表观基因组学名词解释
- 格式:doc
- 大小:12.94 KB
- 文档页数:2
表观遗传学的实用工具全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:表观遗传学是研究基因表达受环境和生活方式影响的科学领域,也被称为表观基因组学。
随着对表观遗传学的研究日益深入,人们逐渐意识到其在健康和疾病中的重要作用。
表观遗传学提供了许多实用工具,帮助人们更好地了解基因表达调控机制,发现疾病的潜在原因,甚至预测健康状况。
表观遗传学的实用工具可以分为两类:实验室技术和计算方法。
实验室技术包括DNA甲基化检测、组蛋白修饰检测和RNA甲基化检测等方法,这些方法可以帮助研究人员在细胞和组织水平上检测基因组的表观修饰情况。
DNA甲基化检测可以揭示基因组中的甲基化位点,帮助研究人员了解哪些基因会受到甲基化的影响,从而影响基因的表达。
组蛋白修饰检测可以揭示组蛋白在基因组中的修饰情况,帮助研究人员了解组蛋白修饰和基因表达之间的关系。
RNA甲基化检测可以帮助研究人员了解在基因转录和翻译过程中RNA的甲基化程度,进而揭示RNA甲基化在基因表达调控中的作用。
与此计算方法在表观遗传学研究中也扮演着重要角色。
计算方法主要包括数据分析、模型构建和预测方法等。
数据分析方法可以帮助研究人员分析大规模的表观遗传学数据,发现数据中的模式和规律。
模型构建方法可以帮助研究人员建立数学模型,模拟基因表达调控过程,预测基因表达水平的变化。
预测方法可以帮助研究人员预测疾病发生的概率,提前干预和预防疾病的发生。
表观遗传学的实用工具在许多领域都有着广泛的应用。
在生物医学领域,表观遗传学的实用工具可以帮助研究人员发现疾病的潜在原因,为疾病诊断和治疗提供新的思路。
在农业领域,表观遗传学的实用工具可以帮助农民培育更加耐旱、耐盐等抗逆性强的作物品种,提高作物产量和品质。
在环境保护领域,表观遗传学的实用工具可以帮助研究人员监测环境中的污染物对生物体的影响,评估环境质量,制定环境保护政策。
表观遗传学的实用工具为科学研究和生活实践提供了新的思路和方法。
随着对表观遗传学的研究不断深入,相信表观遗传学的实用工具将会为人类社会带来更多的益处,推动科学和技术的发展。
1.表观遗传学概念表观遗传是与DNA 突变无关的可遗传的表型变化,且是染色质调节的基因转录水平的变化,这种变化不涉及DNA 序列的改变。
表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达了可遗传的变化的一门遗传学分支学科。
表观遗传学内容包括DNA 甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、遗传印记、随机染色体失活及非编码RNA 等调节。
研究表明,这些表观遗传学因素是对环境各种刺激因素变化的反映,且均为维持机体内环境稳定所必需。
它们通过相互作用以调节基因表达,调控细胞分化和表型,有助于机体正常生理功能的发挥,然而表观遗传学异常也是诸多疾病发生的诱因。
因此,进一步了解表观遗传学机制及其生理病理意义,是目前生物医学研究的关键切入点。
别名:实验胚胎学、拟遗传学、、外遗传学以及后遗传学表观遗传学是与遗传学(genetic)相对应的概念。
遗传学是指基于基因序列改变所致基因表达水平变化,如基因突变、基因杂合丢失和微卫星不稳定等;而表观遗传学则是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如和染色质构象变化等;表观基因组学(epigenomics)则是在基因组水平上对表观遗传学改变的研究。
2.表观遗传学现象(1)DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG 二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个甲基基团。
正常情况下,人类基因组“垃圾”序列的CpG 二核苷酸相对稀少,并且总是处于甲基化状态,与之相反,人类基因组中大小为100—1000 bp左右且富含CpG二核苷酸的CpG岛则总是处于未甲基化状态,并且与56%的人类基因组编码基因相关。
人类基因组序列草图分析结果表明,人类基因组CpG岛约为28890个,大部分每1 Mb就有5—15个CpG岛,平均值为每Mb含10.5个CpG岛,CpG岛的数目与基因密度有良好的对应关系[9]。
由于DNA甲基化与人类发育和肿瘤疾病的密切关系,特别是CpG岛甲基化所致抑癌基因转录失活问题,DNA甲基化已经成为表观遗传学和表观基因组学的重要研究内容。
表观基因组学和表观遗传学的发展随着生命科学的发展,表观基因组学和表观遗传学逐渐成为研究热点。
表观基因组学是研究基因组上甲基化、染色质修饰、组蛋白修饰和非编码RNA等表观遗传信息的科学,它研究的是影响基因表达的四级结构,而表观遗传学是研究细胞可以通过非DNA序列的遗传元素来传递表观special信息的学科,它研究的是真核生物中除 DNA 以外遗传信息的传递和表达。
本文将从表观基因组学和表观遗传学的历史、技术、应用等多个角度出发,探究其发展现状和未来趋势。
一、历史表观基因组学是关于DNA相关的表观特征,包括甲基化、组蛋白修饰和RNA调控,还包括染色体构象和位点绑定等。
表观遗传学是关于不同于基因序列的特征,在通过遗传和非遗传方式传递到下一代的时候,对表观特征的影响以及表观特征的遗传方式。
早在 1960 年代末期,科学家们发现 DNA 中的腺嘌呤和胸腺嘧啶之间的磷酸二乙酯键可以通过为 DNA 添加印迹酶 (DNase) 来容易地识别。
此后不久,研究人员还发现,通过不同的印迹酶(例如,Hae III 和 Hinf I) 来切割 DNA,会产生不同的 DNA 片段,因为印迹酶具有特异性,可以切除 DNA 上部分区域的磷酸二乙酯键,这些酶作为“检查器”标记出不同的表观遗传特征和表观基因组学。
制定血清补体反应或酶联免疫吸附实验 (ELISA) 检测特定化合物(例如乙酰化肽或甲基化转录因子)的抗体也成为了研究表观遗传学的常用工具。
此外,还开发了抗体浓缩免疫检测(ChIP)和详细地描述了 DNA 设计、合成、克隆和扩增的先进技术,这些技术都应用于表观基因组、表观修饰、微小 RNA 和 Noncoding RNA 以及调控因子的定量分析上。
二、技术表观基因组学和表观遗传学技术主要有基于 DNA 变化的技术和基于 RNA 变化的技术两大部分,下面将从两方面进行阐述。
基于 DNA 变化的技术:(1)甲基化识别:MSRA-Seq(全基因组甲基化识别测序)是一项定量描述 DNA 甲基化状态的技术,其基本原理就是通过比对甲基化和非甲基化的读数来估算甲基化的水平。
第一部分:功能、作用、意义1、胆固醇在膜中的作用:胆固醇的甾环与磷脂分子近头部烃链相互作用,增加膜的稳定性。
降低溶水性物质的通透性。
胆固醇的碳氢链可以弯曲,防止低温时膜的流动性突然降低。
2、质膜功能:.(1)维持相对稳定的内环境。
(2)物质交换和能量交换(3)是细胞与相邻细胞及细胞外基质的连接中介3、NA+-K+ATP酶介导主动运输的效应:直接效果维持胞内低Na+,高K+的特殊离子环境间接效果(1)调节细胞体积(2)促进物质吸收(3)维持重要酶活动必需的高K+环境(4)产生跨膜电位4、内质网的功能:(一)粗面内质网:蛋白质合成、加工修饰、转运;(1)、核糖体附着支架(2)、信号肽介导分泌性蛋白合成(重点)(3)、蛋白质糖基化(4)、蛋白质胞内运输(二)滑面内质网:(1)脂质、类固醇激素的合成(2)糖原的分解、(3)解毒作用、(4)Ca2+储存场所(5)胃酸、胆汁合成与分泌5、高尔基体的功能:(1)蛋白质的化学修饰(2)蛋白质的加工改造(3)蛋白质的分拣运输(4)生物膜的成分更新6、溶酶体的功能:(1)清除衰老的细胞器,稳定细胞的内环境(2)消化病原菌,实现机体的防御、(3)消化多余的大分子,提供细胞营养、(4)参与个体的发生与发育(5)参与激素的生成(6)参与受精作用7、微管的功能:(1)支持、维持细胞的形态(2)参与中心粒、纤毛和鞭毛的形成(3)参与细胞内物质运输(4)维持细胞器的定位和分布(5)参与染色体的运动,调节细胞分裂(6)参与细胞内的信号传导8、微丝的功能:(1)构成细胞的支架并维持细胞的形态(2)参与细胞运动(3)参与细胞分裂(4)参与肌肉收缩(5)参与细胞内物质运输(6)参与细胞内信号传递9、中间纤维的功能:(1)在细胞内形成一个完整的网状骨架系统(2)为细胞提供机械强度支持 (3)参与细胞连接(4)参与细胞内信息传递及物质运输(5)维持细胞核膜稳定(6)参与细胞分化10、核膜的功能:(1)是核质之间的屏障,内外核膜的脂质双分子层可阻挡极性分子的通过,使细胞核物质维持一个相对稳定的微环境(2)具有物质交换的功能(3)具有物质代谢过程所需要的酶(4)作为基因的表达环节11、核孔复合体功能:介导细胞核与细胞质之间的物质运输 机械强度支持12、核纤层的功能:(1)在细胞核中起支架作用(2)与核膜的重建及染色质凝集关系密切(3)参与了细胞核构建与DNA复制13、核仁功能:rRNA基因转录和加工的场所、组装核糖体的亚单位。
基因组学-名词解释Chromosome walking,染色体步移,通过鉴定克隆DNA的重叠部分来构建克隆重叠群的一种方法 Contig,(重叠群)一组连续的重叠DNA序列 C-value paradox,(C值悖论)在每一种生物中其单倍体基因组的DNA总量是特异的,被称为C值 (C Value)。
C值和生物结构或组成的复杂性不一致的现象称为C值悖论 CpG island,(CPG岛)人类基因组中大约56%的基因上游富含GC的DNA区域 Physical gap,(物理间隙)指构建基因组文库时被丢失的DNA序列,它们从已有的克隆群体中永久性地消失Restriction mapping,限制性酶切图谱,通过分析限制性酶切片段的大小确定DNA分子中限制性酶切位点Scaffold,骨架序列,序列间隙分开的一系列序列重叠群Genomics, 基因组学,研究生物基因组和如何利用基因的一门学问。
用于概括涉及基因作图、测序和整个基因组功能分析的遗传学分支。
Proteomics, 蛋白质组学,用来研究蛋白质组的各种技术Histone code,组蛋白密码,组蛋白化学修饰的模式影响各种细胞活性的假说 Map-based cloning,又称定位克隆(positional cloning),用该方法分离基因是根据目的基因在染色体上的位置进行的,无需预先知道基因的DNA 顺序,也无需预先知道其表达产物的有关信息Restriction fragment length polymorphism (RFLP),限制性片段长度多态性,因为在其一端或两端存在多态性限制位点而产生的长度各异的限制性片段Epigenetics,表观遗传学,是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达的可遗传的变化的一门遗传学分支学科pseudogene, (假基因)一个失活,即无功能性的基因拷贝 nucleoid,(拟核)原核生物中的含DNA区域fluorescent in situ hybriduzation, 荧光原位杂交,一种通过观察荧光标记在染色体的位置而确定标记物的技术sequence tagged site mapping,序列标签位点,基因组中唯一的一段DNA序列mapping reagent,作图试剂,在STS作图中使用的一种分布于单个染色体或整个基因组的DNA片段集合SSLP, 简单序列长度多态图,一系列表现长度多态性的重复序列variable number of tandem repeat, 可变数串联重复,由十几个核苷酸的重复序列拷贝组成的简单序列长度多态图,也叫小卫星short tandem repeat,短序列重复,由二,三或四核甘酸重复单位顺序排列组成的一种简单序列多态性,也叫微卫星long(or short) interspersed nuclear element, 长散布重复片段,一种基因组范围的重复序列,常常具有转座活性RNA world, 进化早期所有生化反应以RNA为中心的时期 genetic mapping, 遗传作图,采用遗传学技术构建基因组图谱physical mapping(物理图)采用分子生物学技术构建基因组图谱的方法感谢您的阅读,祝您生活愉快。
表观遗传学和基因组学研究在生物学领域,表观遗传学和基因组学是两个非常热门的研究方向。
表观遗传学主要研究影响基因表达和细胞分化的化学修饰和激活,探究外部环境对基因表达的影响。
而基因组学则是研究基因在整个基因组中的结构、功能和相互关系,解析遗传信息对个体发育和疾病的影响。
本文将详细探讨表观遗传学和基因组学的研究进展和应用前景。
一、表观遗传学1. DNA甲基化DNA甲基化是表观遗传学中最常见的一种化学修饰。
它是指DNA分子上附着着甲基基团,通过甲基化使得DNA分子不适合被转录因子结合,抑制基因表达。
除了经典的CpG甲基化,研究者们还发现了非经典的甲基化形式,例如5hmC、5fC、5caC等。
这些新型的甲基化类型有可能对人类疾病的发生发展有着潜在的影响。
2. 着丝点修饰外层着丝点代表新型表观遗传学的重要研究领域。
在有丝分裂过程中,着丝点扮演着拆分染色体、保持染色体相对稳定性的重要角色。
新型的表观遗传学学派发现了着丝点的化学修饰在染色体的不对称性中起到了重要作用。
着丝点修饰与人类疾病的关系尚未被完全探究,但是这个领域的创新研究为细胞分裂和染色体在细胞内的维持等方面提供了新的方式和视角。
3. 组蛋白修饰组蛋白修饰在表观遗传学中占据着非常重要的地位。
不同的化学修饰可以组成不同的“标记”,为基因表达、DNA复制和调节过程提供指导。
调控组蛋白修饰的产生和分解是表观遗传学中的重要研究方向,有助于解析基因活动的复杂性和多样性。
4. 环状RNA环状RNA (circRNA) 是一种闭合的RNA技术。
环状RNA的产生发生在转录过程中,由于RNA聚合酶的同向移动和背反移动造成一些RNA序列在基因组上的环状连接。
环状RNA具有抑制常规RNA降解的作用,并在基因表达和转录调节等领域扮演重要角色。
环状RNA的研究还是一个比较新颖的领域,目前仍有很多未解之谜等待研究人员来解答。
二、基因组学1. 功能基因组学随着基因组技术的不断进步,大量的基因信息被快速地产生和积累。
第二章基因1.反向重复序列:两个顺序相同的互补拷贝在同一 DNA链上呈反向排列构成。
2.基因:是编码RNA或一条多肽链所必需的全部核酸序列(通常指DNA序列)。
包括编码序列、两侧的侧翼序列及插入序列。
3.割裂基因(断裂基因):基因的编码序列在DNA上不是连续的,而是被不编码的序列隔开。
4.多基因家族(multigene famly)由一个祖先基因经过重复和变异所形成的一组基因。
5.假基因(pseudogene)在多基因家族中,某些成员在进化过程中获得一个或多个突变而丧失了产生蛋白产物的能力,这类基因称为假基因。
如:wZ、Wa、w06.突变(mutation):包括基因突变和染色体畸变7.基因突变(gene mutation):是指DNA分子中的核昔酸顺序发生改变,使遗传密码编码产生相应的改变,导致组成蛋白质的氨基酸发生变化,以致引起表型的改变。
8.自发突变或自然突变(spontaneous mutation):在没有人工特设的诱变条件下,由外界环境的自然作用或生物体内的生理和生化变化而发生的突变。
突变频率很低。
9.诱发突变(induced mutation):人工运用物理、化学或生物的方法所诱导的突变。
突变频率大大提高。
10.生殖细胞突变(germinal mutation)和体细胞突变(somatic mutation) 突变体(mutant):携带突变Gene的细胞或个体。
野生型(Wild type):未突变Gene的细胞或个体。
11.突变的分子基础碱基替换(base substitution)移码突变(frameshift mutation)动态突变(dynamic mutation)12.碱基替换(base substitution) 一种碱基被另一种碱基替换,又叫点突变(pointmutation)。
有两种形式:转换(transition): DNA分子中一个嘌吟被另一个嘌吟替代或一个嘧啶被另一个嘧啶所替代。
基因组学概论的名词解释近年来,随着科技的飞速发展,基因组学成为了生物学领域中备受瞩目的分支学科。
它涵盖了许多重要的名词和概念,为了更好地理解基因组学领域的知识,让我们一起来探索其中的名词解释。
1. 基因组学(Genomics)基因组学是研究生物体在整个基因组层面上的结构、功能和演化的学科。
它涵盖了DNA序列的研究和基因的功能及调控机制等方面。
通过对基因组的研究,科学家们能够更好地了解生物的遗传信息、种群演化以及相关疾病的发生机制。
2. 基因组(Genome)基因组是生物体遗传信息的完整集合,包括所有的DNA序列和基因。
它可以分为核基因组和线粒体基因组两部分。
基因组的研究不仅可以揭示基因的分布和组织方式,还可以帮助我们理解基因在生物体发育和功能表现中的作用。
3. DNA(Deoxyribonucleic acid)DNA是所有生物体中的遗传物质,也被称为脱氧核糖核酸。
它是由四种碱基(腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤和胸腺嘧啶)组合而成的长链分子。
DNA储存了生物体的遗传信息,并通过遗传密码将信息传递给下一代。
4. 基因(Gene)基因是控制特定特征和功能的DNA片段。
它是遗传信息的基本单位,负责编码蛋白质或调控蛋白质的合成。
基因由启动子、编码区和终止子组成,并通过转录和翻译过程产生功能性蛋白质。
5. 基因组装(Genome Assembly)基因组装是将测序得到的原始DNA片段重新拼接组装成完整的基因组序列的过程。
随着测序技术的发展,基因组装变得越来越精确和高效,为进一步理解基因组提供了有力工具。
6. 基因组注释(Genome Annotation)基因组注释是对已经完成基因组测序和组装的结果进行进一步分析和注释的过程。
通过比对现有数据库中的已知序列和进行进一步的生物信息学分析,可以确定基因的位置、编码的蛋白质功能以及可能的调控元件。
7. 生物信息学(Bioinformatics)生物信息学是将计算机科学和统计学的方法应用于生物学领域的一门学科。
第十三章 表观遗传学第一节 概 述基因的表达相同的基因型不同的表型:一.表观遗传学(epigenetic)DNA的序列不发生变化、基因表达改变、并且这种改变可稳定遗传。
二.表观遗传学研究的内容:1.基因选择性转录、表达的调控。
2.基因转录后调控。
(表观遗传通常被定义为DNA的序列不发生变化但是基因表达却发生了可遗传的改变,也就是说基因型未变化而表型却发生了改变,这种变化是细胞内除了遗传信息以外的其他可遗传物质的改变,并且这种改变在发育和细胞增殖的过程中能稳定的传递下去。
表观遗传学研究内容具体来说主要包括DNA甲基化表观遗传、染色质表观遗传、表观遗传基因表达调控、表观遗传基因沉默、细菌的限制性基因修饰等。
从更加广泛的意义上来说,DNA甲基化、组蛋白甲基化和乙酰化、基因沉默、基因组印记、染色质重塑、RNA剪接、RNA编辑、RNA干扰、x染色体失活等等都可以归入表观遗传学的范畴,而其中任何一个过程的异常都将影响基因结构以及基因表达,导致某些复杂综合症、多因素疾病或癌症。
) 三.表观遗传修饰从多个水平上调控基因表达:1.RNA水平:非编码RNA可通过某些机制实现对基因转录以及转录后的调控,例如microRNA、RNA干扰等2.蛋白质水平:通过对蛋白质的修饰或改变其构象实现对基因表达的调控,例如组蛋白修饰3.染色质水平:通过染色质位置、结构的变化实现对基因表达的调控,例如染色质重塑以上几个水平之间相互关联,任何一方面的异常都将影响染色质结构和基因表达。
四.表观遗传学的研究意义:1.表观遗传学补充了“中心法则”所忽略的两个问题,即哪些因素决定了基因的正常转录和翻译以及核酸并不是存储遗传信息的唯一载体。
2.表观遗传信息可以通过控制基因的表达时间、空间和方式来调控各种生理反应。
所以许多用DNA序列不能解释的现象都能够找到答案。
3.与DNA序列的改变不同,许多表观遗传的改变是可逆的,这使表观遗传疾病的治愈成为可能。
表观基因组学名词解释
表观基因组学在对DNA进行序列分析的同时,也能够获取生物遗传信息,这种技术被称为表观遗传学。
在正常情况下,大部分的表观遗传学调控区都在DNA序列中,这样才便于表观遗传学家进行表观遗传学调控的研究。
而现代分子生物学手段的进步使得表观遗传学家可以利用体外细胞系或者动物体内小型基因转录本,从而获得体外真实基因组表达图谱,实现对于真核生物基因功能的更深层次的了解。
表观遗传学是一门交叉学科,涉及到分子生物学、细胞生物学、微生物学和化学等诸多领域,并且需要多种技术的配合来进行数据分析,因此它是整个基因组研究计划的重要组成部分之一。
表观遗传学主要应用于基因组研究的后期,当对生物进行长期研究发现生物体在其进化过程中有着独特的遗传表现时,就需要将这些经过验证的新结果运用到生物学教学当中,以帮助广大高中学生更好地理解基因组学。
表观遗传学研究生物表型与其基因组的关系,通过基因型和表型的相互比较来认识生物遗传的本质。
它在表型水平上对已知遗传学规律进行验证,主要采用体外细胞系和动物体内小型基因转录本。
表观遗传学与功能基因组学相辅相成,通过对表观遗传学调控网络的构建来推测生物体内真正基因的活性。
表观遗传学对生物功能基因组学的研究具有非常重要的意义。
许多通过功能基因组学的研究结果可以直接应用到表观遗传学研究中去。
例如小干扰RNA(siRNA)通过与表观
遗传学中转录后修饰的关联可以间接地影响基因的表达,通过动态转录组的比较分析,可以鉴定调控模式,并预测基因表达的靶点。
可以通过DNA序列的比较,发现基因组序列中调控机制间的差异,由此推测并验证基因在基因组中的功能。
此类研究对于功能基因组学的发展起到巨大的促进作用,并最终使人们能够更加准确地认识生命的本质。
目前基因组学研究中尚存在着许多未解决的问题,而表观遗传学正是寻求新的思路和方法的重要手段。
在生物表型和基因组分析之间架起一座桥梁。
表观遗传学作为分子生物学的前沿学科,虽然目前还处于探索阶段,但是它为更深层次的研究提供了新的技术手段,有望对基因组学乃至整个生命科学产生深远的影响。