化合物脂水分配系数计算软件及比较研究

化工工艺设计涉及大量的计算，主要的有工艺流程的模拟，管道水力学计算，公用工程管网计算，换热器设计计算，容器尺寸计算，转动设备的计算和选型，安全阀泄放量和所需口径的计算，火炬泄放系统，控制阀Cv计算和选型，等等。

这些计算过程通常都有专用的商业软件或者是工程公司自行开发的软件或者计算表格。

大的设计公司通常也会指定公司用于以上设计过程的软件或经过确认的表格。

下面就我的经验来看看常用的一些软件。

1. 工艺流程模拟：∙ASPEN Plus∙Pro II∙HYSYS2. 管道水力学计算：∙通常是工程公司自备的EXCEL表格，没必要使用专用软件。

当然，也可以自己编制，一般来说使用CRANE手册提供的公式就足够了。

∙两相流的水力学计算相当复杂，自己编制费力不讨好，用公司内部经过验证的表格就可以了。

3. 公用工程管网计算∙我用过Pipe 2000，肯塔基大学教授的出品，包括Gas 2000, Water 2000, Steam 2000等一系列。

∙Pipenet也是不错的选择。

∙有人用SimSCI的InPlant。

没用过，有用过的朋友可以介绍一下。

4. 换热器设计计算∙HTRI∙HTFS∙这两个软件都可以。

常见的介质用HTRI更好，因为它的物性数据是经过实验得到的。

HTFS使用了ASPEN或HYSYS的物性数据，很多都是计算得到的，所以精度可能稍差。

5. 压力容器尺寸计算（长度与内径）∙工程公司往往使用自制的EXCEL表格来计算容器尺寸。

内构件一般要提交供货商来设计。

∙计算容器尺寸首先要确定容器的用途：气液分离，液液分离，还是气液液三相分离。

然后要确定容器是卧式还是立式。

最后要根据物料属性，考虑是否使用Wire Mesh或其他内构件来除去微小雾滴。

以上三项是影响计算的主要因素。

6. 塔设备计算∙塔设备的计算和内构件的计算通常要由主要的供货商来进行。

软件比如说Koch-Glitsch的KG-Tower和Sulzer 的SULCOL。

分子模拟软件简介3D分子图形显示工具 (RasMol and OpenRasMol)(免费)AMBER (分子力学力场模拟程序)autodock (分子对接软件)(免费)GROMACS (分子动力学软件)(免费)GULP (General Utility Lattice Program)(免费)NIH分子模拟中心的化学软件资源导航(Research Tools on the Web) X-PLOR (大分子X光晶体衍射、核磁共振NMR的3D结构解析)(免费)高通量筛选软件PowerMV (统计分析、分子显示、相似性搜索等)(免费)化合物活性预测程序PASS(部分免费)计算材料科学MathubC4：Cabrillo学院化学可视化项目以及相关软件(免费)Databases and Tools for 3-D Protein Structure Comparison and Alignment(三维蛋白质结构对比)(免费)Democritus (分子动力学原理演示软件)DPD应用软件cerius2(免费)EMSL Computational Results DataBase (CRDB)MARVIN'S PROGRAM (表面与界面模拟)(免费)XLOGP(计算有机小分子的脂水分配系数)(免费)量子化学软件中文网美国斯克利普斯研究院：金属蛋白质结构和设计项目(免费) /doc/1f7136708.html,/(免费)3D Molecular Designs (蛋白质及其他3D分子物理模型快速成型技术)3D-Dock Suite Incorporating FTDock, RPScore and MultiDock (3D分子对接)(免费)AMSOL (半经验量子化学计算)(免费)Amsterdam Density Functional (ADF, 第一原理电子结构计算) Bilbao晶体学服务器(免费)BOSS (蒙特卡罗模拟软件)CADPAC (剑桥量子化学计算软件)(免费)Car-Parrinello分子动力学(CPMD, ab-initio分子动力学计算软件)(免费)CHARMM (大分子分子力学模拟计算软件)(部分免费)Chem2Pac package (A computational Chemistry Integrator)(免费) ChemTK Lite (QSAR软件)(免费)Chemweb计算化学在线工具：GAMESS(免费)Clebsch-O-Matic (在线计算器)(免费)Collaborative Computational Projects (协同计算计划) COLUMBUS (量化从头计算分子电子结构程序集)(免费) CrystalMaker Software (晶体结构可视化软件)DL_POLY (分子动力学模拟软件)(免费)DockVision (分子对接程序)(部分免费)DPMTA (分子动力学并行模拟软件)(免费)Dr. Pablo Wessig 研究小组开发的计算化学软件(免费)eHiTS: Electronic High Throughput ScreeningEMSL Gaussian Basis Set Order Form(免费)GAMESS-UK (分子电子结构计算软件)GAMESS: The General Atomic and Molecular Electronic Structure System(免费)Genebrowser (生物技术、基因治疗资源导航)Glide (分子对接程序)GROMOS (通用分子动力学软件包)(部分免费)HyperChem (分子模拟)Interprobe Chemical Services (分子模型化软件)Jmol (分子可视化软件)(免费)List of Computationally Sick Species (ab initio计算出现问题的物质、方法)MacroModel (分子力学计算程序)MARDIGRAS和CORMA (弛豫矩阵分析)(免费)MCPRO (用于蛋白质和核酸的蒙特卡罗模拟软件)MDRANGE (分子动力学计算ion ranges)(免费)MDynaMix (分子动力学计算软件)(免费)MidasPlus (分子建模软件, 美国加利福尼亚大学旧金山分校计算机图形实验室开发)MOE(分子模拟应用环境、方法开发平台)MOLMOL (生物大分子3D结构分析和显示、NMR结构解析)(免费) MolPOV 2.0.8 (一个将PDB文件转为POV-Ray文件的软件)(免费) MOLPRO 量子化学软件包(用量化从头方法计算分子电子结构)(免费) Mopac 2002 (通用半经验量子力学程序)NAMD (并行分子动力学计算软件)(免费)Norgwyn Montgomery (化学软件公司)NWChem (计算化学软件包)OpenEye (快速计算分子的静电性质、形状)ORAC (用于模拟溶剂化生物分子的分子动力学计算程序, 意大利佛罗伦萨大学)(免费)ORTEP-III (美国橡树岭国家实验室晶体结构可视化--热椭圆体绘图程序)(免费)OSIRIS Property Explorer (LogP, 溶解度、成药可能性预测)(免费) PAPA (计算粒状物料的三维并行分子动力学计算程序)(免费) PETRA (反应性参数预测，包括生成焓、键离解能等)(部分免费) PharmTree (3D药效团生成和化合物分类)Pipeline Pilot (药物发现集成平台)PMDS (并行分子动力学模板库)(免费)PreADMET (ADMET预测)Protein Domain Motion Analysis Software: DynDom （蛋白质分析软件）(免费)ProtoMol (分子动力学并行计算软件)(免费)PSI3量子化学软件包(量化从头计算)(免费)Q-Chem (量子化学计算软件包)SGI应用于化学、生物信息学的软件、硬件产品SIGMA (分子动力学相关软件)SimBioSys (药物设计软件SPROUT)SMILECAS 数据库 (描述分子结构、子结构和复合结构的线性编码系统)SURFNET (量子化学计算程序)(免费)Sweet (依据标准命名方法和分子顺序建立糖类三维模型)Swiss PDB Viewer (PDB蛋白质结构可视化软件)SYBYL/Base(分子模拟和药物发现平台)TINKER (分子设计软件)(免费)UCSF Chimera (可扩展的, 交互式分子图形程序)(免费)VAMP/VASP (采用从头计算量子力学的分子力学)(免费)VHMPT (螺旋膜蛋白拓扑结构显示与编辑程序)(免费)Virtual Molecular Dynamics Laboratory (分子动力学软件)(免费) voidoo(空腔探测软件)(免费)WAM: Web Antibody Modeling (抗体模型构建)(部分免费) WebMO (基于3W界面的计算化学软件包)(免费)并行分子动力学模拟软件DoD-TBMD(免费)大分子对接程序Hex(免费)大规模原子(分子)并行模拟器 LAMMPS(免费)单晶和粉末衍射合作计算项目开发的免费软件(CCP14)(免费)蛋白质分子动力学模拟软件：CONCOORD(免费)蛋白质模拟资源导航，美国橡树岭国家实验室ORNL分子的物理化学性质在线计算(用在基于结构的药物设计, 可计算logP, PSA,等)(免费)化合物3D结构VRML文件的自动生成(免费)化学中的常用计算机软件与资源(免费)化学资源工具箱(免费)计算机模拟的分子运动图像集(DSMM)(免费)可下载的教学软件(伦敦大学玛丽女王学院化学系提供)(免费)量子化学网美国华盛顿州立大学化学系：无机化学教学资源美国加州大学圣地亚哥分校所开发的化学软件(化学反应计算、分子建模和可视化)美国康奈尔大学理论中心计算生物服务单元提供的免费软件(计算生物与化学方面)(免费)美国马里兰大学：生物技术研究所Gilson研究小组美国能源部Ames实验室：经典分子动力学软件AL_CMD(免费) 免费远程计算：贵州大学GHPCC量子化学从头计算系统(免费)模拟蛋白质的并行分子动力学计算程序EGO(免费)牛津大学：抗癌药物分布式计算项目 Screensaver Lifesaver欧洲科学基金资助项目：分子模拟所面临的挑战(Simu: Challenges in Molecular Simulations)生物大分子结构分析和确认系列软件(美国加州大学圣地亚哥分校大分子结构计算研究中心开发)(免费)牙买加西印度大学Mona分校化学系所开发的免费软件(免费)应用于双原子分子的数值Hartree-Fock程序(免费)原子轨道3维模拟演示。

有机化合物脂水分配系数logP的计算有机化合物脂水分配系数（logP）是指化合物在油相（有机相）和水相中的分配比例的对数值，它是一种用来描述化合物亲水性和疏水性的重要参数。

logP的计算对于新药物的研发和环境领域的研究都具有重要意义。

logP的计算方法有多种，其中常用的包括计算化合物结构中各原子对logP的贡献值，再通过累加得到整个分子的logP值；另一种是利用分子对比法，通过参考物质的logP值对待测物质的logP进行预测。

无论采用哪种方法，logP的计算都需要考虑诸多因素，如局部结构、极性、分子尺寸等。

logP对于化合物的性质和应用具有重要影响。

较高的logP值往往代表了化合物的疏水性较强，这类化合物更容易溶解于有机溶剂中。

在药物领域中，药物的ADME（吸收、分布、代谢、排泄）性质的研究中，logP值对于药物的溶解性和渗透性有着重要的指导作用。

另外，logP值还可以用来评价化合物在环境中的迁移和生物富集情况，对于环境监测和环境保护有着重要的意义。

个人观点上，logP的计算对于有机化合物的研究和应用至关重要。

良好的logP预测模型不仅可以帮助我们更好地理解分子结构与性质之间的关系，更可以为药物设计和环境保护提供有力的支持。

在未来，我相信logP的计算方法会更加精确和高效，为化学和生物领域的发展贡献更多的力量。

总结了对有机化合物脂水分配系数logP的计算、作用及展望之后，我们可以更全面地认识到logP这一重要参数的重要性。

通过对logP的深入理解，可以帮助我们更好地利用这一参数，推动有机化合物的研究和应用。

logP值是指化合物在油相（有机相）和水相中的分配比例的对数值，它是描述化合物亲水性和疏水性的重要参数。

logP的计算方法有多种，其中常用的包括计算化合物结构中各原子对logP的贡献值，再通过累加得到整个分子的logP值；另一种是利用分子对比法，通过参考物质的logP值对待测物质的logP进行预测。

LogP,LogD对有机化合物的QSAR的研究摘要：自从20世纪60年代QSAR/QSPR研究兴起以来, 人们研究有机化合物的脂水分配系数和溶解度的计算方法已经有近半个世纪. 目前存在众多方法用于计算有机化合物的脂水分配系数和溶解度. 相对而言, 脂水分配系数的计算方法更为成熟一些, 应用范围更广, 效果也更好.关键词：脂水分配系数; logP/logD; QSAR1.基本概念1.1 脂水分配系数的定义有机化合物的脂水分配系数(P)通常是指化合物在正辛醇和水两相间的分配系数, 以其对数值来表示其大小，标记为其中Coct 和Cw分别为化合物在正辛醇和水两相间达到平衡时的浓度. logP在许多QSAR研究中都是用于衡量有机化合物疏水性的重要参数. 当今各大制药公司都已经将logP列为活性化合物必测的标准参数之一. 通常P给出的是中性化合物在两相间的分配系数. 对于可电离的化合物, 情况则变得相当复杂, 这时使用分配率D(distributionrate)来表示溶质在两相间总的分配系数. 例如, 对于可电离的溶质HA可有:其中[HA], [A-]分别代表溶质的中性状态和离子状态的浓度. D是与溶质的酸碱解离常数pKa 以及溶液的pH值相关的参数. 假设溶质HA 是仅在水相电离的一元酸, 则有:然而, 如果溶质分子含有不止一个电离中心而且在正辛醇相中也是可以电离的, 此时溶质在溶液中的存在形式就变得相当复杂, 像公式(4)这样的简单关系就已经不再成立. 对于含多个可电离基团的复杂溶质分子, D的具体表达式可描述为:这里表示溶质在溶液中的第i 种离子形式, 根据电离平衡关系, 其在两相间的浓度与溶液pH值以及可电离基团的pKa 都密切相关.1.2、QSAR研究的兴起有机化合物的定量结构一活性相关(Quantitative Structure—Activity Relationship)最初是作为定量药物设计的一个研究分支领域而发展起来的。

LogP的名词解释在药物研发和环境科学等领域，LogP是一个重要的概念和工具。

LogP是脂水分配系数的对数值，用于表示化合物在脂肪和水之间的分配性质。

本文将对LogP 进行详细解释，并探讨其在科学研究中的应用。

1. LogP的定义及原理LogP是脂水分配系数（Partition co-efficient）的对数值。

脂水分配系数是指溶质在有机溶剂（如脂肪）和水溶液之间的平衡分配情况。

LogP由以下公式表示：LogP = log（Co / Cw）其中，Co是化合物在有机溶剂中的浓度，Cw是化合物在水溶液中的浓度。

LogP的数值越大，表示化合物在脂肪相中的溶解度越高，而在水相中的溶解度较低。

这是因为脂肪相中通常存在较多的疏水性分子，而水相则富含极性分子。

LogP能够量化化合物在两相之间的分配行为，是评估化合物亲水性和脂溶性的重要指标。

2. LogP在药物研发中的应用LogP在药物研发中具有重要的应用价值。

首先，药物的脂水分配性质直接影响药物在生物体内的吸收、分布和代谢等过程。

通过计算和预测药物的LogP值，研究人员能够评估药物分子跨过生物膜的能力，从而优化药物的吸收性能。

其次，LogP也与药物的毒性和代谢相关。

脂溶性药物往往更容易存留在生物体中，累积于脂肪组织中，而极性药物则更容易被肾脏排泄。

因此，合理设计药物的LogP值能够帮助预测和优化药物的毒性和代谢途径。

此外，药物的血浆蛋白结合率也与LogP密切相关。

药物通常与血浆蛋白结合形成药物-蛋白复合物，这会影响药物的药效和分布。

LogP可以作为预测药物与血浆蛋白结合之间的关系的指标，有助于药物分子的设计和优化。

3. LogP在环境科学中的应用除了药物研发，LogP也在环境科学中起着重要的作用。

环境中的有机污染物常常具有一定的脂溶性，这使得它们倾向于在沉积物、植物和动物组织中富集。

通过测定物质的LogP值，科学家可以预测和评估其在环境中的迁移、转化和生态毒性等行为。

脂肪胺类化合物脂水分配系数的qspr研究新一代中离子液体的发展和应用，加上改变的分子计算和原子力学以及更好的实验方法，使得脂肪胺化合物的研究受到了一定程度的重视。

QSPR研究（Quantitative Structure-Property Relationship）研究是一种用于预测某种性质或反应而开展的理论研究，它是“以分子结构为基础建立定量性质与分子结构之间的关系”技术的总称。

因此，研究脂肪胺类化合物的脂水分配系数的QSPR研究成为了当前极具研究潜力的一种研究方式。

一、什么是脂肪胺类化合物的脂水分配系数？脂肪胺类化合物的脂水分配系数（Log P）是指一种特定化合物在水和有机溶剂中的分配系数，它表示了化合物在水和有机溶剂之间的相互分配比例。

脂肪胺类化合物的Log P值可以用来预测它们在水和有机溶剂中的物化性质，如融解性、溶解度以及溶解率，从而指导反应研究的选择。

二、QSPR研究的基本原理QSPR研究的基本原理是利用关联模型将化合物的分子结构特征与它们的某种性质建立联系。

在脂肪胺类化合物的Log P研究中，一般会将化合物的结构特征和它们的Log P值构建到一个向量空间中，然后借助多元回归分析或者神经网络模型对该模型进行拟合，从而得到更精确的Log P值预测结果。

三、QSPR研究的方法1.验数据收集：在实际应用中，脂肪胺类化合物的Log P研究一般需要大量的实验数据，以便构建拟合模型，因此，实验数据的收集是QSPR研究的重要一步。

有很多种方法可以用来收集实验数据，比如利用极化差热计测定法（PDC）、溶解度分析仪测定方法等。

2.征提取：分子结构特征是QSPR研究的基础，因此在将化合物的模型映射到向量空间之前，要提取分子结构特征，比如分子量、碳原子数、氢原子数等，然后将其映射到一个向量空间中，这样才能获得更准确的Log P研究结果。

3.型构建：一般情况下，QSPR研究会借助多元回归分析或者神经网络模型来构建模型，同时也需要一些特定的模型参数来说明模型的参数，以便调整拟合结果。

吡唑并[1 5-a]嘧啶酮类M通道开放剂脂水分配系数的测定及计算目的计算并测定吡唑并[1,5-a]嘧啶酮类（PPOs）化合物QO-58，QO-58-L及QO-58-Cl的脂水分配系数，并比较两者的相符程度。

方法摇瓶法（正辛醇/水）处理样品，水相用C18固相萃取小柱浓缩，高效液相色谱外标法测定QO-58，QO-58-L和QO-58-Cl水相和油相中的浓度，并分别计算其脂水分配系数（log P）。

结果QO-58的logP=2.43，QO-58-L的logP=1.07，QO-58-Cl的logP=5.50。

结论PPOs结构修饰后的脂水分配系数发生了较大改变，与计算结果趋势相符。

标签：高效液相色谱法；QO-58；QO-58-L；QO-58-Cl；脂水分配系数Detection and Calculation for Lipohilicity ( Log P ) of PPOs compound M Channel OpenersLI Rui-hong1,SHEN Li-ru2,QI Jin-long3(1.Department of Pharmacy ,Children’s Hospital of H ebei Province,Shijiazhuang 050031,Hebei,China;2.Tangshan City Food and Drug Inspection Center,Tangshan 063000,Hebei,China;3.Department of Pharmacology,Hebei Medical University,Shijiazhuang 050071,Hebei,China)Abstract：ObjectiveTo calculate and detect the lipohilicity ( Log P ) of PPOs compound, including QO-58, QO-58-L, QO-58-Cl as M channel openers, and to compare the conformity of two results.MethodsDetermined by high performance liquid chromatography, the peak area of QO-58, QO-58-L and QO-58-Cl can infer their lipid-water partition coefficient ( octanol / water ). The fixed phase is Spherisorb C18 ( 34/118 ) 10L 4.6 ×250 mm reverse column, and the mobile phases are acetonitrile-0.2mol/L ammonium acetate ( 57:43, QO-58 ), acetonitrile-0.2mol/L ammonium acetate ( 57:43, QO-58-L ), methanol-0.2mol/L ammonium acetate ( 85:15, QO-58-Cl ).ResultsQO-58 log P=2.43, QO-58-L log P=1.07, QO-58-Cl log P=5.50.ConclusionAfter structural modification, the lipid-water partition coefficient of PPOs will change. Software verifies its trend correct.Key words：HPLC; QO-58; QO-58-L; QO-58-Cl; log PM通道是一种电压依赖性非失活的钾离子通道，属于KCNQ家族。

脂水分配系数名词解释
脂水分配系数（Partition coefficient）是指描述化学物质在两个不相溶的相（通常是有机溶剂和水）之间分配行为的一个参数。

它是衡量化合物相对亲水性和亲油性的指标。

脂水分配系数的定义如下：
脂水分配系数 = 有机溶剂中的浓度 / 水中的浓度
脂水分配系数的数值范围从0到无穷大，可以衡量一个化合物在有机溶剂和水相中相对富集的程度。

脂水分配系数较大的化合物更易溶于有机溶剂，而较小的化合物更倾向于溶于水。

脂水分配系数主要用于描述某个物质在药物代谢、毒理学、环境科学等领域中的分布和转移行为。

它在药物研发过程中可以用于评估药物吸收、分布、代谢和排泄的性质，以及药物在不同体内组织之间的平衡情况。

在毒理学研究中，脂水分配系数可以用于预测化学物质在生物体内的积累和毒性效应。

在环境科学研究中，脂水分配系数可以用于评估化学物质在土壤和水体之间的迁移和分布情况。

脂水分配系数的测定可以通过传统的溶解度实验、液相色谱和气相色谱等分析方法来进行。

此外，还可以利用计算机模拟和模型推测等方法来预测和估算脂水分配系数的数值。

总之，脂水分配系数是描述化合物在有机溶剂和水相之间分配行为的重要参数。

它在药物代谢、毒理学、环境科学等领域中
具有广泛的应用价值，对于理解化学物质的分布和转移行为，以及评估其药理和毒理效应具有重要意义。

脂水分配系数（lipid-water partition coefficient）是化合物在脂相和水相间达到热力学平衡时的浓度比值，通常是以化合物在有机相中的浓度为分子，在水相中的浓度为分母。

脂水分配系数越大，越易溶于脂，反之则越易溶于水。

此外，脂水分配系数特别是溶质在正辛醇-水体系中的分配系数被广泛用来进行疏水性的衡量。

脂水分配系数（logPo/w）被定义为：logPo/w=logCo/Cw，其中Co表示溶质在油相的平衡浓度，Cw表示溶质在水相的平衡浓度。

logPo/w数值的大小表示溶质疏水性的大小，logPo/w越大，疏水性越强，反之则亲水性越强。

脂水分配系数的计算方法有多种，其中一种常用的方法是利用脂水分配系数的公式：P = (C_w / C_f) * (1 / (1 - y))，其中P表示脂水分配系数，C_w和C_f分别表示化合物在纯水和纯脂相中的浓度，y表示脂相的体积百分比。

此外，也有通过实验方法测定化合物的脂水分配系数。

通常是将化合物在不同浓度的有机溶剂和水中进行分配实验，通过测定分配平衡时有机溶剂和水中化合物的浓度，计算出分配系数。

logp 分配系数
logP分配系数是一种用来描述化合物亲水性/疏水性的参数。

它通常被用于药物设计和环境化学领域。

logP的计算是基于化合物
在油相和水相中的分配系数，它是油相中的浓度与水相中的浓度的
比值的对数。

logP分配系数可以用来预测化合物在生物体内的吸收、分布、代谢和排泄的性质，因此在药物研发中具有重要意义。

另外，logP也可以用来评估化合物在环境中的生物富集性和毒性。

logP分配系数的计算可以使用实验测定或计算机模拟。

实验测
定通常包括油水分配实验或高效液相色谱法等，而计算机模拟则可
以利用分子模拟软件进行。

常见的计算logP的方法包括基于化学结
构的方法（比如ClogP、XlogP等）和基于物理化学性质的方法（比
如计算溶解度后再转化为logP）。

这些方法都有其适用的范围和局
限性，因此在使用时需要根据具体情况选择合适的方法。

在药物设计中，logP分配系数可以帮助研究人员优化化合物的
药代动力学性质，比如增加口服生物利用度或减少代谢率。

在环境
化学领域，logP分配系数可以用来评估化合物在环境中的行为，比
如迁移性和生物富集性。

总之，logP分配系数是一个重要的化学参数，对于药物设计和环境化学研究都具有重要的应用意义。

通过对logP的合理计算和应用，可以更好地理解化合物的性质和行为，为相关领域的研究提供有益的信息。

计算有机化合物脂水平分配系数的新方法王任小;傅瑛【期刊名称】《物理化学学报》【年(卷),期】1997(013)001【摘要】A new lnethod is presented for the calculation of octanol/water partition coefficients.On the basis of summation of atomic contributions, our algorithm, namely;XLOGP, also incorporate correction factors into the calculation. Multivarlate regression aIlalysis was performed on a traming database of 1831 organic compounds with diverse structures to give the final model. The correlation coefficients for the whole set fitting is 0.968 and the standard deviation is O.37. The result sllows that our model is accturate enough for logP estmimation in QSAR studies. Compared to other similar approashes, our method gives better results and is more convenient to use.【总页数】4页(P1-4)【作者】王任小;傅瑛【作者单位】北京大学物理化学研究所;北京大学物理化学研究所【正文语种】中文【中图分类】O621.2【相关文献】1.小分子脂水分配系数最优值的计算机模拟 [J], 高军晖;刘飞;吴桂强2.有机化合物脂水分配系数和溶解度的计算方法 [J], 王艳玲;李婕;王任小3.有机化合物脂水分配系数LogP的计算 [J], 来鲁华;王任小4.吡唑并[1,5-a]嘧啶酮类M通道开放剂脂水分配系数的测定及计算 [J], 李瑞宏;沈立茹;祁金龙5.化合物脂水分配系数计算软件及比较研究 [J], 苏笠;杨劲;王友群;王广基因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

有机化合物脂水分配系数和溶解度的计算方法
王艳玲;李婕;王任小
【期刊名称】《物理化学学报》
【年(卷),期】2010(026)007
【摘要】有机化合物的脂水分配系数和溶解度在药物化学以及环境化学的研究中是十分重要的物理化学性质,在许多涉及有机化合物在生物体内的吸收、转运、代谢以及在环境中迁移等过程的定量构效关系研究(QSAR)中发挥着不可替代的作用.目前在实践中应用较多的计算有机化合物脂水分配系数和溶解度的理论方法主要有片段加合法和基于描述符的方法.本文总结了这两大类方法的优缺点以及在该领域中未来可能的发展方向.
【总页数】13页(P1742-1754)
【作者】王艳玲;李婕;王任小
【作者单位】中国科学院上海有机化学研究所,生命有机化学国家重点实验室,上海,200032;中国科学院上海有机化学研究所,生命有机化学国家重点实验室,上海,200032;中国科学院上海有机化学研究所,生命有机化学国家重点实验室,上海,200032
【正文语种】中文
【中图分类】O642
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化合物ob值计算随着计算机技术的发展，计算化学在药物研究中的应用越来越广泛。

其中，化合物的OB值（Oral Bioavailability）是一项重要的计算指标。

OB值可以用来评估化合物在口服后被吸收的能力，是评估药物口服生物利用度的重要参考指标。

本文将从化合物OB值的计算方法、OB值与药物研究的关系以及OB值的应用等方面进行介绍。

一、OB值的计算方法OB值的计算是基于分子描述符的，描述符可以反映化合物的化学结构和性质。

常用的分子描述符有分子量、荷电性、溶解度、脂水分配系数等。

其中，脂水分配系数（logP）是OB值的主要描述符。

logP是化合物在水和油中分配的平衡常数的对数值，可以反映化合物在生物体内的脂溶性和亲水性。

一般来说，OB值越高，说明化合物越容易被生物体内的水溶液吸收，因此有更好的口服生物利用度。

二、OB值与药物研究的关系OB值是评估药物口服生物利用度的重要参考指标。

药物的OB值越高，说明药物在人体内的吸收能力越强，口服后的生物利用度也越高。

因此，OB值是药物设计和筛选过程中的重要指标。

研究表明，OB值与药物的药效、毒性、代谢、排泄等方面有着密切的关联。

药物研究人员可以通过OB值来预测药物的口服生物利用度，从而更好地设计和开发新的药物。

三、OB值的应用OB值在药物研究中有着广泛的应用。

首先，OB值可以用于药物设计和筛选过程中的药物分子优化。

药物研究人员可以通过计算化合物OB值来预测其口服生物利用度，从而进行合理的化合物设计和筛选。

其次，OB值还可以用于药物代谢和毒性的预测。

药物的OB 值与其代谢和毒性有着密切的关系。

研究人员可以通过计算化合物OB值来预测其代谢和毒性，从而更好地评估药物的安全性。

最后，OB值还可以用于药物分子的优化和改良。

药物研究人员可以通过计算化合物OB值，发现化合物的不足之处，从而进行分子的优化和改良，以提高药物的口服生物利用度。

OB值是药物研究中的重要指标，可以用于评估药物的口服生物利用度、代谢和毒性等方面。

各大化工模拟软件比较 1 概要目前,国内主要的化工流程模拟软件美国 SimSci-Esscor 公司的 PRO/II,美国AspenTech 公司的 Aspen Plus, Hysys ,英国 PSE 公司的 gPROMS ,美国 Chemstations 公司 ChemCAD 和美国 WinSim Inc. 公司的 Design II,加拿大 Virtual Materials Group的 VMGSim 。

现将这几种软件简介归纳如下,供参考学习之用。

2 CHEMCAD, PROII, ASPEN的比较简单总结以下七点:1. 一般认为, PROII 在炼油工业应用更为准确些, 因其数据库中有不少经验数据; 而 ASPEN 在化工领域表现更好, Aspen Plus与之比较有其它软件不可比拟的优点它基本上覆盖了以上各软件的所有优点。

有人比喻:PROII 是经验派, ASPEN 是学院派。

2. 学习 aspen plus必备1化工原理;讲化工过程得单元操作2热力学方法;讲述物性计算方法;3化工系统工程;讲述如何对化工系统进行建模,分析、求解如果简单掌握, 1、 2就可以了,如果想进一步深入,还需看看 3,另外有一个有经验得老师辅导也是很重要的。

3. HYSYS主要用于炼油。

动态模拟是它的优势。

SPEN 是智能型的,用于化工领域流程模拟,比较大或长的流程,而且数据库比较全,开方式的。

它和 HYSYS 现在是一家。

PRO /II 可以用于设备核算,流程短,或精馏核算。

chemcad 由于物性较少,使用不方面,相对较差,网上到处都可以下载,设计院不太使用, 高校中有一定市场。

4. 我觉得 aspen plus 的计算是最精确的,数据库的建设也是最完善的。

不过我对它的操作不太适由于它考虑的方面非常全面,所以让我感觉学起来比较费劲。

chemcad 的界面操作让人感觉非常简单, 使用起来比较顺手。

但是数据库不是太大, 我用的 5.0版本, 就只有 2000中常用物质的物性数据。

【科研进展】IDEALIQ精准水脂分离和定量化技术介绍脂肪组织不仅质子密度较高，且T1值很短，T2值较长，因此在T1WI和T2WI上呈现高信号。

脂肪组织的这些特性会降低MR图像的质量，从而影响病变的检出，包括脂肪组织引起的运动伪影，水脂肪界面上的化学位移伪影，脂肪组织所造成的图像对比度降低，以及影响增强扫描的效果。

因此MRI中脂肪抑制的主要目的在于减少运动伪影、化学位移伪影或其他相关伪影。

通过抑制脂肪组织信号，增加图像的组织对比度，改善增强扫描的效果以及鉴别病灶内是否含有脂肪，为鉴别诊断提供信息。

MRI脂肪抑制技术主要基于脂肪和水的化学位移以及脂肪与其他组织的纵向弛豫差别。

关于化学位移现象，同一种磁性原子核，处于同一磁场环境中，如果不受其他因素干扰，其进动频率应该相同。

但是我们知道，一般的物质通常是以分子形式存在的，分子中的其他原子核或电子将对某一磁性原子核产生影响。

那么同一磁性原子核如果在不同分子中，即便处于同一均匀的主磁场中，其进动频率将出现差别。

在磁共振学中，我们把这种现象称为化学位移现象。

化学位移的程度与主磁场的强度成正比，场强越高，化学位移越明显。

常规MRI 时，成像的对象是质子，处于不同分子中的质子的进动频率也将出现差异，也即存在化学位移。

在人体组织中，最典型的质子化学位移现象存在于是水分子与脂肪之间。

这两种分子中的质子进动频率相差约3.5ppm，在3T场强下相差440Hz，1.5 T的场强下相差约220Hz。

脂肪和水中质子的进动频率差别为脂肪抑制技术提供了一个切入点。

另外，在人体正常组织中，脂肪的纵向弛豫速度最快，T1值最短。

脂肪组织与其他组织的T1值差别也为脂肪抑制技术提供了一个新的角度。

一、传统脂肪抑制技术针对上述脂肪组织的特性，MRI可采用多种技术进行脂肪抑制。

不同场强的MRI仪宜采用不同的技术，同一场强的扫描机也可因检查的部位、目的或扫描序列的不同而采用不同的脂肪抑制技术。