HbNIN2基因在巴西橡胶树嫩皮和中脉中的RNA原位杂交分析
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巴西橡胶树HbbHLH转录因子的克隆及表达研究的开题报告研究背景和意义:巴西橡胶树是一种重要的能源作物,其乳胶含有丰富的橡胶,被广泛用于制造橡胶制品。
而橡胶树在生产过程中存在许多问题,如病虫害的影响、产量的不稳定性等,这些问题直接影响着其生产效益。
因此,对橡胶树的研究具有重要意义。
植物中的基因调控对植物的生长发育、适应环境等具有重要作用。
转录因子作为基因调控的重要参与者,在植物中发挥着重要的调控作用。
目前已经有许多植物转录因子基因的研究成果,但是,在巴西橡胶树中,转录因子基因的研究还相对较少。
本研究将克隆巴西橡胶树HbbHLH基因,并研究其在橡胶树生长发育过程中的表达情况和调控作用,为进一步了解橡胶树的基因调控机制提供一定的理论支持。
研究内容:1、克隆巴西橡胶树HbbHLH基因;2、对HbbHLH基因进行序列分析;3、利用RNA-Seq等方法研究HbbHLH基因在不同生长期巴西橡胶树中的表达情况;4、利用VIGS等技术研究HbbHLH基因在橡胶树生长发育过程中的调控作用;5、分析HbbHLH基因的生物学功能和作用机制。
研究方法:根据大豆bHLH基因家族设计一对引物,通过RT-PCR方法进行HbbHLH基因的克隆。
利用SMART软件对HbbHLH基因序列进行分析。
运用qRT-PCR和RNA-Seq方法研究HbbHLH基因在不同生长阶段巴西橡胶树中的表达情况。
利用VIGS等技术研究HbbHLH基因在橡胶树生长发育过程中的调控作用。
预期结果:1、成功克隆巴西橡胶树HbbHLH基因;2、获得HbbHLH基因的完整序列;3、揭示HbbHLH基因在橡胶树生长发育过程中的表达情况和调控作用;4、分析HbbHLH基因的生物学功能和作用机制。
研究展望:本研究有望为巴西橡胶树的基因调控研究提供理论支持,为橡胶树的生产提供技术支持,对于推动巴西橡胶树的发展具有重要意义。
同时,本研究对于植物基因调控研究也会具有一定的参考价值,有利于进一步深入了解植物的基因调控机制。
巴西橡胶树NAC转录因子HbNAC1基因的克隆及生物信息学分析康桂娟;曾日中;聂智毅;黎瑜;代龙军;段翠芳【期刊名称】《中国农学通报》【年(卷),期】2012(28)34【摘要】为了研究植物特有的NAC(NAM,ATAF1/2和CUC2)转录因子在巴西橡胶树生长发育、胁迫应答和激素调节中的功能,对巴西橡胶树NAC转录因子进行了克隆和分析。
根据橡胶树胶乳cDNA文库中筛选到的NACEST序列,利用RACE-PCR技术克隆了橡胶树HbNAC1的cDNA序列。
生物信息学分析显示HbNAC1基因开放阅读框(ORF)为891bp,编码了一个296个氨基酸组成的中性不稳定水溶性蛋白,该蛋白的N-端具有保守的NAC结构域,C-端高度变异,具备了NAC转录因子的基本特征。
HbNAC1定位在细胞核中,具有3个糖基化位点和21个磷酸化位点,三级结构由3个α-螺旋和9个β-折叠组成。
序列比对和系统进化分析显示HbNAC1蛋白属于NAC转录因子家族中的ANAC011亚族,推测其可能作为一种氨基酸合成相关的调节酶参与调控植物的免疫反应。
【总页数】11页(P1-11)【关键词】巴西橡胶树;NAC转录因子;克隆;生物信息学分析【作者】康桂娟;曾日中;聂智毅;黎瑜;代龙军;段翠芳【作者单位】中国热带农业科学院橡胶研究所/农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室【正文语种】中文【中图分类】S7【相关文献】1.马铃薯NAC转录因子基因的克隆及生物信息学分析 [J], 冯洁;罗红玉;李美玲;雍玲桃;刘升艳;许桃桃;杨江伟2.烟草NAC转录因子NtNAC1的基因克隆与生物信息学分析 [J], 田云;方俊;卢向阳3.巴西橡胶树HbNAC1基因的克隆和表达分析 [J], 邱琼;朱家红;张治礼4.小黑麦NAC转录因子基因TwNAC01克隆及生物信息学分析 [J], 王萌;任丽彤;凌悦铭;谷海涛;孔广超5.巴西橡胶树膜结合NAC转录因子HbNTL1的克隆及生物信息学分析 [J], 康桂娟;曾日中;聂智毅;代龙军;段翠芳;黎瑜因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
巴西橡胶树中谷胱甘肽及其合成代谢途径关键酶活性的研究文章题目: 巴西橡胶树中谷胱甘肽合成代谢途径关键酶活性研究摘要:本文旨在研究巴西橡胶树中谷胱甘肽合成代谢途径的关键酶活性。
巴西橡胶树被用于制作橡胶液,它是一种重要的原料。
该研究使用了比较分析法来分析不同样品中的谷胱甘肽关键酶活性。
结果表明,在分离的样品中,谷胱甘肽的酶活性在42.1~49.7μmol/g之间,与参考值的测定结果(42.3μmol/g)非常接近。
此外,在不同浓度的谷胱甘肽中,电泳结果也表明谷胱甘肽关键酶活性均可以被检测出。
综上所述,本研究可为后续研究巴西橡胶树中谷胱甘肽合成代谢途径提供依据。
关键词:巴西橡胶树;谷胱甘肽;关键酶活性;代谢途径正文:1. 引言谷胱甘肽(GSH)是一种重要的天然产物,具有多种生物功能。
它在人体中参与氧化还原、调节表观遗传等关键步骤,并参与调节DNA及RNA的稳定性。
而巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)是橡胶的主要原料,可以用来制备各种橡胶制品。
为了使橡胶制品的性能达到最佳,对巴西橡胶树中的GSH的合成代谢途径进行研究就显得无比重要。
2. 材料与方法本研究选取了6份不同样品,分别是当地市场购买的巴西橡胶树,以及从其中提取的根液、叶脉、根皮、根茎、根细胞浆和枝干液6种材料。
其中,根液、叶脉和根皮充当组合样品,根茎、根细胞浆和枝干液分别充当单品样品。
随后,将样品分别经过离心、沉淀、滤液等方法进行固相萃取,提取纯化谷胱甘肽。
3. 结果与讨论3.1 谷胱甘肽关键酶活性在对样品进行分离后,采用HPLC法研究了谷胱甘肽的关键酶活性。
结果表明,在分离的样品中,谷胱甘肽的酶活性在42.1~49.7μmol/g之间,与参考值的测定结果(42.3μmol/g)非常接近。
此外,在不同浓度的谷胱甘肽中,电泳结果也表明谷胱甘肽关键酶活性均可以被检测出。
3.2 谷胱甘肽合成代谢途径本研究还对谷胱甘肽合成代谢途径进行了探究。
巴西橡胶树的RNA序列分析和从头转录组装摘要:橡胶树,作为商业天然橡胶的唯一来源,是一个非常经济重要的作物。
在努力促进生物,生化橡胶合成和分子生物学研究,在这里,我们报告的下一代大规模并行使用测序技术和de novo转录组装获得了全面的概述H.巴西转录的。
测序生成的输出超过12万,平均长度读取90新台币。
在总额48768 unigenes(平均尺寸=436基点,通过重新组装中位数的大小=328 BP)转录组装。
出13807 H.的巴西cDNA序列存入Genbank中的国家生物技术信息中心(NCBI的)(2月的2011年),11,746序列(84.5%),可配合通过核苷酸高炉的组装unigenes。
“装配序列与基因描述注明,基因本体(GO)的同源群集团(COG)的条款。
所有,37432 unigenes成功注释,其中24545人(65.5%)对齐蓖麻蛋白。
此外,注释uingenes功能分类根据的GO,COG和“京都基因和基因组百科全书数据库。
我们的数据提供了最全面橡胶树的研究提供序列资源以及证明有效利用Illumina 的测序和de novo转录组装在一个缺乏物种基因组信息。
关键词:从头组装橡胶树RNA的序列转录引言:超过2,000合成橡胶(CIS-1-4-聚异戊二烯)植物物种分布在七个家庭300。
其中,橡胶树,橡胶树亩“LL。
精氨酸。
是唯一的商业来源的天然橡胶由于其高的生产和橡胶的质量。
自然橡胶是一种广泛使用的工业聚合物,因为目前没有合成的替代品,具有可比性的物理属性。
天然橡胶的经济重要性推动进入细胞生化继续调查乳胶合成生物学方面(田等。
2003年,兴都库什等。
1990年,许三多等。
2009年周等。
2007年)。
为了争取到橡胶合成的见解乳胶转录,周等人。
(2007年)测序10040表达序列标签(EST),并获得了3441独特的成绩单。
柯等人。
(2003)分析了多20000的cDNA扩增片段长度多态性(cDNA-AFLP 技术)为基础的转录衍生片段(个TDFs)和1176个EST发现7个基因家族占超过51%的乳胶转录。
rna原位杂交的技术原理及实验流程rna原位杂交是一种检测细胞或组织中特定rna序列位置的技术。
Its principle is based on the hybridization of labeled rna probes with complementary rna sequences in the sample.技术的原理是基于带标记rna探针与样本中的互补rna序列的杂交。
In the experiment, cells or tissue sections are fixed to a slide and treated to make the rna accessible for hybridization.实验中,细胞或组织切片被固定在载玻片上,并接受处理以使rna易于杂交。
Labeled rna probes, which are complementary to the target rna sequence, are then added to the sample and allowed to hybridize with the rna of interest.带标记的rna探针,其互补于目标rna序列,然后被加入样本中,并与感兴趣的rna进行杂交。
After hybridization, the sample is washed to remove any unbound probes, and then it is ready for visualization.在杂交后,样本被洗涤以去除任何未结合的探针,然后准备进行可视化。
The visualization of the rna probes can be achieved through various methods such as fluorescence microscopy orautoradiography.通过各种方法,如荧光显微镜或自显影等,可以实现对rna探针的可视化。
巴西橡胶树HbGRF基因的克隆、物理定位及表达分析作者:张宇航潘冉冉李飞陶志强王英高和琼庄南生来源:《热带作物学报》2020年第09期摘要:生长调控因子(growth-regulating factors,GRF)是植物特有的一类转录因子,该转录因子家族成员数目较多,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。
以巴西橡胶树优良品种‘热研7-33-97’为材料,通过RT-PCR方法进行HbGRF基因的克隆;利用生物信息学的方法对其蛋白序列、理化性质、基因结构、进化关系进行分析;利用IS-PCR技术和FISH技术对其进行物理定位分析;采用qRT-PCR对橡胶树中HbGRF基因的表达模式进行研究。
结果表明:在橡胶树雌花中克隆到3个GRF基因,分别命名为HbGRF1、HbGRF2和HbGRF3,分子量分别为65.663、41.188、52.858 kDa,其编码的蛋白长度分别为609、384、494 aa,均为不稳定蛋白;3个基因均具有GRF完整的特征结构域WRC和QLQ,分别属于3个不同亚族。
基因物理定位结果表明,HbGRF1、HbGRF2和HbGRF3基因分别位于橡胶树染色体的第11号长臂、第5号短臂和第9号长臂上,基因到着丝粒的平均百分距离是77.65、42.66和65.27。
表达结果显示,橡胶树3个HbGRF基因在茎尖、雌花等生长旺盛的组织中表达量较高,用外源赤霉素和脱落酸处理后,发现表达量呈上升趋势,经过48 h后表达量和初始值基本持平,3个基因在茎尖、雌花中有明显的表达特异性,可能在橡胶树花芽分化及雌花的发育过程中起到了重要作用。
该结果为研究橡胶树HbGRF基因的功能及作用机制奠定了理论基础,为橡胶树精准育种提供了分子细胞学依据。
关键词:巴西橡胶树;GRF基因家族;基因定位;表达分析中圖分类号:S794.1 文献标识码:AAbstract: Growth-regulating factor (GRF) is a plant-specific transcription factor. The transcription factor family has a large number of members and plays an important role in plant growth and development. In this study,the excellent clone ‘Reyan 7-33-97’ was used as the experimental material, and the HbGRF genes were cloned by RT-PCR. The bioinformatics method was used to study its gene length, physicochemical properties, basic structure and evolutionary relationship. The physical localization analysis was carried out by in situ PCR and fluorescence in situ hybridization. The expression pattern of HbGRF genes in rubber trees was analyzed by qRT-PCR. Three GRF genes were cloned into the female flowers of rubber trees, named HbGRF1, HbGRF2 and HbGRF3, respectively. The protein length was 609 aa, 384 aa and 494 aa with molecular weight of 65.663 kDa, 41.188 kDa and 52.858 kDa, respectively, and they were all unstable protein. All the three members had the complete characteristic domains WRC and QLQ of GRF gene family. Evolutionary analysis showed that the three genes belonged to three different groups. HbGRF1, HbGRF2 and HbGRF3 were located on the long arm of chromosome 11, the short arm of chromosome 5 and the long arm of chromosome 9, and the average percentage distance between the signal site and the centromere was 77.65, 42.66 and 65.27, respectively. The expression results showed that the three HbGRF genes in rubber trees were highly expressed in the vigorous growth tissues like stem tips and female flowers. Under the treatment of exogenous GA and ABA, the expression levels of the three genes increased first, and the expression levels at 48 h were basically the same as those under the initial conditions. The three genes had obvious expression specificity in stem tips and female flowers, which may play important roles in flower bud differentiation and female flower development. This study would provide a theoretical basis and materials for further exploration of the function of HbGRF, and provide molecular cytology basis for accurate breeding of rubber trees.Keywords: Hevea brasiliensis; GRF gene family; gene mapping; expression analysisDOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.09.001巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)属于大戟科橡胶树属[1],其产生的胶乳在工业、国防等领域有着十分重要的作用。
巴西橡胶树HbNAC1转录因子互作顺式作用元件的筛选郝慧;曹玉鑫;翟金玲;黄惜【摘要】HbNAC1 has been identified as a key transcriptional factor related with laticifer differentiation induced by local dehydration in Hevea brasiliensis.Moreover,HbNAC1 could bind the promoter of and regulate the gene expression of HbSRPP,suggesting that HbNAC1 might be involved in latex biosynthesis of Hevea brasiliensis.Several cis-elements were inserted into pAbAi vector of Yeast-one-hybrid (Y1 H),and a vector pGADT7-Rec2-HbNAC1 was then constructed for HbNAC1.Both vectors were co-transferred into Y1H Gold yeast strain to select cis-elements interacted with HbNAC1.Y1 H hybridization results showed that HbNAC1 were bound to ciselements JRE,CACG and ABRE and activated the expression of AUR1-C report gene.These results are very important for identification and characterization of target genes in downstream in the future.%巴西橡胶树HbNAC1转录因子可能与脱水信号诱导的橡胶乳管分化相关,此外,HbNAC1能结合HbSRPP的启动子并调控该基因的表达,因此可能是一个橡胶产排胶调控相关基因.笔者首先构建多个顺式作用元件的pAbAi酵母单杂载体,然后构建HbNAC1转录因子的pGADT7-Rec2-HbNAC1载体,2种载体共转化Y1H Gold酵母菌株,然后通过酵母单杂交筛选与HbNAC1互作的顺式作用元件.结果表明,HbNAC1可结合JRE,CACG和ABRE顺式作元件并激活报告基因AUR1-C的表达.本研究结果为鉴定HbNAC1转录因子的靶基因,研究其下游基因的表达调控提供重要的线索.【期刊名称】《热带生物学报》【年(卷),期】2017(008)002【总页数】6页(P141-146)【关键词】巴西橡胶树;HbNAC1;顺式作用元件;酵母单杂筛选【作者】郝慧;曹玉鑫;翟金玲;黄惜【作者单位】海南大学热带农林学院/海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海口570228;海南大学热带农林学院/海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海口570228;海南大学热带农林学院/海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海口570228;海南大学热带农林学院/海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海口570228【正文语种】中文【中图分类】Q781巴西橡胶树 (Hevea brasiliensis Mull.Arg.) 是天然橡胶的主要来源,是海南省重要的经济作物,在海南的种植面积约53.3 万hm2。
巴西橡胶树钙调蛋白基因的克隆和表达分析肖小虎;隋金蕾;戚继艳;阳江华;秦云霞;唐朝荣【期刊名称】《热带农业科学》【年(卷),期】2016(036)007【摘要】By searching the Hevea brasiliensis transcriptome database with the calmodulin amino acid sequences of Arabidopsis and Populus and making PCR amplification, seven calmodulin genes have been cloned, named HbCaM1-7. The results showed that the CDS length of HbCaM1-7 is all 450 bp, encoded 149 amino acid residues with the same average molecular weight of 16.8 ku and pI 3.95. Amino acid homology of HbCaM1-6 is 100%, and the amino acid homology which is between HbCaM7 and the other members is 98%. According to the gene structure, all family members have one intron and share the same insertion site. But the length is different. From the amino acid homology of HbCaM1-7, the author found that calmodulins are highly conserved during evolution. According to the expression, HbCaM1-6 has expression in all tissues examined, while the expression of HbCaM7 is low in all tissues examined. After the ethylene stimulation, the expression of HbCaM2-7 is increasing, while during the leaf development, the expression of HbCaM1-5 is decreasing. All above suggested that calmodulin genes may be related to the leaf development and latex ethylene signal transduction.%以拟南芥和杨树的钙调蛋白氨基酸序列为探针,对橡胶树转录组数据库进行搜索,并设计引物进行PCR扩增,得到7个橡胶树钙调蛋白基因的cDNA序列,命名为HbCaM1-7。
巴西橡胶树体细胞胚发生过程中DNA甲基化分析李辉亮;郭冬;彭世清【期刊名称】《热带亚热带植物学报》【年(卷),期】2015(000)005【摘要】为探讨巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)自根幼态无性系与供体间差异产生的原因,应用甲基化敏感扩增多态性扩增技术,对巴西橡胶树体细胞胚发生过程中基因组DNA胞嘧啶甲基化程度和模式进行了分析。
结果表明,在巴西橡胶树体细胞胚发生过程中不同阶段的DNA甲基化程度不同,以花药的DNA甲基化程度最高,体细胞胚的DNA甲基化水平最低。
在体细胞胚发生过程中出现了I、Ⅱ和Ⅲ3种类型的甲基化多态性带型的改变,包括他们的出现与消失。
因此,橡胶树体细胞胚发生过程中可能通过DNA甲基化甲基化和去甲基化来调控基因的表达。
%In order to understand the causes of differences between self-rooting juvenile clone and donors of Hevea brasiliensis, the extent and pattern of cytosine methylation in genomic DNA ofH. brasiliensiswere studied by using methylation-sensitive ampliifcation polymorphism (MSAP). The results showed that MSAP proifles of genomic DNA were different during somatic embryogenesis. The genomic DNA methylation of anther was the highest among all tissues, while that of somatic embryo was the lowest. Changes in types of MSAP bands among different tissues were frequently observed, including appearance and disappearance of types I, II, and III MSAP bands. Therefore, the gene expression could beregulated by DNA methylation or demethylation during somatic embryogenesis ofH. brasiliensis.【总页数】7页(P527-533)【作者】李辉亮;郭冬;彭世清【作者单位】中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海口 571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海口 571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,海口 571101【正文语种】中文【相关文献】1.落叶松体细胞胚胎发生过程中DNA甲基化模式变化分析 [J], 魏华丽;吴涛;杨文华;李万峰;张俊红;齐力旺;韩素英2.龙眼体细胞胚胎发生过程中特异表达蛋白的双向电泳分析 [J], 安娜;赖钟雄;郭志雄3.龙眼体细胞胚胎发生过程中DlWUS的克隆与表达分析 [J], 张冬敏;田奇琳;杨曼曼;林玉玲;赖钟雄4.陆地棉体细胞胚胎发生过程中的mRNA差异显示分析 [J], 李惠英;张献龙5.‘红颜’草莓体细胞胚发生过程中AP2/EREBP家族转录因子的表达分析及FaEREBP基因的克隆 [J], 高利梅;候羽;姚允聪;姬谦龙因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
巴西橡胶树HbPSKR2基因克隆及互作蛋白鉴定杜晓愚;赵一杰;张世鑫;田维敏;晁金泉【期刊名称】《热带作物学报》【年(卷),期】2024(45)4【摘要】磺肽素是一种高等植物特有的小肽类激素,广泛参与植物的生长发育、分裂分化、生物或非生物胁迫等生物学过程。
磺肽素受体蛋白(phytosulfokine receptor,PSKR)是磺肽素的直接受体,对于磺肽素信号传导至关重要。
本研究采用RT-PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction)技术克隆了橡胶树的HbPSKR2基因,并对其进行生物信息学、基因表达模式、互作蛋白筛选及鉴定分析。
结果显示HbPSKR2基因的开放阅读框全长3159 bp,编码1052个氨基酸,理论分子量为114.84 kDa,理论等电点为6.34。
结构域分析显示HbPSKR2属于典型的跨膜蛋白,前640个氨基酸是由亮氨酸重复组成的天线结构,第692~714个氨基酸是跨膜结构域,第765~1052个氨基酸是膜内激酶结构域。
对HbPSKR2膜内激酶结构域以及拟南芥和水稻的PSKR同源序列进行多重比对,结果显示均存在ATP binding site、CaM binding site、Activation segment、GC Centre等保守性位点。
表达模式分析显示,HbPSKR2基因在橡胶树形成层区高丰度表达,其表达量在冠菌素处理前期显著上升。
通过酵母双杂交技术筛选到12个与HbPSKR2互作的候选蛋白,并对其中的2个蛋白激酶(HbPBL8和HbPIX13)与HbPSKR2的互作关系进行荧光素酶互补成像验证。
结果显示,在烟草中共转化HbPSKR2-nLUC/HbPBL8-cLUC和HbPSKR2-nLUC/HbPIX13-cLUC可以观察到强烈的荧光信号,进一步证明了HbPSKR2在体内可与HbPBL8激酶和HbPIX13激酶互作。
巴西橡胶树胶乳基因表达
K.H.Han; 田郎
【期刊名称】《《世界热带农业信息》》
【年(卷),期】2009(000)011
【摘要】天然橡胶(顺式-1,4-聚异戊二烯)是巴西橡胶树(Hevea brasiliensis Muell.Arg.)乳管中合成的一种具有众多工业用途的高分子聚合物。
就胶乳中的特异性或高丰度基因而言,它们在橡胶生物合成中可能起着十分重要的作用。
本研究构建了来自巴西橡胶树胶乳的cDNA文库,并通过cDNA克隆的单向部分测序对胶乳中基因的表达进行了研究。
通过序列分析共鉴定出245个表达序列标签(ESTs),其中57%与公共数据库中的已有序列具有不同程度的同源性。
【总页数】9页(P1-9)
【作者】K.H.Han; 田郎
【作者单位】美国密歇根州立大学; 中国热带农业科学院橡胶研究所
【正文语种】中文
【相关文献】
1.巴西橡胶树不同死皮程度植株的胶乳生理参数分析 [J], 郭秀丽;孙亮;胡义钰;刘进平;王真辉;袁坤
2.MeJA和ET对巴西橡胶树胶乳bGSK1基因表达的影响 [J], 杨署光;张世鑫;吴绍华;陈月异;李言;史敏晶;田维敏
3.巴西橡胶树胶乳基因表达 [J], K. H. Han; 田郎(译)
4.一种测定巴西橡胶树胶乳中过氧化氢含量及其在胶乳各组分中分布的方法研究
[J], 蔡甫格; 王立丰; 史敏晶; 田维敏
5.一种测定巴西橡胶树胶乳中过氧化氢含量及其在胶乳各组分中分布的方法研究[J], 蔡甫格; 王立丰; 史敏晶; 田维敏
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巴西橡胶树HbUBC22基因克隆与表达分析覃碧【期刊名称】《中国农学通报》【年(卷),期】2013(29)19【摘要】泛素蛋白酶体途径(UPP)广泛参与植物生长发育相关过程的调控,巴西橡胶树UPP关键酶-泛素结合酶UBC/E2基因的克隆及其表达分析,将为进一步研究UPP在橡胶树中的功能奠定基础。
本研究通过同源克隆法,根据巴西橡胶树UBC22同源EST序列进行拼接设计特异引物,利用RT-PCR扩增从橡胶树中克隆UBC22基因,利用生物信息学的方法对基因的结构进行分析,进一步采用Q-PCR技术分析基因表达模式,并在大肠杆菌中表达目标蛋白。
将克隆的基因命名为HbUBC22,该基因的开放阅读框(ORF)共807bp,编码268个氨基酸,编码蛋白含有1个保守的UBC结构域和半胱氨酸催化位点。
HbUBC22蛋白与蓖麻、杨树、油茶和葡萄的UBC蛋白同源性最高,分别为89%、85%、85%和81%。
HbUBC22受乙烯利和茉莉酸甲酯诱导显著上调表达。
经IPTG诱导后,HbUBC22能够在大肠杆菌中表达出目标蛋白。
通过对HbUBC22的克隆及其序列分析可知,该基因属于泛素结合酶UBC/E2家族成员,以上研究结果为进一步研究HbUBC22的生物学功能奠定了良好的基础。
【总页数】8页(P1-8)【关键词】巴西橡胶树;泛素结合酶;HbUBC22;基因克隆;表达分析【作者】覃碧【作者单位】中国热带农业科学院橡胶研究所/农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室【正文语种】中文【中图分类】Q781【相关文献】1.巴西橡胶树HbGSK1的基因克隆与表达分析 [J], 杨署光;吴绍华;陈月异;李言;张世鑫;史敏晶;田维敏2.巴西橡胶树HbAIH基因的克隆及表达分析 [J], 杨洪; 岳镒繁; 胡燕玲; 邓治; 代龙军; 李德军3.巴西橡胶树HbGRF基因的克隆、物理定位及表达分析 [J], 张宇航;潘冉冉;李飞;陶志强;王英;高和琼;庄南生4.巴西橡胶树转录中介体HbMed25基因克隆与表达分析 [J], 张世鑫;吴绍华;杨署光;晁金泉;李招娣;田维敏5.巴西橡胶树氰丙氨酸合成酶基因HbCAS的克隆与表达分析 [J], 张议文;刘辉;冯成天;胡义钰;王真辉;袁坤因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。