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胃腺癌预后基因的筛选和分析高丽娟;曹夏【摘要】目的通过对TCGA数据库中胃腺癌测序数据进行分析,找出预后相关的基因.方法通过R语言edgeR包筛选差异基因(FC>2,P<0.05),经DAVID在线软件对差异基因进行GO和pathway富集分析后(FDR<0.01),利用R语言sur-vival包对预后相关基因进行Cox回归分析,筛选出与预后相关的基因,结合Oncomine数据库将这些基因与其他胃癌研究中的表达情况进行结果比较.结果得到1634个差异基因,其中上调差异基因857个,下调差异基因777个,GO分析发现差异基因主要集中于消化吸收(GO:0007586),细胞外基质蛋白(GO:0005578),激素活性(GO:0005179),角质化包膜(GO:0001533),结构分子活性(GO:0005198),表皮发育(GO:0008544),蛋白质水解(GO:0006508),肽交联(GO:0018149)等生物过程,Pathway分析差异基因主要涉及细胞色素P450对有害物质的代谢(hsa00980),化学致癌(hsa05204),脂肪消化与吸收(hsa04975),甾类激素的生物合成(hsa00140),蛋白质的消化与吸收(hsa04974)等生物通路,通过Cox生存分析发现ATAD2和SERPINE1的高表达对患者的预后有显著影响.结论通过对TCGA数据库中胃腺癌的表达数据分析研究,选出两个与该疾病预后密切相关的基因ATAD2和SERPINE1,为该疾病的早期诊断治疗和靶向药物的开发提供重要理论依据.【期刊名称】《山西医科大学学报》【年(卷),期】2018(049)005【总页数】6页(P476-481)【关键词】TCGA数据库;胃腺癌;R语言;三磷酸腺苷酶家族蛋白2;纤溶酶原激活物抑制因子1【作者】高丽娟;曹夏【作者单位】山西医科大学生理学系,太原 030001;山西医科大学细胞生理学教育部重点实验室;山西医科大学基础医学院【正文语种】中文【中图分类】R735.2胃癌(gastric cancer,GC)是全球高发恶性肿瘤之一[1]。
中国临床医学 ２０１２年１２月 第１９卷 第６期 Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，２０１２．Ｖｏｌ．１９，Ｎｏ．６ ·论著· 胃癌组织中ＨＥＲＧ的表达及其临床意义邵晓冬 张永国 陈江 林浩 郭晓钟（沈阳军区总医院消化内科，辽宁沈阳 １１００１６）摘要 目的：分析人类ｅａｇ相关基因（ｈｕｍａｎ ｅｔｈｅｒ－ａ－ｇｏ－ｇｏ－ｒｅｌａｔｅｄ ｇｅｎｅ，ＨＥＲＧ）蛋白在胃癌组织中的表达及其临床意义。
方法：采用免疫组化方法研究ＨＥＲＧ蛋白在胃癌组织和正常胃组织中的表达水平，阐述ＨＥＲＧ蛋白水平与临床生化指标之间的关系。
结果：免疫组化结果显示，ＨＥＲＧ蛋白在胃癌细胞的细胞质和细胞膜中表达，在正常的胃上皮细胞中不表达。
ＨＥＲＧ蛋白在低分化胃癌组织中的表达水平显著高于其在高分化和中分化胃癌组织中的表达水平（Ｐ＜０．０５）。
ＩＩＩ、ＩＶ期（按国际抗癌联盟ＴＮＭ分期）胃癌组织中ＨＥＲＧ蛋白染色强度显著高于Ｉ、ＩＩ期胃癌组织（Ｐ＜０．０５）；伴有淋巴结转移的胃癌组织中的ＨＥＲＧ蛋白的表达水平显著高于不伴有淋巴结转移的胃癌组织（Ｐ＜０．０５）。
结论：ＨＥＲＧ蛋白的表达水平与胃癌的发生和恶性程度相关，有可能作为胃癌诊断及预后判断的一个指标。
关键词 胃癌； 人ｅａｇ相关基因蛋白； 钾离子通道中图分类号 Ｒ７３５．２ 文献标识码 ＡＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ＨＥＲＧ Ｐｒｏｔｅｉｎ ｉｎ Ｇａｓｔｒｉｃ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｉｓｓｕｅｓ ａｎｄ Ｉｔｓ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｖａｌｕｅ ＳＨＡＯ Ｘｉａｏｄｏｎｇ ＺＨＡＮＧＹｏｎｇｇｕｏ ＣＨＥＮ Ｊｉａｎｇ ＬＩＮ Ｈａｏ ＧＵＯ Ｘｉａｏｚｈｏｎｇ Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ，Ｇｅｎｅｒａｌ Ｈｏｓ－ｐｉｔａｌ ｏｆ Ｓｈｅｎｙａｎｇ Ｍｉｌｉｔａｒｙ Ｃｏｍｍａｎｄ Ａｒｅａ，Ｓｈｅｎｙａｎｇ １１００１６，ＣｈｉｎａＡｂｓｔｒａｃｔ Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ：Ｔｏ ｓｔｕｄｙ ｔｈｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ＨＥＲＧ ｐｒｏｔｅｉｎ ｉｎ ｇａｓｔｒｉｃ ｃａｎｃｅｒ ｔｉｓｓｕｅｓ ａｎｄ ｉｔｓ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｖａｌｕｅ．Ｍｅｔｈｏｄｓ：Ｔｈｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ＨＥＲＧ ｐｒｏｔｅｉｎ ｉｎ ｇａｓｔｒｉｃ ｃａｎｃｅｒ ａｎｄ ｎｏｒｍａｌ ｇａｓｔｒｉｃ ｔｉｓｓｕｅｓ ｗａｓ ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｄ ｂｙ ｉｍｍｕｎｏｈｉｓｔｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ．Ｔｈｅ ｒｅｌａ－ｔｉｏｎｓｈｉｐ ｂｅｔｗｅｅｎ ｔｈｅ ｌｅｖｅｌｓ ｏｆ ＨＥＲＧ ａｎｄ ｃｌｉｎｉｃｏｐａｔｈｏｌｏｇｉｃａｌ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｗａｓ ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌｌｙ ａｎａｌｙｚｅｄ．Ｒｅｓｕｌｔｓ：Ｃｏｍｐａｒｅｄ ｗｉｔｈｎｏｒｍａｌ ｇａｓｔｒｉｃ ｔｉｓｓｕｅｓ，ＨＥＲＧ ｐｒｏｔｅｉｎ ｗａｓ ｈｉｇｈｌｙ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ｉｎ ｇａｓｔｒｉｃ ｃａｎｃｅｒ ｔｉｓｓｕｅｓ；ａｎｄ ｔｈｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ＨＥＲＧ ｐｒｏｔｅｉｎ ｗａｓａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｗｉｔｈ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ＴＮＭ ｓｔａｇｅ ａｎｄ ｌｙｍｐｈ ｎｏｄｅ ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ ｏｆ ｇａｓｔｒｉｃ ｃａｎｃｅｒ（Ｐ＜０．０５）．Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ：ＨＥＲＧ ｐｒｏｔｅｉｎｐｌａｙｓ ａ ｒｏｌｅ ｉｎ ｃａｒｃｉｎｏｇｅｎｅｓｉｓ ｏｆ ｇａｓｔｒｉｃ ｃａｎｃｅｒ ａｎｄ ｉｔ ｉｓ ａｌｓｏ ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｗｉｔｈ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ＴＮＭ ｓｔａｇｅ ａｎｄ ｌｙｍｐｈ ｎｏｄｅ ｍｅｔａｓ－ｔａｓｉｓ ｏｆ ｇａｓｔｒｉｃ ｃａｎｃｅｒ，ｓｏ ｔｈｉｓ ｍｏｌｅｃｕｌｅ ｍａｙ ｓｅｒｖｅ ａｓ ａ ｍａｒｋｅｒ ｆｏｒ ｔｈｅ ｄｉａｇｎｏｓｉｓ ａｎｄ ｐｒｏｇｎｏｓｉｓ ｏｆ ｇａｓｔｒｉｃ ｃａｎｃｅｒ．Ｋｅｙ Ｗｏｒｄｓ Ｇａｓｔｒｉｃ ｃａｎｃｅｒ； Ｈｕｍａｎ ｅｔｈｅｒ－ａ－ｇｏ－ｇｏ－ｒｅｌａｔｅｄ ｇｅｎｅ； Ｐｏｔａｓｓｉｕｍ ｃｈａｎｎｅｌ基金项目：国家自然科学基金资助项目（编号：３０４００２０４）通讯作者 邵晓冬，Ｅ－ｍａｉｌ：ｓｘｄｓｙｓ６０８＠ｓｏｈｕ．ｃｏｍ 新近的研究［１］提示，某些钾离子通道（ｖｏｌｔａｇｅ－ｇａｔｅｄ ｐｏｔａｓｓｉｕｍ ｃｈａｎｎｅｌｓ，ＫＶ）与恶性肿瘤的发生发展有关，其中电压门控钾离子通道与肿瘤的关系已成为研究的热点。
PGⅠPGⅡG-17检测在胃癌及萎缩性胃炎诊断中的应用价值PGⅠ、PGⅡ和G-17是胃黏膜的特异性生化指标，其浓度变化在胃癌和萎缩性胃炎的诊断中具有重要的应用价值。
PGⅠ、PGⅡ和G-17的浓度水平受到多种因素的影响，如饮食习惯、感染、炎症等，因此在临床诊断中需结合其他检测结果进行综合分析。
下面将从PGⅠ、PGⅡ和G-17在胃癌及萎缩性胃炎诊断中的应用价值、影响因素以及临床意义等方面进行阐述。
1. PGⅠ/PGⅡ比值在胃癌诊断中的应用PGⅠ与PGⅡ在胃腺癌患者中的比值通常降低，而在萎缩性胃炎患者中则升高。
这一差异性表明PGⅠ/PGⅡ比值在胃癌与萎缩性胃炎的鉴别诊断中具有很好的临床应用价值。
临床研究发现，当PGⅠ/PGⅡ比值小于3.0时，其对胃癌的诊断敏感性为83.3%，特异性为91.7%，诊断准确性显著提高。
2. G-17水平在胃癌及萎缩性胃炎诊断中的应用G-17是一种负反馈调节剂，其分泌水平在胃癌患者中通常降低，而在萎缩性胃炎患者中则升高。
临床研究表明，胃癌患者的G-17水平普遍低于正常人群，其中以晚期胃癌患者降低更为显著，而萎缩性胃炎患者则呈现出显著升高。
G-17水平的测定有助于胃癌患者与萎缩性胃炎患者的鉴别诊断。
二、PGⅠ、PGⅡ和G-17水平受多种因素影响1. 饮食习惯饮食习惯是影响PGⅠ、PGⅡ和G-17水平的重要因素。
高脂肪、高糖、高盐饮食会导致胃黏膜细胞的损伤，从而影响PGⅠ、PGⅡ和G-17的分泌水平。
2. 感染及炎症幽门螺杆菌感染和其他引起胃黏膜炎症的因素会导致PGⅠ、PGⅡ和G-17的分泌水平异常。
幽门螺杆菌感染引起的胃炎和胃溃疡会导致PGⅠ、PGⅡ和G-17的分泌水平的改变，临床检测中应予以重视。
3. 药物作用某些药物如非甾体抗炎药、皮质类固醇等会对胃腺细胞产生影响，导致PGⅠ、PGⅡ和G-17水平的异常变化。
在进行PGⅠ、PGⅡ和G-17检测时，需注意患者近期使用的药物情况。
胃癌组织中LRG1与E-cadherin的表达及临床意义田薇;章建国;刘益飞;卞兆连;黄华;靳钦【摘要】目的探讨胃癌中富含亮氨酸的α-2-糖蛋白1(leucine-rich α2 glycoprotein 1,LRG1)的表达及临床意义.方法采用免疫组化法检测74例胃癌组织及相应癌旁组织中LRG1、E-cadherin的表达;探讨胃癌组织及癌旁组织中LRG1、E-cadherin的表达,并分析LRG1表达与E-cadherin表达的相关性及与临床病理特征、患者生存时间的关系.结果 LRG1蛋白在胃癌组织中的表达明显高于癌旁组织(P＜0.01),E-cadherin蛋白在胃癌组织中的表达明显低于癌旁组织(P＜0.01),LRG1表达与E-cadherin表达呈负相关.进一步分析显示,胃癌中LRG1的表达与肿瘤分化程度及淋巴结转移相关(P＜0.01),与患者年龄、性别、肿瘤大小、TNM分期等无关(P＞0.05).Kaplan-Meier单因素统计分析结果显示LRG1高表达组患者术后生存时间明显低于LRG1低表达组(P＜0.05).结论 LRG1在胃癌组织中高表达,其表达水平与胃癌分化程度及淋巴结转移相关,其高表达抑制E-cadherin 的表达,促进肿瘤细胞迁移,且有助于判断肿瘤的恶性生物学行为及预后评估.【期刊名称】《临床与实验病理学杂志》【年(卷),期】2017(033)010【总页数】4页(P1129-1132)【关键词】胃肿瘤;LRG1;E-cadherin;预后【作者】田薇;章建国;刘益飞;卞兆连;黄华;靳钦【作者单位】南通大学附属医院病理科,南通226000;南通大学附属医院病理科,南通226000;南通大学附属医院病理科,南通226000;南通大学附属南通第三医院南通市肝病研究所,南通226000;南通大学附属医院病理科,南通226000;南通大学附属医院病理科,南通226000【正文语种】中文【中图分类】R735.2胃癌是源自胃黏膜上皮的恶性肿瘤，严重威胁人类健康，是我国常见高发肿瘤之一，其病程进展快，患者预后差，病死率位居恶性肿瘤的第2位[1]。
hOGG1基因多态性与胃癌临床病理参数的相关性研究
摘要】目的 分析hOGG1基因型与胃癌临床病理参数之间的关系，以探讨其在胃
癌预后中的潜在价值。方法 选取住院接受手术治疗的原发性胃癌患者176例。遴
选5项临床病理参数（TNM分期、临床病理类型、肿瘤局部炎症反应、胃癌瘤体
的大小及肿瘤级别），通过PCR-RFLP 方法检测胃癌患者hOGGl基因Ser326Cys多
态的基因型，通过组织病理学方法检测并收集临床病理参数，应用卡方检验对
Ser326 Cys基因与临床病理参数进行相关性分析。结果 实验结果显示hOGGl基因
Ser326 Cys与临床病理参数无统计学意义（P＞0.05）结论 hOGGl基因Ser326 Cys
与临床病理参数无明显相关性。
【关键词】hOGG1基因 胃癌 临床病理参数
【中图分类号】R730.23【文献标识码】A【文章编号】2095-1752（2012）30-
0191-02
胃癌是威胁人类生命健康的常见消化道恶性肿瘤，胃癌发生发展与其他恶性
肿瘤一样属多因素、多步骤、多阶段和多基因改变过程。近年来，DNA复制过程
中各种修复基因缺陷与肿瘤发生和发展的关系是研究的热点。人8-羟基鸟嘌呤糖
苷酶（human 8-hydroxyguanine glycosylase，hOGG1）基因是碱基切除修复酶基因
[1]，其编码的蛋白质在碱基切除修复和单链断裂修复中发挥重要作用，它们的多
态改变会影响其功能，从而影响个体的肿瘤易感性和生物学行为。有研究表明，
在hOGG1基因中存在着一个改变氨基酸编码序列的多态，可以导致这个糖苷酶
326位的丝氨酸（Ser）改变为半胱氨酸（Cys），携带Ser的hOGG1修复能力是
Cys变异体的7倍[2]。目前hOGG1基因多态性研究主要集中于其与肿瘤易感性的
关系。其与胃癌临床病理参数的关系尚未见报道。为此，我们采用PCR-RFLP方法
检测胃癌患者hOGGl基因Ser326Cys多态的基因型，并结合对照其临床病理参数，
探讨hOGG1基因多态性与胃癌临床病理参数的关系。
1 对象和方法
1.1研究对象 胃癌患者176例，来自赣南医学院第一附属医院，均经组织病
理学确诊为胃癌患者，病理参数采集为病历资料和病理科取材诊断资料。
1.2基因分型 抽取患者5ml静脉抗凝血，从全血中先分离得到淋巴细胞，再
用蛋白酶K、十二烷基硫酸钠（SDS）消化，然后用酚/氯仿抽提，乙醇沉淀提取
基因组DNA，用序列为5’-ACTAGTCTC ACCAGCCGTGAC-3’和5’-TGGCCTTTGAGGTA
GTCA-CA G-3’扩增含Ser326 Cys的hOGG1基因，扩增条件为：94℃变性5min，
94℃30s，55℃30s，72℃30s，共35循环后，72℃延伸l0min。扩增产物用DNA
回收试剂盒回收并溶解于10μl去离子水中，取5μl回收扩增产物与限制性核酸内
切酶Fnu4HI于37℃温育过夜，经2%琼脂糖凝胶电泳后在凝胶成像仪中观察结果。
PCR产物经Fnu4HI消化后，产生3种不同的电泳条带。纯合子Ser/Ser基因型
293bp，纯合子Cys/Cys基因型因突变增加一酶切位点而产生169bp和124bp两个
片断，而杂合子Ser/Cys基因型则产生169bp、124bp和293bp3个片断。
1.3统计分析 应用χ2检验分别检验hOGG1基因型与胃癌临床病理参数
（TNM分期、临床病理类型、肿瘤局部炎症反应、胃癌瘤体的大小及肿瘤级别）
之间的相关性，
2 结果
176胃癌患者hOGGl基因Ser326Cys多态的基因型（Ser/Ser、Cys/Cys和
Ser/Cys）与胃癌临床病理参数（TNM分期、临床病理类型、肿瘤局部炎症反应、
胃癌瘤体的大小及肿瘤级别）的关系如表1。实验结果显示hOGGl基因Ser326
Cys的多态基因型与临床病理参数无统计学意义（P＞0.05）。
3 讨论
hOGGl基因是碱基切除修复基因，在DNA氧化损伤中，8-羟基鸟嘌呤形成频
率最高、致突变能力最强，可以导致G:C→T:A突变，与肿瘤的发生发展有密切关
系[3]。已经有不少学者报导其与肺癌、食管癌、肝癌及胃癌等的易感性相关。
胃癌临床病理参数（TNM分期、临床病理类型、肿瘤局部炎症反应、胃癌瘤
体的大小及肿瘤级别）是临床评价胃癌预后的重要参数[4]，研究结果呈示hOGGl
基因Ser326Cys的基因多态性与胃癌临床病理参数之间无明显统计学意义，这与
一些学者之前的研究结果比较一致，苏智雄等学者在研究原发性肝癌hOGGl蛋白
表达与患者年龄、性别、HBsAg阳性、AFP阳性、肿瘤大小、病理分级等临床病
理因素关系时，亦发现hOGGl蛋白表达与临床病理因素之间无统计学意义[5]。这
可能与临床病理因素跟多因素有关，可能是长时间的生长，亦可能与恶性程度高
或生长速度快等。这也提示hOGGl基因Ser326Cys的基因多态性与肿瘤的发生有
明显相关性，而与肿瘤的发展预后无明显相关性。
表1 hOGGl基因Ser326Cys多态的基因型与胃癌临床病理参数的关系
Ser326Cys TNM
分期 病理
类型 局部炎
症反应 瘤体
大小 肿瘤
级别
1 2 3 早期 晚期 无 有 ≤
2cm ＞
2cm Ⅰ级 Ⅱ级 Ⅲ级
C/C 3 15 9 5 22 11 16 11 16 5 10 12
C/G 19 60 16 21 74 33 62 35 60 14 16 55
G/G 13 28 13 12 42 24 30 26 28 13 21 30
χ2 5.193 0.178 1.428 1.821 4.252
P值 0.268 0.915 0.490 0.402 0.373
TNM分期（分为1：无区域淋巴结转移和远处转移，2：有区域淋巴结转移无
远处转移，3：有区域淋巴结转移和远处转移）
参考文献
[1] 胡富勇,蒋友胜,柯跃斌.hOGGl简介及其分子流行病学研究进展.癌变.畸变.突变，
2008,20(3);242-244
[2] Takezaki T, Gao CM, Wu JZ,et al.hOGG1 Ser(326)Cys polymorphism and
modification by environmental factors of stomach cancer risk in Chinese. International
Journal of Cancer, 2002,99(4):624-627
[3] Floyd RA.The role of 8-hydroxyguanine in carcinogenesis Carcinogenesis,
1990,11(9);1447-1450
[4] 武忠弼,杨光华.中华外科病理学.北京:人民卫生出版社.200 2.655-664
[5] 苏智雄,黎乐群,彭涛,等. hOGGl在原发性肝癌和肝硬化组织中的表达及意义. 中
国癌症防治杂, 2009，1(1);3-6
