产麻痹性贝毒塔玛亚历山大藻共培养菌群的物种多样性研究
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t a m a r e n s e ) 是 我 国典 型赤 潮 甲藻 , 但 对 其 共 培
化 测试 所需 培养 基 , 参照文献 [ 1 5 ] 配制 ; 细 菌 基 因组 D N A提 取 、 P C R 扩 增 试 剂 盒 均 购 自荷 兰
养菌群的物种 多样性背景信 息 尚知之甚少 。本
为 海洋 Z o b e l l 2 2 1 6培 养 基 H 。细 菌 鉴 定 生 理 生
的实验证 据支 持
。产毒 赤潮藻与其共生菌
的关 系是揭 示 P S P产 生 机制 的关 键 , 而其 共 培 养 菌群 的分 离 及 其 多 样 性 分 析 是 开 展 此 研 究 的 必
要 前 提 。产 P S P塔 玛 亚 历 山 大 藻 ( A l e x a n d r i u m
2 0 0 0 9 0; 2 .上海海洋大学 , 上海 2 0 1 3 0 6 ;
1 0 6 1 7 ; 4 . 俄勒冈州立大学微生物学 系 , 科瓦里斯 , 俄勒 冈 9 7 3 3 3 )
摘
要 :产毒赤潮藻与其共 生菌的互 作关 系是 揭示麻痹性贝毒 ( P S P ) 产生机制 的关键 , 而其 共培养 菌群 的分
离及其多样性解析是开展此研究的必要前提。塔玛亚历 山大藻 ( A l e x a n d r i u m t a m a r e n s e ) 是典 型产 P S P赤潮原 因 甲藻 , 为揭示其共培养菌群 的物种多样性信息 , 本文通过免培养海洋微生物高通量测序技术 , 解析 了东海塔
玛亚历山大藻 ( a t 3 # ) 共培养菌群的种类 、 丰度及 多样性信息 。结果表 明 , 其共培养菌群共有 8 7个种 与已有数
产 麻 痹 性 贝 毒塔 玛 亚历 山大 藻 共培 养 茵群 的 物 种 多样 性 研 究
刘 巧红 ,苑丽东 ,田晓清 ,马丽艳 ,周宏农。 ,
樊成奇 ,杨 宪时 ,杨
( 1 .中N I 水产科学研究 院东海水产研究所 , 上海 3 .台湾大学渔业科学研究所 , 中国台北
桥 ,张晓玲
作者简介 :刘 巧红( 1 9 9 0一) , 硕士研究生 , 研究 方向 : 海洋微生 物及 海洋毒素。
通 讯 作 者 :张 晓玲 , 副 研 究 员 。E - ma i l : n y y q x l @1 2 6 . c o n r
海
洋
渔
业
2 0 1 6正
学 试剂 均 为分析 纯 , 购 自上海 国药 集 团。实 验 用
1 材 料 与 方 法
1 . 1 实验 材料
产 P S P塔 玛 亚 历 山 大 藻 ( A l e x a n d r i u m t a m a r e n s e , 编号 a t 3 # ) , 由台湾 大 学 渔 业 科 学 研 究 所 周宏 农 教 授 课题 组 提 供 。 分 离 自台湾 屏 东 市 东 港水 产养 殖池 中 , 保存 于本 研究 室 。 藻培养 基 : 改 良f / 2培 养基 、 细 菌分 离培 养 基
染 日趋 加重 , 导致 赤潮 频 发 , 给 我 国 生态 环 境 、 海 产养殖 及渔 业 、 水 产 品质 量 安全 等 多 方 面 带来 巨
的生物学背景信息支持。
大威胁 , 且不断 引发人体 中毒 乃至死 亡事 件发
生 。而 目前关 于麻 痹性 贝 毒 ( P S P ) 的来 源 问 题 仍悬 而未 决 , 而 甲藻共 生 菌 产 毒 假 说 认 为 , 赤 潮 藻 内共 生 菌 才 是 P S P的 主 要 生 产 者 J 。该 学 说得 到 了 日益增 加 的赤 潮 藻产 毒共 生 菌 数 量
据库 匹 配 , 此 外 尚有 5 % 的 未 知 种 。其 包 含 5 7个 属 , 其 中 优 势 菌 属 5个 , 分别 为 R h o d o b a c t e r a c e a e 、
Ma r i n o b a c t e r 、 Me t h y l o p h a g a 、 N i t r a t i r e d u c t o r 及P h y c i s p h a e r a 。研 究表明东海产 P S P塔玛亚历 山大藻( a t 3 # ) 含有物 种丰富的共培养菌群 , 且具有发掘海洋特殊生境微生物新种属 的良好潜力 。
关键 词 :塔玛 亚历 山大藻 ;麻痹性贝毒 ; 共培养菌群 ; 物种多样性
中图分类号 :Q 9 4 9 . 3 文献标识码 :A
有 害赤 潮 是 受 到 全 球关 注 的 重 大环 境 问 题
及 海洋 生态 灾 害 ¨ 。近 年来 , 我 国海 洋 环 境 污
通 过免 培养 微生 物 高通 量 测 序技 术 , 首 次解 析 了 其共 培养 菌群 的种类 、 丰度 及 多 样 性 信 息 。此 研 究结 果可 为后 续 开 展 藻 菌 关 系 等 研 究 提 供 必 要
纯水制 自美 国 Mi l l i p o r e公 司 Mi l l i - Q纯 水系统 。
1 . 2 实验 方法
1 . 2 . 4 数 据分析
第3 8 第 6期
海 洋 渔
M I i Ⅱ e
业
Vo 1 . 3 8, No . 6
2 0 1 6年 1 1 月
F i s h e r i e s
NO V . , 20 1 6
文章编号 :1 0 0 4— 2 4 9 0 ( 2 0 1 6 ) 0 6— 0 6 6 3— 0 7
文 以东 海塔 玛亚历 山大 藻 株 ( a t 3 # ) 为研 究 材 料 ,
收稿 日期 :2 0 1 6— 0 2—1 6
Q I A G E N公司; P C R引物 由上海生工合成 ; 其它化
基金项 目:国家 自然科学基金 ( 4 1 2 0 6 0 9 3 ) ; 中央公益性科研院所基本科研业 务费专项 ( 2 0 1 2 T 0 8 )