水稻DNA提取

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水稻DNA提取方法
1.光照培养箱中(30℃)水稻催芽,8天左右,切去整株苗;
2.液氮研磨至粉末,装入离心管,藏于-20℃;
3.向粉末中加入预热至65℃左右的600μlCTAB提取液,将管置于65℃水浴锅中温育
30-60min;
4.加入600μl氯仿/异戊醇(24:1)用力上下颠倒充分混匀;
5.12000r/min离心5-10min,取上清液转入新离心管中,加入预冷异丙醇600μl,充
分摇匀,于-20℃30min;
6.12000r/min离心10min,弃上清;
7.以70%乙醇洗涤数次,12000r/min离心5min,超净台上吹干;
8.用100μl TE溶解藏于-20℃
1、CTAB提取缓冲液的经典配方
CTAB为十六烷基三甲基溴化铵,
Tris-HCl 提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;
NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中;
Cβ-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除基因组DNA。

CTAB 4g
NaCl 16.364 g
1M Tris-HCl 20ml(
0.5M EDTA 8ml,先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml
高温高压灭菌
提取时再加% 2-巯基乙醇(400ul)或PVP 2g(1%)。

2、氯仿-异戊醇(24:1):
100ml:96ml氯仿,再加4ml异戊醇,摇匀。

200ml:192ml氯仿,再加8ml异戊醇,摇匀。

3、0.5 M EDTA (pH
1000ml
EDTA-Na·2H2O 186.1 g
NaOH ~20 g
Adjust to pH
dH2O to 1000 ml
高温高压灭菌
100ml
EDTA-Na·2H2O 1g
NaOH ~2 g
Adjust to pH
dH2O to 100 ml
高温高压灭菌
4、1×TE Buffer
组成浓度:10mM Tris-HCl 1mM EDTA PH=
配制量:100ml
配制方法:量取下列溶液于500ml烧杯中
1M Tris-HCl Buffer PH= 5ml
1M Tris-HC Buffer PH= 50ml(TrisBase 6.0g+HCl 2ml)
0.5M EDTA PH= 1ml
0.5M EDTA pH= 50ml ( 9.3g+NaOH 1g)
EDTA又叫做乙二胺四乙酸二钠
向烧杯中加入约400mldd H2O均匀混合;将溶液定容到500ml后,调节pH值=,高温高压灭菌;室温保存.。