Science Finder检索技巧
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Appendix A:智能检索:SciFinder怎样去检索结构SciFinder有很多计算工具帮助用户进行检索,找出令人满意的结果。
SciFinder 的智能检索能理解结构询问,检索出最全面的和最多的相关结构结果。
智能检索的物性理解在结构图标窗中的结构,并考虑其不同的结构形式,包括任何有关这结构的物质,都会显示在结果内。
注意:智能检索适用于完全符合结构检索和亚结构检索。
智能检索系统会自动检索出所有有关的物质,其原子排列和键与输入的结构相同。
检索结果会包括以下物质。
•相同结构•结构同分异构体•互变异体(包括酮-烯醇互变异体)•配位化合物•含有电荷的化合物•离子基•含有同位素的物质•其高分子具体的例子:•在互变异性体(如酮-烯醇互变异体和共轭键系)中,虽然其单键和双键的位置不同,但SciFinder的智能检索也会自动包括这些结构在结果内。
只需输入以下任何一个结构,便能检索全部有关的结构。
不同的氢键的互变异性体会自动被检索。
只需输入以下任何一个结构,便能检索全部有关的结构。
•如分子为离子物,其电荷附在不同原子的结构会自动被检索。
只需输入以下任何一个结构,便能检索全部有关的结构。
•如结构含有金属原子,其金属原子在结构的不同位置会自动被检索。
只需输入以下任何一个结构,便能检索全部有关的结构。
不论怎样绘制含有金属的结构,智能检索也会自动检索其分离结构和环结构。
此外,它的水合离子也会被检索。
定义:金属原子不包括以下的原子:H, B, C, N, O, F, Si, P, S, Cl, As, Se, Br, Te, I, At, He, Ne, Ar, Kr, Xe例子:左面的结构为 (HMg-CH2-CN),其它右面六个结构也会被检索•在荧光素或邻苯二甲酸的化合物检索中,所有其开环和闭环的结构也会被检索。
糖和半缩醛都是一样。
例子:检索左面的结构,右面结构也会被检索。
•在五卤化磷和卤化砷中,不论怎样绘图结构,以下三种结构也会被检索。
举例说明SCIFINDER的应用下载安装SciFinder2007客户端,登陆后可选择模式有三种:1、explore:search for scientific information2、locate:find a specific reference or substance3、browse:scan tables of contents of my favorite journals。
一、选择第一种explore模式:(一)查阅文献可按主题、作者名、公司或机构名称查找。
1、按主题查找:输入感兴趣的主题,如biological polymer,可得到可得到包含该词的文献181篇,涉及该概念的文献共61565篇。
查看包含该词的文献,可看到文章作者,文章名称等简单信息,如:Chen, Sha; Bai, Juan; Li, Changfei; Wang, Shumin. Biological polymer composites comprising modified starch and thermoplastic polymer.Faming Zhuanli Shenqing (2012), 10pp. CODEN: CNXXEV CN 102558615 A 20120711 CAN157:262641 AN 2012:1018614 CAPLUS继续点击右侧图标可查看文摘或是全文内容,如:Bibliographic InformationBiological polymer composites comprising modified starch and thermoplastic polymer.Chen, Sha; Bai, Juan; Li, Changfei; Wang, Shumin. (Wuhan Huali Environmental Technology Co., Ltd., Peop. Rep. China). Faming Zhuanli Shenqing (2012), 10pp. CODEN: CNXXEV CN 102558615 A 20120711 Patent written in Chinese. Application: CN 2012-10010737 20120113. Priority: CN2012-10010737 20120113. CAN 157:262641 AN 2012:1018614 CAPLUSPatent Family InformationPatent No. Kind Date Application No. Date CN 102558615 A 20120711 CN 2012-10010737 20120113Priority ApplicationCN 2012-10010737 20120113AbstractBiol. polymer composites comprise modified starch 30-45, inorg. filler 10-25, high-d. PE 27-42, coupling agent 0.5-1, heat stabilizer 0.5-1, lubricant 0.5-1 and brightening agent 1-2 parts, and low-d. PE ≤15 parts. Thus, modified starch 35 kg, talc 20 kg, HDPE 32 kg, LDPE 10 kg, titania 1 kg, calcium stearate 1 kg, zinc stearate 0.5 kg, aluminate 0.5 kg were mixed at 80︒ for 9 min, extruded at 165-200︒ to give a product showing tensile strength 20.4 MPa, elongation at break 63%.Indexing -- Section 37-6 (Plastics Manufacture and Processing)Section cross-reference(s): 44Coupling agentsFillersHeat stabilizersLubricants(biol. polymer composites comprising modified starch and thermoplastic polymer)AluminatesTitanatesRole: MOA (Modifier or additive use); USES (Uses)(biol. polymer composites comprising modified starch and thermoplastic polymer)Soybean oilRole: IMF (Industrial manufacture); POF (Polymer in formulation); TEM (Technical or engineered material use); PREP (Preparation); USES (Uses)(epoxidized, reaction product with starch; biol. polymer composites comprising modified starch and thermoplastic polymer)77-92-9DP, Citric acid, reaction product with starchRole: IMF (Industrial manufacture); POF (Polymer in formulation); TEM (Technical or engineered material use); PREP (Preparation); USES (Uses)(biol. polymer composites comprising modified starch and thermoplastic polymer)57-11-4, Octadecanoic acid, uses557-05-1, Zinc stearate1345-05-7, Lithopone1592-23-0, Calcium stearate7429-90-5D, Aluminum, derivs7440-32-6D, Titanium, derivs7440-66-6D, Zinc, derivs7440-70-2D, Calcium, derivs10043-52-4, Calcium chloride, uses13463-67-7, Titania, uses13983-17-0, Wollastonite14807-96-6, Talc, uses14808-60-7, Quartz, usesRole: MOA (Modifier or additive use); USES (Uses)(biol. polymer composites comprising modified starch and thermoplastic polymer)9002-88-4, HDPE9005-25-8D, Starch, modifiedRole: POF (Polymer in formulation); TEM (Technical or engineered material use); USES (Uses)(biol. polymer composites comprising modified starch and thermoplastic polymer)Supplementary Termspolyethylene citric acid epoxidized soybean oil modified starch compn2、按作者名查找:建立新的任务按作者名查找,输入作者名,如:wantai yang。
1. 进入数据库,选择explore; 如下图:2. 进入prefs, 设置个人喜好, 如下图:3. 选择每篇文献显示一个例子,这个非常重要。
否则每次合符条件的太多,看起来就非常累眼了。
在这里设置这个可以一劳永逸。
如果等搜到结果以后再设置时好像是只针对本次有效。
4. 进入explore, 选择explore reaction:5.进入explore reaction, 以下面化合物的第二步为例。
查一模一样的这反应肯定是没希望的,先简化掉那个醛基,在画图界面里画出反应物和产物,注意产物的二氟甲基上的氢特意画出来了。
如果不画出来的话三氟甲基的产物也会被检索出来。
其它的位置同此。
有时检索出来的结果太多了,就通过把氢都画出来来缩小检索结果数目。
用左下角的锁定功能锁定反应物和产物关键原子。
那两个1表示产物的那个碳原子来源于左边指定的那个碳原子。
这个功能也非常重要。
点击get reactions, 进入检索选择界面。
6. 在这个界面设置:选择只在特定位置可变化还是没指定的地方都可以变;通过几步的转换,如果检索结果中发现很多是多步反应才实现的转化,而你只想要一步转化的结果,就可以退回来,在这里输入1;反应分类,一般我不做任何设置;选择显示结果的类型:只显示专利还是专利以外都显示。
年份设置我一般不设置。
点OK.7. 出来三个结果,点击每一个具体的结构就可以看到和这个化合物相关的信息。
尤其是CAS#, 在这个检索结果中我们发现所用的氟化试剂是氟利昂,这是个气体,购买和使用复杂。
检索结果太少了,选择的余地太小,所以把环戊基换成甲基再查。
8. 点击顶上的back箭头。
回到如下界面:再点击get reactions9. 出来34个检索结果。
一般来说出来20到50个检索结果是比较理想的,有适当的选择性,也看得过来。
点击左上角的那个试剂查出CAS#, 拷贝到Aldrich的网站上,发现这个试剂能买到,价格还可以。
左下角的6 hit reactions in this reference表示这篇文献里有6个反应符合条件。
研发工具Scifinder《使用说明书》第一章 Scifinder数据库介绍1.1 Scifinder数据库1.1.1 检索系统支持的检索方式:主题检索、物质名称检索、分子式检索、结构式检索、亚结构式检索、相似结构式检索、反应式检索、类反应式检索、分析与二次检索。
作者、机构名称、杂志名称、专利号、CA号检索结果后处理系统:Scifinder不仅仅包含有分子式、反应式和结构式(包括亚结构检索)等多种检索功能,而且在得到初步检索结果的基础上还可以进一步利用超过20个选项的后处理功能以最快的速度找到最精确的答案。
它已经超越了检索工具的范畴,而成为研发人员不可或缺的研发工具。
包含的信息量:大于2600万条文章记录;3000多万个有机无机物质,5800多万生物序列,1100多万条单步多步反应。
信息时效:1907年-至今1.1.2 原文下载系统Scifinder具有强大的期刊和专利链接,收录了全世界9500多种主要期刊和50多家合法专利发行机构的专利文献中公布的研究成果,占全球化工信息的98%。
其中能直接链接原文的化工类核心期刊1365种,约占全球英文版电子化工类期刊总数的90%,几乎包含了所有高影响因子期刊。
1.2 Scifinder的化学学科覆盖事实上,Scifinder数据库囊括了自20世纪以来所有与化学相关的资料,以及大量生命科学及及其它科学学科方面的信息。
1.2.1 生命科学领域遗传学、基因组学、酶学、蛋白质组学、实验内科学、生物化学、生物技术学、分子生物学、微生物学、细胞生物学、药理学等能够保证将9大主要专利组织2日内发布的与生物加工方法、蛋白质组技术、新遗传学工艺,及其它对现代药品开发至关重要的课题等相关的专利收录进来;通过Scifinder访问遗传学、酶学、生物化学、生物技术学及更多科学信息。
用户可查找:摘自细胞、科学、核酸研究、现代药品开发资料及其它知名期刊的科学信息。
1.2.2 传统化学领域有机化学高分子——聚合物、塑料、纺织、橡胶粘合剂等应用化学和化学工程——加工、工业化学、金属/合金、陶瓷、环境等物理化学、无机化学和分析化学1.3 Scifinder检索路径汇总第二章 Scifinder 检索界面2.1 Scifinder检索界面登录Scifinder 后出现一下界面(默认为新任务窗口):2.2 Scifinder 主检索界面点击新任务(New Task)按钮,出现Scifinder 主检索界面,这是各个检索路径的共同起点,是进入检索的入口。
SciFinder 检索方法简单介绍SciFinder Scholar简单介绍:SciFinder Scholar是美国化学学会(ACS)旗下的化学文摘服务社CAS (Chemical Abstract Service)所出版的化学资料电子数据库学术版。
其中的CAPLUS是CA的网络版,它是全世界最大、最全面的化学和科学信息数据库。
作为化学和生命科学研究领域中不可或缺的参考和研究工具的“化学文摘”的网络版,SciFinder 在线数据库每天更新数千条记录,更整合了Medline医学数据库、欧洲和美国等50家专利机构的全文专利资料、它可以透过网络直接查看“化学文摘”1907年以来的所有期刊文献和专利摘要;以及四千多万的化学物质记录和CAS注册号。
可访问的蛋白质和核酸信息远多于任何可公开获得的资源。
它涵盖的学科包括应用化学、化学工程、普通化学、物理、生物学、生命科学、医学、聚合体学、材料学、地质学、食品科学和农学等诸多领域。
到目前为止, SciFinder已收文献量占全世界化工化学总文献量的98%。
另外,它还有分子式、反应式和结构式(包括亚结构)检索、核酸和蛋白质序列检索等多种功能。
它超越了一般检索工具的范畴,而成为研发人员不可或缺的研发工具。
SciFinder Scholar可检索数据库包括:① CAPLUSSM(>2150万条参考书目记录,每天更新3000条以上,始自1907年)②CAS REGISTRYSM(>2000万条物质记录,每天更新约4000条,每种化学物质有唯一对应的CAS注册号,始自1957年)③CASREACT?(>570万条反应记录,每周更新约600-1300条,始自1974年)④CHEMCATS?(>390万条商业化学物质记录,来自655家供应商的766种目录)⑤ CHMLIST?(>22.7万种化合物的详细清单,来自13个国家和国际性组织)⑥ MEDLINE(National Library of Medicine数据库,>1200万参考书目记录,来自3900多种期刊,始自1958年)安装注意事项:①、安装前退出所有程序,网页浏览器除外。
1. 进入数据库,选择explore; 如下图:
2. 进入prefs, 设置个人喜好, 如下图:
3. 选择每篇文献显示一个例子,这个非常重要。
否则每次合符条件的太多,看起来就非常累眼了。
在这里设置这个可以一劳永逸。
如果等搜到结果以后再设置时好像是只针对本次有效。
4. 进入explore, 选择explore reaction:
5.进入explore reaction, 以下面化合物的第二步为例。
查一模一样的这反应肯定是没希望的,先简化掉那个醛基,
在画图界面里画出反应物和产物,注意产物的二氟甲基上的氢特意画出来了。
如果不画出来
的话三氟甲基的产物也会被检索出来。
其它的位置同此。
有时检索出来的结果太多了,就通过把氢都画出来来缩小检索结果数目。
用左下角的锁定功能锁定反应物和产物关键原子。
那两个1表示产物的那个碳原子来源于左边指定的那个碳原子。
这个功能也非常重要。
点击get reactions, 进入检索选择界面。
6. 在这个界面设置:
选择只在特定位置可变化还是没指定的地方都可以变;通过几步的转换,如果检索结果中发现很多是多步反应才实现的转化,而你只想要一步转化的结果,就可以退回来,在这里输入1;反应分类,一般我不做任何设置;选择显示结果的类型:只显示专利还是专利以外都显示。
年份设置我一般不设置。
点OK.
7. 出来三个结果,点击每一个具体的结构就可以看到和这个化合物相关的信息。
尤其是CAS#, 在这个检索结果中我们发现所用的氟化试剂是氟利昂,这是个气体,购买和使用复杂。
检索结果太少了,选择的余地太小,所以把环戊基换成甲基再查。
8. 点击顶上的back箭头。
回到如下界面:再点击get reactions
9. 出来34个检索结果。
一般来说出来20到50个检索结果是比较理想的,有适当的选择性,也看得过来。
点击左上角的那个试剂查出CAS#, 拷贝到Aldrich的网站上,发现这个试剂能买到,价格还可以。
左下角的6 hit reactions in this reference表示这篇文献里有6个反应符合条件。
如果我们当初不设置每篇文献只显示一条的话这时显示的就是6条,34篇文献里显示出来的就是一二百条了。
就看不过来了。
PCT Int Appl表示是国际专利。
登录drug future 网址:/Index.html)点击欧洲专利打包下载
10. 输入WO200979692, 选择任何一个查询线路。
既可下载专利全文。
WO也是国际专利的意思,两个专利是同一个。
用PCT打头是检索不到的。
再往下拉会发现还有用苯磺酰的氟甲烷做的。
文献是一片杂志,我们目前是组长和少数老员
工有代理账号,你把文献信息给他们,让他们帮忙查。
检索过程会学习到很多以前没见过的反应和试剂。
检索工具的功能不限于我们介绍的这几种。
它的功能非常强大,多探索还会有更多的发现。
所以多用检索工具本身就是学习的过程。
下面补充几个检索的案例:
案例-1:化合物10到化合物7,需要脱掉苄基又保持那个烯键。
检索技巧如下:应用位置可变工具使烯键的位置可以为苯环的邻,间和对位,烯键上加上两个氢原子和产物酚上的氢也画出来限制检索结果的个数。
检索结果显示有112条,大致浏览后发现主要有几个方法:催化氢化,TFA, BCl3, HCl
我试验了催化氢化,TFA和6 N HCl, 结果发现6 N HCl的反应结果很好。
案例-2:化合物7到9。
检索界面如下:用中括号把产物的CH2扩一下,然后在From to 栏里输入1-5,表示可以从1个碳原子到5个碳原子。
点击preview预浏览一下,这样可以节省流量。
显示出来的是化合物,没有什么用处,点击“Back” , 还是去点击“get reaction”
在这个检索结果里进行帅选是不算流量的。
进入下面的界面:选择“Refine”
选择“Reaction Structure”
回到检索界面:
这时把把N, N-二甲基上的氢都加上去,把可变原子数变为2-3. 点击“get reaction”
进入下面的对话框,选择“substructure…”
还是出来700多个结果,所以把酯基也加上去。
出来还是有两百多结果。
再帅选,选择“reaction classification”
选择“Non catalyzed”和“catalyzed”
出来30个检索结果,主要有Me2NCH2CH2Cl/K2CO3/KI/DMF;
Me2NCH2CH2OH/DEAP/PPh3等。
总的来说,个人觉得初次Analyze工具的效率低。
熟练以后应该会快不少。