猪流行性腹泻病毒四个毒株全基因测序和进化分析
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山东畜牧兽医2017年第38卷猪流行性腹泻病毒的分子结构和遗传特性高淑娟(山东省泰安市岱岳区畜牧兽医局 271000)中图分类号:S858.28 文献标识码:A 文章编号:1007-1733(2017)08-0058-02猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea, PED)是由猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)引起的一种高度接触性肠道传染病,以腹泻、呕吐、脱水和对哺乳仔猪高致死率为主要特征[1]。
PED于1971年在英国的养殖场首次出现,随后传遍整个欧洲大陆,以冬季零星爆发为主要特征。
PEDV粒子具有与冠状病毒科冠状病毒属其他成员同样的形态特征。
病毒的抵抗力不强,对乙醚、氯仿等敏感,一般的消毒剂即可将其杀灭,病毒没有血凝性,无法凝集猪、鼠、山羊、马和人等12种不同动物的红细胞。
PEDV适应株经60℃或以上处理30min即可失去感染能力。
PEDV接种到Vero细胞,在无血清的培养液中加入10~100µg/ml胰蛋白酶的前提下,产生细胞病变,并可以传代培养。
1 PEDV的分子结构PEDV是被膜病毒,线性正链RNA,基因组约28kb,两端带有帽子结构(Cap)和Poly(A)尾巴。
基因组包含5′非编码区、3′非编码区和7个开放阅读框(ORF)。
这7个开放阅读框编码4个结构蛋白(S蛋白、E蛋白、M蛋白、N蛋白)和3个非结构蛋白(复制酶1a、复制酶1b和ORF3),ORF3编码一个未知功能并具有多态性的产物。
PEDV S基因编码的S蛋白是种位于病毒粒子表面的纤突Ⅰ型糖蛋白,由1383个氨基酸(aa)组成,分子量为150-220kDa之间。
从N端到C端分成4个主要结构:包含一个信号肽区(1-18aa),四个中和位点区域(499-638aa、748-755aa、764-771aa和1368-1374aa),一个跨膜区(1334-1356aa)和一个较短的胞内区(Sato et al., 2011)。
猪流行性腹泻病毒的研究进展作者:敖清莹来源:《国外畜牧学·猪与禽》2024年第03期摘要:猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是一种由猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的传染病,具有传染性强、致病性高、易传播的特点。
主要感染肠道上皮细胞,引起肠道上细胞损伤,从而影响肠道的吸收功能,感染后,病猪会出现呕吐、腹泻、食欲下降等症状,严重时可能导致脱水、死亡。
本文从猪流行性腹泻流行病学、病毒基因组及结构、临床症状及诊断进展进行综述,旨在为猪流行性腹泻的防控提供参考。
关键词:PEDV;流行病学;诊断中图分类号:S852.61 文献标志码:A 文章编号:1001-0769(2024)03-0089-04猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是一种由猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的接触性传染病,具有传染性强、致病性高的特点,主要感染猪肠道上皮细胞,引起肠道上皮细胞的损伤,从而影响肠道的吸收功能。
感染后,发病猪会出现食欲下降、呕吐、腹泻等症状,严重时可能导致脱水、死亡[1]。
研究表明,不同年龄段的猪均会感染PEDV,但临床症状有所不同,新生仔猪较易感,且发病率和死亡率较高[2]。
1971年,PEDV首次被发现;1978年,Pensaert等[3]首次分离出PEDV的经典毒株PEDVCV777株;1988年,Hofmann等[4]通过Vero细胞连续传代,分离到PEDV。
在过去的三十年中,PEDV的肆虐使欧洲和亚洲养猪业遭受了相当严重的经济损失。
2013—2014年,美国、加拿大和墨西哥也相继报道了PED[5]暴发,仅一年时间就损失了近七百万头仔猪,占美国养猪业的10%[6]。
我国早在1973年报道了PEDV[7],1984年,Xuan等[8]通过血清中和实验,首次鉴定出PEDV。
·研究论文·摘 要:猪流行性腹泻病毒(PEDV )是一种主要感染仔猪小肠的肠道冠状病毒。
本研究旨在建立一种用于PEDV 体外研究的仔猪小肠类器官模型。
首先从PEDV 发病猪场的临床仔猪腹泻样品中分离PEDV 并进行全基因组测序,结果显示成功分离1株PEDV ,命名为PEDV SD 株。
另外采用肠道类器官的培养技术,从10日龄健康仔猪小肠中分离小肠隐窝组织,经过体外培养7 d 左右分化成具有肠道隐窝结构的猪小肠类器官,并能进行连续传代。
然后将分离的PEDV SD 株感染传代培养的猪小肠道类器官,通过间接免疫荧光试验显示PEDV 可以很好地感染猪小肠道类器官,表明成功建立了PEDV 感染肠道类器官的模型。
猪小肠类器官感染模型可以在体外很好地重现PEDV 感染肠道细胞的复杂结构的过程,为深入研究PEDV 的致病机制提供一种新的可再生的体外研究模型。
关键词:猪流行性腹泻病毒;肠道类器官;感染模型中图分类号: S858.28 文献标志码:A 文章编号:1674-6422(2024)01-0001-08Isolation of Porcine Epidemic Diarrhea Virus SD Strain and Development ofin Vitro 3D Intestinal Organoids Infection ModelCAI Hongming 1,2, ZHANG Min 2, LYU Lilei 2, JIANG Yifeng 2, GAO Fei 2, YU Lingxue 2, TONG Wu 2,LI Liwei 2, LI Guoxin 2, ZHOU Yanjun 2, LIU Changlong 2, TONG Guangzhi 2(1. College of Animal Sciences (College of Apiology), University of Agriculture and Forestry in Fujian, Fuzhou 350002, China; 2. ShanghaiV eterinary Research Institute, CAAS, Shanghai 200241, China)收稿日期:2022-03-11基金项目:上海市浦江人才计划资助(21PJ1416300),上海市自然科学基金资助项目(21ZR1477200),中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2019JB09)作者简介: 蔡鸿明,男,硕士研究生,预防兽医学专业通信作者:童光志,E-mail:***************.cn猪流行性腹泻病毒PEDV SD 株的分离及体外3D 肠道类器官感染模型建立蔡鸿明1,2,张 敏2,吕丽蕾2,姜一峰2,高 飞2,虞凌雪2,童 武2,李丽薇2,李国新2,周艳君2,刘长龙2,童光志2(1.福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州350002;2.中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241)Abstract: Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) is an intestinal coronavirus that infects the small intestines of piglets. The objective of the present study was to develop an in vitro 3D organoid model of porcine small intestines for studying the mechanism of PEDV infection. A PEDV SD strain was isolated from a farm and its whole genome sequence was analyzed in this study. The crypts of small intestines from a 10-day old pig were isolated and embedded in basement membrane extract and covered with the porcine intestinal organoids medium modifi ed from the human system. The organoids with a crypt-villus architecture formed in 7 days. Then the swine organoids wereChinese Journal of Animal Infectious Diseases中国动物传染病学报2024,32(1):1-8· 2 ·中国动物传染病学报2024年2月infected with the PEDV SD strain virus. The PEDV infection was determined in indirect immunofl uorescence assay. The results showed that the PEDV infection model of swine intestinal organoids were developed in this study. The 3D intestinal organoid model off ered a long-term, renewable resource for investigating porcine intestinal infections with PEDV.Key words: Porcine epidemic diarrhea virus; swine intestinal organoids; infection model猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)会可引起猪特别是新生仔猪的呕吐、腹泻和食欲下降,发病率和死亡率高[1]。