DNA的提取及电泳检测
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外周血 DNA提取
【实验原理】
真核细胞DNA分子存在于细胞核中,并与核蛋白结合而稳定存在,故而可以通过提取Buffer液破坏胞膜及核膜,释放出高分子量的基因组DNA,并用蛋白酶K将核蛋白降解成小片段从核酸上分离下来,这样便初步得到了基因组DNA,然后通过苯酚、氯仿等提取进一步去除蛋白质,再用乙醇洗涤沉淀,得到的DNA分子便可以满足一般的实验要求了。
【操作步骤】
1. 取500μl冰冻血样,加等体积1×PBS,混匀15000r/min离心4min,弃去上液重复两次。
2. 加350μl抽提Buffer,RNase1μl(10μg/ml)37℃温育30min。
3. 再加prok酶(10mg/ml)10μl,55℃消化过夜,根据消化情况可补加一次prok酶。
4. 加等体积(500ul)酚抽提,离心(15000r/min 5min),取上层液于另一支Eppedorf管中。
5. 加酚:氯仿(1∶1)(200ul:200ul)抽提,离心(15000r/min 5min)取上层液与另一支Eppedorf管中。
6. 加氯仿(等体积)(500ul)抽提,离心(15000r/min 5min)取上层与另一支Eppedorf管中。
7. 加1/5V(60ul)的乙酸铵和2V(600ul)的无水乙醇(-20℃)静置10min后,离心(15000r/min
5min),倒去上清夜。
8. 加75%乙醇(500ul)洗DNA沉淀一次,(12000r/min 1min),倒去上清夜,将离心管倒置在滤纸上,除尽残余的乙醇,
9. 加灭菌水70-80μl溶解(室温1-2h,4℃过夜)。
琼脂糖凝胶电泳
【实验原理】
核酸分子是两性解离分子,在高于其等电点的电泳缓冲液中(PH8.0~8.3),其碱基不解离,而磷酸全部解离,核酸分子带负电荷,向正极移动,采用琼脂糖凝胶作为电泳支持介质,发挥分子筛功能,使得分子大小和构象不同的核酸分子泳动率出现较大差异,达到分离目的。此外,直接用低浓度的荧光嵌入染料溴乙锭或4S Green Plus进行染色,可确定DNA在凝胶中的位置,少至1—10ng的DNA条带即可直接在紫外灯下检出。
【操作步骤】
1.选择合适的水平式电泳槽,调节电泳槽平面至水平,检查稳压电源与负极的线路。
2.用胶纸将制槽板两端封住,形成一个胶膜,将胶膜放在工作台的水平位置上。选择孔径大小适宜的梳板。
3.配制1%的琼脂糖凝胶:准确称量1g琼脂糖凝胶,溶于100ml电泳缓冲液0.5×TBE中,加热溶解待溶液冷却至60℃,加入溴乙锭5μl(10mg/ml)至终浓度为0.5μg/ml或Green
Plus染料10-12μl,充分混匀后,将温热的琼脂糖液缓慢到入胶膜中,注意使其不产生气泡。
4.待凝胶完全凝固后,小心移去梳板和胶纸。将凝胶放入电泳槽中。
5.加入没过胶面约1mm的足量电泳缓冲液(0.5×TBE)。
6.取待测DNA样品15μl加入加样缓冲液4μl,混匀小心加样,记录样品次序与点样量。
7.盖上电泳槽并通电,采用90-120V的电压,时间为0.5~1小时即可。
8.切断电源,取出凝胶直接在紫外透射仪(溴乙锭)或蓝光切胶仪(4S Green Plus)上观察记录结果。
4S Green 是EB(溴化乙锭)的新型替代品,无毒无致癌作用。其灵敏度与EB相当,使用方法完全相同,可与单、双链DNA和RNA结合。
【实验结果】