酵母双杂交实验

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酵母双杂交相关实验方法

1、酵母总DNA的提取方法(蜗牛酶法)

1、酵母质粒提取试剂

Buffer I 0.9 mol/L Sorbitol

0.1mol/L EDTA

Buffer II 50mM/L Tris

20mM/L EDTA

Buffer III 10mM/L Tris

1Mm/L EDTA

2、操作步骤:

(1) 收集新鲜菌体重加入150μl buffer I,25μl 蜗牛酶

(30mg/ml)。.

(2) 37℃水浴1h。

(3) 10000rpm离心10min,去上清,沉淀中加入250μl buffer II。

(4) 加入25μl 10% SDS,65℃水浴30min,每间隔5min中震荡一

次。

(5) 加入25μl 5mol/L 醋酸钾,冰浴60min。

(6) 4℃12000rpm离心15min,取上清。

(7) 在上清中加入2-3倍体积的无水乙醇,混匀静置于-20℃,1小

时以上。

(8) 取出,4℃12000rpm离心15min ,弃上清。

(9) 加入150μl buffer III 溶解沉淀,用等体积苯酚/氯仿/异戊醇抽

提。

(10) 12000rpm离心15min。

(11) 将上清转入新的离心管中,加入6μl(10U/μl)RNA酶 37℃放

置30min。

(12) 取上清,加入等体积的异丙醇。

(13) 4℃静置10min,1小时以上或过夜。

(14) 4℃10000rpm 离心5min。

(15) 弃上清,并把沉淀溶于10μl buffer III 中。

2、 小规模酵母转化

1、酵母转化试剂:

转化用试剂除PEG采用过滤灭菌外,其它试剂均需高温高压灭菌,条件同普通培养基灭菌。

(1) M 醋酸锂(Lithium Acetate)

(2) 聚乙二醇(Polyethylene glycol,PEG)分子量3350,浓度 50%

(w/v)

(3) PEG/LiAc 溶液的配制(现用现配)

800μl 50%PEG

100μl 10×TE

100μl 10×LiAc

1ml 总体积

(4) 1.1×TE/LiAc溶液(现用现配) 11ml 10×TE

(5) 11ml 10×LiAc

(6) 78ml ddH20

2、操作步骤:

(1) 第一天下午3点将酵母接种于5ml YPDA中,30℃摇菌。

(2) 第二天上午10点测OD600,转2.5×108个于50ml YPAD中。

(3) 下午3:00收集菌体。

(4) 室温离心,700g,5min。

(5) 弃上清,用60ml 灭菌ddH20重悬细胞。

(6) 室温离心,700g,5min。

(7) 弃上清,用3ml 1.1×TE/LiAc 重悬细胞。

(8) 1.5ml/管分装细胞。

(9) 12000rpm离心15-30s。

(10) 弃上清,每管加入600μl 1.1×TE/LiAc重悬细胞,100μl分

装到1.5ml管中。

(11) 冰上准备转化混合物(与收集菌体同步进行):

PEG3350 (50%) 240μl

LiAc (1.0M) 36μl

Carrier DNA (10mg/ml) 10μl

质粒 2μl(总量大于100ng)

ddH20 32μl

总体积 360μl

(12) 12000rpm离心15-30s除去1.5ml离心管中的液体,将转化

混合物加入并与感受态细胞剧烈混匀。

(13) 30℃温浴30min,每15min混合一次。

(14) 加入20μl DMSO,混合,然后在42℃水浴15min,每5min混合

一次。

(15) 12000rpm离心30s,吸弃转化混合物。

(16) 加入1ml YPDA重悬细胞。

(17) 30℃温浴90min。

(18) 12000rpm离心15s

(19) 弃上清,用1ml NaCl(0.9%)重悬细胞。

(20) 稀释100-1000倍涂选择性平板(SD/-Trp或SD/-T-L,SD/-

T-L-H等)。

(21) 37℃培养2-3天可见长出的菌落。

3、β-半乳糖苷酶活性检测

1、 β-半乳糖苷酶活性检测试剂:

(1) Z buffer

Na2HPO4·12H2O 21.5g/L

NaH2PO4·2H20 6.22g/L

KCl 0.75g/L

MgCl2.6H20 0.226g/L

PH 7.0,高压灭菌

(2) X-gal

溶解X-gal 于DMF中,浓度20mg/ml。

(3) Z buffer/X-gal 溶液

Z buffer 100ml

β-巯基乙醇 0.27ml

X-gal 1.67ml

2、操作步骤:

(1) 用牙签挑取三缺大平板上长出的单菌落,划线到到新的二缺

和三缺平板(SD /-His/-Leu/-Trp)的平板上,同时每个板均涂上正

负对照(正对照含pGADT7-ReT和pGBKT7-53质粒的酵母,负对照:pGADT7-ReT和pGBKT7-Lam质粒的酵母),30℃培

养,2d。

(2) 三缺平板放于4℃保存,二缺用于X-gal显色。

(3) 用牙签将菌挑二缺平板上的菌体涂到滤纸上,液氮上漂浮

30s,再37℃保温1-2min,重复液氮30s

(4) 取出置于室温,晾干后将滤纸放于经底物溶液(Z buffer,

0.1% X-gal)润湿的普通滤纸上,避光于37℃,温浴4h,观察滤

纸颜色的变化并记录。