新型核酸染料-gelred、EB替代品
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DNAGREEN核酸染料说明书货号:G7140规格:0.5ml(10000×)保存:常温运输,4℃保存,有效期一年。
注意:本产品属于微量核酸检测试剂,使用时请按照说明书操作。
产品简介:目前最常见的替代EB的核酸染料SYBR Green I(属于花氰类染料)虽然毒性比EB低、灵敏度比EB高,但由于其化学稳定性差;此外,SYBR Green I在电泳过程中能在DNA分子间移位,很容易使DNA条带模糊和扭曲,电泳清晰度和分辨率下降。
所以在实际应用中依然不能有效替代EB。
本产品是同时具有EB稳定性和SYBR Green I低毒性的新性核酸染料,其特点如下:1.低毒。
其主要成分未发现对人体有致癌性、未被列入有毒有害品,有利于保护使用者的健康和保护日益恶化的环境。
2.灵敏。
检测灵敏度跟EB相当,能满足常规核酸电泳实验要求。
3.稳定。
对光、水和热的稳定性跟EB相当,可加入琼脂糖凝胶中反复熔化。
4.无分子间位移现象。
不会出现SYBR染料常见的条带模糊和扭曲现象。
5.使用方法多样。
既可以加入熔化的胶中,也可以电泳后染色,还可用于PAGE。
6.跟各种常用的核酸电泳缓冲液(如SuperBuffer-2、TBE、TAE)兼容,但在SuperBuffer-2和TBE中背景最低。
7.观察时不需要任何额外的仪器设备或UV光源,可以使用现成的观察EB的300nm UV。
8.可用于RNA染色(也呈绿色)。
9.DNA或RNA浓度较高时还可以直接在日光下观察(需要将胶放在黑色背景下)。
由于避免了UV对DNA的伤害,尤其适用于胶回收实验。
使用方法:电泳中染色:本方法是将DNAGREEN直接加入溶化的凝胶中使用,只适用于琼脂糖凝胶电泳,不适用于PAGE。
1.将DNAGREEN直接加入到融化的琼脂糖凝胶中,每100mL凝胶加3-10uL DNAGREEN,混合均匀后倒胶。
琼脂糖凝胶中不能含任何其他染料(如EB和SYBR Green I,否则会相互干扰)。
核酸染料简介核酸染料是一种用于染色核酸(DNA和RNA)的化合物,常用于分子生物学实验中的核酸检测、分离和可视化。
核酸染料通常具有高亲和力,能够与核酸分子特异性地结合,并在染色后发出荧光信号,以便观察和测量核酸的存在和定量。
核酸染料在分子生物学领域中具有广泛的应用。
它们可以在凝胶电泳实验中用于可视化和分离DNA,也可用于定量PCR、蛋白质-核酸相互作用研究、细胞核酸染色和细胞核型分析等实验中。
常见的核酸染料1. 基于暗电荷色团的核酸染料基于暗电荷色团的核酸染料是最常见的核酸染料之一。
它们的分子结构中含有芳香环和氮碱基,能够与DNA或RNA 的磷酸二酯链发生静电吸引力作用。
常见的基于暗电荷色团的核酸染料有乙溴铵溴化物(EB)、溴化乙啶(EtBr)等。
这类染料通常呈现橙色到红色的荧光,可以与DNA或RNA 的碱基配对形成稳定的络合物。
它们在紫外-可见光谱中显示出特定的吸收峰,并能够发出强烈的荧光信号,使核酸在凝胶电泳实验中可视化。
然而,这些染料具有一定的毒性,对人体和环境有潜在危害。
2. 基于亮电荷色团的核酸染料基于亮电荷色团的核酸染料是近年来发展起来的一类新型核酸染料。
它们的分子结构中含有多个亮电荷基团,能够与DNA或RNA的排斥性电荷相互作用,实现与核酸的高亲和力结合。
常见的基于亮电荷色团的核酸染料有SYBR Green、SYBR Safe等。
这类染料通常呈现绿色的荧光,能够与DNA或RNA形成稳定的复合物,并显示出荧光增强效应。
相比基于暗电荷色团的染料,这些染料毒性较低,对人体和环境的危害较小。
它们在核酸检测、定量PCR等实验中得到了广泛应用。
3. 其他类型的核酸染料除了基于暗电荷色团和亮电荷色团的核酸染料,还存在其他类型的核酸染料。
例如,环形染料是一类由多环芳香烃环组成的染料,可用于核酸检测和荧光原位杂交实验。
还有一些特殊的核酸染料,如GelRed、GelGreen等,它们能够与DNA 或RNA的双链结合,在凝胶中呈现高亮度的荧光。
电泳后;核酸需经染色才能显色出带型;常用以下核酸染色剂:1.ethidium bromide; EB 最常用的核酸;这种扁平分子可嵌入核酸双链的配对碱基之间;在紫外线激发下;发出桔红色荧光..激发荧光的能量来源于两个方面;一是核酸吸收波长为260nm的紫外线后能将能量传送给;二是结合在DNA分子中的EB本身;主要吸收波长为300nm和360nm 的紫外线的能量;来源于这两方面的能量;最终激发EB发射出波长为590nm的可见光谱红橙区的红色荧光.. EB-DNA复合物中的EB发出的荧光;比游离的凝胶中的EB发出的荧光强度大10倍;因此无需洗净背景即可清楚观察核酸带型..若EB背景太深;可将凝胶浸泡于1mmol/LMgSO4中1h或10mmol/L MgCl2中5min;使非结合的EB褪色;这样可检查到10ng的DNA样品;EB也可用于检测或RNA;但其对单链核酸的亲和力相对较小;荧光产率也相对较低.. 在凝胶或电泳缓冲液中加入终浓度为0.5μg/ml的EB;染色可在电泳过程中进行;能随时观察核酸的迁移情况;这种方法使用于一般性的核酸检测..但EB带正电荷;嵌入碱基后增加了核酸分子的刚性;使迁移率减慢;故不宜用于测定核酸分子量的大小;这时应在电泳后将凝胶浸入0.5μg/ml的EB水溶液中10min进行染色..EB见光易分解;应于4℃避光保存..2.acridine orange;AO:吖啶橙可嵌入双链核酸碱基对之间;在254nm紫外线激发下发出530nm的绿色荧光;还通过静电与单链核酸的磷酸基结合;在254nm紫外线激发下产生640nm的红色荧光..因此可区分单链和双链核酸;灵敏度分别为0.1μg和0.05μg..但吖啶橙的染色操作要求严格;应在 22℃;0.01mol/LpH7.0中避光浸泡30min;然后在搪瓷盘中用该缓冲剂4℃脱色过夜或22℃脱色1~2小时..3.银Ag+试剂: Ag+与核酸形成稳定复合物;然后用甲醛使Ag+还原成银颗粒..AgNO3等试剂可使上的单链;及 RNA都染成黑褐色..银染法的灵敏度比EB染色高200倍左右;比染色高100~1000倍;在小于0.5mm厚的凝胶中;能检测出0.5ng的 RNA;其缺点是专一性不强;能与蛋白质;去污剂反应也产生褐色;而且对DNA的染色定量不准确..银与DNA稳定结合;对DNA有破坏作用;不适于DNA 片段回收的制备..4.亚甲蓝methylene blue:可将RNA染成蓝色;但灵敏度不高;而且操作时间长..染色过程:胶浸泡于0.02%的亚甲蓝;10mmol/L Tris-AcpH8.3;4℃放置1~2h;用净水洗5-8h反复换水;带型肉眼可见;最低检测量为 250ng..5.Gold View Ⅰ型核酸染色剂与溴化乙锭:Gold View是一种可代替溴化乙锭EB的新型DNA燃料;其灵敏度与EB相当;使用方法与之完全相同..在紫外灯下双链DNA呈现绿色荧光;而单链DNA成红色荧光..通过小鼠皮下注射实验;尚未发现Gold View有致癌作用;而溴化乙锭EB是一种强致癌剂..因此用Gold View代替EB不失为一种明智的选择..实验操作步骤:100mL溶胶液在微波炉中融化;冷却至60℃左右不烫手后加入10vL Gold View;轻轻摇匀后倒胶;待胶完全凝固后上样电泳;电泳完毕在紫外灯下观察..注意事项:1)胶厚度不要超过0.5cm;胶太厚会影响检测灵敏度2)加入Gold View的琼脂样凝胶反复融化可能会对DNA检测的灵敏度产生一定影响;但不明显..3)Gold View在pH 3.6-7.0之间能更好的与核酸结合;因此电泳时最好使用新鲜的电泳缓冲液..4)由于Gold View产生绿色荧光;因此不适合于用一般单色胶卷拍照;可以使用凝胶成像系统保存图像..5)含有Gold View的凝胶不适合于进行凝胶回收试验..要进行回收试验;请使用EB胶或supper GreenⅠ型核酸染色剂..6)Gold View特别适合于大片段DNA的检测大于1kb的片段;检测灵敏度与EB相当;当DNA片段小于1kb时;检测灵敏度低于EB;特别是低于500bp的片段;Gold ViewⅠ型可能亮度很弱或者检测不到;如要检测小片段的DNA;请选用supper GreenⅠ型核酸染色剂;该染色剂适合检测所有片段大小的DNA片段..7)虽然尚未发现Gold View有致癌作用;但由于Gold View溶液酸性较强;一次对皮肤;眼睛会有一定的刺激;操作是应戴手套..。
常见核酸染料选择浅析(李路军河南农业职业学院植物科学系河南郑州450000)摘要:由于只需简单温和的物理方法(光照)激发和检测,荧光染料是研究生物学微观世界特别是核酸时最常用的示踪工具之一。
DNA电泳后检测凝胶的EB大概是最为人熟知的荧光核酸染料。
除了染胶,荧光核酸染料还可用于荧光原位杂交中作为常见的复染剂。
下面比较一下在分子生物学实验和细胞学实验中常用的荧光染料。
关键词:核酸染料、EB、GeneFinder、Goldview、SYBER greenI、GelRed、GelGreen引言:作为生物体内的重要的大分子,核酸是研究生命现象与本质的物质基础,通过对它们的理化性质、复制与转录、表达与调控等的研究,可以了解生命有关的本质规律。
因此,对核酸的研究具有及其重要的意义。
但核酸肉眼不可见,对其的研究主要是借助一定的仪器来观察它的形态、大小、表达量,其中最常见的也是最简单的是琼脂糖凝胶电泳。
EB(溴化乙锭)是实验室最常用的核酸染料,有着简单、快速、灵敏度高的特点,但是由于其有着强烈的致突变能力和中度致癌性,对实验者和周围环境都有着较大的危害。
溴化乙锭(EB)是分子生物学实验室常用的一种核酸荧光染料。
但是,由于EB是一种强烈的致癌物,因此,如何消除EB对实验室的污染,是分子生物学实验室安全所必须面对的一个难题。
A bstract:Because only needs the simple temperate physical method(illumination)to stimulate and the examination,the fluorescent dye studies the biology microcosm is when specially the nucleic acid one of most commonly used tracing tools.After DNA electrophoresis,examines the gelatin EB is the fluorescence nucleic acid dye which probably the most person knew very well. Except dyes the rubber,the fluorescence nucleic acid dye may also use in the fluorescence home position hybrid taking the common counterstain.Following compares in the molecular biology experiment and the cytology experiment the commonly used fluorescent dye.Key word:Nucleic acid dye,EB,GeneFinder,Goldview,SYBER greenI,GelRed,GelGreenIntroduction:In the achievement organism's important macro-molecule,the nucleic acid is studies the biological phenomena and the essential material base,through to their physics and chemistry nature,the duplication and the duplication,the expression and the regulation and so on research,may understand the life related essence rule.Therefore,has and the vital significance to the nucleic acid research.But the nucleic acid naked eye is not obvious,is mainly draws support from certain instrument to its research to observe its shape,the size,the expression quantity,what most common is also the simple is the agarose gel electrophoresis.EB(bromination second grade spindle)is the laboratory most commonly used nucleic acid dye,has simply,fast,the sensitivity high characteristic,but because it has intense sends the sudden change ability and the moderatecarcinogenicity,has the big harm to the laboratory technician and the environment.Bromination second grade spindle(EB)is the molecular biology laboratory commonly used one kind of nucleic acid fluorescent dye.But,because EB is one kind of intense careinogen,therefore,how to eliminate EB to the laboratory pollution,is a difficult problem which the molecular biology laboratory security must face.1.EB核酸染料溴化乙锭(EB)是一种常规核酸染料,被广泛应用于观察、检测琼脂糖凝胶与聚丙烯酰胺凝胶中的DNA或RNA。
M5 6×Gelred Loading Buffer6×含gelred DNA上样缓冲液使用说明书产品名称单位货号M5 6×Gelred Loading Buffer 0.5ml MF830-01M5 6×Gelred Loading Buffer 5x0.5ml MF830-05【储存条件】2-8℃。
【产品简介】本产品在常规6×Loading Buffer中添加了Gelred染料,该染料是一种生物大分子,不能穿透细胞膜进入细胞内。
相对于EB的强诱变性,是一种安全无毒的核酸染料。
使用6×Gelred Loading Buffer替代原始Loading Buffer时,在制胶过程中无需加入EB等核酸染料,只需要将DNA与6×Gelred Loading Buffer混匀即可进行凝胶电泳。
由于Gelred 与EB具有相同的光谱特性,无需改变滤光片及观察装置,在正常紫外光激发检测即可,使用非常方便和灵活。
【注意事项】1.由于该染料只需在电泳前与DNA混匀,无需加入凝胶中,可使制备的凝胶保存时间更长。
2.由于Loading Buffer中染料的量远高于将染料加入凝胶中的量,对DNA的灵敏度更高。
【自备试剂】琼脂糖(聚合美MF103)TAE(聚合美MF143)/TBE(聚合美MF146)电泳缓冲液【操作步骤】1.配置合适浓度的琼脂糖凝胶。
2.吸取5 μl DNA样品与1 μl 6×Gelred Loading Buffer混匀后,直接电泳于上样孔内,进行常规电泳和图像采集。
向DNA Marker中添加1μl 本产品,在不加染料的TAE缓冲液配置的琼脂糖凝胶中的电泳图,从左到右主带上样量为(150 ng,75 ng)。
【备注】本产品仅供科研使用。
在确认产品质量出现问题时,本公司承诺为客户免费更换等量的质量合格产品。
gelred核酸染料原理GelRed是一种广泛应用于核酸染色的染料,具有非常高的敏感性和选择性。
它以其独特的性质在核酸分离和分析领域发挥着重要作用。
本文将详细介绍GelRed核酸染料的原理和性能。
GelRed是一种光亮荧光染料,能够通过荧光显微镜观察到核酸的染色效果。
它在核酸凝胶电泳和核酸柱层析等方法中广泛应用。
GelRed的化学结构是由两个类似乙笼的分子基团组成。
这两个分子基团通过一个杂环连接在一起,形成一个芳香环结构。
在荧光激发下,GelRed会发出强烈的红色荧光信号,以此实现核酸的检测和定量分析。
GelRed核酸染料的基本原理如下:1.静电相互作用:GelRed是一种阳离子染料,它的阳离子部分与DNA或RNA等核酸分子中的负电荷基团发生静电相互作用。
这种相互作用可以使GelRed紧密结合在核酸分子表面,形成稳定的染色复合物。
2.内部排斥作用:GelRed分子中的芳香环结构会与核酸分子中的碱基间成π-π相互作用。
这种π-π相互作用可以增强GelRed与核酸分子之间的结合力,使其更容易与核酸分子结合。
同时,GelRed的分子结构还使其在胶体中形成聚集状态,进一步增强了与核酸分子的结合。
3.荧光激发和发射:GelRed能够吸收短波长的紫外光激发,从而发射长波长的红色荧光。
这种荧光信号可以被荧光显微镜或荧光成像系统捕捉和记录。
GelRed的发射峰位于约620nm 处,这个波长非常适合于红色荧光成像。
GelRed核酸染料的优势和应用主要有以下几个方面:1.敏感性:GelRed是一种极其敏感的核酸染料,它可以检测到非常低浓度的核酸。
与传统的核酸染料相比,GelRed的检测灵敏度提高了数十倍。
这使得在核酸分析和定量实验中能够使用更少的样品和试剂,降低了成本和浪费。
2.选择性:GelRed对核酸具有很高的选择性,它能够与DNA 和RNA等核酸分子结合。
GelRed与DNA和RNA的结合有明显不同的荧光特性,可以通过荧光强度和荧光发射波长等特征来区分它们。
核酸染料成分核酸染料是一类广泛应用于生物学和化学领域的重要物质,其可以用来检测、标记和研究生物分子,如DNA和RNA。
核酸染料的成分多种多样,下面将介绍几种常见的核酸染料成分及其应用。
1. 乙溴蓝(Ethidium Bromide):乙溴蓝是一种常用的核酸染料,可以通过与DNA或RNA分子的双螺旋结构相互作用而发出荧光。
乙溴蓝主要用于琼脂糖凝胶电泳中的核酸分离和检测。
它可以在紫外光照射下与DNA分子结合并发出橙红色荧光,从而可以直观地观察到DNA分离带或RNA分离带。
2. SYBR Green:SYBR Green是一种常用的核酸染料,它与DNA或RNA结合后能发出绿色荧光。
SYBR Green广泛应用于实时荧光定量PCR(qPCR)技术中,用于检测和定量PCR反应体系中产生的DNA分子。
其优点是灵敏度高、特异性好,可以实时监测PCR反应的进程,并定量分析反应体系中的DNA含量。
3. GelRed:GelRed是一种相对较新的核酸染料,它具有与乙溴蓝类似的性质,但更加安全和稳定。
GelRed可以在琼脂糖凝胶电泳中用于检测和定量DNA或RNA分子。
与乙溴蓝相比,GelRed对生物体和环境的毒性更低,使用更加方便和安全。
4. Methylene Blue:亚甲基蓝是一种常用的核酸染料,可以通过与DNA或RNA分子的碱基相互作用而发出蓝色荧光。
亚甲基蓝可以用于琼脂糖凝胶电泳中的核酸分离和检测。
与乙溴蓝相比,亚甲基蓝对生物体和环境的毒性较低,但其荧光强度相对较弱。
5. acridine orange:吖啶橙是一种双功能核酸染料,可以发出绿色荧光或橙色荧光,具有荧光探针和核酸染色剂的双重作用。
吖啶橙可以用于细胞核酸的染色和细胞活力的检测。
在荧光显微镜下观察,吖啶橙可以染色细胞核酸,并显示出不同类型的细胞核和胞质。
6. Propidium Iodide:碘化丙啶是一种常用的核酸染料,主要用于细胞凋亡和细胞周期分析。
广东常用的核酸染料染色原理引言核酸染料是生物学和生物化学研究中常用的试剂,可以用于染色、可视化和分析核酸分子。
在广东地区,有几种常用的核酸染料,它们具有不同的染色原理和应用范围。
本文将介绍这些核酸染料的染色原理以及在实验中的应用。
常用的核酸染料在广东地区,常用的核酸染料主要包括EtBr(乙溴化孔雀石绿)、SYBR Green I (SYBR绿Ⅰ)、SYBR Safe(SYBR安全染色剂)和GelRed(凝胶红染料)。
以下将对每种核酸染料进行详细介绍。
二级标题:EtBr(乙溴化孔雀石绿)EtBr是一种经典的核酸染料,主要用于琼脂糖凝胶电泳中的DNA染色。
其染色原理是EtBr可以与DNA分子发生非共价相互作用,形成复合物,从而使DNA分子在紫外光下发出红色荧光。
EtBr的应用范围广泛,在DNA凝胶电泳中常用于检测DNA片段的大小和纯度。
尽管EtBr染色方便快速,但其对人体有潜在的毒性,需要小心操作和处理废液。
二级标题:SYBR Green I(SYBR绿Ⅰ)SYBR Green I是一种广泛应用于实时荧光定量PCR(real-time PCR)的核酸染料。
它的染色原理是SYBR Green I与双链DNA结合后发出绿色荧光信号,可以实时监测PCR产物的扩增过程。
SYBR Green I在实时PCR中广泛应用,其优点是灵敏度高、成本低、操作简单。
然而,SYBR Green I对于非特异性PCR产物也会产生荧光信号,因此需要结合熔解曲线分析来确定PCR产物的特异性。
二级标题:SYBR Safe(SYBR安全染色剂)SYBR Safe是SYBR Green I的一种改良型核酸染料,其染色原理与SYBR Green I类似,都是与DNA结合发出荧光信号。
与SYBR Green I相比,SYBR Safe对人体和环境的影响更小,更安全。
SYBR Safe广泛应用于琼脂糖凝胶电泳中的核酸染色,可以代替EtBr。
常用的核酸染料
核酸染料是用于检测DNA和RNA分子的荧光染料。
在生物医学研究和诊断中,常用的核酸染料包括以下几种:
1. 基于亚甲基蓝的染料:如Ethidium bromide(EB)和SYBR Green。
EB进入DNA分子中,使其发生荧光,SYBR Green则可以与DNA结合形成荧光复合物。
这些染料广泛应用于凝胶电泳,PCR检测和细胞成像等领域。
2. 基于Cy系列染料的染料:如Cy3和Cy5。
这些染料具有较高的荧光强度和稳定性,广泛应用于荧光原位杂交和蛋白质-核酸相互作用研究等领域。
3. 基于蓝莓素的染料:如Hoechst 33258。
这些染料可以与DNA 结合形成荧光复合物,常用于染色体染色和细胞核染色等领域。
4. 基于荧光素的染料:如Fluorescein和Tetramethylrhodamine(TMR)。
这些染料具有高荧光强度和较短的激发波长,广泛应用于DNA测序和细胞成像等领域。
总的来说,选择合适的核酸染料要根据实验需要和染料的特性进行考虑。
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核酸染料!EB?Gelred?你还有其他选择!
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本人郑重推荐两款全进口核酸染料有两个分类,全都是安全无毒的花青类的染料。
第一类:RS-138Safe DNA Stain(核酸安全染色剂)
1经Ames-test测试,不透过细胞膜,安全无毒,美国认证;
2与EB使用方法一致,灵敏度高,在紫外光及蓝光下均可观察实验结果,发出绿色荧光,效果好;
3耐热,可加在缓冲液里,100℃溶解凝胶,防止染色剂没充分混匀;
4电泳时染色均匀,靠近负极凝胶和靠近正极端的亮度一样;
5稳定性好,不像EB、Goldview放久(一天)了会淬灭,电泳时间过长(>30min)会变暗;
6含有Safe DNA Stain的琼脂糖凝胶在4℃可存放7天;
7无毒性,不进入细胞内,是花菁染料成分;
8EB替代品,与之使用方法一样,可前染,可后染
第二类:Red/Green Safe DNA Loading Dye特色:
1安全无毒(Ames-test污染物致突变性检测),可替代EB;
2电泳时有3条指示带:蓝(4000bp),紫(300bp),黄(50bp),一般的只含有两种
3无需添加额外的上样液,只需将本品与DNA按1:5的比例混合直接上样即可;
4在紫色或蓝色荧光灯下均可视,条带清晰、明亮;
5Red Safe DNA Loading Dye显示红色荧光,Green Safe DNA Loading Dye显示绿色荧光。
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