第３７卷 第８期２０１８年 ８月环 境 化 学ＥＮＶＩＲＯＮＭＥＮＴＡＬＣＨＥＭＩＳＴＲＹＶｏｌ．３７，Ｎｏ．８
Ａｕｇｕｓｔ２０１８
２０１８年２月２７日收稿（Ｒｅｃｅｉｖｅｄ：Ｆｅｂｒｕａｒｙ２７，２０１８）．
∗国家自然科学基金（４１６７２２４８，４１４７１４０９）和黑龙江国土厅科技项目和辽宁省创新团队（ＬＴ２０１５０１７）资助．
ＳｕｐｐｏｒｔｅｄｂｙｔｈｅＮａｔｉｏｎａｌＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＦｏｕｎｄａｔｉｏｎｏｆＣｈｉｎａ（４１６７２２４８，４１４７１４０９）ａｎｄＳｃｉｅｎｃｅＦｏｕｎｄａｔｉｏｎｏｆＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＬａｎｄａｎｄ
ＲｅｓｏｕｒｃｅｓｏｆＨｅｉｌｏｎｇｊｉａｎｇＰｒｏｖｉｎｃｅ，ＩｎｎｏｖａｔｉｏｎＴｅａｍＦｏｕｎｄａｔｉｏｎｏｆＬｉａｏｎｉｎｇＰｒｏｖｉｎｃｅ（ＬＴ２０１５０１７）．
∗∗通讯联系人，Ｔｅｌ：０２４⁃６２２６７０４１；Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｙａｎｇｘｉｎｙａｏ＠ｈｏｔｍａｉｌ．ｃｏｍ
Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ，Ｔｅｌ：０２４⁃６２２６７０４１；Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｙａｎｇｘｉｎｙａｏ＠ｈｏｔｍａｉｌ．ｃｏｍＤＯＩ：１０．７５２４／ｊ．ｉｓｓｎ．０２５４⁃６１０８．２０１８０２２７０１
赵方园，杨新瑶，陈芳敏，等．抗性ＤＮＡ在水土环境中的迁移归趋与水平转移［Ｊ］．环境化学，２０１８，３７（８）：１８０４⁃１８１９．ＺＨＡＯＦａｎｇｙｕａｎ，ＹＡＮＧＸｉｎｙａｏ，ＣＨＥＮＦａｎｇｍｉｎ，ｅｔａｌ．Ｔｒａｎｓｐｏｒｔ，ｆａｔｅａｎｄｈｏｒｉｚｏｎｔａｌｔｒａｎｓｆｅｒｏｆａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｒｅｓｉｓｔａｎｃｅＤＮＡｉｎｓｏｉｌａｎｄｗａｔｅｒ
ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ［Ｊ］．ＥｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌＣｈｅｍｉｓｔｒｙ，２０１８，３７（８）：１８０４⁃１８１９．
抗性ＤＮＡ在水土环境中的迁移归趋与水平转移∗
赵方园１ 杨新瑶１∗∗ 陈芳敏２ 阮丽丽１ 张海燕３ 杨悦锁１
『锐帮读』宏基因组分析南方水稻田土壤中抗生素抗性基因
Metagenomic profiles of antibiotic resistance genes in paddy
soils from South ChinaFEMS Microbiology Ecology，2016，IF=3.568通讯作者：1）朱永官，中国科学院生态环境科学研究中心，**************.cn2）张彤，香港大学土木工程学系环境生物技术实验室，*************过去的几十年间，数百种抗生素相继被发现或开发，在人类、动物健康及农业发展上起到了极为重要的作用。但随着抗生素的滥用，抗性基因（ARGs）、耐药细菌，甚至像NDM-1这样的超级细菌不断出现，引起了人们的担忧。本研究基于国际抗生素耐药基因数据库（ARDB）、宏基因组测序，首次对南方水稻田土壤中抗生素抗性基因（ARGs）进行了定量检测。材料和方法样品采集：从中国南部（广东雷州-LZ、浙江嘉兴-JX、江西鹰潭-YT、湖南桃源县下两地——TYB、TYG）共五地水稻田收集土壤表层土（0~20cm），共采集10个样品（每地两个重复）。带回实验室后利用MoBio
PowerSoil kit提取土壤基因组DNA，并对土壤的理化性质（PH、含水量、溶解性有机碳等）进行检测。测序平台：Illumina Hiseq 2000测序策略：PE200研究结果1、对比含有25个ARGs的数据库，5份水稻田土壤中共检测出16个ARGs，其中11个ARGs在所有土壤样品中均被检测到。
图1 五个水稻田土壤样品中ARGs的组成与含量2、水稻田土壤中ARGs主要包含3种机制：efflux pump，antibiotic deactivation，cellular protection，其中efflux pump起主要作用（图2）。
图2 抗生素抗性机制3、RDA分析表明，PH可能是与最高的10种ARGs 亚型基因关联最明显的因素（P=0.032）。
科研TrendsMicrobiol.：人类一直在寻找的基因——宿主抗性基因
编译：秋秋糖，编辑：小白、江舜尧。
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导读
随着抗生素耐药性的发展、新的疫情爆发及已被消灭的传染病再次出现，因感染病原微生物而死亡的人数不断增加，不仅造成严重的公共卫生问题，还造成巨大的经济损失。因此，宿主与微生物之间相互作用的机制研究迫在眉睫。目前，基因组学的进步正在推动微生物领域的重大突破，在这篇综述中，作者重点介绍了前沿遗传学和基因组学应用于识别宿主感染细菌后其抵抗力的遗传决定因素的筛查，讨论了如何利用CRISPR/Cas9、自然多样性、蛋白质组学和转录组学等手段来筛选宿主抗性基因，并且总结了这些筛选方法的优点、局限性和创新性与互补性，以便人类继续在后基因组时代取得进展，并朝着更深层次的机制研究和临床应用迈进。
论文ID
原名：These Are the Genes You’re Looking For: Finding
Host Resistance
Genes译名：人类一直在寻找的基因——宿主抗性基因
期刊：Trends in MicrobiologyIF：13.546发表时间：2020.09通讯作者：Dennis C. Ko
通讯作者单位：杜伦大学
内容
1. 关键学科的新兴研究工具
17世纪中期，胡克和范·列文虎克第一次使用显微镜观察到微生物，随后巴斯德、亨勒、科赫和其他人进一步深入微生物研究，分子生物学的出现则彻底改变了微生物的研究方式，而基因组学的进步推动微生物学研究的重大突破。微生物学领域也不断开发新的遗传工具进行遗传学研究，如成簇的规则间隔的短回文重复序列和CRISPR相关蛋白9(CRISPR/Cas9)。这种新技术的出现对微生物研究产生了重要影响。
在这篇综述中，作者主要介绍了前沿遗传学和基因组学筛选如何被应用于识别宿主对细菌感染的抵抗力的研究中。讨论了利用CRISPR/CAS9、自然多样性、蛋白质组学和转录组学来进行抗性基因的筛选，这些方法在宿主-细菌相互作用研究的创新中起到了推动性力量。
环境中抗生素抗性基因的水平传播扩散*
杨凤霞1毛大庆2＊＊罗义3汪庆4母全华4
（1沈阳药科大学生命科学与生物制药学院，沈阳110016；2天津大学环境科学与工程学院，天津300072；3南开大学环境科学
与工程学院教育部环境污染过程与基准重点实验室，天津300071；4南开大学环境科学与工程学院，天津300071）
摘要抗生素抗性基因作为一类新型环境污染物，其在不同环境介质中的传播扩散可能比
抗生素本身的环境危害更大，其中，水平基因转移是抗生素抗性基因传播的重要方式，是造成
抗性基因环境污染日益严重的原因之一．本文系统阐述了抗生素抗性基因在环境中发生水平
转移的主要分子传播元件及其影响因素，这对于正确揭示抗性基因的分子传播机制具有重要
意义．结合多重抗药性的传播扩散机制，探讨了行之有效的遏制抗生素抗性基因传播扩散的
方法和途径，并针对目前的污染现状，对今后有关抗生素抗性基因水平转移的研究重点进行
了展望．
关键词抗生素抗生素抗性基因水平基因转移多重耐药性
文章编号1001－9332（2013）10－2993－10中图分类号X171文献标识码A
Horizontaltransferofantibioticresistancegenesintheenvironment．YANGFeng-xia1，MAODa-qing2，LUOYi3，WANGQing4，MUQuan-hua4（1CollegeofLifeScienceandBiopharmaceutical，ShenyangPharmaceuticalUniversity，Shenyang110016，China；2CollegeofEnvironmentalScienceandEngineering，TianjinUniversity，Tianjin300072，China；3MinistryofEducationKeyLaboratoryofPollutionProcessesandEnvironmentalCriteria，CollegeofEnvironmentalScienceandEngineering，NankaiUniversity，Tianjin300071，China；4CollegeofEnvironmentalScienceandEngineering，Nan-kaiUniversity，Tianjin300071，China）．-Chin．J．Appl．Ecol．，2013，24（10）：2993－3002．
