pLOX-Ttag-iresTK慢病毒载体使用说明
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LentiCRISPRv2 and lentiGuide-Puro: lentiviral CRISPR/Cas9 and single guide RNA CRISPR (C lustered R egularly I nterspaced S hort P alindromic R epeats) is a microbial nuclease system involved in defense against invading phages and plasmids. CRISPR loci in microbial hosts contain a combination of CRISPR-associated (Cas) genes as well as non-coding RNA elements capable of programming the specificity of the CRISPR-mediated nucleic acid cleavage. Lentiviral CRISPR/Cas can infect a broad variety of mammalian cells by co-expressing a mammalian codon-optimized Cas9 nuclease along with a single guide RNA (sgRNA) to facilitate genome editing (Shalem*, Sanjana*, et al., Science 2014). Protocols for cloning into the lentiviral transfer plasmid and general considerations for producing lentivirus are described below. Separate protocols are available for amplifying the genome-scale CRISPR knock-out (GeCKO) libraries. This protocol is for creating individual lentiviral CRISPR plasmids targeting a single genomic locus.lentiCRISPRv2 (one vector system): This plasmid contains two expression cassettes, hSpCas9 and the chimeric guide RNA. The vector can be digested using BsmB I, and a pair of annealed oligos can be cloned into the single guide RNA scaffold. The oligos are designed based on the target site sequence (20bp) and needs to be flanked on the 3' end by a 3bp NGG PAM sequence, as shown on the next page.lentiGuide-Puro (two vector system): This plasmid expressed only the chimeric guide RNA. It does not contain Cas9. Please use lentiCas9-Blast (a separate lentiviral construct that delivers hSpCas9 and blasticidin resistance) to first integrate Cas9 into your cell line. The lentiGuide-Puro vector can be digested using BsmB I, and a pair of annealed oligos can be cloned into the single guide RNA scaffold. The oligos are designed based on the target site sequence (20bp) and needs to be flanked on the 3' end by a 3bp NGG PAM sequence, as shown on the next page.Which vector to use: lentiCRISPRv2 is identical to the original lentiCRISPRv1 but produces nearly 10X higher titer virus. lentiGuide-Puro produces >100X higher titer virus over lentiCRISPRv1 and should be used in cell lines where Cas9 has already been integrated in (e.g. using the separate lentiCas9-Blast lentivirus). For applications where Cas9 cannot first be introduced (e.g. primary cells), lentiCRISPRv2 is recommended. After transduction, use puromycin to select for cells with lentiCRISPRv2 or lentiGuide-Puro.Lentiviral production: Before starting any lentiviral work, please ensure compliance with your Environmental Health and Safety office and government/organization/university. Briefly, to make lentivirus, a transfer plasmid (e.g. lentiCRISPRv2 or lentiGuide-Puro) must be co-transfected into HEK293(F)T cells with the packaging plasmids pVSVg (AddGene 8454) and psPAX2 (AddGene 12260). As a positive control for viral production, we often use a CMV-EGFP lentiviral transfer plasmid (eg. AddGene 19319).Target design notes and online resources: For application of Cas9 for site-specific genome editing in eukaryotic cells and organisms, we have computationally identified suitable target sites for the S. pyogenes Cas9 and calculated most likely off-targets within the genome. Please visit to access these Cas9 target design tools. Complete plasmid sequences, protocols, a discussion forum and additional information can be found at the Zhang Lab GeCKO website: /gecko/ . Citation: Please reference the following publications for the use of this material.Improved lentiviral vectors and genome-wide libraries for CRISPR screening. Sanjana NE*, Shalem O*, Zhang F. Nature Methods (2014).Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Shalem O*, Sanjana NE*, Hartenian E, Shi X, Scott DA, Mikkelsen T, Heckl D, Ebert BL, Root DE, Doench JG, Zhang F (2014). Science, 343, 83-7. DOI: 10.1126/science.1247005Target Guide Sequence Cloning ProtocolIn order to clone the target sequence into the lentiCRISPRv2 or lentiGuide-Puro backbone, synthesize two oligos of the following form. All plasmids have the same overhangs after BsmBI digestion and the same oligos can be used for cloning into lentiCRISPRv2, lentiGuide-Puro or lentiCRISPRv1.Example oligo design : Note that the NGG PAM is not included in the designed oligos. Oligonucleotide ordering tips : Standard de-salted oligos (usually the most inexpensive synthesis) are sufficient forcloning. If not already resuspended, dilute each oligo to 100 µM in sterile water or TE.* * * * *Lentiviral vector digestion, oligo annealing and cloning into digested vector:1. Digest and dephosphorylate 5ug of the lentiviral CRISPR plasmid with BsmB I for 30 min at 37C: 5 ug lentiCRISPRv2 or lentiGuide-Puro 3 ul FastDigest BsmB I (Fermentas) 3 ul FastAP (Fermentas) 6 ul 10X FastDigest Buffer 0.6 ul 100 mM DTT (freshly prepared) X ul ddH 2O 60 ul total2. Gel purify digested plasmid using QIAquick Gel Extraction Kit and elute in EB. If BsmBI digested, a ~2kb filler piece should be present on the gel. Only gel purify the larger band . Leave the 2kb band.3. Phosphorylate and anneal each pair of oligos: 1 ul Oligo 1 (100 µM) 1 ul Oligo 2 (100 µM) 1 ul 10X T4 Ligation Buffer (NEB) 6.5 ul ddH 2O 0.5 ul T4 PNK (NEB M0201S) 10 ul total Please use the T4 Ligation Buffer since the buffer supplied with the T4 PNK enzyme does not include ATP (or supplement to 1mM ATP).Put the phosphorylation/annealing reaction in a thermocycler using the following parameters: 37o C 30 min 95o C 5 min and then ramp down to 25o C at 5o C/min4. Dilute annealed oligos from Step 3 at a 1:200 dilution into sterile water or EB.5. Set up ligation reaction and incubate at room temperature for 10 min:X ul BsmB I digested plasmidfrom Step 2 (50ng)1 ul diluted oligo duplex from Step 4 5 ul 2X Quick Ligase Buffer (NEB) X ul ddH 2O 10 ul subtotal1 ul Quick Ligase (NEB M2200S) 11 ul total Also perform a negative control ligation (vector-only with water in place of oligos) and transformation.6.Transformation into Stbl3 bacteria . Lentiviral transfer plasmids contain Long-Terminal Repeats (LTRs) and must be transformed into recombination-deficient bacteria. We use homemade Stbl3 (propagated from Invitrogen C7373-03) and get excellent plasmid yields. Although other RecA- strains may work, we have found the most consistent transformations and yields using Stbl3.。
pLenti6.3-MCS慢病毒载体使⽤说明pLenti6.3-MCSpLenti6.3-MCS载体基本信息:载体名称: pLenti6.3-MCS质粒类型: 慢病毒表达载体⾼拷贝/低拷贝: --启动⼦: --克隆⽅法: 多克隆位点,限制性内切酶载体⼤⼩: --5' 测序引物及序列: --3' 测序引物及序列: --载体标签: --载体抗性: --筛选标记: --备注: --稳定性: --组成型: --病毒/⾮病毒: 慢病毒pLenti6.3-MCS载体质粒图谱和多克隆位点信息pLenti6.3-MCS载体序列pLenti6.3-MCS其他相关慢病毒载体:Tet-pLKO-neo Tet-pLKO-puro pPACKH1-GAGpMD2.G pCMV-dR8.2-dvpr pLKO.1-GFP-shRNA pLKO.1-TRC control pLKO.1-hygro pLKO.1-TRCpCDH-MSCV-MCS-EF1-copGFP pCDH-MSCV-MCS-EF1-copGFP-T2A-Puro FUW-tetO-hOKMSFUW-tetO-hOCT4 FUW-tetO-hSOX2 FUW-tetO-hKLF4FUW pLVX-AcGFP1-N1 pLVX-AcGFP1-C1pLVX-AmCyan1-N1 pLVX-DsRed-Express2-C1 pLVX-DsRed-Express2-N1 pLVX-DsRed-Monomer-N1 pLVX-PAmCherry-C1 pLVX-PAmCherry-N1 pLVX-ZsGreen1-N1 pLVX-IRES-ZsGreen1 pLVX-IRES-mCherry pLVX-mCherry-C1 pLVX-mCherry-N1 pLVX-tdTomato-C1 pLKO.1-puro pLentilox 3.7 pLVX-Tet-On-Advanced pLVX-IRES-Puro pLVX-IRES-Neo pLVX-IRES-HygpLVX-EF1α-DsRed-Monomer-C1 pLVX-EF1α-AcGFP1-N1 pLVX-EF1α-AcGFP1-C1 pLVX-EF1α-mCherry-C1 pLVX-EF1α-IRES-mCherry pLVX-EF1α-IRES-ZsGreen1 pLVX-MetLuc Control pLVX-MetLuc pLVX-Hom-Mem1pLVX-Het-2 pLVX-DD-AcGFP1-Actin pPRIME-TET-GFP-FF3pSIH1-H1-CopGFP pCDH-EF1-MCS-T2A-Puro pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro pCDF1-MCS2-EF1-copGFP pLOX-CWBmi1 pLOX-CW-CREpRSV-rev pMDLg-pRRE pLL3.7pLVX-DD-AmCyan1 Control pLVX-DD-AmCyan1 Reporter pLVX-DD-tdTomato Reporter pLVX-DD-tdTomato Control pLVX-PTuner-Green pLVX-CherryPicker2pLVX-TetOne-Puro-Luc pLVX-TetOne pLVX-TetOne-PuropLVX-TetOne-Luc pLVX-rHom-Nuc1 pLVX-rHom-Sec1pLVX-rHom-1 pLVX-Hom-Nuc1 pLVX-Het-Nuc1pLVX-PTuner pLVX-PTuner2 pLVX-DD-ZsGreen1 Reporter pLVX-Het-1 pLVX-CherryPicker Control pLVX-Tet3GpCDH-CMV-MCS-EF1-RFP-T2A-Puro pCDH-CMV-MCS-EF1-Hygro pCDH-CMV-MCS-EF1-Neo pCDH-MCS-T2A-Puro-MSCV pCDH1-MCS2-EF1-copGFP pCDF1-MCS2-EF1-Puro pCDH-EF1-MCS-T2A-copGFP pWPXL pLVX-TRE3G-ZsGreen1 pLVX-TRE3G-mCherry pLenti6.3-EmGFP-BveI miR pLenti6/V5-GW/lacZpLenti6.3/V5-GW/EmGFP pLenti6.3-MCS pLenti6.3-DsRed2-BveI miR pLenti6.3-MCS-IRES2-EGFP pLVX-shRNA2 psPAX2VSV-G pSico PGK Puro pcDNA6.2-DsRed2-MCS1 miR pcDNA6.3-EmGFP-NC- II pcDNA6.2-EmGFP-NC- I pcDNA6.2-EmGFP-BsaI miR pLenti6.3-BveI miR pLenti6.3-MCS-IRES2-DsRed2 pLEX-MCSpGIPZ pLP2 pLP1FUGW pFUGW pLOX-Ttag-iresTKpMDLg/pRRE pLentG-KOSM pCMV-dR8.91pLVX-TRE3G-Luc Control pLVX-TRE3G-IRES pCgpvpSico pSicoR pLVTHMpGensil-1 pLVX-EF1α-IRES-Puro pCDF1-MCS2-EF1-copGFP pPACKH1-REV pLVX-Het-Mem1 pLVX-shRNA1pLKO.1-puro-GFP-siRNA pPRIME-TREX-GFP-FF3 pcDNA6.2-DsRed2-BsmBI miR pCDH-MSCV-MCS-EF1-Puro pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP pLVX-TRE3GFUW-tetO-hMYC pLOX-TERT-iresTK pLP/VSVGFUW-M2rtTA pCDH-EF1-MCS-(PGK-Puro) pcDNA6.2-EmGFP-MCS1 miR pLVX-AmCyan1-C1 pLVX-Hom-1 pcDNA6.2-BsaI miRpLVX-DsRed-Monomer-C1 pLVX-mCherry-Actin pTRIPZpLVX-ZsGreen1-C1 pLVX-CherryPicker1 LeGO-iC2pLVX-IRES-tdTomato pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP-T2A-Puro pLKO.3GpLVX-tdTomato-N1 pLVX-PTuner2-C pLVX-PuropLVX-Tight-Puro pLVX-DD-ZsGreen1 Control pSicoR PGK PuropLVX-EF1α-DsRed-Monomer-N1 pCDH-UbC-MCS-EF1-Hygro pLVTHpLVX-EF1α-mCherry-N1 pCDH-CMV-MCS-EF1-RFP。
慢病毒使用操作指南一、慢病毒的储存与稀释:1. 病毒的储存:用户收到病毒液后在很短时间内即使用慢病毒进行实验,可以将病毒暂时放置于4 ℃保存;如需长期保存请放置于-80℃(病毒置于冻存管,并使用封口膜封口)注:A.病毒可以存放于-80℃6个月以上;但如果病毒储存时间超过6个月,我们建议在使用前需要重新滴定病毒滴度。
B.反复冻融会降低病毒滴度:每次冻融会降低病毒滴度10%;因此在病毒使用过程中应尽量避免反复冻融,为避免反复冻融我们强烈建议客户收到病毒后按照每次的使用量进行分装。
2. 病毒的稀释:用户需要稀释病毒时,请将病毒取出置于冰浴融解后,使用培养目的细胞用PBS或无血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)混匀分装后4℃保存(请尽量在三天内用完),分装后使用。
二、慢病毒用于体外(in vitro)实验:感染培养原代细胞和建系细胞1. 慢病毒对各种细胞和组织的亲嗜性不同,用户使用Invabio提供的慢病毒之前可以通过查阅相关文献,了解慢病毒对您的目的细胞的亲嗜性,感染复数(MOI 值)以及在体内(in vivo)注射所需要的病毒量。
如果没有相关文献支持,可以通过感染预实验得到合适的感染复数(MOI 值)(使用24孔板检测病毒对目的细胞的亲嗜性)2. 慢病毒感染目的细胞预实验①慢病毒感染目的细胞预实验注意事项A.测定慢病毒对目的细胞的亲嗜性时,需要同时设置对慢病毒亲嗜性较高的(HEK293T,Hela)细胞作为平行实验的对照细胞。
B.在进行慢病毒感染实验时,可以用完全培养基(培养目的细胞用)稀释;理论上,含有血清、双抗或者其他营养因子的完全培养基不影响慢病毒的感染效率。
C.Invabio提供的病毒单位为TU/ml,即每毫升中含有具有生物活性的病毒颗粒数。
如:病毒滴度为>1X108 TU/ml 即每毫升病毒液中至少含有1X108个具有生物活性的慢病毒颗粒。
②以24孔培养板为例,进行目的细胞和HEK293T 细胞的感染预实验实验前按照不同的MOI设置不同的感染孔,并根据MOI和细胞数量计算所需要的病毒量,如有必要可以使用PBS溶液或者无血清培养基稀释病毒原液第一天,准备细胞:在24孔培养板接种若干孔,每个孔内接种3~5X104个目的细胞,铺板时细胞的融合率为50%左右,每孔培养基体积为100 μl;进行病毒感染时细胞的融合度约为70%左右。
慢病毒载体包装构建过程原理:慢病毒载体可以将外源基因或外源的shRNA有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达目的序列的效果。
在感染能力方面可有效地感染神经元细胞、肝细胞、心肌细胞、肿瘤细胞、内皮细胞、干细胞等多种类型的细胞,从而达到良好的的基因治疗效果。
对于一些较难转染的细胞, 如原代细胞、干细胞、不分化的细胞等,使用慢病毒载体,能大大提高目的基因或目的shRNA的转导效率,且目的基因或目的shRNA整合到宿主细胞基因组的几率大大增加,能够比较方便快捷地实现目的基因或目的shRNA的长期、稳定表达.概念:慢病毒载体是指以人类免疫缺陷病毒-1 (H IV-1) 来源的一种病毒载体,慢病毒载体包含了包装、转染、稳定整合所需要的遗传信息,是慢病毒载体系统的主要组成部分。
携带有外源基因的慢病毒载体在慢病毒包装质粒、细胞系的辅助下,经过病毒包装成为有感染力的病毒颗粒,通过感染细胞或活体组织,实现外源基因在细胞或活体组织中表达。
辅助成分:慢病毒载体辅助成分包括: 慢病毒包装质粒和可产生病毒颗粒的细胞系。
慢病毒载体包含了包装、转染、稳定整合所需要的遗传信息。
慢病毒包装质粒可提供所有的转录并包装RNA 到重组的假病毒载体所需要的所有辅助蛋白.为产生高滴度的病毒颗粒,需要利用表达载体和包装质粒同时共转染细胞,在细胞中进行病毒的包装,包装好的假病毒颗粒分泌到细胞外的培养基中,离心取得上清液后,可以直接用于宿主细胞的感染,目的基因进入到宿主细胞之后,经过反转录,整合到基因组,从而高水平的表达效应分子。
基本原理:慢病毒载体系统由两部分组成,即包装成分和载体成分.包装成分:由HIV—1基因组去除了包装、逆转录和整合所需的顺式作用序列而构建,能够反式提供产生病毒颗粒所必需的蛋白。
包装成分通常被分开构建到两个质粒上,一个质粒表达Gag和Pol蛋白,另一个质粒表达Env蛋白,其目的也是降低恢复成野生型病毒的可能.将包装成分与载体成分的3个质粒共转染细胞(如人肾293T细胞),即可在细胞上清中收获只有一次性感染能力而无复制能力的、携带目的基因的HIV-1载体颗粒。
pLVX-IRES-Neo pLVX-IRES-Neo载体基本信息:载体名称:pLVX-IRES-Neo, pLVX IRES Neo质粒类型: 慢病毒载体;哺乳动物细胞表达载体;双顺反子载体高拷贝/低拷贝: 高拷贝启动子: CMV克隆方法: 多克隆位点,限制性内切酶载体大小: 8269 bp5' 测序引物及序列: CMV-F: CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG (Invitrogen)3' 测序引物及序列: IRES-R: CCTCACATTGCCAAAAGACG载体标签: 无标签载体抗性: 氨苄青霉素筛选标记: 新霉素Neomycin克隆菌株: Stbl3 E.coli备注: pLVX-IRES-Neo载体以双顺反子的形式同时表达Neo抗性基因和目的基因;CMV启动子驱动目的基因的过表达。
稳定性: 稳表达组成型: 组成型病毒/非病毒: 慢病毒pLVX-IRES-Neo载体质粒图谱和多克隆位点信息:pLVX-IRES-Neo载体序列:ORIGIN1 TGGAAGGGCT AATTCACTCC CAAAGAAGAC AAGATATCCT TGATCTGTGG ATCTACCACA61 CACAAGGCTA CTTCCCTGAT TAGCAGAACT ACACACCAGG GCCAGGGGTC AGATATCCAC121 TGACCTTTGG ATGGTGCTAC AAGCTAGTAC CAGTTGAGCC AGATAAGGTA GAAGAGGCCA 181 ATAAAGGAGA GAACACCAGC TTGTTACACC CTGTGAGCCT GCATGGGATG GATGACCCGG 241 AGAGAGAAGT GTTAGAGTGG AGGTTTGACA GCCGCCTAGC ATTTCATCAC GTGGCCCGAG 301 AGCTGCATCC GGAGTACTTC AAGAACTGCT GATATCGAGC TTGCTACAAG GGACTTTCCG 361 CTGGGGACTT TCCAGGGAGG CGTGGCCTGG GCGGGACTGG GGAGTGGCGA GCCCTCAGAT 421 CCTGCATATA AGCAGCTGCT TTTTGCCTGT ACTGGGTCTC TCTGGTTAGA CCAGATCTGA481 GCCTGGGAGC TCTCTGGCTA ACTAGGGAAC CCACTGCTTA AGCCTCAATA AAGCTTGCCT 541 TGAGTGCTTC AAGTAGTGTG TGCCCGTCTG TTGTGTGACT CTGGTAACTA GAGATCCCTC601 AGACCCTTTT AGTCAGTGTG GAAAATCTCT AGCAGTGGCG CCCGAACAGG GACTTGAAAG 661 CGAAAGGGAA ACCAGAGGAG CTCTCTCGAC GCAGGACTCG GCTTGCTGAA GCGCGCACGG 721 CAAGAGGCGA GGGGCGGCGA CTGGTGAGTA CGCCAAAAAT TTTGACTAGC GGAGGCTAGA 781 AGGAGAGAGA TGGGTGCGAG AGCGTCAGTA TTAAGCGGGG GAGAATTAGA TCGCGATGGG 841 AAAAAATTCG GTTAAGGCCA GGGGGAAAGA AAAAATATAA ATTAAAACAT ATAGTATGGG 901 CAAGCAGGGA GCTAGAACGA TTCGCAGTTA ATCCTGGCCT GTTAGAAACA TCAGAAGGCT 961 GTAGACAAAT ACTGGGACAG CTACAACCAT CCCTTCAGAC AGGATCAGAA GAACTTAGAT 1021 CATTATATAA TACAGTAGCA ACCCTCTATT GTGTGCATCA AAGGATAGAG ATAAAAGACA 1081 CCAAGGAAGC TTTAGACAAG ATAGAGGAAG AGCAAAACAA AAGTAAGACC ACCGCACAGC 1141 AAGCGGCCGG CCGCTGATCT TCAGACCTGG AGGAGGAGAT ATGAGGGACA ATTGGAGAAG 1201 TGAATTATAT AAATATAAAG TAGTAAAAAT TGAACCATTA GGAGTAGCAC CCACCAAGGC 1261 AAAGAGAAGA GTGGTGCAGA GAGAAAAAAG AGCAGTGGGA ATAGGAGCTT TGTTCCTTGG 1321 GTTCTTGGGA GCAGCAGGAA GCACTATGGG CGCAGCGTCA ATGACGCTGA CGGTACAGGC 1381 CAGACAATTA TTGTCTGGTA TAGTGCAGCA GCAGAACAAT TTGCTGAGGG CTATTGAGGC 1441 GCAACAGCAT CTGTTGCAAC TCACAGTCTG GGGCATCAAG CAGCTCCAGG CAAGAATCCT1501 GGCTGTGGAA AGATACCTAA AGGATCAACA GCTCCTGGGG ATTTGGGGTT GCTCTGGAAA 1561 ACTCATTTGC ACCACTGCTG TGCCTTGGAA TGCTAGTTGG AGTAATAAAT CTCTGGAACA 1621 GATTTGGAAT CACACGACCT 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CGGTATCGCC GCTCCCGATT CGCAGCGCAT CGCCTTCTAT 4201 CGCCTTCTTG ACGAGTTCTT CTGAACGCGT CTGGAACAAT CAACCTCTGG ATTACAAAAT 4261 TTGTGAAAGA TTGACTGGTA TTCTTAACTA TGTTGCTCCT TTTACGCTAT GTGGATACGC 4321 TGCTTTAATG CCTTTGTATC ATGCTATTGC TTCCCGTATG GCTTTCATTT TCTCCTCCTT4381 GTATAAATCC TGGTTGCTGT CTCTTTATGA GGAGTTGTGG CCCGTTGTCA GGCAACGTGG 4441 CGTGGTGTGC ACTGTGTTTG CTGACGCAAC CCCCACTGGT TGGGGCATTG CCACCACCTG 4501 TCAGCTCCTT TCCGGGACTT TCGCTTTCCC CCTCCCTATT GCCACGGCGG AACTCATCGC 4561 CGCCTGCCTT GCCCGCTGCT GGACAGGGGC TCGGCTGTTG GGCACTGACA ATTCCGTGGT 4621 GTTGTCGGGG AAGCTGACGT CCTTTCCATG GCTGCTCGCC TGTGTTGCCA CCTGGATTCT 4681 GCGCGGGACG TCCTTCTGCT ACGTCCCTTC GGCCCTCAAT CCAGCGGACC TTCCTTCCCG 4741 CGGCCTGCTG CCGGCTCTGC GGCCTCTTCC GCGTCTTCGC CTTCGCCCTC AGACGAGTCG 4801 GATCTCCCTT TGGGCCGCCT CCCCGCCTGG AATTAATTCT GCAGTCGAGA CCTAGAAAAA 4861 CATGGAGCAA TCACAAGTAG CAATACAGCA GCTACCAATG CTGATTGTGC CTGGCTAGAA 4921 GCACAAGAGG AGGAGGAGGT GGGTTTTCCA GTCACACCTC AGGTACCTTT AAGACCAATG 4981 ACTTACAAGG CAGCTGTAGA TCTTAGCCAC TTTTTAAAAG AAAAGAGGGG ACTGGAAGGG 5041 CTAATTCACT CCCAACGAAG ACAAGATATC CTTGATCTGT GGATCTACCA CACACAAGGC 5101 TACTTCCCTG ATTAGCAGAA CTACACACCA GGGCCAGGGG TCAGATATCC ACTGACCTTT 5161 GGATGGTGCT ACAAGCTAGT ACCAGTTGAG CCAGATAAGG TAGAAGAGGC CAATAAAGGA 5221 GAGAACACCA GCTTGTTACA CCCTGTGAGC CTGCATGGGA TGGATGACCC GGAGAGAGAA 5281 GTGTTAGAGT GGAGGTTTGA CAGCCGCCTA GCATTTCATC ACGTGGCCCG AGAGCTGCAT 5341 CCGGAGTACT TCAAGAACTG CTGATATCGA GCTTGCTACA AGGGACTTTC CGCTGGGGAC 5401 TTTCCAGGGA GGCGTGGCCT GGGCGGGACT GGGGAGTGGC GAGCCCTCAG ATCCTGCATA 5461 TAAGCAGCTG CTTTTTGCCT GTACTGGGTC TCTCTGGTTA GACCAGATCT GAGCCTGGGA 5521 GCTCTCTGGC TAACTAGGGA ACCCACTGCT TAAGCCTCAA TAAAGCTTGC CTTGAGTGCT 5581 TCAAGTAGTG TGTGCCCGTC TGTTGTGTGA CTCTGGTAAC TAGAGATCCC TCAGACCCTT 5641 TTAGTCAGTG TGGAAAATCT CTAGCAGTAG TAGTTCATGT CATCTTATTA TTCAGTATTT 5701 ATAACTTGCA AAGAAATGAA TATCAGAGAG TGAGAGGCCT TGACATTGCT AGCGTTTACC 5761 GTCGACCTCT AGCTAGAGCT TGGCGTAATC ATGGTCATAG CTGTTTCCTG TGTGAAATTG 5821 TTATCCGCTC ACAATTCCAC ACAACATACG AGCCGGAAGC ATAAAGTGTA AAGCCTGGGG 5881 TGCCTAATGA GTGAGCTAAC TCACATTAAT TGCGTTGCGC TCACTGCCCG CTTTCCAGTC 5941 GGGAAACCTG TCGTGCCAGC TGCATTAATG AATCGGCCAA CGCGCGGGGA GAGGCGGTTT 6001 GCGTATTGGG CGCTCTTCCG CTTCCTCGCT CACTGACTCG CTGCGCTCGG TCGTTCGGCT 6061 GCGGCGAGCG GTATCAGCTC ACTCAAAGGC GGTAATACGG TTATCCACAG AATCAGGGGA 6121 TAACGCAGGA AAGAACATGT GAGCAAAAGG CCAGCAAAAG GCCAGGAACC GTAAAAAGGC 6181 CGCGTTGCTG GCGTTTTTCC ATAGGCTCCG CCCCCCTGAC GAGCATCACA AAAATCGACG 6241 CTCAAGTCAG AGGTGGCGAA ACCCGACAGG ACTATAAAGA TACCAGGCGT TTCCCCCTGG 6301 AAGCTCCCTC GTGCGCTCTC CTGTTCCGAC CCTGCCGCTT ACCGGATACC TGTCCGCCTT 6361 TCTCCCTTCG GGAAGCGTGG CGCTTTCTCA TAGCTCACGC TGTAGGTATC TCAGTTCGGT 6421 GTAGGTCGTT CGCTCCAAGC TGGGCTGTGT GCACGAACCC CCCGTTCAGC CCGACCGCTG 6481 CGCCTTATCC GGTAACTATC GTCTTGAGTC CAACCCGGTA AGACACGACT TATCGCCACT 6541 GGCAGCAGCC ACTGGTAACA GGATTAGCAG AGCGAGGTAT GTAGGCGGTG CTACAGAGTT 6601 CTTGAAGTGG TGGCCTAACT ACGGCTACAC TAGAAGAACA GTATTTGGTA TCTGCGCTCT 6661 GCTGAAGCCA GTTACCTTCG GAAAAAGAGT TGGTAGCTCT TGATCCGGCA AACAAACCAC 6721 CGCTGGTAGC GGTGGTTTTT TTGTTTGCAA GCAGCAGATT ACGCGCAGAA AAAAAGGATC6781 TCAAGAAGAT CCTTTGATCT TTTCTACGGG GTCTGACGCT CAGTGGAACG AAAACTCACG6841 TTAAGGGATT TTGGTCATGA GATTATCAAA AAGGATCTTC ACCTAGATCC TTTTAAATTA6901 AAAATGAAGT TTTAAATCAA TCTAAAGTAT ATATGAGTAA ACTTGGTCTG ACAGTTACCA6961 ATGCTTAATC AGTGAGGCAC CTATCTCAGC GATCTGTCTA TTTCGTTCAT CCATAGTTGC7021 CTGACTCCCC GTCGTGTAGA TAACTACGAT ACGGGAGGGC TTACCATCTG GCCCCAGTGC7081 TGCAATGATA CCGCGAGACC CACGCTCACC GGCTCCAGAT TTATCAGCAA TAAACCAGCC7141 AGCCGGAAGG GCCGAGCGCA GAAGTGGTCC TGCAACTTTA TCCGCCTCCA TCCAGTCTAT7201 TAATTGTTGC CGGGAAGCTA GAGTAAGTAG TTCGCCAGTT AATAGTTTGC GCAACGTTGT7261 TGCCATTGCT ACAGGCATCG TGGTGTCACG CTCGTCGTTT GGTATGGCTT CATTCAGCTC7321 CGGTTCCCAA CGATCAAGGC GAGTTACATG ATCCCCCATG TTGTGCAAAA AAGCGGTTAG7381 CTCCTTCGGT CCTCCGATCG TTGTCAGAAG TAAGTTGGCC GCAGTGTTAT CACTCATGGT7441 TATGGCAGCA CTGCATAATT CTCTTACTGT CATGCCATCC GTAAGATGCT TTTCTGTGAC7501 TGGTGAGTAC TCAACCAAGT CATTCTGAGA ATAGTGTATG CGGCGACCGA GTTGCTCTTG7561 CCCGGCGTCA ATACGGGATA ATACCGCGCC ACATAGCAGA ACTTTAAAAG TGCTCATCAT7621 TGGAAAACGT TCTTCGGGGC GAAAACTCTC AAGGATCTTA CCGCTGTTGA GATCCAGTTC7681 GATGTAACCC ACTCGTGCAC CCAACTGATC TTCAGCATCT TTTACTTTCA CCAGCGTTTC7741 TGGGTGAGCA AAAACAGGAA GGCAAAATGC CGCAAAAAAG GGAATAAGGG CGACACGGAA7801 ATGTTGAATA CTCATACTCT TCCTTTTTCA ATATTATTGA AGCATTTATC AGGGTTATTG7861 TCTCATGAGC GGATACATAT TTGAATGTAT TTAGAAAAAT AAACAAATAG GGGTTCCGCG7921 CACATTTCCC CGAAAAGTGC CACCTGACGT CGACGGATCG GGAGATCAAC TTGTTTATTG7981 CAGCTTATAA TGGTTACAAA TAAAGCAATA GCATCACAAA TTTCACAAAT AAAGCATTTT8041 TTTCACTGCA TTCTAGTTGT GGTTTGTCCA AACTCATCAA TGTATCTTAT CATGTCTGGA8101 TCAACTGGAT AACTCAAGCT AACCAAAATC ATCCCAAACT TCCCACCCCA TACCCTATTA8161 CCACTGCCAA TTACCTGTGG TTTCATTTAC TCTAAACCTG TGATTCCTCT GAATTATTTT8221 CATTTTAAAG AAATTGTATT TGTTAAATAT GTACTACAAA CTTAGTAGT//pLVX-IRES-Neo其他相关慢病毒载体:Tet-pLKO-neo Tet-pLKO-puro pPACKH1-GAGpMD2.G pCMV-dR8.2-dvpr pLKO.1-GFP-shRNA pLKO.1-TRC control pLKO.1-hygro pLKO.1-TRCpCDH-MSCV-MCS-EF1-copGFP pCDH-MSCV-MCS-EF1-copGFP-T2A-Puro FUW-tetO-hOKMSFUW-tetO-hOCT4 FUW-tetO-hSOX2 FUW-tetO-hKLF4FUW pLVX-AcGFP1-N1 pLVX-AcGFP1-C1pLVX-AmCyan1-N1 pLVX-DsRed-Express2-C1 pLVX-DsRed-Express2-N1 pLVX-DsRed-Monomer-N1 pLVX-PAmCherry-C1 pLVX-PAmCherry-N1 pLVX-ZsGreen1-N1 pLVX-IRES-ZsGreen1 pLVX-IRES-mCherry pLVX-mCherry-C1 pLVX-mCherry-N1 pLVX-tdTomato-C1 pLKO.1-puro pLentilox 3.7 pLVX-Tet-On-Advanced pLVX-IRES-Puro pLVX-IRES-Neo pLVX-IRES-HygpLVX-EF1α-DsRed-Monomer-C1 pLVX-EF1α-AcGFP1-N1 pLVX-EF1α-AcGFP1-C1 pLVX-EF1α-mCherry-C1 pLVX-EF1α-IRES-mCherry pLVX-EF1α-IRES-ZsGreen1 pLVX-MetLuc Control pLVX-MetLuc pLVX-Hom-Mem1pLVX-Het-2 pLVX-DD-AcGFP1-Actin pPRIME-TET-GFP-FF3pSIH1-H1-CopGFP pCDH-EF1-MCS-T2A-Puro pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro pCDF1-MCS2-EF1-copGFP pLOX-CWBmi1 pLOX-CW-CREpRSV-rev pMDLg-pRRE pLL3.7pLVX-DD-AmCyan1 Control pLVX-DD-AmCyan1 Reporter pLVX-DD-tdTomato Reporter pLVX-DD-tdTomato Control pLVX-PTuner-Green pLVX-CherryPicker2pLVX-TetOne-Puro-Luc pLVX-TetOne pLVX-TetOne-PuropLVX-TetOne-Luc pLVX-rHom-Nuc1 pLVX-rHom-Sec1pLVX-rHom-1 pLVX-Hom-Nuc1 pLVX-Het-Nuc1pLVX-PTuner pLVX-PTuner2 pLVX-DD-ZsGreen1 Reporter pLVX-Het-1 pLVX-CherryPicker Control pLVX-Tet3GpCDH-CMV-MCS-EF1-RFP-T2A-Puro pCDH-CMV-MCS-EF1-Hygro pCDH-CMV-MCS-EF1-Neo pCDH-MCS-T2A-Puro-MSCV pCDH1-MCS2-EF1-copGFP pCDF1-MCS2-EF1-Puro pCDH-EF1-MCS-T2A-copGFP pWPXL pLVX-TRE3G-ZsGreen1 pLVX-TRE3G-mCherry pLenti6.3-EmGFP-BveI miR pLenti6/V5-GW/lacZpLenti6.3/V5-GW/EmGFP pLenti6.3-MCS pLenti6.3-DsRed2-BveI miR pLenti6.3-MCS-IRES2-EGFP pLVX-shRNA2 psPAX2VSV-G pSico PGK Puro pcDNA6.2-DsRed2-MCS1 miR pcDNA6.3-EmGFP-NC- II pcDNA6.2-EmGFP-NC- I pcDNA6.2-EmGFP-BsaI miR pLenti6.3-BveI miR pLenti6.3-MCS-IRES2-DsRed2 pLEX-MCSpGIPZ pLP2 pLP1FUGW pFUGW pLOX-Ttag-iresTKpMDLg/pRRE pLentG-KOSM pCMV-dR8.91pLVX-TRE3G-Luc Control pLVX-TRE3G-IRES pCgpvpSico pSicoR pLVTHMpGensil-1 pLVX-EF1α-IRES-Puro pCDF1-MCS2-EF1-copGFP pPACKH1-REV pLVX-Het-Mem1 pLVX-shRNA1pLKO.1-puro-GFP-siRNA pPRIME-TREX-GFP-FF3 pcDNA6.2-DsRed2-BsmBI miR pCDH-MSCV-MCS-EF1-Puro pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP pLVX-TRE3GFUW-tetO-hMYC pLOX-TERT-iresTK pLP/VSVGFUW-M2rtTA pCDH-EF1-MCS-(PGK-Puro) pcDNA6.2-EmGFP-MCS1 miR pLVX-AmCyan1-C1 pLVX-Hom-1 pcDNA6.2-BsaI miRpLVX-DsRed-Monomer-C1 pLVX-mCherry-Actin pTRIPZpLVX-ZsGreen1-C1 pLVX-CherryPicker1 LeGO-iC2pLVX-IRES-tdTomato pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP-T2A-Puro pLKO.3GpLVX-tdTomato-N1 pLVX-PTuner2-C pLVX-PuropLVX-Tight-Puro pLVX-DD-ZsGreen1 Control pSicoR PGK PuropLVX-EF1α-DsRed-Monomer-N1 pCDH-UbC-MCS-EF1-Hygro pLVTHpLVX-EF1α-mCherry-N1 pCDH-CMV-MCS-EF1-RFP。
慢病毒包装操作流程一、材料1 细胞培养试剂试剂名称终浓度试剂品牌DMEM/High glucose基础培养基90%Invitrogen胎牛血清10%Invitrogen/Gibco丙酮酸钠1mM Invitrogen2 慢病毒包装试剂试剂名称浓度试剂品牌Lipofectamine 2000InvitrogenPEG6000溶液50%WakoHBSS溶液Invitrogen3 耗材50 mL离心管15 mL离心管10 cm细胞培养皿μm过滤器2 mL EP管二、操作流程1细胞培养1.1293T/293FT细胞的复苏1)将完全培养液从4°C中取出放置到室温预热30 min左右。
在超净台内,用吸管吸取6~7mL完全培养液至15 mL离心管中;2)快速将冻存的细胞从液氮中取出,并迅速用镊子夹住盖子放入37°C 水浴中快速晃动(水不要没到盖子),使其在1~2分钟内完全融化;3)在超净台内,用酒精棉球擦拭冻存管外壁消毒,用吸管吸取所有融化的细胞悬液至装准备好的完全培养液中,轻轻吹打混匀,使冻存液分散开(目的是让DMSO分散,降低恢复室温的DMSO对细胞造成的毒性作用)。
4)在室温条件下,250 g离心4分钟。
5)离心后,在超净台内小心倒去上清,用吸管吸取2 mL新鲜完全培养液重悬细胞至单细胞悬液,再转移已经加好培养基的培养瓶/培养皿中,写上细胞名称、日期,放置37°C、5% CO2饱和湿度培养箱内培养。
(首次复苏细胞时,离心重悬后需取样计数,根据细胞数选择面积合适的培养容器。
)6)复苏翌日,给复苏的293T细胞更换新鲜的完全培养基。
1.2293T/293FT细胞传代1)待细胞长至60%-70%融合度即可传代。
将培养瓶里的所有培养液全部移去,用1×PBS洗涤细胞两次(洗涤速度要快,避免细胞干涸时间过长),以去除残余的培养液和血清(血清含有胰酶的抑制因子);2)加入适当的胰酶溶液,能使其完全浸过细胞即可,室温孵育1-2分钟。
一、简介慢病毒(Lentivirus)载体是以HIV-1 (人类免疫缺陷I型病毒)为基础发展起来的基因治疗载体。
区别一般的逆转录病毒载体,它对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力。
慢病毒载体的研究发展得很快,研究的也非常深入。
该载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达。
目前慢病毒也被广泛地应用于表达RNAi的研究中。
由于有些类型细胞脂质体转染效果差,转移到细胞内的siRNA半衰期短,体外合成siRNA对基因表达的抑制作用通常是短暂的,因而使其应用受到较大的限制。
采用事先在体外构建能够表达siRNA的载体,然后转移到细胞内转录siRNA的策略,不但使脂质体有效转染的细胞种类增加,而且对基因表达抑制效果也不逊色于体外合成siRNA,在长期稳定表达载体的细胞中,甚至可以发挥长期阻断基因表达的作用。
慢病毒载体能够产生表达shRNA的高滴度的慢病毒,在周期性和非周期性细胞、干细胞、受精卵以及分化的后代细胞中表达shRNA,实现在多种类型的细胞和转基因小鼠中特异而稳定的基因表达的功能性沉默,为在原代的人和动物细胞组织中快速而高效地研究基因功能,以及产生特定基因表达降低的动物提供了可能性。
慢病毒作为siRNA的携带者,不但具备特异性地使基因表达沉默的能力,而且充分发挥了慢病毒载体自身所具备的优势,为基因功能的研究提供了更强有力的工具。
在所构建的siRNA表达载体中,是由RNA聚合酶III启动子来指导RNA合成的,这是因为RNA聚合酶HI有明确的起始和终止序列,而且合成的RNA不会带poly A尾。
当RNA 聚合酶I遇到连续4个或5个T时,它指导的转录就会停止,在转录产物3’端形成1~4个U。
U6和H1 RNA启动子是两种RNA聚合酶H依赖的启动子,其特点是启动子自身元素均位于转录区的上游,适合于表达〜21ntRNA和〜50ntRNA茎环结构(stem loop)。
在siRNA表达载体中,构成siRNA的正义与反义链,可由各自的启动子分别转录然后两条链互补结合形成siRNA;也可由载体直接表达小发卡状RNA(small hairpin RNA, shRNA),载体包含位于RNA聚合酶I启动子和4〜5T转录终止位点之间的茎环结构序列,转录后即可折叠成具有1~4个U 3 ’突出端的茎环结构,在细胞内进一步加工成siRNA。
慢病毒使用操作指南慢病毒是一种常用的实验工具,广泛应用于细胞和分子生物学研究。
本文档旨在提供慢病毒使用的操作指南,帮助研究人员更好地利用慢病毒进行实验研究。
第一部分:慢病毒基本知识1. 什么是慢病毒?慢病毒是一种具有RNA基因组的病毒,属于反转录病毒。
它能够将自身的RNA基因组逆转录成DNA,再与宿主细胞的基因组融合,长期稳定地存在于宿主细胞中。
2. 利用慢病毒进行基因转染的优势相比其他常用的基因转染方法,慢病毒具有以下优势:- 高效性:慢病毒能够高效地转染多种类型的细胞,包括非分裂细胞。
- 长期稳定性:慢病毒转染的基因能够长期稳定地存在于宿主细胞中。
- 遗传稳定性:慢病毒转染的基因可以遗传给后代细胞,因此适用于长期实验研究。
第二部分:慢病毒使用的关键步骤1. 选择合适的慢病毒载体慢病毒载体是慢病毒的基础构建单元,其中包含转录启动子、报告基因等必要的元件。
根据实验需要选择合适的载体。
2. 包装慢病毒慢病毒的包装是将慢病毒载体与包装载体共转染至特定细胞株,通过包装载体中的包装酶,将慢病毒的RNA基因组逆转录成DNA,形成可复制的慢病毒。
3. 提取慢病毒经包装后的细胞培养基中含有包装好的慢病毒。
可通过超速离心等方法,将细胞培养物离心,提取慢病毒。
4. 病毒滴定病毒滴定是用来确定病毒滴度的重要步骤。
通过适当稀释提取的慢病毒,将其感染指定细胞株,计算出感染单位的浓度。
5. 慢病毒感染及筛选将提取的慢病毒添加至目标细胞中,通过细胞培养和筛选,筛选出具有所需基因的细胞株。
第三部分:慢病毒使用的注意事项1. 安全操作慢病毒具有一定的传染性,进行实验时需要遵守生物安全操作规范,佩戴一次性手套、口罩等个人防护装备,避免直接接触慢病毒。
2. 避免交叉感染实验室中使用慢病毒时,应尽可能避免交叉感染。
定期对实验室环境进行消毒,使用一次性材料,避免共享器械等措施可以减少交叉感染的风险。
3. 合理控制病毒滴度对于不同类型的细胞,需要确定合适的病毒滴度,以避免过度感染或感染不足的情况。
pLEX-MCS pLEX-MCS载体基本信息:载体名称:pLEXMCS, pLEX MCS, pLEX-MCS质粒类型: 哺乳动物细胞慢病毒表达载体高拷贝/低拷贝: 高拷贝启动子: CMV克隆方法: 多克隆位点,限制性内切酶载体大小: 10682 bp5' 测序引物及序列: pLEX-MCS-FWD: CACCAAAATCAACGGGACTT3' 测序引物及序列: pLEX-MCS-REV: ATATAGACAAACGCACACCGGCCT 载体标签: --载体抗性: 氨苄/博来霉素(Zeocin)筛选标记: 嘌呤霉素(Puromycin)备注:稳定性: 稳定组成型: 诱导型病毒/非病毒: 慢病毒pLEX-MCS载体质粒图谱和多克隆位点信息:pLEX-MCS载体简介:pLEX-MCS载体是慢病毒载体,带有一个多克隆位点。
pLEXMCS载体骨架是设计用来瞬转或稳转表达目的慢病毒,进而感染目的细胞系,导致你的目的基因过表达的载体。
pLEX-MCS载体拥有多个载体特征(具体见上文),这些载体特征使得载体能够有效进行过表达基因研究。
1.具有使用复制的非竞争性慢病毒转染或者转导的能力。
2.在体内和体外使用时都比较容易控制。
3.在进构建稳转细胞系的时候,可以使用嘌呤霉素进行筛选。
4.可以方便将任何目的基因导入到载体的多克隆位点处。
pLEX-MCS载体序列pLEX-MCS其他相关慢病毒载体:Tet-pLKO-neo Tet-pLKO-puro pPACKH1-GAGpMD2.G pCMV-dR8.2-dvpr pLKO.1-GFP-shRNA pLKO.1-TRC control pLKO.1-hygro pLKO.1-TRCpCDH-MSCV-MCS-EF1-copGFP pCDH-MSCV-MCS-EF1-copGFP-T2A-Puro FUW-tetO-hOKMSFUW-tetO-hOCT4 FUW-tetO-hSOX2 FUW-tetO-hKLF4FUW pLVX-AcGFP1-N1 pLVX-AcGFP1-C1pLVX-AmCyan1-N1 pLVX-DsRed-Express2-C1 pLVX-DsRed-Express2-N1 pLVX-DsRed-Monomer-N1 pLVX-PAmCherry-C1 pLVX-PAmCherry-N1pLVX-ZsGreen1-N1 pLVX-IRES-ZsGreen1 pLVX-IRES-mCherrypLVX-mCherry-C1 pLVX-mCherry-N1 pLVX-tdTomato-C1 pLKO.1-puro pLentilox 3.7 pLVX-Tet-On-Advanced pLVX-IRES-Puro pLVX-IRES-Neo pLVX-IRES-HygpLVX-EF1α-DsRed-Monomer-C1 pLVX-EF1α-AcGFP1-N1 pLVX-EF1α-AcGFP1-C1 pLVX-EF1α-mCherry-C1 pLVX-EF1α-IRES-mCherry pLVX-EF1α-IRES-ZsGreen1 pLVX-MetLuc Control pLVX-MetLuc pLVX-Hom-Mem1pLVX-Het-2 pLVX-DD-AcGFP1-Actin pPRIME-TET-GFP-FF3pSIH1-H1-CopGFP pCDH-EF1-MCS-T2A-Puro pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro pCDF1-MCS2-EF1-copGFP pLOX-CWBmi1 pLOX-CW-CREpRSV-rev pMDLg-pRRE pLL3.7pLVX-DD-AmCyan1 Control pLVX-DD-AmCyan1 Reporter pLVX-DD-tdTomato Reporter pLVX-DD-tdTomato Control pLVX-PTuner-Green pLVX-CherryPicker2pLVX-TetOne-Puro-Luc pLVX-TetOne pLVX-TetOne-PuropLVX-TetOne-Luc pLVX-rHom-Nuc1 pLVX-rHom-Sec1pLVX-rHom-1 pLVX-Hom-Nuc1 pLVX-Het-Nuc1pLVX-PTuner pLVX-PTuner2 pLVX-DD-ZsGreen1 Reporter pLVX-Het-1 pLVX-CherryPicker Control pLVX-Tet3GpCDH-CMV-MCS-EF1-RFP-T2A-Puro pCDH-CMV-MCS-EF1-Hygro pCDH-CMV-MCS-EF1-Neo pCDH-MCS-T2A-Puro-MSCV pCDH1-MCS2-EF1-copGFP pCDF1-MCS2-EF1-Puro pCDH-EF1-MCS-T2A-copGFP pWPXL pLVX-TRE3G-ZsGreen1 pLVX-TRE3G-mCherry pLenti6.3-EmGFP-BveI miR pLenti6/V5-GW/lacZpLenti6.3/V5-GW/EmGFP pLenti6.3-MCS pLenti6.3-DsRed2-BveI miR pLenti6.3-MCS-IRES2-EGFP pLVX-shRNA2 psPAX2VSV-G pSico PGK Puro pcDNA6.2-DsRed2-MCS1 miR pcDNA6.3-EmGFP-NC- II pcDNA6.2-EmGFP-NC- I pcDNA6.2-EmGFP-BsaI miR pLenti6.3-BveI miR pLenti6.3-MCS-IRES2-DsRed2 pLEX-MCSpGIPZ pLP2 pLP1FUGW pFUGW pLOX-Ttag-iresTKpMDLg/pRRE pLentG-KOSM pCMV-dR8.91pLVX-TRE3G-Luc Control pLVX-TRE3G-IRES pCgpvpSico pSicoR pLVTHMpGensil-1 pLVX-EF1α-IRES-Puro pCDF1-MCS2-EF1-copGFP pPACKH1-REV pLVX-Het-Mem1 pLVX-shRNA1pLKO.1-puro-GFP-siRNA pPRIME-TREX-GFP-FF3 pcDNA6.2-DsRed2-BsmBI miR pCDH-MSCV-MCS-EF1-Puro pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP pLVX-TRE3GFUW-tetO-hMYC pLOX-TERT-iresTK pLP/VSVGFUW-M2rtTA pCDH-EF1-MCS-(PGK-Puro) pcDNA6.2-EmGFP-MCS1 miR pLVX-AmCyan1-C1 pLVX-Hom-1 pcDNA6.2-BsaI miRpLVX-DsRed-Monomer-C1 pLVX-mCherry-Actin pTRIPZpLVX-ZsGreen1-C1 pLVX-CherryPicker1 LeGO-iC2pLVX-IRES-tdTomato pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP-T2A-Puro pLKO.3GpLVX-tdTomato-N1 pLVX-PTuner2-C pLVX-PuropLVX-Tight-Puro pLVX-DD-ZsGreen1 Control pSicoR PGK PuropLVX-EF1α-DsRed-Monomer-N1 pCDH-UbC-MCS-EF1-Hygro pLVTHpLVX-EF1α-mCherry-N1 pCDH-CMV-MCS-EF1-RFP。
慢病毒使用操作手册:1 慢病毒使用操作2 慢病毒安全使用规范3 悬浮细胞感染方法概要4 相关专业术语(详情可参考公司网站FAQ)5 细胞培养器皿的相关参数1、慢病毒使用操作手册1.1 慢病毒的储存与稀释:1.1.1 病毒的储存:用户收到病毒液后在很短时间内即使用慢病毒进行实验,可以将病毒暂时放置于4 ℃保存;如需长期保存请放置于-80℃(病毒置于冻存管,并使用封口膜封口)A.病毒可以存放于-80℃ 6个月以上;但如果病毒储存时间超过6个月,我们建议在使用前需要重新滴定病毒滴度B.反复冻融会降低病毒滴度:每次冻融会降低病毒滴度10%;因此在病毒使用过程中应仅尽量避免反复冻融,为避免反复冻融我们强烈建议客户收到病毒后按照每次的使用量进行分装。
1.1.2 病毒的稀释:用户需要稀释病毒时,请将病毒取出置于冰浴融解后,使用培养目的细胞用PBS或无血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)混匀分装后4℃保存(请尽量在三天内用完) 分装后使用。
1.2 慢病毒用于体外(In Vitro)实验:感染培养原代细胞和建系细胞1.2.1 慢病毒对各种细胞和组织的亲嗜性不同,用户使用Invabio提供的慢病毒之前可以通过查阅相关文献,了解慢病毒对您的目的细胞的亲嗜性,感染复数(MOI 值)以及在体(In Vivo)注射所需要的病毒量。
如果没有相关文献支持,可以通过感染预实验得到合适的感染复数(MOI 值)(使用24孔板检测病毒对目的细胞的亲嗜性)1.2.2 慢病毒感染目的细胞预实验1.2.2.1 慢病毒感染目的细胞预实验注意事项A.测定慢病毒对目的细胞的亲嗜性时,需要同时设置对慢病毒亲嗜性较高的细胞(HEK293T,Hela)作为平行实验的对照细胞。
B.在进行慢病毒感染实验时,可以用完全培养基(培养目的细胞用)稀释;理论上,含有血清,双抗或者其他营养因子的完全培养基不影响慢病毒的感染效率。
C. Invabio提供的病毒单位为TU/ml, 即每毫升中含有具有生物活性的病毒颗粒数。
慢病毒安全使用和注意事项
➢慢病毒安全使用注意事项(*非常重要!!!*)
1)慢病毒相关实验请在生物安全柜(BL-2级别)内操作。
2)操作病毒时请穿实验服,佩戴口罩和手套,尽量不要裸露双手及手臂的皮肤。
3)操作病毒时特别小心病毒溅出。
如果操作时超净工作台有病毒污染,请立即用70%
乙醇加1%的SDS溶液擦拭干净。
接触过病毒的枪头,离心管,培养板,培养液请于84消毒液浸泡后统一处理。
4)如需要离心,应使用密封性好的离心管,如有必要请用封口膜封口后离心。
5)病毒相关的废弃物需要特殊收集,统一经高温灭菌处理。
6)实验完毕用香皂清洗双手。
➢慢病毒收到后的注意事项
1)慢病毒的储存
用户收到病毒液后在短期内即使用慢病毒进行实验,可以将病毒暂时放置于4 ℃保存(尽量一周内用完);如需长期保存请分装后放置于-80℃。
注:a.反复冻融会降低病毒滴度(每次冻融会降低病毒滴度10%-50%);在病毒使用过程中应尽量避免反复冻融,所以我们前期对病毒进行了分装(200 l/tube),收到后直接放置-80℃保存即可。
b.如果病毒储存时间超过6个月,我们建议在使用前重新测定病毒滴度。
2)慢病毒的稀释
汉恒慢病毒载体构建及包装操作手册
用户需要稀释病毒时,请将病毒取出置于冰浴融解后,使用培养目的细胞用PBS或无血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)混匀分装后置于4℃保存(请尽量一周内用完)。
慢病毒生产及使用操作手册一、实验流程制备慢病毒穿梭质粒及其辅助包装原件载体质粒,三种质粒载体分别进行高纯度无内毒素抽提,共转染293T细胞,转染后6 h 更换为完全培养基,培养48和72h后,分别收集富含慢病毒颗粒的细胞上清液,病毒上清液通过超离心浓缩病毒。
以下内容由汉恒生物科技(上海)有限公司精心整理总结。
二、实验材料(一)慢病毒载体、包装细胞和菌株该病毒包装系统为三质粒系统,组成为pspax2, pMD2G,pHBLV TM系列质粒。
1、载体信息(见附录)2、细胞株 293T,慢病毒的包装细胞,为贴壁依赖型成上皮样细胞,生长培养基为DMEM(含10% FBS)。
贴壁细胞经培养生长增殖形成单层细胞。
3、菌株大肠杆菌菌株DH5α。
用于扩增慢病毒载体和辅助包装载体质粒。
三、包装细胞293T细胞的培养(一) 293T细胞的冻存随着传代的次数增加,293T细胞会出现生长状态下降、突变等。
为了防止此类现象的出现,我们需要在开始就对细胞进行大量冻存,以保证实验的稳定性和持续性。
在细胞对数生长期进行冻存,增加细胞复苏成活率。
1、去掉上清液,加入PBS洗去残留的培养基;2、加入0.25%的胰酶,消化1~2min后,镜下观察细胞变圆,细胞间间隙加大时,去除胰酶,加入新鲜培养基吹打混匀,移入离心管中。
3、细胞计数,将细胞全部晃下,加入 3mL 37 ℃预热的 10% DMEM,用 10mL 移液管进行吹打,较大力吹打 6~8 次即可,不留死角,之后,将所有细胞吸出,置于15mL 离心管中,取 50ul 混匀后的细胞于 1.5mL eppendorf 管中,加入 450ul 10% DMEM,即为 10 倍稀释,混匀,取 10ul 细胞于计数板中计数。
计数板上共 4 大格,每大格 16 小格。
计数时,4 大格均计数,总数除以 4(得每大格细胞数),再乘以 10(10 倍稀释),即为实际 n万/mL 细胞浓度。
4、细胞离心,1000rpm,5min。
慢病毒使用操作指南一、慢病毒的储存与稀释:1.?病毒的储存:用户收到病毒液后在很短时间内即使用慢病毒进行实验,可以将病毒暂时放置于4?℃注:AB2.?PBS),分二、慢病毒用于体外(in?vitro)实验:感染培养原代细胞和建系细胞1.?慢病毒对各种细胞和组织的亲嗜性不同,用户使用Invabio提供的慢病毒之前可以通过查阅相关文献,了解慢病毒对您的目的细胞的亲嗜性,感染复数(MOI?值)以及在体内(in?vivo)注射所需要的病毒量。
如果没有相关文献支持,可以通过感染预实验得到合适的感染复数(MOI?值)(使用24孔板检测病毒对目的细胞的亲嗜性)2.?慢病毒感染目的细胞预实验①?A.?Hela)? BC.度为②?以24孔培养板为例,进行目的细胞和HEK293T?细胞的感染预实验实验前按照不同的MOI设置不同的感染孔,并根据MOI和细胞数量计算所需要的病毒量,如有必要可以使用PBS溶液或者无血清培养基稀释病毒原液第一天,准备细胞:在24孔培养板接种若干孔,每个孔内接种3~5X104个目的细胞,铺板时细胞的融合率为50%左右,每孔培养基体积为100?μl;进行病毒感染时细胞的融合度约为70%左右。
第二天,观察细胞生长状态,如细胞状态较好则开始实验:1准确计2a?b?c?在目的细胞和对照细胞中分别加入计算好的病毒液d?混匀后放于二氧化碳培养箱(37℃、5%CO2)孵育过夜注:感染前细胞的状态好坏对最终的感染效果高低影响很大,所以务必保证加病毒之前,细胞处于良好的生长状态。
如果慢病毒对目的细胞的感染效率偏低,则可以通过提高MOI?值来增加其感染效率,但是当MOI?高于20?时,我们建议客户在培养基中加入ploybrene(8?μg/ml左右)来提高病毒的感染效率。
4小时候1.?病毒操作时最好使用生物安全柜。
如果使用普通超净工作台操作病毒,请不要打开排风机。
2.?病毒操作时请穿实验服,带口罩和手套。
3.?操作病毒时特别小心不要产生气雾或飞溅。
慢病毒使用操作指南1. 引言1.1 目的本文档旨在提供关于慢病毒使用的详细操作指南,以确保实验室人员能够正确、安全地处理和利用该种类病毒。
2. 概述2.1 定义与特点- 慢病毒是一类具有复制缓激活机制并且感染后可长期存在于寄主体内的RNA或DNA 症候群相关性(SAR)等多个领域中发挥重要作用。
3. 实验前准备工作在进行任何涉及到潜在危险生物材料如此类型之前, 快速评估风险,并采取适当措施来最小化这些风险。
4 . 材料清单:下面列出了完成所需任务时可能需要的基本设备和试剂: - 生物安全柜级别II (BSL-2) 或更高级别环境下进行所有步骤;- 防护手套、防护眼镜/面罩和实验服;...5 . 实验流程:进行以下步骤以成功执行您对操纵蠕虫样品库存的需求:5.1 准备工作- 确保实验室环境符合慢病毒操作所需要的生物安全级别;- 检查所有设备和试剂是否齐全并处于良好状态。
5.2 培养基准备:...6 . 安全注意事项与风险评估7 . 应急措施及处理方法8 . 相关法律名词及注释:在本文档中,以下是一些常见使用到的法律名词以及其相应解释说明。
a) 生物安全柜 (Biosafety Cabinet, BSC):是用来提供对人员、产品和环境进行防护,并且在其中进行微生物学或细胞培养等活动时,提供无菌条件下能够有效地限制有害因素扩散传播而又不影响正常运行过程。
9. 结束语本文档涵盖了详尽的慢病毒使用操作指南,旨在确保实验室人员正确理解并遵循相关规定以最大程度上降低任何可能存在的危险性。
10. 文档涉及附件:请参考随信发送之文件列表。
金拓思慢病毒产品说明书一、产品简介慢病毒载体是一类重组逆转录病毒载体,由于其结构和功能的特点,慢病毒载体作为一种重要的基因转移工具应用于基因治疗和细胞分子生物学研究领域。
区别于一般的逆转录病毒载体,它对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力。
该载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达。
在感染能力方面可有效地感染神经元细胞、肝细胞、心肌细胞、肿瘤细胞、内皮细胞、干细胞等多种类型细胞,达到良好的基因治疗效果。
我公司生产的重组慢病毒均以国际通用的第三代载体四质粒体系生产,通过重组改造后将含有目的基因的慢病毒骨架及其相应的作用元件组合为新质粒,并通过辅助质粒将病毒包装的元件组成重组病毒。
通过自我灭活的方式,阻止病毒自我复制。
保证了慢病毒使用过程中的良好生物安全性。
二、重要说明2.1安全操作说明1.应在Ⅱ级及以上级别生物安全柜中使用慢病毒产品。
2.虽经过改造后病毒安全性极大提高,操作中仍需佩戴口罩、手套等安全防护措施以免产生潜在危害。
3.操作中所有接触慢病毒试剂的样品、耗材、器皿等均需通过84消毒液(1:20)浸泡后,高温121℃灭活15min以上。
4.实验过程中有病毒液洒落的情况时,应用纸巾将病毒液吸干后喷洒70乙醇,并将擦干的纸巾一并高温处理以免造成其它伤害、污染环境。
2.2使用注意事项所有慢病毒产品均通过干冰低温运输,请收到产品后立即转入-80℃冰箱保存。
每次使用时提前取出病毒液放置在4℃冰箱待融化,并保存于4℃冰箱。
每次融化后请尽快使用,病毒液应尽量避免反复冻融降低病毒滴度。
三、慢病毒制备与使用3.1实验材料细胞:人贴壁细胞293T培养基:高糖DMEM培养基血清:胎牛血清抗生素:青链霉素转染试剂:Transfection-mate增强剂:Polybrene3.2病毒制备方法3.2.1细胞准备细胞复苏:1.将液氮保存细胞取出后,迅速放入37℃水浴锅内,应及时轻柔摇动加快解冻速度。
2.将完全溶解的细胞离心,1500rpm,3min。
YRGene 慢病毒包装试剂盒说明书产品编号:LPK010 产品规格:10个10cm 皿 产品简介:赢润生物的慢病毒包装试剂盒包括如下成分:(1) 优化配比的慢病毒包装辅助质粒混合物,可兼容大多数慢病毒表达载体。
(2) 高效转染试剂(Invitrogen Lip2000原装产品分装,293T 细胞转染效率接近 100%)。
(3 )高效率的慢病毒浓缩液,无需超速离心,也不需要价格昂贵的过滤柱,快速富集病毒粒子,其优 势在于操作安全简单,对设备要求低,产毒效率高,能够快速、高效地收获高滴度病毒。
产品组成:1. 转染前,传代 293FT 细胞于10cm 培养皿中(例如,接种 1 x 107细胞于10cm 培养皿中,使用完全 培养基DMEM+10%FBS培养),当细胞密度能够达到 90-95%即可进行转染。
Tips :培养基里面不要添加抗生素。
2. 转染前1-3小时,更换培养基,加入7ml 新鲜的完全培养基(DMEM+10%FBS ),注意不要添加抗生素。
3. 准备转染。
在5ml 离心管中,分别配制 A 管与B 管试剂(Tube A and Tube B )配好后,放置5min ,然后将A 管缓慢加入B 管,混合均匀。
室温放置20min ,使得脂质体-DNA 混合物形成。
Tips :混合后可能会出现淡淡的乳白状,不会影响转染。
然后将混合液逐滴均匀加入 10cm 培养皿,轻微混匀。
置于37C, 5% CO ?培养箱中培养过夜。
4. 第三天,更换培养基,加入 10ml 的完全培养基,同样注意不要加抗生素。
5. 转染后48-72h 后收取上清,转移至 15ml 离心管。
Tips :上清里面含有病毒,请小心操作。
6. 3000rpm 在4C 离心15min ,去除沉淀。
7. 上清液用0.45卩m 滤器过滤后转移到新的离心管中。
慢病毒浓缩:1. 每10ml 过滤后的病毒初始液,加入 Concen Solution 3ml ,每20-30min 混合一次,共进行 3-5次。
慢病毒操作资料说明慢病毒操作资料说明1、Hexadimethrine bromide.pdf:这是Hexadimethrine bromide(别名Polybrene)的说明书,该试剂用于提高慢病毒的感染效率,在病毒滴度测定和病毒感染实验中均需使用;2、Lenti-X™ Concentrator.pdf:这是Lenti-X Concentrator的说明书,该试剂用于病毒粒子的浓缩纯化;3、Lenti-X™ Lentiviral Expression Systems User Manual.pdf:这是过表达慢病毒(用于基因过表达)的操作说明书4、Lenti-X™ shRNA Expression Systems User Manual.pdf:这是干扰慢病毒(用于基因干扰)的操作说明书5、pLVX-shRNA1 Vector Information.pdf:pLVX-shRNA1慢病毒干扰载体说明书6、pLVX-IRES-Neo Vector Information.pdf:pLVX-IRES-Neo 慢病毒过表达载体说明书7、慢病毒(Lentivirus)载体.pdf:慢病毒载体介绍8、Lenti-X™ Lentiviral Packaging Systems FAQs.pdf:慢病包装系统常见问题介绍9、病毒纯化-PEG6000.doc:病毒纯化方法10、病毒滴度测定-针对没有绿色荧光蛋白标记的病毒.doc:病毒滴度测定-针对没有绿色荧光蛋白标记的病毒;11、病毒滴度测定-针对有绿色荧光蛋白标记的病毒.doc:病毒滴度测定-针对有绿色荧光蛋白标记的病毒;12、Production, concentration and titration of pseudotyped HIV-1-based lentiviral vectors.pdf:慢病毒包装、纯化、滴度测定操作指南,供理论学习;13、C0508磷酸钙法细胞转染试剂盒.pdf:磷酸钙转染方法;14、慢病毒实验方法.doc:慢病毒包装报告单;15、慢病毒包装、纯化、滴度测定及感染.doc:慢病毒包装、纯化、滴度测定及感染操作指南;。
pLOX-Ttag-iresTK pLOX-Ttag-iresTK载体基本信息:载体名称:pLOX-Ttag-iresTK质粒类型: 慢病毒系统载体高拷贝/低拷贝: 高拷贝启动子: --克隆方法: 多克隆位点,限制性内切酶载体大小: 12292bp5' 测序引物及序列: CMV Fwd3' 测序引物及序列: SP6 rev载体标签: --载体抗性: 氨苄青霉素(Ampicillian)筛选标记: --备注: 克隆菌株 Stbl3 或HB101,以减少基因重组现象的发生。
稳定性: --组成型: --病毒/非病毒: 慢病毒pLOX-Ttag-iresTK载体质粒图谱和多克隆位点信息:pLOX-Ttag-iresTK载体序列ORIGIN1 AGTTGGAAGG GCTAATTCAC TCCCAAAGAA GACAAGATAT CCTTGATCTG TGGATCTACC61 ACACACAAGG CTACTTCCCT GATTAGCAGA ACTACACACC AGGGCCAGGG GTCAGATATC 121 CACTGACCTT TGGATGGTGC TACAAGCTAG TACCAGTTGA GCCAGATAAG GTAGAAGAGG 181 CCAATAAAGG AGAGAACACC AGCTTGTTAC ACCCTGTGAG CCTGCATGGG ATGGATGACC 241 CGGAGAGAGA AGTGTTAGAG TGGAGGTTTG ACAGCCGCCT AGCATTTCAT CACGTGGCCC 301 GAGAGCTGCA TCCGGAGTAC TTCAAGAACT GCTGATATCG AGCTTGCTAC AAGGGACTTT 361 CCGCTGGGGA CTTTCCAGGG AGGCGTGGCC TGGGCGGGAC TGGGGAGTGG CGAGCCCTCA 421 GATCCTGCAT ATAAGCAGCT GCTTTTTGCC TGTACTGGGT CTCTCTGGTT AGACCAGATC 481 TGAGCCTGGG AGCTCTCTGG CTAACTAGGG AACCCACTGC TTAAGCCTCA ATAAAGCTTG 541 CCTTGAGTGC TTCAAGTAGT GTGTGCCCGT CTGTTGTGTG ACTCTGGTAA CTAGAGATCC 601 CTCAGACCCT TTTAGTCAGT GTGGAAAATC TCTAGCAGTG GCGCCCGAAC AGGGACTTGA 661 AAGCGAAAGG GAAACCAGAG GAGCTCTCTC GACGCAGGAC TCGGCTTGCT GAAGCGCGCA 721 CGGCAAGAGG CGAGGGGCGG CGACTGGTGA GTACGCCAAA AATTTTGACT AGCGGAGGCT 781 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