westernblot实验详细步骤(1)
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WesternBlot操作流程Western Blot操作流程本⼈将⾃⼰做WB实验时的具体操作流程,做了详细的记录并整理。
因为每个实验室的条件不⼀样,所以本流程仅供参考,具体适合⾃⼰的实验操作需要⼤家摸索。
由于知识量有限,有些描述⽤词并不专业,请⼤家谅解。
⼀、流程图制胶→→电泳跑胶(1.5-2.5h)→→转膜(3h)→→(可使⽤⽴春红检测是否蛋⽩是否成功转移)TBST清洗(10min)→→封闭(2h)→→TBST清洗(10min)→→附Ⅰ抗(内参:⼩⿏抗β-Actin,先摇床轻摇30min,再放冰箱4度过夜)→→TBST 清洗三次(10min/次)→→附Ⅱ抗(内参:⼭⽺抗⼩⿏,轻摇1.5h)→→TBST清洗三次(10min/次)→→显影⼆、物料及配制1、电泳液:⼀包电泳粉+1000ml双蒸⽔(可回收使⽤)2、10%过硫酸铵:1g过硫酸铵+10ml双蒸⽔3、转膜液:⼀包转膜粉+800ml双蒸⽔+200ml甲醇(可回收使⽤)4、TBST溶液:50ml 20*TBS+950ml双蒸⽔+1ml吐温20。
(⽆需回收)5、封闭液:购买6、Ⅰ抗(内参):将⼩⿏抗β-Actin:Ⅰ稀释液按1:500稀释待⽤,4度保存。
Ⅰ抗(⽬的蛋⽩58kDa):将smad2:Ⅰ稀释液按1:1000稀释待⽤,4度保存。
7、Ⅱ抗(内参):将⼭⽺抗⼩⿏:Ⅱ抗稀释液按1:5000稀释代⽤,4度保存。
Ⅱ抗(⽬的蛋⽩58kDa):将⼭⽺抗兔:Ⅱ抗稀释液按1:5000稀释待⽤,4度保存。
7、显影液:按说明书配制,避光可长期回收使⽤8、定影液:按说明书配制,可长期回收使⽤9、发光液:超敏发光液A液:B液=1:1三、步骤(⼀)制胶1、Tris-⽢氨酸SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳分离胶溶液的配制2、Tris-⽢氨酸SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳5%积层胶所⽤溶液3、1)将规格1.0mm或其它规格的玻璃板固定好。
2)依次将所需试剂加⼊烧杯中,加⼊TEMED之后,混匀,⽤1000ml的移液枪沿玻璃板缝左右两边的⾓交替加⼊分离胶溶液,也可从左到右连续加⼊(⽬的:两种⽅法都可以使液⾯快速达到⽔平状态)。
Western blotting实验流程实验流程共分为6步:1 待测蛋白的准备;2 蛋白电泳;3 转膜;4 抗体结合;5 曝光;6 灰度值统计分析。
一、待测蛋白的准备1.细胞蛋白的提取:(1)拿出六孔培养板,去培养液,PBS洗细胞两遍,根据细胞密度每孔加50~100µl细胞裂解液(含1%的蛋白酶抑制剂PMSF,现用现配),冰上放置10分钟裂解。
(2)将培养板置于冰上,用细胞刮挂下细胞,每孔刮一分钟左右(刮不同孔细胞需用PBS 或水冲洗细胞刮,洗后甩干),收集裂解液于1.5ml EP管中,置于冰上裂解20分钟,期间需用振荡器振荡混匀3次,每次15秒左右(3)12000rpm,4℃冷冻离心5min左右,收集上清置于新EP管,存于-80℃。
2. BCA法蛋白溶液浓度测定(具体步骤按试剂盒说明书)(1)配制BCA工作液:打开37℃恒温箱预热加温,取出BCA标准品与蛋白样品解冻,配BCA工作液,A:B=50:1,A液总量=(8个标准蛋白+待测蛋白数量)*200µl,B液总量=(8个标准蛋白+待测蛋白数量)*4µl,配好后混匀。
(2)配制BCA标准品与标准曲线:用PBS稀释好标准品,按说明书将标准品加入到96孔板中,再补加PBS到一样体积。
(3)配制蛋白样品:每孔加入5µl蛋白原液,补加PBS稀释(稀释可节省蛋白,记住稀释倍数,蛋白较多时也可不稀释直接加蛋白原液测;蛋白孔可做2~3个平行孔,测量时取平均值较准)(4)加入BCA工作液:每孔各加200µl已配好的工作液,盖上板盖混匀30秒,37℃孵育30min,放好蛋白样品。
(5)测蛋白浓度:打开酶标仪预热10分钟以上,孵育完后取出96孔板冷却到室温,用移液枪去除小气泡,用纸巾擦干96孔板板度水珠,调节酶标仪波长,放入打印纸,打开96孔板板盖,在570nm波长下读取数值,空白孔可设可不设。
(具体按酶标仪操作说明,可以测几次选取)(6)计算浓度:用EXCELL表格制作标准直线方程,计算待测蛋白浓度(若稀释测量的记住要乘以稀释倍数才是最终蛋白浓度),然后以每个条带最低浓度那组蛋白为标准计算各组蛋白上样体积与细胞裂解液RIPA的补加体积。
蛋⽩质免疫印迹(WesternBlot,WB)实验⽅法原理步骤及注意事项实验⽅法原理Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋⽩质转移到膜上,然后利⽤抗体进⾏检测的⽅法。
对已知表达蛋⽩,可⽤相应抗体作为⼀抗进⾏检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。
与Southern或Northern杂交⽅法类似,但Western Blot采⽤的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋⽩质,“探针”是抗体,“显⾊”⽤标记的⼆抗。
经过PAGE分离的蛋⽩质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以⾮共价键形式吸附蛋⽩质,且能保持电泳分离的多肽类型及其⽣物学活性不变。
以固相载体上的蛋⽩质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第⼆抗体起反应,经过底物显⾊或放射⾃显影以检测电泳分离的特异性⽬的基因表达的蛋⽩成分。
该技术也⼴泛应⽤于检测蛋⽩⽔平的表达。
实验材料蛋⽩质样品试剂、试剂盒丙烯酰胺SDS Tris-HClβ-巯基⼄醇ddH2O⽢氨酸Tris甲醇PBSNaClKClNa2HPO4KH2PO4ddH2O考马斯亮兰⼄酸脱脂奶粉硫酸镍胺H2O2DAB试剂盒仪器、耗材电泳仪电泳槽离⼼机离⼼管硝酸纤维素膜匀浆器剪⼑移液枪刮棒实验步骤⼀、试剂准备1. SDS-PAGE试剂:见聚丙烯酰胺凝胶电泳实验。
2. 匀浆缓冲液:1.0 M Tris-HCl(pH 6.8) 1.0 ml;10%SDS 6.0 ml;β-巯基⼄醇 0.2 ml;ddH2O 2.8 ml。
3. 转膜缓冲液:⽢氨酸 2.9 g;Tris 5.8 g;SDS 0.37 g;甲醇200 ml;加ddH2O定容⾄1000 ml。
4. 0.01 M PBS(pH7.4):NaCl 8.0 g;KCl 0.2 g;Na2HPO4 1.44 g;KH2PO4 0.24 g;加ddH2O⾄1000 ml。
5. 膜染⾊液:考马斯亮兰 0.2 g;甲醇80 ml;⼄酸2 ml;ddH2O118 ml。
western blot实验实验步骤
Western blot实验步骤如下:
收集蛋白样品:使用细胞裂解液,对贴壁细胞、悬浮细胞或组织样品进行裂解。
然后测定每个蛋白样品的蛋白浓度。
SDS-PAGE凝胶配制:参考一些文献资料进行配制。
样品处理:在收集的蛋白样品中加入适量浓缩的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液。
例如2X或5X的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液。
使用5X的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液可以减小上样体积,在相同体积的上样孔内可以上样更多的蛋白样品。
5X的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液可以参考相关文献资料配制,100℃或沸水浴加热3-5分钟,以充分变性蛋白。
上样与电泳:将处理后的蛋白样品冷却到室温后,直接上样到SDS-PAGE胶加样孔内即可。
Western Blot(免疫印迹法)实验方法步骤发布日期:2008-8-25 热门指数:4360Western Blot(免疫印迹法)主要包括以下4个基本步骤:n 样品制备n 电泳分离n 蛋白的膜转移n 免疫杂交与显色――蛋白检测溶液和试剂n 1X 磷酸盐缓冲液(PBS)n Modified RIPA bufferTris-HCl: 50 mM, pH 7.4 ; NP-40: 1% ;Na-deoxycholate: 0.25% ;NaCl: 150 mM ;EDTA: 1 mM ;PMSF: 1 mM ;Aprotinin, leupeptin, pepstatin: 1 microgram/ml each ;Na3VO4: 1 mM ;NaF: 1 mMn 1X SDS 样品缓冲液62.5 mM Tris-HCl (pH 6.8 于25°C), 2% w/v SDS, 10%甘油,50 mM DTT, 0.01% w/v溴酚蓝n 转移缓冲液25 mM Tris base, 0.2 M 甘氨酸, 20%甲醇(pH 8.3)n 10X Tris缓冲盐(TBS)准备1L 10X TBS: 24.2 g Tris base, 80 g NaCl;用1N HCl调pH为7.6n 脱脂奶粉或BSAn 甲醇n TBS/T缓冲液1X TBS, 0.1% Tween-20)TBS/T封闭缓冲液(n1X TBS, 0.1% Tween-20加5% w/v脱脂奶粉或BSAn 一抗的稀释1X TBS, 0.1% Tween-20 加5% BSA (多抗)或5%脱脂奶粉(单抗)Note: 一般来说, BSA被推荐用于多克隆抗体,脱脂奶粉用于单克隆抗体,这样可得到较高的信噪比。
抗体的稀释度参考抗体说明书或根据实验确定。
n 预染的蛋白质Marker,可用于监测转膜的效率样品制备原始样品可为细胞、组织、培养上清、免疫沉淀或亲和纯化的蛋白,以下为定性检测目的蛋白时细胞样品的处理方法,其余的样品制备方法参阅相关文献。
Western Blot(免疫印迹法)实验方法步骤发布日期:2008-8-25 热门指数:4360Western Blot(免疫印迹法)主要包括以下4个基本步骤:n 样品制备n 电泳分离n 蛋白的膜转移n 免疫杂交与显色――蛋白检测溶液和试剂n 1X 磷酸盐缓冲液(PBS)n Modified RIPA bufferTris-HCl: 50 mM, pH 7.4 ; NP-40: 1% ;Na-deoxycholate: 0.25% ;NaCl: 150 mM ;EDTA: 1 mM ;PMSF: 1 mM ;Aprotinin, leupeptin, pepstatin: 1 microgram/ml each ;Na3VO4: 1 mM ;NaF: 1 mMn 1X SDS 样品缓冲液62.5 mM Tris-HCl (pH 6.8 于25°C), 2% w/v SDS, 10%甘油,50 mM DTT, 0.01% w/v溴酚蓝n 转移缓冲液25 mM Tris base, 0.2 M 甘氨酸, 20%甲醇(pH 8.3)n 10X Tris缓冲盐(TBS)准备1L 10X TBS: 24.2 g Tris base, 80 g NaCl;用1N HCl调pH为7.6n 脱脂奶粉或BSAn 甲醇n TBS/T缓冲液1X TBS, 0.1% Tween-20)TBS/T封闭缓冲液(n1X TBS, 0.1% Tween-20加5% w/v脱脂奶粉或BSAn 一抗的稀释1X TBS, 0.1% Tween-20 加5% BSA (多抗)或5%脱脂奶粉(单抗)Note: 一般来说, BSA被推荐用于多克隆抗体,脱脂奶粉用于单克隆抗体,这样可得到较高的信噪比。
抗体的稀释度参考抗体说明书或根据实验确定。
n 预染的蛋白质Marker,可用于监测转膜的效率样品制备原始样品可为细胞、组织、培养上清、免疫沉淀或亲和纯化的蛋白,以下为定性检测目的蛋白时细胞样品的处理方法,其余的样品制备方法参阅相关文献。
蛋白免疫印迹(western blot)实验实验步骤:一、试剂准备1. SDS-PAGE试剂:见聚丙烯酰胺凝胶电泳实验。
2. 匀浆缓冲液:1.0 M Tris-HCl(pH 6.8) 1.0 ml;10%SDS 6.0 ml;β-巯基乙醇 0.2 ml;ddH2O 2.8 ml。
3. 转膜缓冲液:甘氨酸 2.9 g;Tris 5.8 g;SDS 0.37 g;甲醇200 ml;加ddH2O定容至1000 ml。
4. 0.01 M PBS(pH7.4):NaCl 8.0 g;KCl 0.2 g;Na2HPO4 1.44 g;KH2PO4 0.24 g;加ddH2O至1000 ml。
5. 膜染色液:考马斯亮兰 0.2 g;甲醇80 ml;乙酸2 ml;ddH2O118 ml。
包被液(5%脱脂奶粉,现配):脱脂奶粉1.0 g 溶于20 ml的0.01 M PBS中。
6. 显色液:DAB 6.0 mg;0.01 M PBS 10.0 ml;硫酸镍胺 0.1 ml;H202 1.0 μl。
【晶莱生物】二、蛋白样品制备1.单层贴壁细胞总蛋白的提取(1)倒掉培养液,并将瓶倒扣在吸水纸上使吸水纸吸干培养液(或将瓶直立放置一会儿使残余培养液流到瓶底然后再用移液器将其吸走)。
(2)每瓶细胞加3 ml 4℃预冷的PBS(0.01M pH7.2~7.3)。
平放轻轻摇动1 min洗涤细胞,然后弃去洗液。
重复以上操作两次,共洗细胞三次以洗去培养液。
将PBS弃净后把培养瓶置于冰上。
(3)按1ml裂解液加10 μl PMSF(100 mM),摇匀置于冰上。
(PMSF要摇匀至无结晶时才可与裂解液混合。
)(4)每瓶细胞加400 μl含PMSF的裂解液,于冰上裂解30 min,为使细胞充分裂解培养瓶要经常来回摇动。
(5)裂解完后,用干净的刮棒将细胞刮于培养瓶的一侧(动作要快),然后用枪将细胞碎片和裂解液移至1.5 ml离心管中。
(整个操作尽量在冰上进行。
Westernblot操作步骤[完整版]Western blot 操作流程作者:孙雪纯审核人:关宝生发布者:王建宇实验原理:Western,也称Western blot、Western blotting、Western印迹,是用抗体检测蛋白的重要方法之一。
Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。
经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。
以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。
该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。
内参:WB过程监测以及目的蛋白定量的标准;最重要和最不可或缺的对照就是内参照。
1.内参可检测整个WB实验过程及体系是否正常工作,如果一个实验连内参照都出不了阳性结果的话(在内参抗体有效的情况下),那么这个体系就是存在问题的;2、起半定量的标准的作用,内参一般选择管家基因编码表达的蛋白,在很多组织和细胞中都是稳定表达的,因此可以作为检测靶蛋白表达量的标准;内参名称分子量大小适用范围beta-actin 43kDa 胞浆和全细胞GAPDH 30-40kDa 胞浆和全细胞Tubulin 55kDa 胞浆和全细胞VCDA1/Porin 31kDa 线粒体COXIV 16kDa 线粒体TBP 38kDa 细胞核实验步骤一、蛋白样品制备(组织中总蛋白的提取)第一步:法(1)敲取0.07-0.1g组织+400-500ul裂解液,放入打样管,放入打样机打样。
法(2)实验室研钵研磨:取稍大于0.1g的样品放入研钵中,来回磨,至粉末状,用枪头刮取收集入离心管。
注:任何操作都要在液氮中进行,并且要将枪头和离心管提前泡在液氮中。
Western-blot(WB)实验步骤有哪些?
B通常广泛用于检测复杂样品中的少量目的蛋白,或监测蛋白表达与纯化。
它通常被认为是评估新抗体及其蛋白检测分析方法(如ELISA)的标准之一。
WB的主要步骤大致分为以下三步:SDS-PAGE分离蛋白样品、蛋白样品转移至膜上以及鉴定膜上的目的蛋白。
根据WB的这几大步骤,我们总结出一个成功的WB需要具备大致四个要求:
1.蛋白样品的分离及洗脱。
一个复杂的蛋白样品在凝胶电泳中根据其分子大小分离,之后在转移过程中从凝胶上洗脱,如果仍保留在凝胶上则影响WB实验;
2.吸附于膜。
蛋白从凝胶上洗脱后吸附于膜上,转移时电极方向、转移时间、膜的处理等都将影响蛋白的吸附;
3.实验过程中蛋白的截留,在转移后的后续处理过程中蛋白持续吸附于膜上,过分冲洗等做法都将导致蛋白脱落;
4.在实验过程中,吸附的蛋白样品能直接与其检测试剂接触,比如不适当的封闭等操作将使蛋白样品被掩蔽,无法得到WB结果。
因此,在WB的实际操作中都应注意以上要求为前提进行,以期得到良好的**印记。
Westernblot 实验步骤Westernblot实验步骤1. 组织块称重2. 利用液氮、研钵粉碎组织块3. 加入RIPA缓冲液(每克组织3 ml RIPA),PMSF(每克组织30μl,10 mg/ml PMSF),利用Polytron进一步匀浆(15,000转/分*1分钟)维持4℃4. 加入PMSF(每克组织30μl,10 mg/ml PMSF),冰上孵育30分钟5. 移入离心管4℃约20,000 g(约15,000转)15分钟6. 上清液为细胞裂解液可分装-20℃保存7. 进行Bradford比色法测定蛋白质浓度8. 取相同质量的细胞裂解液(体积*蛋白质浓度),并加等体积的2×电泳加样缓冲液9. 沸水浴中3分钟 10. 上样 11. 电泳(浓缩胶20mA,分离胶35mA) 12. 电转膜仪转膜(100mA 40分钟) 13. 膜用丽春红染色,胶用考马斯亮蓝染色 14. Westernblot试剂盒显色 15. 分析比较记录。
Western实验步骤1. 收集蛋白样品(Protein sample preparation) 可以使用适当的裂解液,例如碧云天生产的Western及IP细胞裂解液,裂解贴壁细胞、悬浮细胞或组织样品。
收集完蛋白样品后,为确保每个蛋白样品的上样量一致,需要测定每个蛋白样品的蛋白浓度。
根据所使用的裂解液的不同,需要采用适当的蛋白浓度测定方法。
如果使用碧云天生产的Western及IP细胞裂解液,可以使用BCA蛋白浓度测定试剂盒。
2. 电泳(Electrophoresis) (1) SDS-PAGE凝胶配制 (2) 样品处理在收集的蛋白样品中加入适量浓缩的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液。
例如2X或5X的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液。
使用5X 的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液可以减小上样体积,在相同体积的上样孔内可以上样更多的蛋白样品。
5X的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液可以参考相关文献资料配制,100℃或沸水浴加热3-5分钟,以充分变性蛋白。
Western blot一.仪器及器皿:棕色广口瓶5个(50ml),灭菌,烧杯3个灭菌,EP管,枪及枪头,分光光度计,超声破碎机,冷冻离心机,灭菌0.9%生理盐水,冰,灭菌水(1000ml),两套灭菌器械。
二.药品配制:1.TBS×10(Tris Buffered Saline):2.42 g Tris base8g NaCl100ml H2O, 用HCl调pH 7.6,4°C保存.(配TBST用)TBST=TBS+0.05%Tween 2.TBS:0.303 g Tris base0.4383g NaCl (150mM)0.05gSDS用HCl调pH至8.0(配裂解液用),50ml约用2.1mlHCl。
3.0.5M Tris-HCl(pH6.8),50ml,:3gTris-base加灭菌水约30ml,用6N盐酸缓缓调pH至6.8(约用1ml),定容至50ml,4℃保存。
(若调小了,用5.6%NaHCO3调回) 。
1.5M Tris-HCl(pH8.8),50ml,9.08gTris-base加灭菌水约40ml,用6N盐酸缓缓调pH至8.8(约用2ml),定容至50ml,4℃保存。
4.5×Running buffer pH8.3,500ml:Tris-base 7.5g,Glycine(甘氨酸) 36g,SDS 2.5g加灭菌水至500ml, 4℃保存,用时若有沉淀析出可提前拿出置37℃,不用调pH值,用时按1:5稀释,即60ml的5×Running buffer加入240ml水。
5.30%acrylamide(丙稀酰胺贮液):8.76g acrylamide, 0.24g N, N'-methylene-bisacrylamide(亚甲基双丙烯酰胺),加少许灭菌H2O搅匀,最后定容至30 ml 。
用0.45 µm的过滤器过滤后4°C避光保存6.10%SDS:5gSDS+50 ml H2O,(难溶,需较长时间),常温保存。
WesternBlotprotocol实验步骤Western Blot protocol主要试剂及缓冲液的配制1). 30%丙烯酰胺:将29g丙烯酰胺和1g N,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为100ml的⽔中。
搅拌器帮助溶解,滤纸过滤除杂质,避光保存于4度冰箱。
2). 10% SDS:称量10g⼗⼆烷基硫酸钠,加⼊80ml超纯⽔中,加热搅拌溶解,加⽔⾄100ml室温保存备⽤。
3).10x蛋⽩电泳缓冲液:30.2gTris、188g⽢氨酸、10gSDS、加⽔⾄1000ml4).20×转膜缓冲液:Tris 29g,Glycine 144g,SDS 2g 加⽔定容⾄1000ml配制1×转膜缓冲液200ml (甲醇 40ml,20×transfer buffer 10ml,H2O 150ml)5).1.5M Tris 8.8:(注意温度对tris PH值的影响)18.15 g Tris 溶于80ml超纯⽔中,加浓盐酸调PH值8.8,定容⾄100ml。
⾼温灭菌后室温保存。
6).1M Tris 6.8:12.11g Tris 溶于80ml 超纯⽔,加浓盐酸调PH值6.8,定容⾄100ml。
⾼温灭菌后室温保存。
7). 10×PBS:NaCl 80g,KCl 2g,Na2HPO4.12H2O 35.85g,KH2PO4 2.4g,⽤盐酸调PH⾄7.4,加⽔定容⾄1000ml8). 1xPBST(0.05% Tween 20):10×PBS 100ml,H2O 900ml, Tween 20 50ul9).10%(W/V)过硫酸铵:临时配,0.1g过硫酸铵溶于1ml 超纯⽔,4度冰箱保存3天10). 丽春红染液储存液(0.1%(W/V)丽春红,5%(V/V)⼄酸):,丽春红0.04g,冰醋酸2ml,超纯⽔ 38ml11). 封闭液:5%(W/V)脱脂奶粉溶于1X PBST 中,使⽤时现配。
蛋⽩质免疫印迹(WesternBlot)实验步骤和原理及注意事项蛋⽩质免疫印迹(Western Blot )实验步骤和原理及注意事项1.收集蛋⽩样品(Protein sample preparation)可以使⽤适当的裂解液。
收集完蛋⽩样品后,为确保每个蛋⽩样品的上样量⼀致,需要测定每个蛋⽩样品的蛋⽩浓度。
根据所使⽤的裂解液的不同,需要采⽤适当的蛋⽩浓度测定⽅法。
因为不同的蛋⽩浓度测定⽅法对于⼀些去垢剂和还原剂等的兼容性差别很⼤。
BCA法。
2. 电泳(Electrophoresis)(1) SDS-PAGE凝胶配制(2) 样品处理在收集的蛋⽩样品中加⼊适量浓缩的SDS-PAGE蛋⽩上样缓冲液。
例如2X或5X的SDS-PAGE蛋⽩上样缓冲液。
使⽤5X的SDS-PAGE蛋⽩上样缓冲液可以减⼩上样体积,在相同体积的上样孔内可以上样更多的蛋⽩样品。
100℃或沸⽔浴加热3-5分钟,以充分变性蛋⽩(根据蛋⽩分⼦的⼤⼩,煮沸时间可适当变化,⼀般不低于5min。
煮沸只是变性蛋⽩,⽽不是分解,⼀般加了抑制酶不会分解。
煮沸对于SDS-PAGE凝胶电泳是必须的,只有煮沸,才能消除蛋⽩质的⽴体⼆级结构,伸展为⼀维线性结构,所以⼀般来讲⼆聚体都会解体,才能完全按照分⼦量跑电泳,加的蛋⽩Marker才有指⽰分⼦量的意义。
蛋⽩样品变性后与SDS充分结合,SDS使每个氨基酸带相同的电荷,使整个蛋⽩呈线性结构. 抗体因为要是线性表位结合的,100度煮10min 后13000,离⼼5分钟,取上清电泳,因为沉淀会导致拖尾.也可以取上清到另⼀管,4度可以放⼀周备再次电泳)。
(3)电泳i.清洗玻璃板:⼀只⼿扣紧玻璃板,另⼀只⼿蘸点洗⾐粉轻轻擦洗。
两⾯都擦洗过后⽤⾃来⽔冲,再⽤蒸馏⽔冲洗⼲净后⽴在筐⾥晾⼲。
ii.灌胶与上样(1)玻璃板对齐后放⼊夹中卡紧。
然后垂直卡在架⼦上准备灌胶。
(操作时要使两玻璃对齐,以免漏胶。
)(2)配10%分离胶,加⼊TEMED后⽴即摇匀即可灌胶。
Western Blot实验技术一、制胶SDS-PAGE分离胶配方表1、检查制胶器是否漏水,吸干玻璃中水分2、配置分离胶,加入玻璃板中(注意:不能有气泡和杂物),距离玻璃上口1.5mL停止加胶。
3、再加ddH2O或异丁醇水封除去气泡,凝胶后倒掉水,吸干水到浓缩胶插梳。
二、上样1、先在内槽加满电泳液才可以拔梳子。
2、拔梳子时垂直向上拔出,不可左右摇晃梳子。
3、拔完梳子后观察梳子孔,是否有缺口和歪,用针头拨正。
4、上样时从左到右依次上样。
5、若上样组不多时,左右第一孔不加样。
6、要预留Marker的上样孔。
三、电泳四、转膜PVDF膜即聚偏二氟乙烯膜(polyvinylidene fluoride)是蛋白质印迹法中常用的一种固相支持物。
PVDF膜是疏水性的,膜孔径有大有小,随着膜孔径的不断减小,膜对低分子量的蛋白结合就越牢固。
(转膜缓冲液:需4度预冷,现配现用,不能放太久。
)1、转印滤纸:全胶长8.5cm,宽5.5cm,需剪裁成7层滤纸,压平后约3mm。
需在转膜缓冲液中平衡浸泡备用。
2、海绵垫:在转膜液中平衡浸泡备用。
3、PVDF膜:剪裁8.5cm*5.5cm ,需在甲醇中浸润2min(活化膜上正电基团),然后在转膜缓冲液中平衡浸泡备用。
4、凝胶:凝胶也需要在预冷的转膜转膜缓冲液中平衡浸泡3-5分钟。
否则在转膜过程中会出现皱缩,导致出现转移的条带变形。
三明治夹心法:负极(黑)-海绵垫-滤纸-胶-PVDF膜-滤纸-海绵垫-正极(白)转膜时间:通电恒流,60V,一个槽100mA左右,1h(注意:在操作过程中用玻棒赶走气泡。
装置转膜仪时注意黑对黑(负对负),白对红(正对正)。
装置运行时需冰浴。
)五、封闭在进行抗体杂交之前,需要先对转印膜进行封闭,以防止抗体对非转印蛋白区域的非特异性吸附。
封闭一般采用异源性蛋白质或去污剂,本实验室常用的有5%BSA,10%脱脂奶等,至于选择哪一类封闭液,首先应考虑与检测目的相适应(做l酪氨酸磷酸化时不推荐non-fat milk 封闭)。
1、将脱脂奶粉封闭液(1xTBST:脱脂奶粉=20mL:2g一块膜用量。
牛血清蛋白、5%BSA 效果更好)倒好。
2、将PVDF膜取出放入封闭液中,盖子改好。
3、封膜一般常温1-2小时即可,也可4℃封闭过夜。
六、一抗抗体反应主要采用间接法:即先加入未标记特异性一抗与膜上抗原结合后,再加入标记的二抗进行杂交检测,标记二抗物质有放射性核素,酶,以及生物素等。
1、将封闭后的杂交膜,在摇床上用TBST洗膜3次×5min,2、加入经TBST稀释的一抗(用血清封闭液)3、4℃孵育过夜或室温摇动孵育2-4小时回收一抗稀释液七、洗膜1、之后,在摇床上用TBST洗膜3次×5min,八、二抗1、加入标记的二抗室温1-2小时,二抗不回收注意:一抗稀释液(稀释2000到4000)及孵育条件,孵育时间最好严格按说明书要求来做。
例如:CST某些磷酸化抗体要求5%BSA稀释液稀释,4℃平缓震荡过夜。
根据不同的目的条件和目标抗体,可剪膜后孵育抗体,即便做单一条带,仍推荐剪膜,在相同体积抗体下,更小的膜可以使抗原和抗体孵育更充分。
回收的一抗可加入叠氮钠抑菌(-20°保存影响不大)。
二抗作用时间不可太长,2小时之后已无抗原抗体结合,导致背景过深。
九、洗膜1、在摇床上用TBST洗膜3×5min十、显影1、打开电源,预冷成像系统,同时开机,打开GE成像软件,等待显示camera ready。
2、暗室红灯下操作,按EP管中加显色剂A、B(4℃保存)按1:1剂量混匀,ECL 发光液现配现用。
3、用滤纸吸干PVDF膜上的TBST洗涤液。
4、平整铺上保鲜膜,5、将配好的ECL发光液均匀的涂布于PVDF蛋白膜上,盖上另一半保鲜膜,放上合适大小的胶片,保鲜膜平整赶走气泡,关闭成像仪盖子,开始曝光。
6、曝光时间:根据需要,可先曝10-30s,视首曝决定是否再曝,或曝光时间。
7、曝光后可对图像进行调节,通过调试背景亮度及曝光度。
显色后strippingStripping solution: 100 mM 2-mercaptoethanol, 2% (w/v) SDS, 62.5 mM Tris-HCl, pH 6.7方法:将用过的膜浸入stripping buffer中,置50℃水浴箱中30min,间断振摇。
之后用TBST洗4*5min就好。
此时你已经可以按新的转移好的膜来再次使用了。
该方法的优点:省事,省力,省钱。
十一、常见问题聚丙烯酰胺凝胶由单体丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺聚合而成,聚合过程由自由基催化完成。
催化聚合的常用方法有两种:化学聚合法(常用)和光聚合法。
PAGE根据其有无浓缩效应,分为连续系统和不连续系统两大类。
连续系统电泳:体系中缓冲液pH值及凝胶浓度相同;带电颗粒在电场作用下,主要靠电荷和分子筛效应。
不连续系统:由于缓冲液离子成分、pH、凝胶浓度及电位梯度的不连续性;带电颗粒在电场中泳动不仅有电荷效应,分子筛效应,还具有浓缩效应,因而其分离条带清晰度及分辨率比连续系统电泳的较好。
不连续体系由电极缓冲液、浓缩胶及分离胶所组成。
浓缩胶是由AP催化聚合而成的大孔胶,凝胶缓冲液为pH6.7的Tris-HC1。
分离胶是由AP催化聚合而成的小孔胶,凝胶缓冲液为pH8.9 Tris-HC1。
电极缓冲液是pH8.3 Tris-甘氨酸缓冲液。
2种孔径的凝胶、2种缓冲体系、3种pH值使不连续体系形成了凝胶孔径、pH值、缓冲液离子成分的不连续性,这是样品浓缩的主要因素。
SDS-PAGE各试剂作用1. 过硫酸铵(APS)为催化剂2. 四甲基乙二胺(TEMED)为加速剂:在聚合过程中,TEMED催化过硫酸铵产生自由基,后者引发丙烯酰胺单体聚合,同时甲叉双丙烯酰胺与丙烯酰胺链间产生甲叉键交联,从而形成三维网状结构3. SDS是阴离子去污剂,作为变性剂和助溶试剂,它能断裂分子内和分子间的氢键,使分子去折叠,破坏蛋白分子的二、三级结构。
4. 强还原剂如巯基乙醇,二硫苏糖醇能使半胱氨酸残基间的二硫键断裂。
在样品和凝胶中加入还原剂和SDS后,分子被解聚成多肽链,解聚后的氨基酸侧链和SDS结合成蛋白- SDS胶束,所带的负电荷大大超过了蛋白原有的电荷量,这样就消除了不同分子间的电荷差异和结构差异。
5. 聚丙烯酰胺——为蛋白质电泳提供载体,其凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关;制胶缓冲液选择tris-HCL系统;AP——提供自由基;TEMED——催化剂,催化自由基引起的聚合反应进行;十二烷基硫酸钠(SDS)——阳离子去污剂,作用:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠。
⒈配胶缓冲液系统对电泳的影响?在SDS-PAGE不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris-HCl缓冲系统,浓缩胶是pH6.7,分离胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的Tris-甘氨酸缓冲系统。
在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而Cl离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。
由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压梯度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带。
当样品进入分离胶后,由于胶中pH的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随氯离子之后,同时由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固有的带电性和分子大小进行分离。
所以,pH对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除其他因素之后仍不能很好解决问题的情况,应首要考虑该因素,当然其他的因素也可以从多方面考虑。
⒉样品如何处理?根据样品分离目的不同,主要有三种处理方法:还原SDS处理、非还原SDS处理、带有烷基化作用的还原SDS处理。
1)还原SDS处理:在上样buffer中加入SDS和DTT(或β-巯基乙醇)后,蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成SDS与蛋白相结合的分子,在电泳中,只根据分子量来分离。
一般电泳均按这种方式处理,样品稀释适当浓度,加入上样Buffer,离心,沸水煮5min,再离心加样。
2)带有烷基化作用的还原SDS处理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的并经久牢固的保护SH基团,得到较窄的谱带;另碘乙酸胺可捕集过量的DTT,而防止银染时的纹理现象。
100ul样品缓冲液中10ul 20%的碘乙酸胺,并在室温保温30min。
3)非还原SDS处理:生理体液、血清、尿素等样品,一般只用1%SDS沸水中煮3min,未加还原剂,因而蛋白折叠未被破坏,不可作为测定分子量来使用。
⒊SDS-PAGE电泳凝胶中各主要成分的作用?聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺与为蛋白质电泳提供载体,其凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关;制胶缓冲液:浓缩胶选择pH6.8,分离胶选择pH8.8,选择Tris-HCl系统,TEMED与AP:AP 催化剂,催化单丙和双丙聚合成聚丙烯酰胺。
TEMED四甲基乙二胺,催凝剂,加速AP催化作用;十二烷基磺酸钠(SDS):阴离子去污剂,作用有四:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠。
⒋提高SDS-PAGE电泳分辨率的途径?聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝胶的分辨率。
建议做法:待凝胶在室温凝固后,可在室温下放置一段时间使用。
忌即配即用或4度冰箱放置,前者易导致凝固不充分,后者可导致SDS结晶。
一般凝胶可在室温下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。
一般常用的有氨基黑、考马斯亮蓝、银染色三种染料,不同染料又各自不同的染色方法,具体可参照郭尧君编著的《蛋白质电泳技术手册》P82-103。
⒌“ 微笑”(两边翘起中间凹下)形带原因?主要是由于凝胶的中间部分凝固不均匀所致,多出现于较厚的凝胶中。
处理办法:待其充分凝固再作后续实验。
⒍“皱眉”(两边向下中间鼓起)形带原因?主要出现在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部间隙气泡未排除干净。
处理办法:可在两板间加入适量缓冲液,以排除气泡。
⒎为什么带出现拖尾现象?主要是样品融解效果不佳或分离胶浓度过大引起的。
处理办法:加样前离心;选择适当的样品缓冲液,加适量样品促溶剂;电泳缓冲液时间过长,重新配制;降低凝胶浓度。
⒏为什么带出现纹理现象?主要是样品不溶性颗粒引起的。
处理办法:加样前离心;加适量样品促溶剂。
⒐什么是“鬼带”,如何处理?“鬼带”就是在跑大分子构象复杂的蛋白质分子时,常会出现在泳道顶端(有时在浓缩胶中)的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉淀,主要由于还原剂在加热的过程中被氧化而失去活性,致使原来被解离的蛋白质分子重新折叠结合和亚基重新缔合,聚合成大分子,其分子量要比目标条带大,有时不能进入分离胶。