一个水稻多柱头突变体的形态特征和基因定位
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作物学报ACTA AGRONOMICA SINICA 2012, 38(1): 168-173 /zwxb/ ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@本研究由国家自然科学基金项目(31071072)和重庆市重大攻关项目(CSTC, 2010AA1013)资助。
*通讯作者(Corresponding author): 赵芳明, E-mail:zhaofangming2004@第一作者联系方式: E-mail: duqing2863@Received(收稿日期): 2011-05-19; Accepted(接受日期): 2011-09-18; Published online(网络出版日期): 2011-11-07. URL: /kcms/detail/11.1809.S.20111107.1552.019.htmlDOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.00168水稻叶尖早衰突变体lad的形态、生理分析与基因定位杜 青 方立魁 桑贤春 凌英华 李云峰 杨正林 何光华 赵芳明*西南大学水稻研究所 / 转基因植物与安全控制重庆市市级重点实验室, 重庆400716摘要: 叶片作为植物的主要光合作用场所, 研究其早衰机制对提高作物的经济产量具有非常重要的意义。
本研究报道了一个来自EMS诱变优良恢复系缙恢10号的新水稻叶尖早衰突变体lad (leaf apex dead), 其叶尖在第5片叶抽出前呈正常状态, 当第5叶完全抽出之后前5叶的叶尖变黄并最终枯死; 随后的叶子在完全抽出后, 叶尖也逐渐变黄并枯死。
对该突变体的生理生化分析发现, 其叶绿素含量、可溶性蛋白含量明显下降, SOD酶活性异常。
其株高、叶长、粒数等也都显著降低。
经遗传分析, 该突变性状受1对隐性单基因控制, 利用分子标记将该基因定位于第11染色体SSR标记SWU11-19和SWU11-5之间, 遗传距离为13 cM, 并且与SSR标记SWU11-25和SWU11-27共分离。
588中国水稻科学(icc)第2ChnJRieSi3卷第6期(09年u月)202000,2():1519237-7.13.02[1Naaa1]gswaN,Mioh,SnysiMaoY,eaDeuaeoht1Lrgltsbt.lansidvlpetiieRieGeews19efadpitleeomnnrc.cntNel,96,13:121500.[onH,YamooT,Ssk2]LiXmataaiT,e1Chrcejainadta.aatztonrdtcinopsaiitrcinf3QTseetfitneatsoL,Ha,Hcnoetcolcad2H幽,cntolgedndtircuigerysgncorlihaigaeniesnnalioein[2罗伟,1]胡江,孙川i,等.水稻抽穗期功能叶叶型相关性le.ThoisnerApplGee,20nt00,1:12—08.010112kwaTktmiS,e1ta.Phohoeofrytermscne[1zwaT,Oia,Touo2]Iatepooeidcotoofornirc(ahtdyhhtproicnrlflweigniesor—a状遗传分析.分子植物育种,20,65:838008()5—6.[3u—ci,Atuh1]JnIhIssiH,HiedmiK,ea.Arcsiehtr—t1eeseeovcrncmuain,patcod,sotnstepatcrnadhoittolsohrrhrehlsohoneogtstevgttvhsnrc.PlnllnaeheeaiepaeiieatCel,1998,10:115.51121pa)Plnlnt.atJ,2000,25:3139.2()9—9[2邬亚文,于永红,胡国成,等.一个新的水稻生育期延迟T—2]DNA插入突变体.作物学报,20,3()1111.0628:11-16[4L1]iK,Pno,Sasl,e1dnictnozisnSRMtneJWta.Ietiiffaoqaiaierioi(unttvtatctlQTLs)fredndtapaohaigaendlnthihncliaeie(yastv)TherApnegtiutvtdrcOrzaiaL..oplGe—e,19t95,91343.:7—81[3杨瑶君,汪旭东,吴先军,等.水稻显性早熟材料D6B的发2]4现、传分析和分子标记定位.遗传学报,20,3()9—遗0525:45500.[4St,Haah2]aoYIysiK.Teeeicnrlfhaivgthntotooebsceeagcttrhaeialauigntvievreisiepsnerymtrnaiercaite.Jped—nJBreig,18n95,35:10l66一6.[5林鸿宣,钱惠荣,振民,等.几个水稻品种抽穗期主效基因1]熊与微效基因的定位研究.遗传学报,19,33:2523962()0—1.[6罗林广,虎渠,万建民.水稻抽穗期的遗传学研究.江苏农1]翟业学报,20,1()12.0172:1916[5邓晓建,周开达,仁端,等.水稻完全显性早熟基因的发现2]李和定位.中国农业科学,0143:232920,3()3—3.[7李1]平,陆朝福,周开达,.利用RL等FP标记定位水稻重要[6郭龙彪,储成才,2]钱前.水稻突变体与功能基因组学.植物农艺性状的主效基因与微效基因.中国科学:辑,19,2C966():272335-6.学通报,20,33062:11.[7XuY,XigYZ,egXY,e12]eWnWnt.NauavrtniatrlaiinaoGhdsampratrguaofhaigdtnilotn7iniotneltroednaeadyedpe—tanrc.Nant,20i1iietGee08,40:76.6177[8YamooT,LnH,Ssk1]matiaaiT,e1dnictnoedt.IetiifhaafaoigdtuntaietatlcdnhrceiainotnaeqaitvriousH6adcaatrzt0fisteittcieatospsaintrcinwihtHiiesndacdaknrcuigavnebc—YtrymaKta.eefcsohum[8i,KaoH,Maua,e1Thfetntecl2]0glntnhigooccaatrasdbedrigeghadterarnmihrcescueysmiwafncosprgn.Geeis00,14:88—9.rsoeyntc,205581[9n,HauhmaY,Naar15YaoMrsigmuaY,ea.Ietiainot1dnictffoqatttvrioiotolghaigdtnrcuigauniietatcalcnrlnednaeiiesnihg—estnaema.ThoApplGeeihdniylkgpiernt,1997,95:1205gnsates-lcsiieYpnJeethd1ounrc.Bren,19edig93,48:272567.欢迎订阅2100年《子植物育种》分《子植物育种》一份为转基因育种、子标记辅助育种及常规育种服务的科学杂志,是中国唯一的一份以育种为名的分是分也科学杂志。
RMD水稻突变体信息及基因型鉴定1.背景介绍:突变体对于遗传学研究有着重要作用,随着拟南芥和水稻等物种全基因组测序的开展,人类积累了前所未有的基因序列信息,为了弄清这些基因序列的生物学信息,寻找该基因区段序列发生变异的突变体是阐释基因功能最直接最有效的方法。
植物在自然的环境条件下也会产生突变性状,早期普通正向遗传学研究往往通过寻找与某种生物学特性相关的突变体来发掘或定位某个特定基因。
为配合植物功能基因组研究高通量的策略,构建水稻等物种的大型突变体库已成为必然,借助水稻全基因组测序信息、通过反向遗传学的手段大规模地筛选突变体库,理论上可以获得基因组中任一基因的突变体,最终实现阐释基因功能的目的。
2.原理:2.1农杆菌介导的T-DNA 插入农杆菌是寄主范围非常广泛的土壤杆菌,它能通过伤口侵染植物导致冠瘿瘤和毛状根的发生。
1974从根癌农杆菌中分离出一种与肿瘤诱导相关的质粒,称为致瘤质粒(Tumor-inducing plasmid),简称Ti 质粒。
Ti 质粒上存在一段DNA,能够转移并整合到植物基因组中,称为Transferred DNA,简称T-DNA。
研究发现,T-DNA 两端存在非常保守的同向重复的25bp 序列,分别称为左边界(LB)和右边界(RB)。
T-DNA 的转移只与边界序列相关,尤其是RB,而与T-DNA区段的其它基因或序列无关。
我们将T-DNA 区段上的致瘤基因和其它无关序列去掉,利用其转移的特性,实现农杆菌介导的T-DNA 转入水稻愈伤,从而构建水稻突变体库。
大量研究表明,农杆菌T-DNA 整合到植物基因组中的位置是随机的,并且整合到植物基因组中的T-DNA 能稳定遗传。
由于插入到植物基因组中的T-DNA 区段序列已知,这样随机插入到植物基因组中的T-DNA类似于给植物基因“贴”了一个序列标签。
我们利用这个标签,通过各类PCR技术最终可以获取其插入的位点。
2.2 水稻Tos17 反转录转座子创造水稻突变体的另一种方法是利用植物的反转录转座子,它们是以DNA→RNA→DNA 的方式进行转座,在水稻上已发现大约40 种长未端重复的反转录转座子,它们是Tos1-Tos32,RIRE1-RIRE8,其中5 类被证明是有转座活性的,分别是Tos10、Tos17、Tos19、Tos25 和Tos27。
一个水稻生殖发育突变体的遗传分析及基因定位的开题报告题目:一个水稻生殖发育突变体的遗传分析及基因定位研究背景:水稻是全球重要的粮食作物之一,其生殖发育过程对其产量和品质具有重要影响。
研究水稻生殖发育的突变体对于解析其相应调控机制,提高水稻产量和品质具有重要意义。
研究目的:本研究旨在通过遗传分析和基因定位,解析一个水稻生殖发育突变体的相应调节机制,为水稻产量和品质的提高提供理论支持。
研究内容:1. 突变体的鉴定和表型分析利用突变体与野生型品种进行比较分析,观察突变体在水稻生长发育过程中的表现和性状变化。
2. 遗传分析利用突变体和野生型进行杂交,分析突变体的遗传特性和遗传方式,确定突变体的基因型。
3. 基因定位通过SNP标记和基因组测序技术,对突变体的基因位置进行定位,筛选可能的候选基因,进一步确认突变体基因。
4. 基因功能分析通过基因克隆、表达、转基因等技术,对突变体基因进行功能分析,深入探究突变体基因对水稻生殖发育的影响。
研究意义:本研究可以为水稻生殖发育的相应调控机制提供新的线索,为水稻产量和品质的提高提供理论支持。
同时,本研究也为其他植物遗传分析和基因定位研究提供参考。
研究方法:本研究主要采用突变体、野生型品种杂交、表型和基因定位等分析方法,同时结合基因克隆、表达、转基因等技术对突变体基因进行功能分析。
预期结果:本研究预计能够最终确认突变体基因,并从基因水平上解析水稻生殖发育调控机制,为水稻产量和品质提高提供理论支持。
结论:本研究有望从遗传和基因水平上揭示水稻生殖发育调控机制,为水稻产量和品质提高提供理论基础,并为其他作物遗传分析和基因定位研究提供参考。
一个水稻株高突变体的遗传分析与基因定位的开题报告尊敬的指导老师:我是一名本科生,在您的指导下将进行一个有关水稻亲本遗传分析与基因定位开题报告。
我的课题研究是针对水稻株高突变体的遗传特性进行分析和研究。
以下是我的开题报告。
1. 研究背景水稻是全球最重要的农作物之一,也是许多人口众多的发展中国家主要的口粮作物。
然而,由于人口不断增长以及气候变化的影响,保持水稻产量的稳定也越来越困难。
因此,在改良和提高水稻品质和产量方面进行研究和开发是至关重要的。
株高是一个重要的农艺性状,对水稻产量和品种筛选具有重要意义。
2. 研究目的通过遗传分析和基因定位的手段,深入了解水稻株高突变体的遗传特性,以确定影响株高的相关基因、基因座和QTL,为后续的育种研究提供更多有价值的信息。
3. 研究方法首先,将突变株材料与其亲本材料进行杂交,以获得F1代。
其次,通过后代的株高测量和统计分析,确定突变株和亲本株之间的株高差异。
然后,从突变株和亲本株中各选择若干个代表性个体,进行DNA取样和测序。
根据测序结果,以突变株为参照,分别对突变株和亲本株进行SNP等位基因分型,并进行遗传分析和统计评估。
最后,采用基因定位的分子标记辅助方法,进行株高QTL的定位和分析,鉴定株高相关基因或基因座。
4. 研究意义通过对水稻株高突变体的遗传分析和基因定位,可以更全面深入地了解水稻株高形成和调控机制,对相关遗传育种研究提供更多的理论支持和实践指导。
有助于促进水稻的品种改良和产量提高,同时也有助于补充和完善相关基因组和遗传图谱的信息。
5. 研究难点和挑战水稻具有复杂基因型、多基因控制和基因与环境互作影响等特点,因此在遗传分析和QTL定位的过程中,需要克服数据量大、分析复杂、分辨率低、错误率高等难点和挑战。
以上是我初步的开题报告,请您审阅并指导,谢谢。
一份水稻花器官突变体的形态发生、性状遗传分析及相关基因的分子标记定位水稻(Oryza sativa L.)属于单子叶植物,是发育分子生物学研究领域中常用的一种模式植物,同时也是世界上最重要的粮食作物之一,其花器官发育的结果直接影响稻谷产量和品质,因此对其花器官发育的研究有着深远的意义。
目前,由于在水稻中发现的花器官突变体很少,所以对水稻花发育的研究主要是利用双子叶植物MAS-box基因的保守序列设计引物,在水稻基因组或者cDNA文库中筛选与双子叶植物花器官发育相对应的MADS基因,因为同源异型基因的突变与花器官的变异是直接对应的关系,所以突变体的应用是当前功能基因组学的发展方向。
本文对一份从水稻双胚苗体系中自然分化出来的突变体进行了研究。
该突变体是了解水稻花发育特别是雌蕊中子房、柱头发育的良好材料。
作者进行了突变体的形态解剖研究、突变形状的遗传分析及相关基因的分子标记定位研究,获得了如下结果:1突变体形态结构特征:突变体的生殖发育受到明显的影响,主要表现在抽穗过程缓慢,有的甚至整个生殖周期内都无法抽出。
枝梗分枝稀疏,次级枝梗与主梗之间的角度明显,顶端有不同程度的卷曲,整个穗部由下至上着生小花的数目逐渐减少。
突变体花器官变异程度不一,内稃退化和外稃严重弯曲使得二者无法闭合,颖花内部结构外露,突变体颖花的浆片同源转化为类内稃的结构;雄蕊部分或全部转化为雌蕊,不完全转化雄蕊通常下部为类心皮组织上部则是类柱头的羽毛状结构。
颖花通常只含有一个发育完全的雌蕊结构,而同源异型转化的雌蕊发育是不完全的,不能形成完整的胚囊结构,通过调查证明该突变体不能结实。
2突变体形状的遗传分析:用突变体做父本,分别以93-11、蜀恢527、日本晴为母本配制杂交组合进行遗传分析。
所有杂交组合F<sub>1</sub>代株系均表现正常亲本的表性。
根据F<sub>2</sub>代表型及x<sup>2</sup>测验表明,正常植株与突变体的比例符合一对基因控制的分离比3:1,说明该突变性状是受一对隐性基因控制。
RMD水稻突变体信息及基因型鉴定1.背景介绍:突变体对于遗传学研究有着重要作用,随着拟南芥和水稻等物种全基因组测序的开展,人类积累了前所未有的基因序列信息,为了弄清这些基因序列的生物学信息,寻找该基因区段序列发生变异的突变体是阐释基因功能最直接最有效的方法。
植物在自然的环境条件下也会产生突变性状,早期普通正向遗传学研究往往通过寻找与某种生物学特性相关的突变体来发掘或定位某个特定基因。
为配合植物功能基因组研究高通量的策略,构建水稻等物种的大型突变体库已成为必然,借助水稻全基因组测序信息、通过反向遗传学的手段大规模地筛选突变体库,理论上可以获得基因组中任一基因的突变体,最终实现阐释基因功能的目的。
2.原理:2.1农杆菌介导的T-DNA 插入农杆菌是寄主范围非常广泛的土壤杆菌,它能通过伤口侵染植物导致冠瘿瘤和毛状根的发生。
1974从根癌农杆菌中分离出一种与肿瘤诱导相关的质粒,称为致瘤质粒(Tumor-inducing plasmid),简称Ti 质粒。
Ti 质粒上存在一段DNA,能够转移并整合到植物基因组中,称为Transferred DNA,简称T-DNA。
研究发现,T-DNA 两端存在非常保守的同向重复的25bp 序列,分别称为左边界(LB)和右边界(RB)。
T-DNA 的转移只与边界序列相关,尤其是RB,而与T-DNA区段的其它基因或序列无关。
我们将T-DNA 区段上的致瘤基因和其它无关序列去掉,利用其转移的特性,实现农杆菌介导的T-DNA 转入水稻愈伤,从而构建水稻突变体库。
大量研究表明,农杆菌T-DNA 整合到植物基因组中的位置是随机的,并且整合到植物基因组中的T-DNA 能稳定遗传。
由于插入到植物基因组中的T-DNA 区段序列已知,这样随机插入到植物基因组中的T-DNA类似于给植物基因“贴”了一个序列标签。
我们利用这个标签,通过各类PCR技术最终可以获取其插入的位点。
2.2 水稻Tos17 反转录转座子创造水稻突变体的另一种方法是利用植物的反转录转座子,它们是以DNA→RNA→DNA 的方式进行转座,在水稻上已发现大约40 种长未端重复的反转录转座子,它们是Tos1-Tos32,RIRE1-RIRE8,其中5 类被证明是有转座活性的,分别是Tos10、Tos17、Tos19、Tos25 和Tos27。
水稻卷叶突变体rl76的表型和组织分析及基因定位目录一、内容综述 (2)1. 研究背景及意义 (3)2. 研究目的和任务 (4)二、水稻卷叶突变体rl76的表型分析 (4)1. 突变体的形态特征 (5)1.1 叶片形态变化 (6)1.2 植株整体形态变化 (7)2. 突变体的生物学特性 (8)2.1 生长周期变化 (10)2.2 生物量变化 (11)三、水稻卷叶突变体rl76的组织分析 (12)1. 组织结构观察 (13)1.1 叶片结构变化 (14)1.2 茎秆及根系结构变化 (15)2. 组织化学分析 (16)2.1 生化成分分析 (17)2.2 细胞壁组分变化 (18)四、水稻卷叶突变体rl76的基因定位 (19)1. 遗传背景分析 (20)1.1 遗传图谱构建 (21)1.2 遗传标记选择及定位群体构建 (22)2. 基因定位方法与技术 (23)2.1 基于分子标记的基因定位技术 (24)2.2 基于高通量测序的基因定位方法 (24)五、基因定位结果及功能分析 (26)一、内容综述水稻卷叶突变体rl76作为一种重要的农艺性状变异,在植物生物学、遗传学和分子生物学领域引起了广泛关注。
该突变体的研究不仅有助于深入了解水稻叶片发育的分子机制,而且对于作物遗传改良和抗逆性育种具有潜在的应用价值。
本文将对水稻卷叶突变体rl76的表型特征、组织结构变化以及基因定位进行综述。
在表型特征方面,rl76突变体在水稻叶片发育过程中表现出明显的卷叶现象。
这种卷叶表型可能表现为叶片弯曲、扭曲或翻滚,与正常叶片相比,突变体叶片的形态和生长方向发生显著改变。
rl76突变体可能还伴有其他相关表型变化,如株高、穗形、粒型等,这些表型变化可能与卷叶表型存在某种程度的关联。
在组织结构分析方面,rl76突变体的叶片结构与正常叶片相比存在显著差异。
通过显微观察,可以发现突变体叶片的细胞形态、排列以及组织结构发生变化。
细胞大小、形状、排列方式以及叶绿体的发育可能受到影响,这些变化可能与卷叶表型直接相关。
一个水稻多柱头突变体的形态特征和遗传定位的开题报告
一、研究背景
水稻是世界上最重要的粮食作物之一。
多柱头突变体是指某些水稻个体植株出现2个或2个以上的花柱,这种突变体与普通单一花柱的水稻相比具有诸如花器结构、
花粉中心粒形态等明显差异,是水稻生殖生物学研究的重要材料之一。
二、研究目的
本研究旨在通过对一个多柱头突变体进行形态特征分析和遗传定位,探究多柱头突变体的成因以及对水稻生殖发育的影响。
三、研究内容
1.分析多柱头突变体的形态特征:包括成株高度、叶片形态、花器结构、花粉中心粒形态等方面的观测和测量;
2.遗传定位:通过建立多柱头突变体与野生型的遗传图谱,利用分子标记技术进行连锁分析,确定其在水稻染色体上的位置;
3.确定多柱头突变体的成因:结合形态特征和遗传定位结果,探讨多柱头突变体的成因和遗传机制。
四、研究意义和预期结果
通过本研究可以加深对水稻生殖发育的理解,为育种提供新的思路和途径。
同时,研究多柱头突变体的成因和遗传机制,有助于揭示多柱头性状的形成和遗传规律,为
其他作物多柱头性状的研究提供参考。
预期结果:1.对多柱头突变体的形态特征会做出详细的描述和解释;2.通过遗传
定位,确定多柱头突变位点在水稻染色体上的位置;3.探讨多柱头突变体的成因和遗
传机制,为相关研究提供参考和借鉴。
HEREDI T AS (Be i j i n g 2012年 8月, 34(8: 1064― 1072ISSN 0253-9772 研究报告收稿日期: 2012−05−11; 修回日期: 2012−05−20基金项目 :福建省自然科学基金项目 (编号:2011J01110, 福建省农业科学院青年人才创新基金项目 (编号:2010QJ-A4 , 福建省农业科学院科技创新团队建设重点科研项目 (编号:CXTD2011-12 资助作者简介 :杨德卫 , 硕士 , 助理研究员 , 研究方向:水稻遗传育种。
E-mail: dewei-y@通讯作者 :叶新福 , 博士 , 研究员 , 研究方向:水稻遗传育种。
E-mail:yexinfu@网络出版时间 : 2012-7-16 10:34:50URL: /kcms/detail/11.1913.R.20120716.1034.003.htmlDOI: 10.3724/SP.J.1005.2012.01064一个水稻内颖退化突变体的形态特征及基因的精确定位杨德卫 , 卢礼斌 , 程朝平 , 曾美娟 , 郑向华 , 叶宁 , 刘成德 , 叶新福福建省农业科学院水稻研究所 , 福州 350018摘要: 水稻产量和品质受花器官发育的直接影响 , 因此对水稻颖花发育机理的研究将有助于水稻产量提高和品质的改良。
文章利用60Co γ射线辐照亲本 8PW33 (籼稻背景获得一个性状能稳定遗传的内颖退化突变体 (编号:MU102, 并对其农艺性状和花器官进行了观察和分析。
结果显示 , 相对于野生型 , 该突变体的株高、每穗总粒数及剑叶宽均显著增加 , 而结实率则显著降低 , 差异均达显著水平。
解剖镜下观察表明 , 该突变体内颖退化 , 外颖弯曲呈现镰刀状 , 其余器官与野生型表型基本一致。
扫描电镜观察显示 , 突变体与野生型叶片维管束的结构组成以及外颖表皮细胞组成、排列均正常 , 没有明显差异 ; 与野生型相比 ,突变体内颖表皮细胞排列较为紧密 , 推测可能是内颖收缩退化导致的。
作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2018, 44(2): 169-176/ISSN 0496-3490; CN 11-1809/S; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@本研究由国家重点研发计划项目(2016YFD0102102), 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-01-12)和广东省应用型研发项目(2015B020231011)资助。
This study was supported by the National Key Research and Development Program of China (2016YFD0102102), the China Agricultural Research System (CARS-01-12), and the Applied Research and Development Funds in Guangdong (2015B020231011).*通信作者(Corresponding authors): 陈志强, E-mail: zqchen@, Tel: 020-********; 郭涛, E-mail: guo.tao@, Tel: 020-**********同等贡献(Contributed equally to this work)第一作者联系方式: 严贤诚, E-mail: 186********@; 陈立凯, E-mail: leeking1113@Received(收稿日期): 2017-05-27; Accepted(接受日期): 2017-09-10; Published online(网络出版日期): 2017-10-27. URL: /kcms/detail/11.1809.S.20171027.1727.002.htmlDOI: 10.3724/SP.J.1006.2018.00169水稻花器官数目突变体mf2的鉴定和基因定位严贤诚** 陈立凯** 罗玉花 罗文龙 王 慧 郭 涛* 陈志强*华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心, 广东广州 510642摘 要: 水稻的花器官发育影响着水稻的产量与品质。
作物学报ACTA AGRONOMICA SINICA 2016, 42(9): 1261 1272/ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@ DOI: 10.3724/SP.J.1006.2016.01261一个新的水稻D1基因等位突变体的遗传鉴定与基因功能分析王翠红马建王帅田鹏岂长燕赵志超王久林王洁程治军张欣郭秀平雷财林*中国农业科学院作物科学研究所 / 农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程, 北京 100081摘要: 株高是影响水稻产量的一个重要性状。
本研究从水稻稻瘟病普感品种丽江新团黑谷(LTH)经甲基磺酸乙酯(EMS)诱变群体中分离出一个遗传稳定的小粒矮化突变体LTH-m3。
该突变体是赤霉素(GA)和油菜素内酯(BR)相关突变体, 它对外源GA (GA3)不敏感, 对外源BR (eBL)的敏感性较野生型显著降低。
遗传分析、基因克隆和转基因互补实验确认, 该突变体是一个新的d1基因等位突变体, 其D1基因在第6个外显子与内含子接合处发生单碱基突变(G2522 →A2522), 导致第6外显子被选择性剪切及Gα蛋白翻译提前终止, 从而造成LTH-m3小粒矮化突变表型。
进一步的研究表明, 该突变体D1基因突变引起SD1和SLR1等基因表达的显著改变, 因而影响植株细胞内GA和BR反馈调节功能和信号传递。
突变体LTH-m3弥补了LTH植株过高、茎秆软和极易倒伏等缺陷, 可作为LTH的改良系在今后水稻稻瘟病研究中加以利用, 其功能突变基因的鉴定为深入研究水稻Gα蛋白的功能及激素信号途径提供了新的材料。
关键词:水稻; 突变体; 矮秆基因; 基因克隆; 基因功能Genetic Identification of a New D1-allelic Mutant and Analysis of Its Gene Function in RiceWANG Cui-Hong, MA Jian, WANG Shuai, TIAN Peng, QI Chang-Yan, ZHAO Zhi-Chao, WANG Jiu-Lin, WANG Jie, CHENG Zhi-Jun, ZHANG Xin, GUO Xiu-Ping, and LEI Cai-Lin*National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement / Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, ChinaAbstract: Plant height is one of important traits for rice yield. One genetically stable rice mutant, LTH-m3, was isolated from the cv. Lijiangxintuanheigu (LTH)-derived mutant population by mutagenesis using ethylmethane sulfonate (EMS). LTH-m3 was involved in the pathways of gibberellic acid (GA) and brassinosteroid (BR), and showed no sensitiveness to exogenous GA (GA3) and significantly reduced sensitiveness to exogenous BR (eBL) compared with the wild type. The genetic analysis, gene cloning and transgenic complementary test confirmed that LTH-m3 was a new d1-allelic mutant with small grain and dwarf phenotypes, and a single base was mutated (G2522→A2522) in the functional dwarf gene D1 at the conjunction site of its sixth exon and intron, which caused excision of the sixth exon in mRNA and premature termination of the D1 encoded Gα protein, resulting in mutated phenotypes in the mutant. The further study showed that the D1 mutation caused obvious expression change of some dwarf genes such as SD1 and SLR1 in the mutant, and could affect the GA and BR pathways in their feedback regulations and signaling trans-ductions in plant cells. The mutant overcome the defects of the universally blast-susceptible cv. LTH, such as too tall plant, soft stem and easy lodging, and could be utilized as an improved substitute of LTH in the future rice blast researches. The mutated D1 gene identified from the LTH-m3 mutant may be useful for further study of Gα functions and signaling pathways of GA and BR. Keywords: Rice; Mutant; Dwarf gene; Gene cloning; Gene function本研究由国家公益性行业(农业)科研专项经费(201203014)和中国农业科学院科技创新团队项目“作物功能基因组”资助。
水稻突变体介绍及鉴定(很详细)汇总教材RMD水稻突变体信息及基因型鉴定1.背景介绍:突变体对于遗传学研究有着重要作用,随着拟南芥和水稻等物种全基因组测序的开展,人类积累了前所未有的基因序列信息,为了弄清这些基因序列的生物学信息,寻找该基因区段序列发生变异的突变体是阐释基因功能最直接最有效的方法。
植物在自然的环境条件下也会产生突变性状,早期普通正向遗传学研究往往通过寻找与某种生物学特性相关的突变体来发掘或定位某个特定基因。
为配合植物功能基因组研究高通量的策略,构建水稻等物种的大型突变体库已成为必然,借助水稻全基因组测序信息、通过反向遗传学的手段大规模地筛选突变体库,理论上可以获得基因组中任一基因的突变体,最终实现阐释基因功能的目的。
2.原理:2.1农杆菌介导的T-DNA 插入农杆菌是寄主范围非常广泛的土壤杆菌,它能通过伤口侵染植物导致冠瘿瘤和毛状根的发生。
1974从根癌农杆菌中分离出一种与肿瘤诱导相关的质粒,称为致瘤质粒(Tumor-inducing plasmid),简称Ti 质粒。
Ti 质粒上存在一段DNA,能够转移并整合到植物基因组中,称为Transferred DNA,简称T-DNA。
研究发现,T-DNA 两端存在非常保守的同向重复的25bp 序列,分别称为左边界(LB)和右边界(RB)。
T-DNA 的转移只与边界序列相关,尤其是RB,而与T-DNA区段的其它基因或序列无关。
我们将T-DNA 区段上的致瘤基因和其它无关序列去掉,利用其转移的特性,实现农杆菌介导的T-DNA 转入水稻愈伤,从而构建水稻突变体库。
大量研究表明,农杆菌T-DNA 整合到植物基因组中的位置是随机的,并且整合到植物基因组中的T-DNA 能稳定遗传。
由于插入到植物基因组中的T-DNA 区段序列已知,这样随机插入到植物基因组中的T-DNA 类似于给植物基因“贴”了一个序列标签。
我们利用这个标签,通过各类PCR技术最终可以获取其插入的位点。
水稻类病斑突变体w y3的鉴定和基因定位张宏根#㊀王茂宇#㊀张丽佳㊀胡雅㊀马佳琦㊀张翼帆㊀汤述翥∗㊀梁国华㊀顾铭洪(扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部植物功能基因组学重点实验室,江苏扬州225009;#共同第一作者;∗通讯联系人,E Gm a i l :s z t a n g@y z u .e d u .c n )C h a r a c t e r i z a t i o na n dG e n eM a p p i n g o fL e s i o n M i m i cM u t a n t w y3i nR i c e Z H A N G H o n g GG e n #,W A N G M a o Gy u #,Z H A N G L i Gj i a ,H U Y a ,M A J i a Gqi ,Z H A N G Y i Gf a n ,T A N G S h u Gz h u ∗,L I A N G G u o Gh u a ,G U M i n g Gh o n g(K e y L a b o r a t o r y o f C r o p G e n e t i c s a n dP h y s i o l o g y o f J i a n g s uP r o v i n c e /K e y L a b o r a t o r y o f P l a n t F u n c t i o n a l G e n o m i c s ,M i n i s t r y o fE d u c a t i o n ,Y a n g z h o u U n i v e r s i t y ,Y a n g z h o u 225009,C h i n a ;#T h e s ea u t h o r sc o n t r i b u t e d e q u a l l y tot h i s w o r k ;∗C o r r e s p o n d i n ga u t h o r ,E Gm a i l :s z t a n g @yz u .e d u .c n )Z HA N G H o n g g e n ,WA N G M a o y u ,Z HA N G L i j i a ,e t a l .C h a r a c t e r i z a t i o na n d g e n e m a p p i n g of l e s i o n m i m i cm u t a n t w y3i n r i c e .C h i n JR i c eS c i ,2016,30(3):239G246.A b s t r a c t :Al e s i o n m i m i c m u t a n t w y 3w a so b t a i n e df r o mt h e p r o g e n y o fa j a po n i c a v a r i e t y W u y u j i n g 3b y n a t u r a l m u t a t i o n .T h e l e s i o n sw e r e f i r s t o b s e r v e do n t h e l e a v e s a t t h e s e e d l i n g s t a g e ,t h e n s p r e a d g r a d u a l l yt o t h ew h o l e l e a f a t t h e i n i t i a l t i l l e r i n g s t a g e .C o m p a r e dw i t h t h ew i l d t y p e (WT ),t h e p l a n th e i g h t ,t h en u m b e r o f e f f e c t i v e t i l l e r ,pa n i c l e l e n g t h ,g r a i nn u mb e r p e r p a n ic l ea n ds e e ds e t t i n g r a t eo f w y3w e r e r e d u c e ds i g n i f i c a n t l y .T h es h a d i n g a s s a y s h o w e d t h a t t h e l e s i o n so nl e a v e so f w y3w e r e i n d u c e db y n a t u r a l l i g h t .C o m p a r e d w i t ht h e w i l dt y p e ,t h e p h o t o s y n t h e t i c p i g m e n t a n d t h en e t p h o t o s y n t h e t i c r a t e o f w y3w e r e s i g n i f i c a n t l y r e d u c e d ,b u t t h eS O Da c t i v i t y ,P O Da c t i v i t y ,C A T a c t i v i t y a n dM D Ac o n t e n t o f w y 3w e r e s i g n i f i c a n t l y h i g h e r t h a n t h o s e o fWT.T r y p a n b l u e s t a i n i n g e x p e r i m e n t s s h o w e d t h a t t h e r ew e r e a l a r g e n u m b e r o f d e a d c e l l s i n t h em u t a n t l e s i o n .G e n e t i c a n a l y s i s s u g g e s t e d t h a t t h e p h e n o t y p e o f w y3w a s c o n t r o l l e db y a s i n g l e r e c e s s i v e n u c l e a r l o c u s ,a n d t h e t a r g e t g e n ew a sm a p pe db e t w e e nm a r k e r sW 2G17a n dW 2G18w i t h t h e p h y s i c a l d i s t a n c e of 28k bo n c h r o m o s o m e 2.S e q u e n c ea n a l y s i s r e v e a l e d t h a t t h em u t a t e dg e n e i n w y3h a da s i n g l en u c l e o t i d e d e l e t i o na t t h e 375t h i nC D So f L O C _O s 02g 02000,r e s u l t i n gi n a p r e m a t u r e t e r m i n a t i o n o f t r a n s l a t i o n o f t h e t a r ge t g e n e ,w h i c h i s a nn e wa l l e l e of O s HP L 3.K e y w o r d s :r i c e ;l e s i o nm i m i cm u t a n t ;g e n em a p p i n g 张宏根,王茂宇,张丽佳,等.水稻类病斑突变体w y3的鉴定和基因定位.中国水稻科学,2016,30(3):239G246.摘㊀要:在粳稻品种武育粳3号栽培群体中获得一个类病斑突变体w y 3.该突变体类病斑出现于苗期,分蘖期扩散至整张叶片,属于扩散型类病斑突变体.相比野生型,突变体w y 3的株高明显降低,有效分蘖数减少,穗长㊁每穗粒数㊁结实率均显著降低.遮光处理表明,突变体w y 3类病斑的产生受自然光诱导.台盼蓝染色结果表明,类病斑部位有大量的死亡细胞.突变体w y3的光合色素含量和净光合速率较野生型显著降低,S O D ㊁P O D ㊁C A T 活性和M D A 含量均显著高于野生型.遗传分析表明突变体表型受单隐性核基因控制,采用B S A 将该基因初步定位在第2染色体短臂端粒附近.采用F 2群体中1099株类病斑单株将基因定位在标记W 2G17和W 2G18之间28k b 的物理距离内.测序结果表明,突变体w y3中的L O C _O s 02g02000编码区(C D S )第375位碱基C 缺失,导致翻译提前终止,突变体中该候选基因为O s H P L 3的一个新等位基因.关键词:水稻;类病斑突变体;基因定位中图分类号:Q 343 5;Q 754㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀文献标识码:A㊀㊀㊀文章编号:1001G7216(2016)03G0239G08㊀㊀植物斑点叶(s po t t e d l e a f )突变体是指植物在没有遭受病原物侵染或明显逆境条件下在叶片或叶鞘上自发形成斑点的一类突变体,由于这些斑点与病原物侵染后产生的病斑非常相似,又被称为类病变突变体(l e s i o ns i m u l a t i n g di s e a s e m u t a n t ,l s d )或类病斑突变体(l e s i o n m i m i cm u t a n t ,l m m )[1].类病斑突变体广泛存在于水稻㊁拟南芥㊁玉米㊁大麦和大豆等植物中[2G7].根据突变体的表型,类病斑突收稿日期:2015G11G30;修改稿收到日期:2015G12G24.基金项目:国家自然科学基金资助项目(31071384,31000533);江苏省科技支撑计划资助项目(B E 2013301);江苏高校优势学科建设工程资助项目.932中国水稻科学(C h i nJR i c eS c i ),2016,30(3):239-246h t t p ://w w w.r i c e s c i .c n D O I :10.16819/j.1001G7216.2016.5176变体可分为起始型和扩散型[8G10],起始型突变体的病斑有相对稳定的分布位置和大小,而扩散型突变体的病斑形成以后会很快扩散到叶片的其他部位,甚至包括叶鞘和茎秆.已有研究表明,植物类病斑的发生主要与过敏性反应(h y p e r s e n s i t i v er eGs p o n s e,H R)导致的细胞程序性死亡以及细胞死亡途径中自由基非正常产生有关[11G13].此外,许多类病斑突变体对某些植物病原物表现出了一定的抗性[14G16],能激发病程相关蛋白的表达[17G18],可以提高植株的持久㊁广谱抗病性.因此,这类突变体对植物过敏反应激活机制和植物抗病反应机制的研究具有重要意义.目前,水稻中已经发现了80多个类病斑突变[19].其中,绝大部分呈单隐性核基因遗传规律,也有部分表现为双隐性核基因或显性核基因遗传规律.在这些类病斑基因中,s p l5[20]㊁s p l7[21]㊁s p l11[22]㊁s p l18[23]㊁s p l28[16]㊁T t m l[24]等18个基因已被克隆,这些基因编码许多不同类型的蛋白,如第一个被克隆的水稻类病变突变基因s p l7编码一个热激转录因子蛋白(h e a t s t r e s s t r a n s c r i p t i o n f a c t o r p r o t e i n,H S F)[21],s p l11编码一个UGb o x/A r m aGd i l l o重复蛋白[22],s p l18编码一个酰基转移酶[23].类病斑基因的克隆与功能研究表明类病变过程非常复杂,这些基因的作用机制以及性状表现各不相同,涉及到许多生化代谢过程,但突变体性状大多与细胞程序性死亡相关[22].本课题组在粳稻品种武育粳3号栽培群体中获得一个稳定遗传的类病斑突变体w y3,该类病斑突变是自然诱变产生.本研究中以w y3为材料,描述了该突变体的形态特征㊁生理学特性,并对该突变基因进行了精细定位与克隆,以期为该基因的功能研究及应用提供理论依据.1㊀材料与方法1.1㊀实验材料2013年扬州正季,在粳稻品种武育粳3号栽培群体中获得一个类病斑突变体w y3,经过多代连续种植,突变体类病斑表型稳定遗传.2014年正季扬州,以籼稻品种K a s a l a t h为父本与w y3杂交获得F1,2014年冬季在海南种植F1及相关亲本,成熟期收获F1植株自交种子.2015年正季,种植突变体w y3㊁野生型武育粳3号及组合w y3/K a s a l a t hF2群体.1.2㊀表型鉴定2015年正季,将突变体w y3和对照武育粳3号种植于扬州大学农学院实验基地,小区种植,3次重复,管理与一般大田相同.全生育期观察田间突变体的表型,包括突变体斑点出现的时期㊁颜色及分布情况等.成熟后随机从小区中央选取10株考查株高㊁单株穗重㊁每株有效穗数㊁每穗粒数㊁每穗实粒数㊁结实率和千粒重等性状.1.3㊀光照处理实验通过遮光试验了解光照对斑点发生的影响.大田条件下,在苗期用宽度约为1c m的锡箔纸对突变体w y3叶片已有斑点和无斑点部位进行遮光处理,各重复3次.分别观察遮光15d及恢复光照7d后斑点的发生及变化情况,并拍照.1.4㊀突变体死亡细胞鉴定苗期,分别取野生型正常叶片与突变体w y3发生类病斑的叶片,剪成1c mˑ1c m大小.加入台盼蓝染液(染液配方参照Y i n等[25]的方法),真空抽滤使染液进入细胞间隙,沸水蒸沸5~8m i n.室温下静置6~8h后用2.5g/m L的水合氯醛溶液脱色,直到组织完全透明为止.脱色好的叶片在体视显微镜下观察㊁拍照.1.5㊀叶绿素含量测定分蘖期,分别取野生型正常叶片与突变体w y3发生类病斑的叶片,按L i c h t e n t h a l e r等[26]修正的A r n o n法进行叶绿素和类胡萝卜素含量测定,具体操作如下:将鲜叶去掉叶脉,截取叶片中段(叶片最宽处),擦净组织表面污物,并吸干叶片表面附着水;准确剪成2mm条状并称取0.2g鲜样3份,分别置于3个20m L带盖的玻璃管中;吸取10m L提取液(96%乙醇)置于玻璃管中,密封并置于30ħ~50ħ水浴锅中萃取3h,此过程中需轻摇几次.当叶片完全变白时即可比色.比色时,以提取液为空白,在波长663n m㊁646n m和470n m下测定吸光度.每样重复测定2次.1.6㊀光合作用相关指标的鉴定始穗期,使用L iG6400型便携式光合测定仪于晴天上午9:00-11:00分别测定w y3及其野生型剑叶叶片的净光合速率(n e t p h o t o s y n t h e t i c,P n)㊁气孔导度(l e a f c o n d u c t a n c e,G s)㊁蒸腾速率(t r a nGs p i r a t i o nr a t e,T r)和胞间C O2浓度(i n t e r c e l l u l a r C O2c o n c e n t r a t i o n,C i),各测定3片具有代表性的剑叶.光合测定仪使用红蓝光源,光强恒定为1200042中国水稻科学(C h i nJR i c eS c i)㊀第30卷第3期(2016年5月)μm o l/(m2 s),温度为30ħ,C O2浓度为空气中的浓度,湿度为大气中的湿度.取3次重复的平均值进行分析.1.7㊀抗氧化酶活性测定分蘖期,测定突变体w y3和对照相同部位叶片中超氧化物歧化酶(s u p e r o x i d ed i s m u t a s e,S O D)㊁过氧化物酶(p e r o x i d a s e,P O D)㊁过氧化氢酶(c a t aGl a s e,C A T)活性和丙二醛(m a l o n a l d e h y d e,M D A)的含量.所有测定重复3次,取平均值进行分析. S O D活性采用S O D测试盒(南京建成生物工程研究所生产)测定,该试剂盒采用黄嘌呤氧化酶法; P O D活性采用愈创木酚法[27]测定,以每1m i n内O D470变化0.01为一个过氧化物酶活性单位(U);C A T活性采用高锰酸钾滴定法测定;MD A含量采用硫代巴比妥酸(t h i o b a r b i t u r i ca c i d,T B A)法测定.1.8㊀图谱构建与数据分析采用隐性分离群体进行遗传分析和基因定位.在F2群体中,根据分子标记检测的结果,具有w y3突变亲本带型的个体赋值1,具有K a s a l a t h带型的个体赋值3,具有双亲带型(杂合带)的个体赋值2,利用M a p M a k e r3.0作图软件进行基因位点与标记间连锁分析,用K o s a m b i函数将重组率转化为遗传距离(c e n t i M o r g a n,c M).其他数据在E x c e l2013中处理.1.9㊀候选基因分析根据基因精细定位结果,查阅在水稻基因组注释数据库(R i c eG e n o m eA n n o t a t i o nP r o j e c t)中相应区间内的所有开放阅读框(O R F),并分析可能的候选基因.根据候选基因全长基因组D N A序列,设计测序引物,分别对野生型和突变体的基因组进行扩增并测序.测序结果用C o n t i g E x p r e s s软件拼接完整再通过D N A S T A R软件进行比对,确定突变位点.2㊀结果与分析2.1㊀突变体表型鉴定在大田自然条件下,突变体w y3从苗期开始叶片表面出现类病斑,分蘖期比较明显.叶片上斑点出现的位置并无特殊规律,但最终都会扩散到整张叶片,表现为扩散型突变体.考查突变体与野生型的农艺性状,突变体的长势较差,株高㊁穗长㊁每穗粒数㊁结实率等农艺性状也显著低于对照(表1,图1).造成突变体株高等性状显著降低的原因可能是由于突变叶片过早枯死,光合作用能力减退.2.2㊀光照对突变体的影响对突变体w y3只出现少量类病斑的叶片未产生类病斑部位用锡箔纸遮光15d后发现,整张叶片A-苗期植株表型;B-分蘖初期野生型(左)和突变体w y3(右)植株表型;C-成熟期野生型(左)和突变体w y3(右)植株表型;D-野生型(左)和突变体w y3(右)穗部表型;E-分蘖期野生型(左)和突变体w y3(右)叶片表型.A,P h e n o t y p e s o f w y3d u r i n g s e e d l i n g s t a g e;B,P h e n o t y p e s o fWT(l e f t)a n d w y3(r i g h t)d u r i n g t h e e a r l y t i l l e r i n g s t a g e;C,P h e n o t y p e s o f WT(l e f t)a n d w y3(r i g h t)d u r i n g t h em a t u r e s t a g e;D,P a n i c l e t r a i t s o fWT(l e f t)a n d w y3(r i g h t);E,L e a v e s o fWT(l e f t)a n d w y3(r i g h t) d u r i n g t h e e a r l y t i l l e r i n g s t a g e.图1㊀突变体w y3及其野生型表型F i g.1.P h e n o t y p e s o f w y3a n dw i l d t y p e(W T).142张宏根等:水稻类病斑突变体w y3的鉴定和基因定位表1㊀突变体和野生型的农艺与产量性状T a b l e 1.P e r f o r m a n c e o f a g r o n o m i c a n d y i e l d t r a i t s o f t h em u t a n t w y 3a n d t h ew i l d t y pe (W T ).材料M a t e r i a l株高P l a n t h e i g h t /c m分蘖数N o .o ft i l l e r s 穗长P a n i c l e l e n g t h /c m结实率S e e d Gs e t t i n g r a t e/%每穗粒数G r a i nn u m b e r pe r p a n i c l e 粒长G r a i n l e n g t h /mm粒宽G r a i nw i d t h /mm千粒重1000Gg r a i n w e i g h t /gw y356.9ʃ0.6∗∗3.5ʃ0.6∗∗14.8ʃ1.2∗∗79.0ʃ0.1∗∗89.6ʃ6.8∗∗7.5ʃ2.23.4ʃ1.426.54ʃ0.56WT87.5ʃ0.510.0ʃ1.716.6ʃ0.898.3ʃ0.1123.6ʃ11.07.3ʃ2.83.3ʃ0.926.85ʃ0.62㊀㊀∗∗表示在0.01水平差异显著.下同.∗∗d e n o t e s i gn i f i c a n t d i f f e r e n c e a t 0.01l e v e l .T h e s a m e a s b e l o w.表2㊀突变体w y3和野生型叶片光合色素含量T a b l e 2.P i g m e n t c o n t e n t s i n l e a v e s o f w y 3a n dw i l d t y pe (W T ).材料M a t e r i a l叶绿素a 含量C h l o r o p h yl l a c o n t e n t /(m gg -1)叶绿素b 含量C h l o r o p h yl l b c o n t e n t /(m gg -1)叶绿素a /bC h l o r o p h y l l a /b 类胡萝卜素含量C a r o t e n o i d c o n t e n t /(m gg -1)w y31.28ʃ0.09∗∗0.27ʃ0.11∗∗4.68ʃ0.13∗∗0.15ʃ0.11∗∗WT2.28ʃ0.030.99ʃ0.082.31ʃ0.070.59ʃ0.04A-遮光前w y 3;B -未发生斑点部位遮光15d 后;C -遮光部位恢复光照7d 后;D -野生型.A ,L e a f o f w y 3b e f o r e s h a d i n g ;B ,L e a fw i t h o u t l e s i o n a f t e r s h a d i n g f o r 15d a y s ;C ,L e a f s h a d e d f o r 7d a y s t h e nu n d e r n o r m a l l i g h t f o r 7d a y s ;D ,W i l d t y pe .图2㊀遮光对突变体w y3叶片的影响F i g .2.E f f e c t s o f s h a d i n g on w y 3l e a v e s .其他部位都产生类病斑,但是遮光部位没有产生类病斑;恢复光照,跟踪观察原遮光部位变化,一周后,原本没有类病斑的遮光处产生了明显的类病斑(图2).该结果表明,类病斑的发生受自然光照的诱导,适当的遮光可以阻止或者减轻类病斑的发生或者扩散.2.3㊀叶绿素含量变化分蘖期,通过对突变体和野生型叶片叶绿素含量的测定结果可以看出,突变体的叶绿素a ㊁叶绿素b 和类胡萝卜素含量均显著低于野生型,但叶绿素a /b 比值显著高于其野生型,说明突变体w y 3是一个叶绿素缺陷突变体(表2).2.4㊀突变对光合作用的影响始穗期,测定突变体w y 3和野生型剑叶的光合参数,包括净光合速率(P n )㊁气孔导度(G s )㊁蒸腾速率(T r )和胞间C O 2浓度(C i ).由于在该时期突变体叶片类病斑明显,突变体w y3所测得的P n ㊁G s ㊁T r 和C i 4个参数均显著低于野生型(表3),说明类病斑的发生导致突变体光合能力的降低.2.5㊀突变体叶片细胞死亡鉴定利用台盼蓝染色方法对突变体及野生型叶片中死亡细胞进行检测.经台盼蓝染色后,野生型叶片整体呈淡蓝色,没有深蓝色染色,说明野生型叶片基本上没有细胞死亡.与野生型叶片不同的是,突变体类病斑发生处对应着严重的深蓝色小点,说明斑点部位有大量的死亡细胞,而在大块深蓝色染色间隙也出现了深蓝色的小点,说明类病斑正在扩散中(图3).2.6㊀抗氧化酶活性的变化㊀㊀植物细胞程序性死亡时常产生活性氧的沉积,242中国水稻科学(C h i nJR i c eS c i )㊀第30卷第3期(2016年5月)表3㊀突变体w y3和野生型武育粳3号分蘖期叶片光合特性T a b l e 3.P h o t o s y n t h e t i c p a r a m e t e r s o f w y 3a n dw i l d t y p e (W T )a t t h e i n i t i a l t i l l e r i n g s t a ge .材料M a t e r i a l净光合速率P n /(m m o lm -2s -1)蒸腾速率T r /(mm o lm -2s -1)气孔导度G s/(m o lm -2s -1)胞间C O 2浓度C i/(m m o l m o l-1)w y314.16ʃ0.27∗∗193.27ʃ10.10∗∗0.13ʃ0.02∗∗2.76ʃ0.23∗∗WT22.46ʃ0.29276.96ʃ6.300.66ʃ0.088.93ʃ0.43图3㊀武育粳3号和w y3叶片的台盼蓝染色检测F i g .3.T r y p a nb l u e s t a i n i n g o f l e a v e s o f t h em u t a n t w y 3a n dw i l d t y pe (W T ).因此测定了突变体w y3和野生型相同部位叶片中一系列的活性氧代谢生理指标.结果显示,突变体w y3中C A T ㊁P O D ㊁T GS O D 以及M D A 含量均显著高于野生型(图4),说明在突变体叶片产生类病斑后,活性氧大量积累,活性氧的积累诱发了植物细胞合成大量的超氧化物歧化酶,超氧化物歧化酶将自由基状态的氧负离子以及单线态氧歧化为过氧化氢,过氧化氢在细胞中的积累诱发过氧化物酶(过氧化氢酶)的大量表达.同时,在突变的叶片中活性氧大量积累导致叶片细胞中的生物膜的磷脂分子的不饱和脂肪酸链大量过氧化,生成大量丙二醛.2.7㊀w y3的遗传控制与基因定位2014年海南,K a s a l a t h 与突变体w y3配置的F 1植株叶片表型正常,2015年F 2群体中出现明显的分离,分别表现双亲性状,其中正常株3000株,类病斑单株1099株.经卡方测验,正常株与突变株符合3ʒ1分离比(c 2=0.7295<c 20.05,1=3.84).表明突变体w y3类病斑性状受一对隐性核基因控制.为定位该类病斑基因,在均匀分布于水稻12条染色体的380对S S R 标记中,筛选出120对在K a s a l a t h 双亲间显示多态性的标记.分别取15株正常株和15株突变株构建正常基因池和突变基因池,利用上述多态标记对这两个基因池进行检测.在所用检测的120对标记中,第2染色体的标记R M 3340和R M 12368在两个混池间表现出差异,初步推测这两个标记与基因连锁.进一步选取30株正常株和30株类病斑植株,利用R M3340㊁∗∗P <0.01.图4㊀突变体w y3与野生型(W T )对照在分蘖期的生理学特性比较F i g .4.P h y s i o l o g i c a l c h a r a c t e r i s t i c s o f t h ew i l d t y p e (W T )a n d t h e w y 3m u t a n t d u r i n g t h e t i l l e r i n g s t a ge .342张宏根等:水稻类病斑突变体w y 3的鉴定和基因定位表4㊀本研究开发的多态性S T S 标记T a b l e 4.P o l y m o r p h i c S T Sm a r k e r s d e v e l o p e d i n t h i s s t u d y.标记M a r k e r反向引物F o r w a r d p r i m e r (5ᶄG3ᶄ)正向引物R e v e r s e p r i m e r (5ᶄG3ᶄ)W 2G10G A G A T G C C A G G A G A A T G A T G T A G C T G A G G G T T T G A T A W 2G17A A A T C T G G A C C T G A A A G TT T A G G G A A G A T T C T C A A A W 2G18G C C A G C G A G A A G A A G A A G G A G G A T G T G G T C G G G T G TW 2G3G C A G C A C G G A C T A C A A G A C A A T T C T G C C A T G A C C A A W 2G13T A G T G T C G C C C C T T T T A A C A T C A C A G C A A A C A A G CAA-基因的初步定位;B-基因的精细定位;C-覆盖基因物理图谱;D -基因内变异位点.A ,P r i m a r i l y m a p p i n g o ft a r g e t g e n e ;B ,F i n e m a p p i n g o ft a r g e t g e n e ;C ,P h y s i c a lm a p o f g e n e s ;D ,T h e m u t a t i o nl o c u so f t a r g e t ge n e .图5㊀水稻类病斑突变体基因定位F i g .5.M a p p i n g o f t h e t a r g e t ge n e i n w y 3.R M 12368进行检测,正常株表现为K a s a l a t h 或F 1条带,类病斑植株表现为突变体w y 3条带,说明标记R M 3340㊁R M 12368与基因连锁(图5).结合本实验室已有的S S R 标记和G r a m e n e (h t t p://w w w.g r a m e n e .o r g )网站上提供的S S R 信息,在标记R M 3340㊁R M 12368附近筛选了14对S S R 标记,其中R M 12317㊁R M 12339和R M 12348在双亲之间具有多态.利用这些标记对F 2群体中1099株类病斑单株进行检测,结果在标记R M 3340处找到28个交换株,在标记R M 12339处找到53对交换株,根据交换株信息,初步将基因定位在R M 3340和R M 12339之间.为了进一步精细定位基因,结合已经公布的水稻品种9311和日本晴全基因组序列,利用P r i m e rP r e m i e r 5.0软件,在水稻第2染色体上发展了13对新的S T S 标记,其中5对标记表现出多态性(部分引物序列如表4所示).利用5对多态标记和81株交换株,最终把基因定位在W 2G17和W 2G18之间,两标记间物理距离约为28k b .2.8㊀候选基因测序分析根据水稻基因组注释数据库(R i c e G e n o m e A n n o t a t i o nP r o j e c t )中的数据,在定位区间共有6个开放阅读框(L O C _O s 02g 01960-L O C _O s 02g 02010).对这6个O R F 进行基因组测序.结果发现,与野生型武育粳3号相比,突变体w y 3中的L O C _O s 02g 02000编码区(C D S )第375位碱基C 缺失,编码序列在920b p 处出现终止子TG A ,使得翻译提前终止(图5),并且野生型武育粳3和日本晴在这个O R F 上的序列完全相同.3㊀讨论在植物中已经发现的大量斑点叶或类病斑突变体中,斑点或者类病斑的出现往往伴随着其他农艺性状的改变,但不同突变体表现并不一致.例如h m 197[19]㊁l m s 1[28]㊁l m m 4[29]等植株株高降低,而突变体s p l 32[30]株高未有显著变化;在分蘖数上,h m 197[28]㊁g 340[31]㊁s pl 32[30]等均未发生显著变化;在结实率上,l m m 4[29]㊁s p l 31[32]㊁s p l 32[30]等突变体均显著下降,但g 340[31]突变体结实率没有显著变化.本研究中,w y 3株高㊁分蘖数㊁结实率均显著低于其野生型,植株光合作用能力的下降是造成这些农艺㊁产量性状降低的主要原因.类病斑突变体叶绿素各组分含量显著低于野生型,叶绿素含量降低这一结果也与突变体植株叶片表型相符合,这也导致突变体中叶片光合作用能力的下降.已有研究发现,类病斑形成部位通常伴随自由基和活性氧的积累.在植物细胞中,无法及时清除的活性氧积累是诱导细胞进行程序性死亡的重要信442中国水稻科学(C h i nJR i c eS c i )㊀第30卷第3期(2016年5月)号因子.S a m u i l o v等[33]研究表明活性氧的积累与植物细胞凋亡的起始与调节有重要关系.在水稻中已经被克隆的类病斑突变体基因中,O s L S D1[34]㊁s p l11[22]㊁s p l28[16]等突变体基因与细胞的凋亡有关.本研究中,台盼蓝染色后发现类病斑叶片出现大量死亡细胞,进一步测得突变体w y3类病斑叶片中的S O D㊁P O D㊁C A T和M D A均极显著高于对照叶片,这一结果说明在突变体w y3叶片产生类病斑后,叶片细胞中存在大量的活性氧自由基,进而调控细胞非程序性死亡,造成了突变体叶片最终枯死.㊀㊀本研究中,利用组合K a s a l a t h/w y3衍生F2群体中的1099株隐性单株,将突变体中控制类病斑基因定位在第2染色体短臂标记W2G17和W2G18之间28k b的物理区间内.根据已有的报道,在此区间内已经报到了3个类病斑基因s p l2[35],c e a62[36]和O s HP L3[37],其中s p l2未进行精细定位,c e a62与O s HP L3已克隆.通过对定位区间内候选O R F 进行测序发现,与野生型相比,突变体w y3中的L O C_O s02g02000编码区(C D S)第375位碱基C缺失,编码序列在920b p处出现终止子T G A,使得翻译提前终止.不同的是,突变体c e a62是在L O C_ O s02g02000编码区第1146b p处发生单碱基替换(T A CңT A G)从而使得翻译过程提前终止,O s HGP L3突变体中的L O C_O s02g02000编码区518b p 和519b p之间插入了一个大约700b p大小的转座子,使得该基因功能丧失,从而发生类病斑突变.由此可以看出,本研究中定位到的类病斑基因和c e a62㊁O s HP L3为变异位点不同的复等位基因.尽管s p l2没有被精细定位,但比较已有的定位结果及突变体表型,可以推断c e a62㊁O s HP L3及本研究中克隆的基因与已报到的s p l2均为等位基因.从表型来看,突变体w y3与已报道的c e a62和O s HP L3基本一致,但也有所差异.突变体w y3在发生突变时期㊁病斑扩散形式㊁病斑颜色以及植株株高和分蘖等性状上都与c e a62㊁O s HP L3表现一致,但是w y3在千粒重上与野生型并没有发生显著变化,这与O s HP L3的千粒重较野生型显著下降有所不同[36];突变体w y3在结实率上的表现与c e a62有所不同,c e a62结实率极显著低于野生型,这种极显著降低是由于花粉育性降低造成的[37],而本研究中w y3花粉育性与野生型并无显著差异(数据未列出),突变体w y3结实率下降是由于植株后期叶片枯死,籽粒灌浆不充实而出现大量瘪粒造成的.另外,O s HP L3突变体来源于粳稻品种中花11,c e a62背景源于日本晴,结合性状上的差异,我们推测差异的原因可能是突变位点的不同或核背景不同.鉴于此,我们将该突变基因导入日本晴背景,以期在不同背景下研究该基因的差异.由于实验进度限制,结果仍在进一步研究中.参考文献:[1]㊀王忠华.植物类病变突变体的诱发与突变机制.细胞生物学杂志,2006,27(5):530G534.W a n g Z H.I n d u c t i o na n d m u t a t i o n m e c h a n i s m o f p l a n t l e s i o n m i m 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