全自动核酸提取仪器及试剂对比
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两种全自动核酸检测系统对乙肝核酸检测性能的比较1. 引言1.1 背景介绍乙肝是一种由乙型肝炎病毒引起的肝炎感染,是全球范围内的公共卫生问题。
乙肝病毒主要通过血液和体液传播,感染者可能长期携带病毒而不易被发现,严重危害人类健康。
乙肝核酸检测是诊断乙肝感染的重要手段之一,能够准确、快速地检测出感染者体内的乙肝病毒核酸,对病情的诊断和治疗具有重要意义。
随着科技的发展和医疗设备的改进,全自动核酸检测系统逐渐成为乙肝核酸检测的主流工具。
这些系统能够自动完成样本处理、核酸提取、PCR扩增等步骤,大大提高了检测效率和准确性。
目前市面上有许多种全自动核酸检测系统,其中以系统A和系统B最为常见和应用广泛。
针对这两种系统,本文将从检测灵敏度、检测效率和成本效益等方面进行比较分析,旨在为乙肝核酸检测提供更好的选择和指导。
1.2 研究目的本研究旨在比较两种全自动核酸检测系统在乙肝核酸检测方面的性能表现,分析它们在检测灵敏度、检测效率和成本效益等方面的差异,为临床医学实践提供参考依据。
通过对这两种系统的工作原理进行详细解析,并结合相应指标的比较分析,旨在为乙肝核酸检测的选择提供决策支持,为临床医生、研究人员和患者提供更准确、快速和经济有效的检测方案选择。
通过本研究的深入比较,希望能够揭示不同系统之间的优劣势,为相关技术的研发和应用提供指导意见,促进乙肝疫苗接种和疾病预防控制工作的开展,提高核酸检测技术在临床诊断和流行病学监测中的应用水平和质量。
2. 正文2.1 核酸检测系统A的工作原理核酸检测系统A是一种全自动的检测系统,其工作原理主要包括以下几个步骤:样本处理阶段。
在这个阶段,样本会被提取并经过一系列处理步骤,包括溶解、离心、洗涤等,以保证样本中核酸的纯度和完整性。
接着,核酸提取阶段。
在这个阶段,通过化学方法或磁珠吸附法等技术,将样本中的核酸提取出来,并使其分离纯化。
然后,核酸扩增阶段。
在这个阶段,核酸会被放入PCR仪器中进行扩增,通过循环反应使核酸序列倍增。
新城疫(newcastle disease ,ND )是由新城疫病毒(newcas-tle disease virus ,NDV )强毒株引起的、以感染禽类为主的一种急性、热性、败血性和高度接触性传染病[1],具有很高的发病率和死亡率,在全球范围内广泛流行,曾在世界范围内引起三次大的流行,给养禽业造成了巨大的经济损失,严重影响了养禽业的发展,该病与高致病性禽流感并列为世界公认的最重要的2个禽类疫病[2,3]。
世界动物卫生组织(OIE )将新城疫列为A 类疫病,我国将其列入一类动物疫病[4]。
目前检测新城疫病毒的常用方法为荧光定量RT-PCR ,该方法比常规的检测方法用时少、周期短、灵敏、准确、特异性强、操作简便[5],且不易引起污染,还可用于病毒的定量分析。
在检测过程中,提取核酸是关键环节,因为提取后的核酸质量及其完整性会直接影响到后续试验结果[6]。
本研究选用实验室常用的磁珠法和柱式法提取病毒核酸进行荧光定量RT-PCR 检测,发现两种提取方法在灵敏度及重复性等方面存在差异。
现将研究结果报告如下。
1材料与方法1.1材料1.1.1主要仪器与设备King Fisher Flex 96通道全自动核酸提取仪,微量移液器,MIKRO 200R 高速冷冻离心机,BIO-RAD CFX Connect 荧光定量PCR 仪。
1.1.2检测试剂新城疫病毒荧光RT-PCR 试剂盒,购自深圳澳东检验检测科技有限公司,批号:66080;病毒核酸(RNA )抽提试剂盒(离心柱式),购自深圳澳东检验检测科技有限公司,批号:69015;病毒核酸提取试剂(磁珠法),购自广州和实生物技术有限公司,批号:CZD00412。
1.1.3样品2020年主要禽病流行病学调查及监测中,筛查出的新城疫阳性样品(鸡咽泄拭子和环境拭子),共22份。
1.2方法1.2.1磁珠法将拭子样品混匀,静置3~5min ,取200μL 上清,由KingFisher Flex 96通道全自动核酸提取仪提取核酸,最后获得100μL RNA 溶液。
乙肝病毒DNA检测2种不同核酸提取方法的性能验证情况分析董剑;许小华【摘要】目的:对乙肝病毒DNA(HBV-DNA)检测的2种不同核酸提取方法,即手工法(煮沸法)和全自动核酸提取仪法(磁珠法),在使用相同的检测试剂和核酸扩增仪的条件下进行性能验证,以评价其验证结果.方法:依据《医学实验室质量和能力认可准则》《全国临床检验操作规程》等相关文件,由同一操作人员应用中山达安公司生产的HBV-DNA检测试剂盒和ABI7500实时荧光核酸扩增仪,分别采用手工法和全自动核酸提取仪法提取HBV-DNA进行临床样本的批内精密度、批间精密度、正确度、线性范围性能验证实验.结果:手工法的高值血清批内精密度为2.18%,低值血清批内精密度为3.76%;高值质控品批间精密度为3.29%.全自动核酸提取仪法的高值血清批内精密度为1.78%,低值血清批内精密度为2.44%;高值质控品批间精密度为2.84%.正确度验证分别取浓度为2.0×103、2.0×104、2.0×105、2.0×106copies/ml的可溯源标准品进行验证,手工法偏倚分别为-4.88%、-2.51%、-2.46%,-2.12%,全自动核酸提取仪法偏倚分别为-2.37%、-0.95%、0.74%、-1.33%.线性范围验证中,手工法和全自动核酸提取仪法的相关系数分别为0.9660、0.985 8,均能满足临床检测的需求.结论:全自动核酸提取仪法较手工法提取核酸有利于简化HBV-DNA提取流程,实现分子生物实验室自动化提取核酸.【期刊名称】《医疗卫生装备》【年(卷),期】2019(040)006【总页数】4页(P40-43)【关键词】乙型肝炎病毒DNA定量检测;手工(煮沸法);全自动核酸提取仪法(磁珠法);性能验证;血清【作者】董剑;许小华【作者单位】联勤保障部队第909医院检验科,厦门大学附属东南医院检验科,福建漳州363000;联勤保障部队第909医院检验科,厦门大学附属东南医院检验科,福建漳州363000【正文语种】中文【中图分类】R318;R446.10 引言乙型肝炎也被称为乙肝,是目前世界上最常见的一类传染病,据不完全统计[1] ,在全世界范围每年至少有100万以上的患者死于乙肝。
Doi : 10. 13621 /j. 1001 - 5949. 2020. 10. 0913-实验研究-不同新型冠状病毒核酸检测试剂性能比较分析张伟宏马 雯*2,李富荣2,葸 静3,金哲宇2叭崔学强2,何瑞芬2,张俊华2,朴文花2[基金项目]宁夏重点研发计划科技支撑"新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控”专项(2020BEG03023)[作者单位]1.宁夏银川市疾病预防控制中心,宁夏银川7500022. 宁夏回族自治区人民医院临床医学检验诊断中心, 宁夏银川7500023. 宁夏金域医学检验所,宁夏银川7500024. 苏州大学附属第一医院骨科,江苏苏州215006[通讯作者]朴文花,Email : ******************[摘要]目的 比较6种新型冠状病毒核酸检测试剂盒的性能,为相关实验室选择核酸检测试剂提供参考依据。
方法 选择6种国产新型冠状病毒核酸检测试剂盒,比较其基本情况,并用5例阳性患者的咽拭子标 本,提取RNA 倍比稀释后进行RT-qPCR 检测,分析扩增结果,评估各试剂盒的差异。
结果 使用核酸检测试剂盒检测稀释后的RNA ,扩增后可见IC 基因、N 基因及ORF1ab 基因的Ct 值及A Rn 值有显著差异;在1 :16稀释 倍数时F 试剂未检测到ORF1ab 基因,C 试剂在1 :64时无法检出ORF1ab 基因和N 基因,A 、B 、D 试剂在1 :256 稀释倍数时未检测到ORFlab 基因和N 基因,E 试剂在各个稀释度均可扩增IC 、ORF1ab 、N 及E 4个基因。
结论新型冠状病毒核酸检测试剂对低病毒载量核酸的检测能力有较大差异,各实验室选用试剂时需要进行 性能验证,根据检测目的和检测对象选择合适的试剂盒。
[关键词]2019新型冠状病毒;核酸检测;试剂盒;性能比较[中图分类号]R192.3 [文献标识码]AComparison and analysis oftheperformancein different COVID-19 nucleic acid detection reagentsZHANG Weihong 1,MA Wen 2, LI Furong 2,XI Jing 3,JIN Zheyu 2'4, CUI Xueqiang 1,HE Ruifen 2,ZHANG Junhua 2,PIA O Wenhua^.1. The Center for Disease Control and Preventionof Yinchuan ,Yinchuan 750002,China ;2. The Department of Clinical MedicalExamination and Diagnosis Center ,Ningxia Hui Autonomous Region People's Hospital ,Yinchuan 750002,China ; 3. Ningxia Jinyu Medical Laboratory ,Yinchuan 750002,China ; 4. Department of Orthopedics ,The First Affiliated Hospital of Suzhou University , Suzhou 215006, ChinaCorresponding author : PIA O Wenhua ,Email : ******************[Abstract ] Objective To compare and analyze the detection ability of six domestic SARS -CoV -2 (Covid-19) detection kits ,thus providing reference for molecular laboratories. Methods Six domestic detection kits ,categorized randomLy from A to F , were selected and applied in the detection of SARS-Cov-2. Five positive nasopharyngeal swab specimens were selected in the study , Ct(threshold cycle )value , ARn value and detection of target genes(ORF1ab ,E and N gene )and IC gene were analyzed and evaluated prior to and after different dilution folds. Results Ct (threshold cycle )and ARn value for ORF1ab , IC , E , N gene showed statistically significant differences at different dilution folds for six detection kits. At the dilution of 1:16,F kit was unable to detect ORF1ab gene. At the dilution of 1 :64, C kit was unable to detect ORF1ab and N gene. At a dilution of 1 :256, A , B and D kits were unable detect ORF1ab and N genes. E kit detected IC , ORF1ab , N and E gene at all dilution folds. Conclusion Detection ability for 6 nucleic acid detection kits varied for low -viral load samples. Performance validation prior selection of kits is recommended. Selection of reagent kits should be based on the aim of the testing and testing subjects.[Key words ] SARS-Cov-2; Nucleic acid detection ; Re a ge n t kits ; Performance comparison.由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在世界范围内迅速蔓延,RT-qPCR 检测新冠病毒核酸阳性作为诊断疾病 的标准,在疾病的防控中发挥了重要的作用⑴。
核酸自动提取纯化仪面对当前疫病世界范围内流行蔓延,需要大规模进行核酸检测的现状,核酸提取产业化、自动化已成为不可抵挡的趋势,因此,核酸自动提取纯化仪在核酸提取自动化过程中不可或缺。
核酸自动提取纯化仪是应用配套的核酸提取试剂来自动完成样本核酸的提取工作的仪器。
它可替代原来复杂的手动操作,仪器自动完成对细胞或组织的处理,分析提取出目标DNA/RNA。
洛阳慧庆生物科技有限公司的核酸自动提取纯化仪的提取原理为磁珠法。
它是通过细胞裂解液裂解样本,从样本中游离出来的核酸分子被特异的吸附到磁性颗粒表面,而蛋白质等杂质不被吸附而留在溶液中,再在磁场作用下,使磁性颗粒与液体分开,回收颗粒(即磁珠-核酸混合物),再用洗脱液洗脱即可以得到高纯度的核酸。
洛阳慧庆生物科技有限公司的核酸自动提取纯化仪具有自动化程度高,提取速度快,结果稳定,操作简便等优点。
使用96孔深孔板试剂盒,可同时纯化1-32个样品,一批样本的提取时间最短可达11分钟。
可搭配不同种类的磁珠法核酸提取试剂,快速提取动植物组织、血液、体液等样品中的DNA或RNA。
同时它体积小巧,重量为17千克,仪器运行接近静音,便于运输和放置实验室使用,内置电池,在突然断电情况下仍可运行2小时,防止因断电等情况而导致实验无法进行。
洛阳慧庆核酸自动提取纯化仪产品特点:1、最大通量:32个样本/批;2、提取时间:11min/批;(可根据不同试剂盒产品进行差异化参数设置)3、实验重复性、稳定性好;4、操作简单,触屏可视化界面;5、体积小巧、运输方便、占据实验空间小,仪器重量仅17kg;6、专业的结构设计,仪器运行接近静音;7、操作软件设计通用性强,可适合各厂家提取试剂盒;8、内置电池,在突然断电情况下仍然可以继续运行;9、一次性磁棒套、紫外灭菌灯以及先进排气系统(HEPA)的使用,可有效保障环境和人员的生物安全,并且可有效截留气溶胶,避免不同批次试剂间的交叉污染。
五种核酸提取仪的比较 Document number:NOCG-YUNOO-BUYTT-UU986-1986UT
五种核酸自动提取仪的比较
百泰克仪器如何避免样品交叉污染
1、百泰克仪器的设计使每个样本在提取过程中有独立的空间,整个过程中,带有DNA的磁棒只
在规定的6个孔移动,不经过其他样本的上空,所以不会产生滴液污染。
百泰克仪器相对于其他仪器的优势
1、百泰克仪器相对于其他仪器有明显的优势,从上述对比表格中很清楚的得出结论,最明显的优势是我们的仪器不管对于任何样本都可以提取,不会受样本类型的影响,不会产生吸附柱堵住,移液器枪头堵住导致裂解不好等影响,纯度和得率高于对方一筹。
五种核酸自动提取仪的比较
百泰克仪器如何避免样品交叉污染
1、百泰克仪器的设计使每个样本在提取过程中有独立的空间,整个过程中,带有DNA的磁棒只在规定的6个孔移动,不经过其他样本的上空,所以不会
产生滴液污染.
百泰克仪器相对于其他仪器的优势
1、百泰克仪器相对于其他仪器有明显的优势,从上述对比表格中很清楚的得出结论,最明显的优势是我们的仪器不管对于任何样本都可以提取,不会受样本类型的影响,不会产生吸附柱堵住,移液器枪头堵住导致裂解不好等影响,纯度和得率高于对方一筹。
全自动核酸提取仪工作原理一、引言全自动核酸提取仪是一种高效、精确的实验设备,广泛应用于生物医学领域的核酸提取过程中。
它通过自动化的方式,实现了对样本中的核酸进行提取和纯化的过程,大大提高了实验效率和准确性。
本文将主要介绍全自动核酸提取仪的工作原理。
二、工作原理全自动核酸提取仪主要由样本处理模块、核酸提取模块、洗涤模块、干燥模块和存储模块组成。
其工作原理可以概括为以下几个步骤:1. 样本处理:将待提取的样本放入样本处理模块中,通过特定的方法,如离心或超声波处理,使样本中的细胞或病毒破裂,释放出核酸。
2. 核酸提取:经过样本处理后,样本中的细胞或病毒溶解,核酸溶液与提取试剂混合后形成复合物。
核酸提取模块中的磁珠吸附这些复合物,并通过磁力的作用将其沉降到底部。
3. 洗涤:经过核酸提取后,为了去除杂质和残留的试剂,需要进行洗涤步骤。
洗涤模块中的洗涤缓冲液与磁珠上的核酸复合物结合,然后通过磁力的作用将洗涤液吸附到底部,将杂质和残留的试剂去除。
4. 干燥:洗涤后的核酸复合物需要去除液体,以便进行后续的操作。
干燥模块中的干燥缓冲液与磁珠上的核酸复合物结合,然后通过磁力的作用将液体吸附到底部,使核酸复合物干燥。
5. 存储:经过干燥后的核酸复合物可以长时间保存。
存储模块中的稳定液与核酸复合物结合,形成稳定的复合物,以便后续的分析和实验。
三、优势与应用全自动核酸提取仪具有以下优势和应用:1. 高效性:全自动核酸提取仪可以同时处理多个样本,大大提高了核酸提取的效率。
相比手工操作,其处理速度更快,且结果更准确可靠。
2. 准确性:全自动核酸提取仪通过精确的控制和自动化的操作,可以减少人为操作的误差,提高核酸提取的准确性。
3. 灵活性:全自动核酸提取仪可根据不同的实验需求和样本特点进行调整和优化,适用于不同类型的核酸提取。
4. 应用广泛:全自动核酸提取仪广泛应用于医学、生物学、遗传学等领域的核酸提取过程中。
例如,在临床诊断中,可用于病毒核酸的提取和检测,以帮助医师进行疾病的早期诊断和治疗。
核酸提取自动化仪器原理引言核酸提取是生物学研究和临床诊断中非常重要的步骤之一,它可以从生物样本中分离和纯化出核酸分子。
传统的核酸提取方法通常耗时、劳动密集且易受操作者技术水平的影响。
为了提高核酸提取的效率和准确性,自动化仪器被广泛应用于核酸提取过程中。
本文将详细解释与核酸提取自动化仪器原理相关的基本原理。
核酸提取自动化仪器基本原理核酸提取自动化仪器主要由以下几个部分组成:样本处理模块、核酸纯化模块、溶剂处理模块、温控模块、机械臂和控制系统。
1. 样本处理模块样本处理模块是核酸提取自动化仪器的第一个部分,其主要功能是将待提取的样本加入到自动化仪器中。
样本可以是血液、组织、细胞等生物样本,通常需要经过前处理步骤,如离心、裂解等。
样本处理模块通常包括样本输入装置、样本转移装置和样本处理装置。
样本输入装置用于将待提取的样本输入到自动化仪器中。
常见的输入方式包括使用样本管架、样本针头等。
样本转移装置用于将样本从输入装置中转移到样本处理装置中。
转移过程通常需要控制样本的体积和精确度。
样本处理装置是核酸提取的关键部分,它包括样本混匀、裂解、蛋白质沉淀等处理步骤。
2. 核酸纯化模块核酸纯化模块是核酸提取自动化仪器的核心部分,其主要功能是从样本中分离和纯化核酸分子。
核酸纯化的基本原理是利用核酸的特性,在特定条件下将核酸与其他样品成分分离开来。
核酸纯化模块通常包括细胞破碎、蛋白质去除、核酸吸附、洗脱等步骤。
细胞破碎是核酸纯化的第一步,它通常使用裂解缓冲液和机械力等方式将细胞破碎,释放出细胞内的核酸。
蛋白质去除是将蛋白质从核酸中分离出来的步骤,常用的方法包括酚-氯仿法、酶解法等。
核酸吸附是利用核酸与某些固相材料(如硅胶、磁珠等)之间的亲和性将核酸吸附在固相材料上。
洗脱步骤是将吸附在固相材料上的核酸从固相材料上洗脱下来,得到纯净的核酸溶液。
3. 溶剂处理模块溶剂处理模块是核酸提取自动化仪器的另一个重要部分,其主要功能是提供和处理用于核酸提取的各种溶剂。
两种HBV DNA定量检测方法的临床对比研究王爽;王雅杰;郭杰;王大刚;时景仁;潘美晨;殷商启;何超男;孟欢;张响【摘要】目的比较某国产实时荧光定量PCR试剂(后称国产试剂)与某进口(后称进口试剂)检测乙型肝炎病毒(HBV)DNA的定量的结果.方法根据进口试剂检测结果抽取514份慢性乙型肝炎的血浆标本,采用国产全自动核酸提取仪和PCR高敏试剂进行HBV DNA定量平行检测,以分析国产试剂的检测情况和与进口试剂的结果差异和相关性.结果进口试剂和国产试剂的阳性检出率分别为77.2%和78.5%,不符合率分别为7.2%和8.6%,两者无明显差异;Spearman相关分析显示,两种试剂检测的HBV DNA在20~1.7×108 IU/mL区间内检测结果的相关系数(r=0.966,P<0.0001),表明二者具有较强的相关性;Bland?Altman分析2种方法检测病毒载量的差异分析显示结果具有较高的一致性.结论国产高敏试剂和进口试剂,检测血浆HBVDNA在20~1.7×108 IU/mL的病毒载量结果具有较好的相关性和一致性.【期刊名称】《分子诊断与治疗杂志》【年(卷),期】2019(011)005【总页数】5页(P374-378)【关键词】乙型肝炎病毒DNA;荧光定量PCR;病毒载量;一致性【作者】王爽;王雅杰;郭杰;王大刚;时景仁;潘美晨;殷商启;何超男;孟欢;张响【作者单位】首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015【正文语种】中文在目前全球面临的最严峻的公共卫生问题中,乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是最大的问题之一,目前全球慢性感染者逾2.57 亿人,每年死亡88.7 万人,其中约25%死于肝癌或肝脏相关并发症[1]。
国产全自动核酸提取仪的比较比较国产全自动核酸提取仪的特点:厂家仪器通道防污染措施提取时间___ 16、20、32、96 循环风路、hepa滤膜、紫外 30-40min西安天隆 24、32、48、96 紫外 30-50min杭州博日 32、96 30-60min___ 24、32、48、96 紫外 15-40min杭州艾康 32 紫外 12-40min___ 32 循环风路、hepa滤膜、紫外 30-70min___ 24、32、96 紫外 30-50min江苏硕世 24、32、96 30-50min百泰克 16、32 <60min厦门致善 32 30-60min___生物 24、32 30-40min天根 16、32 30-40min均一性 CV值___ <5%西安天隆 <5%___ <3%___ <5%杭州___ <1.5%___ <5%___ <3%江苏硕世 <5%百泰克 <5%厦门致善 <5%___生物 <5%天根 <5%是否有试剂盒磁珠回收率处理体积南京___ 有。
99% 30ul-2000ul西安天隆有。
99% 30ul-15ml杭州博日有。
98% 10ul-1000ul___ 无。
95% 50ul-10ml杭州艾康有。
98% 20ul-1000ul___ 有。
99% 100ul-2400ul___ 有。
98% 20ul-1100ul江苏硕世有。
99% Max1000ul百泰克有。
99% 20ul-7000ul厦门致善有。
99% 50ul-1000ul___生物有。
99% 50ul-1000ul天根有。
99% 20ul-2400ul对比这些国产全自动核酸提取仪,可以发现它们在通道、防污染措施、提取时间、均一性、是否有试剂盒、磁珠回收率和处理体积等方面存在差异。
其中,南京___、西安天隆、杭州博日、杭州奥盛、杭州艾康、___、___、江苏硕世、___、厦门致善、济凡生物和天根这些品牌的全自动核酸提取仪都有其各自的特点和优势。
文章编号:1673-8640(2021)05-0530-05 中图分类号:R373.9 文献标志码:A DOI:10.3969/j.issn.1673-8640.2021.05.015不同核酸提取方法SARS-CoV-2核酸检测性能比较张云丽,王 鑫,邵 玲,曲 波,赵鸿梅(辽宁省人民医院检验医学科,辽宁沈阳 110016)摘要:目的比较磁珠吸附法和样本释放剂法对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)核酸检测结果的符合率、重复性及检出限,优选出提取效率高、耗时短、成本低的核酸提取方法。
方法采用2种核酸提取方法的3种商品化核酸提取试剂,分别对阴性样本、阳性样本及不同浓度(稀释度20~28)的SARS-CoV-2 RNA标准品进行RNA提取及实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测,以Ct值评价不同核酸提取方法的性能。
结果3种核酸提取试剂的阴性和阳性样本结果符合率均为100%。
使用磁珠吸附法进行核酸提取的变异系数(CV)(CV为0.89%~1.58%)低于样本释放剂法,样本释放剂B的CV(CV为0.83%~2.73%)次之,样本释放剂A的CV最大(CV为1.62%~4.90%)。
磁珠吸附法及样本释放剂B提取核酸的检出限均为156.3 拷贝/mL,样本释放剂A的检出限为625.0 拷贝/mL。
结论磁珠吸附法核酸提取试剂核酸提取效率高、重复性好,适合大批量样本的集中操作。
关键词:严重急性呼吸综合征冠状病毒2;核酸检测;核酸提取;实时逆转录荧光聚合酶链反应Comparison of different nucleic acid extraction methods for the detection of SARS-Cov-2 ZHANG Yunli,WANG Xin,SHAO Ling,QU Bo,ZHAO Hongmei.(Department of Clinical Laboratory,Liaoning Provincial People's Hospital,Shenyang 110016,Liaoning,China)Abstract:Objective To compare the consistency rate,repeatability and detection limit of magnetic bead adsorption method and sample releasing agent method in the nucleic acid extraction of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2),so as to optimize the extraction method of nucleic acid with high extraction efficiency,short time consuming and low cost. Methods Totally,3 commercial nucleic acid extraction reagents for 2 methods of nucleic acid extraction were used to extract RNA from negative samples,positive samples and SARS-CoV-2 standard samples with different dilution(20-28),and real-time fluorescence reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR) was performed. Ct value was used to evaluate the performance of different nucleic acid extraction methods. Results The consistency rate of negative and positive samples of 3 nucleic acid extraction reagents was 100%. The coefficient of variation(CV) of magnetic bead adsorption method was lower than those of sample releasing agent method(CV 0.89%-1.58%),sample releasing agent A(CV 1.62%-4.90%) and sample releasing agent B(CV 0.83%-2.73%). The detection limit of magnetic bead adsorption methodand sample releasing agent B was 156.3 copies/mL,and that of sample releasing agent A was 625.0 copies/mL.Conclusions The magnetic bead adsorption method of nucleic acid extraction is efficient and reproducible,which is suitable for the centralized operation of a large number of samples.Key words:Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2;Nucleic acid detection;Nucleic acid extraction;Real-time fluorescence reverse transcription-polymerase chain reaction作者简介:张云丽,女,1988年生,主管技师,主要从事临床生化免疫研究。