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Section A 细胞与大分子简述复杂大分子的生物学功能及与人类健康的关系。
Section C 核酸的性质1.DNA的超螺旋结构的特点有哪些？A 发生在闭环双链DNA分子上B DNA双链轴线高卷曲，与简单的环状相比，连接数发生变化C 当DNA扭曲方向与双螺旋方向相同时，DNA变得紧绷，为正超螺旋，反之变得松弛为负超螺旋。
自然界几乎所有DNA分子超螺旋都为负的，因为能量最低。
2.简述核酸的性质。
A 核酸的稳定性：由于核酸中碱基对的疏水效应以及电荷偶极作用而趋于稳定B 酸效应：在强酸和高温条件下，核酸完全水解，而在稀酸条件下，DNA的核苷键被选择性地断裂生成脱嘌呤核酸C 碱效应：当PH超出生理范围时（7-8），碱基的互变异构态发生变化D 化学变性：一些化学物质如尿素，甲酰胺能破坏DNA和RNA二级结构中的而使核酸变性。
E 粘性：DNA的粘性是由其形态决定的，DNA分子细长，称为高轴比，可被机械力和超声波剪切而粘性下降。
F 浮力密度：1.7g/cm^3,因此可利用高浓度分子质量的盐溶液进行纯化和分析G 紫外线吸收：核酸中的芳香族碱基在269nm 处有最大光吸收H 减色性，热变性，复性。
思考题：提取细菌的质粒依据是核酸的哪些性质？质粒是抗性基因，，在基因组或者质粒DNA中用碱提取法。
Sectio C 课前提问1.在 1.5mL的离心管中有500μL，取出10 μL稀释至1000 μL后进行检测，测得A260=0.15。
问（1）：试管中的DNA浓度是多少？问（2）：如果测得A280=0.078, .A260/A280=？说明什么问题？(1)稀释前的浓度：0.15/20=0.0075稀释后的浓度：0.0075/100=0.75ug/ml（2）0.15/0.078=1.92〉1.8，说明DNA中混有RNA样品。
2.解释以下两幅图（native:非变性的；denatured:变性的）图一表示dsDNA和RNA的热变性，中间的Tm值表示解链温度。
真核生物转录元件组成及其分类
真核生物转录元件是指在基因转录过程中与RNA聚合酶和调控因子结合的特定DNA序列，用于调控基因的转录。
它们包括启动子、增强子、沉默区和辅助区等。
1. 启动子：启动子位于基因的转录起始点上游，这是RNA聚合酶与DNA结合的起点。
启动子中一般包含TATA盒子和CAAT盒子等特定DNA序列，它们可以吸引转录因子与RNA聚合酶II结合并激活基因的转录。
2. 增强子：增强子位于启动子上游，它们可以增强启动子的活性，从而提高转录速率。
增强子一般由多个转录因子结合而成，它们可以通过相互作用来协同作用，实现调控基因的转录。
3. 沉默区：沉默区位于基因的转录起始点下游，它们可以阻止RNA聚合酶的结合，从而抑制基因的转录。
沉默区一般包括转录终止位点和多个转录抑制因子结合的DNA序列。
4. 辅助区：辅助区分布在基因的远端、内含子和外显子中，它们可以调节基因的表达水平和组织特异性。
辅助区包括增强子和增强子类似物，它们可以通过转录因子结合来调控基因的转录。
根据其作用和位置的不同，转录元件可以分为启动元件、增强元件和沉默元件等。
启动元件包括启动子和促进元件，主要用于启动基因的转录。
增强元件包括增强子和增强子类似物，主要用于增强基因的表达。
沉默元件包括沉默区和抑制元件，主要用于抑制基因的转录。
转录因子基因转录有正调控和负调控之分。
如细菌基因的负调控机制是当一种阻遏蛋白(repressor protein)结合在受调控的基因上时，基因不表达；而从靶基因上去除阻遏蛋白后，RNA聚合酶识别受调控基因的启动子，使基因得以表达，这是正调控。
这种阻遏蛋白是反式作用因子。
而顺式作用因子则指的是基因上与反式作用因子结合的对基因表达起调控作用的基因序列。
转录因子(transcription factor)是起正调控作用的反式作用因子。
转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。
真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态，RNA聚合酶自身无法启动基因转录，只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后，基因才开始表达。
转录因子的结合位点（transcription factor binding site，TFBS）是转录因子调节基因表达时，与mRNA结合的区域。
按照常识，转录因子（transcription factor，TF）的结合位点一般应该分布在基因的前端，但是，新的研究发现，人21和22号染色体上，只有22％的转录因子结合位点分布在蛋白编码基因的5'端。
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。
一种蛋白质是不是转录机构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所必须的。
一般可将这些转录所需的蛋白质分为三大类：(1)RNA聚合酶的亚基，它们是转录必须的，但并不对某一启动子有特异性。
(2)某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复合物，但不组成游离聚合酶的成分。
这些因子可能是所有启动子起始转录所必须的。
但亦可能仅是譬如说转录终止所必须的。
但是，在这一类因子中，要严格区分开哪些是R NA聚合酶的亚基，哪些仅是辅助因子，是很困难的。
(3)某些转录因子仅与其靶启动子中的特异顺序结合。
如果这些顺序存在于启动子中，则这些顺序因子是一般转录机构的一部分。
如果这些顺序仅存在于某些种类的启动子中，则识别这些顺序的因子也只是在这些特异启动子上起始转录必须的。
真核生物的转录因子专项文档一、转录因子的定义和作用转录因子是一类控制基因表达的蛋白质，它们能够与基因的DNA序列结合，并调控基因的转录过程。
转录因子在真核生物中起着关键的作用，它们能够决定细胞的命运和特化，调控细胞周期和分化，以及响应环境刺激等。
二、转录因子的分类转录因子可分为两大类：顺式调控因子和择性调控因子。
顺式调控因子与DNA的特定序列结合并激活或抑制转录过程，而择性调控因子通过与其他蛋白质和共调控因子的相互作用来调控基因的表达。
顺式调控因子又分为激活基因表达的激活子和抑制基因表达的抑制子。
激活子通过与RNA聚合酶结合来促进转录的发生，而抑制子则与转录复合体的组分相互作用，阻碍转录的进行。
择性调控因子根据其调控机制的不同，可分为组蛋白修饰调控因子、染色体剪接调控因子和基因启动调控因子等。
组蛋白修饰调控因子通过修饰染色体上的组蛋白来调控基因的表达。
染色体剪接调控因子参与基因的剪接过程，影响基因的转录结果。
基因启动调控因子是一类与转录启动复合体相互作用的因子，它们能够促进或抑制转录的发生。
三、转录因子的结构和功能域转录因子的结构通常包括DNA结合结构域、转录激活结构域和转录抑制结构域等。
DNA结合结构域使得转录因子能够与基因的DNA序列结合。
转录激活结构域能够与转录启动复合体相互作用，并激活转录的发生。
转录抑制结构域则可以与其他转录因子或转录启动复合体相互作用，并抑制转录的进行。
四、转录因子的调控机制转录因子的调控机制非常复杂，涉及到信号转导通路、组蛋白修饰、DNA甲基化等多种调控方式。
转录因子的活性和稳定性可以通过磷酸化、去磷酸化、泛素化等化学修饰方式来调节。
此外，染色质的状态和结构也对转录因子的调控起着重要的作用。
五、典型的转录因子家族真核生物中存在许多转录因子家族，其中一些家族在不同物种中高度保守。
例如，家庭基因家族（homeobox gene family）编码一类在胚胎发育过程中起关键作用的转录因子。
