各种标签Tag的核苷酸与氨基酸序列
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蛋白标签蛋白标签(protei ntag)是指利用DN A体外重组技术,与目的蛋白一起融合表达的一种多肽或者蛋白,以便于目的蛋白的表达、检测、示踪和纯化等。
随着技术的不断发展,研究人员相继开发出了具有各种不同功能的蛋白标签。
目前,这些蛋白标签已在基础研究和商业化产品生产等方面得到了广泛的应用。
美国Gene Copoe ia(复能基因)为客户提供50多种蛋白标签,可以满足客户的不同需求,包括各种最新型的标签,如:SNAP-Tag™、HaloTag™、AviTag™、Sumo等;也提供齐全的各种常用标签,如eGFP、His、Flag等等标签。
∙标签的分子量小,只有~0.84KD,而GST和蛋白A分别为~26KD和~30KD,一般不影响目标蛋白的功能;∙His标签融合蛋白可以在非离子型表面活性剂存在的条件下或变性条件下纯化,前者在纯化疏水性强的蛋白得到应用,后者在纯化包涵体蛋白时特别有用,用高浓度的变性剂溶解后通过金属螯和亲和层析去除杂蛋白,使复性不受其它蛋白的干扰,或进行金属螯和亲和层析复性;∙His标签融合蛋白也被用于蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA相互作用研究;∙His标签免疫原性相对较低,可将纯化的蛋白直接注射动物进行免疫并制备抗体。
∙可应用于多种表达系统,纯化的条件温和;∙可以和其它的亲和标签一起构建双亲和标签。
Flag标签蛋白Flag标签蛋白为编码8个氨基酸的亲水性多肽(DYKDDD DK),同时载体中构建的Koz ak序列使得带有FL AG的融合蛋白在真核表达系统中表达效率更高。
FLAG作为标签蛋白,其融合表达目的蛋白后具有以下优点:∙FLAG作为融合表达标签,其通常不会与目的蛋白相互作用并且通常不会影响目的蛋白的功能、性质,这样就有利用研究人员对融合蛋白进行下游研究。
核苷酸氨基酸序列转换核苷酸和氨基酸序列的转换是生物学研究中常见的任务。
核苷酸序列是由四种碱基(腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶)组成的,而氨基酸序列是由20种氨基酸组成的。
在生物学研究中,了解核酸和蛋白质的序列信息对于理解生物体的结构和功能至关重要。
通过将核苷酸序列转换为氨基酸序列,我们可以从一个角度更深入地研究生物体的特征和性质。
核苷酸是DNA和RNA的基本构建单元。
DNA是生物体遗传信息的携带者,而RNA在蛋白质合成中起着重要的作用。
核苷酸序列是由不同碱基的排列组合而成,可以根据碱基的顺序确定生物体的遗传信息。
然而,核苷酸序列本身并不能直接揭示生物体的功能和特征,因此需要将其转化为氨基酸序列。
氨基酸是蛋白质的构建单元。
蛋白质是生物体中功能最为丰富的分子,它们在细胞内担任多种重要的生物学功能,如催化反应、结构支持和信号传导等。
氨基酸序列的不同排列组合决定了蛋白质的结构和功能。
通过将核苷酸序列转换为氨基酸序列,我们可以更好地理解蛋白质的性质和功能。
在进行核苷酸到氨基酸序列的转换时,需要参考遗传密码表。
遗传密码表是核苷酸和氨基酸之间的对应关系表,它规定了特定核苷酸序列所对应的氨基酸。
通过查找遗传密码表,可以将核苷酸序列中的碱基转换为相应的氨基酸。
这个过程被称为翻译,是生物体中蛋白质合成的重要步骤之一。
翻译过程在生物体中由核糖体和tRNA共同完成。
核糖体是细胞中的蛋白质合成机器,它能够识别核苷酸序列中的起始密码子,并将相应的氨基酸连接在一起,最终形成氨基酸序列。
tRNA是一种小分子RNA,可以将核苷酸序列与氨基酸进行配对。
tRNA中的特定序列可以与核苷酸序列中的特定序列进行互补配对,从而将正确的氨基酸带到核糖体上。
通过核苷酸到氨基酸序列的转换,我们可以更深入地研究生物体的遗传信息、蛋白质结构和功能。
这对于基因工程、药物设计和疾病治疗等领域具有重要意义。
通过了解生物体的遗传信息和蛋白质特性,我们可以更好地理解生物体的内部机制,并为生物学研究和应用提供更多的可能性。
生物信息学_复习题及答案(打印)(1)一、名词解释:1.生物信息学:研究大量生物数据复杂关系的学科,其特征是多学科交叉,以互联网为媒介,数据库为载体。
利用数学知识建立各种数学模型; 利用计算机为工具对实验所得大量生物学数据进行储存、检索、处理及分析,并以生物学知识对结果进行解释。
2.二级数据库:在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来,是对生物学知识和信息的进一步的整理。
3.FASTA序列格式:是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串,大于号(>)表示一个新文件的开始,其他无特殊要求。
4.genbank序列格式:是GenBank 数据库的基本信息单位,是最为广泛的生物信息学序列格式之一。
该文件格式按域划分为4个部分:第一部分包含整个记录的信息(描述符);第二部分包含注释;第三部分是引文区,提供了这个记录的科学依据;第四部分是核苷酸序列本身,以“//”结尾。
5.Entrez检索系统:是NCBI开发的核心检索系统,集成了NCBI 的各种数据库,具有链接的数据库多,使用方便,能够进行交叉索引等特点。
6.BLAST:基本局部比对搜索工具,用于相似性搜索的工具,对需要进行检索的序列与数据库中的每个序列做相似性比较。
P947.查询序列(query sequence):也称被检索序列,用来在数据库中检索并进行相似性比较的序列。
P988.打分矩阵(scoring matrix):在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。
包括基于理论(如考虑核酸和氨基酸之间的类似性)和实际进化距离(如PAM)两类方法。
P299.空位(gap):在序列比对时,由于序列长度不同,需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果,这样在其中一序列上产生中断现象,这些中断的位点称为空位。
P2910.空位罚分:空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响,序列中的空位的引入不代表真正的进化事件,所以要对其进行罚分,空位罚分的多少直接影响对比的结果。
5 / GGT AAG CCT ATC CCT AAC CCT CTC CTC GGT CTC GAT TCT ACG3G K P__I P N P L L G L D ST 6 X His tagCAT CAT CAC CAT CAC CAT H H H H H HS-tag AAA GAA ACC GCT GCT GCT AAA TTC GAACGC CAG CAC A TG GAC A GCKETAAAKFERQHMDSFlag-Tag GAT TAC AAG GAT GAC GAC GAT AAGDYKDDDDKMyc-Tag GAG CAG AAA CTC ATC TCT GAA GAG GAT CTG» B TSOOS O A MU —sa«M-竺 am ^3-PPfeSb <■拥 HK Btzs anas?■ 靜Inharrwl ftMd时 如0心 .U g ifT 丽 i£務 ■因凶低=o ci e■ 曲帝 口■^) (3 “ © e 铀号強■ awHA-Tag TAC CCA TAC GAC GTC CCA GAC TAC GCTTATACAGACATAGAGATGAACCGACTTGGAAAGThromb in recog ni ses the consen sus seque nee Leu-Val-Pro-Arg-Gly-SerSequenee CTG GTT CCG CGT GGA TCC重组蛋白表达技术现已经广泛应用于生物学各个具体领域。
特别是体内功能研究和蛋白质的大规模生产都需要应用重组蛋白表达载体。
:His6是指六个组氨酸残基组成的融合标签,可插入在目的蛋白的 C 末端或N 末端。
当某一个标签的使用,一是能构成表位利于纯化和检测;二是构成独特的结构特征(结合配体) 利于纯化。
组氨酸残基侧链与固态的镍有强烈的吸引力,可用于固定化金属螯合层析(IMAC),对重组蛋白进行分离纯化。
蛋白标签蛋白标签(proteintag)是指利用DNA体外重组技术,与目的蛋白一起融合表达的一种多肽或者蛋白,以便于目的蛋白的表达、检测、示踪和纯化等。
随着技术的不断发展,研究人员相继开发出了具有各种不同功能的蛋白标签。
目前,这些蛋白标签已在基础研究和商业化产品生产等方面得到了广泛的应用。
美国GeneCopoeia(复能基因)为客户提供50多种蛋白标签,可以满足客户的不同需求,包括各种最新型的标签,如:SNAP-Tag™、Halo Tag™、AviTag™、Sumo等;也提供齐全的各种常用标签,如eGFP、His、Flag等等标签。
∙标签的分子量小,只有~0.84KD,而GST和蛋白A分别为~26KD和~30KD,一般不影响目标蛋白的功能;∙His标签融合蛋白可以在非离子型表面活性剂存在的条件下或变性条件下纯化,前者在纯化疏水性强的蛋白得到应用,后者在纯化包涵体蛋白时特别有用,用高浓度的变性剂溶解后通过金属螯和亲和层析去除杂蛋白,使复性不受其它蛋白的干扰,或进行金属螯和亲和层析复性;∙His标签融合蛋白也被用于蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA相互作用研究;∙His标签免疫原性相对较低,可将纯化的蛋白直接注射动物进行免疫并制备抗体。
∙可应用于多种表达系统,纯化的条件温和;∙可以和其它的亲和标签一起构建双亲和标签。
Flag标签蛋白Flag标签蛋白为编码8个氨基酸的亲水性多肽(DYKDDDDK),同时载体中构建的Kozak序列使得带有FLAG的融合蛋白在真核表达系统中表达效率更高。
FLAG作为标签蛋白,其融合表达目的蛋白后具有以下优点:∙FLAG作为融合表达标签,其通常不会与目的蛋白相互作用并且通常不会影响目的蛋白的功能、性质,这样就有利用研究人员对融合蛋白进行下游研究。
∙融合FLAG的目的蛋白,可以直接通过FLAG进行亲和层析,此层析为非变性纯化,可以纯化有活性的融合蛋白,并且纯化效率高。
∙FLAG作为标签蛋白,其可以被抗FLAG的抗体识别,这样就方便通过Western Blot、ELISA等方法对含有FLAG的融合蛋白进行检测、鉴定。
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蛋白标签蛋白标签(proteintag)是指利用DNA体外重组技术,与目的蛋白一起融合表达的一种多肽或者蛋白,以便于目的蛋白的表达、检测、示踪和纯化等。
随着技术的不断发展,研究人员相继开发出了具有各种不同功能的蛋白标签。
目前,这些蛋白标签已在基础研究和商业化产品生产等方面得到了广泛的应用。
美国GeneCopoeia(复能基因)为客户提供50多种蛋白标签,可以满足客户的不同需求,包括各种最新型的标签,如:SNAP-Tag?、Halo Tag?、A viTag?、Sumo等;也提供齐全的各种常用标签,如eGFP、His、Flag等等标签。
以下是部分蛋白标签的特性介绍,更加详细的介绍可在查询克隆产品的结果列表里面看到各种推荐的蛋白标签和载体。
标签纯化促进溶解度抗体效价细胞标记His6 + +/- +/-Flag + +/- +GST + + +MBP + ++ +His-MBP ++ + +HA +eGFP/CFP/YFP +++Myc +His-Myc + +His-AviTag?++ ++ ++Sumo +++ +His-Sumo ++ ++ +SNAP-Tag?++ + +++Halo Tag?++ + +++TrxHISHis6是指六个组氨酸残基组成的融合标签,可插入在目的蛋白的C末端或N末端。
当某一个标签的使用,一是能构成表位利于纯化和检测;二是构成独特的结构特征(结合配体)利于纯化。
组氨酸残基侧链与固态的镍有强烈的吸引力,可用于固定化金属螯合层析(IMAC),对重组蛋白进行分离纯化。
使用His-tag有下面优点:?标签的分子量小,只有~0.84KD,而GST和蛋白A分别为~26KD和~30KD,一般不影响目标蛋白的功能;?His标签融合蛋白可以在非离子型表面活性剂存在的条件下或变性条件下纯化,前者在纯化疏水性强的蛋白得到应用,后者在纯化包涵体蛋白时特别有用,用高浓度的变性剂溶解后通过金属螯和亲和层析去除杂蛋白,使复性不受其它蛋白的干扰,或进行金属螯和亲和层析复性;?His标签融合蛋白也被用于蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA相互作用研究;?His标签免疫原性相对较低,可将纯化的蛋白直接注射动物进行免疫并制备抗体。
常见tag蛋白标签介绍在分子生物学和生物化学领域中,蛋白质标签是进行蛋白质表达、纯化和定位的重要工具。
其中,tag蛋白质标签是通过在蛋白质的N端或C端结合不同的蛋白质标签,可用于检测、纯化和追踪蛋白质。
下面,我们将介绍几种常见的tag蛋白标签。
His-TagHis-Tag是由6个组氨酸序列(His-His-His-His-His-His)组成,并且容易被许多金属离子亲和树脂(如Ni-NTA矩阵)捕捉。
这使得His-Tag成为常用的纯化标签之一。
此外,His-Tag蛋白标签具有中性对目标蛋白质溶解压力的作用,能够在蛋白质纯化的过程中保持目标蛋白原始的构象和生物活性。
GST-TagGST-Tag是由谷氨酸(G)-丝氨酸(S)-硫氨酸(T)三个氨基酸,以及谷氨酸二肽(DGP)组成的标签。
GST-Tag主要用于增强蛋白质的溶解和稳定性,并且也常用于纯化蛋白质。
此外,由于GST-Tag蛋白标签对多种酶具有亲和性,也可以用于显微镜研究中的指示标记。
FLAG-TagFLAG-Tag标签由Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys(DYKDDDDK)组成,通常用于识别和高效表达蛋白质。
FLAG-Tag的鉴定方法是通过利用抗体识别FLAG标签,从而对FLAG标签的蛋白产物进行检测分析。
由于其广泛应用和成功的用例,它成为了最常用的蛋白质标记之一。
HA-TagHA-Tag标签由YPYDVPDYA序列组成,被广泛用于病毒插入物好转载体的制备。
HA-Tag蛋白标签可以将蛋白质捕捉到表面上的抗HA抗体上,并通过其特异性快速检测引入的基因。
Myc-TagMyc-Tag通常由EQKLISEEDL序列组成,并且通常被用于稳定的表达和检测。
当蛋白质连接到Myc-Tag标签时,它与特异性抗体反应,从而实现检测。
Myc-Tag 标签是许多流行的促进反应的标记中最新的标记之一。
GFP-TagGFP-Tag由最常见的荧光蛋白质GFP(Green Fluorescence Protein)制成。
V5-tag5ˊGGT AAG CCT ATC CCT AAC CCT CTC CTC GGT CTC GAT TCT ACG 3ˊ6 X His tagCAT CAT CAC CAT CAC CATS-tag AAA GAA ACC GCT GCT GCT AAA TTC GAACGC CAG CAC A TG GAC A GCFlag-Tag GAT TAC AAG GAT GAC GAC GAT AAGMyc-Tag GAG CAG AAA CTC ATC TCT GAA GAG GAT CTGHA-Tag TAC CCA TAC GAC GTC CCA GAC TAC GCTVSV-G: TATACAGACATAGAGATGAACCGACTTGGAAAGThrombin recognises the consensus sequence Leu-Val-Pro-Arg-Gly-Ser Sequence:CTG GTT CCG CGT GGA TCC重组蛋白表达技术现已经广泛应用于生物学各个具体领域。
特别是体内功能研究和蛋白质的大规模生产都需要应用重组蛋白表达载体。
美国GeneCopoeia的蛋白表达载体按照表达宿主的不同新推出3类,分别为表达宿主为大肠杆菌,哺乳动物细胞的,以及慢病毒载体,宿主可以为哺乳动物细胞和原代细胞。
除了必要的复制和筛选的元件,协助表达和翻译的元件外,本文将各类载体分别按照功能标签的不同确定种类并将个标签的功能初步介绍如下:His6:His6是指六个组氨酸残基组成的融合标签,可插入在目的蛋白的C末端或N末端。
当某一个标签的使用,一是能构成表位利于纯化和检测;二是构成独特的结构特征(结合配体)利于纯化。
组氨酸残基侧链与固态的镍有强烈的吸引力,可用于固定化金属螯合层析(IMAC),对重组蛋白进行分离纯化。
使用His-tag有下面优点:1.标签的分子量小,只有~0.84KD,而GST和蛋白A分别为~26KD和~30KD,一般不影响目标蛋白的功能;2.His标签融合蛋白可以在非离子型表面活性剂存在的条件下或变性条件下纯化,前者在纯化疏水性强的蛋白得到应用,后者在纯化包涵体蛋白时特别有用,用高浓度的变性剂溶解后通过金属螯和亲和层析去除杂蛋白,使复性不受其它蛋白的干扰,或进行金属螯和亲和层析复性;3.His标签融合蛋白也被用于蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA相互作用研究;5.可应用于多种表达系统,纯化的条件温和;6.可以和其它的亲和标签一起构建双亲和标签。
trx tag氨基酸序列TRX标签是一种常用的蛋白质表达和纯化工具,它是由氧还蛋白(thioredoxin,TRX)的N端和多肽序列组成的。
TRX标签通常被用于在大肠杆菌中表达重组蛋白质,并且可以通过亲和层析法进行纯化。
TRX标签的氨基酸序列是非常重要的,因为它决定了标签的性质和功能。
在本文中,我们将详细介绍TRX标签的氨基酸序列及其在蛋白质表达和纯化中的应用。
TRX标签的氨基酸序列TRX标签的氨基酸序列通常由三个部分组成:TRX蛋白质的N端,多肽序列和TRX蛋白质的C端。
TRX蛋白质的N端包含了一个信号肽序列,用于将TRX 标签定向到细胞质中。
多肽序列是TRX标签的核心部分,它通常由6-10个氨基酸组成,用于增加标签的亲和性和稳定性。
TRX蛋白质的C端包含了一个His 标签序列,用于在纯化过程中进行亲和层析。
TRX标签的氨基酸序列通常为:MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHM,其中“MG”是TRX蛋白质的信号肽序列,“SSHHHHHH”是His标签序列,“GLVPRGSHM”是多肽序列。
这个序列可以在大肠杆菌中高效表达,并且可以通过亲和层析法进行纯化。
TRX标签的应用TRX标签是一种非常常用的蛋白质表达和纯化工具,它具有以下几个优点:1. 高效表达:TRX标签可以在大肠杆菌中高效表达,因为TRX蛋白质是一种天然存在于大肠杆菌中的蛋白质。
2. 稳定性:多肽序列可以增加标签的稳定性,使其在表达和纯化过程中不易降解。
3. 亲和性:多肽序列可以增加标签的亲和性,使其在纯化过程中更容易与目标蛋白质结合。
4. 可逆性:TRX蛋白质具有还原性,可以将目标蛋白质的二硫键还原,从而增加其可溶性和稳定性。
TRX标签通常被用于以下几个方面:1. 蛋白质表达:TRX标签可以用于在大肠杆菌中表达重组蛋白质,从而获得大量的目标蛋白质。
2. 蛋白质纯化:TRX标签可以通过亲和层析法进行纯化,从而获得高纯度的目标蛋白质。
V5-tag5ˊGGT AAG CCT ATC CCT AAC CCT CTC CTC GGT CTC GAT TCT ACG 3ˊG K P I P N P L L G L D S T6 X His tagCAT CAT CAC CAT CAC CATH H H H H HS-tag AAA GAA ACC GCT GCT GCT AAA TTC GAA CGC CAG CAC A TG GAC A GCKETAAAKFERQHMDSFlag-Tag GAT TAC AAG GAT GAC GAC GAT AAGD Y K D D D D KMyc-Tag GAG CAG AAA CTC ATC TCT GAA GAG GAT CTGHA-Tag TAC CCA TAC GAC GTC CCA GAC TAC GCTVSV-G: TATACAGACATAGAGATGAACCGACTTGGAAAGThrombin recognises the consensus sequence Leu-Val-Pro-Arg-Gly-Ser Sequence:CTG GTT CCG CGT GGA TCC重组蛋白表达技术现已经广泛应用于生物学各个具体领域。
特别是体内功能研究和蛋白质的大规模生产都需要应用重组蛋白表达载体。
美国GeneCopoeia的蛋白表达载体按照表达宿主的不同新推出3类,分别为表达宿主为大肠杆菌,哺乳动物细胞的,以及慢病毒载体,宿主可以为哺乳动物细胞和原代细胞。
除了必要的复制和筛选的元件,协助表达和翻译的元件外,本文将各类载体分别按照功能标签的不同确定种类并将个标签的功能初步介绍如下:His6:His6是指六个组氨酸残基组成的融合标签,可插入在目的蛋白的C末端或N末端。
当某一个标签的使用,一是能构成表位利于纯化和检测;二是构成独特的结构特征(结合配体)利于纯化。
组氨酸残基侧链与固态的镍有强烈的吸引力,可用于固定化金属螯合层析(IMAC),对重组蛋白进行分离纯化。
使用His-tag有下面优点:1.标签的分子量小,只有~0.84KD,而GST和蛋白A分别为~26KD和~30KD,一般不影响目标蛋白的功能;2.His标签融合蛋白可以在非离子型表面活性剂存在的条件下或变性条件下纯化,前者在纯化疏水性强的蛋白得到应用,后者在纯化包涵体蛋白时特别有用,用高浓度的变性剂溶解后通过金属螯和亲和层析去除杂蛋白,使复性不受其它蛋白的干扰,或进行金属螯和亲和层析复性;3.His标签融合蛋白也被用于蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA相互作用研究;5.可应用于多种表达系统,纯化的条件温和;6.可以和其它的亲和标签一起构建双亲和标签。
Flag:Flag标签蛋白为编码8个氨基酸的亲水性多肽(DYKDDDDK),同时载体中构建的Kozak 序列使得带有FLAG的融合蛋白在真核表达系统中表达效率更高。
FLAG作为标签蛋白,其融合表达目的蛋白后具有以下优点:1.FLAG作为融合表达标签,其通常不会与目的蛋白相互作用并且通常不会影响目的蛋白的功能、性质,这样就有利用研究人员对融合蛋白进行下游研究。
2.融合FLAG的目的蛋白,可以直接通过FLAG进行亲和层析,此层析为非变性纯化,可以纯化有活性的融合蛋白,并且纯化效率高。
3.FLAG作为标签蛋白,其可以被抗FLAG的抗体识别,这样就方便通过Western Blot、ELISA等方法对含有FLAG的融合蛋白进行检测、鉴定。
4.融合在N端的FLAG,其可以被肠激酶切除(DDDK),从而得到特异的目的蛋白。
因此现FLAG标签已广泛的应用于蛋白表达、纯化、鉴定、功能研究及其蛋白相互作用等相关领域。
MBP:MBP(麦芽糖结合蛋白)标签蛋白大小为40kDa,由大肠杆菌K12的malE基因编码。
MBP可增加在细菌中过量表达的融合蛋白的溶解性,尤其是真核蛋白。
MBP标签可通过免疫分析很方便地检测。
有必要用位点专一的蛋白酶切割标签。
如果蛋白在细菌中表达,MBP可以融合在蛋白的N端或C端。
纯化:融合蛋白可通过交联淀粉亲和层析一步纯化。
结合的融合蛋白可用10mM麦芽糖在生理缓冲液中进行洗脱。
结合亲和力在微摩尔范围。
一些融合蛋白在0.2% Triton X-100或0.25% Tween 20存在下不能有效结合,而其他融合蛋白则不受影响。
缓冲条件为pH7.0到8.5,盐浓度可高达1M,但不能使用变性剂。
如果要去除MBP融合部分,可用位点特异性蛋白酶切除。
检测:可用MBP抗体或表达的目的蛋白特异性抗体检测。
GST:GST(谷胱甘肽巯基转移酶) 标签蛋白本身是一个在解毒过程中起到重要作用的转移酶,它的天然大小为26KD。
将它应用在原核表达的原因大致有两个,一个是因为它是一个高度可溶的蛋白,希望可以利用它增加外源蛋白的可溶性;另一个是它可以在大肠杆菌中大量表达,起到提高表达量的作用。
GST融合表达系统广泛应用于各种融合蛋白的表达,可以在大肠杆菌和酵母菌等宿主细胞中表达。
结合的融合蛋白在非变性条件下用10mM 还原型谷胱甘肽洗脱。
在大多数情况下,融合蛋白在水溶液中是可溶的,并形成二体。
GST标签可用酶学分析或免疫分析很方便的检测。
标签有助于保护重组蛋白免受胞外蛋白酶的降解并提高其稳定性。
在大多数情况下GST融合蛋白是完全或部分可溶的。
纯化:该表达系统表达的GST标签蛋白可直接从细菌裂解液中利用含有还原型谷胱甘肽琼脂糖凝胶(Glutathionesepharose)亲和树脂进行纯化。
GST标签蛋白可在温和、非变性条件下洗脱,因此保留了蛋白的抗原性和生物活性。
GST在变性条件下会失去对谷胱甘肽树脂的结合能力,因此不能在纯化缓冲液中加入强变性剂如:盐酸胍或尿素等。
如果要去除GST融合部分,可用位点特异性蛋白酶切除。
检测:可用GST抗体或表达的目的蛋白特异性抗体检测。
HAHA标签蛋白,标签序列YPYDVPDYA,源于流感病毒的红细胞凝集素表面抗原决定簇,9个氨基酸,对外源靶蛋白的空间结构影响小, 容易构建成标签蛋白融合到N端或者C端。
易于用Anti-HA抗体检测和ELISA检测。
c-MycC-Myc标签蛋白,是一个含11个氨基酸的小标签,标签序列Glu-Gln-Lys-Leu-Ile-Ser-Glu-Glu-Asp-Leu,这11个氨基酸作为抗原表位表达在不同的蛋白质框架中仍可识别其相应抗体。
C-Myc tag已成功应用在Western-blot杂交技术、免疫沉淀和流式细胞计量术中, 可用于检测重组蛋白质在靶细胞中的表达。
eGFP/eCFP/eYFP/mCherry分别是增强型绿色荧光蛋白/增强型黄绿色荧光蛋白/增强型黄绿色荧光蛋白/单体红色荧光蛋白,具有不同的激发波长发射波长为,均由野生型荧光蛋白通过氨基酸突变和密码子优化而来。
就eGFP而言,相对于GFP,其荧光强度更强、荧光性质更稳定。
同时载体中构建的Kozak序列使得含有eGFP的融合蛋白在真核表达系统中表达效率更高。
mCherry 是从DsRed演化来的性能最好的一个单体红色荧光蛋白,可以和GFP系列荧光蛋白共用,实现多色标记体内、外实验表明,mCherry在N端和C端融合外源蛋白时,荧光蛋白活性和被融合的目标蛋白功能相互没有明显影响。
这些荧光标签蛋白,其融合表达目的蛋白后具有以下优点:1.不用破碎组织细胞和不加任何底物,直接通过荧光显微镜就能在活细胞中发出绿色荧光,实时显示目的基因的表达情况,而且荧光性质稳定,被誉为活细胞探针。
2.其自发荧光,不需用目的基因的抗体或原位杂交技术就可推知目的基因在细胞中的定位等情况。
3.同时细胞内的其它产物不会干扰标签蛋白检测,从而使其检测更显得快速、简便、灵敏度高而且重现性。
4.其低消耗、高灵敏度检测,十分适用于高通量的药物筛选。
因此现eGFP 表达标签被广泛地应用于基团表达调控、转基因功能研究、蛋白在细胞中的功能定位、迁移变化及药物筛选等方面。
5.mCherry红色荧光蛋白在标记病毒颗粒,研究病毒和宿主细胞之间更有得天独厚的优势。
如用mRFP或mCherry标记HIV病毒颗粒,研究H1V和宿主细胞问的相互作用以及HIV侵染宿主细胞的过程.用mRFP标记慢病毒颗粒,研究慢病毒在小鼠体内的复制过程等。
荧光素酶来源于生物体内的荧光素,常见的有萤火虫荧光素酶、海肾荧光素酶和Guassia荧光素酶。
这些荧光素酶作为“报告蛋白”被用于分子生物学研究中,这种技术被称为报告基因检测法或萤光素酶检测法(Luciferase Assay)。
跟普通融合蛋白标签不同,使用荧光素酶构建的报告基因可用作目的基因的定量分析。
因此常用于研究启动子、miRNA 3'UTR克隆的功能与调控,因为它们对目的基因的调控可以是渐变的,而不是简单的开和关两种状态。
优点:灵敏度高,检测幅度宽;不是哺乳动物细胞内源性基因;重复性好;与HTS兼容等。
萤火虫和海肾荧光素酶已经被广泛应用于协同报告并进行均一化研究。
由于它们都是快速,容易和高灵敏的监测方法。
而且萤火虫和海肾荧光素酶是理想的双基因报告系统,因为它们来源于不同的生物进化方向,蛋白结构和底物差异都很大,在实验中不会产生相互影响。
基于荧光素酶的特性,我司研发提供的Secrete-Pair? Dual Luminescence Assay Kit 可用于分析双报告系统中Gaussia荧光素酶(GLuc)和分泌型碱性磷酸酶(SEAP)活性。
GLuc 和SEAP均为分泌型报告蛋白,无需裂解细胞即可便捷的从细胞培养液中取得样本,并对实验结果进行精准的实时分析。
Avi TagAviTag标签蛋白是一个15 个氨基酸的短肽,具有一个单生物素化赖氨酸位点,与已知天然可生物素化序列完全不同,可以加在目标蛋白的N端和C端。
融合表达后,可被生物素连接酶生物素化,为了纯化重组蛋白选用低亲和性的单体抗生物素蛋白或抗生物素蛋白衍生物,除了用于蛋白质分离纯化,还用于蛋白质相互作用研究。
Avi Tag标签系统具有以下几大优点:1.无论在体外或者体内,几乎所有的蛋白都可以在一个独特的Avi Tag位点轻易且有效地被生物素化;2.生物素化是通过酶和底物的反应来实现,反应条件相当温和而且标记的专一性极高;3.生物素AviTag只有15个氨基酸,对蛋白空间结构的影响非常小。
SNAP-TagSNAP-Tag是新一代的蛋白标签技术,不仅专一性极高而且稳定,最大的优点是适用于多种环境下的蛋白质检测与纯化,如活细胞内、溶液中、或固态相(如SDS-PAGE gels)等。
SNAP-Tag是从人的O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移(O6-alkylguanine-DNA-alkyltransferase)获得。