酵母双杂交实验
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酵母双杂交相关实验方法
1、酵母总DNA的提取方法(蜗牛酶法)
1、酵母质粒提取试剂
Buffer I 0.9 mol/L Sorbitol
0.1mol/L EDTA
Buffer II 50mM/L Tris
20mM/L EDTA
Buffer III 10mM/L Tris
1Mm/L EDTA
2、操作步骤:
(1) 收集新鲜菌体重加入150μl buffer I,25μl 蜗牛酶
(30mg/ml)。.
(2) 37℃水浴1h。
(3) 10000rpm离心10min,去上清,沉淀中加入250μl buffer II。
(4) 加入25μl 10% SDS,65℃水浴30min,每间隔5min中震荡一
次。
(5) 加入25μl 5mol/L 醋酸钾,冰浴60min。
(6) 4℃12000rpm离心15min,取上清。
(7) 在上清中加入2-3倍体积的无水乙醇,混匀静置于-20℃,1小
时以上。
(8) 取出,4℃12000rpm离心15min ,弃上清。
(9) 加入150μl buffer III 溶解沉淀,用等体积苯酚/氯仿/异戊醇抽
提。
(10) 12000rpm离心15min。
(11) 将上清转入新的离心管中,加入6μl(10U/μl)RNA酶 37℃放
置30min。
(12) 取上清,加入等体积的异丙醇。
(13) 4℃静置10min,1小时以上或过夜。
(14) 4℃10000rpm 离心5min。
(15) 弃上清,并把沉淀溶于10μl buffer III 中。
2、 小规模酵母转化
1、酵母转化试剂:
转化用试剂除PEG采用过滤灭菌外,其它试剂均需高温高压灭菌,条件同普通培养基灭菌。
(1) M 醋酸锂(Lithium Acetate)
(2) 聚乙二醇(Polyethylene glycol,PEG)分子量3350,浓度 50%
(w/v)
(3) PEG/LiAc 溶液的配制(现用现配)
800μl 50%PEG
100μl 10×TE
100μl 10×LiAc
1ml 总体积
(4) 1.1×TE/LiAc溶液(现用现配) 11ml 10×TE
(5) 11ml 10×LiAc
(6) 78ml ddH20
2、操作步骤:
(1) 第一天下午3点将酵母接种于5ml YPDA中,30℃摇菌。
(2) 第二天上午10点测OD600,转2.5×108个于50ml YPAD中。
(3) 下午3:00收集菌体。
(4) 室温离心,700g,5min。
(5) 弃上清,用60ml 灭菌ddH20重悬细胞。
(6) 室温离心,700g,5min。
(7) 弃上清,用3ml 1.1×TE/LiAc 重悬细胞。
(8) 1.5ml/管分装细胞。
(9) 12000rpm离心15-30s。
(10) 弃上清,每管加入600μl 1.1×TE/LiAc重悬细胞,100μl分
装到1.5ml管中。
(11) 冰上准备转化混合物(与收集菌体同步进行):
PEG3350 (50%) 240μl
LiAc (1.0M) 36μl
Carrier DNA (10mg/ml) 10μl
质粒 2μl(总量大于100ng)
ddH20 32μl
总体积 360μl
(12) 12000rpm离心15-30s除去1.5ml离心管中的液体,将转化
混合物加入并与感受态细胞剧烈混匀。
(13) 30℃温浴30min,每15min混合一次。
(14) 加入20μl DMSO,混合,然后在42℃水浴15min,每5min混合
一次。
(15) 12000rpm离心30s,吸弃转化混合物。
(16) 加入1ml YPDA重悬细胞。
(17) 30℃温浴90min。
(18) 12000rpm离心15s
(19) 弃上清,用1ml NaCl(0.9%)重悬细胞。
(20) 稀释100-1000倍涂选择性平板(SD/-Trp或SD/-T-L,SD/-
T-L-H等)。
(21) 37℃培养2-3天可见长出的菌落。
3、β-半乳糖苷酶活性检测
1、 β-半乳糖苷酶活性检测试剂:
(1) Z buffer
Na2HPO4·12H2O 21.5g/L
NaH2PO4·2H20 6.22g/L
KCl 0.75g/L
MgCl2.6H20 0.226g/L
PH 7.0,高压灭菌
(2) X-gal
溶解X-gal 于DMF中,浓度20mg/ml。
(3) Z buffer/X-gal 溶液
Z buffer 100ml
β-巯基乙醇 0.27ml
X-gal 1.67ml
2、操作步骤:
(1) 用牙签挑取三缺大平板上长出的单菌落,划线到到新的二缺
和三缺平板(SD /-His/-Leu/-Trp)的平板上,同时每个板均涂上正
负对照(正对照含pGADT7-ReT和pGBKT7-53质粒的酵母,负对照:pGADT7-ReT和pGBKT7-Lam质粒的酵母),30℃培
养,2d。
(2) 三缺平板放于4℃保存,二缺用于X-gal显色。
(3) 用牙签将菌挑二缺平板上的菌体涂到滤纸上,液氮上漂浮
30s,再37℃保温1-2min,重复液氮30s
(4) 取出置于室温,晾干后将滤纸放于经底物溶液(Z buffer,
0.1% X-gal)润湿的普通滤纸上,避光于37℃,温浴4h,观察滤
纸颜色的变化并记录。