sanger测序培训PPT最终精讲
- 格式:ppt
- 大小:5.40 MB
- 文档页数:37
sanger测序结果解读sanger测序是一种经典的测序技术,被广泛应用于DNA测序领域。
它以其高可靠性和较低的成本而闻名,是许多基因研究项目的首选测序方法。
在本文中,我们将以“sanger测序结果解读”为主题,详细介绍sanger 测序的原理、步骤以及如何解读测序结果。
一、Sanger测序原理sanger测序是基于DNA链延伸原理的一种测序方法。
它利用了DNA合成时的一种特性,即位置固定的链终止。
当DNA合成反应中加入了一种特殊的二进制链终止剂(即dideoxynucleotide),DNA合成过程会被阻止。
在sanger测序中,使用一小部分含有4种不同的二进制链终止剂的反应混合物,其中每种终止剂对应一个特定的碱基(A、T、C、G)。
通过测定反应混合物中各个碱基的浓度,可以确定DNA序列中每个位置上的碱基。
二、Sanger测序步骤1. DNA模板制备:首先,需要从目标DNA样本中提取DNA,并对其进行纯化和扩增,以获得足够的DNA模板用于测序。
2. 反应混合物制备:将DNA模板与引物(即反向和正向引物)以及核苷酸(dNTPs)和dideoxynucleotide(ddNTPs)混合。
其中ddNTPs对应着A、T、C和G中的每一个,只是与相应碱基缺失了3'-OH基团,从而阻止相应碱基的链延伸。
3. PCR扩增:反应混合物经过PCR(聚合酶链反应)扩增,使得DNA模板在冷却和加热循环中得以复制。
4. 电泳分离:扩增后的DNA片段通过聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分离。
电泳的原理是根据DNA分子大小,让DNA片段按照大小排列形成“梯度”。
5. 测序反应:将电泳分离后的DNA片段放入4个不同反应管中,每个管中添加一个ddNTP,并在每个管中使用DNA聚合酶进行扩增。
6. 电泳分析:使用高分辨率聚丙烯酰胺凝胶电泳将反应产物进行分离,并根据分子量和颜色的大小排列顺序,读取出测序长度。
三、解读sanger测序结果在sanger测序过程中,通过对反应产物进行电泳分析,可以获得一系列不同长度的DNA片段。
sanger测序原理
Sanger测序是一种DNA测序方法,它基于DNA的合成与断
裂原理。
该方法是1985年由Frederick Sanger及其团队开发的,因此得名为Sanger测序。
在Sanger测序中,首先需要通过PCR或其他方法得到待测DNA的模板序列。
然后,将该模板序列分为多个小片段。
接着,对每个小片段进行DNA合成反应。
DNA合成反应中会加入少量的dideoxynucleotide(ddNTPs),与普通的deoxynucleotide(dNTPs)不同的是,ddNTPs具有
辨识碱基A、T、C、G的能力,但在加入到DNA链中后,无
法再进行链延伸。
合成反应产生的dNTPs和ddNTPs的比例是经过精心调节的,使得在某个时间点,每个小片段的链延伸会停止。
这样,反应结束后,就生成了具有不同长度的DNA片段。
接下来,通过电泳将这些DNA片段分离,根据其长度的不同,可以将DNA分离成一系列的带电DNA片段。
最后,通过一种特殊的染料或放射性示踪剂,检测每个带电DNA片段的长度。
根据这些DNA片段的长度,就可以逆推出原始DNA模板的序列。
Sanger测序是一种经典而常用的测序方法,尽管其速度相对较
慢,但仍然广泛应用于一些较小规模的测序项目和基因组研究中。
sanger测序技术原理小伙伴们!今天咱们来聊一聊超酷的Sanger测序技术原理呀。
Sanger测序技术就像是一个超级侦探,专门去探寻DNA序列这个神秘世界的真相。
你想啊,DNA那可是生命的密码本,里面藏着无数关于我们从哪儿来,为啥长这样之类的超级秘密呢。
Sanger测序技术的核心是一种很有趣的化学反应哦。
它利用了DNA聚合酶这个小助手。
这个DNA聚合酶就像是一个勤劳的建筑工人,它的工作就是把一个个核苷酸按照模板DNA的样子,一个一个地搭建起来,形成新的DNA链。
不过呢,这里面有个小把戏。
我们会给这个建筑工人一些特别的“建筑材料”,也就是双脱氧核苷酸(ddNTP)。
正常的核苷酸(dNTP)就像是完整的砖头,可以让这个链子一直延伸下去。
但是双脱氧核苷酸(ddNTP)就像是缺了一块的砖头,一旦它被DNA聚合酶用了,这个新的DNA链就不能再继续延长啦,就像盖房子盖到一半,没材料了一样。
那这个双脱氧核苷酸(ddNTP)是怎么标记的呢?这可就更有趣啦。
我们会给不同的ddNTP标记上不同的颜色,就像给不同的小砖头涂上不同的颜色一样。
比如说,给ddATP标记上一种颜色,给ddTTP标记上另一种颜色,这样我们就能区分它们啦。
然后呢,我们把模板DNA、DNA聚合酶、正常的核苷酸(dNTP)还有那些特别的双脱氧核苷酸(ddNTP)都放在一起,就像开一个大派对一样。
在这个派对里,DNA聚合酶就开始工作啦。
它会随机地把正常的核苷酸或者双脱氧核苷酸接到新的DNA链上。
因为双脱氧核苷酸会让链停止生长,所以最后就会形成好多长短不一的DNA片段。
这些DNA片段可都是宝贝呢。
我们把它们放在一个特殊的凝胶里,这个凝胶就像是一个大迷宫。
然后给这个迷宫加上电,那些带负电的DNA片段就会开始在迷宫里跑起来啦。
小的片段跑得就快,大的片段跑得就慢。
就像一群小动物在赛跑,小老鼠跑得比大象快多啦。
当这些片段在凝胶里跑了一段距离之后呢,因为我们之前给双脱氧核苷酸标记了颜色,所以我们就能看到不同颜色的条带啦。
Sanger测序原理与方法在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。
目前用于DNA测序的技术主要有Frederick Sanger发明的Sanger双脱氧链终止法(Chain Termination Method)。
快速DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。
测序原理利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物,直到掺入一种链终止核苷酸为止。
每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)。
由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止。
终止点由反应中相应的双脱氧而定。
每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整,使反应得到一组长几百至几千碱基的链终止产物。
它们具有共同的起始点,终止点由反应中相应的双脱氧而定。
测序方法基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR 产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物,使得四种荧光染料的测序PCR产物可在一根毛细管内电泳,从而避免了泳道间迁移率差异的影响,大大提高了测序的精确度。
由于分子大小不同,在毛细管电泳中的迁移率也不同,当其通过毛细管读数窗口段时,激光检测器窗口中的CCD(charge-coupled device)摄影机检测器就可对荧光分子逐个进行检测,激发的荧光经光栅分光,以区分代表不同碱基信息的不同颜色的荧光,并在CCD摄影机上同步成像,分析软件可自动将不同荧光转变为DNA序列,从而达到DNA测序的目的。
分析结果能以凝胶电泳图谱、荧光吸收峰图或碱基排列顺序等多种形式输出。
测序设备DNA测序仪(3730xl DNA Analyzer),性能特点,自动化程度高,提供连续、无需监控的操作,自动灌胶、上样、电泳分离、检测及数据分析,可连续运行24小时无需人工干预。
sanger 测序法Sanger测序法,也称为链终止法,是一种生物学技术,用于在DNA或RNA分子中确定序列的方法。
简而言之,它可以帮助我们找出基因或其他生物分子的确切顺序。
Sanger测序法是20世纪70年代由Frederick Sanger等人开发的,并于1980年获得了诺贝尔化学奖。
Sanger测序法基于DNA链延伸的原理。
它需要以下四个主要组成部分:一些待测序的DNA分子,起始DNA链和末端DNA链、DNA酶、DNA聚合酶和核酸清单(the dideoxynucleotide terminating mix)。
DNA聚合酶会将待测序DNA与一个起始DNA链配对,并在这些DNA酶的作用下,在每个位置上加入一个dNTP(简称deoxynucleotide,即包含脱氧核糖的核苷酸),形成新的DNA链。
银行测序法通过加入dideoxynucleotide,即复合物ddNTP,来终止DNA链的生长。
这是因为在ddNTP中,没有一个3'羟基,这一羟基在DNA链延伸过程中分子向当前分子加上新的碱基(A,T,C或G)起到了重要作用。
因此,在存在ddNTP的反应中,DNA聚合酶无法将ddNTP添加到DNA的3'端,因此DNA链的延伸停止。
这样,我们就能够确定每个位置上所以存在碱基的类型,进而确定该DNA分子的真实序列。
Sanger测序法的优点是其稳定性和准确性,其缺点在于它需要大量的实验操作,并且只能处理少量的DNA序列。
然而,由于测序技术的突飞猛进,Sanger测序法已经成为前基因组时代,即在基因组大规模测序技术出现之前,进行单个基因或低质量DNA样品测序的首选技术。
现在,高通量测序技术已经取代了Sanger测序法,并且可以处理大规模的基因组序列,让我们能够更快速和准确地了解生物分子中的基因组和其他信息。
总之,Sanger测序法是一种基于DNA链延伸原理的技术,用于确定DNA分子中低数目的准确序列。