学习R语言,一篇文章让你从懵圈到入门
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学习R语言，一篇文章让你从懵圈到入门
在昨天本文的推送中，由于小编失误，将本篇文章的原文链接标注错误，给原出处雪晴数据网和广大读者带来不便，敬请谅解，特此更正：
本文编译：雪晴数据网原文参考：https:///rstudio/RStartHere本文链接：/cms/article/198
在实际工作中，每个数据科学项目各不相同，但基本都遵循一定的通用流程。具体如下：
数据科学工作流程：
1.数据导入2.数据整理3.反复理解数据
数据可视化
数据转换统计建模4.作出推断（比如预测）
5.沟通交流
6.自动化分析
7.程序开发下面列出每个步骤最有用的一些R包：
数据导入
以下R包主要用于数据导入和保存数据feather：一种快速，轻量级的文件格式。在R和python上都可使用
readr：实现表格数据的快速导入。中文介绍可参考这里
readxl：读取Microsoft Excel电子表格数据 openxlsx：读取Microsoft Excel电子表格数据
googlesheets：读取google电子表格数据
haven：读取SAS，SPSS和Stata统计软件格式的数据
httr：从网站开放的API中读取数据
rvest：网页数据抓取包
xml2：读取HTML和XML格式数据
webreadr：读取常见的Web日志格式数据
DBI：数据库管理系统通用接口包
RMySQL：用于连接MySQL数据库的R包RPostgres：用于连接PostgreSQL数据库的R包bigrquery用于连接Google
BigQuery的R包
PivotalR：用于读取Pivitol（Greenplum）和HAWQ数据库中的数据
dplyr：提供了一个访问常见数据库的接口
data.table：data.table包的fread()函数可以快速读取大数据集
git2r：用于访问git仓库
数据整理
以下R包主要用于数据整理，以便于你后续建模分析：tidyr：用于整理表格数据的布局
dplyr：用于将多个数据表连接成一个整齐的数据集
purrr：函数式编程工具，在做数据整理时非常有用。
broom：用于将统计模型的结果整理成数据框形式 zoo：定义了一个名zoo的S3类型对象，用于描述规则的和不规则的有序的时间序列数据。
数据可视化
以下R包用于数据可视化：ggplot2及其扩展：ggplot2包提供了一个强大的绘图系统，并实现了以下扩展
ggthemes：提供扩展的图形风格主题ggmap：提供Google
Maps，Open Street Maps等流行的在线地图服务模块ggiraph：绘制交互式的ggplot图形
ggstance：实现常见图形的横向版本
GGally：绘制散点图矩阵
ggalt：添加额外的坐标轴，geoms等
ggforce：添加额外geoms等
ggrepel：用于避免图形标签重叠
ggraph：用于绘制网络状、树状等特定形状的图形
ggpmisc：光生物学相关扩展
geomnet：绘制网络状图形
ggExtra：绘制图形的边界直方图
gganimate：绘制动画图
plotROC：绘制交互式ROC曲线图
ggspectra：绘制光谱图
ggnetwork：网络状图形的geoms
ggradar：绘制雷达图 ggTimeSeries：时间序列数据可视化
ggtree：树图可视化
ggseas：季节调整工具lattice：生成栅栏图
rgl：交互式3D绘图
ggvis：交互式图表多功能系统
htmlwidgets：一个专为R语言打造的可视化JS库leaflet：绘制交互式地图
dygraphs：绘制交互式时间序列图
plotly：交互式绘图包，中文介绍详见这里
rbokeh：用于创建交互式图表和地图，中文介绍
Highcharter：绘制交互式Highcharts图
visNetwork：绘制交互式网状图
networkD3：绘制交互式网状图
d3heatmap：绘制交互式热力图，中文介绍
DT：用于创建交互式表格threejs：绘制交互式3d图形和地球仪 -rglwidget：绘制交互式3d图形DiagrammeR：绘制交互式图表
MetricsGraphics：绘制交互式MetricsGraphics图rCharts：提供了对多个javascript数据可视化库（highcharts/nvd3/polychart）的R封装。
coefplot：可视化统计模型结果
quantmod：可视化金融图表 colorspace：基于HSL的调色板
viridis：Matplotlib viridis调色板
munsell：Munsell调色板
RColorBrewer：图形调色板
igraph：用于网络分析和可视化
latticeExtra：lattice绘图系统扩展包
sp：空间数据工具
数据转换
以下R包用于将数据转换为新的数据类型dplyr：一个用于高效数据清理的R包。视频学习课程
magrittr：一个高效的管道操作工具包。
tibble：高效的显示表格数据的结构
stringr：一个字符串处理工具集
lubridate：用于处理日期时间数据
xts：xts是对时间序列数据(zoo)的一种扩展实现，提供了时间序列的操作接口。
data.table：用于快速处理大数据集
vtreat：一个对预测模型进行变量预处理的工具
stringi：一个快速字符串处理工具
Matrix：著名的稀疏矩阵包
统计建模与推断
下述R包是统计建模最常用的几个R包，其中的一些R包适用于多个主题。
car：提供了大量的增强版的拟合和评价回归模型的函数。
Hmisc：提供各种用于数据分析的函数
multcomp：参数模型中的常见线性假设的同时检验和置信区间计算，包括线性、广义线性、线性混合效应和生存模型。
pbkrtest用于线性混合效应模型的参数Bootstrap检验
MatrixModels：用于稠密矩阵和稀疏矩阵建模
mvtnorm：用于计算多元正态分布和t分布的概率，分位数，随机偏差等
SparseM：用于稀疏矩阵的基本线性代数运算
lme4：利用C++矩阵库 Eigen进行线性混合效应模型的计算。
broom：将统计模型结果整理成数据框形式
caret：一个用于解决分类和回归问题的数据训练综合工具包
glmnet：通过极大惩罚似然来拟合广义线性模型
gbm：用于实现随机梯度提升算法
xgboost：全称是eXtreme Gradient Boosting。是Gradient
Boosting Machine的一个c++实现。目前已制作了xgboost工具的R语言接口。详见统计之都的一篇介绍
randomForest：提供了用随机森林做回归和分类的函数
ranger：用于随机森林算法的快速实现
h2o：H2O是0xdata的旗舰产品，是一款核心数据分析平台。它的一部分是由R语言编写的，另一部分是由Java和Python语言编写的。用户可以部署H2O的R程序安装包，之后就可以在R语言环境下运行了。
ROCR：通过绘图来可视化分类器的综合性能。
pROC：用于可视化，平滑和对比ROC曲线
沟通交流
以下R包用于实现数据科学结果的自动化报告，以便于你跟人们进行沟通交流。rmarkdown ：用于创建可重复性报告和动态文档
knitr：用于在PDF和HTML文档中嵌入R代码块
flexdashboard：基于rmarkdown，可以轻松的创建仪表盘
bookdown：以R Markdown为基础，用于创作书籍和长篇文档
rticles：提供了一套R Markdown模板
tufte：用于实现Tufte讲义风格的R Markdown模板
DT：用于创建交互式的数据表
pixiedust：用于自定义数据表的输出
xtable：用于自定义数据表的输出
highr：用于实现R代码的LaTeX或HTML格式输出
formatR：通过tidy_source函数格式化R代码的输出
yaml：用于实现R数据与YAML格式数据之间的通信。
自动化分析
以下R包用于创建自动化分析结果的数据科学产品：shiny：一个使用R语言开发交互式web应用程序的工具。中文教程shinydashboard：用于创建交互式仪表盘
shinythemes：给出了Shiny应用程序的常用风格主题
shinyAce：为Shiny应用程序开发者提供Ace代码编辑器。
shinyjs：用于在Shiny应用程序中执行常见的JavaScript操作
miniUI：提供了一个UI小部件，用于在R命令行中集成交互式应用程序
shinyapps.io：为创建的Shiny应用程序提供托管服务
Shiny Server Open Source：为Shiny应用程序提供开源免费的服务器
Shiny Server Pro：为企业级用户提供一个Shiny应用程序服务器rsconnect：用于将Shiny应用程序部署到shinyapps.io
plumber：用于将R代码转化为一个web API
rmarkdown：用于创建可重复性报告和动态文档
rstudioapi：用于安全地访问RStudio IDE的API
程序开发
以下这些包主要用于开发自定义的R包：RStudio Desktop
IDE：R的IDE。大家都懂，不用解释。
RStudio Server Open Source：开源免费的RStudio服务器
RStudio Server Professional：商业版RStudio服务器
devtools：一个让开发R包变得简单的工具集
packrat：创建项目的特定库，用于处理包的版本问题，增强
