长链非编码解读15.1.14
- 格式:pptx
- 大小:3.03 MB
- 文档页数:34
长链非编码RNA(lncRNA)简介什么是长链非编码RNA?长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是一类本身不编码蛋白、转录本长度超过200nt的长链非编码RNA分子,它可在多层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达。
lncRNA最初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,是一种“噪音”,不具有生物学功能。
然而,今年来的研究表面,lncRNA参与了X染色体沉默、染色体修饰和基因组修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等过程,其调控作用正在被越来越多的人研究。
lncRNA的分布据统计,哺乳动物蛋白编码基因占总RNA的1%,长链非编码RNA占总RNA的比例可达4%-9%,这些长链非编码RNA是基因功能研究的又一座宝库。
目前发现的许多lncRNA都具有保守的二级结构,一定的剪切形式以及亚细胞定位。
它们在基因组上相对于蛋白编码基因的位置,可以分为5种:正义链(sense)、反义链(antisense)、双向(bidirectional)、内含子间(intronic)、基因间(intergenic),其所在的位置与其功能有一定的相关性。
lncRNA的作用机制长链非编码RNA的作用机制非常复杂,至今尚未完全清楚。
根据目前的研究,lncRNA的作用机制如要有以下几种(如图)。
编码蛋白的基因上游启动子区(橙色)转录,干扰下游基因(蓝色)的表达;抑制RNA聚合酶II或者介导染色质重构以及组蛋白修饰,影响下游基因(蓝色)的表达;与编码蛋白基因的转录本形成互补双链(紫色),干扰mRNA的剪切,形成不同的剪切形式;与编码蛋白基因的转录本形成互补双链(紫色),在Dicer酶的作用下产生内源性siRNA;与特定蛋白质结合,lncRNA转录本(绿色)可调节相应蛋白的活性;作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体;结合到特定蛋白质上,改变该蛋白质的细胞定位;作为小分子RNA(如miRNA、piRNA)的前体分子。
《METTL14通过m6A修饰调节LINC02747在非小细胞肺癌的作用研究》篇一一、引言非小细胞肺癌(NSCLC)是肺癌的主要类型,其发病率和死亡率居高不下,已成为全球关注的健康问题。
因此,探究非小细胞肺癌的发生发展机制及其有效治疗策略具有重大的医学价值。
近年来,长链非编码RNA(lncRNA)在肿瘤发生发展中的调控作用逐渐受到关注。
其中,LINC02747作为一种新发现的lncRNA,在多种癌症中表现出重要的生物学功能。
而甲基转移酶相关蛋白14(METTL14)则是参与m6A(N6-甲基腺嘌呤)修饰的关键酶。
本文旨在探讨METTL14通过m6A修饰对LINC02747在非小细胞肺癌中的作用及机制。
二、研究背景与目的m6A修饰是一种常见的RNA修饰方式,对基因的表达具有重要影响。
METTL14作为m6A甲基转移酶的核心成分,其在RNA上的修饰作用广泛。
而LINC02747作为一种新发现的lncRNA,在多种癌症中表现出异常表达,其具体功能尚不明确。
因此,本研究旨在探讨METTL14通过m6A修饰对LINC02747在非小细胞肺癌中的调控作用及机制,以期为非小细胞肺癌的诊治提供新的思路和靶点。
三、研究方法本研究采用细胞实验、分子生物学实验及生物信息学分析等方法,首先通过生物信息学分析预测METTL14与LINC02747的关联;其次,通过细胞实验验证METTL14与LINC02747的相互作用;最后,探讨METTL14通过m6A修饰对LINC02747的表达及功能的影响。
四、研究结果1. 通过生物信息学分析,我们发现METTL14与LINC02747存在关联,提示两者可能在非小细胞肺癌中具有相互作用。
2. 细胞实验证实,METTL14与LINC02747在非小细胞肺癌细胞中存在相互作用,且这种相互作用受到m6A修饰的调控。
3. 分子生物学实验表明,METTL14通过m6A修饰调节LINC02747的表达,进而影响非小细胞肺癌细胞的增殖、迁移和侵袭等生物学行为。
长链非编码RNA的概述聊聊跟科研有关的感想心得,如基金,文章和实验。
长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA,其在转录沉默、转录激活、染色体修饰、核内运输等均具有重要的功能。
一、lncRNA的简介不同的lncRNA参与多种生物学进程RNA是以一条DNA链为模板,以碱基互补配对原则转录形成的单链。
RNA分为mRNA、miRNA、tRNA、rRNA、ncRNA等。
非编码RNA包含短链非编码RNA和长链非编码RNA。
起初,lncRNA是被认为是基因组转录的“噪音”,无生物学功能。
随着研究的深入,已经发现lncRNA是一类参与多种生物学进程的非编码RNA。
lncRNA 包含多种类型的转录本,在结构上类似mRNA,有时也转录成编码基因的反义转录本。
lncRNA被认为执行了重要的调控功能,也与疾病发展息息相关。
有些lncRNA在物种之间相当保守,可以调控一些共有的信号通路。
二、lncRNA的产生lncRNA和mRNA一样是由对应的基因转录而成,具有5'帽子和poly尾巴,通过剪接形成成熟体的lncRNA;同一基因可以形成不同的转录本的lncRNA。
lncRNA的产生有几种方式:1、编码基因发生框插入,转成一个与先前编码序列合并的lncRNA;2、染色质重排后,两个不转录并且原来可能间隔的很远的序列区合并到了一起,产生了一个含多个外显子的lncRNA;3、非编码基因通过反转录转座作用复制,产生一个有功能的非编码逆转基因,或产生一个无功能的反转录基因;4、两次连续的重复时间在ncRNA内部产生相邻的重复序列产生lncRNA;5、转位因子插入产生一个有功能的lncRNA。
三、lncRNA的分类lncRNA分为以下几种:1、Antisense lncRNA (反义长链非编码RNA)2、Intronic transcript (内含子非编码RNA)3、Large intergenic noncoding RNA (lincRNA,基因区间的lncRNA)4、Promoter-associated lncRNA(启动子相关lncRNA)5、UTR associated lncRNA (非翻译区lncRNA)四、lncRNA的特点1、lncRNA的长度在200-100000nt之间,具有mRNA相似的结构,经剪接,具有ployA尾巴以及启动子结构,分化过程中有动态的表达以及不同的剪接方式,形成不同的lncRNA;2、lncRNA一般无蛋白编码能力,但是有很多lncRNA能编码一些短肽;3、lncRNA的保守性较低;4、lncRNA的表达具有组织特异性以及时空特性。
植物生长调控的非编码RNA 植物生长调控是一个复杂而精细的过程,其中非编码RNA (noncoding RNA)在调控基因表达和生物发育中起到了重要的作用。
非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA分子,包括长链非编码RNA、短链非编码RNA和微小RNA等多种类型。
在植物中,非编码RNA通过多种机制参与调控细胞生长、发育和适应环境等生理过程。
一、长链非编码RNA的调控作用长链非编码RNA是指长度超过200个核苷酸的RNA分子,常见的类型包括天然反义RNA(natural antisense RNA)和长链内含子RNA (long intronic RNA)等。
这些长链非编码RNA可以与编码蛋白质的mRNA形成双链结构,从而调节基因表达。
例如,天然反义RNA可以通过互相碱基配对,形成双链RNA,从而影响靠近的基因的转录和翻译过程。
长链内含子RNA在基因表达中的作用还不太清楚,但研究发现它们与染色质构象和DNA甲基化有关,可能参与基因座的表观遗传调控。
二、短链非编码RNA的调控作用短链非编码RNA是指长度在20-200个核苷酸之间的RNA分子,常见的类型包括小核RNA(small nuclear RNA)、小核仁RNA(small nucleolar RNA)、外显子环状RNA(exonic circRNA)和滨核RNA (intergenic RNA)等。
它们在植物细胞中广泛存在,并参与多种生物过程的调控。
例如,小核RNA和小核仁RNA在剪接和修饰mRNA的过程中起到重要的作用。
外显子环状RNA是一种特殊类型的短链非编码RNA,其具有环状结构,可以与核糖体结合并抑制蛋白质的合成。
滨核RNA是指位于基因间区域的短链非编码RNA,其功能还在进一步研究中探索。
三、微小RNA的调控作用微小RNA(miRNA)是一类长度约为20-24个核苷酸的非编码RNA。
在植物中,miRNA参与调控基因表达的主要机制是通过与靶基因的mRNA结合,并导致其降解或抑制其翻译过程。
国际老年医学杂志 2023年11月 第44卷第6期 IntJGeriatr,November2023,Vol.44No.6 2023国际老年医学杂志编辑部 2023bytheEditorialOfficeofInternationalJournalofGeriatrics甘肃省自然科学基金项目(22JR5RA007) 通讯作者:张百红,电子邮箱bhzhang1999@126 comRNA结合基序蛋白15的功能及其在肿瘤中的研究进展谈元郡1 王 霞1 张百红2 岳红云31甘肃中医药大学第一临床医学院,兰州 730000;2中国人民解放军联勤保障部队第九四 医院肿瘤科,兰州 730050;3中国人民解放军联勤保障部队第九四 医院眼科,兰州 730050 [摘 要] RNA结合基序蛋白15(RBM15)是一类有N端RNA识别基序(RRM)和C端Spen旁系/直系同源物(SPOC)结构的蛋白质。
RBM15以N6-甲基腺苷(m6A)修饰依赖性方式或独立于m6A修饰的方式调节mRNA表达、神经干细胞分化、营养物质代谢和遗传稳态等过程。
近年研究发现,RBM15与肿瘤发生发展密切相关。
本文详细阐述了RBM15的功能,及其与多种肿瘤发生发展的关系,为临床上探讨靶向RBM15作为肿瘤治疗的新策略提供可靠依据。
[关键词] RNA结合基序蛋白15;肿瘤;mRNA;N6-甲基腺苷 doi:10 3969/j issn 1674-7593 2023 06 022RecentAdvancesinUnravelingtheFunctionsofRBM15andItsSignificanceinTumorigenesisTanYuanjun1,WangXia1,ZhangBaihong2,YueHongyun31theFirstClinicalMedicineCollegeofGansuUniversityofChineseMedicine,Lanzhou 730000;2DepartmentofOncology,the940thHospitalofJointLogisticsSupportForceofPeople′sLiberationArmy,Lanzhou 730050;3DepartmentofOphthalmology,the940thHospitalofJointLogisticsSupportForceofPeople′sLiberationArmy,Lanzhou 730050Correspondingauthor:ZhangBaihong,email:bhzhang1999@163 com [Abstract] RNAbindingmotifprotein15(RBM15)belongstoaclassofproteinscharacterizedbyanN-terminalRNArecognitionmotif(RRM)andaC-terminalSpenparalogandorthologC-terminal(SPOC)structure.RBM15playspivotalrolesinmodulatingmRNAexpression,guidingneuralstemcelldifferentiation,regulatingnutrientmetabolism,andmaintaininggenetichome ostasis.ItsinfluenceonthesecellularprocessescaneitherbedependentonN6-methyladenosine(m6A)modificationsoroccurin dependentlyofm6A.Inrecentyears,RBM15hasemergedasakeyplayercloselyassociatedwithtumorigenesisanddevelopmentalprocesses.ThispaperdelvesintointricatedetailsregardingthemultifacetedfunctionsofRBM15anditsintricateinterplaywiththede velopmentofvarioustumors.ThesefindingsofferarobustfoundationforthepotentialclinicalexploitationofRBM15asanovelthera peutictargetinthefightagainstcancer. [Keywords] RNAbindingmotifprotein15;Tumor;mRNA;N6-methyladenosine RNA结合基序蛋白15(RNAbindingmotifpro tein15,RBM15)的编码基因位于人类染色体1p13 3区域,最早在t(1;22)(p13;q13)易位的急性巨核细胞白血病婴儿体内发现[1]。
血清LncRNA MALAT1和microRNA-124水平检测对非小细胞肺癌患者预后的评估价值梁亚海;李金媚;彭晓霞;张丽花;刘美莲;郑伟珍;杨志雄;赖振南【期刊名称】《现代肿瘤医学》【年(卷),期】2024(32)7【摘要】目的:探究长链非编码RNA-转移相关肺腺癌转录本1(LncRNA MALAT1)和微小RNA-124(microRNA-124)对非小细胞肺癌(NSCLC)患者预后的预测效能。
方法:选取2020年06月至2022年06月我院收治的124例NSCLC患者作为研究对象,入院后,收集患者的病历资料,检测入院时外周血LncRNA MALAT1、microRNA-124的相对表达量。
电话随访12个月记录患者的死亡率,分为生存组和死亡组,分析NSCLC患者预后的影响因素,评估血清LncRNA MALAT1、microRNA-124对NSCLC患者预后的预测效能。
结果:死亡组患者的IV期占比及LncRNA MALAT1相对表达量高于生存组,microRNA-124相对表达量低于生存组。
Logistic遂步分析显示,病理分期IV期(OR=12.342,95%CI:4.295~36.765)、LncRNA MALAT1(OR=5.371,95%CI:1.836~15.714)及microRNA-124(OR=0.257,95%CI:0.089~0.752)是NSCLC患者死亡的影响因素(P<0.05)。
LncRNA MALAT1与microRNA-124呈负相关(P<0.05)。
受试者工作特性曲线(ROC)分析显示,LncRNA MALAT1及microRNA-124单一及联合预测NSCLC患者预后的灵敏度分别为0.741(95%CI:0.601~0.846)、0.759(95%CI:0.621~0.861)、0.815(95%CI:0.682~0.903),特异度分别为0.825(95%CI:0.705~0.906)、0.762(95%CI:0.635~0.856)、0.841(95%CI:0.723~0.917),曲线下面积(AUC)分别为0.781、0.760、0.839。
非编码RNA参与调控基因表达机制解析概述:基因表达是生物体内转录和翻译的过程,能够决定细胞的功能和特性。
近年来,越来越多的研究揭示了非编码RNA在调控基因表达中的重要作用。
非编码RNA是指不参与翻译过程,而在细胞内具有调控功能的RNA分子。
本文将对非编码RNA参与调控基因表达的机制进行解析。
介绍非编码RNA:非编码RNA主要包括长链非编码RNA(lncRNA)、微小RNA (miRNA)和环状RNA(circRNA)等。
它们在细胞内通过与DNA、RNA或蛋白质相互作用,调控基因的表达和功能。
非编码RNA的调控机制:1. lncRNA调控机制:lncRNA可以通过中间过程干扰转录调控,它们与染色质相关复合物相互作用,参与染色质的重塑和启动子区域的辅助元件的招募,从而影响基因的转录水平。
此外,lncRNA还可以调控转录后调节。
例如,一些lncRNA可以与mRNA分子结合,调控转录后的RNA剪接、稳定性和翻译过程。
2. miRNA调控机制:miRNA是一类长度约为20-22个核苷酸的小RNA分子,它们通过与mRNA相互作用,调节基因的表达。
miRNA通过与mRNA 3'非翻译区结合,导致靶基因的降解或抑制其翻译。
这种调控机制在许多生物过程中起到重要作用,如细胞周期调控、细胞分化和肿瘤发生等。
3. circRNA调控机制:circRNA是一种环状RNA分子,其特殊的环状结构使其在细胞中稳定存在。
近年来的研究表明,circRNA可以通过吸附miRNA和调控基因表达的方式参与调控。
circRNA可以通过吸附miRNA,起到竞争性内源性RNA (ceRNA)的角色,从而减少miRNA与靶基因的结合,增加靶基因的表达水平。
非编码RNA参与调控基因表达的功能和作用:1. 调控细胞周期:非编码RNA参与细胞周期的调控。
一些miRNA可以影响细胞周期的进行,通过调控周期检查点蛋白的表达,影响细胞周期的进程。
2. 调控基因转录和翻译:lncRNA可以通过与染色质相关复合物相互作用,影响染色质的结构和启动子的辅助元件的招募,从而影响基因的转录水平。
长非编码RNA-是指大于200 nt的RNAs,位于细胞核或胞浆内,不参与或很少参与蛋白质的编码。
长非编码RNA-是指大于200 nt的RNAs,位于细胞核或胞浆内,不参与或很少参与蛋白质的编码。
学术术语来源---人脂肪干细胞脂向分化中长非编码RNA的差异表达文章亮点:脂肪干细胞传代至第3代后诱导其脂向分化,获取诱导过程中0,5,12 d总RNA。
通过微阵列测序技术对不同诱导时期RNA进行高通量分析,筛选出差异倍数明显的长非编码RNA。
结合生物信息学报告进一步筛选出可能在脂向分化过程中发挥重要作用的长非编码RNA并通过实时荧光定量PCR进行验证,为进一步实验提供依据。
关键词:干细胞;脂肪干细胞;脂向分化;长链非编码RNA差异性表达;lncRNAs;生物信息学报告;qRT-PCR主题词:腹内脂肪;间质干细胞;成脂分化;RNA摘要背景:肥胖导致了包括高血压、冠心病、脂肪肝、高脂血症、2型糖尿病在内的诸多疾病,因此深入理解脂肪细胞分化机制对于肥胖的防治具有深远意义。
目前对于脂向分化机制的研究多集中在微小RNA上,对于长非编码RNA在脂向分化过程中的作用尚且知之甚少。
目的:获得脂向分化过程中差异倍数明显的长非编码RNA,并进一步筛选在脂向分化过程中可能发挥重要作用的长非编码RNA进行验证。
方法:取人腹部皮下脂肪,采用组织块培养法获取脂肪干细胞,传至第3代后进行成脂诱导分化,通过微阵列技术对脂向分化过程中0,5,12 d长非编码RNA及mRNA差异性表达量进行统计,并结合生物信息学报告筛选出呈现明显差异性表达的长非编码RNA,通过qRT-PCR进行验证。
结果与结论:脂向分化过程中以差异倍数1.5(P < 0.05)为标准,上调长非编码RNA的数量5 d vs. 0 d 748个,12 d vs. 0 d 847个,12 d vs. 5 d 593个;下调长非编码RNA的数量5 d vs.0 d 828个,12 d vs.0 d 1 113个,12 d vs.5 d 750个;结合生物信息学分析结果,在与脂类代谢有关的28个长非编码RNA中根据诱导0,5,12 d 差异表达倍数较高且其靶基因可能是已知的与成脂相关的基因中,筛选出3个长非编码RNA:AK304548、BP216319、DA852857。
长链非编码RNA在糖尿病心肌病发生发展中作用的研究进展杜柯一1,2,席洋波1,2,陈冬萍3,杨帆4,肖建民1,31 暨南大学附属东莞医院心内科,广东东莞523000;2 暨南大学附属第一医院心内科;3 暨南大学附属东莞医院中心实验室;4 暨南大学附属东莞医院超声科摘要:在糖尿病心肌病(DCM)的发生发展过程中,能量代谢紊乱、氧化应激、线粒体功能障碍、局部慢性炎症、细胞凋亡、自噬、内皮功能紊乱、心脏自主神经病变等均有参与。
长链非编码RNA(lncRNA)参与调节细胞分化、增殖、凋亡、迁移、血管生成等多种过程。
研究表明,糖尿病患者心脏组织中lncRNA异常表达,通过调节心肌细胞凋亡、自噬、焦亡、铁死亡,心肌间质纤维化以及心肌细胞肥大,导致DCM的病理生理变化。
了解lncRNA表达变化在糖尿病心肌病发生发展中的作用,有助于为DCM的诊断和治疗提供新的研究方向。
关键词:长链非编码RNA;细胞凋亡;细胞自噬;细胞焦亡;铁死亡;间质细胞纤维化;心肌细胞肥大;糖尿病并发症;心肌病doi:10.3969/j.issn.1002-266X.2023.14.023中图分类号:R587.2 文献标志码:A 文章编号:1002-266X(2023)14-0093-04糖尿病心肌病(DCM)是由糖尿病引起的心血管并发症,其主要特征是心室肥厚、间质及血管周围纤维化、冠状动脉基底膜增厚和心肌微血管病变,最终导致心脏舒张乃至收缩功能障碍。
研究表明,在DCM疾病进程中,能量代谢紊乱、氧化应激、线粒体功能障碍、局部慢性炎症、细胞凋亡、自噬、内皮功能紊乱、心脏自主神经病变等均参与其中。
非编码RNA是指可转录但不能翻译的一类RNA,其靶基因及相关信号通路在细胞分化、增殖、凋亡、迁移、血管生成等多种过程中均产生显著影响。
根据RNA碱基序列长度的不同,可分为小非编码RNA和长链非编码RNA(lncRNA)。
lncRNA是长度大于200个核苷酸的非编码RNA,缺乏蛋白质编码能力。
长链非编码RNA THOR促进宫颈癌细胞C33A增殖杨浩杰;谭梓聪;林俊杰;傅钢兰;曹铭辉【摘要】目的研究长链非编码RNA THOR对宫颈癌C33A细胞生长的调控作用.方法 qRT-PCR分别检测15对肿瘤组织/癌旁组织和宫颈癌细胞系C33A、siHa、正常宫颈鳞状上皮细胞H8中的LncRNA THOR表达水平.在宫颈癌细胞系C33A 中,siRNA沉默LncRNA THOR后利用CCK8和平板克隆形成实验检测细胞增殖,流式细胞学实验检测细胞周期,使用western blot检测细胞周期蛋白变化.结果qRT-PCR结果显示15例组织中12例肿瘤组织LncRNA THOR表达明显高于癌旁组织,宫颈癌细胞系C33A、siHa中LncRNA THOR表达也明显高于宫颈鳞状上皮细胞H8细胞.在宫颈癌细胞系C33A中沉默LncRNA THOR后,CCK8结果显示细胞增殖受到抑制,平板克隆形成实验表现为细胞克隆明显减少.流式细胞学周期分析发现G0/G1期细胞比值增高.western blot实验显示周期蛋白cyclinD1和cyclinE1在蛋白水平下降,p27和p21蛋白水平增高.结论 LncRNATHOR在宫颈癌中高表达,沉默LncRNA THOR可以抑制宫颈肿瘤细胞增殖.【期刊名称】《岭南现代临床外科》【年(卷),期】2019(019)001【总页数】4页(P19-22)【关键词】长链非编码RNA;THOR;宫颈癌;增殖【作者】杨浩杰;谭梓聪;林俊杰;傅钢兰;曹铭辉【作者单位】中山大学孙逸仙纪念医院麻醉科;广东省恶性肿瘤表观遗传和基因调控重点实验室,广州510120;中山大学孙逸仙纪念医院麻醉科;广东省恶性肿瘤表观遗传和基因调控重点实验室,广州510120;中山大学孙逸仙纪念医院麻醉科;广东省恶性肿瘤表观遗传和基因调控重点实验室,广州510120;中山大学孙逸仙纪念医院麻醉科;广东省恶性肿瘤表观遗传和基因调控重点实验室,广州510120;中山大学孙逸仙纪念医院麻醉科;广东省恶性肿瘤表观遗传和基因调控重点实验室,广州510120【正文语种】中文【中图分类】R737.33宫颈癌是世界范围排名第四位的常见恶性肿瘤,严重威胁全球女性健康,在我国也不例外[1]。
长链非编码RNA LINC00958在恶性肿瘤发生发展中的作用及作用机制研究进展刘剑1,2,侯净2,倪青1,21 贵州医科大学临床医学院,贵阳550004;2 贵州省人民医院乳腺外科摘要:长链非编码RNA(lncRNAs)LINC00958,又称膀胱癌相关转录本2(BLACAT2),位于人类染色体13p15.2上,在膀胱癌、甲状腺乳头状癌、食管鳞癌、乳腺癌及子宫内膜癌等多种恶性肿瘤细胞中高表达,被鉴定为致癌性ln⁃cRNA。
在恶性肿瘤细胞中,LINC00958的高表达提示恶性肿瘤的临床病理分期较高,存在远处转移,促进恶性肿瘤细胞的增殖、迁移、抑制其凋亡,调节其代谢,促进了恶性肿瘤的发生发展。
在机制上,LINC00958不仅可作为内源性竞争性RNA(ceRNA)通过miRNA-mRNA轴调控肿瘤细胞的恶性行为,还可通过多种关键信号通路,如c-Myc、SIRT1/p53、Wnt/β-catenin等信号通路,调控恶性肿瘤的发生发展。
关键词:非编码RNA;长链非编码RNA;长链非编码RNA LINC00958;恶性肿瘤doi:10.3969/j.issn.1002-266X.2023.33.020中图分类号:R737.9 文献标志码:A 文章编号:1002-266X(2023)33-0083-06人类基因组被广泛转录,除mRNA参与编码蛋白质外,绝大多数从人类基因组转录的RNA都是非编码RNA(ncRNA)。
非编码RNA对生物的发育、遗传及疾病的发生发展具有重要作用,可以通过多种生物学方式对癌症施加影响及调控[1]。
长链非编码RNA(lncRNAs)属于非编码RNA中的调控型ncRNA[2],长度>200个核苷酸,一般不编码蛋白质,通过与RNA、DNA相互作用来调节基因表达,具有保守的二级结构。
随着转录组学测序的不断深入,lncRNAs的类型及功能不断更新,其功能与亚细胞定位密切相关,可与蛋白质、DNA及RNA相互作用,通过多种机制(如染色质重塑,染色质相互作用,ceRNA和天然反义转录物NAT)在不同层面(表观遗传学、转录调控及转录后调控等)影响基因的表达[3]。
编码与非编码RNA的功能随着基因组学和生物信息学的发展,越来越多的研究表明,除了编码蛋白质的基因,非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA)在生物体内也起着重要的调控作用。
ncRNA是指在转录过程中不被翻译为蛋白质的RNA分子,包括长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)、微小RNA(MiRNA)和其他小分子RNA等。
这些ncRNA的功能在生殖、发育、免疫应答、细胞凋亡等方面都发挥着关键作用。
本文将详细介绍编码与非编码RNA的功能。
一、编码RNA的功能编码RNA大致可分为以下两类:信息传递RNA和功能RNA。
1. 信息传递RNA信息传递RNA(Messenger RNA, mRNA)是由DNA转录而来,带有编码信息的RNA。
mRNA中的信息序列被翻译为蛋白质,负责维持细胞的结构和功能。
转录的RNA分子随后会在核内经过编辑和多种质控检查,确保成熟RNA的正确性和稳定性,然后运输到细胞质中。
mRNA通过核糖体上的tRNA将氨基酸送到多肽链上,最终形成蛋白质。
mRNA在蛋白质合成中扮演了不可或缺的角色,它们的变化会影响蛋白质的表达及其与其他分子的相互作用。
2. 功能RNA功能RNA(Functional RNA, fRNA)是指在细胞内不被翻译为蛋白质但具有特定功能的RNA。
功能RNA主要包括以下几类:(1) tRNAtRNA是一种短链RNA,它通过它的“反密码子”与mRNA上的三联密码子相配对,将特定的氨基酸带到变形核糖体上,参与蛋白质合成。
此外,tRNA还参与RNA修饰、保护细胞免受病毒攻击等功能。
(2) rRNArRNA是一种结构稳定、复杂的RNA,它与蛋白质相互作用形成核糖体,参与蛋白质合成。
rRNA不仅具有机械支架的功能,还可以帮助调节细胞内的基因表达。
(3) snRNAsnRNA(Small nuclear RNA)主要参与前体mRNA的剪切和剪接。
非编码RNA在宫颈癌组织中的表达及临床意义郭方圆;李文亮;徐凡;魏向群【期刊名称】《昆明医科大学学报》【年(卷),期】2022(43)5【摘要】目的分析非编码RNA长链非编码RNA(LINC00982)及微小RNA(hsa-miR-1246)在子宫颈癌组织中的表达情况,旨在为宫颈癌的诊断提供新的生物标志物和潜在的治疗靶点。
方法收集云南大学附属医院2021年1月至2021年10月收治的21例因子宫肌瘤等良性病变行全子宫切除术患者的正常宫颈组织样本(对照组)和43例经病理学诊断为子宫颈癌患者的宫颈癌组织样本(实验组),运用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测并比较2组间LINC00982及hsa-miR-1246的表达情况。
结果(1)与人正常子宫颈组织相比,子宫颈癌组织中LINC00982-1/2的表达下调(P<0.05),而hsa-miR-1246表达上调(P<0.05);(2)高分化宫颈癌组织中LINC00982-1/2及hsa-miR-1246的表达量低于中低分化宫颈癌组织(P<0.05);(3)Ⅲ/Ⅳ期人宫颈癌组织中LINC00982-1/2及hsa-miR-1246的表达量高于Ⅰ/Ⅱ期(P<0.05);(4)腺癌组织中LINC00982-1的表达量低于鳞状细胞癌(P<0.05),但腺癌与鳞状细胞癌中LINC00982-2两者比较,差异无统计学意义(P>0.05),而hsamiR-1246的表达量则高于鳞状细胞癌(P<0.05);(5)LINC00982-1/2表达量随SCCA的增高而下降(P<0.05),而hsa-miR-1246表达量随SCCA的增高而增高;(6)肿瘤直径>4 cm的组织中,LINC00982-1/2及hsa-miR-1246的表达量高于肿瘤直径≤4 cm者。
结论LINC00982在宫颈癌组织中低表达;hsa-miR-1246在宫颈癌组织中高表达;且子宫颈癌组织中LINC00982-1/2及hsa-miR-1246表达与组织分化程度、病理分期、病理类型、SCCA的高低及肿瘤直径密切相关。
非编码RNA在急性髓系白血病中的作用和临床意义
黄玉维;肖剑文
【期刊名称】《临床医学进展》
【年(卷),期】2024(14)4
【摘要】急性髓系白血病(AML)是一种细胞遗传学和分子异质性疾病,其特征是克隆性髓系前体细胞的分化停滞和恶性增殖。
尽管治疗选择越来越多,但大多数患者在缓解后仍会复发和死亡,预后仍然不理想。
因此,有必要探索新的治疗方法。
研究发现非编码RNA (ncRNA),特别是微RNA (miRNA)、长链非编码RNA (lncRNA)和环状RNA (circRNA)被发现与AML的发生发展、预后及耐药有关。
本文重点介绍ncRNA与AML的相关性的最新研究结果,为未来AML开发高度特异性的诊断工具和更强大的治疗策略奠定基础。
【总页数】7页(P2964-2970)
【作者】黄玉维;肖剑文
【作者单位】重庆医科大学附属儿童医院血液科
【正文语种】中文
【中图分类】R73
【相关文献】
1.长链非编码RNA在急性髓系白血病中调控机制的研究进展
2.长链非编码RNA 在急性髓系白血病发病中作用机制的研究进展
3.长链非编码RNA HOTAIRM1在急性髓系白血病中的表达
4.长链非编码RNA linc00467在儿童急性髓系白血病中
的表达及耐药中的作用研究5.长链非编码RNA FOXD3-AS1在急性髓系白血病中的表达及功能
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。