免费生物医学期刊全文检索与获取方法
王敏许培扬
（中国医学科学院/中国协和医科大学医学信息研究所）
关键词：生物医学免费期刊免费全文文献检索
中图分类号：R 文献标识码：
文章编号：1009-0878（2006）04-0000-00
随着Internet的迅猛发展，生命科学研究作为人类科学最活跃的领域，生物医学资源已占整个网络资源的30%，如何方便、快捷的获取免费生物医学期刊全文成为科研人员、临床医生、教师学生的迫切需求。目前从网上获取免费全文的方法主要有二种：一是通过网络数据库提供的全文链接；二是登录提供免费期刊索引的网站。下面具体介绍免费生物医学期刊全文检索与获取方法。
1 网络数据库提供的全文链接
1.1 PubMed: https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,
PubMed是美国医学图书馆下属国家生物技术信息中心开发的基于Web的检索系统，是NCBI Entrez目录式检索系统中的重要组成部分。该系统收录了1950以来16,000,000条生物医学文献记录，并且提供部分文献的全文链接以及相关资源的链接站点，是国际上公认的最具权威的生物医学文献检索系统。
PubMed提供的文献题录类型有四种，具体见表1
PubMed中有5156种期刊提供网络版全文，其中800种期刊提供免费全文（期刊部分免费或全部免费），这些免费期刊来源于140多个出版社或供应商，PubMed central中的免费全文仅是PubMed免费全文中的一部分。
在PubMed中获取免费全文有两种方法，下面以检索有关“aids vaccine”的免费全文为例进行介绍：
(1) 利用“Limit”标签中的“Links to free full text”进行限定，见图1
(2) 在检索框中输入free full text[sb]
本例检索式为：aids vaccine AND free full text [sb]，见图2
图2
2登录免费期刊索引网站
目前互联网上有七大免费医学期刊索引网站，提供1600多种免费医学期刊，可以根据刊名、主题、分类、出版社、英文字顺等多种途径获取期刊网址链接，有的还可以通过篇名、作者、关键词等检索到特定的文献，也可以通过当前期、过刊卷期得到引文，进而点击进入指定格式的全文。
2.1 free medical journals https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/
截止2006年6月底Free medical journals网站已收集1450种免费全文期刊，该网站对收录的期刊按照学科、英文字顺和语种排列，见图3。这些期刊不仅包括英文，还有法语、西班牙语等14种语言的期刊，是查找免费小语种文献的重要网站。
https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/
图3
从Free medical journals网站检索到一篇免费全文需要两步：
第一步是查找到某一本特定的期刊。一般按照刊物内容所属的专业(specialty)和刊名英文字顺检索。另外英语以外的其它语种单独排列，对于影响因子较高的期刊、最新加入免费的期刊特别列出，还可以按照免费可得与印刷出版时差的不同选择期刊（比如出版后1-6月、出版后1年、出版后2年以上）。
第二步是查找到具体的全文。找到具体的期刊以后，通过点击期刊刊名即跳转进入到相应期刊的网站，不同期刊网站中文献的检索方式不尽相同，一些通过简单的篇名检索得到文献，多数期刊是通过年代、期、现刊、过刊等，逐步点击浏览到具体的文献。
2.2 Directory of Open Access Journals (DOAJ): https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/
开放期刊列表（Directory of Open Access Journals ）由瑞典隆德大学图书馆(Lund University Libraries )主办，OSI 、 SPARC 协办。该列表旨在覆盖所有学科、所有语种的高质量的开放存取同行评审期刊。截至2006年6月底，该列表已经收录2280种免费期刊，101070篇免费全文，涵盖农业和食物科学、生物和生命科学、化学、历史和考古学、法律和政治学、机械工程等17个学科领域。
该网站提供关键词检索和分类浏览检索两种方式。 其中分类浏览检索可分为三步：
第一步，通过该网站提供的刊名英文字顺或专业主题进行查找，该网站提供“Biology and life sciences ”/“Health science ”两个的医学类目，见图4；
第二步，“Biology and life sciences ”分为生物学、生命科学两个二级类目，“Health science ”分为口腔医学、普通内科学、护理学、公共卫生四个二级类目，点击进入相应二级类目对应的期刊列表，提供期刊ISSN 、学科主题、出版社、语种、关键词、提供免费电子期刊的年代信息；
第三步，通过期刊名链接进入该刊网站，或是通过“DOAJ content ”得到期刊免费的卷期。
2.3 PubMed Central: https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,
PubMed Central 是美国国立卫生研究院提供的免费生物医学期刊全文库，截止2006年6月底提供免费期刊254种。该网站提供关键词检索和期刊英文字顺检索两种方式，见图5
https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,
图4
2.4 BioMed Central: https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,
BioMed Central(BMC)是一个独立出版商，刊登的所有论文均通过同行评议，出版生物医学期刊178种，其中156种期刊免费。BMC 中的所有研究性论文均可及时永久性免费获取，一些期刊需要机构或个人付款才可阅读全文，如综述或论文报告。
该网站提供快速检索和分类浏览检索两种方式，其中分类浏览检索又分为英文字顺检索和专业主题检索，见图6。
2.5 Highwire Press: https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/
Highwire Press 是美国斯坦福大学图书馆的一个部门，该网站收录当今最新的生命科学、医学、物理学、社会科学等重要研究报告，截止2006年6月底共提供电子期刊944种， 350多万篇文献，其中免费全文130多万篇。
该网站提供关键词检索和分类浏览检索，其中分类浏览又分为期刊字顺、主题、出版社等多种途径。提供的免费期刊分为临时性全文免费（free trial 11种）、完全免费（free site 34种）、过刊全文免费（free back issue 214种），摘要免费（pay per view 845种）。通过点击https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/
https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/
点击进入免费
全文检索界面
图6
图7
“1,352,240 free, full text articles ”进入免费全文检索界面，见图7，进行通过输入关键词检索免费全文，或浏览相应期刊卷期。
2.6 Public Library of Science （PLOS ）: https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/journals/index.html
科学公共图书馆是一个非赢利组织，致力于全世界科技医学文献的共享。PLOS 出版社出版一系列经过同行评议、在互联网上可及时免费获取的、高质量的期刊全文，现在已向用户免费开放6种期刊，《PLOS biology 》、《PLOS Medicine 》、《PLOS Computational Biology 》、《PLOS Genetics 》、《PLOS Clinical trials 》，其中《PLOS biology 》是ISI 生物学领域高被引期刊之一，影响因子高达13.9。 2.7 FindArticles: https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,
在
find articles 中获取免费全文有两种方式：一限制在“free articles only ”字段进行关键词检索，见图8；二通过“Health & Fitness ”专业主题，进入生物医学期刊列表，见图9，继而得到相应免费期刊的卷期以及其它信息。
参考文献： 1． Entrez PubMed.https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/entrez/query.fcgi?DB=pubmed
2． Free medical journals.https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/
3． Directory of Open Access Journals.https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/
4． PubMed Central.https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,
5． BioMed Central. https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,
6． Highwire Press.https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/
7． Public Library of Science. https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,/
图8
图9
8．FindArticles.https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,
第25章Meta分析 思考与练习参考答案 一、最佳选择题 1. Meta分析中，如果异质性检验不拒绝H0，一般采用（B）进行效应合并。 A．随机效应模型 B. 固定效应模型C．混合效应模型 D. 回归模型 E. 贝叶斯模型 2. 关于meta分析，以下（C）说法不正确。 A．meta分析本质上是一种观察性研究，因而可能存在各种偏倚 B．meta分析是用定量的方法综合同类研究结果的一种系统评价 C．采用随机效应模型能使meta分析的结果更加可靠 D．meta分析时，如果研究间异质性很大，应认真考察异质性的来源，并考虑这些研究的可合并性 E．亚组分析能使meta分析的结果更有针对性 3. 对连续型变量资料的meta分析，如果各纳入研究的测量单位不同，应采用（A）作为效应合并指标。 A．标准化均数差 B. 加权均数差C．均数差 D. 标准化P值 E. 危险度差值 4. 异质性检验采用的统计量是（B）。 A．F统计量 B. Q统计量C．t统计量 D．H统计量 E. Z统计量 5. 关于发表偏移，以下说法（C）不正确。 A．通过漏斗图可大致判断是否存在发表偏倚 B．产生发表偏倚的主要原因是作者往往只把统计学上有意义的阳性研究结果拿来写文章并投稿 C．若发表偏倚对meta分析的影响较大，则需要增加很多个研究，才能使meta分析的结果被逆转 D．尽量搜集未发表的阴性研究结果，可减少发表偏倚 E．漏斗图的基本思想是纳入研究效应的精度随着样本含量的增加而增加
二、思考题 1. Meta分析的基本步骤有哪些？ 答：Meta分析的基本步骤包括：提出问题，制定研究计划；检索相关文献；选择符合要求的纳入文献；提取纳入文献的数据信息；纳入研究的质量评价；资料的统计学处理；敏感性分析；结果的分析和讨论。 2. Meta分析的目的和意义是什么？ 答：通过meta分析能增加统计功效，评价研究结果的一致性，增强结论的可靠性和客观性，通过亚组分析，得出新结论，寻找新的假说和研究思路。 3. Meta分析时，固定效应模型和随机效应模型有什么不同？如果研究间有异质性，应如何处理？ 答：Meta分析进行效应合并时的变异可能来源于两个部分，一是研究内变异，二是研究间变异。采用固定效应模型只考虑研究内变异，即认为研究间的差别只是抽样引起，纳入meta分析的各个独立研究来自一个相同的总体，各个独立研究的效应是效应合并值这一总体参数的估计值。采用随机效应模型则同时考虑了研究内变异和研究间变异，即认为研究间的差异不仅仅是抽样引起的，纳入meta 分析的各个独立研究分别来自不同但互有关联的一些总体，每个研究有其相应的总体参数，meta分析的效应合并值是多个不同总体参数的加权平均。 Meta分析时，如果异质性检验的结果不拒绝H0，即研究间的差异没有统计学意义，可采用固定效应模型得到效应合并值。如果拒绝H0，则认为研究间存在异质性，此时应考察异质性来源，并通过敏感性分析或亚组分析等异质性处理方法，使之达到同质后，再采用固定效应模型。若经异质性分析和处理后，多个独立研究的结果仍然不具有同质性，可选择随机效应模型、meta回归及混合效应模型进行效应合并。如果异质性很大，应考虑这些研究结果的可合并性，或放弃meta分析，只对结果进行定性分析。 4. Meta分析有哪些常见的偏倚？ 答：Meta分析本质上是一种观察性研究，在meta分析的各个步骤中均有可能产生偏倚。偏倚的存在对meta分析的结果产生较大影响。偏倚的类型主要包括文献发表偏倚、文献查
底栖生物物种资源调查附表1 表1小型底栖生物换算系数表 并殖吸虫纲介形类、涡旋类、腹足类、缓步类、多毛类、寡毛类等注:桡足类换算系数C因形状而异。不同桡足类199-1- 附表1大型底栖生物海洋采样记录 |见530 450 295 550 550 614 530 230 图1转换系数199网格号:海域:航次:航站号:经纬度:纬度:水深:米绳长:米底材质:底温:℃底盐:采泥机采泥次数m2:样品厚度cm网目类型:网目宽度:拖网距离:采泥时间:年月日小时 拖网时间:年月日，小时采样:记录:数字: 采集的泥浆样本总数:拖网样本总数:1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 XXXX日期和时间:月、年、月、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、年、月、月、年、年、年、年、月、月、月、年、年、月、月、月、月记录仪: 芯样号0-2厘米2-5厘米5-10厘米瓶样号01 02小生物03 04 05 > 10厘米注 -3- 附表3大型底栖生物定量分析记录表
网格号:海域航次采样站号:年、月、日、小时，水深:米沉积物取样器m2取样次数取样厚度厘米取样重量计算编号 2年第1号2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 XXXX小时取样记录编号 9年第。 ind储量-5- -6- 附表5小型底栖生物定量分析记录 网格数:海域航站号 测站南北水深m 泥浆取样器m 2样品厚度cm 沉积物取样时间、年、月、日和小时分类记录编号 核心样本编号0-2cm 2-5cm 5-10cm >10cm个体编号(ind)密度(ind/ M)备注2瓶样本编号1线虫2 3平均1桡足类2 3平均1介形类2 3平均1介形类23平均1 2 3平均1 2 — 7 — 3平均总量注:各种群的百分比为线虫、桡足类、介形类，表6定性测量站北斯诺。水深m挖泥船m2型 类群号 种名称的识别(ind)-8-
第15章 样本含量估计 思考与练习参考答案 一、最佳选择题 1. 在假设检验中，样本含量的确定（ C ）。 A. 只与Ⅰ类错误概率α有关 B. 只与Ⅱ类错误概率β有关 C. 与α、β都有关 D. 与α、β都无关 E. 只与α、β有关 2. 以下关于检验功效的描述，不正确的是（ C ）。 A. 假设检验中，若0H 客观上不成立，但根据假设检验的规则，将有β大小的概率错误地得出“差异无统计学意义”的推断结论，这种错误称为Ⅱ类错误，相应地，推断正确的概率为β-1，称为检验功效。 B. 检验功效受客观事物差异的大小、个体间变异的大小、样本量和α值等要素的影响。 C. 假设检验的“阴性”结果（P ＞0.05）可以作为“总体参数之间的差异无统计学意义”这一结论的证据。 D. 假设检验得出“阴性”结果（P ＞0.05）是“总体参数之间的差异无统计学意义”这一结论的必要条件而非充分条件。 E. 当假设检验出现“阴性”结果（P ＞0.05）时，有必要复核样本含量和检验功效是/否偏低，以便正确分析假设检验“阴性”结论的正确性。 3.在调查研究中，计算配对设计均数比较所需样本含量的公式为（ A ）。 A. 2])([δβαS t t n += B. 2])([2δβαS t t n +?= C. 2])([δβαS t t N += D. 2 2 21)() )(1(2p p Z Z p p n -+-=βα E. =n 22212211)(] )1()1()1(2[p p p p p p Z p p Z --+-+-βα 4. 在调查研究中，计算两样本率比较所需样本含量的公式为（ E ）。
8.3 淡水浮游生物的调查方法 淡水浮游生物调查有定性调查和定量调查两种类型。定性调查是指采集浮游生物进行属种鉴定的过程，其目的在于了解水体中浮游生物的种类组成、出现季节及其分布状况。定量调查是指采集浮游生物，确定个体数目或重量的过程，其目的在于探明各种浮游生物在水体中的数量及其变化情况。定性调查是定量调查的基础，定量调查则是定性调查的发展和补充，二者相辅相成，在实践中常相互结合进行。 一、调查用品用具 (1)网具 ①浮游生物定性网：用于表层50厘米内各种浮游生物的定性采集。由铜环、缝在环上的圆锥形筛绢网袋及连在网袋末端的集中杯（网头）三部分组成（其外形见本书图2-3）。由于浮游生物大小各不相同，为了采全各种浮游生物，应使用25#、20#、13#三种规格。其中25#网适于采集个体较小的浮游植物，其网孔大小为0.064毫米；20#网适于采集一般浮游植物及中小型浮游动物，其网孔大小为0.076毫米；13#网适于采集大型枝角类和桡足类等浮游动物，其网孔大小为0.112毫米。中学生开展本项活动时，可以只用20#网进行采集。 定性网可以自己裁剪制作，裁剪时可按图8-1所示方法进行。如网口直径为20厘米，其半径为10厘米，可依c=2rπ公式计算，从a到b的弧长为62.8厘米，a至c为网的长度即60厘米，这样就可按照图8－1中的1与2所示方法进行裁剪。缝合时，应该用细针，以免网上留下针孔，造成浮游生物自针孔流失。网衣应该用10厘米宽的白布条固定在铜环上，使筛绢不与铜环直接接触。在网的末端装配集中杯。为了使网衣坚固耐用，最好在缝合处加缝2厘米宽的白布条。 定性网各部分的尺寸规格，依型式不同而有差别，其尺寸规格见表8-1。 表8-1 浮游生物定性网规格 单位：厘米
水体浮游动物调查研究 摘要为初步了解研究水生动物的手段和方法，为将来从事有关水生动物的研究和工作奠定基础。本实验对内的一个池塘内的水体浮游动物展开调查。研究了该水体中水生浮游动物的种类组成和种类密度。实验表明：该水体中存在多种水生植物和水体浮游动物。其中以尾裸藻为优势物种。 关键词浮游动物；种类组成；种类密度 A research of the zooplankton in XXXX Abstract In order to learn the means and methods of study the zooplankton;to lay the foundation for the future work which is studying on the zooplankton.In this Experiment,Survey the zooplankton which is in a pond of XXXX.Study the The species composition and species density of zooplankton .The results showed that there are a variety of aquatic plants and zooplankton . And the dominant species is Euglena caudata.. Key Words zooplankton;species composition;species density 1 前言 1.1 浮游动物概念及其功能特点 1.1.1 浮游动物概念 浮游动物是指悬浮于水中的水生动物，它们没有游泳能力或游泳能力很弱，不能做远距离移动也不足以抵拒水的流动力，身体微小，要借助显微镜才能观察到。它是生态学名词，主要包括原生动物、轮虫、枝角类和桡足类(刘健康，1999)。 1.1.1.1 原生动物 原生动物是由单细胞构成的微小动物，有些种类形成群体，群体中的单个虫体都是独立生活的，以伪足、纤毛和鞭毛为主要行动胞器，典型的原生动物的原生质是透明的、无色的，许多原生动物因摄食许多食物呈多种不同的颜色。原生
底栖生物 一、填空题 1．底栖动物是指栖息生活在水体底部淤泥内或石块、砾石的表面或其间隙中，以及附着在的、肉眼可见的。 2．底栖动物包括水生昆虫、软体动物、水栖寡毛类、、和等大类。 3．在进行颤蚓类种的鉴别时，需要观察成熟的，故需要在显微镜下观察。 4．底栖动物标本一般用或固定，或采用混合固定液，可以长期保存。 5．在采集底栖动物样品时，定性采样常用的工具是，定量采样常用的工具是和。 二、判断题 1．生物监测采集底栖动物时，人工基质篮式采样器广泛适用于采集较坚硬的底质和淤泥底质，多用于湖泊、水库及底质非砾石且较松软、水流较缓的河流。( ) 2．一般正常情况下，比较清洁的水体中分布的底栖动物种类多、个体数量相对少，污染水体(严重污染除外)中分布的底栖动物种类少、个体数量相对多。( ) 3．底栖动物监测是河流和湖泊、水库水体生物监测的必测项目。( ) 4．在水体受到污染后，生物的种类和数量会发生变化，底栖动物与浮游生物都能敏感地反映这些变化，因此其群落结构的变化对侦察和评价污染所起的作用是相同的。( ) 5．底栖动物包括大型无脊椎动物的众多门类，在环境监测时，所有物种均需鉴定到种。( ) 6．底栖动物种群和数量的变化可以稳定地反映水体环境质量状况，在计数底栖动物时，除个体较大的软体动物外，皆应在显微镜下按属或种计数，并按大类统计数量。( ) 三、选择题 1．一般认为底栖动物是体长超过2mm、不能通过目分样筛的水生生物。( )
A．40 B．20 C． 100 D．200 2．具有相对稳定的生活环境，本身移动能力差，在未受到干扰的情况下，种群和群落结构是比较稳定的水生生物，是指。( ) A．浮游植物 B．底栖动物 C．浮游动物 D。原生动物 3．对底栖动物摇蚊幼虫的鉴定，需依据。( ) A．成熟的生殖器官 B．口器的结构差异 C．幼虫的长度 D．幼虫的羽化时间 4．在监测底栖动物封胶制片时，需用到卑瑞斯胶，它搁置的时间是——。( ) A．不能久放 B．没有关系 C。越久越好 D．有确定的时间 5，底栖动物定量采样一般使用彼得逊采泥器，适用于采集淤泥底质和沙泥底质，采样面积通常为 m2。( ) A． 1／4 B．1／8 C．1／16 D. 1／32 四、问答题 1．通过对水体底栖动物群落结构、优势种类及有毒物质含量的监测，可反映水体污染状况，为什么? 2．摇蚊科幼虫应如何鉴定、制片和保存? 3．何为底栖动物?它们包括哪些门类? 4．从水底取得样品后，还需经过怎样的处理才能得到每个样品中的大型无脊椎动物?
统计学是应用概率论和数理统计的方法，研究数据的搜集、整理、分析与推断的学科，是认识世界的一种重要手段。 变量（variable）：就是反映个体特征或属性的量.变量值(variable value)：变量的观察结果或测量值。定量变量quantitative variable/数值变量numerical variable 定性变量qualitative variable/分类变量categorical variable 同质（homogeneity）是指被研究指标的影响因素相同。但在医学研究中，有些影响因素往往是难以控制的（如遗传、营养等），甚至是未知的。因此，在实际工作中只有相对的同质。 变异(variation):同质基础上的各观察单位间的差异称为变异。 总体：是根据研究目的所确定的同质观察对象的全体，或者说所有同质的某指标实测值的集合。样本：根据随机化的原则从总体中抽取有代表性的部分观察单位，其变量实测值构成样本。 参数（parameter）：根据总体变量值统计计算出来的、描述总体特征的统计指标。统计量（statistic）：根据样本变量值统计计算出来的、描述样本特征的统计指标。 误差：指测量值和真实值之间的差别 准确度(accuracy) ：观察值与真值的接近程度，受系统误差的影响。可靠度（reliability）：也称精密度(precision)或重复性（repeatability）：是重复观察时观察值与其均值的接近程度，受随机误差的影响。 概率:是描述随机事件发生的可能性大小的一种度量，常用P表示。0≤P≤1 随机事件 P=1 必然事件P=0 不可能事件P≤0.05或P≤0.01为小概率事件 统计工作的基本步骤: 统计设计(研究对象,处理因素,统计分析),搜集资料(任务：遵循统计学原理，按照设计要求，采取必要措施得到准确可靠的原始资料。原则：及时、准确、完整。),整理资料(编码，将数据输入计算机;纠错改错、补漏等;根据研究目的将原始数据进行归纳、分组或计算),分析资料如何对数值变量进行统计描述。1频数表与频数分布图2集中趋势的统计描述3离散趋势的统计描述 相对数的概念包括率、构成比、相对比和动态数列，由于它是两个有联系的指标之比，因而叫作相对数。相对数应用中的注意事项1计算相对数的分母不易过小2防治概念混淆, 分析时不能以构成比代替率3对观察单位不等的几个率，不能直接相加求其平均率。4资料的对比应注意同质5对样本率的比较应遵循随机抽样，要作假设检验。 率:表示在一定条件下，发生某现象的观察单位数与可能发生某现象的观察单位数之比。 构成比表示某一现象内部各组成部分所占的比重或分布。特征1各组成部分的构成比之和为100% 2某一部分构成比增大或减小，必然使其它部分产生相应的变化。注意区别率和构成比虽然两者均为两个指标之比，但意义却完全不同。率反应了某项指标的平均强度或平均水平，它具有数值变量中平均数的含意,构成比表示某一现象内部各组成部分所占的比重或分布，不能反应该现象的平均强度或平均水平。 正态分布的概念若将各直条顶端的中点顺次连接起来,得到一条折线。当样本量n越来越大时，组段越分越细，此时直方渐进直条，这条折线就越来越接近于一条光滑的曲线（见图3.1），我们把这条呈中间高，两边低，左右基本对称的“钟型”曲线称为正态分布曲线，近似于数学上的正态分布（高斯分布; Gauss）。正态分布的特征1．集中性：正态曲线在横轴上方均数处最高2．对称性：以均数为中心，左右对称。3．正态分布的图形由均数和标准差两个参数决定。位置参数μ；变异度参数σ4. 正态分布曲线下的面积分布有一定规律：正态曲线与横轴所夹的面积为1(1.64,1.96,2.58)应用1. 制定医学参考值范围2. 估计频数分布3. 进行质量控制4.正态分布是许多统计方法的理论基础 二项分布在医学研究中，许多观察或试验的可能结果可以归结为二个相互排斥的结果。性质与特征⑴形态取决于π和n：当π接近0.5时，分布对称，π离
思考与练习参考答案 第1章绪论 一、选择题 1. 研究中的基本单位是指( D)。 A．样本 B. 全部对象C．影响因素 D. 个体 E. 总体 2. 从总体中抽取样本的目的是（ B ）。 A．研究样本统计量 B. 由样本统计量推断总体参数 C．研究典型案例 D. 研究总体统计量Ｅ. 计算统计指标 3. 参数是指（ B ）。 A．参与个体数 B. 描述总体特征的统计指标 C．描述样本特征的统计指标 D. 样本的总和 E. 参与变量数 4. 下列资料属名义变量的是（E）。 A．白细胞计数B．住院天数 C．门急诊就诊人数D．患者的病情分级 E. ABO血型 5．关于随机误差下列不正确的是（C）。 A．受测量精密度限制B．无方向性 C. 也称为偏倚 Ｄ．不可避免 E. 增加样本含量可降低其大小 二、名称解释（答案略） 1. 变量与随机变量 2. 同质与变异 3. 总体与样本 4. 参数与统计量 5. 误差 6. 随机事件 7. 频率与概率 三、思考题 1. 生物统计学与其他统计学有什么区别和联系？ 答：统计学可细分为数理统计学、经济统计学、生物统计学、卫生统计学、医学统计学等，都是关于数据的学问，是从数据中提取信息、知识的一门科学与艺术。而生物统计学是统计学原理与方法应用于生物学、医学的一门科学，与医学统计学和卫生统计学很相似，其
不同之处在于医学统计学侧重于介绍医学研究中的统计学原理与方法，而卫生统计学更侧重于介绍社会、人群健康研究中的统计学原理与方法。 2. 某年级甲班、乙班各有男生50人。从两个班各抽取10人测量身高，并求其平均身高。如果甲班的平均身高大于乙班，能否推论甲班所有同学的平均身高大于乙班？为什么？ 答：不能。因为，从甲、乙两班分别抽取的10人，测量其身高，得到的分别是甲、乙两班的一个样本。样本的平均身高只是甲、乙两班所有同学平均身高的一个点估计值。即使是按随机化原则进行抽样，由于存在抽样误差，样本均数与总体均数一般很难恰好相等。因此，不能仅凭两个样本均数高低就作出两总体均数熟高熟低的判断，而应通过统计分析，进行统计推断，才能作出判断。 3. 某地区有10万个7岁发育正常的男孩，为了研究这些7岁发育正常男孩的身高和体重，在该人群中随机抽取200个7岁发育正常的男孩，测量他们的身高和体重，请回答下列问题。 (1) 该研究中的总体是什么？ 答：某地区10万个7岁发育正常的男孩。 (2) 该研究中的身高总体均数的意义是什么？ 答：身高总体均数的意义是: 10万个7岁发育正常的男孩的平均身高。 (3) 该研究中的体重总体均数的意义是什么？ 答：体重总体均数的意义是: 10万个7岁发育正常的男孩的平均体重 (4) 该研究中的总体均数与总体是什么关系？ 答：总体均数是反映总体的统计学特征的指标。 （5）该研究中的样本是什么？ 答：该研究中的样本是：随机抽取的200个7岁发育正常的男孩。 （宇传华方积乾） 第2章统计描述 思考与练习参考答案 一、最佳选择题 1. 编制频数表时错误的作法是（ E ）。 A. 用最大值减去最小值求全距 B. 组距常取等组距，一般分为10~15组 C. 第一个组段须包括最小值 D. 最后一个组段须包括最大值
浮游动物生物量的测量方法 自赵文《水生生物学》现存量：单位面积或体积中所存在生物体的数量或质量。 现存量若以个体数表示则可称为丰度或（数量）密度，单位为个/L。若以质量表示则可称为生物量，单位为mg/L。 采集方法： 一采水器采水后沉淀分离（适用原生动物、轮虫等小型浮游动物）； 二用网过滤（适用于枝角类、挠足类等甲壳动物）。 仪器：采水器，（25#）浮游生物网，显微镜，计数框（计数原生动物用0.1ml计数框，计数轮虫和甲壳动物用1ml计数框）解剖镜，毛细管，目测微尺 一采集 1 设站根据浮游动物的分布设站。 2 采水层次由水体的深度决定。切不可之采一个表层或一个底层水样。（据夏季调查，东湖B站（水深4m左右），在2m的水层区，甲壳动物的数量约占31%，而入2m一下的水层占69%左右。同时还发现，在夏季，一般幼体喜欢在表层，成体在深层。） 分层方法：是每隔0.5m或1m,甚至2m取一个水样加以混合，然后取得一部分作为浮游动物定量之用。 许多水库或深水湖泊，水深20m以上，这种水体在夏季及冬季存在温跃层（或称变温层）。由于在温跃层一下缺乏光照，浮游植物数量极少，依赖植物生存的浮游动物数量也相应减少。 如果从养殖角度而言，只取温水层以上的水层就足够了。 3 采水量浮游动物不但种类组成复杂，而且个体大小相差也极悬殊。因此要根据它们在水体中的不同密度二采不同的水量。 （目前计数原生动物、轮虫的水样量以1L为宜，枝角类、桡足类则以10~50L较好。） 4 采集时间采样时间要尽量保持一致。一般在上午8:00~10:00进行为好。 在长江中下游采集，如果采集四次，则春、夏、秋、冬各一次。如果只采一次，则应在秋季（9、10月）进行为好。（这是因为9~10月正是鱼类摄食旺季，为鱼类生长的最佳时期，如果此时有较高的现存量，则可认为该水体中有较大的供铒能力。） 浮游动物样品的固定，原生动物和轮虫可用碘液或福尔马林，加量同浮游植物（一般可与浮游植物合用同一样品）。枝角类和桡足类一般用5%体积的甲醛固定。原生动物、轮虫的种类鉴定需活体观察，为方便起见，可加适当的麻醉试剂，如普鲁卡因、乌来糖（鸟烷），也可用苏打水等。 二沉淀和虑缩 1 沉淀法操作方法与浮游植物定量样品的沉淀和浓缩方法相同。（即在筒形分液漏斗中沉淀48小时后，吸取上层清液，把沉淀浓缩样品放入试瓶中，最后定量30或50ml。一般原生动物和轮虫的计数可与浮游植物的计数合用一个样品。） 2 滤缩法甲壳动物一般个体较大，在水体中的密度也较低，通常用过滤法浓缩水样。注意：首先必须用25#浮游生物网作为过滤网；其次，应当有过滤网和定性网之分。在不得已情况下，定要先采定量样品，后采定性标本。如果再次过滤样品时，一定要反复洗净后方可使用。同时切记用25#网过滤的水样，不能当做计数原生动物或轮虫的定量样品之用。 三计数 1 浮游动物、轮虫的计数计数时，成点样品应充分摇匀，然后用定量吸管吸0.1ml注入0.1ml 计数框中，在10*20的放大倍数下计数原生动物。在10*10放大倍数下计数轮虫。计数两片
生物医学论文中统计结果的表达及解释 【摘要】统计学是生物医学研究所必需的重要手段, 生物医学研究的实验设计、资料收集、数据处理分析以及结论都离不开统计学应用。生物医学研究论文主要由摘要、引言、材料与方法、结果和讨论5个部分组成, 各个部分都涉及统计结果的表达和解释, 统计学是专业结论成立与否的重要依据。统计学应用不当不仅影响论文的科学性, 还有可能得出错误的专业结论。 【关键词】统计学科研论文统计分析统计表达 近年来, 统计学在生物医学科研中的应用越来越受到重视, 统计分析结果的表达及解 释已成为医学科研论文中不可缺少的重要组成部分。除论文涉及的专业（如细胞与分子免疫学杂志为免疫学专业）和表述的文字2个方面外, 统计学是评价论文质量优劣的重要依据, 然而国内生物医学论文中统计学应用仍存在着较为严重的问题[1-4], 如2003年某大学学报拟发表论著中统计方法误用率为57%[3]。细胞与分子免疫学杂志虽然在国内生物医学系列杂志中具有较高的学术地位[5], 但拟发表及刊出论文在科研设计、统计学分析、结果解释等方面也不同程度地存在一些问题, 作者的统计学应用水平有待进一步提高。许多生物医学杂志, 如国外著名杂志JAMA、新英格兰医学杂志（NEJM）和英国医学杂志（BMJ）等, 以及国内中华医学会系列杂志及细胞与分子免疫学杂志等, 对来稿都有统计学表达的基本要 求或统计学指导原则。国际生物医学杂志编辑协会在其《生物医学期刊投稿的统一要求》中也包含了统计学表达的基本要求。生物医学研究性论文主要由摘要、引言、材料与方法、结果和讨论5个部分组成, 各个部分或多或少都涉及到统计结果的表达和解释问题。例如在论文的“引言”部分需要给出文献复习的综合结果, 如文献报告的组间差别及P值等。其他重要的统计表达和解释主要集中在论文的“摘要”、“材料和方法”、“结果”及“讨论”4个部分[6]。 1 摘要 “摘要”中要有表示研究结果的重要统计指标（统计量）的数值、可信区间及假设检验结果（P值）。如处理组和对照组的均数（中位数）、标准差（标准误）、率、P值, 或2组均数（率）之差、95%可信区间、OR值及多个观察指标的相关系数等。这些数据是循证医学Meta分析的基本依据。 2 材料和方法 “材料和方法”中的统计学描述包括以下两个方面。 2.1 描述研究设计的内容内容包括研究类型、观察对象类型、入选和剔除标准、观察方法和测量技术以及实验、试验或调查资料的搜集过程等。尤其应具体地描述研究对象的来源和选择方法（如是否配对、随机抽样）, 包括观察对象的基本情况、有无随机分组（随机抽样）、随机化分组方法、样本含量及其估计的依据等。对于非随机化分组的观察性研究（含调查研究）, 还应给出影响因素（如年龄、性别、病情）的均衡性分析结果。对于临床试验, 还需要特别说明诊断标准、疗效评价标准、病例入选标准、病例剔除标准、依从性如何、
~ 淡水浮游生物的调查方法 淡水浮游生物调查有定性调查和定量调查两种类型。定性调查是指采集浮游生物进行属种鉴定的过程，其目的在于了解水体中浮游生物的种类组成、出现季节及其分布状况。定量调查是指采集浮游生物，确定个体数目或重量的过程，其目的在于探明各种浮游生物在水体中的数量及其变化情况。定性调查是定量调查的基础，定量调查则是定性调查的发展和补充，二者相辅相成，在实践中常相互结合进行。 一、调查用品用具 (1)网具 ①浮游生物定性网：用于表层50厘米内各种浮游生物的定性采集。由铜环、缝在环上的圆锥形筛绢网袋及连在网袋末端的集中杯（网头）三部分组成（其外形见本书图2-3）。由于浮游生物大小各不相同，为了采全各种浮游生物，应使用25#、20#、13#三种规格。其中25#网适于采集个体较小的浮游植物，其网孔大小为毫米；20#网适于采集一般浮游植物及中小型浮游动物，其网孔大小为毫米；13#网适于采集大型枝角类和桡足类等浮游动物，其网孔大小为毫米。中学生开展本项活动时，可以只用20#网进行采集。 定性网可以自己裁剪制作，裁剪时可按图8-1所示方法进行。如网口直径为20厘米，其半径为10厘米，可依c=2rπ公式计算，从a到b的弧长为厘米，a至c为网的长度即60厘米，这样就可按照图8－1中的1与2所示方法进行裁剪。缝合时，应该用细针，以免网上留下针孔，造成浮游生物自针孔流失。网衣应该用10厘米宽的白布条固定在铜环上，使筛绢不与铜环直接接触。在网的末端装配集中杯。为了使网衣坚固耐用，最好在缝合处加缝2厘米宽的白布条。 ) 定性网各部分的尺寸规格，依型式不同而有差别，其尺寸规格见表8-1。 表8-1 浮游生物定性网规格 单位：厘米
第12章实验设计 思考与练习参考答案 一、最佳选择题 1. 处理因素作用于受试对象的反映须通过观察指标来表达，则选择指标的依据具有（ E ）。 A.客观性 B. 特异性 C. 敏感性 D. 特异性和敏感性 E. A与D 2. 以前的许多研究表明，血清三酰甘油的含量与冠心病危险性有关，即三酰甘油的含量越高，患冠心病的危险性就越大，有的医生以此筛选危险人群。后来的研究表明，冠心病还与其他因素有关，特别是血清中高含量胆固醇和低含量的高密度脂蛋白，它们常与冠心病同时发生联系，采用严格的实验设计平衡了其他因素的作用后，发现三酰甘油的含量与冠心病发病的危险性之间的联系就不复存在了。这是以下选项中的（B）选项把握得较好所致。 A. 重复实验次数较多 B.均衡性原则考虑得周到 C.用多因素设计取代单因素设计 D.提高实验人员的技术水平 E.严格按随机化原则进行分组 3. 实验共设4个组，每组动物数均为4只，在4个不同的时间点上对每只犬都进行了观测，资料概要列于教材表12-7中，此资料取自（B）。(注：B100 mg代表用B药的剂量) 教材表12-7 Beagle犬受6.5 Gy不均匀γ射线照射再用Ｂ药后外周血白细胞总数的结果━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━时间白细胞总数(S X ，×109/L) ─────────────────────────────────────── /天照射对照照射+B100 mg 照射+阳性对照药照射+B100 mg+阳性对照药────────────────────────────────────────────照射前 14.30±3.77 14.70±2.83 14.08±1.60 13.98±1.37 照射后: 6 3.68±0.82 4.26±1.40 5.28±1.52 6.90±0.97 12 7.23±0.83 7.44±1.10 8.75±1.02 10.53±1.57 18 6.87±1.50 9.26±1.36 9.87±1.23 12.78±1.83 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ A. 具有一个重复测量的两因素 B.具有一个重复测量的三因素设计 C.两因素析因设计 D. 三因素析因设计 E.交叉设计 4. 已知A、B、C都是三水平因素，且根据预试验结果得知，三个因素之间的各级交互作用都很重要，需要考察。好在这个实验作起来比较方便，需要的费用和时间都比较少。最好选用（A）。 A.析因设计Ｂ. 交叉设计Ｃ. 随机区组设计 Ｄ. 配对设计 E. 单因素三水平设计
生物統計方法在流行病學、臨床醫學上之應用 統計(Statistics) ˙資料收集(collect)、偵測(monitor)、分析(analyze)、綜括(summary)、解釋(interpret)之科學。 生物統計(Biostatistics) ˙統計應用於生物(生命) 科學，主要包括下列領域: 公共衛生(Public Health)、醫藥(Medicine)、生態及環境(Ecological and environmental)。 流行病學( Epidemiology ) ˙希臘原文Epidemiology: Epi = among, demos = people, logos = doctrine. ˙Webster’s dictionary: 1.The branch of medicine dealing with the incidence and prevalence of disease in large populations and with detection of the source and cause of epidemics. 2. The factors contributing to the presence or absence of a disease. ˙(周碧瑟教授): 流行病學是研究人類疾病分佈及其決定因素的科學，疾病的發生以個人特性或環境的不同來衡量。 ˙（陳建仁教授）： 流行病學是研究族群之健康狀態和健康事件之分布狀況及其決定因素，並應用研究成果以控制健康問題的學問。（引自：Last, 1988）。 ˙(林瑞雄教授): 流行病學是一科學研究方法論，主要用以探討觀察值與期望值之不同，人、時、
Autonomous Plankton Sampler A modern Plankton Sampler updating the Hardy design for automated, towed, moored and shipborne use. ? ? ? ? Fixed depth and undulating towed vehicles ? Moorings FEATURES ? Onboard batteries and microcontroller ? Hydrodynamics closely matched to the Hardy sampler ? Integral flow meter ? Integral 6 channel data logger ? Uses standard 270 μm mesh silk or 80 μm nylon gauze ? Pre-programmed or commanded sampling ? Automatic advance from onset of clogging
AUTONOMOUS PLANKTON SAMPLER The Autonomous Plankton Sampler is the result of a collaborative venture between the Centre for Coastal Marine Science and Chelsea Technologies Group to design and develop a new versatile, low-cost plankton sampler mechanism. The Autonomous Plankton Sampler is intended for use in Chelsea’s N ν-Shuttle and AQUA shuttle towed vehicles as well as ship-borne and mooring pumped deployments. It also provides a modern replacement for traditional sampling mechanisms such as that used in the Continuous Plankton Recorder (CPR) programme of the Sir Alister Hardy Foundation for Ocean Science (SAHFOS). The Autonomous Plankton Sampler incorporates an internal programmable data logger controller and battery pack coupled with state of the art electric motor technology to drive the gauze advance mechanism. Gauze advance, battery low and memory full flags are logged after every gauze advance. The Autonomous Plankton Sampler provides data logging for six external environmental sensors along with the capability to trigger the gauze advance protocol from an external source such as MINI pack or other CTDs. Provision has been made for the inclusion of a flow meter if required. The system is intended to meet the requirements of sampling programmes for the 21st Century, whilst maintaining backward data compatibility with the 60-year time series of the CPR and other long-term monitoring programmes. The sampler sensor suite is optimised to meet the requirements of programmes such as GOOS, EuroGOOS, the Large Marine Ecosystems (LME) programme and the US National Marine Fisheries Service. INSTRUMENT DESCRIPTION The Autonomous Plankton Sampler is constructed in stainless steel with two spools of either silk or nylon gauze, integral microcontroller, motor, batteries and flow meter. On towing, or pumping, the water passes through the intake aperture. The zooplankton are captured upon a filtration gauze which is then covered by a second gauze and wound on to a collection spool immersed in preservative. Post-deployment analysis is undertaken either on gauze or wash off. Key design features: ? The hydrodynamics of the water intake into the sampling mechanism closely matches that of the existing Hardy mechanism. This is intended to maintain continuity between the samples collected during the last 60 years by the CPR programme and those that will be collected using the new system. ? The electric motor permits the use of an electronic controller, and the ability to programme a complete tow in terms of sampling duration before each gauze advance. External advance on demand is also available. ? The onboard microprocessor also enables such features as early gauze advance to be incorporated, for example by high chlorophyll levels. The option of sensing the pressure differential across the gauze permits advance when the onset of clogging is indicated. ? Measurement of flow through the device can be incorporated in the mechanism exhaust. The controller/logger system permits logging of gauze advance, flow rate, together with output from external sensors, all date and time stamped. ? Standard silk gauze is used (270μm mesh). Nylon gauze may also be used, permitting sample wash-off and allowing the use of mesh sizes down to 80μm for quantitative sampling of juvenile stages and smaller copepods. ? The mechanism has been simplified to obviate the need for skilled operators to set up prior to deployment. INSTRUMENT SOFTWARE The Graphical User Interface (GUI) is a 32-bit Windows application used to programme the controller. Error detection is used on all data transfers. The plankton sampler screen allows the operator to set the frame advance rate based on either time, chlorophyll-a or flow. SPECIFICATION Size: Weight: Depth rating: Operational duration: Batteries: Time between gauze advances: Switch on: Preservation: Gauze size: Filtration area : Inlet port: Maximum tow speed: 140mm x 235mm x 291mm 12.75Kg 200 metres 2 to 4 weeks 6 x 1.2V primary cells 15 secs to 1 year Internally programmable or external trigger Formalin tank 80 to 400 μm range 50 x 100 mm 25 x 100 mm 25 knots In view of our policy of continual improvement, the designs and specifications of our products may vary from those described. 4/03 Chelsea Technologies Group 55 Central Avenue West Molesey Surrey KT8 2QZ United Kingdom Tel: +44 (0)20 8481 9000 Fax: +44 (0)20 8941 9319 sales@https://www.doczj.com/doc/5212312094.html, https://www.doczj.com/doc/5212312094.html,