基于^1H NMR代谢组学和偏最小二乘法的小柴胡汤证判别研究
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3种不同基原藏药沙棘的1H—NMR代谢组学研究运用1H-NMR代谢组学方法,建立藏药沙棘的氢核磁共振指纹图谱,明确不同基原之间的整体代谢物差异,为其质量评价提供新方法。
利用核磁共振仪测定不同基原的沙棘药材,将所得自由衰减信号导入MestReNova软件进行分段积分,数据归一化后进行主成分(PCA)分析和偏最小二乘法(PLS-DA)分析,结果显示3种不同品种沙棘能够明显分开,L-白雀木醇、苹果酸和部分未鉴定的糖类成分是引起3个品种分类的差异代谢物。
该研究鉴定出25个代谢产物,包括黄酮类、三萜类、氨基酸类、糖类、脂肪酸类等成分。
1H-NMR分析方法具有整体性的特征,并且样品制备简单、分析快速、重复性好,建立的指纹图可以为藏药沙棘药材的质量控制与评价提供参考依据。
标签:藏药沙棘;1H-NMR代谢组学;化学计量学;质量控制沙棘为胡颓子科植物沙棘Hippophae rhamnoides L.的干燥成熟果实,具有健脾消食,止咳化痰,活血化瘀之功效,常用于脾虚食少,咳嗽痰多,胸痹心痛,跌打瘀肿等[1]。
沙棘属植物品种繁多,分布地域广泛,不同品种分布地域区间跨度大,这些因素直接导致了沙棘药材基原的复杂性[2-4]。
目前沙棘药材的质量控制主要是采用HPLC对黄酮类成分进行含量测定或指纹图研究[5-6]。
1H-NMR 的优势在于能较全面的检测药材的整体化学成分,测定快速准确,专属性强等。
1H-NMR代谢组学技术已成功应用于人参[7]、黄连[8]、泽泻[9]等药材质量控制与评价。
本文采用1H-NMR代谢物组学技术,研究中国沙棘H. rhamnoides L. subsp.sinensis Rousi.、西藏沙棘H.tibetana Schlechtend.、江孜沙棘H. rhamnoides L.subsp. gyantsensis Rousi药材的代谢成分,结合PCA,PLS-DA等化学计量学方法研究不同基原沙棘药材的代谢物差异,最终建立其代谢指纹图谱,找出引起种间差异性的标志物,为藏药沙棘药材的质量控制研究提供参考。
基于偏最小二乘回归分析法怀牛膝药材抗炎镇痛谱效关系孙亮亮;吴剑;张叶;康浩;宋洁;蔡百祥【期刊名称】《中成药》【年(卷),期】2018(040)012【摘要】目的基于偏最小二乘回归分析法探讨怀牛膝药材抗炎镇痛的谱效关系.方法该药材的分析采用ZORBAX SB-C18柱(250 mm×4.6 mm,5μm);流动相乙腈-水(含0.3%甲酸)梯度洗脱;柱温30℃;体积流量1.0 mL/min;检测波长320 nm.采用偏最小二乘回归分析法分析谱效关系.结果 10批样品指纹图谱中有12个共有峰,相似度均大于0.973.以二甲苯所致小鼠耳肿胀为药效学指标时,1、7、11号峰为药效峰;以降低醋酸所致毛细血管通透性为药效学指标时,2、7、9、10号峰为药效峰;以降低醋酸诱导小鼠扭体时间为指标时,2、7、9号峰为药效峰;以各给药组给药0.5h后热板痛阈延长为指标时,2、7、9号为主要药效峰;以各给药组给药1h后热板痛阈延长为指标时,2、7号为主要药效峰;以各给药组给药2h后热板痛阈延长为指标时,7号为主要药效峰.结论苄基葡萄糖苷异构体、β-蜕皮甾酮,三七皂苷R1可能为怀牛膝药材抗炎、镇痛作用可能的物质基础.【总页数】7页(P2786-2792)【作者】孙亮亮;吴剑;张叶;康浩;宋洁;蔡百祥【作者单位】安徽中医药高等专科学校药学系,安徽芜湖241000;安徽中医药高等专科学校中心实验室,安徽芜湖241000;安徽中医药高等专科学校药学系,安徽芜湖241000;安徽中医药高等专科学校中心实验室,安徽芜湖241000;安徽中医药高等专科学校药学系,安徽芜湖241000;安徽中医药高等专科学校中心实验室,安徽芜湖241000;安徽中医药高等专科学校药学系,安徽芜湖241000;安徽中医药高等专科学校中心实验室,安徽芜湖241000;安徽中医药高等专科学校药学系,安徽芜湖241000;安徽中医药高等专科学校中心实验室,安徽芜湖241000;上海中医药大学研究生院,上海200032【正文语种】中文【中图分类】R284.1【相关文献】1.基于稀疏偏最小二乘回归分析白及抗氧化谱效关系 [J], 陈丹;李红婷;谢国勇;秦民坚2.偏最小二乘回归分析法在黄芩抑菌谱-效关系及数学模型研究中的应用 [J], 丁晓彦;俎龙辉;王变利3.基于偏最小二乘回归法分析药用紫草抗肿瘤谱效关系 [J], 廖梅4.基于偏最小二乘回归法分析诃子对溃疡性结肠炎"肺肠同治"的谱效关系 [J], 王巍;张强;杜春洁;鞠成国5.基于偏最小二乘回归法的黑果菝葜乙酸乙酯部位抗肿瘤谱效关系 [J], 王春艳;侯益民;李汉伟;苏秀红;董诚明;陈随清因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
小柴胡汤调控miR-122逆转肝癌多药耐药的作用机制小柴胡汤调控miR-122逆转肝癌多药耐药的作用机制摘要:肝癌是世界范围内常见的一种恶性肿瘤,其多药耐药性常常使治疗变得困难。
近年来,为了解决这个问题,许多研究人员开始关注中药对肝癌多药耐药的调节作用。
在本研究中,我们发现小柴胡汤(XCHT)可以通过调节miR-122,逆转肝癌药物耐药的发生。
我们用实验室肝癌细胞系Hep3B、Bel7402,以及荷肝癌原位移植实验,通过Real-time PCR、Western blot、MTT、细胞周期和细胞凋亡分析等各种实验方法,系统研究了小柴胡汤对Hep3B和Bel7402细胞系生长、凋亡和细胞周期的影响,以及其对多种化疗药物耐药性的影响。
实验结果表明,小柴胡汤可以调节miR-122的表达,拮抗其下游靶基因MDR1,减少肝癌细胞对多种化疗药物的抵抗力。
我们的研究结果表明,小柴胡汤可以作为肝癌多药耐药治疗的潜在药物,提供了治疗肝癌多药耐药性的新思路。
关键词:小柴胡汤;肝癌;多药耐药;miR-122;MDR1引言:肝癌是一种多发性、高度恶性的恶性肿瘤,是目前世界上第三大癌症致死原因。
由于肝癌常常对多种化疗药物产生耐药性,导致治疗效果不佳、复发率与转移率高,因此肝癌的治疗仍是一个难题。
这也促使文献中有越来越多的报道关于中药对治疗肝癌的多药耐药性有调控作用。
小柴胡汤(XCHT)是中药中的一种处方,主要由黄芩、人参、山楂、桂枝、炙甘草、半夏、细辛、川芎、柴胡组成,其处方组合经过了临床实验证明,可以治疗多种疾病,如感冒、肝肾气亏、中枢神经系统疾病、心血管疾病等,但其对肝癌的作用机制还不十分清楚。
miRNA是一种短链RNA,长度通常在22个核苷酸(nt)到24nt之间,miRNA能够在细胞内调节基因表达的后转录水平。
miR-122在肝细胞中表达量占所有miRNA的50%,可在肝细胞中发挥多种生物学功能,包括胆固醇代谢、糖脂代谢和肝细胞的分化,且miR-122还被证明在肝癌患者中表达量显著降低,这可能与肝癌恶性进展和多药耐药有关。
基于核磁共振氢谱及偏最小二乘判别分析法的红木快速识别模型的建立与应用陈碧莹;廖世莉;吴霞;冯毅凡【摘要】以核磁共振技术为基础,采用核磁共振氢谱(1H NMR)对奥氏黄檀、巴里黄檀、交趾黄檀、刺猬紫檀、大果紫檀和檀香紫檀6类国标红木及胶漆树、染料紫檀2类混淆品的甲醇超声提取液进行检测分析,并结合聚类分析法、主成分分析法(PCA)和偏最小二乘判别分析法(PLS-DA)等模式识别方法对其进行快速鉴别.结果显示,利用PLS-DA法建立的模型前3个主成分累积贡献率达79%,能将国标红木与混淆品进行有效区分,且能大致区分不同种类的国标红木.该方法快速、高效,在红木快速鉴别分析中具有较大的潜力.【期刊名称】《分析测试学报》【年(卷),期】2019(038)002【总页数】7页(P134-140)【关键词】红木;核磁共振;模式识别;偏最小二乘判别分析【作者】陈碧莹;廖世莉;吴霞;冯毅凡【作者单位】广东药科大学中心实验室,广东广州510006;广东药科大学中心实验室,广东广州510006;广东药科大学中心实验室,广东广州510006;广东药科大学中心实验室,广东广州510006【正文语种】中文【中图分类】O657;O482.53红木作为珍贵的家具用材,制作而成的家具和工艺品等备受青睐,价值极高[1]。
根据国家红木标准(GB/T 18107-2000)[2],可将红木分为5属8类,共29种。
不同种类、不同产地的红木之间价格差异较大。
目前红木鉴别仍以人工鉴别为主,而人工鉴别能力参差不齐,加之市场上真假红木鱼目混珠,使得消费者不能有效地识别真伪,易造成损失。
国标红木中俗称为小叶紫檀的檀香紫檀,在市场上价格较高,而染料紫檀因价格低廉、形似檀香紫檀的特点,常被混作檀香紫檀。
胶漆树也因外观类似紫檀,常被冒充作为红木使用。
目前常用的传统鉴别红木的方法为观测红木木材的材色、纹理、气味及其显微结构等[3-5]。
近年来,化学检测手法也被逐步应用于红木鉴别。
基于1H-NMR技术寻找非酒精性脂肪肝肝郁脾虚证的差异代谢标志物李若瑜;何丽清;苗宇船;苏赵威;贾飞;李明磊;刘杨;郭继龙;关伟;张冉冉【摘要】目的:运用核磁共振(nuclear magnetic resonance,1 H-NMR)寻找非酒精性脂肪肝(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)肝郁脾虚证大鼠血清中的内源性代谢产物.方法:建立雄性SD大鼠NAFLD肝郁脾虚证模型,检测血清5-羟色胺(5-HT)、去甲肾上腺素(NE)和尿D-木糖排泄率生化指标并取肝组织进行病理学检查以验证模型,1H-NMR检测大鼠血清的代谢产物变化,运用多元统计分析方法寻找差异性代谢产物.结果:与对照组比较,模型组大鼠血糖、血脂升高,血清5-HT和D-木糖排泄率显著降低,肝组织明显脂肪变性;在2组大鼠的血清中找到23种代谢产物,从模型组血清中发现丙酮、丙氨酸、甜菜碱、α-D-葡萄糖、甘油、异亮氨酸、α-酮戊二酸、苏氨酸、赖氨酸等9种差异代谢物.结论:血清代谢产物可从脂质代谢紊乱、胰岛素抵抗与免疫调节紊乱等方面不同程度地反映NAFLD的部分发病机制.【期刊名称】《中国中医基础医学杂志》【年(卷),期】2018(024)003【总页数】4页(P334-336,357)【关键词】1H-NMR;非酒精性脂肪肝;肝郁脾虚证;代谢标志物【作者】李若瑜;何丽清;苗宇船;苏赵威;贾飞;李明磊;刘杨;郭继龙;关伟;张冉冉【作者单位】山西中医学院,山西晋中 030619;山西中医学院,山西晋中 030619;山西中医学院,山西晋中 030619;建德市中西医结合医院,浙江建德 311612;山西中医学院,山西晋中 030619;山西中医学院,山西晋中 030619;山西中医学院,山西晋中030619;山西中医学院,山西晋中 030619;山西中医学院,山西晋中 030619;山西中医学院,山西晋中 030619【正文语种】中文【中图分类】R285.5非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease, NAFLD)是遗传-环境-代谢应激相关性疾病。
基于偏最小二乘法的近红外光谱模型用于丹参口服液提取过程的分析冯婉红;邹艳君;麻淑磊【摘要】目的探讨丹参口服液提取过程采用近红外光谱(NIR)分析的可能性及其方法.方法制备共122份提取液,采用高效液相色谱法(HPLC)测定原儿荼醛含量,并收集NIR图,用偏最小二乘法(PLS)建立校正模型.结果采用二阶求导及Savitzky-Golay平滑处理后的校正模型交叉验证均方根误差(RMSECV)为3.456,相关系数为0.988,优于其他优化方式.结论基于PLS的原儿茶醛NIR模型可用于丹参口服液提取过程的在线分析.【期刊名称】《实用药物与临床》【年(卷),期】2016(019)009【总页数】4页(P1156-1159)【关键词】丹参口服液;质量控制;近红外光谱;偏最小二乘法【作者】冯婉红;邹艳君;麻淑磊【作者单位】杭州市萧山区中医院,杭州311201;永嘉县中医医院,温州325401;永嘉县中医医院,温州325401【正文语种】中文丹参为唇形科鼠尾草植物丹参(Salvia miltiorrhiza)的干燥根及根茎,具有祛瘀止痛、活血通经、清心除烦之功。
由丹参单味药材煎煮制成的丹参口服液属于医保乙类药,具有较为优良的疗效,且不良反应小,临床上用于治疗心绞痛[1-3]、冠心病[4-5]等心血管疾病。
《丹参口服液质量标准》(以下简称“标准”)现收录于国家食品药品监督管理局药品标准,指标性成分为原儿茶醛[6]。
中药提取液的质量直接决定了制剂的质量,因此有必要进行实时监控。
在线近红外光谱(NIR)技术提供了一种对提取过程进行检测的方法,可以实时监控提取液中主要成分的变化情况[7-8],并根据这些情况灵活调整提取方案,从而获得质量最优的提取液。
本实验按照“标准”中的提取工艺,采用NIR技术对其建模,对提取过程进行质量控制。
AntarisⅡ型近红外光谱仪(Thermo Fisher公司),配备Version 3 SP4 Result and TQ光谱分析软件;LC-20AB高效液相色谱仪[岛津(中国)有限公司];Venusil XBP C18色谱柱(博纳艾吉尔科技有限公司);EL104型分析天平[梅特勒-托利多(上海)有限公司];PHS-3C型精密pH计(上海精科仪器有限公司);RE-52型旋转蒸发仪(瑞士步琦有限公司)。
基于1H-NMR的模式识别方法在慢性心力衰竭患者血清代谢组学中的应用杜智勇;沈安娜;苏亮;梁健球;许顶立【期刊名称】《南方医科大学学报》【年(卷),期】2012(032)003【摘要】目的探讨基于1H-NMR的模式识别方法应用于慢性心力衰竭(CHF)血清代谢组学研究的可行性.方法应用1H-NMR技术对9例CHF患者和6例健康人血清进行检测,对所得数据分别采用主成分分析法(PCA)和正交信号校正偏最小二乘法(OPLS)进行模式识别分析,确定CHF患者与健康人血清差异代谢物,比较两种模式识别方法判别能力.结果 CHF患者与健康人血清1H-NMR图谱有明显差异.其中PCA模式识别法未能将CHF组和健康对照组区分开,而用OPLS模式识别方法两组可明显区分.结论 1H-NMR技术是研究CHF代谢组学的有效技术手段,CHF患者血清代谢组与健康人存在明显差异.OPLS模式识别法明显优于PCA法,能够去除非实验因素的影响,提高分类效果.%Objective To investigate the feasibility of applying 'H-NMR-based pattern recognition in the studies of serum metabonomics in chronic heart failure (HF). Methods 'H-NMR technique was applied for examination of the serum samples from 9 patients with chronic heart failure and 6 healthy individuals. The data were analyzed for pattern recognition through principal component analysis (PCA) and Orthogonal Partial Least Square (OPLS) to determine the differences in serum metabolites between the two groups. The recognition ability of the two analysis methods were compared. Results The serum 'H-NMR spectraof heart failure patients and healthy individuals were significantly different. The PCA method failed to distinguish the patterns between the two groups, but OPLS clearly differentiated the two groups. Conclusions 'H-NMR technique is effective in the study of serum metabolomics in chronic heart failure. The serum metabonomics of patients with chronic heart failure and the healthy individuals are significantly different. OPLS pattern recognition method is superior to PCA method in that the former can remove the influence of non-experimental factors and provide an improved characterization.【总页数】5页(P415-419)【作者】杜智勇;沈安娜;苏亮;梁健球;许顶立【作者单位】南方医科大学南方医院心血管内科,广东广州510515;南方医科大学南方医院心血管内科,广东广州510515;南方医科大学南方医院心血管内科,广东广州510515;南方医科大学南方医院心血管内科,广东广州510515;南方医科大学南方医院心血管内科,广东广州510515【正文语种】中文【中图分类】R541.6【相关文献】1.基于1H-NMR的丹七片对自发性高血压大鼠血清代谢组学分析 [J], 张莉晶;王娅妮;吕光耀2.基于1H-NMR代谢组学技术对卵巢癌患者血清的研究 [J], 魏凌云;周玉枝3.基于肝脂和1H-NMR技术的草鱼肝胰脏及血清代谢组学分析 [J], 黄春红;肖调义;胡毅;赵玉蓉;刘巧林4.基于1H-NMR血清代谢组学的阿尔茨海默病肾虚精亏证生物学机制及地黄饮子的干预作用研究 [J], 帅月圆;韩诚;曹建华;李少创;秦亚莉5.基于1H-NMR血清代谢组学的阿尔茨海默病肾虚精亏证生物学机制及地黄饮子的干预作用研究 [J], 帅月圆;韩诚;曹建华;李少创;秦亚莉因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
基于灰色关联度分析和偏最小二乘回归辨识款冬花止咳活性成分吴笛;蔺晓源;刘凯;宁杭;罗文汇;赵光发【期刊名称】《中南大学学报(医学版)》【年(卷),期】2024(49)3【摘要】目的:款冬花具有止咳化痰的作用,以止咳为主。
研究显示款冬花的某些成分可能与止咳作用相关,另有某些成分被证实具有止咳活性,但款冬花止咳药效的物质基础尚未阐明。
本研究通过对款冬花提取物的高效液相色谱指纹图谱与止咳作用进行谱效相关分析,旨在阐明款冬花的止咳活性成分群。
方法:采用高效液相色谱法建立10批款冬花提取物的指纹图谱并获得其化学成分数据;选用豚鼠作为实验动物,采用枸橼酸引咳法获得10批款冬花提取物的止咳药效数据。
将SPF级健康雄性Hartley豚鼠随机分为S1~S10组、阳性对照组和空白对照组(共12组),每组10只,S1~S10组分别给予款冬花提取物S1~S10(4 g/kg),阳性对照组给予枸橼酸喷托维林(10 mg/kg),空白对照组给予纯化水,各组连续给药5 d,将豚鼠置于5 L容积的密闭广口瓶内,用超声雾化器以最大喷雾力度喷入17.5%的枸橼酸并持续0.5 min,记录每只豚鼠的咳嗽潜伏期和5 min内咳嗽次数。
采用灰色关联度分析和偏最小二乘回归对款冬花提取物的化学成分数据和止咳药效数据进行谱效相关分析,预测款冬花的止咳活性成分群。
对预测的款冬花止咳活性成分群进行等效性验证:将SPF级健康雄性Hartley豚鼠随机分为S9组、活性成分群组、阳性对照组和空白对照组(共4组),每组10只,S9组给予款冬花提取物S9(4 g/kg),活性成分群组给予预测的止咳活性成分组合物(剂量相当于4 g/kg的款冬花提取物S9),阳性对照组给予枸橼酸喷托维林(10 mg/kg),空白对照组给予纯化水,各组连续给药5 d,动物造模和药效指标观察同前。
结果:共建立10批款冬花提取物的高效液相色谱指纹图谱并获得14个主要共有峰的峰面积数据;获得10批款冬花提取物的止咳药效数据。
基于代谢组学研究黄连—黄芩药对治疗脑缺血大鼠的作用机制运用代谢组学方法研究黄连-黄芩药对对脑缺血模型大鼠代谢的作用机制。
采用线栓法致大脑中动脉阻塞复制缺血再灌脑损伤大鼠模型(MCAO)。
通过超高效液相色谱-串联四级杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF/MS)的方法、Markerlynx 软件、以及主成分分析法和偏最小二乘判别法分析正常大鼠、脑缺血模型大鼠以及分别给予黄连(HL)、黄芩(HQ)和黄连-黄芩药对(LQ)干预后大鼠尿液样本中的内源性代谢物的差异,结合内源性代谢物的一级及二级碎片离子的精确信息,检索并鉴定可能的生物标志物,进而在MetPA数据库中构建代谢通路。
结果在脑缺血模型大鼠的尿液中发现并鉴定出了20种生物标志物,并对其相对含量及代谢途径进行分析。
主要涉及神经递质调节、氨基酸代谢、能量代谢、脂质代谢等。
这些代谢通路在脑缺血模型大鼠的体内发生紊乱,主成分分析表明,正常与脑缺血模型得到明显区分,而给予HL,HQ,LQ后可以使之向着正常状态转变。
此研究对脑缺血大鼠代谢组及黄连-黄芩药对干预的作用机制进行阐释,体现代谢组学可反映生物体的生理及代谢状态,能较好地体现药对是中医遣方用药的特色优势,具有内在的组合变化规律以及中医药的整体观、系统观以及多成分协同或拮抗作用的特点。
标签:脑缺血;黄连-黄芩药对;代谢组学;UPLC-Q-TOF/MS[Abstract] The metabolic effect of Huanglian-Huangqin herb pairs on cerebral ischemia rats was studied by using metabolomic method. The rat model of ischemia reperfusion injury induced by introduction of transient middle cerebral artery occlusion (MCAO)followed by reperfusion. Ultra high performance liquid chromatography-series four pole time of flight mass spectrometry method (UPLC-Q-TOF/MS),Markerlynx software,and principal component analysis and partial least-squares discriminant analysis were used to analyze the different endogenous metabolites among the urine samples of sham rats,cerebral ischemia model rats,Huanglian groups (HL),Huangqin groups (HQ)and Huanglian-Huangqin herb pairs groups (LQ)was achieved,combined with accurate information about the endogenous metabolites level and secondary fragment ions,retrieval and identification of possible biological markers,metabolic pathway which build in MetPA database. The 20 potential biomarkers were found in the urine of rats with cerebral ischemia,which mainly involved in the neurotransmitter regulation,amino acid metabolism,energy metabolism,lipid metabolism and so on. Those metabolic pathways were disturbed in cerebral ischemia model rats,the principal component analysis showed that the normal and cerebral ischemia model is clearly distinguished,and the compound can be given to the normal state of change after HL,HQ,LQ administration. This study index the interpretation of cerebral ischemia rat metabolism group and mechanism,the embodiment of metabonomics can reflect the physiological and metabolic state,which can better reflect the traditional Chinese medicine as a whole view,system view and the features of multi ingredient synergistic or antagonistic effects.[Key words] cerebral ischemia;Huanglian-Huangqin herb pairs;metabolomics;UPLC-Q-TOF/MS藥对是单味中药与若干方剂之间的桥梁,是许多方剂隐含的规律性特征与辨证施治内涵体现[1]。