三种不同核酸分析系统的效率比较分析
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两种全自动核酸检测系统对乙肝核酸检测性能的比较乙肝核酸检测是指对乙型肝炎病毒(HBV)的核酸进行定性或定量检测的方法。
近年来,随着核酸检测技术的进步,全自动核酸检测系统逐渐取代传统的手工实验方法,成为乙肝核酸检测的首选方法之一。
本文将对比两种常见的全自动核酸检测系统在乙肝核酸检测性能方面的差异。
第一种全自动核酸检测系统是PCR法(聚合酶链反应法)。
PCR法是目前乙肝核酸检测的主要方法之一。
它通过将DNA模板与引物、酶及核酸酶链反应混合,然后通过多次循环的DNA扩增和酶解过程,从而在体外产生大量目标DNA分子。
PCR法具有高度灵敏度和特异性,能够检测到非常低浓度的乙肝病毒核酸。
PCR法能够对乙肝病毒进行定量检测,可以根据PCR扩增产生的目标DNA分子量来确定病毒的数量。
第二种全自动核酸检测系统是荧光定量PCR法。
与传统的PCR法相比,荧光定量PCR法在核酸检测方面具有更高的灵敏度和特异性。
它利用荧光探针的特殊性质,在扩增反应过程中实时检测目标DNA分子的存在情况。
荧光定量PCR法比传统PCR法更加准确,可以提供更为精确的乙肝病毒核酸浓度。
从操作上来说,两种全自动核酸检测系统都能够快速进行实验,大大缩短了实验周期。
这两种方法都能够高通量地进行核酸检测,适用于多个样本同时处理。
在乙肝核酸检测的结果准确性方面,荧光定量PCR法相对较为准确,由于采用实时检测技术,能够实时监测PCR反应的进程,从而提供更可靠的实验结果。
从以上对两种全自动核酸检测系统的比较来看,荧光定量PCR法相对于传统PCR法在乙肝核酸检测性能方面具有优势。
具体选择哪种系统还需根据实验室的需求、预算以及设备的可行性进行综合考虑。
三种核酸检测方法
目前常用的三种核酸检测方法为:
1. PCR(聚合酶链式反应):PCR 是一种常用的核酸检测方法,通过引物与目标序列的互补配对,利用酶的作用在体外复制目标DNA 或RNA 片段,进行扩增后,通过荧光探针或凝胶电泳等方法进行检测。
PCR 方法具有高灵敏度和特异性,可以检测极微量的目标核酸。
2. LAMP(等温扩增法):LAMP 是一种基于异构酶的等温扩增技术,可以在恒温条件下,通过多个特异性引物和DNA 聚合酶,实现核酸片段的高倍增。
LAMP 技术不需要特殊设备和高精度温控,成本较低,操作方便,适用于一些基层医疗机构进行疫情监测。
3. NGS(高通量测序):NGS 是一种高通量测序技术,可以同时测定数百万条DNA 或RNA 片段的序列,广泛应用于基因组学和转录组学研究。
在核酸检测领域,NGS 技术可以通过对样本进行高通量测序,快速检测和鉴定病原体的基因组序列,对于新型病毒的检测和变异分析具有较高的灵敏度和准确性。
然而,NGS 技术需要专业的设备和分析软件,成本较高,操作复杂,一般用于重大疫情的溯源和研究。
比较两种核酸检测系统检测能力的结果分析庄养林;熊丽红【摘要】目的:分析比较罗氏和诺华核酸试剂的核酸检测(NAT)能力。
方法同时运用罗氏和诺华系统对262例无偿献血者血液标本及10例卫生部室间质评(NCCL)核酸标本进行检测,统计分析比较阳性检测率。
结果245例酶联免疫吸附实验(ELISA)检测阴性的献血者标本中,罗氏和诺华系统分别检出1例和4例NAT阳性,其中仅有诺华1例鉴别实验鉴别为HBV,其余均未能鉴别;17例ELISA检测阳性的标本中,运用罗氏系统检测,11例HBsAg阳性的标本检出5例NAT阳性,5例抗-HCV阳性的标本检出3例,1例抗-HIV阳性的标本未检出,10例NCCL标本全部正确检出;运用诺华系统检测,上述ELISA阳性标本分别检出3例、3例和0例,NCCL标本也全部正确检出。
结论两种核酸检测系统在检测能力上各有优势,均能较好地胜任日常的检测工作。
%Objective To analyze and compare the detection ability of nucleic acid reagent of Roche and Novartis. Methods Roche and Novartis nucleic acid detection systems were used to detect the 262 specimens of blood donors and 10 copies of NCCL specimens, the positive detection rates of the two systems were statistically analyzed. Results Among 245 cases of blood speci-mens with negative NAT detected by ELISA, Roche and Novartis systems detected 1 case and 4 cases with positive NAT respec-tively. In the identification test, only one of the NAT positive specimens detected by Novartis system was identified as HBV. In the 17 cases of blood specimens with positive NAT detected by ELISA, when detected by Roche system, 11 cases of HBsAg positive specimens had 3 cases with positive NAT, 5 cases of anti -HCVpositive specimens had 3 cases with positive NAT. In 1 case of anti-HIV positive specimens, the NAT was negative, 10 cases of NCCL specimens were correctly detected, while using Novartis systems to detect, among HBsAg positive specimens, anti-HCV positive specimens and anti- HIV positive specimens, there were 3 cases, 3 cases and 0 case of them with positive NAT , NCCL specimens were also correctly detected. Conclusion Two kinds of nucleic acid detection system have their own advantages in detection capability, both of them can be well fit for routine tests.【期刊名称】《实验与检验医学》【年(卷),期】2015(000)001【总页数】3页(P43-45)【关键词】NAT;罗氏核酸检测系统;诺华核酸检测系统;血液筛查【作者】庄养林;熊丽红【作者单位】江西省血液中心检验科,南昌330000;江西省血液中心检验科,南昌330000【正文语种】中文【中图分类】R446.62;Q343.1+1由于窗口期感染、隐匿性感染等原因,ELISA法检测献血者血液中的抗体或抗原存在一定的局限性,输血残余感染风险也时有发生[1-8]。
两种全自动核酸检测系统对乙肝核酸检测性能的比较1. 引言1.1 背景介绍乙肝是一种由乙型肝炎病毒引起的肝炎感染,是全球范围内的公共卫生问题。
乙肝病毒主要通过血液和体液传播,感染者可能长期携带病毒而不易被发现,严重危害人类健康。
乙肝核酸检测是诊断乙肝感染的重要手段之一,能够准确、快速地检测出感染者体内的乙肝病毒核酸,对病情的诊断和治疗具有重要意义。
随着科技的发展和医疗设备的改进,全自动核酸检测系统逐渐成为乙肝核酸检测的主流工具。
这些系统能够自动完成样本处理、核酸提取、PCR扩增等步骤,大大提高了检测效率和准确性。
目前市面上有许多种全自动核酸检测系统,其中以系统A和系统B最为常见和应用广泛。
针对这两种系统,本文将从检测灵敏度、检测效率和成本效益等方面进行比较分析,旨在为乙肝核酸检测提供更好的选择和指导。
1.2 研究目的本研究旨在比较两种全自动核酸检测系统在乙肝核酸检测方面的性能表现,分析它们在检测灵敏度、检测效率和成本效益等方面的差异,为临床医学实践提供参考依据。
通过对这两种系统的工作原理进行详细解析,并结合相应指标的比较分析,旨在为乙肝核酸检测的选择提供决策支持,为临床医生、研究人员和患者提供更准确、快速和经济有效的检测方案选择。
通过本研究的深入比较,希望能够揭示不同系统之间的优劣势,为相关技术的研发和应用提供指导意见,促进乙肝疫苗接种和疾病预防控制工作的开展,提高核酸检测技术在临床诊断和流行病学监测中的应用水平和质量。
2. 正文2.1 核酸检测系统A的工作原理核酸检测系统A是一种全自动的检测系统,其工作原理主要包括以下几个步骤:样本处理阶段。
在这个阶段,样本会被提取并经过一系列处理步骤,包括溶解、离心、洗涤等,以保证样本中核酸的纯度和完整性。
接着,核酸提取阶段。
在这个阶段,通过化学方法或磁珠吸附法等技术,将样本中的核酸提取出来,并使其分离纯化。
然后,核酸扩增阶段。
在这个阶段,核酸会被放入PCR仪器中进行扩增,通过循环反应使核酸序列倍增。
3种检测系统9种常规生化项目测定结果的比对分析贾珂珂;杨硕;王洪亚;张捷【摘要】目的通过3种不同检测系统间9种常规生化项目测定结果的比对分析,探讨不同系统间测定结果的可比性.方法参考美国临床实验室标准化委员会(NCCLS) 的EP9-A2 文件,以Modular P-800 检测系统作为比对系统,用患者新鲜血清在Olympus AU5400检测系统(待评系统1)和强生950检测系统(待评系统2)上测定9 种常规生化项目:尿素( UREA)、肌酐( CREA)、尿酸(UA)、总钙(Ca)、总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)以及葡萄糖( GLU),其测定结果与比对系统进行比对,计算待评系统(Y) 和比对系统(X) 之间的相对偏差及相关线性方程,以美国临床实验室改进修正案(CLIA′88) 建议的允许总误差的1/ 2 为标准,通过各项目医学决定水平处的系统误差与之比较来判定结果的可比性.结果待评系统1 的白蛋白(ALB)低值与比对系统存在正偏差(9.50%)、肌酐(Cre)与比对系统存在明显正偏差(3.52%~32.46%),与比对系统不具可比性.待评系统2 的白蛋白(ALB)与比对系统存在明显负偏差(-12.56%~-39.75%),与比对系统不具可比性.两种待评系统的其他项目在医学决定水平处的预期偏差均小于实验室可接受偏差,与比对系统有可比性.结论不同检测系统之间,某些常规生化项目仍存在不同程度的偏差;当用不同的检测系统检测同一项目时,应进行方法比对,对临床可接受性进行评价,以实现检验结果的可比性.【期刊名称】《中国实验诊断学》【年(卷),期】2013(017)006【总页数】4页(P1083-1086)【关键词】方法比对;偏差评估;干化学分析【作者】贾珂珂;杨硕;王洪亚;张捷【作者单位】北京大学第三医院,检验科,北京100191;北京大学第三医院,检验科,北京100191;北京大学第三医院,检验科,北京100191;北京大学第三医院,检验科,北京100191【正文语种】中文【中图分类】R393近年来,检验医学无论仪器设备的更新,还是试验方法的完善,都得到很快的发展。
三种荧光定量PCR检测方式比较:以参照物为标准,对PCR终产物进行分析或对PCR进程进行监测,从而达到评估样本中靶基因的拷贝数,称为定量PCR。
定量PCR的可行性定量一样是在PCR扩增的指数期进行的。
常见检测方式可分为以下几类:(1) SYBR Green I 检测模式SYBR Green I 是一种能与双链 DNA 结合发光的荧光染料。
其与双链 DNA 结合后,荧光大大增强。
因此,SYBR Green I 的荧光信号强度与双链 DNA 的数量相关,能够依照荧光信号检测出 PCR 体系存在的双链 DNA 数量。
SYBR Green I 的最大吸收波长约为 497nm,发射波长最大约为 520nm。
PCR 扩增程序一样为 94℃~55℃~72℃三步法,40 个循环。
SYBR Green I 的缺点:由于 SYBR Green I 没有特异性,不能识别特定的双链,只若是双链就会结合发光,对 PCR 反映中的非特异性扩增或也会产生荧光,通常本底较高,因此在临床上利用可能会有假阳性发生。
SYBR Green I 的优势:SYBR Green I 的优势是因为其缺点产生,由于它能所有的双链相结合,因此对不同模板不需专门定制不同的特异性探针,通用性较好,而且价钱相对较低。
这对科研是很有利的,因此国内外在科研中利用比较普遍。
(2) 水解探针模式(man探针)TaqMan 探针是一种探针,荧光基团连接在探针的5’结尾,而淬灭剂那么在3’结尾。
当探针与靶序列配对时,荧光基团发射的荧光因与3’端的淬灭剂接近而被淬灭。
在进行延伸反映时,聚合酶的5’外切酶活性将探针切断,使得荧光基团与淬灭剂分离,发射荧光。
一分子的产物生成绩伴随着一分子的荧光信号的产生。
随着扩增循环数的增加,释放出来的荧光基团不断积存。
因此 Taqman 探针检测的是积存荧光。
PCR 扩增程序一般是:94℃~60 ℃ 40 个循环。
经常使用的荧光基团是 FAM,TET,VIC,HEX。
两种全自动核酸检测系统对乙肝核酸检测性能的比较全自动核酸检测系统是一种能够自动完成核酸提取、核酸扩增和测序等步骤的检测设备。
在乙肝核酸检测中,全自动核酸检测系统能够提供高灵敏度、高特异性和高效率的检测结果,对于乙肝病毒感染的早期诊断和治疗有着重要的意义。
本文将比较两种常见的全自动核酸检测系统在乙肝核酸检测性能方面的差异。
两种全自动核酸检测系统在核酸提取的效率上存在差异。
一种系统采用化学方法进行核酸提取,另一种系统采用磁珠技术进行核酸提取。
化学方法可以高效地提取核酸,但可能会引入外源性污染物,影响检测结果的准确性。
而磁珠技术不仅可以高效地提取核酸,还能够从样本中去除污染物,提高检测结果的准确性。
两种全自动核酸检测系统在核酸扩增的效率和准确性上也存在差异。
一种系统采用传统PCR(聚合酶链式反应)方法进行核酸扩增,而另一种系统则采用新一代测序技术进行核酸扩增。
传统PCR方法具有较高的扩增效率,可以检测到较低浓度的核酸,但其扩增的靶序列长度有限,可能会漏检某些变异株。
而新一代测序技术具有高通量、高灵敏度和高分辨率的特点,可以检测到更多的变异株和相关基因信息。
两种全自动核酸检测系统在操作简便性上也存在差异。
一种系统操作简单,只需将样本加入系统中即可完成整个检测过程。
而另一种系统则需要操作者具备一定的操作技能和实验经验,以确保检测结果的准确性。
两种全自动核酸检测系统在价格上也存在差异。
一种系统价格较低,适合在基层医疗机构和社区医疗机构使用。
而另一种系统价格相对较高,适合在大型医院和科研机构使用。
两种全自动核酸检测系统在乙肝核酸检测性能方面存在差异。
选择适合的核酸检测系统应综合考虑核酸提取效率、核酸扩增效率、操作简便性和价格等因素,并根据实际需求进行选择。
两种全自动核酸检测系统对乙肝核酸检测性能的比较核酸检测是一种常用的检测方法,可以用来检测病毒感染。
乙肝病毒是一种常见的病毒感染,对乙肝病毒的核酸检测具有重要的临床意义。
全自动核酸检测系统是目前使用最广泛的核酸检测方法之一,本文将对两种常见的全自动核酸检测系统在乙肝核酸检测性能方面进行比较。
第一种全自动核酸检测系统是PCR酶链反应技术。
PCR技术是一种灵敏、特异性高的核酸检测方法,已被广泛应用于临床诊断。
在乙肝核酸检测中,PCR技术可以用来检测乙肝病毒的DNA。
PCR技术的原理是通过DNA聚合酶酶链反应的方式,在体外扩增目标DNA的特定区域。
PCR技术具有快速、高灵敏度和高特异性的特点,在乙肝核酸检测中应用广泛。
第二种全自动核酸检测系统是基因芯片技术。
基因芯片技术是一种高通量、并行化的核酸检测方法,可以同时检测多个核酸序列,在乙肝核酸检测中具有重要的应用价值。
基因芯片技术的原理是将多个特异性的探针固定在芯片上,通过杂交反应检测样品中的目标核酸序列。
基因芯片技术具有高通量、高特异性和高准确性的特点,在乙肝核酸检测中有广泛的应用前景。
在乙肝核酸检测性能方面,PCR技术和基因芯片技术具有各自的优势和劣势。
PCR技术可以达到很高的灵敏度和特异性,可以检测到非常低浓度的乙肝病毒DNA。
而基因芯片技术的灵敏度和特异性相对较低,较难检测到低浓度的乙肝病毒DNA。
PCR技术的检测时间相对较短,通常可以在几个小时内完成。
而基因芯片技术的检测时间较长,通常需要几个小时以上。
PCR技术相对便宜,设备和试剂的价格相对较低。
而基因芯片技术相对较昂贵,设备和试剂的价格相对较高。
PCR技术和基因芯片技术都是目前使用较广泛的全自动核酸检测系统,在乙肝核酸检测中具有重要的应用价值。
两者在乙肝核酸检测性能方面有不同的优势和劣势,具体选择哪种检测系统需要根据实际情况进行权衡和选择。
Doi : 10. 13621 /j. 1001 - 5949. 2020. 10. 0913-实验研究-不同新型冠状病毒核酸检测试剂性能比较分析张伟宏马 雯*2,李富荣2,葸 静3,金哲宇2叭崔学强2,何瑞芬2,张俊华2,朴文花2[基金项目]宁夏重点研发计划科技支撑"新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控”专项(2020BEG03023)[作者单位]1.宁夏银川市疾病预防控制中心,宁夏银川7500022. 宁夏回族自治区人民医院临床医学检验诊断中心, 宁夏银川7500023. 宁夏金域医学检验所,宁夏银川7500024. 苏州大学附属第一医院骨科,江苏苏州215006[通讯作者]朴文花,Email : ******************[摘要]目的 比较6种新型冠状病毒核酸检测试剂盒的性能,为相关实验室选择核酸检测试剂提供参考依据。
方法 选择6种国产新型冠状病毒核酸检测试剂盒,比较其基本情况,并用5例阳性患者的咽拭子标 本,提取RNA 倍比稀释后进行RT-qPCR 检测,分析扩增结果,评估各试剂盒的差异。
结果 使用核酸检测试剂盒检测稀释后的RNA ,扩增后可见IC 基因、N 基因及ORF1ab 基因的Ct 值及A Rn 值有显著差异;在1 :16稀释 倍数时F 试剂未检测到ORF1ab 基因,C 试剂在1 :64时无法检出ORF1ab 基因和N 基因,A 、B 、D 试剂在1 :256 稀释倍数时未检测到ORFlab 基因和N 基因,E 试剂在各个稀释度均可扩增IC 、ORF1ab 、N 及E 4个基因。
结论新型冠状病毒核酸检测试剂对低病毒载量核酸的检测能力有较大差异,各实验室选用试剂时需要进行 性能验证,根据检测目的和检测对象选择合适的试剂盒。
[关键词]2019新型冠状病毒;核酸检测;试剂盒;性能比较[中图分类号]R192.3 [文献标识码]AComparison and analysis oftheperformancein different COVID-19 nucleic acid detection reagentsZHANG Weihong 1,MA Wen 2, LI Furong 2,XI Jing 3,JIN Zheyu 2'4, CUI Xueqiang 1,HE Ruifen 2,ZHANG Junhua 2,PIA O Wenhua^.1. The Center for Disease Control and Preventionof Yinchuan ,Yinchuan 750002,China ;2. The Department of Clinical MedicalExamination and Diagnosis Center ,Ningxia Hui Autonomous Region People's Hospital ,Yinchuan 750002,China ; 3. Ningxia Jinyu Medical Laboratory ,Yinchuan 750002,China ; 4. Department of Orthopedics ,The First Affiliated Hospital of Suzhou University , Suzhou 215006, ChinaCorresponding author : PIA O Wenhua ,Email : ******************[Abstract ] Objective To compare and analyze the detection ability of six domestic SARS -CoV -2 (Covid-19) detection kits ,thus providing reference for molecular laboratories. Methods Six domestic detection kits ,categorized randomLy from A to F , were selected and applied in the detection of SARS-Cov-2. Five positive nasopharyngeal swab specimens were selected in the study , Ct(threshold cycle )value , ARn value and detection of target genes(ORF1ab ,E and N gene )and IC gene were analyzed and evaluated prior to and after different dilution folds. Results Ct (threshold cycle )and ARn value for ORF1ab , IC , E , N gene showed statistically significant differences at different dilution folds for six detection kits. At the dilution of 1:16,F kit was unable to detect ORF1ab gene. At the dilution of 1 :64, C kit was unable to detect ORF1ab and N gene. At a dilution of 1 :256, A , B and D kits were unable detect ORF1ab and N genes. E kit detected IC , ORF1ab , N and E gene at all dilution folds. Conclusion Detection ability for 6 nucleic acid detection kits varied for low -viral load samples. Performance validation prior selection of kits is recommended. Selection of reagent kits should be based on the aim of the testing and testing subjects.[Key words ] SARS-Cov-2; Nucleic acid detection ; Re a ge n t kits ; Performance comparison.由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在世界范围内迅速蔓延,RT-qPCR 检测新冠病毒核酸阳性作为诊断疾病 的标准,在疾病的防控中发挥了重要的作用⑴。
两种全自动核酸检测系统对乙肝核酸检测性能的比较乙肝病毒(HBV)感染是一种常见的严重传染病,是全球范围内的公共卫生问题。
乙肝核酸检测是诊断和监测乙肝病毒感染的重要手段。
近年来,随着技术的不断发展,出现了许多全自动核酸检测系统。
本文将比较两种全自动核酸检测系统对乙肝核酸检测性能的差异。
第一种全自动核酸检测系统是荧光定量PCR(qPCR)系统。
这种系统利用荧光探针来测量PCR扩增产物的含量。
qPCR具有高灵敏度和高特异性的优势,是目前乙肝核酸检测的标准方法。
它可以精确地定量HBV病毒DNA的含量,从而评估病毒的复制水平。
qPCR还可以检测HBV基因的变异情况,帮助研究乙肝病毒的进化和耐药性。
第二种全自动核酸检测系统是基因芯片技术。
这种技术利用微阵列芯片上固定的探针来检测多个核酸序列。
它具有高通量、高灵敏度和高特异性的特点。
基因芯片技术可以通过一次实验检测多个核酸标志物,不仅可以检测HBV病毒DNA,还可以检测其他乙肝相关基因的表达水平。
这种多目标检测的能力使得基因芯片技术在乙肝的早期诊断和分型上具有潜力。
两种全自动核酸检测系统在乙肝核酸检测性能上存在一些差异。
qPCR系统具有更高的灵敏度。
它可以检测到非常少量的HBV病毒DNA,可以帮助早期诊断乙肝病毒感染。
相比之下,基因芯片技术的灵敏度稍低,可能会错过一些低水平的感染。
两种系统在特异性上也存在差异。
qPCR系统具有非常高的特异性,可以准确区分HBV 和其他相关病毒的核酸序列。
而基因芯片技术可能存在一定的交叉反应,可能会导致一些假阳性结果。
两种系统的成本和操作复杂性也有所不同。
qPCR系统相对简单易用,操作便捷,但成本较高。
而基因芯片技术的成本相对较低,但操作复杂,需要专业技能人员进行操作。
两种全自动核酸检测系统在乙肝核酸检测性能上存在一些差异。
选择适合的系统应根据实际需求和资源情况进行综合考虑。
qPCR系统适用于需要高灵敏度和高特异性的临床实验室,而基因芯片技术适用于大规模筛查和研究领域。
基因测序技术的精确性与效率对比分析基因测序技术是现代生物学和医学研究中的关键工具,它能够揭示并理解人类基因组的复杂性和多样性。
然而,在不同的基因测序技术之间有着不同的精确性和效率。
本文将对目前常用的基因测序技术,包括Sanger测序、Illumina测序和新一代测序技术进行精确性和效率对比分析。
首先,我们来看Sanger测序技术。
Sanger测序技术是最早的基因测序方法之一。
它利用PCR扩增基因片段,然后通过一系列化学反应和凝胶电泳技术,将DNA链断开并标记。
最后,通过读取DNA链断开的顺序和信号强度来确定基因序列。
Sanger测序的精确性非常高,能够准确地测定每个碱基的顺序,但是这种方法非常耗时,一次只能测序一小段DNA,因此效率相对较低。
接下来是Illumina测序技术。
Illumina测序技术是目前最常用的高通量测序技术之一。
它利用PCR扩增和桥式PCR扩增技术将DNA序列固定在微米级玻璃芯片上,并使用荧光标记的dNTPs进行扩增。
然后,使用激光逐个读取DNA的碱基信息,并将其记录下来。
Illumina测序具有高通量、高精度和较低的成本,能够同时测序多个样本,因此效率和产能非常高。
然而,Illumina测序的误差率相对较高,尤其是在长GC富碱基序列的测序中,容易发生错误。
最后是新一代测序技术,包括PacBio和Nanopore测序技术。
这些技术基于单分子测序原理,可以实现长读长测序,克服了传统测序技术的缺陷。
PacBio测序技术利用DNA聚合酶的活性,通过不断添加dNTPs观察DNA链的合成过程,并记录下来。
Nanopore测序技术利用纳米孔传导DNA,通过测量电流变化来确定碱基序列。
这些新一代测序技术具有高通量、高精度和长读长的优势,能够更好地应对复杂的基因组分析需求。
然而,由于仪器设备复杂、成本高昂以及误差率较高,新一代测序技术仍然需要进一步改进和优化。
综上所述,不同的基因测序技术在精确性和效率方面有着不同的优势和局限性。
『深度剖析』新冠病毒各种检测方法优缺点对比一检测原理:新型冠状病毒常用的核酸诊断方法有两种:病毒核酸特异基因检测和病毒基因组测序。
最常见的检测新型冠状病毒特异性核酸序列的方法是荧光定量PCR(聚合酶链式反应)。
由于新型冠状病毒是RNA病毒,试剂盒检测基本都采纳反转录加实时聚合酶链式反应法(RT-PCR),扩增病原体的核酸(RNA) ,同时通过荧光探针实时检测扩增产物。
在PCR反应体系中,包含一对特异性引物以及一个Taqman探针,该探针为一段特异性寡核苷酸序列,两端分别标记了报告荧光基团和淬灭荧光基团。
探针完整时,报告基团放射的荧光信号被淬灭基团汲取;如反应体系存在靶序列,PCR反应时探针与模板结合,DNA聚合酶沿模板利用酶的外切酶活性将探针酶切降解,报告基团与淬灭基团分别,发出荧光。
每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子产生。
荧光定量PCR仪能够监测出荧光到达预先设定阈值的循环数(Ct值)与病毒核酸浓度有关,病毒核酸浓度越高,Ct值越小。
不同生产企业的产品会依据自身产品的性能确定本产品的阳性推断值。
检测流程:检测程序需要经过五个步骤,取样、留样、保存、核酸提取、上机检测。
首先依据试剂盒说明书进行样本采集,样本类型包括咽拭子、鼻拭子、痰液、支气管灌洗液、肺泡灌洗液等。
由于RNA易降解,因此,采集样本时使用无RNA酶的拭子和无RNA酶的储存管。
获得患者样本后,需尽快进行检测,如无法马上检测需要进行低温封装,并送到特地的检测机构进行检测。
检测机构收到样本后,对样本进行核酸提取,核酸提取试剂应使用批准产品说明书中指定的核酸提取试剂盒。
最终是荧光PCR核酸检测,也就是上机器检测,将提取物进行荧光PCR扩增反应,需要7080分钟。
目前临床中常用的抗体血清学检测方法有3种:酶联免疫吸附试验法、化学发光免疫分析法、胶体金免疫层析法。
酶联免疫吸附法(ELISA)ELISA是一种结合抗原、抗体特异性反应和酶对底物高效催化作用的高敏感性免疫学试验技术。
两种全自动核酸检测系统对乙肝核酸检测性能的比较乙肝核酸检测是一种通过检测人体体液中的乙肝病毒核酸来诊断乙肝感染的方法。
随着生物技术的发展,目前已经出现了许多全自动的乙肝核酸检测系统。
本文将介绍两种常见的全自动核酸检测系统,并对其性能进行比较。
第一种全自动核酸检测系统是PCR-ELISA法。
PCR-ELISA法是目前乙肝核酸检测中应用最广泛的一种方法。
该方法首先利用聚合酶链反应(PCR)扩增样本中的乙肝病毒DNA或RNA片段,然后利用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测扩增产物中的乙肝病毒核酸。
该系统的主要优点是检测灵敏度高,可以检测到非常低浓度的乙肝病毒核酸。
PCR-ELISA法还具有高度的特异性,可以准确区分不同基因型的乙肝病毒。
PCR-ELISA法也存在一些缺点。
该方法的操作比较复杂,需要较长的时间和专业的技术人员才能完成。
由于PCR-ELISA法是基于体外扩增技术的,可能会出现假阳性结果。
PCR-ELISA法对样本中的抑制物敏感,可能会导致检测失败。
第二种全自动核酸检测系统是引物-探针法。
引物-探针法是一种使用特异性引物和探针结合的核酸扩增方法。
该方法首先利用引物扩增样本中的乙肝病毒DNA或RNA片段,然后利用探针与扩增产物特异性结合并发出荧光信号。
该系统的主要优点是操作简单快捷,可以在短时间内完成核酸检测。
引物-探针法还具有较好的特异性和灵敏度,可以准确区分乙肝病毒和其他相关病毒。
引物-探针法也存在一些限制。
该方法对样本的纯度要求较高,可能会受到异质性样本的干扰。
引物-探针法的灵敏度相对较低,可能无法检测到低浓度的乙肝病毒核酸。
由于该方法利用荧光信号进行检测,可能会受到背景信号的干扰。
PCR-ELISA法和引物-探针法都是常见的全自动乙肝核酸检测系统。
两种方法各有优缺点,选择适合的方法应根据具体的实验需求和条件来确定。
新冠病毒核酸检测方法比较新冠病毒核酸检测是目前用于诊断COVID-19的主要方法之一。
它可以通过检测人体样本中的新冠病毒核酸来判断是否感染了该病毒。
在这篇文档中,我们将比较几种常见的新冠病毒核酸检测方法。
RT-PCR法RT-PCR法(逆转录聚合酶链反应)是目前最常用的新冠病毒核酸检测方法之一。
它采用逆转录酶将病毒RNA转录成相应的DNA,并利用聚合酶链反应技术扩增特定的DNA片段来检测病毒。
RT-PCR法具有高灵敏度和特异性,能够快速准确地检测出新冠病毒。
但是,该方法需要复杂的实验室设备和专业技术人员进行操作,且耗时较长。
快速核酸检测法为了提高新冠病毒核酸检测的速度和便捷性,一些快速核酸检测方法被开发出来。
这些方法利用特定的试剂盒,通过简化实验流程和缩短检测时间来实现快速检测。
快速核酸检测法的操作相对简单,不需要复杂的实验室设备和专业技术人员,能够在短时间内快速筛查出感染者。
然而,与RT-PCR法相比,快速核酸检测法的灵敏度和特异性可能略有降低。
抗原检测法抗原检测法是另一种常见的新冠病毒检测方法。
它通过检测患者体内产生的新冠病毒抗原来判断是否感染了该病毒。
抗原检测法具有快速、简便和低成本的优势,能够在短时间内获得检测结果。
然而,与核酸检测方法相比,抗原检测法的灵敏度和特异性较低,可能会出现假阴性或假阳性的情况。
结论综合以上比较,RT-PCR法是目前最可靠和准确的新冠病毒核酸检测方法。
虽然快速核酸检测法和抗原检测法具有操作简便和快速检测的优势,但在准确性上略有不足。
在选择检测方法时,应根据具体情况和需求来确定最适合的方法。
同时,需要注意的是,本文中所提到的方法仅供参考,具体应依据相关权威机构的发布的指南和标准进行决策。
三种新冠病毒核酸提取方法的效果评价【摘要】目的通过比较三种核酸提取方法,了解不同新冠病毒核酸提取方法的性能。
方法采用核酸释放剂法、磁珠法和离心吸附柱法对10份浓度为500copies/ml的新冠病毒阳性质控品和58例新冠病毒核酸检测双阳性的鼻咽拭子样本进行核酸提取,提取后的核酸在同一品牌的荧光定量PCR扩增仪上,使用同一品牌的新冠病毒核酸扩增试剂进行RT-PCR扩增,对三种新冠病毒核酸提取方法的效果进行比较。
结果试验结果显示,离心吸附柱法核酸提取效率最高,磁珠法次之,核酸释放剂法最低。
结论离心吸附柱法提取核酸的效果最好,但操作繁琐、耗时,适合对阳性结果的复核。
其次是磁珠法,既可以满足临床要求,又可以实现自动提取,适合于大样本的检测。
核酸释放法虽然节省了核酸提取步骤和操作时间,但在三种方法中核酸提取的效率最低。
关键词:新型冠状病毒;核酸提取;实时荧光定量PCREvaluation of three methods for extracting COVID-19 nucleic acidLIANG Qihe,LIANG Wanzhen,LIU Jianting(Clinical laboratory of Jiangmen Central Hospital,Jiangmen 529070,China)[abstract] Objective to investigate the performance of different COVID-19 nucleic acid extraction methods by comparing three nucleic acids extraction methods. Methods nucleic acids from 10 positive COVID-19 QC samples with 500copies/ml concentration and 58 positive coronavirus nasopharyngeal swab samples were extracted by nucleic releaser,magnetic bead method and spin column method. The extracted nucleic acids were amplified by RT-PCR using the same COVID-19 nucleic acid amplification reagent on the same fluorescent quantitative PCR analyzer,The effects of three COVID-19 nucleic acid extraction methodswere compared. Results The test results showed that the spin column method had the highest extraction efficiency,followed by magnetic bead method, and the extraction efficiency of nucleic releaser was the lowest. Conclusion The spin column method has the best performance for nucleic acid extraction, but it is tedious and time-consuming and suitable for the reexamination of positive patients. The second is the magnetic bead method, which can both meet the clinical requirements and realize automatic extraction, suitable for the detection of large samples.Nucleic releaser although saving nucleic acid extraction steps and operating time, the efficiency of nucleic acid extraction was the lowest among the three methods.[Keywords] 2019 novel Coronavirus; nucleic acid extraction;Real-time fluorescence quantitative PCR2019年12月以来,在中国武汉爆发、流行的肺炎被中国科学家发现,该致病菌可以引起新型冠状病毒肺炎[1]。
三种核酸提取试剂盒效果比较试验熊立智;金美中;彭新锋;朱琳;王贵平【期刊名称】《郑州牧业工程高等专科学校学报》【年(卷),期】2018(000)002【摘要】比较三种核酸提取试剂盒效果,取2400μL稀释好的猪繁殖与呼吸综合征活疫苗,分为12份,200μL/份.将12份样品分为4组(A、B、C 1和C2),每组3个样品,分别用A、B、C三种试剂盒(共四个批次)进行提取.A和B试剂盒各提供一个批次,C试剂盒提供2个批次(C1和C2).用超微量核酸分光光度计测定四批次的RNA含量;用实时荧光定量RT-PCR扩增提取的RNA.发现三种试剂盒提取RNA 效果有明显差异.提取的RNA含量分别是1.7ng/μL(A组)、4.4ng/μL(B组)、3.3ng/μL(C1组)、4.1ng/μL(C2组).荧光定量检测的Ct值分别为23.49(A组)、21.71(B组)、24.97(C1组)、25.29(C2组).结果显示:B试剂盒相对较好,推荐使用B试剂盒进行核酸提取.【总页数】3页(P7-9)【作者】熊立智;金美中;彭新锋;朱琳;王贵平【作者单位】湖南农业大学动物医学院,湖南长沙410128;湖南省双峰县永丰镇动物防疫站,湖南娄底417700;湖南省双峰县畜牧局,湖南娄底410000;湖南农业大学动物医学院,湖南长沙410128;湖南农业大学动物医学院,湖南长沙410128【正文语种】中文【中图分类】Q786【相关文献】1.三种免核酸提取PCR试剂盒检测乙肝患者血清HBV-DNA的临床对比研究 [J], 高洁;严敏;付婷;邵中军2.三种核酸提取方法在甲型流感病毒临床样本检测中的效果对比 [J], 刘建礼;刘翌;焦艳丽;张绍福;李岩3.三种核酸提取试剂盒效果比较试验 [J], 熊立智;金美中;彭新锋;朱琳;王贵平;;;;;4.三种ELISA试剂盒与虎红平板凝集试验检测牛布鲁氏菌病的比较试验研究 [J], 肖妍; 霍蕾; 赵丹; 李蓉蓉; 王建华; 刘河冰5.6种核酸提取试剂盒的布鲁氏菌核酸提取效率比较 [J], 董浩; 王传彬; 韩焘; 毕一鸣; 原霖; 彭小薇; 蒋卉; 冯宇; 吴同垒; 秦玉明因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
三种核酸共提取试剂盒对血液病毒提取效能的比较研究王聪;陈之遥;武海萍;周国华【摘要】目的比较不同核酸共提取试剂盒对血液病毒的提取效能差异.方法选择国内外广泛使用的3种血液病毒核酸共提取试剂盒,分别为OMEGA试剂盒、QIAGEN试剂盒和WATSON试剂盒,HBV阳性、HBV阴性、HCV阳性和HCV 阴性血清样本均取自南京军区南京总医院.样本核酸提取按照各试剂盒说明书进行操作,定量方法采用实时荧光定量PCR.结果 OMEGA试剂盒对DNA的提取效率最高,对RNA的提取效率最低,耗时最短,成本居中;QIAGEN试剂盒DNA和RNA提取效率均较高,耗时居中,成本最高;国产WATSON试剂盒对DNA或RNA提取效率居中,耗时最长,成本最低.结论不同试剂盒对血液病毒的提取效能各不相同.对于已知病毒载量和病毒种类的样本,根据提取液DNA浓度和RNA浓度选择试剂盒;而对于未知病毒载量和病毒种类的样本,首选QIAGEN试剂盒,其次可选WATSON试剂盒.如只考虑成本,则首选WATSON试剂盒.%Objective To compare the efficiency of different nucleic acid extraction kits for extracting blood virus.Methods 3 commonly used kits for extraction of blood viral nucleic acid were chosen from domestic and international markets, including OMEGA kit, QIAGEN kit and WATSON kit, and serum samples with or without Hepatitis B virus (HBV) and serum samples with or without hepatitis C virus (HCV) were selected from General Hospital of Nanjing Military Area Command. The nucleic acid extraction procedures were carried out according to the instructions of the 3 kits and the real-time quantitative PCR was performed for quantitative analysis. Results OMEGA kit had the best extraction efficiency of DNA but had the worst extractionefficiency for RNA extraction within a short time and at medium cost. QIAGEN kit had good efficiency for both DNA and RNA extraction with medium term, but at the highest cost; WATSON kit had medium efficiency rate for both DNA and RNA extraction with long term extraction and at the lowest cost. Conclusion There are different efficiency rates at the in extracting blood virus with different nucleic acid extraction kits. We should choose kits for the samples with clear virus capacity and category according to the concentrations of extracted DNA and RNA, but for the samples with unknown capacity and category of virus, QIAGEN kit should be the first priority and followed by WATSON kit. WATSON kit should be the first choice in terms of cost.【期刊名称】《临床误诊误治》【年(卷),期】2011(024)008【总页数】4页(P6-9)【关键词】病毒核酸提取试剂盒;实时荧光定量聚合酶链反应;提取效率【作者】王聪;陈之遥;武海萍;周国华【作者单位】210009,南京,中国药科大学生命科学技术学院;210002,南京,华东医学生物技术研究所;210002,南京,华东医学生物技术研究所;210002,南京,华东医学生物技术研究所;210009,南京,中国药科大学生命科学技术学院;210002,南京,华东医学生物技术研究所【正文语种】中文【中图分类】R457.11随着检测技术的不断进步,输血传播相关病毒的危险性已大大降低,但由于病毒感染者“窗口期”献血、病毒变异、低载量病毒感染等因素,使得临床输血依然存在一定风险。
三种核酸快速提取系统的病毒核酸提取效果评价彭雄俊;彭一枝;崔杨飞;李先平【期刊名称】《中国医学装备》【年(卷),期】2022(19)5【摘要】目的:分析比较天隆、中元和硕世3种核酸快速提取系统对咽拭子、全血和尿液3种类型临床样本核酸提取效果。
方法:收集临床上的16个全血标本、16个尿液标本以及32个咽拭子标本,采用天隆、中元和硕世3种核酸快速提取系统进行核酸提取,并用Thermo NanoDrop 2000核酸蛋白分析仪检测所提核酸浓度及纯度。
利用荧光PCR法通过新型冠状病毒核酸检测试剂盒、EB病毒核酸检测试剂盒和BK病毒核酸检测试剂盒分别将咽拭子、全血和尿液3种类型临床样本所提核酸进行检测,并用SPSS25.0统计学软件对3种系统提取的核酸浓度、纯度[光密度(OD)值]OD260/OD280比值及循环阈值(Ct值)进行统计学分析。
结果:天隆系统提取的全血、咽拭子和尿液标本核酸浓度范围分别为16.8~356.1 ng/μl、6.1~146.8 ng/μl和17.2~75.5 ng/μl;中元系统分别为4.5~10 ng/μl、11.3~80.2 ng/μl和2.8~176.3;硕世系统分别为1.8~5.0 ng/μl、0~22.3 ng/μl 和1.4~4.8 ng/μl,天隆系统提取的全血核酸浓度水平最高且核酸浓度范围较宽泛(16.8~356.1 ng/μl,P<0.05)。
天隆系统提取的全血、咽拭子和尿液标本核酸纯度OD260/OD280比值分别为(1.89±0.01)、(1.87±0.02)和(1.91±0.01);中元系统分别为(1.98±0.02)、(3.67±0.22)和(1.42±0.06);硕世系统分别为(1.32±0.02)、(1.19±0.10)和(4.05±0.87)。
天隆和中元系统提取的全血核酸纯度(1.89±0.01,1.98±0.02)较好。