酶工程
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名词解释1。
酶工程:又叫酶技术,是酶制剂的大规模生产和应用的技术。
2。
自杀性底物:底物经过酶的催化后其潜在的反应基团暴露,再作用于酶而成为酶的不可逆抑制剂,这种底物叫自杀性底物??3.别构酶;调节物与酶分子的调节中心结合后,引起酶分子的构象发生变化,从而改变催化中心对底物的亲和力,这种影响被称为别构效应,具有别构效应的酶叫别构酶4。
诱导酶:有些酶在通常的情况下不合成或很少合成,当加入诱导物后就会大量合成,这样的酶叫诱导酶5。
Mol 催化活性:表示在单位时间内,酶分子中每个活性中心转换的分子数目6。
离子交换层析9比活力11葡萄糖效应13产酶动力学15双向凝胶电泳20固定化细胞21酶化学修饰1.酶的转换数:酶的转换数Kp.又称为摩尔催化活性,是指每个酶分子每分钟催化底物转化的分子数.2.酶的催化周期:酶进行一次催化所用的时间。
3.固定化酶的比活力:指每克干固定化酶所具有的6活力单位数,它是酶制剂纯度的一个指标。
4.抗体酶:又称催化行抗体。
是一类具有生物催化功能的抗体分子。
抗体是由抗原诱导产生的抗原特异结构免疫球蛋白,要使机体具有生物催化功能,只要在抗体的可变区赋予酶的催化特性,以及酶的高效催化能力。
是通过人工设计采用现代生物技术而获得的一类新的生物催化剂,有些是自然界原本不存在的。
5.端粒酶:是一种核酸核蛋白,包含蛋白质和RNA两种基本成分.其RNA组分包含有构建端粒的重复序列的核苷酸摸板序列,在合成端粒的过程中,端粒酶以其本身的RNA组分为摸板把端粒的重复序列加到染色体DNA的末端上,使端粒延长。
6.核酶:核酸类酶。
为一类具有生物催化功能的核糖核酸分子。
它可以催化本身RNA剪切或剪接作用,还可以催化其他RNA,DNA多糖,酯类等分子进行反应。
7.KS分段盐析:指在一定温度和PH值条件下,通过改变离子强度使不同的酶和蛋白质分离的方法.8.B分段盐析:指在盐和离子强度条件下,通过改变温度和PH使不同的酶或蛋白质分离的方法.9.凝胶层析:又称凝胶过滤,分子排阻层析,分子筛层析等。
第一章绪论酶工程:酶的生产、改性和应用的技术过程。
酶的生产(enzyme production):通过各种方法获得人们所需的酶的技术过程,主要包括微生物发酵产酶、动植物培养产酶和酶的提取与分离纯化等。
酶的改性(enzyme improving ):通过各种方法改进酶的催化特性的技术过程,主要包括酶分子修饰、酶固定化、酶非水相催化和酶定向进化等。
酶的应用(enzyme application):通过酶的催化作用获得人们所需的物质或者除去不良物质的技术过程,主要包括酶反应器的选择与设计以及酶在各个领域的应用等。
酶工程的主要内容包括微生物细胞发酵产酶,酶的提取与分离纯化,酶分子修饰,酶、细胞和原生质体固定化,酶的非水相催化,酶反应器和酶的应用等。
酶工程的主要任务是经过预先设计,通过人工操作,获得人们所需的酶;并通过各种方法使酶充分发挥其催化功能。
酶是一类具有催化功能的生物大分子,亦称生物催化剂。
酶的分类:1、氧化还原酶(oxidoreductase)2、转移酶(transferase)3、水解酶(hydrolase)4、裂解酶(或裂合酶lyase)5、异构酶(isomerase)6、合成酶(synthease)或连接酶(ligase)酶的催化特性:高效性、高度专一性、反应条件温和且活力可调节影响酶催化反应速率的因素:底物浓度的影响,酶浓度的影响,pH、温度的影响,抑制剂的影响,激活剂的影响米氏方程式:[S]:底物浓度V:不同[S]时的反应速度V max:最大反应速度(maximum velocity)Km:米氏常数(Michaelis constant)米氏常数Km的意义:☐重要特征物理常数,与酶浓度无关。
不同的酶具有不同K m值☐物理意义:Km等于酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度。
☐Km值只是在固定的底物,一定的温度和pH条件下,一定的缓冲体系中测定的,不同条件下具有不同的Km值。
☐K m值近似等于[ES]的解离常数,可表示酶与底物之间的亲和力:K m值大表示亲和程度小,酶的催化活性低; K m值小表示亲和程度大,酶的催化活性高☐从k m可判断酶的专一性和天然底物。
酶工程:又称酶工艺,是围绕酶所特有的催化性能使其在工业、农业医疗保健事业及其其它各方面发挥作用的应用技术,主要为酶制剂的生产和应用。
酶工程的主要内容:1酶的发酵和产2酶的分离纯化3酶和细胞的固定化4酶的分子修饰5酶的发应动力学和反应器6酶电板/酶传感器7酶的应用8有机介质中的酶反应9抗体酶,人工酶和模拟酶使用微生物进行酶生产时,利用微生物的优点:1微生物的种类多,酶种丰富,菌株易诱变2微生物生长繁殖快,易提取酶3培养基价格便宜,微生物培养不受季节,地理限制4发酵生产易自动控制5易获得工程菌,提高酶产率,开发新酶培养基营养成分:碳源,氮源,无机盐,微量元素,生长因子,产酶促进剂发酵条件对产酶的影响因素:温度,PH,通气量,搅拌,泡沫,湿度提高酶产量的方法:1选育优良的产酶细胞株系2添加诱导物3控制阻遏物浓度4添加表面活性剂5添加产酶促进剂提高植物细胞产物产量的途径:1选择高产出的细胞株2代谢途径的调节3控制细胞生长和分化程度4诱导物或加入前体5两相培养及次生产物的释放6毛状根(发根)培养技术酶发酵动力学:研究在发酵过程中细胞生长速度,产物生成以及环境因子对这些速度的影响。
酶的分离纯化:包括三个基本环节:一是抽提,即把酶从材料转入溶剂中来制成酶溶液;二是纯化,即把杂质从酶溶液中除掉或从酶溶液中把酶分离出来;三是制剂,即将酶制成各种剂型。
三个基本原则:1、注意防止酶的变性失活:(1)除少数情况外,所有操作必须在低温下进行,特别是有机溶剂存在时更要特别小心;(2)大多数酶在PH<4或PH>10的条件下不稳定,故不能过酸过碱(3)酶溶液常易形成泡沫而使酶变性,故应防止泡沫的形成(4)重金属能引起酶失活,有机溶剂能使酶变性,微生物污染,蛋白质使酶变性,都必须予以防止2、酶的分离纯化的目的是将酶以外的所有杂质尽可能除去,因此,在不破坏所需酶的条件下,可使用各种“激烈”手段。
此外,由于酶和它的底物,抑制剂等具有亲和性,当这些物质存在时,酶的理化性质和稳定性发生了一定变化,从而提供了更多条件和方法可供采用3、酶具有催化活性,检测酶活性,跟踪酶的来龙去脉,为选择适当的方法和条件提供了直接依据。
第三章酶工程第一节概述酶工程简介生物工程包括四大技术体系:基因工程,细胞工程,酶工程和发酵工程。
基因工程不是一个独立的生产技术,通过基因工程可以改变生物的产酶量和酶系,真正发挥工业效益的还是发酵工程和酶工程。
酶工程是酶学研究发展和工程学相互渗透、结合,发展成一门新的技术科学—酶工程。
酶工程是工业上有目的的设计一定的反应器和反应条件,利用酶的催化功能,在常温常压下催化化学反应,生产人类需要的产品或服务于其他目的的一门应用技术。
酶工程这一术语出现在20世纪60年代末和70年代初,1971年召开了第一次国际酶工程会议:当时研究的范围包括酶的生产(包括微生物酶的发酵提取及从动植物中提取酶的技术、酶的固定化技术、酶的化学修饰、酶动力学研究、酶反应器的设计和应用及酶在医学、工业、农业、食品等方面的应用)近些年又增加了一些新的内容:酶的化学修饰:通过化学修饰(在分子水平上用化学方法对),提高酶的稳定性、改变其作用专一性或者最是反应条件,增加其稳定性,消除其抗原性(指某些酶能在体内诱导产生抗体而失活)。
模拟酶:根据酶的原理,用人工方法合成具有活性中心和催化作用的非蛋白质结构的化合物。
抗体酶:由于抗体和酶均属于蛋白质,两者都有求于互补性物质,具有相似性,前者结合的是直接的,后者的结合是过渡态的。
抗体酶是将类似酶反应中过渡态结合物注入动物体所诱发出来的一种抗体。
核酸酶:具有催化活性的RNA。
有机相酶反应:极端条件下进行得反应,可以改变某些酶的性质,两种方式:1 在水-水不容的有机溶剂双相体系中反应,底物在水和有机溶剂中溶解度大,产物在有机溶剂中溶解度大;2 采用形成反胶束的方式进行,即酶的水溶液都在表面活性剂的作用下在有机相中形成“油包水”的乳浊液,底物要求是能溶于有机相。
酶标免疫反应:酶传感器:生物传感器中的一类,一般包括两部分,1 固定化酶膜,膜允许被测小分子物质进入膜内,而固定在膜内侧的酶则不能泄到膜外;另一部分是基本传感器,酶膜即覆盖在其上。
第五章酶分子修饰
酶分子修饰:通过各种方法使酶分子的结构发生某些改变,从而改变酶的催化特性的技术过程称为酶分子修饰。
酶分子的修饰方法
(1) 酶的金属离子置换修饰:把酶分子中的金属离子换成另一种金属离子,使酶的催化特性发生改变的修饰方法称为金属离子置换修饰。
金属离子置换修饰的过程:
a.酶的分离纯化:首先将欲进行修饰的酶经过分离纯化,除去杂质,获得具有一定纯度的酶液。
b. 除去原有的金属离子:在经过纯化的酶液中加入一定量的金属螯合剂,如乙二胺四乙酸(EDTA)等,使酶分子中的金属离子与EDTA等形成螯合物。
通过透析、超滤、分子筛层析等方法,将EDTA-金属螯合物从酶液中除去。
此时,酶往往成为无活性状态。
c.加入置换离子:于去离子的酶液j中加入一定量的另一种金属离子,酶蛋白与新加入的金属离子结合,除去多余的置换离子,就可以得到经过金属离子置换后的酶。
用于金属离子置换修饰的金属离子,一般都是二价金属离子。
金属离子置换修饰的作用:
1.阐明金属离子对酶催化作用的影响
2.提高酶的催化效率
3.增强酶的稳定性
4.改变酶的动力学特性
(2) 酶的大分子修饰:采用水溶性大分子与酶的侧链基团共价结合,使酶分子的空间构象发生改变,从而改变酶的催化特性的方法。
目前应用最广泛
共价修饰:修饰剂用可溶性大分子,如聚乙二醇、右旋糖苷、肝素等,通过共价键连接于酶分子表面,形成一层覆盖层
酶的大分子修饰作用:
1.通过修饰可以提高酶的催化效率
2.通过修饰可以增强酶的稳定性
怎么增强:用不溶于水的大分子与酶结合制成固定化酶;
用不溶于水的大分子与酶分子共价结合进行分子修饰,可以在酶分子外围形成保护层,起到保护酶的空间构象的作用,从而增加酶的活性。
3.通过修饰降低或消除酶蛋白的抗原性
(3) 侧链基团修饰:采用一定的方法(一般为化学法)使酶的侧链基团发生改变,从而改变酶分子的催化特性的修饰方法。
侧链基团是指组成蛋白质的氨基酸残基上的功能团。
主要包括氨基、羧基(碳二亚胺)、巯基、胍基、酚基、咪唑基、吲哚基、分子内交联修饰。
分子内交联修饰:采用双功能基团化合物(又称双功能试剂),与在酶分子中相距较近的两个侧链基团之间形成共价交联,从而提高酶的稳定性的修饰方法称为分子内交联修饰。
常用的双功能试剂戊二醛
(4)肽链有限水解修饰(酶蛋白主链修饰):在肽链的限定位点进行水解,使酶的空间结构发生某些精细的改变,从而改变酶的催化特性的方法。
(5)核苷酸链剪切修饰:在核苷酸链的限定位点进行剪切,使酶的结构发生改变,从而改变酶的催化特性的方法。
(6) 氨基酸置换修饰:将酶分子肽链上的某一个氨基酸换成另一个氨基酸,从而改变酶的催化特性的修饰方法。
作用:1、通过修饰可以提高酶的催化效率
2、通过修饰可以增强酶的稳定性
3、通过修饰可以使酶的专一性发生改变
现在常用的氨基酸置换修饰的方法是定点突变技术,用于酶分子修饰的主要过程:新的酶分子结构的设计
突变基因碱基序列的确定
突变基因的获得
新酶的获得
(7)核苷酸置换修饰:将酶分子核苷酸链上的某一个核苷酸置换成另一个核苷酸,从而改变酶的催化特性的修饰方法。
(8) 物理修饰:特点:不改变酶的组成单位及其基团,酶分子中的共价键不发生改变,只是在物理因素的作用下,副键发生某些变化和重排,使酶分子的空间构象发生某些改变。
5.酶修饰后的性质变化
热稳定性:一般来说,热稳定性有较大的提高。
抗原性:比较公认的是PEG和人血清白蛋白在消除酶的抗原性上效果比较明显。
各类失活因子的抵抗力:修饰酶对蛋白酶、抑制剂均有一定的抵抗能力,从而提高其稳定性。
半衰期:一般在体内的半衰期得到有效延长。
最适pH:大部分酶经化学修饰后,酶的最适pH发生了变化,修饰酶最适pH更接近于生理环境。
Km的变化:大多数酶经修饰后,Vm没有明显变化,但有些酶经修饰后,Km值变大。
6.酶的定向进化:又称实验分子进化,属于蛋白质的非合理设计,它不需事先了解酶的空间结构和催化机制,通过人为地创造特殊的条件,模拟自然进化机制(随机突变、重组和自然选择),在体外改造酶基因,并定向选择出所需性质的突变酶。
定向进化的原理:在待进化酶基因的PCR扩增反应中,利用Taq DNA聚合酶不具有3’->5’校对功能的性质,配合适当条件,以很低的比率向目的基因中随机引入突变,构建突变库,凭借定向的选择方法,选出所需性质的优化酶(或蛋白质),从而排除其他突变体。
定向进化的基本规则是“获取你所筛选的突变体”。
7.DNA改组和外显子改组
DNA改组又称有性PCR(sexual PCR):该策略的目的是创造将亲本基因群中的突变尽可能组合的机会,导致更大的变异,最终获取最佳突变组合的酶。
通过DNA改组, 不仅可加速积累有益突变,而且可使酶的2个或更多的已优化性质合为一体。
外显子改组:类似于DNA改组,两者都是在各自含突变的片段间进行交换,前者尤其适用于真核生物。
在自然界中,不同分子的内含子间发生同源重组,导致不同外显子的结合,是产生新蛋白质的有效途径之一。
与DNA改组不同,外显子改组是靠同一种分子间内含子的同源性带动,而DNA改组不受任何限制,发生在整个基因片段上
8.定向进化的选择策略:
(1)定向进化中,突变具有随机性,但通过选择特定方向的突变限定了进化趋势,加之控制实验条件,限定突变种类,降低突变率,缩小突变库的容量,这不仅减少了工作量,更重要的是加快了酶在某一方向的进化速度。
(2)通常,筛选方法必须灵敏,至少与目的性质相关。
另有一些其他的筛选方法,如加入能产生可见光信号的底物或利用绿色荧光蛋白的荧光性质等。