分子生物学

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1. SNP单核苷酸多态性 指基因组DNA上单个碱基的变异引起的DNA序列多态性。SNP是人类基因组DNA多态性最多的,是人群个体差异最具代表性的DNA多态性,相当一部分直接或间接地与个体的表型差异、对疾病的易感性或抵抗能力、对药物的反应性等相关。由于没一个个体基因组的每一个核苷酸突变的频率非常低及突变的随机性,使得大多数SNP位点十分稳定。

2. ORF 开放阅读框架 在DNA链上,由蛋白质合成的起始密码开始,到终止密码为止的一个连续编码列,包括3个区域:编码区,有外显子和内含子;前导区,位于编码区上游;调节区,有启动子和沉默子等。

3. 调节基因 指某些可调节、控制结构基因表达的基因。其突变可影响一个或多个结构基因的功能,或导致一个或多个蛋白质量的改变。

4. 目前蛋白质组学研究最常用的技术流程是基于凝胶的工作流程。通过样品制备、样品标记、双向电泳分离、图像获取、图像分析,到抠点、酶切、点靶和MALDI—TOF蛋白质鉴定的一整套技术手段。用于分离的双向电泳原理第一等电聚焦,蛋白质沿PH梯度分离,第二进行相对分子质量分离。

5. 细胞起始基因转录需要反式转录激活因子的参与.酵母转录因子GAL4在结构上是组件式的,往往由两个或两个以上结构上可以分开、功能上相互独立的结构域构成,其中有DNA结合功能域和转录激活结构域。将这两个结构域分开时仍分别具有功能,但不能激活转录,只有当被分开的两者通过适当的途径在空间上较为接近时,才能重新呈现完整的GAL4转录活性,并可激活上游激活序列的下游的启动子,使启动子下游的基因得到转录。

6. (1)分----分离目的基因;切-----限制酶切割目的基因和载体;接-----拼接重组体;转-----转入受体菌;筛----筛选重组体。(2)黏性末端DNA分子的连接;平末端的连接,其中包括质粒和目的基因上没有相同的酶切位点和人工接头连接;通过同聚尾连接。

7. 限制性核算内切酶:分子克隆中切割DNA获取目的基因和切割载体形成切口,使目的基因插入载体;DNA聚合酶和klenow片段:具有5’—3’聚合酶和3’----5’核酸外切酶活性;taqDNA聚合酶:一种耐热的DNA聚合酶聚5’—3’聚合酶和依赖于聚合作用的5’----3’外切酶活性;反转录酶:以RNA为模板合成DNA的功能;末端脱氧核糖核苷酰转移酶:在载体或目的基因3’末端加上互补的同质多聚尾,形成人工黏性末端;DNA连接酶:催化两个互补的黏性末端或平端双链DNA分子端口的连接;碱性磷酸酶:除去DNA片段上的5’磷酸,以防自身连接;核酸酶S1:水解双链DNA、RNA或DNA---RNA杂交中的单链部分,其作用是除去双链DNA的黏性末端产生平末端。

8. 载体因具备的特征:能自我复制并具有较高的拷贝数,并由适宜的分子大小,一般应小于10kb;带有遗传筛选标记;有适当的限制酶切位点,便于外源基因的插入和筛选。

双抗生素筛选法

某些质粒载体如 pBR322质粒中具有Amp和Tet 抗性基因,如将外源DNA片段插入BamHⅠ识别序列(在Tetr基因序列内)时,则此质粒由Tetr变为 Tets 。这种重组子导入宿主菌后,宿主菌在含四环素琼脂平皿上不能生长而在含氨苄青霉素的平皿上能够生长。在含四环素和氨苄青霉素的平皿上都能够生长的细菌只含有空载体,此筛选方法称为双抗生素对照筛选。

-半乳糖苷酶基因失活筛选

某些质粒载体带有lacZ基因,该基因编码-半乳糖苷酶氨基末端145个氨基酸(- 肽), IPTG可诱导lacZ基因的表达而生成-肽,其能与宿主细胞所编码的缺陷型-半乳糖苷酶实现所谓的-互补,形成完整的-半乳糖苷酶活力。该酶能催化X-gal 形

成蓝色菌落。

当外源基因插入lacZ基因中的MCS时,lac -肽基因阅读框架被破坏,细菌内将无-半乳糖苷酶活性,结果重组克隆呈白色菌落,这是常用的蓝白斑筛选。

9. 根据标记物的特性可分为放射性同位素标记和非放射性标记两大类。同位素标记的方法有缺口平移法、随机引物法、末端标记法和反转录标记法。非放射性标记方法分为化学修饰标记法和酶促反应标记法。

10. (1)探针的选择:大多数情况下可以选择克隆的DNA或cDNA双链探针,但在检测靶序列上的单个碱基改变时应该选用寡核苷酸探针,在检测单链靶序列时应选用与其互补的DNA单链探针或RNA探针。(2)探针的标记方法:一般认为放射性探针比非放射性探针的灵敏度高。(3)探针的浓度:随着探针浓度的增加,杂交率也增加。(4)杂交的最适温度:反应温度低于Tm的10到15度,碱基序列高度同源的互补双链可稳定的双链,错配减少。(5)杂交反应的时间:一般杂交应进行20小时左右。(6)洗膜的温度:杂交后洗膜的温度一般应低于Tm的5—12度。(7)杂交液的优化 常增加杂交促进剂。