微生物命名

引言概述：微生物是指在显微镜下可见但肉眼无法观察到的微小生物。

由于微生物的种类繁多，为了对其进行分类和命名，国际微生物学会推出了一套严格的命名规则，即国际微生物命名法规。

本文将详细介绍微生物命名规则，并对其重要性及应用进行分析。

正文内容：1.有机体命名的基本原则：1.1.一名一物：每个已知的微生物应有一个唯一的学名，用以准确标识该微生物。

1.2.优先性：优先默认使用最早描述命名的学名。

若有新的描述被证明与旧描述不同，则新描述的学名将取代旧描述的学名。

1.3.通用名称：学名应尽量避免使用通用名称，以免造成混淆和不确定性。

2.微生物分类级别：2.1.域：根据细胞生物化学和基因组特征将微生物划分为细菌域、古菌域和真核域。

2.2.界：将微生物根据生物形态和生态位特征进一步分成多个界，如细菌界、病毒界等。

2.3.门：介于界和纲之间，将具有相似特征的微生物分为不同门。

2.4.纲：按照细胞形态、代谢类型等特征，将微生物分为不同的纲。

2.5.目：根据细胞及生活方式特征，将微生物分为目。

2.6.科：将具有相似特征的微生物分为科。

2.7.属：相对较小的分类单元，将具有相似性状和遗传特征的微生物分为属。

2.8.种：最小的分类单位，根据生物学特征将微生物分为不同种。

3.个体级别的命名规则：3.1.属名和种加词：微生物的学名由属名和种加词组成，属名首字母大写，种加词全小写，斜体。

3.2.拉丁文命名：微生物的学名一般采用拉丁文进行命名，以确保全球科学界在交流时具有统一的语言和命名规范。

3.3.学名缩写：微生物的学名可以进行缩写，以方便学术交流和出版物的撰写。

缩写应符合国际微生物命名法规。

4.命名的方法和来源：4.1.形态学命名法：根据微生物的形态特征进行命名，如球菌、棒状菌等。

4.2.gen.nov.种：当新株微生物的基因组特征与已知属的微生物有所不同，但又达不到新属的标准时，可以使用gen.nov.种进行命名。

4.3.命名纪念：根据命名者的名字或相关事物进行命名，以表达对先驱科学家或研究领域的尊重和纪念。

细菌得分类与命名细菌分类学细菌分类学（ｔaｘｏｎomy）就是指对细菌进行分类、命名与鉴定得一门学科。

它得任务就是在全面了解细菌得生物学特征得基础上,研究它们得种类，探索其起源、演化以及与其她类群之间得亲缘关系，进而提出能反映自然发展得分类系统，并将细菌加以分门别类.它包括三个方面：分类(claｓsificatiｏn）、命名（ｎomencｌature)与鉴定（iｄentiｆicatｉoｎ)。

一、基本概念1、细菌分类就是根据每种细菌各自得特征,并按照它们得亲缘关系分门别类,以不同等级编排成系统。

分类有两种:①以细菌得形态与生理生化特性为依据得表型特征分类法，包括有传统分类法（classicａｌclassｉｆｉcａｔiｏｎ)与数值分类法(numeｒiｃａl clasｓifｉcatｉｏn）;②用化学分析与核酸分析，以细菌大分子物质(核酸、蛋白质）结构得同源程度进行分类称种系分类(phylogenetic ｃｌassｉficaｔｉoｎ）或自然分类（natural cｌassfｉcａtioｎ）。

2、细菌命名在分类基础上,给予每种细菌一个科学名称，使之在生产实践、临床实践与科学研究工作中相互交流成为可能。

按照细菌命名得法规，能保证所有得科研工作者以同样方式给予细菌命名。

3、细菌鉴定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适当位置与已知细菌比较其相似性，用对比分析方法确定细菌得分类地位。

若与已知细菌相同即采用已知菌得名称,不同者则按命名原则确定一个新名称。

二、分类等级细菌得分类等级与其她生物相同，依次为界(kinｇdom）、门(divｉsiｏn）、纲（cｌass）、目(order)、科(fａmilｙ）、属（genus）、种（species）。

细菌属于原核生物界（procarｙoｔae），包括有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体与螺旋体.分类等级拉丁字尾比较固定，表示方法如下:目—aｌeｓ、亚目-ｉneae、科-aceae、亚科—oideａae、族—eａe、亚族-inａe。

有关微生物名称的一些说明微生物是生物界中的一大门类，其形态微小、种类繁多，且分布于世界多个地域，倘若“各行其是”，各自定名，势必造成名称上的混乱，因此，必须要有一个统一的命名方法。

其命名法是遵循著名的瑞典植物学家Linneaus 的“双名制”原则。

命名后的名称，即为学名。

以下几点说明旨在为作者标引微生物名称时，有助于对其中的斜体和正体进行区分。

“双名制”就是用两个拉丁文（古代罗马人所用文字，相当于我国古文）组成一个名字，前一拉丁文是属名，词首字母必须大写，后一拉丁文是种名，一律小写。

在印刷时，学名用斜体字。

如Staphylococcus aureus，前一个词是“葡萄球菌属”，后一个词是“金黄色”的意思。

其“双名制”正像我们自己的姓名一样，前面冠以父姓，后面随之则是自身的名字。

如上所述，由于微生物种类繁多，往往会发生同菌异名或同名异菌的情况。

为避免引起混乱，在拉丁文双名之后，有时还附上命名人的人名及其发表年份，或分离和发现此菌的地点。

命名人的人名或地点一律用正体。

如金黄色葡萄球菌的学名全称为“Staphylococcus aureus Bergey,1939”；又如柿饼醋杆菌的全称为“Acetobacter hoshigaki Takahashi et Asai”。

学名后人名及发表年份，或分离和发现此菌的地点，在一般应用时常省略。

有时在述及某种微生物时，只提到它的属，不需提哪一个具体的种，或者此菌只有属名，而无种名时，就在属名后加“sp.”或“spp.”表示，如Streptococcus sp.和Flavopaeterium spp.表示链球菌属内的微生物和黄杆菌属内的一些微生物的意思。

“sp.”表示单数，“spp.”表示复数，两者都是种（species）的缩写。

“sp.”或“spp.”则用正体。

种是微生物分类学上的基本单位，种是代表一群在形态上和生理方面彼此非常相似或性状间差别微小的个体。

变种（variety）是指一个微生物的种的某些特性已起明显的改变，当然这种特性的改变是与过去人们从自然界分离获得的菌种所描述的特性相比较而言的，而且这种变异的特性又是比较稳定的，我们就把这种变异的菌种，称之为变种，如粪链球菌（Treptococcus faecalis）的液化变异菌种，就称为粪链球菌液化变种（Treptoccus faecalis var. liguefaciens）, 其中“var.”是“variety ”的缩写，则用正体。

1、微生物是如何命名的？举例说明答：微生物的命名是采用生物学中的二名法，即用两个拉丁字命名一个微生物的种，这个种的名字是由一个属名和一个种名组成，属名和种名都用斜体表示，属名在前，用拉丁文名词表示，第一个字母大写。

种名在后，用拉丁文的形容词表示，第一个字母小写。

如大肠埃希氏杆菌的名字是Escherichia coli2、写出大肠埃希氏杆菌和枯草杆菌的拉丁名全称答：大肠埃希氏杆菌的名称是Escherichia coli枯草杆菌的名称是Bacillus subtilis3、微生物有哪些特点答：（1）个体极小：微生物的个体极小，有几纳米到几微米，要通过光学显微镜才能看见，病毒小于0.2微米，在光学显微镜可视范围外，还需要通过电子显微镜才可看见（2）分布广，种类繁多：环境的多样性如极端高温，高盐度和极端PH造就了微生物的种类繁多和数量庞大（3）繁殖快：大多数微生物以裂殖的方式繁殖后代，在适宜的环境条件下，十几分钟至二十分钟就可繁殖一代。

在物种竞争上取得优势，这是生存竞争的保证。

（4）易变异：多数微生物为单细胞，结构简单，整个细胞直接与环境接触易受外界环境因素影响，引起遗传物质DNA的改变而发生变异。

或者变异为优良菌种，或使菌种退化。

4、细菌有哪几种形态?各举一种细菌为代表。

答：细菌有四种形态：球状，杆状，螺旋状和丝状。

分别叫球菌，杆菌，螺旋菌和丝状菌。

球菌：金黄色葡萄球菌，杆菌：芽孢杆菌，螺旋菌：弧菌，丝状菌：铁丝菌5、叙述革兰氏染色的机制和步骤。

答：机制：①革兰氏染色与细菌等电点有关②革兰氏染色与细胞壁有关步骤：1在无菌操作条件下，用接种环挑取少量细菌于干净载玻片上涂布均匀，固定。

2用草酸结晶紫染液1分钟，水洗。

3用碘-碘化钾媒染1分钟，水洗。

4用中性脱色剂（如乙醇）脱色，革兰氏阳性菌不褪色仍呈紫色，格兰仕阴性菌褪色，呈无色。

5用蕃红染液复染1分钟，革兰氏阳性菌仍呈紫色，格兰仕阴性菌呈红色。

革兰氏阳性菌与格兰仕阴性菌及被区别开来6、细菌有哪些一般结构和特殊结构？它们各有哪些生理功能？答：细菌是单细胞生物。

细菌的分类与命名-微生物命名规则细菌的分类与命名细菌分类学细菌分类学 (taxonomy)就是指对细菌进行分类、命名与判定的一门学科。

它的任务就是在全面认识细菌的生物学特色的基础上,研究它们的种类 ,探究其发源、演化以及与其她类群之间的亲缘关系,从而提出能反应自然发展的分类系统,并将细菌加以分门别类。

它包含三个方面:分类 (classification)、命名 (nomenclature)与鉴定 (identification) 。

一、基本观点1、细菌分类就是依据每种细菌各自的特色,并依照它们的亲缘关系分门别类 ,以不一样样级编排成系统。

分类有两种 :①以细菌的形态与生理生化特征为依照的表型特色分类法 ,包含有传统分类法 (classical classification)与数值分类法(numerical classification);②用化学剖析与核酸剖析,以细菌大分子物质 (核酸、蛋白质 )构造的同源程度进行分类称种系分类 (phylogenetic classification)或自然分类(natural classfication)。

2、细菌命名在分类基础上 ,赐予每种细菌一个科学名称,使之在生产实践、临床实践与科学研究工作中互相沟通成为可能。

依照细菌命名的法例,能保证全部的科研工作者以相同方式赐予细菌命名。

3、细菌判定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适合地点与已知细菌比较其相像性 ,用对照剖析方法确立细菌的分类地位。

若与已知细菌相同即采纳已知菌的名称 ,不一样者则按命名原则确立一个新名称。

二、分类等级细菌的分类等级与其她生物相同,挨次为界 (kingdom)、门(division) 、纲 (class)、目(order)、科 (family) 、属 (genus)、种 (species)。

细菌属于原核生物界 (procaryotae),包含有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体与螺旋体。

一、通用分类单元七级分类单元：界(kingdom)、门(phylum)、纲(class)、目(order)、科(family)、属(genus)、种(species)；必要时可在两级之间添加辅助单元，如亚门。

这七级分类单元的第一个字母必须大写，而且整个名称用正体字表示。

&例：子囊菌纲 Ascomycetes种：一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。

新种：sp. Nov. 或 nov. sp.是species novel 的缩写，附在学名后。

二、学名俗名：普通的、通俗的、地区性的名字。

&例：用“结核杆菌”表示“结核分枝杆菌”。

学名：一个菌种的科学名称，是按照《国际细菌命名法则》命名的，国际学术界公认并通用的正式名字。

学名的命名：采用“双名制”的国际植物命名法则。

“双名制”是瑞典植物学家林奈（Linneaus）于1953年介绍的植物命名原则，该方法已广泛用于植物、动物、微生物的命名。

“双名制”是用两个拉丁文或拉丁化的其他文字组成的一个学名。

三、学名的命名方法学名由属名和种名组成，书写时：属名+种名；翻译时，种名在前，属名在后；印刷时，学名用斜体字；书写时，在学名下加一横线表示斜体字母。

&例：Aspergillusniger 或Aspergillus niger属名（曲霉）种名（黑）前后有两个或数个学名排在一起时，在属名相同的情况下，后一学名中的属名可缩写成一个大写字母加一句号的形式。

&例1：Bacillus（芽孢杆菌属）可缩写成B.&例2：若可能产生混淆，也可写成二至三个字母，如：Bac.属名：表示微生物的主要形态特征、生理特征或以研究者的人名表示。

单数，字首大写。

&例1：根霉属、毛霉属——形态特征&例2：丙酸杆菌属、乳酸杆菌属——生理特征+形态特征&例3：沙门氏杆菌属——研究者的人名 + 形态特征种名：说明微生物的颜色、形状、用途，有时用人名、地名、微生物寄生的宿主名称和致病的性质来表示。

一、微生物如何命名？答：二名法，即用两个拉丁词命名一个微生物的种，由一个属名和一个种名组成，都用斜体字表达，属名在前，用拉丁文名词表达，第一个字母大写；种名在后，用拉丁名形容词表达，第一个字母小写。

为了防止同物异名或同名异物，在微生物名后缀有命名人的姓。

如果细菌只鉴定到属，则只有属名，没有种名。

也可在署名后加sp.（单）spp.（复），sp.和spp.是种的编号。

二、原核微生物和真核微生物的区别？答：原核微生物：核很原始，发育不全，只是DNA链高度折叠成一个核区，无核膜，核质裸露，与细胞质无明显界限，没有细胞器，只有细胞质膜内陷形成的不规则泡沫结构体系，不进行有丝分裂，不进行有丝分裂。

真核微生物：细胞核发育完好，核内有核仁和染色质，有核膜，将细胞核和细胞质分开，两者有明显界限，有高度分化的细胞器，进行有丝分裂，除蓝细菌以外的藻类、酵母菌、霉菌、伞菌、原生动物、微型后生动物。

三、论述细菌细胞的基本结构？答：细胞的基本结构有细胞壁、细胞质膜、细胞质及其内含物和拟核。

1、细胞壁结构与组成：G+细胞壁厚，其厚度为20-80nm，结构较简单，含肽聚糖，磷壁酸，少量蛋白质和脂肪。

G-细胞壁较薄，厚度为10nm，结构较复杂，分外壁层和内壁层，外壁层又分三层，最外层脂多糖，中间层磷脂层，内层脂蛋白。

内壁层含有肽聚糖。

功能：（1）维持细胞外形（2）保护细胞免受机械损伤和渗透压危害（3）鞭毛运动支点（4）正常细胞分裂必需（5）一定的屏障作用（6）噬菌体受体位点所在（7）与细菌的抗原性、致病性有关2、细胞膜结构与组成：细胞膜是紧贴在细胞壁内的一层柔软而又富有弹性的薄膜，细胞膜所含的脂类均为磷脂，占菌体10%，蛋白质60%—70%，脂肪30%—40%，多糖2%。

有上下两层致密的着色层和中间的不着色层组成。

不着色层是由正负电荷、有极性的磷脂双分子层构成，两性分子，亲水基朝膜内外水相，疏水基在不着色区域。

蛋白质流动镶嵌在功能区域。

环境工程微生物第一章绪论1、微生物的分类单位：从大到小，按界门纲目科属种等分类。

2、微生物的命名方法：二名法，即用两个拉丁文命名一个微生物的种。

这个种的名称由一个属名和一个种名组成。

（如枯草芽孢杆菌的名称是Bacillus subtilis Cohn 1872、变种Var（Variety））3、微生物的特点：✧体积微小，结构简单（多以μm表示，病毒以nm表示）；✧种类多、分类广（利用该特点，可以使处理系统中的污染物得以迅速降解）；✧代谢类型多，代谢强度大；✧繁殖快，数量多（我们可以将适合于处理各种污染物的微生物加以快速繁殖、增殖，使之达到所需的数量或浓度）；✧变异性强。

第二章环境中常见的微生物类群1、环境微生物三大类群：原核微生物、真核微生物、非细胞结构的病毒（看表2-1）2、原核微生物特点：由单细胞组成，仅有原始核和裸露的DNA，无核膜和核仁，没有与细胞器。

3、细菌四种基本形态：✧球状：直径0.5~2μm；✧杆状：长1~5μm、宽0.5~1μm；✧螺旋状：长5-50μm 、宽0.5~5μm；✧丝状。

影响细菌大小因素：菌龄、环境渗透压、代谢产物的积累、pH等。

4、细菌的基本结构、结构组成、功能基本结构：细胞壁、细胞膜、细胞质、核质体。

特殊结构：荚膜、鞭毛、菌毛、芽孢。

✧细胞壁：在体表最外层，坚韧而带有弹性的薄膜，主要成分为肽聚糖。

功能：①维持细菌的细胞形态；②保护原生质体免受渗透裂解；③阻止大分子物质进入细胞；④为鞭毛提供支点，使鞭毛运动。

革兰染色：革兰氏阳性菌（G+）-紫色，革兰氏阴性菌（G-）-红色（见图2-3）。

✧细胞膜：紧贴在细胞壁内侧，富有弹性的半透性薄膜，主要由磷脂和蛋白质组成。

形成磷脂双分子层。

功能：①控制细胞内外营养物质和代谢产物的运送和交换；②维持细胞内正常渗透压；③合成细胞壁和荚膜的场所；④进行氧化磷酸化或光合磷酸化的产能基地；⑤鞭毛的着生和生长点。

✧细胞质（原生质）及其内含物：细胞质：由蛋白质、核酸、多糖、脂类、无机盐和水组成。

微生物的分类与命名以啤酒酵母为例，它在分类学上的地位是：界(Kindom)：真菌界门(Phyllum)：真菌门纲(Class)：子囊菌纲目(Order)：内孢霉目科(Family)：内孢霉科属(Genus)：酵母属种(Species)：啤酒酵母（一）、微生物的分类单位界、门、纲、目、科、属、种种是最基本的分类单位每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科...种的概念定义：种是一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。

在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作为具体标本，它就是该种的模式种。

新种：sp.nov.或nov. sp.，新被鉴定的种发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号，新种发表前应将其模式菌株的培养物存放在一个永久性的保藏机构，并应允许人们从中取得。

1. 种（species）：是一个基本分类单位；是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。

①菌株（strain）: 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一切后代（起源于共同祖先并保持祖先特性的一组纯种后代菌群）。

因此，一种微生物的不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。

菌株强调的是遗传型纯的谱系。

例如：大肠埃希氏杆菌的两个菌株：Escherichia coli B 和Escherichia coli K12★菌株的表示法：★如果说种是分类学上的基本单位，那末菌株实际上是应用的基本单位，因为同一菌种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上会有很大的不同和差别！微生物的分类单位-2②亚种(subspecies）或变种(variety)：为种内的再分类。

当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传形状，而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元——亚种。

变种是亚种的同义词，因“变种”一词易引起词义上的混淆，从1976年后，不在使用变种一词。