生物条形码检测技术及其研究进展
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4生物条形码检测技术与核酸检测
在核酸检测方面,生物条形码检测技术因其近 于PCR的检测灵敏度和多种条形码DNA检测方法 的优点,可适用于不同情况下流行性传染病的快速 检测和联合检测。
除上述生物芯片法外,比色法和荧光标记法也 常被用于条形码DNA检测。在比色法检测体系中, 靶序列与标记有互补序列的金纳米颗粒杂交后形 成金纳米颗粒/寡核苷酸网状聚集物。由于金纳米 颗粒溶液的颜色对聚集程度非常敏感,所以实验人 员可以通过红色到蓝色的颜色变化程度来判定实
万方数据
刘松婷等:生物条形码检测技术及其研究进展
【摘要】 生物条形码检测技术是利用磁场作用收集“金纳米颗粒一被检物一磁性微球”复合物,再释放其中的条形码
链,然后可选用多种方法对条形码链进行下一步检测。生物条形码检测技术在蛋白质及核酸的检测方面显示出极高
的灵敏庹,在不依赖酶反应的情况下,检测蛋白质可以达到10-18 tool水平,同时在核酸检测方面也能达到PCR反应
圈2。兰明治”结构(依据Nam原理图嘲)
2生物条形码检测方法
生物条形码检测技术的高敏感性主要来自2 个方面:①数百条形码DNA从每一个金纳米颗粒 上释放下来,从而使针对每个捕获目标的检测灵敏 度增加了2~3个数量级;②每个条形码DNA均可 使用核酸检测方法完成另一个信号放大,例如生物 芯片法11-2.5-71、比色法‘渊、荧光标记法llO-ll】或常规的 PCR方法。在众多的条形码DNA检测方法中,生物 芯片法的使用占有很大的比例。
在传统的检测体系中,采用双链DNA作为生 物条形码,双链DNA中的一条链和金颗粒通过Au- S链相连,另一条链则用于指示被检物。另外,还专 门有一条与目标序列部分互补的DNA序列,这段 序列与上述条形码DNA同时标记于金纳米颗粒表 面。在“三明治”结构形成后,采用高温低盐的方法 进行去杂交。此方法的缺点在于杂交效果不佳,在 一定程度上影响了实验结果。
在原有的“三明治”结构模式上,研究人员尝试 着对检测体系进行调整。2007年,Nam等用Si02微 球代替金纳米颗粒用于修饰条形码DNA和抗体[91, 然后用比色法检测白细胞介素2(IL一2),检出限达 3xlO。17 mol/L,是传统ELISA方法的1000倍以上。 2009年,Zhang等在生物条形码检测技术基础上,用 电化学适配子生物传感器检测凝血酶,检出限达到 6.2xlO一15 mol/UⅧ。
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Vol 2I .
N04 Jul·, 2010
No.·一1.,2010ItS
doi:10.3969/j.issn.1009-0002.2010.04.035
生物条形码检测技术及其研究进展
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综
述
刘松婷1.2,尹惠琼1,贾茗娴1,章金刚1·2 1.军事医学科学院野战输血研究所,北京100850;2.扬州大学生物科学与技术学院,江苏扬州225009
2004年,Nam等对乙肝病毒(HBV)及炭疽杆菌 DNA检测的最低限度达到5xlO。9 mol/L,已接近 PCR的检测灵敏度【2】。2006年,Stoeva等用荧光标记 法对HBV、埃博拉病毒(EV)、天花病毒(VV)、人类 免疫缺陷病毒(HIV)进行芯片法联合检测,对每种 病毒的检出限均能达到10—5 mol/L[61。2008年,He 等用高盐浓度(常规浓度的5倍)制备纳米金颗粒, 大大提高了对互补链的结合特异性,然后用荧光标 记法对HBV表面抗原基因、EV、VV、HIV进行检 测,最低检出限达5xlO。12 mol/L,且检测时间缩短 至40 mint’61。2009年,Zhang等用荧光标记法检测沙 门肠炎,检出限可低至2.15x10—6 mol(1 ng/mL)110l。
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验结果。而荧光标记法的原理是在条形码DNA上 标记荧光染料,通过使用荧光扫描仪采集荧光信号 达到最终的检测目的。在实际应用中,生物条形码 检测技术可以结合不同检测方法来满足多种检测 需求,但在追求高的检测灵敏度和特异性的同时, 还须兼顾检测方法的简便、快速及可重复性。
豳3金标银染法生物芯片扫描检测示意图 (依据Keating原理图㈣)
3生物条形码检测技术与蛋白检测
由于现有的常用蛋白检测技术灵敏度有限,无 法实现对各种疾病的指示蛋白质进行超微量检测。 生物条形码检测技术利用其高灵敏度的特点填补 了这一空白,可作为疾病早期诊断的强有力的检测 工具。
2003年,Mirkin等利用BCA对前列腺特异抗 原(PSA)进行了检测,检测下限可达3xlO。18 mol,比 传统EUSA法检出限低6个数量级[1l。2005年, Georganopoulou等利用BCA对脑脊液(CSF)中的阿 尔茨海默症特异抗原(ADDL)分子进行检测,同样 也得到了满意的实验结果[51。2007年,本实验室利用 BCA对蓝舌病病毒(BTV)的群特异性VP7抗原进 行检测,其检测灵敏度可达10 fg/mL,是常规 ELISA方法(1 ng/mL)的l旷倍fl习。
生物芯片检测体系有2个重要组成部分:①表 面固定捕获探针(与条形码DNA部分互补的寡核 苷酸序列)的芯片;②标记有与条形码DNA另一端 部分互补的寡核苷酸序列的金纳米颗粒。待检的条 形码DNA通过杂交反应,将上述2种序列连接起 来,形成“三明治”结构,反复洗涤后加入银染试剂, 可出现一个清晰的黑色银染信号,再通过平板扫描 仪获得实验结果,然后进行结果分析。在生物芯片 检测过程中,条形码DNA高度集中于芯片表面,大 大增强了后期与纳米金颗粒结合的几率。在此基础 上,体系还采用金标银染法,利用纳米金可催化银 离子还原为银这一原理,使金颗粒体积显著增大, 从而增强其可见性,进一步放大检测信号(图3)。
[Abstract】Bio-bar code assay(BCA)makes u∞of magnetic field to collect the sandwich structures(nanoparti— des/target/magnetic microparticles),and then l肥lease the bar-code strands,which can be identified with several methods.BCA for the detection of protein and nucleic acid targets has been shown to be extraordinarily sensitive, offered a promising method of non—enzyme-dependent detection with low atlomolar sensitivity for protein targets and PCR—competivity sensitivity for nucleic acid targets.It is a innovation toward a diagnostic tool,and may have sig- nificant utility in clinical applications. 【Key words】bio-bar code assay;sensitivity;protein;nucleic acid
针对上述缺点,Thaxton等于2005年对生物条 形码进行了改进。他们采用巯基修饰的单链DNA 代替双链DNA,同样取得了满意的实验效果,芯片 法检出限达到7x1043 moL/L,荧光标记法则可达到 7 pmoL/U4j。与以前标记于金颗粒上的3条修饰链 不同,这段单链DNA既作为捕获探针,又作为条形 码DNA。它由2部分组成,一部分序列与目标序列 互补,另一部分则作为生物条形码。同时,二硫苏糖 醇(DTr)可使Au-S共价结合在纳米金颗粒上的 DNA脱落,以便进行后续检测,从而大大简化了实 验步骤,增强了其定量能力。
在过去的几年里,纳米金技术展现出在临床诊 断领域中的巨大潜力。与传统方法相比,金纳米颗 粒在生物分子的诊断领域具有很大的优势。除了光 学和识别特性之外,它还拥有体积小(直径1~100 nm)、比表面积大以及优异的结合特性等优点,这为 在其表面标记探针及银染增强提供了有利条件。因 此,金纳米颗粒被作为信号放大工具应用于诊断领 域,并且在很大程度上满足了临床诊断的高敏感性 和低费用的要求。
万方数据
1 生物条形码检测技术的原理
蛋白检测体系包括2组微粒,一组是目标蛋白 单抗标记的磁性微球(magnetic microparticles, MMP),另一组是目标蛋白的多抗和条形码DNA链 标记的金纳米颗粒(nanoparticle,NP)。目标蛋白同 时和2组微粒通过抗原一抗体反应形成“MMP一目标 蛋白一NP”的三明治结构复合物,能够在磁场的作用 下从溶液中分离出来,再利用去杂交将NP上标记 的条形码DNA链释放出来,这些释放的DNA链通 过下游检测方法进一步检测目标蛋白(图1)圈。
生物条形码检测技术不仅可用于蛋白的检测, 也可用于核酸领域,其检测原理与蛋白检测原理基 本相同:将与目标序列部分互补的DNA片段1、条 形码DNA共同修饰在金纳米颗粒上;将与目标序
[收稿日期】20lO也一30
[基金项目]国家科技支撑计划(2008BAl54806) [作者简介】刘松婷(1985一),女。硕士研究生 [通信作者]章金刚,(E—mail)zhangig@nie.bmi.ac.cn
的灵敏庹。该技术是一种新型的诊断技术,在临床诊断方面有着广泛的应用前景。
【关键词】 生物条形码检测技术;灵敏度;蛋白质;核酸
[中图分类号】Q789
【文献标识码】A
【文章编号】1009—0002(2010)04-0597-04
Bio-Bar Code Assay and its Development