PCR-DGGE技术评价抗生素诱导的肠道菌群失调
况炜;唐欢;袁静;张志学;魏泓
【期刊名称】《中国微生态学杂志》
【年(卷),期】2008(20)5
【摘 要】目的利用PCR-DGGE技术结合活菌计数评价抗生素引起的肠道菌群失调。方法SPF级BALB/c雌性小鼠连续4d灌胃头孢曲松溶液125mg/ml,0.4ml/d,运用基于细菌16S DNA的PCR-DGGE技术结合活菌计数分析小鼠肠道菌群变化。结果活菌计数结果与PCR-DGGE图谱显示,头孢曲松处理3d后小鼠肠道菌群出现严重失调。结论PCR-DGGE技术可直观而灵敏地显示抗生素处理过程中肠道菌群的动态变化,适用于评价抗生素引起的肠道菌群失调。
【总页数】3页(P425-427)
【关键词】PCR-DGGE;肠道菌群失调;头孢曲松;BALB/c小鼠
【作 者】况炜;唐欢;袁静;张志学;魏泓
【作者单位】西南大学生命科学学院;第三军医大学基础部实验动物学教研室
【正文语种】中 文
【中图分类】Q814.2
【相关文献】
1.变应性气道反应与抗生素诱导的肠道菌群失调关系研究 [J], 刘崇海;杨锡强;刘春花;何云;王莉佳
2.王氏保赤丸对抗生素诱导肠道菌群失调小鼠肠道保护作用及肝脏毒性的影响研究 [J], 李建婷;邝枣园;宋珊珊;肖珊珊;高智群;郭新峰;罗海燕
3.王氏保赤丸对抗生素诱导肠道菌群失调小鼠肠道保护作用及肝脏毒性的影响研究
[J], 李建婷;邝枣园;宋珊珊;肖珊珊;高智群;郭新峰;罗海燕
4.抗生素诱导肠道菌群失调对肠黏膜屏障和肝脏功能的动态影响 [J], 李娜;赵玉民;陈正元;王碧君;罗霞;王青;何国林;熊天琴;桑传兰
5.抗生素诱导的肠道菌群失调加重小鼠肺炎支原体感染 [J], 曾芜薇; 余斓; 丁伟艳;
黄立军; 陈列松; 游晓星; 朱翠明
因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买
第32卷第6期2012年6月环 境 科 学 学 报 ActaScientiaeCircumstantiaeVol.32,No.6Jun.,2012
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973)项目(No.2010CB428903);中国近海海洋综合调查与评价专项(No.ZJ908-01-01-3,ZJ908-02-02,ZJ908-04-02);浙江省自然科学基金(No.Y5100401);国家海洋局青年海洋科学基金(No.2010125);国家海洋局第二海洋研究所基本科研业务
费专项资助项目(No.JG200819)SupportedbytheNationalKeyBasicResearchProgramofChina(No.2010CB428903),theNationalOffshoreMarineIntegratedResearchandAssessmentProgram(No.ZJ908-01-01-3,ZJ908-02-02,ZJ908-04-02),theNaturalScienceFoundationofZhejiangProvince(No.Y5100401),theYoungPeopleMarineScienceFoundationofStateOceanicAdministration(No.2010125)andtheBasicScientificResearchBusinessExpensesoftheSecondStateOceanicAdministration(No.JG200819)
作者简介:杜萍(1985—),女,E-mail:duping816@;∗通讯作者(责任作者),E-mail:chenqz6509@Biography:DUPing(1985—),female,E-mail:duping816@;∗Correspondingauthor,E-mail:chenqz6509@杜萍,刘晶晶,沈李东,等.2012.Biolog和PCR-DGGE技术解析椒江口沉积物微生物多样性[J].环境科学学报,32(6):1436-1444DuP,LiuJJ,ShenLD,etal.2012.DiversityofmicroorganismsinsedimentsoftheJiaojiangEstuaryasestimatedbyBiologandPCR-DGGE[J].ActaScientiaeCircumstantiae,32(6):1436-1444Biolog和PCR-DGGE技术解析椒江口沉积物微生物
第４３卷第９期 ２０１２年９月 东北农业大学学报 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｎｏｒｔｈｅａｓｔ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ４３（９）：６４－６９ Ｓｅｐ．２０１２
ＰＣＲ—ＤＧＧＥ技术分析断奶仔免肠道微生物菌群结构及多样性
白秀娟，刘诚刚，杜智恒，付 晶，杨洪雁 （东北农业大学动物科学技术学院，哈尔滨ｌ５Ｏｏ３Ｏ） 摘要：利用ＰＣＲ—ＤＧＧＥ技术对断奶后１０、２０、３０ ｄ仔兔的十二指肠、空肠、回肠、盲肠和结肠１６Ｓ ｒＤＮＡ Ｖ３区基因进行图谱分析，通过对清晰的特异性和共性条带切胶回收ＤＮＡ和克隆测序，对不同日龄和不同肠段内 容物细茵群落的结构和多样性进行比较，并鉴定其群落成员，分析断奶仔兔不同日龄和肠段部位对微生物群落结 构与多样性的影响。肠道茵群ＤＧＧＥ图谱显示断奶仔兔肠道部位和不同日龄对细菌种群结构和多样性影响很大， 随着日龄增加，十二指肠和盲肠段微生物种类趋于复杂，空肠和结肠段经历由简单到复杂再到简单的过程，而回 肠段肠道微生物则出现由复杂到简单再到复杂的过程。各肠段的优势细茵有厚壁茵门、拟杆菌、梭状杆菌、博德 氏茵属、毛螺旋茵科，以及各种不可培养的细菌等。 关键词：断奶仔兔；肠道微生物；变性梯度凝胶电泳（ＤＧＧＥ）；１６Ｓ ｒＤＮＡ 中图分类号：￥８２９．１ 文献标志码：Ａ 文章编号：１００５—９３６９（２０１２）０９—００６４—０６ Ｕｓｉｎｇ ＰＣＲ－ＤＧＧＥ ｔｅｃｈｎｉｃａｌ ａｎａｌｙｓｉｓ ｗｅａｎｅｄ ｒａｂｂｉｔ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｄｉ— ｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌ ｍｉｃｒｏｆｌｏｒａ／ＢＡｉ Ｘｉｕｊｕａｎ，ＬＩＵ Ｃｈｅｎｇｇａｎｇ，ＤＵ Ｚｈｉｈｅｎｇ，ＦＵ Ｊｉｎｇ， ＹＡＮＧ Ｈｏｎｇｙａｎ（Ｓｃｈ００Ｉ ｏｆ Ａｎｉｍａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ａｎｄ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｎｏｒｔｈｅａｓｔ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｈａｒ－ ｂｉｎ １ ５００３０，Ｃｈｉｎａ）
中国环境科学２０１１，３１（４）：５９７～６０２ Ｃｈｉｎａ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ
ＰＣＲ—ＤＧＧＥ技术分析塔式蚯蚓生态滤池微生物群落结构
郭飞宏‘，郑 正 ，张继彪 （１．南京大学环境学院，污染控制与资源化研究国家重点实验室，江苏南京２１００９３；
２．复旦大学环境科学与工程系，上海２００４３３） ・
摘要：利用ＰＣＲ－ＤＧＧＥ技术研究塔式蚯蚓生态滤池微生物群落结构变化，结果表明，微生物的变化与滤池体积大小、水力停留时间和污染 物负荷有关，微生物群落结构在不同滤池层中变化较大．１２个样品泳道中的总细菌的Ｓｈａｎｎｏｎ—Ｗｉｅｎｅｒ多样性指数从０．２５变化到１．２７，一级 滤池微生物多样性指数从０．２９变化到１．０５，二级滤池微生物多样性指数从Ｏ．７５变化到０．９７，三级滤池微生物多样性指数先从Ｏ．８７减少到 Ｏ．２５，后由于葡萄糖的加入增加到１．２７．二级滤池出水中葡萄糖的加入，加强了系统内微生物的活性，从而三级滤池砂石和青石层细菌条带变 亮变多．经过克隆测序和系统发育树分析，塔式蚯蚓生态滤池内的微生物多为单细胞菌属、假单细胞菌属、革兰氏阴性菌属和不可培养杆 菌属，不同细菌条带在不同级滤池内差异变化明显． 关键词：ＰＣＲ－ＤＧＧＥ；蚯蚓生态滤池；微生物群落；指数；菌属 中图分类号：Ｘ７０５ 文献标识码：Ａ 文章编号：１０００—６９２３（２０１１）０４－０５９７—０６
Ｒｅｓｅａｒｃｈ ｏｎ ｍｉｃｒｏｂｅ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ ｉｎ ｔｏｗｅｒ ｅａｒｔｈｗｏｒｍ ｅｃｏｌｏｇｙ・ｆｉｌｔｅｒ ｂｙ ＰＣＲ・ＤＧＧＥ．ＧＵＯ Ｆｅｉ—ｈｏｎｇ ．ＺＨＥＮＧ
Ｚｈｅｎｇ ，ＺＨＡＮＧ Ｊｉ—ｂｉａｏ （１．Ｓｔａｔｅ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆＰｏｌｌｕｔｉｏｎ Ｃｏｎｔｒｏｌ ａｎｄ Ｒｅｓｏｕｒｃｅ Ｒｅｕｓｅ，Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆｔｈｅ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ， Ｎａｎｊｉｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｎａｎｊｉｎｇ ２１００９３，Ｃｈｉｎａ；２．Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｆｕｄａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ， Ｓｈａｎｇｈａｉ ２００４３３，Ｃｈｉｎａ）．Ｃｈｉｎａ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ，２０１１，３１（４）：５９７～６０２ Ａｂｓｔｒａｃｔ￣Ｃｈａｎｇｅ ｏｆ ｍｉｃｒｏｂｅ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ ｉｎ ｔｏｗｅｒ ｅａｒｔｈｗｏｒｍ ｅｃｏｌｏｇｙ—ｆｉｌｔｅｒ ｗａｓ ｓｔｕｄｉｅｄ ｉｎ ｔｈｉｓ ｒｅｓｅａｒｃｈ ｗｉｔｈ ＰＣＲ—ＤＧＧＥ
