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三角梅种质资源的ISSR分析

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收稿日期： 2011-08-21
修回日期： 2011-09-09
基金项目： 国家支撑计划： 台湾农业新品种、 新技术引进创新研究与示范 (No. 2007BAD07B00) 子课题： 菊花等闽台特色花卉新品种引进
创新和离体保存研究（No. 2007BAD07B03）。
作者简介： 李房英（1971 年—）， 女, 硕士， 副教授。 研究方向： 园林植物与规划设计。 ＊ 通讯作者: 吴少华， E-mail: 348279953@。
热带作物学报 2011， 32（9）： 1692-1696 Chinese Journal of Tropical Crops
三角梅种质资源的 ISSR 分析
李房英 1， 黄彦晶 2， 3， 吴少华 3 ＊
1 福建农林大学园林学院， 福建福州 2 福建农业职业技术学院， 福建福州 3 福建农林大学园艺学院， 福建福州
22 洒金叶红花宝巾 福建省亚植所 45 塔紫三角梅
23 新加坡大宫粉
厦门植物园
46 斑叶塔紫三角梅
说明： 福建省亚植所为福建省亚热带植物研究所的简称。
厦门植物园 厦门植物园
编号 品种名称
采集地点
47 黄金叶
厦门植物园
48 小叶浅紫三角梅
厦门植物园
49 大叶紫花
厦门植物园
50 金斑叶嫣红
厦门植物园
51 洒金大红
三 角 梅 （Bougainvillea spectabilis Willd.） 是 紫 茉 莉 科 （Nyctaginaceae） 南 美 紫 茉 莉 属 （ 或 叶 子 花 属 ） （Bougainvillea）的常绿攀援 状灌木， 在 亚 热 带 和 热 带地区被广泛栽培。 在南方， 一般花期为当年的 10 月 至 翌 年 的 6 月 初 ， 花 期 较 长 ； 花 多 且 美 丽 ， 可用作切花、 盆栽、 盆景、 庭园种植（花篱、 门廊、 绿篱）等， 观赏价值和经济价值极高， 具有广阔的 市场前景[1, 2]。
64 大红
厦门植物园
65 银边白花
厦门植物园
66 水红
厦门植物园
67 暗斑叶西洋红宝巾 厦门植物园
68 花斑叶红宝巾
厦门植物园
剂购自大连宝生物（TAKARA）有限公司。 梯度 PCR 仪 Tgradient 为 Biometra 公司产品。
DNA 提取与检测： 采用改良 CTAB-Mini 提 取 叶片总 DNA。 使用 1％琼脂糖凝胶电泳检测其完整 性 ； 使 用 紫 外 分 光 光 度 计 测 定 OD260、 OD280、 检 测 DNA 的纯度和浓度， DNA -20 ℃保存备用[8]。
13 双托（珊红宝巾） 福建省亚植所 36 胭脂红三角梅
14 重瓣金鱼黄
福建省亚植所 37 银斑细叶小花深紫
15 黄花三角梅
福建省亚植所 38 毛叶三角梅
16 硬枝三角梅A
福建省亚植所 39 重瓣金斑大红
17 硬枝三角梅B
福建省亚植所 40 重瓣樱花
18 洒金叶小精灵
福建省亚植所 41 大花白
19 小叶紫花宝巾
第9期
李房英： 三角梅种质资源的 ISSR 分析
- 1693 -
种质资源进行遗传分析， 试图探明三角梅种质资源 间的遗传关系， 在分子水平上揭示整个基因组的遗 传变异、 遗传多样性的关系， 为三角梅种质资源亲 缘关系的确定及杂交育种提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 材料 供试的 68 份材料（表1）均于 2009 年夏季取自
中图分类号 S687.3
文献标识码 A
ISSR Analysis of Germplasm Resources of Bougainvillea spectabilis Willd
LI Fangying1， HUANG Yanjing2，3， WU Shaohua3
1 College of Landscape Architecture, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian 350002, China 2 Fujian Vocational College of Agriculture, Fuzhou, Fujian 350119, China 3 College of Horticulture, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian 350002, China
厦门植物园
28 皱叶深红
厦门植物园
6 重瓣白里透红
福建省亚植所 29 大花深紫三角梅
7 花叶仙子
福建省亚植所 30 亮叶紫花
8 青叶白
福建省亚植所 31 银边紫花
9 矮宝巾（小精灵） 福建省亚植所 32 白苞三角梅
10 花蝴蝶
福建省亚植所 33 花三角梅
11 白里透红
福建省亚植所 34 金心宝巾
12 花叶白（白花小叶） 福建省亚植所 35 双色(鸳鸯)三角梅
Abstract Sixty -eight bougainvillea samples were analyzed using ISSR technique to study their taxonomic and phylogenetic relationships. Fourteen ISSR primers were used in the ISSR analysis of 68 bougainvillea individuals. A total of 195 ISSR bands were scored, corresponding to the polymorphic bands were 182, and the percentage of polymorphic was 93.3%. According to ISSR-PCR results, a cluster analysis (UPGMA) was used to generate a dendrogram among all 68 individuals. The results showed that genetic similarity among individuals was between 0.50 and 0.97, the average was 0.67. It was indicated that the relationship among all individuals was close and the genetic diversity was poor. According to dendrogram, 68 individuals could be divided into 2 groups at genetic similarity 0.64. The A group could be divided into 2 subgroups and B group could be divided into 6 subgroups. This study revealed the genetic relationship and confirmed the genetic distance among 68 bougainvillea individuals using molecular marker technology. Key words Bougainvillea； ISSR； Genetic diversity； Genetic relationship doi 10.3969/j.issn.1000-2561.2011.09.022
ISSR-PCR 扩增体系： 每 20 μL 体系中含 1.0 U Taq 酶、 0.3 μmol/L 引物、 250 μmol/L dNTPs、 20 ng 模板 DNA、 2 μL 10×Buffer。 扩增程序为： 94 ℃预 变性 5 min； 94 ℃变性 60 s， 在最适退火温 度下退 火 60 s， 72 ℃延伸 120 s， 34 个循环； 72 ℃延伸 7 min 后 4 ℃保存[8]。
A 类群和 B 类群， A 类群可分为 2 亚类， B 类群还可分为 6 亚类。 本研究从分子水平上揭示了三角梅不同种质
资源之间的亲缘关系， 进一步明确了种质资源间的遗传距离， 为三角梅优良品质性状的选择、 杂交育种亲本选
配和良种繁育， 提供了 DNA 分子水平上的理论依据。
关键词 三角梅； ISSR； 遗传多样性； 亲缘关系
三角梅品种多达 100 种以上， 众多品种的遗传 背景复杂。 目前， 三角梅品种、 杂交种的关系大多 参照以形态学特性分类为主的国际三角梅新品种名
录表[3]。 关于三角梅品种分 类和品种间 亲缘关系上 还有很多疑问， 育种专家和研究者都希望建立一个 更有效的方法加以深入研究。
ISSR 是 由 Zietkiewicz 等 于 1994 年 创 建 的 一 种简单序列重复区间扩增多态性的新型的分子标 记 [4]。 具 有 操 作 简 单 ， 稳 定 程 度 高 ， 标 记 重 复 性 好， 多态性丰富 DNA 用量少， 成本低等优点， 已 用于遗传多样性、 品种鉴定、 系统发育、 基因定 位 、 分 子 标 记 育 种 等 方 面[5-7]。 目 前 尚 未 见 到 利 用 ISSR 技术对 较大群体的 三角梅种 质 资 源 进 行 研 究 的报道。 本研究通过 ISSR 分子标记技术对三角梅
每条选中引物对每一个样品重复试验了 3 次。 PCR 扩增产物检测， 1.5％琼脂糖凝胶， 100 V 稳压 电泳 2.0 h， EB 染色， 凝胶成像系统观察、 拍照。 1.3 数据分析
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52 怡红三角梅
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53 重瓣大红
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54 重瓣橙黄
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伊丽莎白安格斯三角梅转录组的SSR、SNP和InDel特征分析

伊丽莎白安格斯三角梅转录组的SSR、SNP和InDel特征分析

伊丽莎白安格斯三角梅转录组的SSR、SNP 和InDel特征分析作者：孙利娜林茂黄旭光陈尔杨舒婷王华新龚建英来源：《南方农业学报》2024年第03期摘要：【目的】基于轉录组测序数据分析伊丽莎白安格斯三角梅SSR、SNP和InDel位点特征，为开发三角梅分子标记、选育无刺或少刺品种、品种鉴定及亲缘关系分析提供理论依据。

【方法】以伊丽莎白安格斯三角梅3个时期的枝刺和茎段为材料，对其进行转录组测序，采用Trinity对获得的高质量测序数据进行序列组装，利用MISA和GATK3对 SSR、SNP 和InDel进行特征分析。

【结果】18个样本转录组测序平均获得45905982 bp Raw data，质控过滤后获得 45640193 bp Clean data，拼接后获得312812条转录本和144512条Unigenes，有54516个SSR位点分布于40820条Unige- nes上，发生频率为28.25%，平均分布距离为2.67 kb，包含1个以上SSR位点的Unigenes 10269条，占Unigenes总数的 4.25%。

在重复基元类型中，单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复数量占优势，其中单核苷酸重复数量最多（39904 个，占比73.20%），其次为二核苷酸重复（8169个，占比14.98%）和三核苷酸重复（5899个，占比10.82%），五核苷酸重复最少（31个，占比0.06%）。

单核苷酸～六核苷酸重复类型共检测到98种重复基元，出现频率为0.01%～25.71%，其中出现频率最高的基元为A/T （37151个），占SSR位点总数的68.15%。

SSR各类型重复基元的重复次数集中在5～23次， SSR序列的长度10～60 bp，平均长度为20.38 bp。

共检测到231248个SNP位点和99580个InDel位点，其中SNP位点平均分布距离为1.59 kb，InDel位点平均分布距离为0.68 kb，且均以含1个位点的Unigenes数量最多，Unigenes数量随 SNP和InDel位点数量的增加而逐渐减少。

三角梅属研究进展

三角梅属研究进展

收稿日期：2021-01-29基金项目：2020年省级农业科技创新及推广项目（2020KJ121）作者简介：杜学林（1996-），男，贵州遵义人，在读硕士研究生，研究方向为观赏园艺，（电话）198****0383（电子信箱）*****************；通信作者，王凤兰（1973-），女，广西武鸣人，副教授，博士，主要从事园林植物与观赏园艺研究，（电话）136****6256（电子信箱）******************。

杜学林，刘悦明，伍青，等.三角梅属研究进展［J ］.湖北农业科学，2022，61（1）：12-17．三角梅属（Bougainvillea ）是瑞香目（Thymelaece⁃ae ）紫茉莉科（Nyctaginaceae ）叶子花属（Bougainvil⁃lea Comm.Ex Juss ）的常绿藤状观花灌木［1］。

1766—1769年，由航海家Louis Antonie de Bougainville 在巴西里约热内卢首次发现了这一植物，后由其好友merson 以这位航海家的名字给它命名为Bougainvillea ［2］。

三角梅以其生命力强、色彩鲜艳、花色繁多、花期长等特点而闻名。

自发现开始就不断被引种到世界其他地区。

其引入中国最早可以追溯到1872年，至今已有140余年的历史［3］。

但三角梅存在品种分类系统紊乱，杂交结实率低，不耐寒、易受涝害等问题，导致其在实际推广中受到了一定的阻碍。

为了更好地开发利用三角梅属植物，本文对三角梅的分类、育种及繁殖、花粉活力、花期调控、抗性等方面的研究进行综述，以期为后续三角梅属植物的深入开发提供参考，扩大其应用范围。

1生物学特性1.1形态特征三角梅的真花细小，不具有观赏价值，真正有观赏价值的是其苞片。

三角梅的苞片在形态学上属于变态叶［4］，跟叶相似但颜色与其叶不同，呈三角形，三角梅属研究进展杜学林1，刘悦明2，伍青1，黄子锋3，余铭杰2，王凤兰1（1.仲恺农业工程学院，广州510225；2.广州市林业和园林科学研究院，广州510405；3.东莞市农业科学研究中心，广东东莞523083）摘要：三角梅（Bougainvillea ）以其苞片色彩丰富鲜艳、花期长和耐干旱、易种养等特点而深受喜爱，被广泛应用在城市园林绿化。

三角梅ISSR反应体系的建立和优化

三角梅ISSR反应体系的建立和优化

三角梅ISSR反应体系的建立和优化李房英;黄彦晶;吴少华【摘要】对影响三角梅ISSR-PCR扩增反应的各个参数进行优化,建立适合三角梅的ISSR反应体系:PCR反应体积为20μL,其中10×buffer(含Mg2+)2.0μL,dNTP 250 μmol/L,Taq酶1.0U,引物0.3μmol/L,模板DNA20ng.扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性1min,51.6℃退火1min,72℃延伸2min,34个循环;最后72℃延伸7min.该反应体系标记点位清晰、稳定、重复性好,适宜三角梅ISSR分析,为应用ISSR技术鉴定三角梅种质资源、分子标记辅助选择育种及其遗传多样性研究奠定了基础.【期刊名称】《海峡科学》【年(卷),期】2010(000)010【总页数】4页(P216-219)【关键词】三角梅;ISSR;体系建立;优化【作者】李房英;黄彦晶;吴少华【作者单位】福建农林大学园林学院;福建农林大学园艺学院;福建农林大学园艺学院【正文语种】中文三角梅(Bougainvillea spectabilis Willd)又名九重葛、毛宝巾、勒杜鹃，在我国已有100多年的栽培历史，品种丰富。

我国部分研究者在同工酶水平上对三角梅品种进行亲缘关系分析但存在难以解释之处[1]，至今仍有分类标准不统一、分类手段有一定的局限性，所得分类结果不一致以及同名异物、同物异名等问题，从而给生产、园林应用、交流等方面带来诸多困难。

而三角梅有关分子标记方面的研究仍是空白，因此利用分子标记技术进行三角梅的分类、品种鉴定等研究显得尤为重要。

ISSR（简单重复序列间隔区，Inter-Simple Sequence Repeat）是由Zietkiewicz等于1994年创建的一种简单序列重复区间扩增多态性的分子标记[2]。

ISSR具有操作简单，标记重复性好，稳定程度高，多态性丰富，DNA用量少，成本低等优点。

三角梅属植物种质资源及其园林应用研究进展

三角梅属植物种质资源及其园林应用研究进展


重点 对 目前 我 国三 角梅 园艺学研 究及 园林 应 用现 状进 行综 述 ，就进 一 步研 究和 开 发应 用作 探讨 。
关键词 ： 角梅属； 质 资源；园林 应 用 ｐａ ｍ ｓｏ ｒ ｅ ｄＴｈ ｉ ｐ ｃ ｔ ｎ ｆ ｓ ａ ｃ ｖ ｎ ｅ ｉ ｔ Ｇｅ ｍ ｌｓ Ｒｅ ｕ ｃ ａ ｅｒＡｐ ｆ ａｉ ｓｏ ｓ ｎ ｈｅ ｓｎ ｉ ｏ
南方农业 Ｓ ｕ ｈ ａ ｇｉ ｌ ｒ ｏ ｔ ｉ Ａ ｒ ｕｔ ｅ ｈＣ ｎ ｃｕ
２１ １ ００年 ０月
第４ 卷第 ｌ 期 Ｏ
三角梅属植物种质资源及其 园林应用研究进展
武晓燕 ，唐源江※ （ 华侨大 学花卉工程研 究所 ，福建厦 ｆ ３ １２ ） － ６０ １ ｊ
摘 要： 集 国 内外近 几年 有 关三 角梅研 究的文献 资料 ，概括 性介 绍 了我 国三 角梅 种质 资源状 况， 搜
价值 ，前 ２ 常见，杂交 品种花色更 多。三角梅两 下的苞叶近 三角形 ，由 ３枚苞叶组成的 “ 种 花朵”也 三 。因其苞 叶质如彩绢 ，形 广称宝 巾，西南称叶子花，华南地区多称三角梅 ，亦 呈三角形 ，故名 “ 角梅” 名九重葛 ，为园圃必 备，很 受园艺界赏识 ，目前几 状奇特 ，色彩艳丽 ，故而成为最动人之 处 ，令人百
ｄ ｏｇｉ １ 于 １６ — １６ 年在南美洲的巴西发现 用现状等方面的研 究进展进行综述 ，以展示其在园 ｅ ｕａ １ Ｂ ｍ４ｅ ７６ ７９
并以他的名字命名ｎ。该属有 １ ～１ 】 ６ ７种 （ 吴征镒 ） 艺 产 业 上 的重 要价 值 。 ，
只有三角梅 （ｏｇ ｉｖｌ ｅｔ ｉａＷｉａ） Ｂ ｕａｎｉｅ ｓ ｃ ｂｌ ｌ ．、光叶 ｌａ ｐ ａ ｉ ｌ
三 角梅 属 （ 日，， ｆ以 ０ ｇ ｆ１ ｆ ）隶属于紫茉莉科 样 ，而且一年四季均可开花而备受关注 ，厦 门市更 ｚｆ