第一章原核微生物分类和代表
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第一章 原核微生物的形态构造
44
2、细菌细胞的特殊构造： 不是所有细菌细胞都具有的构造，称作特殊构造
1）、糖被（glycocalyx）
（1) 概念 包被于某些细菌细胞壁外的一层厚度不定的
胶状物质。糖被按其有无固定层次、层次厚薄又可 细分为荚膜（capsule或macrocapsule，大荚膜）、 微荚膜(microcapsule)、粘液层(slimelayer)和菌胶团 (zoogloea)。
生长、分裂、鞭毛运动所必须。 阻拦大分子有害物质。 抗原性，敏感性。
19
20
(1)革兰氏阳性细菌的细胞壁成分
特点：厚度大（20~80nm） 、化学组分简单，一般含90%肽聚 糖和10%磷壁酸
21
肽聚糖单体:由双糖单位（N—乙酰葡糖胺与N— 乙酰胞壁酸组成)、四肽尾或四肽侧链、肽桥 或肽间桥三部分组成。
结构简单、胞壁坚韧、 多以二分裂方式繁殖 和水生性较强的原核 生物。
3
一、细胞的形态构造及其功能
（一）形态和染色
球状
基
本 形
杆状
态
螺旋状
自然界中杆菌最常见，球菌次之，螺旋菌最4 少.
1、球菌：球状的细菌称为球菌（coccus）。 有单球菌、双球菌、四联球菌、八叠球菌、
链球菌和葡萄球菌等 。
5
根 据 分 裂 方 向 及 随 后 相 互 间 的 连 接 方 式
比正常有细胞壁的细菌更易导入外源遗传物质，是 研究遗传规律和进行原生质体育种的良好实验材料。
34
35
c.球状体(sphaeroplast) 革兰氏阴性细菌被处理后而获得的残留部分细胞壁（ 外壁层）的球形体。与原生质体相比，它对外界环境 具有一定的抗性，可在普通培养基上生长。
36
d 支原体(Mycoplasma)： 是在长期进化过程中形成的、适应自然生活
2、细菌细胞的特殊构造： 不是所有细菌细胞都具有的构造，称作特殊构造
1）、糖被（glycocalyx）
（1) 概念 包被于某些细菌细胞壁外的一层厚度不定的
胶状物质。糖被按其有无固定层次、层次厚薄又可 细分为荚膜（capsule或macrocapsule，大荚膜）、 微荚膜(microcapsule)、粘液层(slimelayer)和菌胶团 (zoogloea)。
生长、分裂、鞭毛运动所必须。 阻拦大分子有害物质。 抗原性，敏感性。
19
20
(1)革兰氏阳性细菌的细胞壁成分
特点：厚度大（20~80nm） 、化学组分简单，一般含90%肽聚 糖和10%磷壁酸
21
肽聚糖单体:由双糖单位（N—乙酰葡糖胺与N— 乙酰胞壁酸组成)、四肽尾或四肽侧链、肽桥 或肽间桥三部分组成。
结构简单、胞壁坚韧、 多以二分裂方式繁殖 和水生性较强的原核 生物。
3
一、细胞的形态构造及其功能
（一）形态和染色
球状
基
本 形
杆状
态
螺旋状
自然界中杆菌最常见，球菌次之，螺旋菌最4 少.
1、球菌：球状的细菌称为球菌（coccus）。 有单球菌、双球菌、四联球菌、八叠球菌、
链球菌和葡萄球菌等 。
5
根 据 分 裂 方 向 及 随 后 相 互 间 的 连 接 方 式
比正常有细胞壁的细菌更易导入外源遗传物质，是 研究遗传规律和进行原生质体育种的良好实验材料。
34
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c.球状体(sphaeroplast) 革兰氏阴性细菌被处理后而获得的残留部分细胞壁（ 外壁层）的球形体。与原生质体相比，它对外界环境 具有一定的抗性，可在普通培养基上生长。
36
d 支原体(Mycoplasma)： 是在长期进化过程中形成的、适应自然生活
1食品微生物--原核微生物
（2）节孢子
▪ 节孢子又称粉孢子，细胞膜和细胞壁同时内陷，逐渐向内缢缩，形成 横膈，把孢子丝缢裂成一串孢子，多为杆状或柱状。
场所。
3．细胞质
▪ 细胞膜内除核质以外的一切物质统称为细胞质。细 胞质的主要成分是蛋白质、核酸、核糖、脂类、糖 类、无机盐和水等。
▪ 细胞质内含有多种酶系统，是细菌细胞进行合成代 谢和分解代谢的重要场所。
▪ 细胞质中没有真核细胞所具有的细胞器，但含有许 多内含物，主要有核糖体、质粒、异染颗粒、肝糖 粒、淀粉粒、液泡等。
（二）杆菌
▪ 菌体呈杆状的细菌称杆菌。杆菌是细菌中种类最多的一类。 分为：
1、长杆菌 2、短杆菌 3、球杆菌
图1-2 各种杆菌的形态
（三）螺旋菌
▪ 菌体弯曲的杆菌称为螺旋菌。根据菌体弯曲程度的不同可分
为弧菌和螺菌两种类型（图1-3）。
1．弧菌
菌体仅一个弯曲，形如弧形、
逗号或香蕉状，螺旋不满一环，
▪ G+ 菌：细胞壁厚，肽聚糖含量高，交联度大，当乙醇脱色时，肽聚 糖因脱水而孔径缩小，故结晶紫-碘复合物被阻留在细胞内，细胞不 能被酒精脱色，仍呈紫色。
▪ Gˉ菌：肽聚糖层薄，交联松散，乙醇脱色不能使其结构收缩，因其含 脂量高,乙醇将脂溶解，缝隙加大，结晶紫-碘复合物溶出细胞壁，酒 精将细胞脱色，细胞无色，沙黄复染后呈红色。
菌体外着生的比鞭毛细、短、直、硬，且数目多的蛋白质丝 或细管。不是细菌的运动“器官”。 ▪ 大小：其直径为5nm～10nm，长为0.2μm～0.5μm。 ▪ 分类：它可分为普通纤毛和性纤毛。 ▪ 普通纤毛：能使细菌相互黏着或附着在某种物体上或液面上 形成菌膜。 ▪ 性纤毛：又称性菌毛（F-菌毛），其功能是细菌在接合作用 时向雌性菌株传递遗传物质。
▪ 节孢子又称粉孢子，细胞膜和细胞壁同时内陷，逐渐向内缢缩，形成 横膈，把孢子丝缢裂成一串孢子，多为杆状或柱状。
场所。
3．细胞质
▪ 细胞膜内除核质以外的一切物质统称为细胞质。细 胞质的主要成分是蛋白质、核酸、核糖、脂类、糖 类、无机盐和水等。
▪ 细胞质内含有多种酶系统，是细菌细胞进行合成代 谢和分解代谢的重要场所。
▪ 细胞质中没有真核细胞所具有的细胞器，但含有许 多内含物，主要有核糖体、质粒、异染颗粒、肝糖 粒、淀粉粒、液泡等。
（二）杆菌
▪ 菌体呈杆状的细菌称杆菌。杆菌是细菌中种类最多的一类。 分为：
1、长杆菌 2、短杆菌 3、球杆菌
图1-2 各种杆菌的形态
（三）螺旋菌
▪ 菌体弯曲的杆菌称为螺旋菌。根据菌体弯曲程度的不同可分
为弧菌和螺菌两种类型（图1-3）。
1．弧菌
菌体仅一个弯曲，形如弧形、
逗号或香蕉状，螺旋不满一环，
▪ G+ 菌：细胞壁厚，肽聚糖含量高，交联度大，当乙醇脱色时，肽聚 糖因脱水而孔径缩小，故结晶紫-碘复合物被阻留在细胞内，细胞不 能被酒精脱色，仍呈紫色。
▪ Gˉ菌：肽聚糖层薄，交联松散，乙醇脱色不能使其结构收缩，因其含 脂量高,乙醇将脂溶解，缝隙加大，结晶紫-碘复合物溶出细胞壁，酒 精将细胞脱色，细胞无色，沙黄复染后呈红色。
菌体外着生的比鞭毛细、短、直、硬，且数目多的蛋白质丝 或细管。不是细菌的运动“器官”。 ▪ 大小：其直径为5nm～10nm，长为0.2μm～0.5μm。 ▪ 分类：它可分为普通纤毛和性纤毛。 ▪ 普通纤毛：能使细菌相互黏着或附着在某种物体上或液面上 形成菌膜。 ▪ 性纤毛：又称性菌毛（F-菌毛），其功能是细菌在接合作用 时向雌性菌株传递遗传物质。
原核微生物的分类
原核微生物的分类
嘿，朋友们！今天咱们来聊聊原核微生物的分类呀。
你说这原核微生物，就像是一个庞大的微生物家族。
里面的成员那可真是五花八门，各有各的特点呢。
先来说说细菌吧，这可是原核微生物里的大部队啊！它们无处不在，土壤里、水里、空气里，甚至咱们的身体上都有它们的身影。
有些细菌那可是人类的好帮手呢，就像那些能帮忙发酵制作美味酸奶、泡菜的细菌，多棒呀！但也有一些坏家伙，会让人生病，真是让人又爱又恨。
然后呢，还有支原体，这些小家伙个头小小的，没有细胞壁，就像一群自由自在的小精灵。
它们能在一些特殊的环境里生存，生命力可顽强啦！
再讲讲立克次氏体，它们就像是微生物世界里的神秘侠客。
虽然平时不太起眼，但是一旦发作起来，那威力也不容小觑呀！
还有衣原体呢，它们就像是隐藏在暗处的小调皮，有时候会偷偷搞点小破坏。
原核微生物的世界是不是很奇妙呢？它们虽然微小，却有着巨大的影响力。
就好像是一个微观的宇宙，充满了未知和惊喜。
你想想看，我们的生活中处处都有它们的存在。
我们吃的食物、喝的水、呼吸的空气，都和它们有着千丝万缕的联系。
它们可以帮助我们，也可以给我们带来麻烦。
这不就像是生活中的朋友一样吗？有的朋友能给你带来快乐和帮助，有的朋友可能会让你有点头疼，但不管怎样，他们都是生活的一部分呀！
所以呀，我们可不能小瞧了这些原核微生物。
我们要了解它们，研究它们，这样才能更好地和它们相处呀！怎么样，是不是觉得原核微生物的世界很有趣呢？让我们一起去探索这个神奇的微观世界吧！。
第一章 原核生物
蓝细菌
巨大芽孢杆菌
大肠杆菌 肺炎球菌 嗜血流感菌
nanobacteria 50nm
纳米细菌
How to comprehend bacterial size?
A、芝麻（3毫米）= ？ 个E.coli 长度。 1500个
B、头发直径（60微米）= ？ 个E.coli “肩并肩”紧挨在一块。 120
3、螺旋菌（spirilla）
弧菌 螺菌 螺旋体菌
弧菌：
蛭 弧 菌
菌体只有一个弯曲，其程度不足一圈， 形似“C”字或逗号，鞭毛偏端生。
霍乱弧菌
螺菌
菌体回转如螺旋，螺
旋数目和螺距大小因
（a）具有可见的双极生鞭毛的迂回螺菌（×4种50）而异。鞭毛二端生
（b）迂回螺菌；相差显微镜（ ×550）
细胞壁坚韧，菌体较 硬。
蜡样芽胞杆菌L型的镜下形态（多形性）
细菌L型生长缓慢，营养要求高，对渗透压敏感，普通营养基上 不能生长，培养时必须用高渗的含血清的培养基。
细菌L型在高渗的含血清的培养基上生长后形成三种类型的菌落
油煎蛋样菌落 （典型L型菌落）
颗粒型菌落
丝状菌落
原生质体（protoplast)：是指在人为条件 下，用溶菌酶除尽原有细胞壁或用青霉素 抑制新生细胞壁合成后，所得到的仅有一 层细胞膜包裹着的圆球状渗透敏感细胞， 一般由革兰氏阳性细菌形成。
革兰阴性菌细胞壁特殊组分
周质空间（periplasmic space）
在革兰氏阴性细菌中，一般指其外膜与细胞膜之 间的狭窄空间（宽约12~15nm），呈胶状。
在周质空间中，存在着多种周质蛋白 （periplasmic proteins），包括： ①水解酶类，例如蛋白酶、核酸酶等； ②合成酶类，例如肽聚糖合成酶； ③结合蛋白（具有运送营养物质的作用）； ④受体蛋白（与细胞的趋化性相关）。
原核微生物类型
原核微生物类型
原核微生物是指没有真核细胞核的微生物。
按照不同的分类方法，可以将原核微生物分为以下几类：
1. 真细菌（Bacteria）：真细菌是最常见的原核微生物，它们以单细胞形式存在，具有细胞壁和细胞膜，可以通过分裂繁殖。
真细菌广泛分布于土壤、水体、空气和生物体内，有些真细菌具有重要的生态和生物技术应用价值。
2. 古菌（Archaea）：古菌是另一类常见的原核微生物，它们在形态和结构上与真细菌类似，但在基因组和生化特性上与真细菌有所不同。
古菌广泛存在于极端环境，如高温泉、盐湖、沼泽地和深海热泉中，具有重要的生态和环境适应能力。
3. 蓝藻（Cyanobacteria）：蓝藻是一类光合作用原核微生物，它们具有类似真核植物的叶绿素和光合色素，能够利用阳光进行光合作用。
蓝藻广泛分布于水生环境中，一些蓝藻也存在于陆地的土壤和岩石上。
4. 原核真核过渡生物（Nanoarchaeota）：这是一类罕见的原核微生物，它们被认为具有介于原核生物和真核生物之间的特征。
原核真核过渡生物是古菌的一种分支，目前尚不清楚它们的生理特性和生态角色。
这只是原核微生物的一小部分示例，实际上原核微生物在分类上非常多样化，还存在许多其他进一步分支和分类。
原核微生物及其分类
编辑课件
27
第一节 细菌的分类与鉴定
二、细菌分类鉴定的依据和方法
（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）
2、细胞的群体形态（菌落形态、斜面菌苔、液体培养形态）
（2）菌苔：在斜面培养基上划线接种，培养3-5天形成的培养物。如果多个 菌落连成一片，或者用大量纯种细胞接种在固体培养基 上，则长成的培养物就是菌苔。
特点：
没有完整而坚韧的细胞壁，细胞呈多形态； 有些能通过细菌滤器，故又称“滤过型细菌”
对渗透敏感，在固体培养基上形成“油煎蛋”似 的小菌落（直径在0.1mm左右）；
编辑课件
22
由于细菌细胞微小又透明，一般先要经过染色才能在显微镜下 观察清晰。
细菌染 色方法
死菌 活菌
简单染色法 正染色：
鉴别染色法
革兰氏染色法 抗酸性染色法 芽孢染色法
编辑课件
亚种
5
第一节 细菌的分类与鉴定
二、细菌分类鉴定的依据和方法
分类鉴定依据
形态学 生理生化 免疫学 遗传学
编辑课件
6
第一节 细菌的分类与鉴定
二、细菌分类鉴定的依据和方法
分类鉴定方法
经典方法 数值分类法 分子分类法
编辑课件
7
Hale Waihona Puke 第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法
（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）
编辑课件
2
第一节 细菌的分类与鉴定
1、细菌含义的界定 三原界中的真细菌 原核生物：真细菌和古细菌
真细菌 古细菌 真核生物
原核生物
2、细菌分类学的工作内容
分类：依据相似性和进化关系划分 鉴定：通过系统测定，确定菌株在类群中的所属关系 命名：根据国际通用法则给所鉴定的菌株以学名。
原核微生物1
第二节 细菌（Bacteria）
一、细菌的形态和大小
1、细菌细胞的形态 2、细菌细胞的大小
一、细菌
1、细菌的形态：球状、杆状、螺旋状和丝状
其次
自 然 界 中 哪 种 最 多？
最多
最少
a.球菌(coccus)
单球菌 双球菌 四联球菌 八叠球菌 葡萄球菌 链球菌
1. 分裂方向
2. 分裂后相互间 的连接方式
成分
占细胞壁干重的%
G＋
G－
肽聚糖 含量很高（30-95） 含量很低（5-20）
磷壁酸 含量较高（<50） 0
类脂质 一般无（<2） 蛋白质 0
含量较高（10-20） 含量较高
革兰氏阳性的细胞壁
G-细菌细胞壁的构造和化学组成
G-细菌细胞壁较薄，但有多层构造，其化学组成除有肽聚糖外， 还有一定量的类脂质和蛋白质等成分。G-细胞壁的组成和结构 比G+更复杂。主要成份为：脂多糖、磷脂、脂蛋白、肽聚糖。
真核微生物
真核微生物有发育完好的细胞核，核内 有核仁和染色质，有核膜将细胞核和细胞 质分开，使两者有明显的界限，有高度分 化的细胞器，如线粒体、中心体、高尔基 氏体、内质网等，进行有丝分裂。包括除 蓝藻以外的藻类、酵母菌、霉菌、原生动 物、微型后生动物等。
细菌
原核微生物： （由原核细胞构成） 放线菌
（3）脱色（95%乙醇10~20S） （4）复染（蕃红30 ~ 60S）
A
A
A
B
机 制
B B
和
A
步
B
骤
（3）脱色（95%乙醇30-45S）
革
（1）初染（结晶紫30S）
兰 氏 染 色
（2）媒染剂（碘液30S）
微生物学-第一章
第一章 原核生物的形态、构造和 功能
第一节 细菌 第二节 放线菌 第三节 蓝细菌 第四节 支原体、衣原体和立克次氏体
第一章 原核微生物的形态、构造和功能
原核生物（procaryotes ）：细菌，放线菌，蓝细菌， 立克次氏体，支原体和衣原体。
真核微生物（eucaryotic microorganisims ）：真菌： 酵母菌、丝状真菌——霉菌、大型真菌— —蕈菌；显微藻类 ；原生动物。
细菌的DNA为共价、闭合、环状、双链。
第一节 细 菌
⑵ 质粒（plasmid） 质粒：是存在于细胞质中的一种染色体
以外的遗传成分，为小型环状 DNA 。 质粒已成为基因工程的重要工具。
第一节 细 菌
6、荚膜（capsule）：某些细菌细胞壁外存在一层厚度 不定的胶状物质，称为荚膜。
◆ 大荚膜 ：较厚，约 200nm，与细胞壁结合紧 密。
第一节 细 菌
第一节 细 菌
◆ 磷壁酸（又称垣酸）：是 G＋菌细胞壁所特有的成分。
G＋细菌细胞壁构造
第一节 细 菌
（2）革兰氏阴性菌（G－）细胞壁的构造 G－较 G＋细胞壁复杂，可分两层： ◆ 内壁层：由肽聚糖组成，较薄，约 1－2 层，占细胞干重不到 10 ％。 紧贴细胞膜，其肽聚糖组成仅具多糖链和短肽。 肽聚糖： 多糖链: G – M – G – M….. 短肽: L-Ala － D-Glu － DAP － D-Ala ★ 没有肽“桥”，直接由Ala－DAP连接。 ◆ 外壁层：由脂多糖（LPS）构成，是G－所特有的，位于细胞壁最 外层的类脂多糖类物质。
第一节 细 菌
G－菌：
因其壁薄，肽聚糖含量低，交联松散，故遇乙醇后，肽聚糖 网孔不易收缩，加上它的类脂含量高，所以当乙醇将类脂溶解后， 在细胞壁上会出现较大的缝隙，结晶紫与碘的复合物就极易被溶 出细胞壁，因此，乙醇脱色后，细胞呈无色。再经番红或沙黄等 红色染料进行复染，使 G－菌获得了一层新的颜色 —— 红色，而 G＋菌仍呈紫色。
第一节 细菌 第二节 放线菌 第三节 蓝细菌 第四节 支原体、衣原体和立克次氏体
第一章 原核微生物的形态、构造和功能
原核生物（procaryotes ）：细菌，放线菌，蓝细菌， 立克次氏体，支原体和衣原体。
真核微生物（eucaryotic microorganisims ）：真菌： 酵母菌、丝状真菌——霉菌、大型真菌— —蕈菌；显微藻类 ；原生动物。
细菌的DNA为共价、闭合、环状、双链。
第一节 细 菌
⑵ 质粒（plasmid） 质粒：是存在于细胞质中的一种染色体
以外的遗传成分，为小型环状 DNA 。 质粒已成为基因工程的重要工具。
第一节 细 菌
6、荚膜（capsule）：某些细菌细胞壁外存在一层厚度 不定的胶状物质，称为荚膜。
◆ 大荚膜 ：较厚，约 200nm，与细胞壁结合紧 密。
第一节 细 菌
第一节 细 菌
◆ 磷壁酸（又称垣酸）：是 G＋菌细胞壁所特有的成分。
G＋细菌细胞壁构造
第一节 细 菌
（2）革兰氏阴性菌（G－）细胞壁的构造 G－较 G＋细胞壁复杂，可分两层： ◆ 内壁层：由肽聚糖组成，较薄，约 1－2 层，占细胞干重不到 10 ％。 紧贴细胞膜，其肽聚糖组成仅具多糖链和短肽。 肽聚糖： 多糖链: G – M – G – M….. 短肽: L-Ala － D-Glu － DAP － D-Ala ★ 没有肽“桥”，直接由Ala－DAP连接。 ◆ 外壁层：由脂多糖（LPS）构成，是G－所特有的，位于细胞壁最 外层的类脂多糖类物质。
第一节 细 菌
G－菌：
因其壁薄，肽聚糖含量低，交联松散，故遇乙醇后，肽聚糖 网孔不易收缩，加上它的类脂含量高，所以当乙醇将类脂溶解后， 在细胞壁上会出现较大的缝隙，结晶紫与碘的复合物就极易被溶 出细胞壁，因此，乙醇脱色后，细胞呈无色。再经番红或沙黄等 红色染料进行复染，使 G－菌获得了一层新的颜色 —— 红色，而 G＋菌仍呈紫色。
原核微生物
螺旋体
4.细菌的特殊形态：
柄细菌、肾形菌、臂微菌、网格硫细菌、 贝日阿托氏菌（丝状）、具有子实体的粘 细菌等是特殊形态的细菌。
（二）细菌的异常形态
1.畸形：理化刺激
结核杆菌的正常形态
结核杆菌的异常形态
2.衰退型
菌细胞衰老、养分缺乏
（三）细菌的大小
（1）测量：测微尺 （2）长度单位：微米（μm） （3）表示：
一紫二碘三脱色四复染，
阳为紫，阴为红
番红复染1min
结果： 阳性菌G+ ——紫色 阴性菌G- ——红色
抗酸染色法
步骤
涂片固定； 酸性复红初染；
3%醋酸酒精脱色；
美蓝复染
结果： 抗酸菌——红色； 非抗酸菌——蓝色
二、细菌细胞的一般结构
细菌细胞的一般结构包括：
细胞壁、细胞质膜、间体、 细胞质、核糖体、气泡、 细胞核、质粒和储藏物
平板培养
斜面培养
2.细菌在半固体培养基中的培养特征
半固体培养基：含0.3%~0.5%琼脂的培养 基 穿刺接种细菌
好氧菌
兼性厌氧菌
厌氧菌
无鞭毛，不运动 有鞭毛，能运动
3.液体培养基
有微生物生长的培养基 是浑浊的。 表面生长：好氧菌 沉淀生长：厌氧或菌体 自身很重
第二节 放线菌
5.细胞质的功能
提供新陈代谢的场所
三、细菌细胞的特殊结构
（一）荚膜： 某些细菌细胞壁外的一层厚度不定的粘液性 物质。 化学成分因种而异，主要是水和多糖。
荚膜的观察：
荧光显微镜下的荚膜
负染色
菌胶团：
有些细菌的荚膜物质互相融合，连成一体， 组成共同的荚膜，其中包含多个菌体，称 为菌胶团。 活性污泥中常见。
第一章2原核微生物细菌的分类及主要类群介绍
例如 Escherichia coli
若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp来表示，
例如 Bacillus sp
（三）原核生物的鉴定和分类方法
生物分类的传统指标： 形态特征、 培养特征、 生理生化特征
从不同层次（细胞的、分子的），用不同学科（化学、物 理学、遗传学、免疫学、分子生物学等）的技术方法来研究和 比较不同微生物的细胞、细胞组分或代谢产物，从中发现的反 映微生物类群特征的资料。 在现代微生物分类中，任何能稳定地反映微生物种类特征的资料， 都有分类学意义，都可以作为分类鉴定的依据。
3）型（form）：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株 之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 例如生物型、化学型、形态型、致病型、血清型、噬菌型等。
（二）微生物的命名法
双名法：由二个拉丁字或希腊字或拉丁化了的其它文字组成， 一般用斜体表示。 学名=属名+种名加词
属名在前，一般用拉丁字名词表示，字首字母大写 种名在后，常用拉丁文形容词表示，全部小写
其分类学意义主要是作为建立新分类 单元的一项基本特征和把那些G+C含 量差别大的种类排除出某一分类单元。
G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定
（2） 核酸的分子杂交
不同生物DNA碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲 缘关系的远近。碱基排列顺序差异越小，它们之间的亲缘关 系就越近，反之亦然。
直接分析比较DNA的碱基排列顺序 ------由于技术上的困难目前尚难以普遍地进行 核酸分子杂交（hybridization）间接比较不同微生物DNA 碱基排列顺序的相似性
数值分类的五个步骤： 1）选择菌株和待测性状 2）性状编码 3）相似性计算 4）进行簇群分析 5）分类结果的表示
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《伯杰氏系统细菌学手册》第二版将原 核生物分为古细菌和真细菌2个界，下 设25门，39纲，89目，207科，包括852 属，5000余种，分为五卷本出版。
原核生物的分类和鉴定
细菌分类学包括三个方面：
➢ 分类（classification）：根据各种细菌的相似性 进化关系将其分为类群，排放在适当的单元中
1923年第1版 1974年第8版：将微生物分成十九个部分 1994年第9版：以细菌形态和生理类型为依据，结合 系统发育知识，将细菌分为35个群，4个大类：
❖具细胞壁的革兰氏阴性细菌 ❖具细胞壁的革兰氏阳性细菌 ❖无细胞壁的真细菌 ❖古细菌
《伯杰氏系统细菌学手册》
第1版：1984年 四卷 第2版：2000年 五卷 纳入研究核糖体RNA测序的结 果，分古细菌、真细菌两个界共31个部分
➢ 鉴定（identification）：是分类的操作过程，经 过一系列测定来确定所研究的菌株属于哪个类群
➢ 命名(nomenclature)：根据命名的国际法规对所 鉴定的菌株给以科学名称
原核生物的分类单位
➢原核生物的分类等级 原核生物界(Kingdom)、门(Phylum)、纲 (Class)、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、 种(Species)。
➢种的概念 种是分类的基本单位，是表型特征和包括 DNA和16SrRNA在内的基因序列特征高度相 似的菌株群，且和其它类群又有明显的差别。
原核微生物的分类学名使用拉丁文，
分类单位的拉丁名称，有些级别的词尾是 比较固定的。
这些词尾是: 目的词尾ales 亚目的词尾ineae 科的词尾aceae 亚科的词尾oideae 族的词尾eae 亚族的词尾inae 属、种没有共同的词尾
按《国际细菌命名法则》命名，该方法采用的是 林奈在1753年提出的双命名法
学名：属名+种名加词（斜体表示）
属名：拉丁文或希腊文，名词，单数，第一个字母大写， 描述微生物的一般的和主要的特征
种名加词：拉丁文或希腊文，形容词，字母小写, 描述该 菌具体的、次要的特征, 并在学名之后写出命名人的姓氏
例如: Bacillus thuringiensis Berliner 1915
一个微生物的种具有如下特征
1.形态、生理特征相同。 2.有共同的起源。 3.是分类的基本单位，也是进化的单位。 4.是繁殖的单位，同种才能产生后代，不同的种
不能产生后代。 5.种有遗传的稳定性，同时也存在变异性。
种与其它分类级的区别在于: 1.它是繁殖的基本单位。 2.它是分类的基本单位。
菌种命名原则
属名 种名ຫໍສະໝຸດ 定名人 定名时间如果泛指某一属的微生物，或某菌种，知其 属但种名未定，可用“sp” “spp”作加词
如 Bacillus sp：一个尚未定名的芽胞杆菌
Bacillus spp：泛指芽胞杆菌属的菌种
种以下分类
亚种（subspecies, subsp.）：指某一明显而稳定的特征 与模式种不同的种，例：
要依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个 属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。
伯杰氏系统简介
《伯杰氏细菌鉴定手册(第九版)》将原核微生物分 为35群，归纳为四大类(或四个门)：
第一类：具细胞壁的革兰氏阴性真细菌 第二类：具细胞壁的革兰氏阳性真细菌 第三类：无细胞壁的真细菌 第四类：古细菌
古细菌原界：由甲烷菌、嗜盐菌、嗜热菌等 真细菌原界：除古细菌外其它原核生物 真核生物原界：原生生物、真菌、动物、植物
原核生物的分类系统
当前比较有权威的分类系统有三个：
• 前苏联克拉西尼柯夫系统 • 法国的普雷沃系统 • 美国的伯杰氏系统
美国微生物学会组织编写《伯杰氏细菌鉴定手册》 （Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology）
第一章 原核生物
The Prokaryotes
（分类方法及主要代表类群 ）
原核生物包括真细 菌和古细菌两大类
目的要求
通过本章学习，要求掌握： 1、真细菌、放线菌、蓝细菌、古生菌的形态特
点及各类群代表微生物的主要特点及应用价值。 2、原核微生物分类，命名的基本知识。
重点： • 原核微生物的分类依据及代表种类的特征。 难点： • 代表原核微生物的拉丁学名和主要特点。
Outline
细菌的分类和鉴定 细菌：Bacteria 放线菌：Actinomycetes 蓝细菌：Cyanobacteria 古细菌：Archaeobacteria
原核微生物的分类
分类的目的
(1)为了研究工作，生产应用，便于 查找。
(2)了解生物进化途径。 (3)了解各生物间的亲缘关系。
生物的分类系统
《伯杰氏鉴定细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology)
（20世纪 80年代末期）
《伯杰氏系统细菌学手册》
(Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology)
伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定的最重
• 1753年，瑞典人林奈（Carl vpm Linne）提出两界 分类系统。 植物界和动物界
• 1969年，惠特克（R. H. Whittaker）提出五界系统 原核生物界：细菌、放线菌、蓝细菌 原生生物界：原生动物、单细胞藻类 真菌界：真菌、酵母 植物界 动物界
• 70年代后期，沃斯(Wose 1978) 根据核糖 体结构、16SrRNA的碱基序列将生物划分 为3个域(domain)或原界
《伯杰氏鉴定细菌学手册》
(Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology)
美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授 伯杰 (D.Bergey) (1860-1937)
1957年第七版后，由于越来越广泛地吸收了 国际上细菌分类学家参加编写 (如1974 年第 八版，撰稿人多达130多位，涉及15 个国家； 现行版本撰稿人多达300多人，涉及近20个国 家)，所以它的近代版本反映了出版年代细菌 分类学的最新成果，因而逐渐确立了在国际 上对细菌进行全面分类的权威地位。