植物基因组学(2018版)-蒋立希
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562019.05了数据应用平台,促进了全球水稻基因组研究和水稻分子设计育种水平的提升。
发现稻瘟菌致病性和水稻抗病性新机制 植物保护研究所宁约瑟、刘文德研究团队揭示了植物营养和抗病性间的内在联系,解析了水稻等单子叶植物特异的SD-1类受体激酶在抗稻瘟病过程中的调控机制,对进一步解析水稻的先天免疫分子机制奠定了基础,对创制新的病害防控策略具有重要意义。
家禽疫苗免疫成功阻断人感染H7N9病毒 哈尔滨兽医研究所陈化兰研究团队研发出高效H5/H7二价禽流感灭活疫苗,大量应用后不但有效阻断了H7N9病毒在家禽中的流行,更在阻断人感染H7N9病毒方面取得立竿见影的效果,为从动物源头控制人兽共患传染病提供了重要启示。
多重组学研究揭示番茄育种历史 深圳农业基因组研究所黄三文研究团队整合数百份材料的基因组、转录组、代谢组数据,利用多重组学方法全面揭示了番茄代谢物的育种历史,在多重组学大数据研究方面取得重要突破,为番茄果实风味和营养物质的遗传调控和中国农科院发布“2018年十大科技进展”日前,中国农科院在2019年工作会上发布了“2018年十大科技进展”。
这些科技成果坚持“顶天立地”导向,聚焦年度重大进展,充分体现农业科技国家队的创新水平和产业贡献,其中关键科学问题类4项、重大品种与产品类2项、重大关键技术与装备类4项。
全面解析亚洲栽培稻基因组遗传多样性 作物科学研究所黎志康研究团队完成了3000份亚洲栽培稻基因组变异研究,是目前植物界最大的基因组测序工程,构建了全球首个接近完整、高质量的亚洲栽培稻泛基因组,深入解析了亚洲栽培稻基因组遗传多样性,建立聚焦三农JUJIAOSANNONG编辑:赵昕(zhaoxin@)聚焦农村,探讨农业,关心农民。
全基因组设计育种提供了路线图。
中畜草原白羽肉鸭新品种通过国家审定 北京畜牧兽医研究所侯水生研究团队培育的中畜草原白羽肉鸭新品种获国家畜禽新品种证书,创建的二维码标记与数据处理、胸肌率与皮脂率选种技术等创新性显著,商品代肉鸭出栏量约占全国市场的24%,大幅度提高了肉鸭品种的国产化率。
基于拟南芥的植物基因组学研究植物基因组学是现代植物生物学的一个重要研究领域,旨在通过对植物基因序列进行深入的研究,揭示植物的基因结构、功能和调控等方面的信息。
在过去的几十年里,随着高通量测序技术和计算生物学手段的发展,植物基因组学研究得到了突破性进展。
在这一领域中,拟南芥(Arabidopsis thaliana)成为了最重要的模式植物之一,因为它具有许多优点,如易于培养、基因组序列已经完全解码、遗传和发育研究历史较长等。
下面,我们将结合拟南芥,介绍植物基因组学研究的相关内容。
一、拟南芥基因组的基本特征拟南芥是一种由十字花科植物协会(Brassicaceae)的Arabidopsis属中的一种模式植物。
它的基因组大小为125 Mb,分为5个染色体,包含约3.5万个基因。
拟南芥的保守基因组组成和快速多样化性质,使其成为广泛研究的对象。
与许多其他植物一样,拟南芥也拥有一组水印基因,这些基因对干旱和盐胁迫有强烈的反应。
此外,拟南芥还拥有一些独特的基因,包括“偶极子”基因和“小RNA”基因等。
二、拟南芥基因组的注释和功能研究拟南芥的基因组序列已经解码,但这并不意味着我们对其中所有基因的功能都了解清楚。
为了了解拟南芥的基因组注释和功能,研究人员进行了大量的生物学实验,例如基因敲除、表达分析、蛋白质互作等,以揭示其生化途径、代谢物和调节模式等底层信息。
其中,基因敲除是揭示基因功能最有效的方法之一。
通过利用基因编辑技术(CRISPR/Cas9)以及突变体筛选、生长和发育分析等手段,最近确定了大约6000个在拟南芥发育过程中具有功能的基因。
此外,还确定了几十个与干旱适应相关的盐胁迫反应基因,这些基因在拟南芥中具有重要用途。
三、拟南芥和转录组学除了基因组的研究,转录组学也是研究植物基因组学的重要领域之一。
拟南芥的转录组谱系图是与约40个生长和发育过程相关的转录因子相互作用的结果。
该过程扮演了许多步骤,如开花时间的调节、发育阶段的控制和调节细胞分裂等。
植物基因组学的研究与进展植物基因组学作为现代生物技术领域的一个重要研究方向,致力于通过对植物的基因组进行全面的高通量测序、数据分析和功能研究,揭示植物基因组的结构与功能,为解决人类对食物、能源和生态环境等方面的挑战提供了重要的技术支持。
本文将介绍植物基因组学的研究方法、进展情况及其在实践中的应用。
一、植物基因组学的研究方法1.基因组测序:基因组测序是植物基因组学中最基础、最重要的技术之一,其基本原理是将DNA分子切割成碎片,并通过高通量测序技术对这些碎片进行分析,最终将书写有基因信息的DNA 序列重新汇总成一系列连续、不重叠、具有生物学意义的序列。
常用的测序方法包括第二代测序技术、第三代测序技术和单细胞测序技术等。
2.转录组分析:转录组分析是指通过测量特定组织或细胞中基因转录产物的数量,研究基因在时间和空间上的表达模式及其对不同环境因素的响应,揭示基因及其转录产物的功能以及基因间相互作用关系。
3.蛋白质组学:蛋白质组学研究植物基因组中的蛋白质、酶、信号分子等生物大分子的种类、数量、功能和相互关系,将分子水平的信息转化为物理和生理过程的启示。
4.生物信息学分析:生物信息学技术是在计算机技术基础上,应用于生物学领域的一种新兴的交叉学科。
通过分析DNA、RNA 及其蛋白质产物的序列等信息,对基因组、转录组、蛋白质组数据进行处理和分析,依靠大数据处理和计算机技术的支持,提出合理的数据处理、算法设计和数据挖掘方法,大大提高了数据的解读和解析效率。
二、植物基因组学的进展情况经过20多年的探索和发展,植物基因组学研究已经取得了很多重要进展。
1.植物基因组测序:近年来,针对许多种植物基因组的全基因组测序工作得以完成,如拟南芥、水稻、小麦、玉米、甘蔗等。
同时,预测了数百万个基因、多个基因家族、外显子、翻译启动子、微家族RNA等基因组特征,为探究植物基因功能和进化提供了基础数据。
随着第三代测序技术的发展,高质量、高精度、低成本的基因组测序将成为可能,将推动更多物种的基因组测序工作展开。
植物基因组学研究植物基因组学是研究植物基因组结构、功能及其对生命周期和环境适应性的影响的学科。
它是植物科学及生物技术领域的一个重要分支,在农业、医药和环境领域具有重要的应用价值。
本文将从植物基因组学的研究方法、技术、应用和前景等方面进行探讨。
一、研究方法植物基因组学的研究方法主要包括:基因表达谱分析、基因组重组与转录组分析、基因组结构与功能分析、基因组信息挖掘与分析等。
其中,基因表达谱分析是当前应用最广泛的方法之一。
它是通过高通量测序技术分析大量基因在不同生长发育阶段、环境适应性和生物应激等因素下的表达模式,从而揭示基因调控和功能的复杂性。
二、研究技术植物基因组学的研究技术主要包括:高通量测序技术、基因组编辑技术、基因克隆技术、CRISPR-Cas等。
其中,高通量测序技术是近年来应用最广泛的技术之一。
它是通过对RNA或DNA样本进行定量PCR、芯片技术或测序等方法,获得大量基因信息,从而揭示生物体内基因调控、基因网络和代谢途径的复杂性。
三、研究应用植物基因组学的研究应用非常广泛,涉及农业、医药和环境领域等。
在农业领域,基因编辑技术可以用于对植物基因进行精准编辑,从而提高作物产量、增强病虫害抗性等;在医药领域,植物基因组学研究可以用于发现植物中具有药用价值的化合物,广泛应用于药物研发、治疗和预防疾病等领域;在环境领域,植物基因组学研究可以用于污染物检测、土壤修复、生态环境保护等方面。
四、研究前景随着科技的不断进步和基因组学的发展,植物基因组学将会发挥越来越重要的作用。
在未来,我们将会应用更多的新技术和新方法,从而更好地理解植物基因组结构与功能、基因调控网络及途径,更好地解决农业、医药和环境领域面临的问题。
总之,植物基因组学是一门富有潜力的学科,它的研究将会对我们的生活产生重要影响,从而实现可持续性发展。
植物遗传学探索植物的遗传变异和遗传传递规律植物作为地球上最重要的生物之一,在自然界的存在与繁衍中扮演着至关重要的角色。
植物遗传学是一门研究植物遗传变异和遗传传递规律的学科,通过对植物基因的研究,揭示了植物界丰富多样的遗传特征和变异现象。
一、植物遗传学的背景与定义植物遗传学是遗传学的一个重要分支,它关注植物基因的传递方式、遗传变异和继承规律。
通过对植物群体的调查和植物品种的选育研究,植物遗传学揭示了植物遗传多样性的基础,以及这多样性在种间和种内遗传传递中的规律。
二、植物遗传变异的类型和原因植物遗传变异主要包括基因突变、染色体结构变异和基因组重组。
基因突变是指由于DNA序列发生变化,导致基因产生功能异常或丧失的现象。
染色体结构变异是指染色体上的删除、重排和倒位等结构的变化。
基因组重组是指染色体在减数分裂过程中交换信息,使得基因在后代中重新组合,产生新的遗传组合。
植物遗传变异的原因主要包括自发突变、诱变和自交。
自发突变是指在DNA复制和维持过程中发生的错误和损伤,导致基因发生变异。
诱变是指利用物理或化学方法,人为地诱导植物基因发生突变,以研究基因的功能和变异机制。
自交是指植物自我受精,增加了同一基因型内的基因组组合,进而增加了遗传变异的可能性。
三、植物遗传传递规律的研究方法植物遗传传递规律的研究主要采用遗传分析和分子标记技术。
遗传分析是通过交配试验的结果,确定植物基因在后代中的表现和传递方式,以揭示基因的遗传规律。
分子标记技术基于DNA序列的差异和分布状况,可以精确检测基因型,并了解基因在群体中的传递和变异情况。
四、植物遗传变异与品种改良植物遗传学的研究对于植物品种改良具有重要的指导作用。
通过研究植物的遗传变异和遗传传递规律,可以选择适应环境和农业生产需求的基因型,并利用育种方法将其引入新的品种中。
这种产品的选育方法包括选择育种、杂交育种和转基因等。
五、植物遗传学在生态保护中的应用植物遗传学的研究对于生态保护和环境修复具有重要意义。
2020,42(1)DOI :10.13836/j.jjau.2020006Acta Agriculturae Universitatis Jiangxiensis http ://江西农业大学学报奉新猕猴桃黑斑病病原菌鉴定及室内药剂筛选周英1,李庚花1,胡叶开2,强遥1,张凯东1,赵尚高3,李帮明3,蒋军喜1*(1.江西农业大学农学院,江西南昌330045;2.江西省浮梁县瑶里农技站,江西浮梁333411;3.江西省奉新县农业局,江西奉新330700)摘要:【目的】明确江西省奉新县猕猴桃黑斑病病原菌种类,筛选防治该病害的有效药剂。
【方法】从奉新县果园中随机采集40个呈典型症状的猕猴桃黑斑病病果,采用PDA 培养基按照常规组织分离法对其进行病菌分离和纯化。
从获得的菌株中选择代表性菌株HB-1进行病菌鉴定和药剂筛选。
在测定其致病性的基础上对其培养性状、分生孢子和分生孢子链形态进行观察,并测量其分生孢子大小。
根据菌落形态特征和病菌形态大小,参考相关文献,对病原菌进行种类归属鉴定。
提取菌株HB-1基因组DNA ,对其rDNA-ITS 和EF-1α基因进行PCR 扩增和序列测定,根据序列同源性大小对病原菌进行分子鉴定。
采用菌丝生长速率法测定22种杀菌剂对该病菌的室内抑菌活性。
【结果】共分离获得35个培养性状一致的真菌菌株,供试菌株HB-1具有致病性,其菌落绒状,正面墨绿色,背面淡绿色。
菌株产生卵形或倒棍棒形,具2~5个横隔膜和1~3个纵、斜隔膜、大小(15~50)μm×(7.5~12.5)μm 的分生孢子。
分生孢子链状着生并有分支,支链一般长1~5个孢子,最长也未达到10个孢子。
上述培养性状和形态特征符合文献中对链格孢(Alternaria alternata )的描述。
该菌株的rDNA-ITS 和EF-1α基因序列长度分别为531bp 和240bp ,与GenBank 中链格孢(A.alternata )的序列同源性为100%。
“第十八届全国植物基因组学大会”在兰州召开
佚名
【期刊名称】《宁夏农林科技》
【年(卷),期】2017(58)8
【摘要】2017年8月20~22日,宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所相关科研人员参加了在兰州举办的"第十八届全国植物基因组学大会"。
此次大会由中国遗传学会植物遗传与基因组学专业委员会主办、中国科学院遗传与发育生物学研究所和兰州大学共同承办,来自国内92个单位的600余名代表参加了大会.
【总页数】1页(P30-30)
【关键词】植物基因组学;中国遗传学会;宁夏农林科学院;工程技术研究所;科研人员;Genomics;安黎哲;国内专家;生命科学;基因组研究
【正文语种】中文
【中图分类】Q943.2
【相关文献】
1.第十八届全国青少年科技创新大赛在兰州举行/八十五团投资230万元加大博乐河治理/新疆育出国内首批超细毛羊/兵团技术市场协会成立大会暨第一届会员代表大会召开 [J], 刘爱喜;阎常;冯泽山;乔同勋
2.第十八届全国植物基因组学大会召开 [J], ;
3.第十九届全国植物基因组学大会成功召开 [J],
4.第八届全国植物基因组学大会2007年8月18—20日在上海召开 [J],
5.第十四届全国植物基因组学大会将在南京召开 [J],
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食品科技组学分析技术在新疆食用菌中的研究进展刘璐萍1,徐 恒1,姜露熙1,郭志远2,裴龙英1*(1.新疆理工学院 新疆黑木耳工程技术研究中心,新疆阿克苏 843000;2.塔里木大学 食品科学与工程学院,新疆阿拉尔 843300)摘 要:组学分析技术主要用于分析生物体在内外环境影响下蛋白、基因及其他小分子物质的变化规律。
目前,组学技术已发展为微生物学、植物学、食品安全学实验研究的主要技术。
本文通过收集整理相关研究资料,综述组学分析技术在新疆食用菌中的研究进展,为进一步了解新疆食用菌分子学机理、开展相关研究提供参考。
关键词:组学分析技术;新疆食用菌;研究进展Research Progress of Omics Analysis Technology in EdibleFungi in XinjiangLIU Luping1, XU Heng1, JIANG Luxi1, GUO Zhiyuan2, PEI Longying1*(1.Engineering Technology Research Center of Xinjiang Black Fungus, Xinjiang Institute of Technology, Akesu 843000, China; 2.School of Food Science and Engineering, Tarim University, Alaer 843300, China) Abstract: Omics analysis technology is mainly used to analyze the changes of proteins, genes and other small molecules of organisms under the influence of internal and external environment. At present, omics analysis technology has developed into the main technology of microbiology, botany and food safety experimental research. By collecting and sorting out relevant research data, this paper summarizes the research progress of omics analysis technology in edible fungi in Xinjiang, so as to provide reference for further understanding the molecular mechanism of edible fungi in Xinjiang and carrying out relevant research.Keywords: omics analysis technology; edible fungi in Xinjiang; research progress组学分析技术是多种生物组学分析技术的总称,包括蛋白组分析技术、转录组分析技术、基因组分析技术和生物小分子代谢组分析技术等,对了解生物体蛋白、基因、小分子变化特征具有重要意义,如今已在食品生物研究中广泛应用,并用于指导生物栽培。
生物镁离子转运体研究进展丛悦玺;骆东峰;陈坤明;蒋立希;郭万里【期刊名称】《农业生物技术学报》【年(卷),期】2012(20)7【摘要】镁(magnesium)是生物生长发育必需的核心营养元素之一,也是细胞中含量最多的两价阳离子.镁具有最大的水合半径,最小的离子半径和最大的电荷密度,特殊的理化性质使其在生物体内的转运方式显得尤为重要.以前的研究大多集中在物化结构,生理功能,缺镁病理等方面,并在光合作用,酶的活化,基因组稳定,抑制衰老,减轻铝害和调节氮代谢等研究方面取得了一定的成就,但Mg2+转运蛋白的晶体结构,Mg2+吸收、转运和体内平衡的分子机理,Mg2+胁迫信号的传导机制等信息仍知之甚少.人们已经从许多生物中克隆了Mg2+转运相关基因,包括原核生物、低等真核生物、高等真核生物,并对其结构、功能、亚细胞定位进行了分析验证.根据已知镁离子运输体的不同结构或功能,把它们分为6个不同的家族:钴抗性蛋白家族(CorA),Mg2+/H+交换体(AtMHX),离子通道,P型磷酸酶(P-type phosphatase),Mg2+转运体基因家族MgtE(MgtE)和其它镁离子运输家族.同一家族的不同成员之间存在结构或功能的相似性,其中,CorA家族的镁离子运输体是最基本、研究最深入的运输体,它们广泛的存在于细菌,酵母菌,动物和植物中,能调节镁离子的吸收和外排.本文对已发现的各种Mg2+转运体的结构功能特点进行了综述,以期为该领域的研究提供一些有益的参考.%Magnesium is the most abundant divalent cation in cells and acts as a critical role in organism growth and development. It has the largest hydrated radius, the smallest ionic radius, and the highest charge density. It is very important for organism totransport magnesium within or among cells because of its specially chemical and physical characteristics. Previous research focused on structural features, physiological function and pathology of magnesium deficiency, and have made great progress in photosynthesis, activating enzymes, stabilizing genomic, inhibiting aging, alleviating Al toxicity and adjusting N metabolism. Our understanding of magnesium crystal structure, signaling of magnesium stress and cellular homeostasis is still in its infancy. Some magnesium transporters have been cloned from organism, such as prokaryote, yeast, mammal and plant, also analyzed the structure, function and subcelluar localization of this magnesium transporters. According to the different structure or function of this magnesium transports, they are divided into six disparate family: Cobalt resistance A (Cor A), Arabidopsis thaliana magnesium-proton exchanger (AtMHX), cation channal, P-type ATPase, magnesium transport E (MgtE) family and other magnesium transports. The structure or function of different members which belong to the same family appears to be closely related. The CorA family is the most extensively studied magnesium transport system, and appears to be the primary magnesium transport system, which exists widely in fungi, bacteria, animals and plants with effectively mediating both influx and efflux of magnesium. This paper reviews the research progress of those magnesium transporter systems, and aims to provide some useful references for the later research.【总页数】12页(P837-848)【作者】丛悦玺;骆东峰;陈坤明;蒋立希;郭万里【作者单位】浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所,杭州310058;浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所,杭州310058;西北农林科技大学生命科学学院,杨凌712100;浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所,杭州310058;浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所,杭州310058【正文语种】中文【相关文献】1.成年SD大鼠肾脏中6种镁离子转运体的表达 [J], 滕飞翔;凌存保2.高盐饮食对更年期焦虑小鼠海马钾离子-氯离子共转运体2、钠-钾-氯离子失转运体1表达的影响 [J], 秦莉花;李晟;叶丽芝;黄宽;陈晓阳3.去铁酮与人有机阳离子转运体及有机阴离子转运体1体外相互作用研究 [J], 孔思思;涂美娟;杨希;赵垒;周慧;曾苏;蒋惠娣4.有机阳离子转运体3(OCT3)的生物学特点及其相关神经精神疾病中的作用 [J], 韩思达5.钾离子和镁离子在畜禽上的生物学作用及研究进展 [J], 刘伟;解庆柱;刘晓辉;廖玉雪;崔丽敏因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。