结核分枝杆菌北京基因型菌株rpoB基因突变特征研究
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耐药结核分枝杆菌耐药相关基因rpoB和katG突变
分析研究的开题报告
题目:耐药结核分枝杆菌耐药相关基因rpoB和katG突变分析研究
背景:
结核病是一种由结核分枝杆菌引起的慢性传染病,全球每年约有
100多万人死于结核病。
耐药结核分枝杆菌是指对治疗结核病常用的药物耐药的分枝杆菌。
目前,耐药结核病已经成为全球公共卫生的重要问题,使得结核病的治疗变得更加困难。
研究目的:
本研究旨在分析耐药结核分枝杆菌中耐药相关基因rpoB和katG的
突变情况,为结核病的诊断和治疗提供理论依据。
研究方法:
采集来自结核病患者的耐药结核分枝杆菌感染样本,通过PCR扩增rpoB和katG基因,并测序分析其序列差异,识别突变位点。
利用统计学方法分析突变位点和耐药性之间的关系。
预期结果:
本研究将分析耐药结核分枝杆菌中rpoB和katG基因的突变情况,
并探讨突变与耐药性之间的关系。
预计可以为结核病的诊断和治疗提供
新的理论依据,有助于制定更有效的治疗方案。
研究意义:
本研究的结果有助于提高对耐药结核分枝杆菌的认识,有利于指导
结核病的早期诊断和有效治疗,对防治结核病具有重要的理论和实践意义。
等位基因特异PCR技术检测结核分支杆菌rpoB基因突变研究朱中元;王海波;陈英兰;谢勇;刘建兵;林丽英【期刊名称】《中国热带医学》【年(卷),期】2002(2)3【摘要】目的建立并评价等位特异多聚酶链反应检测结核分支杆菌耐利福平基因rpoB突变的方法。
方法设计与rpoB基因突变后的碱基配对的引物用于扩增突变基因,建立AS-PCR检测rpoB基因突变的方法,并对58株结核菌进行了检测。
结果AS-PCR检测结核菌耐利福平相关基因rpoB的敏感性为77.3%,特异性达91.7%。
AS-PCR检测rpoB基因,有1628A→T、1657C→T,G和1673C→T突变分别占耐利福平结核菌株的18.2%,22.7%和36.4%。
检测rpoB突变与MIC测定RFP耐药率和PCR-SSCP检测的总符合率分别为86.2%和74.1%。
检测试验可在3~4h内完成。
结论 AS-PCR方法是检测结核菌耐利福平基因突变的敏感和快速方法,可在临床实验室使用并为临床医师提供治疗依据。
【总页数】3页(P295-297)【关键词】rpoB基因突变;等位基因特异聚合酶链反应;结核分支杆菌;耐药性;利福平【作者】朱中元;王海波;陈英兰;谢勇;刘建兵;林丽英【作者单位】海南医学院附属新华医院【正文语种】中文【中图分类】R378.911【相关文献】1.应用PCR-SSCP技术检测痰中结核分枝杆菌katG、rpoB、embB基因突变的研究 [J], 朱敏;李锋;盛国平;范玉美2.PCR-SSCP技术快速检测结核分枝杆菌rpoB基因突变的研究 [J], 闫国蕊;刘国华;刘传玉3.用PCR-SSCP技术检测结核分支杆菌rpoB, KatG, rpsL基因突变 [J], 黄四邑;邱望龙;潘智灵4.PCR-SSCP技术直接快速检测痰标本中结核分支杆菌rpoB,katG,ahpC基因突变的研究 [J], 董德琼;杨渝浩;彭理年;肖瑜5.利用基因芯片技术检测结核分支杆菌耐利福平分离株rpoB基因突变的研究 [J], 梁莉;乐军;李瑶;肖和平;王洪海因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
快速检测结核分枝杆菌γpob基因突变的研究
结核分枝杆菌γpob基因突变检测对于对对抗结核病至关重要。
近年来,随着研究手段的发展,新方法正在不断推出,用于提供快速准确的γpob基因突变检测结果。
本研究旨在检测结核分枝杆菌γpob基因突变,优化快速、准确的测试工具。
首先,我们采用简便易行的DNA提取技术,将分离到的结核分枝杆菌标本灌输于酶标板中,以大肠杆菌染料为目标基因原料,提取DNA样本进行检测。
其次,采用聚合酶链反应(PCR)技术检测γpob基因的突变情况,使用针对阳性参考样本的外显子片段引物设计筛选。
并利用新型高通量测序技术,对PCR扩增的产物进行测序对比分析,进一步识别γpob基因突变情况。
最后,将获得的结果进行统计学分析,以评估PCR技术和高通量测序技术在γpob基因突变检测中的灵敏度和特异性。
总而言之,本研究将通过整合聚合酶链反应(PCR)技术和新型高通量测序技术,提供一种全面而有效的γpob基因突变检测方法,以量化分析结核分枝杆菌γpob基因突变情况,为病原检测提供准确可靠的数据支持。
总之,我们建议以上所提方法可以作为一种快速准确的结核分枝杆菌γpob基因突变检测手段,在今后的研究工作中进一步证明它疾病诊断方面的妥帖性和有效性。
因此,本研究为病原检测提供了一种快速、准确的实验工具,也为进一步研究结核分枝杆菌γpob 基因突变的机制和治疗管理提供了重要的参考信息。
结核分枝杆菌rpoB基因突变的研究杨本付;徐飚;蒋伟利;周佩源;姜庆五【期刊名称】《中国公共卫生》【年(卷),期】2005(21)8【摘要】目的研究农村结核病人中利福平(RIF)耐药结核分枝杆菌(M.TB)临床分离株rpoB基因突变情况,为农村结核病防制提供分子遗传学依据。
方法以标准菌株H37Rv为对照,采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析技术,对来自苏北2个县2001年的145株M.TB分离株(其中敏感株117株,耐RIF或含RIF耐多药株28株)的rpoB基因突变的发生率进行研究。
结果农村RIF耐药或含RIF耐多药M.TB临床分离株中rpoB基因突变的发生率平均为71·4%,所有受试117株敏感株rpoB基因均无突变。
与药敏试验结果对比PCR-SSCP试验的灵敏度为71·4%;其特异度为100%。
结论M.TB耐RIF与rpoB基因突变密切相关,PCR-SSCP方法可检出RIF耐药M.TB的rpoB基因突变,有助于M.TB耐药性的快速检测和耐药性防治。
【总页数】2页(P920-921)【关键词】利福平;耐药性;结核分枝杆菌;聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR—SSCP)【作者】杨本付;徐飚;蒋伟利;周佩源;姜庆五【作者单位】复旦大学公共卫生学院流行病学教研室【正文语种】中文【中图分类】R825.2;S855.2【相关文献】1.2013~2015年陕西地区结核分枝杆菌对利福平耐药性及rpoB基因突变的相关研究 [J], 杨健;王西娣;陈美玲;李妍;王蕊2.结核分枝杆菌rpoB基因突变特征与利福平耐药水平关系的研究 [J], 胡族琼;刘燕文;周文;高璐璐;陈俊宇;谢伟胜;周德旺;曾少芳;钟炳棠3.L型结核分枝杆菌rpoB基因突变与利福平耐药性研究 [J], 刘丹;陈俊林;顾德林;曹文忠;陈晓丽4.结核分枝杆菌耐利福平株rpoB基因突变的研究 [J], 廖小琴;刘梅(通讯作者);王建华;张泓;陈玲(通讯作者)5.浙江省耐利福平结核分枝杆菌rpoB基因突变研究 [J], 卢莺燕;王伟;鲍亚萍;张伟敏;李凫坚因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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结核分枝杆菌rpoB基因突变检测
作者:尹冬梅
来源:《健康必读(上旬刊)》2019年第03期
【摘; 要】目的:通过PCR和测序法检测rpoB基因利福平耐药区域(RRDR)是否存在突变并测定其突变位点。
方法:收集临床分离结核杆菌DNA检测阳性标本,通过PCR技术扩增其rpoB基因,扩增产物测序,并将测序结果提交至NCBI数据库中对比。
结果:30例结核DNA阳性标本中,有25例rpoB 基因PCR 扩增阳性者,有18例测序成功,与PUBMED BLAST中标准菌株rpoB基因对比,存在突变的菌株有10例,没有突变的菌株有8例,突变
率为55.56%,突变核心区域突变率为90.0%。
结论:rpoB 基因PCR 检测在可辅助诊断结核病的同时,对其产物进行测序可直接判别对利福平耐药与否,能给临床提供快速用药指导。
【关键词】结核分枝杆菌;PCR;rpoB基因;利福平耐药
【中图分类号】R454;;;;; 【文献标识码】A;;;;; 【文章编号】1672-3783(2019)03-0047-02。
结核分枝杆菌rpoB基因突变检测的进展
熊国亮
【期刊名称】《实验与检验医学》
【年(卷),期】2004(022)001
【摘要】利福平(rifampin,RFP)是最主要的抗结核药物之一,它在结核病治疗,特别是短程化疗中起着重要作用,抗结核药物也同其它抗生素一样,面临耐药性问题,2000年全国结核病流行病学抽样调查结果显示:结核分枝杆菌对RFP的耐药率为16.6%,耐药问题是结核病化疗中的难题,也是控制结核病面临
【总页数】2页(P62,2)
【作者】熊国亮
【作者单位】330006,南昌,江西省肺科医院检验科
【正文语种】中文
【中图分类】R446.5;R466.61;R378.91+2
【相关文献】
1.结核分枝杆菌基因突变检测方法研究进展 [J], 柳正卫;黄玉;赵雁林
2.套式PCR及测序方法用于痰标本中结核分枝杆菌rpoB耐药基因突变检测 [J], 熊国亮;张慧慧;刘珍琼
3.PCR—SSCP方法用于痰标本中结核分支杆菌rpoB基因突变检测 [J], 何秀云;庄玉辉
4.结核分枝杆菌embB基因突变检测的研究进展 [J], 刘珍琼;熊国亮
5.结核分枝杆菌耐药基因突变检测方法的研究进展 [J], 阳央;侯欢;冯智;李慧;李芳芹
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PCR-反向点杂交法结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB突变发表时间:2016-05-24T14:39:28.370Z 来源:《医师在线》2016年1月第2期作者:黄丽静陈焯彬李崇建[导读] 广西钦州市第一人民医院 PCR-反向点杂交法是一种能直接快速检测结核杆菌基因突变情况的技术,其特异性强,灵敏度高,适合临床快速检测。
(广西钦州市第一人民医院广西钦州535000)【摘要】目的探究对结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB突变以PCR-反向点杂交法检测的效果。
方法设计结核分歧杆菌rpoB基因引物,采用PCR-反向点杂交法对40例结核杆菌临床菌株耐药性进行检测,对照由DNA测序法检测的标准结核分歧杆菌(H37Rv)rpoB基因,确定rpoB基因的变异情况,对PCR-反向点杂交法的灵敏度和准确性作出评价。
结果 40株临床菌株中有11株利福平敏感株的基因序列与对照的H37Rv相同,剩下的29株耐药株中检测到变异基因27株,其特异性为100%,阳性率为93.1%。
结论 rpoB基因本身高度保守,但由于rpoB 基因突变导致结核分枝杆菌对利福平耐药。
本研究使用PCR-反向点杂交法针对rpoB基因高突变区设计引物,此方法快速、简便、准确, 能有效监测临床标本中结核分枝杆菌, 对临床早期诊治结核病有极大帮助。
【关键词】PCR-反向点杂交法;rpoB 基因;利福平;结核分歧杆菌结核病是一种由分歧杆菌导致的常见可致命传染病,它不仅能感染并破坏人体对淋巴系统,还能对人体神经系统、泌尿系统、循环系统、皮肤、骨骼、关节等其他部位造成伤害,表现为发热、盗汗、呼吸障碍、咳嗽、咯血、胸痛等,因此,必须及时对结核病进行诊治,防止其对机体造成更大伤害。
利福平(RFP)是临床上治疗结合病的常用药物,但由于结核杆菌常常对其具有耐药性且各地区耐药情况不同,普通的结核杆菌培养耗时较长、过程繁琐,已经不足以满足及时诊治的需求。
PCR-反向点杂交法是一种能直接快速检测结核杆菌基因突变情况的技术,其特异性强,灵敏度高,适合临床快速检测。