蛋白质翻译练习题
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蛋白质组学蛋白质组学试卷(练习题库)1、自由流电泳分离蛋白质的机理及其优缺点。
2、质谱仪的组成及其主要技术指标。
3、蛋白质组学定量分析方法的主要原理。
4、请列举预测蛋白质相互作用的方法。
5、系统生物学研究的主要流程是什么?6、试述如何应用2D-PAGE进行差异蛋白质组学的研究,并分析其优缺点。
7、 Proteome(蛋白质组)8、 Proteomics(蛋白质组学)9、 Mass Spectrometer(质谱仪)10、 Post translational modification(蛋白质翻译后修饰)11、 De novo sequencing(从头测序)12、 Tandem mass spectrometry(串联质谱)13、 Peptide mass fingerprint(肽指纹谱)14、 Peptide sequence tag 肽序列标签15、 Post-source decay(源后衰变)16、 Neutral loss scan 中性丢失扫描17、 Matrix-assisted laser desorption/ionization基质辅助激光解18、论述蛋白质组学与基因组学的区别和联系。
19、简述与传统的分离技术相比较,PF-2D的优点。
20、多反应监测的英文缩写?()21、下列哪一个不是质谱的离子化模式?()22、质谱分析是根据()对样品进行分析。
23、质谱仪的构造包括()。
24、以下不属于质量分析器的是()。
25、分辨率指,当两个质谱峰的峰高相等,而其谷高相当于峰高的(),这两个峰可以分开。
26、以下哪个质量分析器的检测上限最高()。
27、电子轰击电离主要用于检测()。
28、电喷雾电离源主要用于检测()。
29、 MALDI的中文意思是指()。
30、质谱仪的进样系统包括()。
31、 MALDI是用于()的离子化方法。
32、飞行时间质量分析器是利用具有相同能量的带电荷粒子,由于()的差异而具有不同的速度,通过相同的漂移距离33、要想得到较多的碎片离子,应采用下面哪种离子源()。
蛋白质结构与功能试题一、问答题:1.影响蛋白质二级结构改变的因素有哪些?参考答案:温度;pH;邻近氨基酸残基的二级结构倾向;肽链中远程肽段的影响;肽段是处于分子表面还是被包埋在分子内部2.如下图所示。
多聚谷氨酸poly (Glu) 是由多个L-Glu聚合形成的多肽链,在pH为3的溶液中能形成a-螺旋构象,当pH升高到7时,则由a-螺旋变为无规卷曲,旋光率陡然下降。
同样,多聚赖氨酸poly (Lys) 在pH为10的溶液中具有a-螺旋结构,当pH降低至7时,旋光率也发生陡然下降,由a-螺旋结构变为无规卷曲。
请解释pH对poly (Glu) 和poly (Lys) 构象变化的影响。
答案要点:pH=3接近Glu g-COOH的p K R (4.07),侧链基团为质子化不带电荷状态,可形成a-螺旋结构。
其余情况按此思路分析。
Lys e-NH2 p K R 为10.54。
3.胶原蛋白的结构特点(原胶原分子的一级结构和高级结构)1)在体内,胶原蛋白以胶原纤维的形式存在,胶原纤维的基本结构单位是原胶原分子2)每个原胶原分子由三条左手螺旋的a链(a-肽链)组成右手超螺旋结构,每条a链约含1000个氨基酸残基3)a链间靠H-键和范得华力维系,胶原纤维可以通过分子内和分子间的进一步交联增强稳定性4)a链一级结构序列96%遵守(Gly-X-Y)n。
x多为脯氨酸Pro;y多为羟基脯氨酸Hyp或羟基赖氨酸Hly5)胶原蛋白是糖蛋白,少量糖与5-羟赖氨酸(Hyl)残基的碳羟基共价连接6)具有较好的弹性和抗张强度4.形成结构域的意义是什么?参考答案:1)各结构域分别折叠,其动力学上更有利2)结构域自身紧密装配,结构域之间的柔性连接使每个结构域间可以作较大幅度的相对运动3)多个结构域形成的间隙部位往往是蛋白质的功能部位,结构域的相互作用有利于蛋白质分子产生别构效应5.简述三种浓缩蛋白质溶液的方法及原理1)超滤法:将蛋白质样品装入适当的超滤管中,经一定时间离心,溶剂穿过超滤管滤膜流出而使蛋白质溶液得以浓缩2)硫酸铵沉淀法:通过盐析作用使蛋白质在高浓度中性盐中析出而浓缩。
一、选择题【单选题】1.下列氨基酸活化的叙述哪项是错误的A.活化的部位是氨基酸的α-羧基B.活化的部位是氨基酸的α-氨基C.活化后的形式是氨基酰-tRNA D.活化的酶是氨基酰-tRNA合成酶E.氨基酰tRNA既是活化形式又是运输形式2.氨基酰tRNA的3’末端腺苷酸与氨基酸相连的基团是A.1’-OH B.2’-磷酸C.2’-OH D.3’-OH E.3’-磷酸3.哺乳动物的分泌蛋白在合成时含有的序列是A.N末端具有亲水信号肽段[B.在C末端具有聚腺苷酸末端C.N末端具有疏水信号肽段D.N末端具有“帽结构”E.C末端具有疏水信号肽段4.氨基酸是通过下列哪种化学键与tRNA结合的A.糖苷键B.磷酸酯键C.氢键D.酯键E.酰胺键5.代表氨基酸的密码子是A.UGA B.UAG C.UAA D.UGG E.UGA和UAG6.蛋白质生物合成中多肽链的氨基酸排列顺序取决于A.相应tRNA专一性;B.相应氨基酰tRNA合成酶的专一性C.相应mRNA中核苷酸排列顺序D.相应tRNA上的反密码子E.相应rRNA的专一性7.与mRNA中密码5’ACG3’相对应的tRNA反密码子是A.5’UGC3’B.5’TGC3’C.5’GCA3’D.5’CGT3’E.5’CGU3’8.不参与肽链延长的因素是A.mRNA B.水解酶C.转肽酶D.GTP E.Mg2+ 9.能出现在蛋白质分子中的下列氨基酸哪一种没有遗传密码A.色氨酸B.甲硫氨酸C.羟脯氨酸D.谷氨酰胺E.组氨酸(10.多肽链的延长与下列何种物质无关A.转肽酶B.甲酰甲硫氨酰-tRNA C.GTP D.mRNA E.EFTu、EFTs和EFG 11.下述原核生物蛋白质生物合成特点错误的是A.原核生物的翻译与转录偶联进行,边转录、边翻译、边降解(从5’端)B.各种RNA中mRNA半寿期最短C.起始阶段需ATPD.有三种释放因子分别起作用E.合成场所为70S核糖体12.可引起合成中的肽链过早脱落的是A.氯霉素B.链霉素C.嘌呤霉素D.四环素E.放线菌酮<13.肽键形成部位是A.核糖体大亚基P位B.核糖体大亚基A位C.两者都是D.两者都不是E.核糖体大亚基E位14.关于核糖体叙述正确的是A.多核糖体在一条mRNA上串珠样排列B.多核糖体在一条DNA上串珠样排列C.由多个核糖体大小亚基聚合而成D.在转录过程中出现E.在复制过程中出现15.翻译过程中哪个过程不消耗GTP?A.起始因子的释放B.进位C.转肽D.移位E.肽链的释放16.下列哪一种过程需要信号肽A.多核糖体的合成B.核糖体与内质网附着C.核糖体与mRNA附着D.分泌性蛋白质合成E.线粒体蛋白质的合成17.哺乳动物细胞中蛋白质合成的重要部位是A.核仁B.细胞核C.粗面内质网D.高尔基体E.溶酶体18.氨基酰-tRNA合成酶的特点是`A.存在于细胞核内B.只对氨基酸的识别有专一性C.只对tRNA的识别有专一性D.催化反应需GTP E.对氨基酸、tRNA的识别都有专一性19.蛋白质生物合成时转肽酶活性存在于A.EFTu B.EFG C.IF-3 D.核糖体大亚基E.核糖体小亚基20.下列关于原核生物蛋白质生物合成的描述哪一项是错误的A.起动阶段核糖体小亚基先与mRNA结合B.肽链延长阶段分为进位、转肽、移位三个步骤C.合成肽键需消耗GTPD.在A位上出现UAA以后转入终止阶段E.释放因子只有一种可识别3种终止密码子·21.在氨基酰-tRNA合成酶催化下,tRNA能与哪一种形式的氨基酸结合A.氨基酸-酶复合物B.自由的氨基酸C.氨基酰-ATP-酶复合物D.氨基酰-AMP-酶复合物E.氨基酰-ADP-酶复合物22.下列哪一项不适用于真核生物蛋白质生物合成的起始阶段A.mRNA在30S小亚基上准确就位B.起动作用需甲硫氨酰-tRNAC.起始因子有至少9种D.起始阶段消耗GTPE.起动复合物由大亚基、小亚基、mRNA与甲硫氨酰-tRNA组成23.蛋白质合成时肽链合成终止的原因是】A.已达到mRNA分子的尽头B.特异的tRNA识别终止密码子C.释放因子能识别终止密码子并进入A位D.终止密码子本身具酯酶作用,可水解肽酰基与tRNA之间的酯键E.终止密码子部位有较大阻力,核糖体无法沿mRNA移动24.下列关于蛋白质生物合成的描述错误的是A.氨基酸必须活化成活性氨基酸B.氨基酸的羧基端被活化C.活化的氨基酸被搬运到核糖体上D.体内所有的氨基酸都有相应的密码|E.tRNA的反密码子与mRNA上的密码子按碱基配对原则反向结合25.下列有关多肽链中羟脯氨酸和羟赖氨酸的生成,哪一项是正确的A.各有一种特定的遗传密码编码B.各有一种与之对应的反密码子C.各有一种tRNA携带D.是翻译过程中的中间产物E.是脯氨酸和赖氨酸修饰的产物26.为氨基酰-tRNA和核糖体A位结合所必需的是A.EFTu和EFTs B.IF-3 C.转肽酶D.EFT和EFG E.以上都不是27.一个mRNA的部分序列和密码子编号如下:^140 141 142 143 144 145 146……GAU CCU UGA GCG UAA UAU CGA……以此mRNA为模板,经翻译后生成多肽链含有的氨基酸数是A.140 B.141 C.142 D.143 E.14628.在大肠杆菌中初合成的各种多肽链N端第一个氨基酸是A.丝氨酸B.谷氨酸C.蛋氨酸D.N-甲酰蛋氨酸E.N-乙酰谷氨酸1.B 2.D 3.C 4.D 5.D 6.C 7.E 8.B 9.C 10.B 11.C 12.C 13.B 14.A 15.C 16.D 17.C 18.E 19.D 20.E 21.D 22.A 23.C 24.D 25.E 26.A 27.B 28.D部分习题解释5.D mRNA分子中共有64个密码,其中61个代表20种氨基酸,有一个起始密码-AUG(在蛋白质生物合成的起始阶段,即代表蛋白质合成的起始,也是蛋氨酸的密码),3个终止密码-UAA、UAG及UGA,所以答案A、B、C、E均为终止密码,只有答案D是代表氨基酸(色氨酸)的密码。
第五章基因表达2:蛋白质翻译名词解释:SD序列、无义突变和错义突变、EF-Tu、同义密码填空:1.可使每个氨基酸和它相对应的tRNA分子相偶联形成一个2.核糖体包括两个tRNA分子的结合位点:即P位点,紧密结合与多肽链延伸尾端相连接的tRNA分子;即A位点,结合带有一个氨基酸的tRNA 分子。
3.蛋白质合成的起始过程很复杂,包括一系列被催化的步骤4.tRNA的三叶草型结构中,其中氨基酸臂的功能是_________,反密码环的功能是___________。
5.核糖体沿着mRNA前进时,它需要另一个延伸因子,这一步需要的水解。
当核糖体遇到终止密码、、的时候,延伸作用结束,核糖体和新合成的多肽被释放出来。
翻译的最后一步被称为,并且需要一套因子。
6.tRNA的反密码子为GGC,它可识别的密码子为和7.遗传密码中第个碱基常很少或不带有遗传信息8.真核细胞多肽合成的起始氨基酸均为,而原核细胞的起始氨基酸应为。
9.蛋白质生物合成是从_____端到______端10.原核生物中的释放因子有三种,其中RF-1识别终止密码子_____________、____________;RF-2识别__________、____________;真核中的释放因子只有___________一种。
判断:1、因为AUG是蛋白质合成的起始密码子,所以甲硫氨酸只存在于蛋白质的N末端()2、原核生物蛋白质合成的起始氨基酸为甲硫氨酸,真核生物蛋白质合成起始氨基酸为甲酰甲硫氨酸()3、核糖体小亚基最基本功能是连接mRNA和tRNA大亚基则催化肽键的形成。
()选择题:1、反密码子中哪个碱基参与了密码子的简并性()A、第一个B、第二个C、第三个D、第一个与第二个E、第二个与第三个2、“同工tRNA”是指()A、识别同义mRNA密码子(具有第三个碱基简并性)的多个tRNAB、识别相同密码子的多个tRNAC、代表相同氨基酸的多个tRNAD、由相同的氨酰tRNA合成酶识别的多个tRNA3、核糖体的E位点是()A、真核mRNA加工位点B、tRNA离开原核生物核糖体的位点C、核糖体中受EcoR限制的位点D、电化学势驱动转运的位点4、蛋白质合成所需的能量来自()A、ATPB、GTPC、ATP和GTPD、CTP5、mRNA的5’-ACG-3’密码子相应的反密码子是()A、5′-UGC-3′B、5′-TGC-3′C、5′-CGU-3 ′D、5 ′ -CGT-3 ′6、在蛋白质合成过程中,下列哪些说法是正确的?()A、氨基酸随机地连接到tRNA上去B、新生肽链从C一端开始合成C、通过核糖核蛋白体的收缩,mRNA不断移动D、合成的肽链通过一个tRNA与核糖核蛋白相连问答题:1、简述遗传密码的性质2、原核生物蛋白质合成的过程3、蛋白质前体加工包括哪些?有一个被认为是mRNA的核苷酸序列,长300个碱基,你怎样才能:1.证明此RNA是mRNA而不是tRNA或rRNA。
氨基酸的活化a.起始信号(AUG-甲硫氨酸密码子)和缬氨酸(GUG)极少出现i.真核生物起始氨基酸—甲硫氨酸,原核生物-甲酰甲硫氨酸ii.SD序列:存在于原核生物起始密码子AUG上游7~12个核苷酸处的一种4~7个核苷酸的保守片段,与16srRNA3’端反向互补。
功能将mRNA的AUG起始密码子置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用。
1)原核生物的SD序列:原核mRNA起始密码子上一段可与核糖体结合的序列。
30s小亚基首先与翻译因子IF-1(与30s结合)和IF-3(稳定小亚基,帮助其与mRNA结合位点的识别)结合,通过SD序列与mRNA模板相结合。
iii.真核生物依赖于结合5'帽,核糖体小亚基沿mRNA5'端帽子结构扫描到RBSiv.在IF2起始因子和GTP的帮助下,fMet-tRNA进入小亚基的P位,tRNA上的反密码子与mRNA密码子配对。
v.小亚基复合物与50s大亚基结合,GTP水解,释放翻译起始因子vi.翻译的起始b.后续氨基酸与核糖体的集合:第二个氨酰-tRNA与EF-Tu.GTP形成复合物,进入核糖体的A位,水解产生GDP并在EF-Ts的作用下释放GDP并使EF-Tu结合另一分子GTP形成新的循环。
i.肽键的生成:AA-tRNA占据A位,fMet-tRNA占据P位,在肽基转移酶的催化下,A位上的AA-tRNA转移到P位,P位上的起始tRNA转移至E位,与fMet-tRNA上的氨基酸生产肽键。
起始RNA随后离开。
ii.移位:核糖体通过EF-G介导的GTP水解所提供的能量向mRNA模板3'末端移动一个密码子,二肽基-tRNA完全进入P位点iii.肽链的延申c.当终止密码子UAA,UAG,UGA出现在核糖体的A位时,没有相应的AA-tRNA能与其结合,而释放因子能识别密码子并与之结合,水解P位上的多肽链与tRNA之间的二酯键,然后新生的肽链释放,核糖体大小亚基解体i.肽链的终止d.N端fMet或Met的切除i.二硫键的形成ii.特定氨基酸的修饰iii.新生肽段非功能片段的切除iv.蛋白质前体的加工e.无义突变:DNA序列中任何导致编码氨基酸的三联密码子突变转变为终止密码子UAA,UGA,UAG中的突变,使得蛋白质合成提前终止,合成无功能或无意义的多肽。
蛋白质的生物合成⎯⎯翻译一切生命现象不能离开蛋白质,由于代谢更新,即使成人亦需不断合成蛋白质(约400g/日)。
蛋白质具有高度特异性。
不同生物,它们的蛋白质互不相同。
所以食物蛋白质不能为人体直接利用,需经消化、分解成氨基酸,吸收后方可用来合成人体蛋白质。
mRNA含有来自DNA的遗传信息,是合成蛋白质的“模板”,各种蛋白质就是以其相应的mRNA为“模板”,用各种氨基酸为原料合成的。
mRNA不同,所合成的蛋白质也就各异。
所以蛋白质生物合成的过程,贯穿了从DNA分子到蛋白质分子之间遗传信息的传递和体现的过程。
mRNA生成后,遗传信息由mRNA传递给新合成的蛋白质,即由核苷酸序列转换为蛋白质的氨基酸序列。
这一过程称为翻译(translation)。
翻译的基本原理见图14-1。
由图14-1可见,mRNA穿过核膜进入胞质后,多个核糖体(亦称核蛋白体,图中为四个)附着其上,形成多核糖体。
作为原料的各种氨基酸在其特异的搬运工具(tRNA)携带下,在多核糖体上以肽键互相结合,生成具有一定氨基酸序列的特定多肽链。
合成后从核糖体释下的多肽链,不一定具有生物学活性。
有的需经一定处理,有的需与其他成分(别的多肽链或糖、脂等)结合才能形成活性蛋白质。
第一节参与蛋白质生物合成的物质参与蛋白质合成的物质,除氨基酸外,还有mRNA(“模板”)、tRNA(“特异的搬运工具”)、核糖体(“装配机”)、有关的酶(氨基酰tRNA合成酶与某些蛋白质因子),以及ATP、GTP等供能物质与必要的无机离子等。
一、mRNA与遗传密码天然蛋白质有1010~1011种,组成蛋白质的氨基酸却只有20种。
这20种氨基1酸排列组合的不同,形成了形形色色的蛋白质。
蛋白质中氨基酸的序列如何决定?(一)三联体密码与密码的简并研究表明,密码子(codon)共有64个,每个密码子是由三个核苷酸(称为三联体,triplet)组成的。
有的氨基酸有多个密码子,这种现象称为简并(degenerate),如UUU和UUC都是苯丙氨酸的密码子,UCU、UCC、UCA、UCG、AGU和AGC都是丝氨酸的密码子,同一氨基酸的不同密码子称为同义词(synonyms)。