细菌总蛋白和膜蛋白提取方法
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1分离组织膜蛋白的方法:1、取组织,加入10ml Buffer A 于冰上充分匀浆。
2、J6-HC离心机800rpm,4℃离心10min后,所得上清液转入超速离心管。
3、100000g,4℃离心1hr。
弃去上清,沉淀用适量的Buffer B重悬,冰上孵育2hr后分装至EP管,Eppendorf台式离心机10000rpm,4℃离心30min。
4、收集所得上清液即为膜组份。
Buffer A:0.32M 蔗糖,5mM Tris-HCl(PH 7.5),120mM KCl,1mM EDTA,1mM EDTA, 0.2mM PMSF, 1ug/ml Leupeptin, 1ug/ml Pepstatin A, 1ug/ml Aprotinin。
冰上预冷。
Buffer B:20mM HEPES(PH 7.5),10%甘油,2% Triton X-100, 1mM EDTA, 1mM EDTA, 0.2mM PMSF, 1ug/ml Leupeptin, 1ug/ml Pepstatin A, 1ug/ml Aprotinin。
冰上预冷。
2取约0.1g肝组织,加入2ml粉碎缓冲液,冰浴中超声粉碎,每次20秒,间隔30秒,共3次,4°c 105xg条件下离心2小时,上清液为胞浆蛋白,沉淀部分加入1ml胞膜蛋白提取液,超声粉碎,4°c 105xg条件下离心2小时,上清液为胞膜蛋白。
样品蛋白含量测定采用酚试剂法。
3我们实验室提取膜蛋白的方法如下:1.将细胞种于T75 或T175的培养瓶中培养数天,细胞铺满瓶底后,吸去培养液。
将PBS/EDTA 溶液(NaCl:0.1M,NaH2PO4:0.01M,EDTA:0.04%)加入量以覆盖细胞为止,置于培养箱或在超净台内消化3~5分钟,如仍未脱落瓶底,用吸管吹打,使细胞完全脱落。
2.收集细胞悬液于10毫升或50毫升的离心管中,1000rpm离心10分钟,去上清液。
提取膜蛋白的方法提取膜蛋白是一项关键的实验步骤,用于研究膜蛋白的结构和功能。
本文将介绍几种常用的膜蛋白提取方法。
1. 浸泡法浸泡法是一种简单的膜蛋白提取方法。
将细胞或组织样品置于适当的缓冲液中,如磷酸盐缓冲液或生理盐水中,并加入一些溶解剂(如阴离子洗涤剂)以破坏膜结构。
浸泡一段时间后,离心以分离出溶液中的膜蛋白。
2. 磷脂双层溶液法磷脂双层溶液法利用磷脂双层膜的特性来提取膜蛋白。
首先,将细胞或组织样品放入含有磷脂双层的液体中。
磷脂双层膜与细胞膜相似,可吸附并保持膜蛋白的结构和功能。
然后,用洗涤液洗涤磷脂双层,使膜蛋白释放到洗涤液中。
3. 超声法超声法是一种物理方法,通过超声波的能量来提取膜蛋白。
将细胞或组织样品置于含有缓冲液的管中,并使用超声波处理。
超声波的能量可以破坏细胞膜结构,使膜蛋白溶解到缓冲液中。
然后,对溶液进行离心,将膜蛋白分离出来。
4. 酸碱提取法酸碱提取法利用pH的变化来提取膜蛋白。
首先,将细胞或组织样品放入酸性或碱性溶液中,并搅拌。
酸性或碱性环境可以破坏细胞膜结构,使膜蛋白溶解到溶液中。
然后,通过调整pH值,使膜蛋白沉淀,进一步提纯。
5. 亲水基质法亲水基质法是一种通过亲水基质与疏水膜蛋白的选择性结合来提取膜蛋白的方法。
细胞或组织样品与亲水基质接触,亲水基质与细胞膜的亲水区域结合,使膜蛋白释放到溶液中。
然后,通过离心和洗涤步骤来分离和纯化膜蛋白。
这些方法在膜蛋白的研究中应用广泛,但根据具体的实验目的和样品特性,可以选择适合的方法进行膜蛋白提取。
实验中还应注意选择合适的缓冲液、溶液浓度和温度,并结合离心、洗涤等步骤进行蛋白的纯化和分离。
此外,需要根据实验目的选择合适的检测方法,如SDS-PAGE、Western blot等来确定提取的膜蛋白的质量和纯度。
总之,膜蛋白提取是膜生物学研究的重要一环,不同方法适用于不同的样品和实验要求。
正确选择和操作提取方法可以高效地提取膜蛋白,并为后续研究提供可靠的样品。
细菌总蛋白的提取方法1.培养和收获细菌:首先,选择一种适合您研究目的的细菌株,并在含有适当的培养基的培养皿中培养。
培养温度和时间可以根据具体的细菌株来确定。
在培养到合适的生长期后,用无菌的锥形管或离心管收获细菌。
2. 细胞裂解:将细菌细胞分装到无菌的离心管中,然后通过使用裂解剂来破坏细胞膜并释放蛋白质。
常用的裂解剂有琼脂糖凝胶电泳缓冲液(Tris-HCl),盐溶液(如NaCl)、肌凝蛋白合成抑制剂(例如氯霉素)和酶抑制剂(如苯甲砜)。
可以根据具体实验要求进行调整。
3.细胞裂解方法:细胞裂解方法有多种,常用的有超声波法、冻融法、压力法和化学分解法等。
其中,超声波法是最常用的方法之一、将装有细胞的离心管放入冰桶中,使用超声波处理器将细胞破碎。
超声波处理时间和强度可根据具体细菌株的要求进行调整。
其他方法也可根据实验要求进行选择。
4.离心:将经过细胞裂解的混合物离心,以除去碎片、膜片和细胞碎片。
将裂解液转移到一个新的离心管中。
5.蛋白质沉淀:在裂解液中添加适当的蛋白质沉淀剂(如三氯醋酸、硫酸铵等),并在低温条件下静置一段时间,使蛋白质沉淀成块。
然后,使用离心将混合物分解为沉淀和上清液。
6.重悬和洗涤:将蛋白质沉淀用缓冲液或溶液重悬,并通过反复离心和洗涤步骤去除杂质和残留的蛋白质沉淀剂。
这可以通过溶剂中加入催化剂(如氯化铵)或重悬液进行移液或漩涡混合来实现。
7.可选的纯化步骤:根据研究需要,还可以对提取的细菌总蛋白进行进一步的纯化处理。
例如,可以使用离子交换层析、凝胶过滤、亲和层析和凝胶电泳等技术来获得纯化的蛋白质。
8.存储:最后,将提取的细菌总蛋白通过冷冻或冷冻干燥等方法进行储存,以便将来使用。
以上是一种常见的细菌总蛋白提取方法。
具体的步骤和条件可能会根据研究目的和细菌株而有所不同。
因此,在进行实验之前,建议参考相关文献以获取更准确的方法和条件。
细菌总蛋白和膜蛋白提取方法一、从新鲜样品中提取总蛋白(简易法)1、自配裂解液(pH ):50 mM Tris-HCl,2 mM EDTA, 100 mM NaCl,% Triton X-100,调pH 值至备用;用前加入100 μg/ml 溶菌酶,1μl/ml 的蛋白酶抑制剂PMSF。
该裂解液用量为10-50ml 裂解液/1g湿菌体。
2、将40ml 菌液在12000g,4℃下离心15分钟收集菌体,沉淀用PBS悬浮洗涤2遍,沉淀加入1ml裂解液悬浮菌体。
3、超声粉碎,采用300w,10s超声/10s间隔,超声20min,反复冻融超声3次至菌液变清或者变色。
4、1000g离心去掉大碎片,上清可直接变性后PAGE电泳检测,或者用1% SDS溶液透析后冻存。
缺点:Western blotting结果表明,疏水性跨膜蛋白提取效率有限。
二、从Trizol裂解液中分离总蛋白1、Trizol溶解的样品研磨破碎后,加氯仿分层,2-8℃下10000g离心15min,上层水相用于RNA提取,体积约为总体积的60%。
2、用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。
每使用1ml Trizol加入无水乙醇混匀,室温放置3min,2-8℃不超过2000g离心5min。
3、将上清移至新的EP管中,用异丙醇沉淀蛋白质。
每使用1ml Trizol加入异丙醇,室温放置10min,2-8℃下12000g离心10min,弃上清。
4、用含有0.3M 盐酸胍的95%乙醇洗涤。
每1ml Trizol加入2ml洗液,室温放置20min,2-8℃下7500g离心5min,弃上清,重复洗涤2次。
最后加入2ml无水乙醇,涡旋后室温放置20min,2-8℃下7500g离心5min,弃上清。
5、冷冻干燥5-10min,1%SDS溶液溶解,反复吹打,50℃温浴使其完全溶解,2-8℃下10000g 离心10min去除不溶物。
6、替代方案:将3中的酚醇上清液移至小分子量透析袋中,在2-8℃的1% SDS溶液中透析3次,1000g离心10min去除沉淀,上清可直接用于蛋白实验。
细菌总蛋白和膜蛋白提取方法一、从新鲜样品中提取总蛋白(简易法)1、自配裂解液(pH 8.5-9.0):50 mM Tris-HCl,2 mM EDTA, 100 mM NaCl,0.5% Triton X-100,调pH值至8.5-9.0备用;用前加入100 μg/ml 溶菌酶,1μl/ml 的蛋白酶抑制剂PMSF。
该裂解液用量为10-50ml 裂解液/1g湿菌体。
2、将40ml 菌液在12000g,4℃下离心15分钟收集菌体,沉淀用PBS悬浮洗涤2遍,沉淀加入1ml裂解液悬浮菌体。
3、超声粉碎,采用300w,10s超声/10s间隔,超声20min,反复冻融超声3次至菌液变清或者变色。
4、1000g离心去掉大碎片,上清可直接变性后PAGE电泳检测,或者用1% SDS溶液透析后冻存。
缺点:Western blotting结果表明,疏水性跨膜蛋白提取效率有限。
二、从Trizol裂解液中分离总蛋白1、Trizol溶解的样品研磨破碎后,加氯仿分层,2-8℃下10000g离心15min,上层水相用于RNA提取,体积约为总体积的60%。
2、用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。
每使用1ml Trizol加入0.3ml无水乙醇混匀,室温放置3min,2-8℃不超过2000g离心5min。
3、将上清移至新的EP管中,用异丙醇沉淀蛋白质。
每使用1ml Trizol加入1.5ml异丙醇,室温放置10min,2-8℃下12000g离心10min,弃上清。
4、用含有0.3M 盐酸胍的95%乙醇洗涤。
每1ml Trizol加入2ml洗液,室温放置20min, 2-8℃下7500g离心5min,弃上清,重复洗涤2次。
最后加入2ml无水乙醇,涡旋后室温放置20min,2-8℃下7500g离心5min,弃上清。
5、冷冻干燥5-10min,1%SDS溶液溶解,反复吹打,50℃温浴使其完全溶解,2-8℃下10000g 离心10min去除不溶物。
细胞膜蛋白的提取
细胞膜蛋白的提取可以通过以下步骤进行:
1. 细胞收集:从所需的细胞类型中收集足够数量的细胞。
可以使用细胞培养方法培养细胞,或者从活体组织中分离细胞。
2. 细胞破碎:将细胞用适当的方法破碎,以释放细胞内的蛋白。
可以使用机械方法(如超声波破碎器或高压细胞击碎器)或化学方法(如洗涤液或界面活性剂)来破碎细胞。
3. 蛋白质提取:使用适当的缓冲液或溶液将细胞破碎物悬浮并离心,以去除细胞碎片和细胞核。
随后,可以使用不同的方法来提取膜蛋白,例如溶解细胞膜并提取蛋白。
4. 蛋白质纯化:使用不同的技术来纯化细胞膜蛋白。
这包括以蛋白质的特定性质为基础的方法,例如亲和层析、凝胶过滤层析、离子交换层析等。
5. 蛋白质浓缩:将纯化的细胞膜蛋白浓缩到所需的浓度。
可以使用蛋白质浓缩技术,例如氨基酸纤维柱、浓缩管或旋转蒸发器等。
6. 蛋白质鉴定:利用蛋白质检测方法,如SDS-PAGE、Western blotting或质谱分析等,确定提取的蛋白质的纯度和数量。
细胞膜蛋白的提取过程需根据实验目的和具体需求来选择和优化各个步骤。
6)detergent- based:提取时先裂解液裂胞膜(选用不同的去污试剂是要害),梯度离心分离细胞器(ER),然后分级抽提方法。
例如,去掉细胞器之后的DEBRIS就是核膜,再裂解得到核膜蛋白。
而膜蛋白是裂胞膜时不溶的部分。
总的感受:细胞的量要很充足。
之后的定性鉴定常用的方法有双向免疫扩散、免疫电泳及聚丙稀酰胺凝胶电泳等。
纯化蛋白质浓度的定量测定可用双缩脲法、酚试剂法或紫外光吸收法定量鉴定膜蛋白,方便迅速。
到目前为止,提取膜蛋白仍然是蛋白学的一个瓶颈。
2、分离膜蛋白的方法(操作)1)分离细胞膜蛋白的方法:1 冰上刮下细胞后将细胞溶于有蛋白酶抑制剂的缓冲液A中,于室温与液氮罐中反复冻融2次。
2 5000转4度离心,驱除核及未裂解的细胞。
3 取上清12000转4度离心10分钟取沉淀溶于有蛋白酶抑制剂的缓冲液B中。
4 12000转4度离心10分钟取沉淀溶于有蛋白酶抑制剂的缓冲液C中提取后测蛋白浓度,SDS-PAGE电泳,分装后-20度保存备用。
buffer A : 1mMkcl,5mMNacl,3mM Mgcl2,50mM Hepes,1mM DTT,0.5ug/ml Leupeptin,20uM pmsf(PH=7.4)buffer B : 1mMkcl,5mMNacl,3mM Mgcl2,50mM Hepes,1mM DTT,0.5ug/ml Leupeptin,20uM pmsf(PH=7.4) 1mM EGTAbuffer C : 0.5ug/ml Leupeptin,20uM pmsf,50mMTris-cl(PH=7.0),2)分离细胞膜蛋白的方法:1、细胞放在冰上,去除上清,用pH7。
4的冷磷酸盐缓冲液洗涤单层细胞两次2、加入1ml2%TritonX溶液冰浴15min3、刮下单层细胞,4度下10 000g 5min离心4、溶液37度水浴10min以分离水相和去污剂相,然后37度下2 000g离心5min5、收集水相留作分析6、用500ul冰冷的buffer C溶解去污剂相沉淀,冰浴2min后加温,在按步骤6再次离心7、按步骤8再次抽提去污剂相,用buffer C将洗涤后的去污剂相稀释到初始体积8、用等量的buffer A分别稀释水相与去污相,并进行免疫沉淀实验试剂:1、2%tritonX114:2%TritonX114、50mmol/L Tris HCl(pH7。
细菌总蛋白和膜蛋白提取方法一、从新鲜样品中提取总蛋白(简易法)1、自配裂解液(pH 8.5-9.0):50 mM Tris-HCl,2 mM EDTA, 100 mM NaCl,0.5% Triton X-100,调pH值至8.5-9.0备用;用前加入100 μg/ml 溶菌酶,1μl/ml 的蛋白酶抑制剂PMSF。
该裂解液用量为10-50ml 裂解液/1g湿菌体。
2、将40ml 菌液在12000g,4℃下离心15分钟收集菌体,沉淀用PBS悬浮洗涤2遍,沉淀加入1ml裂解液悬浮菌体。
3、超声粉碎,采用300w,10s超声/10s间隔,超声20min,反复冻融超声3次至菌液变清或者变色。
4、1000g离心去掉大碎片,上清可直接变性后PAGE电泳检测,或者用1% SDS溶液透析后冻存。
缺点:Western blotting结果表明,疏水性跨膜蛋白提取效率有限。
二、从Trizol裂解液中分离总蛋白1、Trizol溶解的样品研磨破碎后,加氯仿分层,2-8℃下10000g离心15min,上层水相用于RNA提取,体积约为总体积的60%。
2、用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。
每使用1ml Trizol加入0.3ml无水乙醇混匀,室温放置3min,2-8℃不超过2000g离心5min。
3、将上清移至新的EP管中,用异丙醇沉淀蛋白质。
每使用1ml Trizol加入1.5ml异丙醇,室温放置10min,2-8℃下12000g离心10min,弃上清。
4、用含有0.3M 盐酸胍的95%乙醇洗涤。
每1ml Trizol加入2ml洗液,室温放置20min,2-8℃下7500g离心5min,弃上清,重复洗涤2次。
最后加入2ml无水乙醇,涡旋后室温放置20min,2-8℃下7500g离心5min,弃上清。
5、冷冻干燥5-10min,1%SDS溶液溶解,反复吹打,50℃温浴使其完全溶解,2-8℃下10000g 离心10min去除不溶物。
哺乳动物跨膜蛋白承担各种生物功能,在疾病的发生、发展过程中扮演重要角色。
膜蛋白的蛋白质组学分析是被大家看好的辨识新的药物靶标和/或疾病的生物学标记的好方法,并已得到广泛应用。
然而膜蛋白通过许多疏水氨基酸残基锚定在膜结构里面,很难溶解在水性缓冲液系统中。
为了制备膜蛋白样品,传统的方法是采用“去污剂+机械处理”的操作方法获取膜蛋白,用于增溶的去污剂有离子型(如SDS)和非离子型的(如Triton?-X)等,前者会使多数蛋白完全变性,限制很多下游分析,而后者虽然相对温和,但抽提膜蛋白(特别是有多个跨膜区的膜蛋白)的效果往往很差。
下面推荐的是两个公司的相关产品,也算是具有代表性的两种方法:1.默克的跨膜蛋白抽提试剂盒ProteoExtract 跨膜蛋白抽提试剂盒(简称TM-PEK,货号71772-3)是一种基于化学而非去污剂方法的高产膜蛋白制备试剂盒。
其简便的两步法操作可以高效地富集膜蛋白和膜关联蛋白。
试剂盒包括两种试剂,TM-PEK试剂A 和TM-PEK试剂B,分别用于制备抽提缓冲液2A和抽提缓冲液2B。
使用者通过实验摸索,可以根据特定目的蛋白的特点从中灵活选择最适缓冲液。
用ProteoExtract TM-PEK 试剂抽提得到的蛋白适合用于常见的各种蛋白分析方法。
从以下的报告中,列举了TM-PEK制备的跨膜蛋白和多次跨膜蛋白样品在免疫印迹、活性分析及2D电泳等方面的实例。
为了验证ProteoExtract跨膜蛋白抽提试剂盒抽提多次跨膜蛋白的有效性,我们用免疫印迹比较了Frizzled-4,CELSR-3(cadherin-EGF-lag seven-pass receptor-3)和EGFR(表皮生长因子,只有一个跨膜区)的样本制备效果。
Frizzled和CELSR是WNT/ PCP (平面细胞极性)通路的重要组成成分,而这个重要的通路则控制了组织的极性和细胞的迁移。
Frizzled蛋白与GPCRs有远源关系,但是除开都具有7个跨膜区的结构外,它们的结构和功能存在很大差异(参见Huang 2004)。
[【生物化学与分子生物学】]细菌总蛋白和膜蛋白提取方法
膜蛋白, 细菌膜蛋白, 细菌
一、从新鲜样品中提取总蛋白(简易法)
1、自配裂解液(pH 8.5-9.0):50 mM Tris-HCl,2 mM EDTA, 100 mM NaCl,0.5% Triton X-100,调pH值至8.5-9.0备用;用前加入100 μg/ml 溶菌酶,1μl/ml 的蛋白酶抑制剂PMSF。
该裂解液用量为10-50ml 裂解液/1g湿菌体。
2、将40ml 菌液在12000g,4℃下离心15分钟收集菌体,沉淀用PBS悬浮洗涤2遍,沉淀加入1ml裂解液悬浮菌体。
3、超声粉碎,采用300w,10s超声/10s间隔,超声20min,反复冻融超声3次至菌液变清或者变色。
4、1000g离心去掉大碎片,上清可直接变性后PAGE电泳检测,或者用1% SDS溶液透析后冻存。
缺点:Western blotting结果表明,疏水性跨膜蛋白提取效率有限。
二、从Trizol裂解液中分离总蛋白
1、Trizol溶解的样品研磨破碎后,加氯仿分层,2-8℃下10000g离心15min,上层水相用于RNA提取,体积约为总体积的60%。
2、用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。
每使用1ml Trizol加入0.3ml无水乙醇混匀,室温放置3min,2-8℃不超过2000g离心5min。
3、将上清移至新的EP管中,用异丙醇沉淀蛋白质。
每使用1ml Trizol加入1.5ml异丙醇,室温放置10min,2-8℃下12000g离心10min,弃上清。
4、用含有0.3M 盐酸胍的95%乙醇洗涤。
每1ml Trizol加入2ml洗液,室温放置20min,2-8℃下7500g 离心5min,弃上清,重复洗涤2次。
最后加入2ml无水乙醇,涡旋后室温放置20min,2-8℃下7500g离心5min,弃上清。
5、冷冻干燥5-10min,1%SDS溶液溶解,反复吹打,50℃温浴使其完全溶解,2-8℃下10000g离心10min去除不溶物。
6、替代方案:将3中的酚醇上清液移至小分子量透析袋中,在2-8℃的1% SDS溶液中透析3次,1000g 离心10min去除沉淀,上清可直接用于蛋白实验。
三、从新鲜样品中提取疏水性膜蛋白(Triton X-114去污剂法)
1、配制疏水性蛋白提取液(非裂解液):1% Triton X-114,150mM NaCl, 10mM Tris-HCl,1mM EDTA,调pH值至8.0备用。
2、菌液于4℃条件下15000g离心15min收集菌体;用1ml 含有5mM MgCl2 的PBS洗涤3次,最后于4℃条件下15000g离心15min收集菌体。
3、菌体沉淀加入1ml冷提取液,于4℃条件下放置2h,17000g离心10min,去除沉淀取上清。
4、将上述上清中的Triton X-114含量增加到2%,再加入20mM的CaCl2抑制部分蛋白酶活性,37℃条件下放置10min使其分层。
室温下1000g离心10min使液相和去污相充分分层。
5、将液相和去污相分开,分别用10倍体积的冷丙酮在冰上沉淀45min。
6、于4℃条件下17000g离心30min,用去离子水洗涤沉淀3次。
7、将沉淀溶解在1% SDS溶液中,测定蛋白浓度,比较液相和去污相中蛋白提取效率,一般是去污相中疏水性膜蛋白较多,适于进一步蛋白实验
8、SDS-PAGE进一步分析液相和去污相的蛋白图谱。