应用图像融合的fMRI数据处理方法的研究
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176 2010.46(4) Computer Engineering and Applications计算机工程与应用 应用图像融合的fMRI数据处理方法的研究 赵 晶,李海云 ZHAO Jing,LI Hai—yun
首都医科大学生物医学工程学院,北京100069 Department of Biomedical Engineering,Capital Medical University,Beijing 100069,China E—mail:jing.zhao7@gmail.COrn
ZHAO Jing,LI Hai-yun.FMRI data processing approach based on image fusion.Computer Engineering and Applications, 2010.46(4):176—179.
Abstract:A new data processing approach of fMR1 which combines Statistical Parametric Mapping(SPM),Independent Compo— nent Analysis(ICA)and image fusion is presented.And it has good performance in extracting the brain activation patterns。Firstly, the data are obtained from the experiment of block design in various hand power forces,which associate with motor cortex.Then the preprocessing stage proceeds and the brain functional information is gotten from the SPM and ICA methods separately.Final— ly,the new image fusion method based upon the Principal Component Analysis(PCA)is used to process the results from the two methods mentioned above.The new approach is a way to localize the brain functional area effectively and complementary in two typical systems. Key words:functional Magnetic Resonance Imaging(fMRI);motor cortex;Statistical Parametric Mapping(SPM);Independent Corn- ponent Analysis(ICA);image fusion
摘要:提出了一种新的fMRI数据处理方法,融合了统计参数图(SPM)、独立成分分析(ICA)所提取的特征信息,实现脑功能激活 区的准确提取。首先通过时段设计实验获取了反应不同握力条件下手运动相关皮层活动的fMRI数据,并且进行相应的预处理;然 后采用SPM和ICA方法分别提取脑功能信息;研究了一种基于主成分分析的图像融合算法。最后,应用图像融合算法对SPM和 ICA方法分别提取的脑功能信息进行融合。结果表明,该方法弥补了SPM和ICA两种方式的不足,是一种进行功能区定位更加有 效的方法。 关键词:功能磁共振成像(fMRI);运动皮层;统计参数图(SPM);独立成分分析(ICA);图像融合 DOI:10.3778 ̄.issn.1002—8331.2010.04.056 文章编号:1002—8331(2010)04—0176—04 文献标识码:A 中图分类号:TP391.41
1引言 功能磁共振成像(functional Magnetic Resonance Imaging, mRI)是根据血氧依赖水平(Blood Oxygenation Level Depen— dent,BOLD)的对比水平[‘进行成像,由于其无创性、无辐射、有 效地将功能与解剖相结合的优点广泛地应用于脑科学研究领 域。但是,fMRI信号在采集过程中易受到磁场、受试者头动、心 跳等因素的影响,其信噪比很低,准确提取fMRI数据的特征信 息是目前研究热点。 近些年,提出了不少fMRI数据处理方法,其中包括统计参 数图(Statistical Parametric Mapping,SPM)、相关性分析(coⅡe— lation)、马尔科夫随机场模型(Markov Random Field Models)、 主成分分析(Principle Component Analysis,PCA)、独立成分分 析(Independent Component Aanalysis,ICA)等。 统计参数图(SPM)是单一变量的数据处理方法,需要运用 先验知识,建立广义线性模(General Linear Model,GLM),得到 显著性水平下的激活图 。相关性分析、马尔科夫随机场模型则 都需要参考函数预先建立模型,而当所执行任务的机制未知 时,以上基于假设驱动的方法稍显不足。主成分分析(PCA)[31和 独立成分分析(ICA)14]是基于数据驱动的分析方法,根据数据自 身的特性,将观测信号分解成若干独立源信号和其相应的激活 时间曲线。不少学者,提出了改进的方法,如Ze WangI 使用支 持向量机的方法,获取数据驱动的参考函数,将其引入GLM的 统计过程中,在敏感性方面优于传统SPM。D.Hu 则将ICA产 生的CTR成分作为新的函数,取代传统的血流动力学方程,将 SPM和ICA进行结合,从函数和模型方面进行了改善。 ICA算法中,Infomax和Fixed—point算法是其中的经典算
基金项目:国家自然科学基金(the National Natural Science Foundation of China under Grant No.30670576);北京市教委科技发展汁划重点项目 (the Scientific Research Key Program of Beijing Municipal Commission of Education under Grant No.kz200810025011);北京市中青年 骨干教师培养项目(Beijing Municipal Middle—aged Backbone Teacher Training Program)。 作者简介:赵晶(1985一),硕士研究生,主要研究方向:fMRI数据处理方法;李海云(1967一),通讯作者,教授,博士生导师,主要研究方向:医学影像 处理与分析。 收稿日期:2009—08—05 修回日期:2009—09—22 赵 晶,李海云:应用图像融合的fMRI数据处理方法的研究 2010.46(4) 177 法,张伟伟[71等人运用信息论方法决定信号源数量,进而采取 Fixed—point算法,得到独立成分。GroupICA理论在数据处理方 面也具有较大优势,弥补了传统ICA仅处理单个被试数据的缺 点,Xia WuN等人分析语义任务fMRI数据,CTR、 兀R成分有 很好的体现,并通过其建立功能网络。 提出了一种新的fMRI特征信息提取方法,首先通过时段 设计实验获取了相关大脑皮层的fMRI功能数据,然后采用 SPM和ICA方法分别提取脑功能信息;研究了一种基于主成 分分析的图像融合算法。最后,应用图像融合算法对SPM和 ICA方法分别提取的脑功能信息进行融合,实现了手握力运动 的脑功能区的准确定位。 2实验设计 实验根据所采用的橡胶握力圈分为三组进行,力的大小经 测试分别为140 N、110 N、75 N。受试者均在清醒状态下完成实 验,平躺放松,根据屏幕提示以1次每秒的频率右手抓握橡胶 圈。实验采用组块设计(block design),每组实验分为6个组块 (block),每一组块包括16 S任务和16 S控制过程。 实验对象:14名健康受试者参加实验,其中男7例,女7 例;年龄23 32岁,平均年龄25.6岁,均为右利手,无神经系统 疾病,矫正后视力正常。 3影像数据的获取 磁共振扫描采用Siemens公司3.OT磁共振成像系统,fMRI 成像采用回波平面成像序列(Echo Planar Imaging,EPI)。轴状 位扫描。参数如下:TR(Repetition time)=2 S,他(Echo time)= 30 ms,反转角:用 Angle=90。,层厚=3 mm,层间距=1 mm,视 野FOV(Field of View)=24 cm,分辨率64x64,层数32,每一个 被试者,功能图像采集时间约为10 min。 高分辨率T1结构像参数如下:矢状位扫描,TR=2 s,阳= 2.13 ms,用 Angle=9。,层厚1 mm,FOV=256 mm,分辨率256x 256,176层。 4数据预处理 采用SPM5(Statistical Parametric Mapping,Welcome De— payment of Cognitive Neurology,London,UK)软件包。首先消 除获取时间不同对图像的影响(slice timing),其次头动校正 (realign),然后将图像以Talairach空间【91为标准进行空间标准 化(normalize),最后将图像与高斯函数(FWHM 8 am)进行平 滑(smooth),得到预处理后的图像。 5统计参数图 SPM原理【 呵以用线性方程表示为: X=Gfl+e (1) x为由元素‰构成的观测信号,每一个行向量代表一次扫描, 列向量表示对应某一个像素的所有扫描后的观测值。G为设计 矩阵,卢为参数矩阵,e则为正态分布的误差矩阵。 SPM需要将实验设计与传统血流动力学方程(Hemody— namic Response Function,HRF)卷积得到设计矩阵,根据 、G 得到参数卢的估计值,最后t检验评价出每一个像素任务状态 是否与控制状态的脑激活程度产生较大差异,根据差异决定了 像素是否被激活。 通过对每个被试者建立广义线性模型,确定每个被试者执 行不同任务的激活区。将不同任务通过单样本检验one sample t-test),分别显示结果,显著性水平p<0.O5(FwE)。结果 通过MNI坐标转化成Talairach坐标,采用Talairach client软 件进行解剖定位。