肝癌的组学研究进展

骆廉舄实验病理学杂志ＪＣｌｉｎＥｘｐＰａｔｈｏｌ２００９Ａｐｒ；２，５（２）・２０５・

比较蛋白质组学在肝癌研究中的进展

侯振江关键词：比较蛋囱质组学；肝肿瘤中阕分类号：Ｒ７３５．７文献标识码：Ａ文章编号：１００１—７３９９（２００９）０２－０２０５一∞随着人类全基因组计划的完成，生命科学的研究重点由基因转移到蛋巍壤土来，蛋内质组学（ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ）应运面生。螽者以蛋白凌缱为穆｝究对象，以全瑟蛋爨覆懿往璇为研究基础，在蛋白质水平探讨对疾病机制、细胞模式和功能联系的科学…。采用黼分辨率的鬣自质分离手段，结合高通量的蛋鸯璇鉴定技拳，全嚣研究特定馕瑟下蛋邃覆的表达游。蛋自质疑有动态性、多样性、时州性、夺闯憔和特异性，煎合成受多因素的调控。不同的组织细胞蛋白质的合成、表达的种类秘数量袁疆大懿差巽，鄹缝细胞发育豹不羁阶段，其蛋囊覆组的构成也在不断的变化。因此，蛋白质组是在空闻和时闻上幼态变化着的整体，分析不同条件下疆白质组的变化，发现稻鉴定不弼生理条件下蛋鑫质组的成分差异，是玩较蛋自质缀学酶研究斑容珏ｊ。，鄄跑较不同蟹稻质缰之闻蛋白震在表达数量、表达水平和修饰状态上的差撵。本文就比较蛋白质缀学及其在肝细胞癌研究中的进展进行综述。ｌ比较蛋白质组学的研究方法比较蛋白质组学是蛋趣艨组学研究的一个分支，常用的磷究方法包耩黢嗣凝胶毫泳、质谱技零、溺位素亲翻标签。１．１双向凝胶电泳（２－ＤＥ）技术２－ＤＥ可以把复杂混合物中的疆白质在二维平面上很好地分开，并对分离出的蛋白质斑点进行定毪稀定量分橇。蠡然对羝誊度蛋自覆娥敬辨舅《，操作要求较高，但其通量和炙敏度高，分辨率和蓖复性好，与质潜技术联合Ｊ血用成为目前最流行最可靠的技术平台”ｊ。激光簇获显徽甥割本（ＬＣＭ）霹降低２－ＤＥ分折样熬孛组织的弊质性，提商分辨率，并有助于比较磁常弓肿瘤缓织蛋白质淡达的差异，ＬＣＭ与２－ＤＥ结合使分辨率进一步得到改善。差异凝胶魄泳＜ＤＩＧＦ）将薅个样品殛窘覆分别媸不同的荧光染料遂行椽记，然后等链混合荠邂行２－ＤＥ，蠢予荧光染料的发光波长不同，使问一块凝胶上＿两个样品蛋融质分离，避免了电泳时的人为误差及胶与胶之阅的差异，保证结果的霹纛经，显灵敏凌毒予英德方法，筏准确反映榉菇秘对嚣瑟收稿日期：２００９—０ｌ一２５基金竣疆：淫北豢辩学技术发缀耱援麓项曩（０５２７６１２８８）律鬻单位：沧州暇学高等专科攀校医学技术系检验教研察，沧州０６１００ｌ作者麓介：侯振渡，男，教授。Ｔｅｌ：（０３１７）５５０７８０５，Ｅ－ｍａｉｌ：ｈｏｕｚｈｅｎ－ｉｉａｎｇ＠ｓｉｎａ。∞ｍ的差异蛋白表达情况【５ｌ。１．２质谱技术通过质谱分析能清楚地鉴定蛋白质，并准确地测量敷稻蛋白黢的摆对分子质量、氨基黢序列及翻｛謦螽的嫠饰，舆有高灵敏麓裙离准确发，置容易蜜琥自动纯，燕蛋白质组学最主要的鉴定技术。液面增强激光解析电离臆谱（ＳＥＩ，ＤＩ—ＭＳ）与不同性质的蛋自质芯片结合，综合了芯片微阵列技零与质谱两者豹优点，瓣麓＋ｆ对蛋自疆的鉴定熊力，可直接榆测样品中目标蛋白质的分子量、ＰＩ、糖基化位点和磷酸化位点等参数ｍｊ。将蛋白质芯片与ＳＥＬＤＩ—ＭＳ和激光舞析电褒纯飞行时闽震谱（ＳＥＬＤＩ－ＴＯＦ—ＭＳ）耀结合，霹瀑我差异表达的蛋白质。与液相色谱（ＬＣＭＳ／ＭＳ）联用，可鉴定复杂样晶中低丰度蛋白质，具有快速、敏感、分辨率高、梭测莛隧大翻不露样品处疆等优点，霹罴手瞒臻大规模蛋自骥组分析‘”。１．３同倥素亲和标签（ＩＣＡＴ）将两种ＩＣＡＴ试剂标记处于不同状态下缨施巾戆半魏氨酸，摹｜ｊ爆事联矮谱技拳，对混合样品送行分析，能准确比较两个样品蛋自矮表达水平的不同。该技术可直接检测混合样黼，快速进行定性和定墩，鉴定低丰度蛋白质，能迅速找出露簧功能蛋囱壤，尤其是膜蛋白等疏水性蛋白质１８ｊ。僵不能分析不含ｃｙｓ的蛋自履，也存在安全和操作上的局限性。２标本的处疆组织、细胞和ｍ清中的蛋白有明显的不同，如血清蛋白数量最多、不列豹蛋内质含量差别极大、低丰度蛋白质的种类多，磊缀不稳定。趣清蛋臼缫学戆标本簸建常采惩染色法、液相层析法、免痰岽合法等去除高丰度磁白质。用商品试剂盒除去高丰度疆向质，简便、快速，但也可能会非特异性吸附部分蠢、分子量低丰度蛋鑫质。毯等≯３对Ｂｉｏ—ｒａｄＡｕｒｕｍ亲合柱、ＡｇｉｌｅｎｔＭＡＲＳ亲合柱、制备溶液等电聚焦法Ｒｏｔｏｆｏｒ和有机溶剂沉淀法进行比较，结果选择了ＡｇｉｌｅｎｔＭＡＲＳ亲会桂臻予瘦浆／盘漶梯麓的处理，完成了标瞧纛浆／盘清榉瑟的分析比较及鉴定。证实血清样晶经特殊预处理，再与多种技术相结合，才能较清晰地显示凝白的表达情况。用免疫亲季瑟吸附法去除斑渣巾的离丰瘦鬣爨，再用色谱方法（包括离子交换色谱和分子筛色谱），预分离血清蛋翔，将富集的低丰度蛋白成分用２一ＤＥ分离，得到ｊ艟３７００个蛋内质点的电泳图谱。这些蛋白质点用ＭＡＬＤＩ—ＴＯＦ—ＭＳ鉴定，将来能成功燕定的蛋裔旋点用ＬＣ・ＭＳ／ＭＳ串联黢谱分析，共浆定窭３２５个完整的蛋白质。血清鬣白先经多维色谱分离，采用色谱聚焦和无孔填料反向色谱分离技术，备分离组分经胰蛋白酶酶解后

医学综述２ＯＯ７年　月　ｌ３　箍　翅丛　垦　迪　Ｙ　Ｑ　：　：　：　

ｆ１７］Ｏｔｓｕｌ【ｉ　Ｙ，Ｔ彻ａｋａ　Ｍ，Ｙｏｓｈｉｉ　Ｓ，ｅｔ　ａ／．Ｔｕｍｏｒ　ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ　ｓｕｐｐｒｅｓｓｏｒ　ｔｏｒＴｉａｍｌ，ｄｉｒｅｃｔｌｙ　ｂｉｎｄｓ　ｔｏ　ｃ—Ｍｙｃ　ａｎｄ　ｉｎｔｅｒｆｅｒｅｓ　ｗｉｔｈ　ｃ。Ｍｙｃ’ｍｅｄｉａｔｅｄ　

ｎｍ２３Ｈ１唧ｌ躺Ｒａｃｌ　ｂｙｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ　ｗｉｔｈＴｉａｍｌ［Ｊ］．Ｐｒｏｃ　Ｎａｉｌ　ａｐｏｐｔｅｓｉｓｉｎ　ｒａｔ—ｌ　ｆｉｂｒｏｂｌａｓｔｓ［Ｊ］．Ｊ　Ｂ　Ｃｈｅｍ，２ＯＯ３，２７８（７）：５１３２一　

Ａｃａｄ　Ｓｃｉ　ＵＳＡ，２００１，９８（８）：４３８５－４３９０．　５１４０．　ｆ１８］Ｓｕｐｒｉａｌｎｏ　Ｍ，Ｈａｒａｄａ　Ｋ，Ｋａｗａｇｕｃｈｉ　Ｓ，ｅｔ　ａ／．Ｅｆｆｅｃｔ　ｏｆ　ｐ２７ｋｉｐｌ　ｏｎ　ｔｈｅ　［２ｏ］Ｑｉ　Ｈ，Ｊｕｏ　Ｐ，Ｍａｓｕｄａ－Ｒｏｂｅｎｓ　Ｊ，ｅｔ　ａ１．ｃａｓｐａｓｅ　ｍｅｄｉａｔｅｄ　ｃｌｅａｖａｇｅ　ｏｆｔｈｅ　ａｂｉｌｉｔｙ　ｏｆｉｎｖａｓｉｏｎ　ａｎｄｍｅｔａｓｔａｓｉｓ　ｏｆａｎ　ｏｒａｌ　Ｃａ／ｌｃ￣ｒｌｉｎｅｄ］．ＯｎｃｏｌＲｅｐ，ＴＩＡＭ１　ｇｕａｎｉｎｅ　ｎｕｃｌｅｏｆｉｄｅ　ｅｘｃｈａｎｇｅ　ｆａｃｔｏｒ　ｄｕｒｉｎｇ　ａｐｏｐｔｅｓｉｓｌ　Ｊ』．Ｃｅｌｌ　

２００３．１０（３）：５２７．５３２．　Ｇｒｏｗｔｈ　Ｄｉｆｅｒ，２００ｌ，１２（１２）：６０３－６ｌ１．　ｆ１９１　Ｏｔｓｕｉｄ　Ｙ，ＴａｎａｋａＭ，ＫａｍｏＴ，ｄ　ａ／．Ｇｕａｎｉｎｅ　ｎｕｄｅｏｔｉｄｅ　ｅｘｃｈａｎｇｅｆａｃ．　收稿日期：２００６一ｌｌ一２４修回日期：２００７－０６—２９　

蛋白质组学及其在肝细胞肝癌中的研究进展　

李　欣（综述），董宝玮（审校）　

（中国人民解放军总医院超声科，北京１００８５３）　

中图分类号：Ｒ７３５．７；Ｒ３９４．２ｌ　文献标识码：Ａ　文章编号：１００６．２ｏ８４（２ｏｏ７）１４．１０６４－０３　

Advances in Clinical Medicine 临床医学进展, 2019, 9(1), 61-66

Published Online January 2019 in Hans. /journal/acm https:///10.12677/acm.2019.91012

文章引用: 汤忠琼, 肖瑶, 王峰. 肝癌分子诊断标志物及相关组学技术研究进展[J]. 临床医学进展, 2019, 9(1): 61-66.

DOI: 10.12677/acm.2019.91012

Advances in Molecular Diagnostic

Markers and Related Omics

Techniques for Liver Cancer

Zhongqiong Tang, Yao Xiao, Feng Wang*

Kunming University of Science and Technology, Kunming Yunnan

Received: Dec. 29th, 2018; accepted: Jan. 15th, 2019; published: Jan. 22nd, 2019

Abstract Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most common malignant tumors in China with high invasive and recurrence rate. Because the early symptoms of liver cancer are not obvious and the

early diagnosis is difficult, it has a high mortality rate. Early diagnosis is one of the most important

Advances in Clinical Medicine 临床医学进展, 2018, 8(2), 135-140 Published Online April 2018 in Hans. /journal/acm https:///10.12677/acm.2018.82023

文章引用: 刘吟絮. 肺癌代谢组学研究进展[J]. 临床医学进展, 2018, 8(2): 135-140. DOI: 10.12677/acm.2018.82023

Advances in Research of Metabolomics in Lung Cancer Yinxu Liu Longhua Hospital of Shanghai University of T.C.M, Shanghai Received: Mar. 16th, 2018; accepted: Apr. 4th, 2018; published: Apr. 11th, 2018 Abstract Metabolomics studies can sensitively identify the specific metabolic patterns produced by genetic and environmental factors, and have an advantage in the study of the role of environmental changes in body production. This paper expounds the lung cancer in amino acid metabolism, lipid metabolism, glucose metabolism of research progress, which provides a new way for the clinical diagnosis and new targets for cancer treatment. In addition, the application of metabolomics to il-lustrate the development of the disease process happens to have the same view of the overall concept and differential Treatment. This paper summarizes the relationship between the lung cancer metabolomics and the syndromes, and lays a theoretical foundation for elucidation of TCM syndromes and syndrome differentiation. Keywords Metabolomics, Lung Cancer, Amino Acid, Glycolysis, Syndrome 肺癌代谢组学研究进展 刘吟絮 上海中医药大学附属龙华医院，上海 收稿日期：2018年3月16日；录用日期：2018年4月4日；发布日期：2018年4月11日 摘 要 代谢组学研究能灵敏地鉴定出基因和环境因素作用而产生的特定代谢型，在环境变化对机体产生作用的研究中具有优势。本文分别阐述了肺癌在氨基酸代谢、脂代谢、糖代谢方面的研究进展，为临床诊断提刘吟絮