第2章 发育生物学中模式生物
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模式生物的概念
模式生物是指在生命科学研究中被广泛用作模型的生物物种。
这些生物通常具有一些特殊的生物学特征或行为,使其成为研究特定生命现象或过程的理想模型。
模式生物的选择通常基于以下几个因素:
1. 代表性:模式生物的生物学特征或行为应能够代表一类生物或一种生命现象,从而使研究结果具有普适性。
2. 实验便利性:模式生物应易于在实验室中培养和操作,以便进行各种实验研究。
3. 基因组简单:一些模式生物的基因组相对较小且简单,这有助于对基因功能和调控机制的研究。
4. 发育过程:一些模式生物的发育过程相对简单,有助于研究胚胎发育和细胞分化等过程。
5. 遗传学:模式生物的遗传学特征应较为清楚,便于进行遗传学研究和基因操作。
常见的模式生物包括大肠杆菌、酵母、果蝇、线虫、斑马鱼、小鼠等。
这些生物在基因功能、细胞生物学、发育生物学、神经科学等领域的研究中发挥了重要作用。
选择合适的模式生物对于生命科学研究的成功至关重要。
通过对模式生物的研究,可以深入了解生命现象的基本原理,并为人类健康和疾病治疗提供重要的线索和启示。
发育生物学模式生物20世纪90年代以来,发育生物学的研究取得了突飞猛进的发展,发育生物学已成为当今最活跃的生命科学研究领域之一。
在发育生物学形成和发展过程中,许多划时代的研究成果往往与一些模式生物相关。
利用模式生物开展发育机制的研究,具有便捷、高效、深入、系统和有利于成果的延展与应用等优势,常用模式生物的基本特征应成为现代生命科学必不可少的学习内容[1]。
1 发育生物学模式生物的概念对某些生物的研究,有利于帮助人们理解生命世界发育现象的共同规律和普遍原理,这些生物被称为发育生物学模式生物,简称发育模式生物。
由于进化的原因,细胞生命在发育的基本模式方面具有一定的同一性,人们往往利用位于生物复杂性阶梯较低级位置上的物种来研究发育的共同规律,以构建发育的普遍原理[2]。
例如人们通过对线虫的研究,揭示了细胞凋亡这种普遍生命现象的机理,使线虫这个身长不过 1mm,全身细胞屈指可数的小生命,成为经典的发育模式生物为科学工作者所追捧。
2 发育模式生物的共同特征处于进化阶梯不同位置的模式生物,在发育生物学研究中各有其优缺点,但都具备一些共同特征:①生理特征能够代表生物界的某一大类群。
②实验材料容易获得,并易于在实验室内饲养、繁殖,研究维持费用低。
③容易进行实验操作,特别是遗传学分析[3]。
3 主要发育模式生物的生物学特性与研究价值在发育生物学研究的历史长河中,人们总是千方百计地寻找最理想的模式生物。
在不同历史阶段,棘皮动物海胆、尾索动物海鞘、头索动物文昌鱼、两栖动物蝾螈、爬行动物蜥蜴、鸟类动物鸡和哺乳类动物小鼠,都曾作为经典的模式生物,其研究成果奠定了发育生物学的一些基本理论。
现代发育生物学的研究主要集中在线虫、果蝇、斑马鱼、非洲爪蟾、鸡、小鼠和拟南芥等模式生物,其中线虫、果蝇、斑马鱼、小鼠、拟南芥的系列研究成果尤为显著,是目前人们竞相研究的热点。
3. 1 华美广杆线虫(Caenorhabditis elegans) 华美广杆线虫(以下简称线虫),是一种长为1mm,直径70m 的线形动物,自由生活在土壤中,以细菌为食,它与寄生于人类肠道内的蛔虫、钩虫和蛲虫同属于线虫类。
模式生物在发育生物学中的应用一直到不久以前,多细胞生物在胚胎期复杂的发育变化和调控一直是困扰生命科学的未解之迷。
个体生命诞生自精卵结合形成合子,经过细胞的不断分裂、迁移、分化并发生巨大形态变化,构建出未来身体的雏形。
越是出生后形态复杂的生物,其发育中细胞间关系的变化也就越剧烈。
此外,虽然所有细胞都来自于同一个受精卵,但从发育早期开始,它们就走上了不同的分化道路,越到后期,要精确的说出每个特定位置上细胞的来历就越困难。
发育过程从本质上讲是一部生命发展的细胞历史。
成体中每个细胞都有一段自己独特的历史,总括起来就构成了个体生命。
对复杂生物发育的解读类似于对有悠久历史的古文明所进行的研究,史料千头万绪,细节纷繁,难以把握,有时甚至无从下手。
显然,如何选取恰当的切入点,找出诸种复杂现象背后潜藏的共同规律就成为洞悉这部生命史的关键。
早在一百多年前人们就发现,如果把关注的焦点集中在相对简单的生物上则发育的难题可以得到部分解答。
因为这些生物的细胞数量和种类更少,胚胎在体外发育,变化也较容易观察。
由于进化的原因,细胞生命在发育的基本模式方面具有相当大的同一性,所以利用位于生物复杂性阶梯较低级位置上的物种来研究发育共同规律是可能的。
尤其是当在有不同发育特点的生物中发现共同形态发生和变化特征时,发育的普遍原理也就得以建立。
因为对这些生物的研究具有帮助我们理解生命世界一般规律的意义,所以它们被称为“模式生物”。
一种模式生物应具备以下特点:1)其生理特征能够代表生物界的某一大类群;2)容易获得并易于在实验室内饲养、繁殖;3)容易进行实验操作,特别是遗传学分析。
于是,长久以来在进化支流的港湾中休憩的小生命——酵母、线虫、果蝇、海胆、斑马鱼、非洲爪蟾、小鼠、拟南芥,获得了前所未有的青睐。
在此,我仅针对斑马鱼进行简要的阐述。
作为模式生物,斑马鱼及其胚胎具有以下优点:①斑马鱼亲鱼体形小,易于管理,极大地减少了饲养空间和管理成本;②斑马鱼雌鱼产卵量大,每次可产约300 枚,实验用样本基数大,确保统计学意义;胚胎药物处理简单,需求量少;③胚胎体外发育,发育周期短,从受精卵到仔鱼在正常条件下只需72h,借助显微镜可清楚的观察整个发育过程;④发育初期透明,通过特定基因标记,可以直观的观察靶基因的表达;⑤应用到原位杂交技术和免疫组化技术。
模式生物发育生物学的研究与应用模式生物是指科研人员对于特定物种或群体进行高度关注、深入理解和广泛应用的生物体,被视为基本生物学理论研究和生命科学应用的重要工具。
在发育生物学上,模式生物在研究人员对于发育机制、分化机制、分子表达和发育调控网络等方面的学习和发现,做出了重要贡献。
本文将从模式生物在发育生物学的研究中的作用和重要性,以及模式生物的选择和应用方面进行探讨。
一、模式生物的重要性模式生物在发育生物学中的重要性不言而喻。
最初,发育生物学的研究只局限在简单的观察和描述阶段,由于缺乏系统和灵敏的分子工具、显微成像技术等现代生命科学技术手段,无法探究胚胎发育的分子机制和调控网络。
模式生物的出现和其在实验室中的长期研究,为研究者们提供了一个非常有利的平台和工具,可以通过简单、可重复、控制变量等方式,建立胚胎发育的模型,在细胞和分子水平上对其进行深入研究。
模式生物作为发育和分子生物学的重要实验动物,能够提供一系列牵涉到发育和疾病的关键基因、调控网络和生理遗传学问题,为疾病预测、预防和治疗提供有益指导和方向。
二、模式生物的选择模式生物的选择标准很高,但也不是所有生物都适于作为模式生物,需要具备以下几个条件:1. 可以在实验室中轻松、快速地繁殖,具备生理特征的高度稳定性和复杂性,并具有标准化和标记化操作方法;2. 具备完整的生命周期和发育过程,尤其是具备胚胎发育的不同发育阶段和提示器官的不同特征,便于发育机制的研究;3. 发育、生长和代谢速度适宜,其生理和发育特征尽可能贴近人类的相关现象,具有普通遗传特征,并且是野外或自然环境的优良生物体。
目前,最常用的模式生物包括无脊椎、小鼠、斑马鱼、拟鼠,以及果蝇等。
严格掌握模式生物的选择标准,有利于在发育生物学探索中,建立有力的试验验证体系,并且大幅降低实验误差。
三、模式生物的应用模式生物在发育生物学、神经科学、医学研究等领域,具有广泛的应用价值。
以小鼠为例,小鼠是哺乳动物中最常用的模式生物之一,在基因组学、干细胞、发育和疾病等领域,常用于基因失活或过表达、蛋白质表达和功能研究、疾病模型建立和药物筛选、检测,并且还被广泛应用于人类疾病的研究中,如癌症、神经元退行性疾病和心血管疾病等。
模式生物在发育生物学中的作用随着人类对于细胞和基因的研究的不断深入,模式生物在发育生物学领域中的作用也愈加显著。
所谓模式生物,是指在特定生长条件下,发育过程具有规律、可预测的生物,如线虫、果蝇、斑马鱼等。
在发育生物学研究中,这些生物被广泛应用于探究基因功能、遗传变异以及发育过程中的信号传递等课题,成为了不可替代的重要工具。
1. 线虫在发育生物学研究中的应用线虫是圆形、透明、微小的生物,具有短命、繁殖快、遗传简单等特点。
在发育生物学领域,线虫广泛被应用于探究细胞分化、胚胎发育等课题。
由于线虫的结构、发育过程及基因组都已经被详细研究和描述,因此研究人员可以利用线虫探究不同生长条件下基因表达和转录特点的变化。
对于点突变的线虫基因,科学家可以利用线虫的基因编辑技术快速筛选出突变基因,并研究其对线虫发育的影响。
此外,线虫也被广泛应用于探究基因在发育过程中的作用。
例如,在线虫发育过程中,某些基因的表达会发生异质性,如启动子的甲基化现象等。
通过对线虫基因的功能研究,人们逐渐理解了甲基化等现象对基因表达及发育的影响。
此外,线虫也被用于研究神经元的成像和系统研究,为研究神经网络等领域提供了有价值的信息。
2. 果蝇在发育生物学研究中的应用果蝇是另一种被广泛应用于发育生物学研究的模式生物。
果蝇的生长和繁殖速度比线虫更快,且其基因组相对更为复杂。
果蝇基因编辑技术的发展,为科学家提供了快速筛选突变基因和功能研究的新途径。
通过对果蝇的研究,科学家们发现,果蝇发育过程中的很多基因和人类基因相似或相同,这也为人们研究某些疾病的发生机理,提供了有价值的参考。
此外,果蝇在线虫不具备的一些生物学特点方面,也能提供独到的研究途径。
例如,果蝇天生就有发育方式多样的头胸异形性,通过对这种生物特性的研究,科学家可以深入了解异形性的发育机制。
3. 斑马鱼在发育生物学研究中的应用斑马鱼在近年来的发育生物学研究中越来越受到科学家的重视。
与其他模式生物相比,斑马鱼发育时间短、繁殖周期快、生长快,比较适合进行高通量筛选和快速遗传变异研究。