小分子物质与蛋白质相互作用研究方法的现状与进展
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蛋白( S ) B A 的体外相互作用 。 苯甲酸钠的加入使得 B A紫外吸收光谱中 20l 的峰值逐渐降低 , S 1 m处 l 峰位 红移 , 可能 是苯 甲酸钠使 B A主链 构象 发生 变化 , 旋结 构变 松散 。魏 晓芳 等州 这 S 螺 利用 紫外 光 谱 研究 了
p .~ 1 H23 1. 3的范 围 内 B A分子 中芳香 氨基酸残 基微 环境 的变化 , S 结果显 示 , 碱诱 导蛋 白质分 子 空 问构 象
小分子物 质 与蛋 白质相 互作用研 究 方法的 现 状 与进 展
唐 江 宏 , 宁 , 国 华 , 德 建 连 张 赵
( 江苏技 术师范学院 化学与环境 工程学院 , 苏 常州 2 3 0 ) 江 1 0 1
摘
要: 小分子 与蛋白质相 互作用 的研究 是化 学生 物学的重要研究 内容。蛋白质 能 与许 多内源性 和外 源性小分
第 l 年 2 期 1 2 16卷第1 2月 00
江 苏 技 术 师 范 学 院 学 报
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Vo .6. . 2 J1 No 1 De . 201 c, 0
体分子与蛋 白质相互作用的信息。利用这些方法可以获得关于蛋 白质与小分子配体作用的结合常数、 结 合 位点 数 、 合 位置 、 结 作用 力 类 型 以及 在 客体 小 分子 作用 下蛋 白质结 构与 功 能的变 化 等信 息 。 文重 点 阐 本 述 紫外 可 见光 谱 、 光 光 谱 法 、 立 叶 变换 红外 光 谱 和 分子 模 拟 法在 小 分 子 与蛋 白质相 互 作 用 方 面 的应 荧 傅 用 和研 究进 展 。
0 引 言
蛋 白质 能与 内源物 质 , 如胆 红 素 、 肪 酸 、 脂 维生 素和 激素 等结 合 , 也能 与许 多外 源 物 质 , 如药 物 、 料 、 染
表面活性剂、 离子和量子点等配体作用。这些物质与蛋 白质结合生成超分子复合物之后 , 体系的光谱 、 电 化学等性质发生改变 , 从而提供蛋白质浓度或结构方面的信息。小分子与蛋 白质相互作用的研究是化学 生物学 的重要 内容 , 能为生命科学、 化学及 临床药理学提供丰富的信息 。 常用的研究方法包括紫外一可见
充 分伸 展 , 将更 多 的疏水性 氨基 酸残基暴 露于溶 剂 中。借 助 于吸 收光谱 也可 辅助判 断小 分子 对蛋 白质 荧
光 的猝灭 机理圈 利用 紫外 可见吸 收光度法 能够计 算小分 子与蛋 白质作用 的结 合常数 和结合 位点 数 。 嫒 。 刘
等同 用分光 光 度法 的原理 , 应 假定 三七 皂甙 的有效成 分 与 B A的结合 产物 在测 定 的波长 没有 吸收 的情 况 S
谱 中 ,8 m处 的 峰是 酪 氨 酸 、 20n 色氨 酸 残基 中共轭 双键 的吸 收 峰 , 丙 氨 酸 的吸收 峰 出现在 27n 苯 5 m波 长 附 近 ,1 m处 的 峰是 肽键 的强 吸 收峰 f 20n l 】 。一般 来 说 , 基酸 残基 的微 环境 由蛋 白质 分子 的构象 决 定 , 氨 构 象改 变 , 环境 改变 , 微 生色基 团的 紫外 吸收 光谱 随 之发 生改 变 。 若小 分子 配 体与 生物 大分 子 结合 前后 的吸
吸 收光 谱 、 光 光 谱 法 、 荧 圆二 色 谱 法 、 里 叶变 换 红外 光 谱法 、 衡透 析 法 、 相 色谱 法 、 傅 平 液 电化 学方 法 、 一 x 晶体 衍射 等 , 着实 验技 术 的 日臻 完善 , 随 质谱 、 核磁 共振 、 细管 电泳 、 光拉 曼 散射 等 方法 的应 用也 日益 毛 激 增 多。 此外 , 计算 机 对接 技 术 的分 子模 拟也 是 近年 来发 展较 快 的一 门新 型学 科 , 以在 分子 水平 上研 究 客 可
下, 推导 出用吸 光度表 示 的 Lnw ae- uk双 倒数方 程 , ie evrB r 利用作 图 的方法 求 出了三七 总 皂甙 的两个 有效
成分与 B A的结合常数。魏永巨等啦 用溶液平衡的处理方法, S 用吸光度表示溶液中组分的浓度 , 导出了 与 Sacad方程 完全 相 同的表达形 式 。 ct r h
1 紫 外一 可 见 吸 收 光 谱 法
在 组 成 蛋 白质 常 见 的 2 0种 仪一氨 基 酸 中 只有 芳 香 族 氨 基 酸 如色 氨 酸(r)酪氨 酸(y)苯丙 氨 酸 Tp、 Tr、
(h) Pe 和含硫氨基酸在 2 0 30n 3~ 1 m波长范 围内有吸收 , 其紫外吸收 , 主要来源 于这些氨基酸的侧链基 团 (r Tp的吲 哚基 、 y 的 酚基 、h Tr P e的苯基 ) 对光 的吸收 , 此外 肽 键对 光也 有 强烈 吸收 。 在蛋 白质 的紫外 吸 收光
收 稿 日期 : 0 0 0 — 4 2 1— 9 0 作者简介 : 唐江宏( 9 3 )男 , 16 一 , 河南新郑人 , 教授 , 博士 , 主要研究方 向为光谱分析及生物分析 。
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江 苏 技 术 师 范 学 院 学 报
第 1 6卷
收光谱 有一 定差 异时 , 明蛋 白质 的构 象发生 了变化嘲 说 。王 亚俐 等听 0 用光谱 法研 究 了苯 甲酸钠 与 牛血清
子物质结合形成超分子复合物 。 通过实验方法可以获得 蛋白质与小分 子配体作用 的结合常数 、 结合位点数、 结合
位置、 作用力类 型以及在客体小分子作用下蛋 自质结构与功能的变化等信息。简述紫外可见光谱 、 荧光光谱法 、
傅立叶变换红外光谱和分子模拟法及其他分析方法在小分子与蛋 白质相互作用方面的应用和研究进展 。 关键词 : 白质 ; 蛋 小分子 ; 相互作用 ; 方法综述 中图分 类号 : 6 97 02. 3 文 献标 识码: A 文章编号 :1 7 — 5 2 2 1 )2 0 0 — 7 3 4 8 2 (0 0 1— 0 1 0