南开大学化学学院教师信息
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学 报Journal of China Pharmaceutical University 2023,54(6):674 - 681674蛋白质糖基化修饰的非变性构象分辨质谱研究进展贾翼菲1,王雅梅1,李功玉1,2*(1南开大学化学学院,分析科学研究中心,天津市生物传感与分子识别重点实验室,天津 300071;2物质绿色创造与制造海河实验室,天津 300192)摘 要 糖基化是蛋白质最重要的翻译后修饰之一,能够调控蛋白质的电荷态、结构及分子间相互作用等,进而影响其功能。
糖基化的高度异质性导致传统的结构解析方法很难对糖蛋白进行全面表征。
随着分析技术的发展,质谱在糖蛋白结构解析中发挥了重要作用。
蛋白质组学质谱技术可在多肽水平上对复杂、低丰度蛋白质糖基化修饰的化学组成与位点信息进行鉴定。
非变性质谱技术(native mass spectrometry,nMS)则直接在完整蛋白水平上揭示聚糖异质性及其对蛋白高级结构和相互作用的调控效应。
作为结构质谱的代表性技术,基于离子淌度的nMS受益于离子淌度仪的构象分辨能力和构象去折叠功能,能够在非变性质谱的基础上提供离子的三维动态结构信息,为异构体结构快速鉴定提供不可替代的解决方案。
本文重点介绍了两种新兴离子淌度质谱技术,即非变性动态构象分辨质谱技术和糖型分辨结构质谱技术,并以3种常见蛋白体系为例,介绍其在糖蛋白构象研究领域的最新进展。
关键词蛋白糖基化;非变性质谱技术;构象分辨质谱;离子淌度质谱;碰撞诱导去折叠中图分类号R363 文献标志码 A 文章编号1000 -5048(2023)06 -0674 -08doi:10.11665/j.issn.1000 -5048.2023060901引用本文贾翼菲,王雅梅,李功玉.蛋白质糖基化修饰的非变性构象分辨质谱研究进展[J].中国药科大学学报,2023,54(6):674–681. Cite this article as:JIA Yifei,WANG Yamei,LI Gongyu. Recent progress of protein glycosylation characterization utilizing native conformer-resolved mass spectrometry[J].J China Pharm Univ,2023,54(6):674–681.Recent progress of protein glycosylation characterization utilizing native conformer-resolved mass spectrometryJIA Yifei1, WANG Yamei1, LI Gongyu1,2*1Tianjin Key Laboratory of Biosensing and Molecular Recognition, Research Center for Analytical Science, College of Chemistry, Nankai University, Tianjin 300071; 2Haihe Laboratory of Sustainable Chemical Transformations, Tianjin 300192, China Abstract Glycosylation of proteins, one of the most prevalent and complex post-translational modifications occurring in nature, plays a crucial role in regulating protein net charge, conformation, binding properties and, ultimately, biological function.Traditional structural techniques are not amenable for glycoproteins due to the inherent heterogeneity of oligosaccharides.With the advances in analytical technique, mass spectrometry dis⁃plays an increasingly crucial role in elucidating the structure of glycoproteins.Mass spectrometry-based pro⁃teomic technique can dissect the chemical composition and site information of low-abundance glycosylation at the peptide level.Instead, native mass spectrometry (nMS) can analyze intact glycoproteins while maintaining the information for glycan heterogeneity, and the insights into the regulatory effects of glycosylation on protein higher order structures and interactions with other proteins or ligands.As a representative structural mass spectrometry tool, ion mobility-based nMS strategy is powered by its conformer-resolving capability and by the feasibility of conformer manipulation through collision-induced unfolding.Consequently, native IM-MS analysis can provide rich information of dynamic protein conformations, allowing for the rapid identification and differ⁃收稿日期2023-06-09 *通信作者Tel:159****1043E-mail:ligongyu@基金项目国家自然科学基金资助项目(No.22104064,No.22293030,No.22293032);国家重点研发计划青年科学家项目资助(No.2022YFA1305200)第 54 卷第 6 期贾翼菲,等:蛋白质糖基化修饰的非变性构象分辨质谱研究进展entiation of protein isoforms in an unprecedented manner.In this review, we briefly introduced two emergingnative IM -MS analytical modes, dynamic conformer -resolving mode and glycoform -resolving mode.Besides, we also discussed the recent progress of conformational and topological characterization of intact glycoproteins with three typical model systems based on two above -mentioned emerging modes of native IM -MS.Key words protein glycosylation; native mass spectrometry; conformer -resolving mass spectrometry; ion mobili⁃ty -mass spectrometry; collision -induced unfoldingThis study was supported by the National Natural Science Foundation of China (No.22104064, No.22293030, No.22293032) and the National Key R&D Program of China (No.2022YFA1305200)糖基化(glycosylation )是一种普遍且重要的翻译后修饰类型,在调控蛋白结构、信号传导、免疫应答、胚胎发育等过程中发挥重要作用[1]。
ISSN^l 002-4956 CN11-2034/T实验技术与管理Experimental Technology and Management第38卷第3期202丨年3月Vol.38 No.3 M ar. 2021DOI: 10.16791/ki.sjg.2021.03.023 T型旋光管的研制及其在实验教学中的应用张业云,王彦美,樊玲,尚贞锋(南开大学化学学院化学国家级实验教学示范中心,天津300071)摘要:蔗糖水解反应是经典的物理化学实验之一,常以旋光法测定其反应速率常数和活化能该文针对实验教学过程中发现的原装旋光管恒温效果不佳等问题,研制了T型旋光管该管一体成型,可避免试液渗漏.提高实验安全性;其恒温夹套全包覆,可加强恒温效果,减小实验误差;漏斗式的加样口便于操作,可提高实验效率,.该T型旋光管已应用于该校的物理化学实验教学中,取得了良好的教学效果.关键词:旋光管;蔗糖水解;实验教学中图分类号:06-32 文献标识码:A 文章编号:1002-4956(2021)03-0113-03Development of T-shaped polariscope tube andits application in experimental teachingZHANG Yeyun,WANG Yanmei,FAN Ling,SHANG Zhenfeng(National Demonstration Center for Experimental Chemistry Education, College of Chemistry,Nankai University, Tianjin 300071, China)Abstract: Sucrose hydrolysis is one of the classical physical chemistry experiments. The reaction rate constant and activation energy of sucrose hydrolysis are often determined by polarimetry. Aiming at the problems found in the course of experimental teaching, the T-shaped polariscope tube has been developed. It is fonned in one piece to avoid liquid leakage and improve the safety of the experiment. The constant temperature jacket is fully covered, which can enhance the constant temperature effect and reduce the experimental error. The funnel type sampling port is easy to operate and can improve the experimental efficiency. The T-shaped polarizer has been applied to the physical chemistry experiment teaching in the university and achieved good teaching effect.Key words: polariscope tube; sucrose hydrolysis; experimental teaching蔗糖水解反应是物理化学实验中最经典的动力学 实验内容之一 [1<。
南开大学卜显和:多孔配位聚合物的发展历程及研究进展2020-01-04以下文章来源于中国科学杂志社,作者中国科学:化学多孔配位聚合物(PCP)(包括金属有机框架)是一类由金属节点和配体通过配位键连接形成的晶态多孔材料。
作为一类新兴的无机-有机杂化材料, PCP具有丰富且可调节的结构和功能, 因此其在气体吸附分离、催化、传感等诸多领域展现出巨大的应用潜力, 是多学科交叉的研究热点。
南开大学化学学院卜显和教授课题组近期在《中国科学:化学》发表评述,依据PCP的结构及性质特点,总结了第一至第四代多孔配位聚合物PCP研究的发展历程, 介绍了该领域的主要研究内容和典型研究进展, 进而基于该领域未来面临的挑战和发展趋势分析了材料的实用化前景。
近年来, 多孔配位聚合物(porous coordination polymer, PCP) (包括金属有机框架(metal-organic framework, MOF))的研究方兴未艾。
PCP是由金属节点(金属离子或金属簇)和有机连接体通过配位键自组装形成的具有无限网络结构的材料。
其作为配位超分子化学的一个重要组成部分, 与无机化学、有机化学、晶体工程、拓扑学、材料化学及固态化学等领域相互交叉、渗透, 现已成为化学和材料领域的研究热点之一。
相较于传统的无机多孔材料(如沸石分子筛、微孔二氧化硅), PCP具有结构和组成多样、结构可设计、孔道可调节和易于功能化的优点。
因此, 这类材料在吸附分离、催化、检测、磁性以及光电等领域展现出巨大的应用价值和潜力。
按照PCP的发展历程和属性对其进行的分类根据剑桥晶体数据中心的统计, 1972~2016年, 约有7万例可被定义为MOF的新结构被合成, 对应的可定义为PCP的化合物的数量更加庞大。
基于PCP数量的急剧增长, 相关研究论文的发表数量也在逐年递增。
与此同时, 涉及PCP材料的研究领域不断扩大。
目前PCP的研究热点主要集中在以下5个方面。
1 关于联系导师
初试前不要联系导师,初试结果出来后,如果情况不错,尽快联系自己感兴趣的导师
南开分析化学导师如下:
博士生导师:严秀平李一峻邵学广蔡文生董襄朝李文友孔德明陈朗星尹学博张玉奎(兼职)刘定斌
硕士生导师:沙伟南唐安娜王荷芳刘玉萍夏炎林深
分析化学/应用化学:
硕士生导师:于奡乔园园张明涛张卫东
2关于真题
做最近10年的真题即可,10年前的题型和现在不一样,浪费时间,又没有参考价值。
南开真题,网上没有官方答案,最好找一个已经考过的学长,学姐的真题答案,可信度比较高。
3关于参考书
一定要看南开指定书目,并认真做课后习题
4关于数学
考数学有风险也有好处
风险:考场上,容易因为紧张而不能开通思路,最终成绩90分以下。
这种情况很多,一定要调整好心态。
好处:如果复试不成功,可以在南开大学化学学院内调剂专硕,难度不大。
5 关于补充资料
1)中科院真题库,有空尽量做
2)考研指津,一定要做,最好熟练到可以背诵,每年的南开真题与它有极高的重复率。
6 我的真题,参考资料都是从一个已经考上南开的学姐那买来的,如有需要购买,请联系QQ: 2858488949。
南开大学化学学院2012年招收在职攻读材料工程、化学工程硕士专业学位研究生简章南开大学化学学科由我国化学界的前辈邱宗岳与杨石先教授等创建于1921年,经老一辈科学家及几代南开化学人80年的努力,已建设成为我国化学教学和科研的重要基地,是为我国历史最悠久、规模最大、学科门类最齐全和实力最雄厚的化学专业学院之一。
化学学院有占地 2万余平方米的实验室。
目前承担着理、工、农、医四个门类11个学科专业的教学、科研任务,正在进行国家和天津市220多项重大科研基金9000多万元的研发工作。
学院师资力量雄厚,有近400名教职工,其中包括多名中科院院士、工程院院士、长江学者特聘教授,拥有一支高水平的中青年学术队伍。
南开大学整合新材料领域的优势力量,于1999年创立了“材料物理与化学”学科, 2001年获得“材料物理与化学”工学硕士学位授予权,2003年获得工学博士学位授予权,2006年“材料物理与化学”评为天津市重点学科。
材料工程是研究、开发、生产和应用金属材料、无机非金属材料、高分子材料和复合材料等的工程领域。
主要研究方向有能源材料、催化材料、纳米材料、环境材料、复合材料、低碳材料等。
化学工程以南开大学应用化学学科为支撑,在充分组合分析化学、有机催化、精细化工等学科的基础上,进一步向功能化合物设计合成、化工过程中的质量控制与分析测试、工业催化、生物化工等实际应用方向倾斜,主要研究方向有:现代分离分析技术与应用、计算机与信息处理技术在化工领域的应用、功能分子的设计与应用、精细化工产品的研制与开发等。
材料工程和化学工程硕士专业学位均是与工程领域任职资格相联系的专业性学位,侧重于工程应用,主要是为企业、设计研究单位和事业单位培养应用型、复合型高层次工程技术和工程管理人才。
一、招收专业及代码1、材料工程0852042、化学工程085216二、招生名额自定三、报考条件具备以下条件之一的在职工程技术或工程管理人员,或在学校从事工程技术与工程管理教学的教师可以报考:1、2009年7月31日前获得学士学位。
化学学院教师系列⾼级专业技术职务评聘业务条件-南开⼤学化学学院化学学院教师系列⾼级专业技术职务评聘业务条件的规定为完善学院教师专业技术职务评聘制度,提升⼈才队伍整体⽔平,促进化学学科的发展,建设真正意义的国际⼀流化学学科,形成南开化学品牌的学术影响⼒,规范教师系列⾼级专业技术职务评聘业务条件,在《关于印发<南开⼤学教师系列专业技术职务评聘条件的规定>的通知》(南发字〔2005〕149号)和《关于印发<南开⼤学教师系列⾼级专业技术职务评聘业务条件的规定>的通知》(南发字〔2012〕12号)的基础上,学院对申请晋升教师系列⾼级专业技术职务的教师任现职以来的教学科研能⼒与学术成果⽔平做出规定,凡达到如下要求者⽅具备报名资格:⼀、副教授1.对本学科具有⽐较系统⽽坚实的理论知识和较丰富的教学经验。
系统讲授过⼀门本科基础课(68学时以上)或者两门以上的其他课程(⼀般授课34学时/门),教学效果较好。
2.在本学科国际学术刊物上,以南开⼤学为第⼀完成单位,以通讯作者或第⼀作者发表⾼⽔平学术论⽂4篇(含)以上,其中2篇发表在《化学学院⼆级学科权威国际学术期刊⽬录》(详见附件⼀)收录的期刊上。
3.此外还须具备下述条件中的⼀项:(1)获得省部级教学或科研成果⼆等以上奖励1项(排名前⼆);或获得校级教学成果奖励2项(排名第⼀)。
(2)主持1项国家级科研项⽬。
⼆、副研究员1.具备本学科较系统坚实的基础理论和专业知识,具有指导和组织课题组进⾏研究⼯作的能⼒,能创造性地进⾏研究⼯作,解决科研⼯作中较为复杂或有重要意义的理论问题或技术问题。
2.在本学科国际学术刊物上,以南开⼤学为第⼀完成单位,以通讯作者或第⼀作者发表⾼⽔平学术论⽂5篇(含)以上,其中3篇发表在《化学学院⼆级学科权威国际学术期刊⽬录》(详见附件⼀)收录的期刊上。
3.此外还须具备下述条件中的⼀项:(1)获得省部级教学或科研成果⼆等以上奖励1项(排名前⼆);或获得校级科研成果奖励2项(排名第⼀)。