价值微藻转化系统的构建及集胞藻PCC 6803假定蛋白功能预测

项目编号项 目 名 称

2015JJ1001基于电网故障行波时空多尺度同步测量的暂态保护新原理

2015JJ1002航天资源通用调度模型、方法及应用

2015JJ1003雷达目标微动特性

2015JJ1004黄麻纤维增强复合塑料约束混凝土的抗压性能研究

2015JJ1005表观遗传修饰的生化分析新方法

2015JJ1006高速磨削硬脆光学材料亚表面损伤机理研究

2015JJ1007间充质干细胞向骨折处定向迁移的研究

2015JJ1008亚10nm图形加工及其器件应用

2015JJ1009R-spondin3在猪胎盘发育中的作用及分子机理研究

2015JJ1010精神分裂症脑影像数据的多尺度综合分析

2015JJ1011miR-27a靶向转录因子AP-2β在肝癌发生中的作用与机制研究

2015JJ1012电离辐射对肌红蛋白结构和功能损伤的分子机制研究

2015JJ1013混沌理论在图像安全中的应用研究

2015JJ1014新型CMOS集成单光子探测器及超高速视觉芯片研究

2015JJ1015印刷制备高效率钙钛矿太阳能电池的界面研究

2015JJ1016石墨烯与硫化钼二维异质结构的设计合成及光电性能研究

2015JJ1017交通安全规划理论

2015JJ1018环境规制、技术创新对产业生态效率的影响机制研究

2015JJ1019新型荧光纳米材料的制备并用于乳腺癌生物标志物检测

2015JJ1020石墨烯与类石墨烯二维材料的电子性质及器件设计

2015JJ1021惯性基导航系统的分析与综合

2015JJ1022长链非编码RNA AFAP1-AS1调控鼻咽癌侵袭转移的机制研究

2015JJ1023DNA甲基转移酶1（DNMT1）在皮肤细胞衰老中表达变化的调控机制研究2015JJ1024非小细胞肺癌铂类化疗个体化用药模型的建立

2015JJ1025外源因子对灵芝三萜酸动态合成的干预作用及其分子机制

2015JJ1026水稻穗长主效基因PL6的克隆与功能分析2015JJ2001车辆动力学及驾驶人行为影响下的车辆路径规划研究2015JJ2002车身结构噪声工况传递路径分析与低噪声结构优化研究2015JJ2003电气化铁路接触线防冰临界电流预测模型研究2015JJ2004公路重大项目设计-施工过程耦合作用分析2015JJ2005核多体理论中的相对论有效场论方法及致密物质相关研究2015JJ2006滑坡涌浪高效模拟技术及其水动力作用机制研究2015JJ2007基于非线性理论的数字图像真实性被动取证技术研究2015JJ2008基于减少造纸用植物纤维消耗的石膏晶须填料微晶结构转化及溶解抑制机理研究2015JJ2009基于石墨烯自旋电子器件的设计与机理分析2015JJ2010酵母展示技术在镉米深加工中的作用机理研究2015JJ2011冷藏期间草鱼肌肉脂质水解氧化与产品风味的相关性研究2015JJ2012石墨化介孔炭载体的低温合成及对铂催化剂的促活与稳定机理研究2015JJ2013准一维功能分子器件理论研究2015JJ2014基于环形天线与MSK软扩频技术的便携式透地通信系统研究2015JJ2015复杂非线性系统的可靠性优化研究2015JJ2016空天混沌自主时间同步研究2015JJ2017医用内螺旋管道机器人的尺寸效应分析2015JJ2018连续流混凝气提流化床好氧颗粒污泥颗粒化机制及其特性研究2015JJ2019伞菌目杀线虫野生菌株的筛选及鉴定2015JJ2020湖南创新驱动战略下金融创新与科技创新耦合协调度研究2015JJ2021心脏数值模型的模拟计算及手术优化研究2015JJ2022混凝沉淀—MWNTs/TiO2光催化工艺对有机磷农药废水的降解研究2015JJ2023近红外H2S荧光探针的设计合成及生物成像研究2015JJ2024人口城镇化与土地城镇化耦合协调机理及时空演化特征研究2015JJ2025重大基础设施项目复杂风险演化机理与组合性均衡评价研究2015JJ2026超硬砂轮多电极数控电火花修整技术研究2015JJ2027泛在网络环境下的移动个性化推荐方法研究2015JJ2028复杂非均相体系荧光化学生物传感定量分析理论及应用研究2015JJ2029高速列车噪声半主动控制研究2015JJ2030高效光催化降解协同水裂解制氢纳米结构材料的设计与可控制备2015JJ2031好氧堆肥过程中木质素降解酶的诱导及其调控机理研究2015JJ2032交叉领域共享知识结构挖掘算法研究2015JJ2033硫纳米粒子内嵌石墨烯/碳纳米管中空微球及其在高性能锂硫电池中的应用2015JJ2034碳纳米管增强超高性能混凝土的力学性能研究2015JJ2035云存储中面向QoS感知的代理服务模型与技术研究2015JJ2036超常材料中Airy光束的传播特性研究2015JJ2037泛在互联车辆传感器网络拓扑控制技术研究2015JJ2038疾病基因预测技术及其应用研究2015JJ2039基于动态微阵列微流控技术的血液中肿瘤相关循环诊断指标分析技术研究2015JJ2040量子点-Majorana束缚态耦合体系散粒噪声的研究2015JJ2041新入侵害虫扶桑绵粉蚧种群的扩散趋势预测2015JJ2042新型稠环噻吩的窄带隙共轭聚合物的合成、能级调控及其光伏性能研究2015JJ2043基于石墨烯的纳米氢化TiO2光催化剂的构筑及可见光产氢性能2015JJ2044EQCM法研究咪唑类离子液体中电沉积铬及铬合金基纳米复合镀层的机理2015JJ2045复杂动态网络的事件-稳定性与混合控制研究2015JJ2046基于高阶差分模式与局部核特征方法的面部表情识别研究2015JJ2047几类基于直觉语言信息的多准则决策方法研究2015JJ2048区域低碳产业协同创新体系形成机理及引导模式研究2015JJ2049微生物还原法制备纳米银及纳米银-抗生素协同抗菌机制研究2015JJ2050以石墨烯为电极的有机环状分子器件热电性质研究2015JJ2051Groebner基与环上的矩阵分解2015JJ2052丙二醛诱导大鼠骨骼肌疲劳的分子机制研究2015JJ2053创意农业带动农村劳动力转移就业的机理与实现路径研究2015JJ2054典型固定结合面接触刚度/热阻的宏微观多尺度分析研究2015JJ2055关于次分数 Brown 运动和双分数 Brown 运动的相关问题的研究2015JJ2056基于视觉注意模型的成人图像视频检测研究2015JJ2057建设项目组织结构对技术创新绩效的影响机制研究2015JJ2058近距离煤层群叠加开采卸压瓦斯运移规律及抽采模式研究2015JJ2059空间金融流动与产业转移的互生共长机理研究2015JJ2060宽带OFDM电力线通信的最优信道传输方法研究2015JJ2061矿井主扇耦合采区通风动态特性的变频通风机理及其应用研究2015JJ2062陆生草本植物氮同位素组成与气候温度的关系研究2015JJ2063脉冲泛函微分方程的相关问题与应用2015JJ2064镁合金表面碳纳米管改性硅烷复合膜的电沉积制备及其耐蚀性能2015JJ2065锰矿山植被恢复中先锋植物促进常绿乡土树种生长的研究2015JJ2066农业干旱灾害社会风险演化及预警研究2015JJ2067渗流—应力耦合作用下采空区有效防水煤柱的服役时效性研究2015JJ2068时标脉冲动力方程特征值问题与周期解2015JJ2069锈蚀栓钉连接件疲劳性能研究2015JJ2070岩石冲击切削破碎声发射特征与能量演化规律研究2015JJ2071中国红树林多尺度关联特征图谱研究2015JJ2072基于多酸-过渡金属大环配合物的合成与性质研究2015JJ2073基于行车动力与细观分析的耐久性沥青路面车辙预控方法2015JJ2074多元多维偏好组合集结多目标优化及其有效性评价2015JJ2075非自治离散系统的同宿轨与异宿轨研究2015JJ2076湖南稻田杂草千金子对氰氟草酯的抗药性监测及机理研究2015JJ2077类谷维素的化学酶法合成优化及其抗氧化应激分子机理的研究2015JJ2078面向SpMV的多核CPU与众核GPU异构协同计算研究2015JJ2079辛基酚聚氧乙烯醚类污染物降解新技术研究及其应用2015JJ2080油菜油酸脱氢酶（FAD2）基因启动子的结构、功能分析2015JJ2081有机肥和地下水位对水稻土镉化学行为的影响2015JJ2082猪圆环病毒2型病毒样颗粒组装机理的研究2015JJ2083苎麻花发育相关AP2/ERF转录因子基因的克隆与功能分析2015JJ2084一个新的白菜ERF转录因子的抗病毒功能及其靶基因研究2015JJ2085引力透镜与暗能量探测研究2015JJ2086供应链视角下中国食品安全整治的前瞻与精准规划研究2015JJ2087经济园区企业间网络嵌入性、关系学习与合作创新绩效之关系研究2015JJ2088青钱柳扦插生根生理机制研究2015JJ2089辣椒胞质雄性不育线粒体比较基因组研究2015JJ2090夏秋绿茶涩味形成物质基础研究2015JJ2091MRP8/14-TLR4调控IL-7表达在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的研究2015JJ2092左归丸对去卵巢骨质疏松大鼠TRPV5介导的钙转运通路的影响2015JJ2093长链非编码RNA与卵巢癌发生发展的相关性及其调控机制2015JJ2094肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）对胃癌细胞生长的影响及机制研究2015JJ2095多复变函数空间的等价刻画及相关问题研究2015JJ2096湖南省历史文化名村传统聚落空间形态测度与调控研究2015JJ2097内隐多效性选择及其神经机制研究2015JJ2098苏云金杆菌Cry6A 晶体蛋白与秀丽小杆线虫相互作用研究2015JJ2099苏云金芽胞杆菌钴胺素合成相关蛋白对杀虫晶体蛋白形成的影响及调控机制研究2015JJ2100新型远程红色荧光粉的设计合成及其应用2015JJ2101抑郁易感个体的自我参照加工程度效应：来自ERPs的证据2015JJ2102早期运动干预促进心肌myosin和actin表达对中老龄果蝇心脏功能的影响2015JJ2103植入式靶控输液的微流体驱动机理与流控关键技术研究2015JJ2104耀变体的光变及多波段关联研究2015JJ2105caveolin-1/SorLA在老年痴呆神经元炎性损伤中的作用及六味地黄汤干预2015JJ2106SIRPα在哮喘神经源性炎症机制中的作用及咳喘宁的调控机理2015JJ2107Wnt信号与TLR4串话在动脉粥样硬化单核细胞中的作用及护心康的影响2015JJ2108创伤性深静脉血栓模型大鼠NF-κB信号表达及消栓饮干预研究2015JJ2109复明片对血-视网膜屏障损伤的保护作用及其机制的研究2015JJ2110基于线粒体能量代谢的肾气丸“少火生气”作用机理及其“方证相关”研究2015JJ2111鱼腥草注射剂超分子结构对（类）致敏性影响的研究2015JJ2112基于免疫机理的网络病毒入侵动态风险评估方法研究2015JJ2113不饱和烃胺氰化成环合成含氰吲哚的研究2015JJ2114超冷偶极玻色量子气体在周期驱动光学晶格中的多体量子动力学2015JJ2115低品位硫氧混合铜矿高效分离提取机理研究2015JJ2116基于底物的TyrRS抑制剂的设计、合成与活性研究2015JJ2117Caveolin-1延缓糖尿病小鼠下肢缺血的作用与机制研究2015JJ2118CysC对高脂血症大鼠血管内皮功能的影响及其机制2015JJ2119DCLK1调控Wnt/β-catenin信号通路影响乳腺癌干细胞生物学行为的研究2015JJ2120miR-467b对小鼠动脉粥样硬化的影响及机制2015JJ2121磁场中亚波长双层复合金属光栅裁剪透射谱的研究2015JJ2122核酸适体-AuNPs-Pb（Cd）体系的纳米界面能量转移机制研究及应用2015JJ2123颌面部三叉神经的三维行径可视化研究及临床应用初步设计2015JJ2124经皮微创腰骶部椎弓根内固定数字解剖模型及工作平台构建研究2015JJ2125内源性硫化氢调控硫酸铍致肺细胞氧化损伤及其PI3K/AKT/Nrf-2/HO-1依赖机制2015JJ2126网络视角下中层管理者对企业创新的影响:角色、效应与机制研究2015JJ2127伪抛物方程解的存在性及其应用

(19)中华人民共和国国家知识产权局

(12)发明专利申请

(10)申请公布号 (43)申请公布日

(21)申请号 201910253412.9

(22)申请日 2019.03.29

(71)申请人 华中科技大学地址 430074 湖北省武汉市洪山区珞喻路1037号

(72)发明人 薛宇　宁万山　许浩东　邓万锟　郭亚萍　

(74)专利代理机构 华中科技大学专利中心 42201代理人 孙杨柳　曹葆青

(51)Int.Cl.G16B 15/20(2019.01)

(54)发明名称蛋白质编码方法及蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统(57)摘要本发明公开了蛋白质编码方法及蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统，属于生物信息学领域。所述蛋白质编码方法包括收集修饰位点信息、位置权重训练和待编码肽段的编码。蛋白质翻译后修饰位点预测方法包括收集修饰位点信息、特征编码、模型训练和蛋白质翻译后修饰位点预测。本发明利用深度神经网络和惩罚逻辑回归分别对不同类别的阳性位点和阴性位点的数字向量特征构建预测模型，得到多个预测模型；将每个预测模型的预测结果作为新的特征并利用惩罚逻辑回归构建最终模型。本发明可以捕获更多蛋白信息从而有助于提高预测的准确度，可

以快速的大规模鉴定蛋白质修饰位点。

权利要求书3页 说明书10页 附图3页CN 110033822 A2019.07.19

CN 110033822

A1.一种蛋白质编码方法，其特征在于，所述蛋白质编码方法用于表示待编码肽段与阳

性数据集肽段的相似度，含有以下步骤：

(1)收集修饰位点信息：首先收集蛋白质翻译后目标类型的修饰位点信息；将所述目标

类型的修饰位点在蛋白质上的对应位点作为阳性位点，将该蛋白质上与所述阳性位点相同

的其它氨基酸位点作为阴性位点；将蛋白质的一级序列切割成以所述阳性位点或阴性位点

为中心，该中心上游为n个氨基酸，该中心下游为n个氨基酸，总长度为2n+1个氨基酸序列；

所述n大于等于1；所有含有所述阳性位点的所述氨基酸序列构成阳性数据集，所有含有所

维隆气单胞菌外膜蛋白AII的植物瞬时表达系统的构建

夏妍;赵利峰;周天惠;张乐祎;赵宝华

【期刊名称】《河北师范大学学报：自然科学版》

【年(卷),期】2014()1

【摘 要】以维隆气单胞菌HBJY01为模板通过PCR技术扩增其外膜蛋白AII(AvompAII)基因片段,将序列正确的AvompAII基因片段与含有黄色荧光蛋白(yellow fluorescent protein,yfp)基因的表达载体pCAMBIA1300重组,将该重组表达载体转化到农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)GV3101中用于转染烟草叶片细胞.通过激光扫描共聚焦成像系统检测方法和RT-PCR的方法来检测融合表达AvompAII基因的黄色荧光蛋白的表达与AvompAII基因在烟草叶片中的转录情况.从维隆气单胞菌HBJY01中克隆出大小为996bp的AvompAII基因序列,并成功构建了AvompAII蛋白的植物瞬时表达系统.通过该方法能方便可靠地构建植物瞬时表达系统,并进一步对维隆气单胞菌所引起的水产疾病的发现和实际生产应用提供了实验基础.

【总页数】6页(P86-91)

【关键词】维隆气单胞菌;外膜蛋白;黄色荧光蛋白;烟草;瞬时表达

【作 者】夏妍;赵利峰;周天惠;张乐祎;赵宝华

【作者单位】山东德州职业技术学院粮油食品工程系;河北师范大学生命科学学院

【正文语种】中 文

【中图分类】Q812 【相关文献】

1.乳酸乳球菌NICE系统食品级分泌表达载体pRNV48的构建及铜绿假单胞菌融合外膜蛋白的表达 [J], 徐波;曹郁生;陈燕;郭兴华

2.维氏气单胞菌吉林分离株外膜蛋白AⅡ基因的克隆及生物信息学分析 [J], 单晓枫;吴同垒;孟庆峰;王伟利;钱爱东

3.嗜水气单胞菌外毒素和外膜蛋白双基因融合表达载体的构建和高效表达 [J], 何鸣筱;叶巧真;陈诚;谢俊锋;何建国

4.嗜水气单胞菌HBNUAh01外膜蛋白A基因在烟草叶片细胞中的瞬时表达 [J],

整合序列与蛋白相互作用特征的亚细胞定位预测

王明会;龚艺;王强;冯焕清;李骜

【摘 要】Information of protein subcellular localization is indispensable to

study protein function, as a protein can perform its function only after it is

correctly transported to a specific subcellular compartment. Thus it is very

important to provide accurate prediction of protein subcellular localization

in biological studies. In contrast to sequence features (e.g. amino acids

composition) that are widely used in subcellular localization prediction,

features extracting protein-protein interaction (PPI) are largely ignored,

although they reflect the co-localization information of different proteins.

In this study, we propose a novel distance formula based on both protein

sequence and PPI features, which precisely measures the similarity of

proteins by incorporating protein information including amino acid