4个Y-STR基因座银染复合扩增 Four Y-STR Multiplex System by Silver Staining
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荧光复合扩增4个Y染色体STR的单倍型及其法医学应用石美森;李英碧;应斌武;云利斌;吴谨;颜静;张霁;侯一平【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2005(021)001【摘要】目的建立一套Y染色体STR的双色荧光复合扩增系统,调查4个Y-STR 基因座单倍型分布情况及其在混合斑物证检验中的法医学应用前景.方法荧光标记引物复合扩增Y-GATA-A10、DYS531、DYS557和DYS448四个Y染色体特异性STR基因座,并用AB Ⅰ 310遗传分析仪对扩增产物进行检测、分型.结果在成都汉族120名无关男性个体中,四个基因座分别检出5、5、8、7个等位基因,共检出78种单倍型,单倍型基因多样性为0.9881.对3例本教研室不能用常规常染色体STR对男性成份作出同一认定的混合斑检材,该系统成功的作出了与嫌疑人血液Y-STR基因型一致的鉴定结论.结论建立的Y-STR荧光标记复合扩增系统具有很高的识别能力,对建立Y染色体STR数据库,研究群体遗传学和进行法医学混合斑物证鉴定有重要意义.【总页数】5页(P1-5)【作者】石美森;李英碧;应斌武;云利斌;吴谨;颜静;张霁;侯一平【作者单位】四川大学华西基础医学与法医学院法医物证教研室,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院法医物证教研室,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院法医物证教研室,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院法医物证教研室,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院法医物证教研室,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院法医物证教研室,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院法医物证教研室,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院法医物证教研室,四川,成都,610041【正文语种】中文【中图分类】DF795.2【相关文献】1.15个常染色体和18个Y染色体STR基因座r复合扩增检测体系及法医学应用[J], 顾丽华;杨帆;梅兴林;周怀谷2.23个STR基因座荧光复合扩增体系的法医学应用评估 [J], 唐建新;李双琳;刘宏;翁玮霞;刘超;杜蔚安;黄杰3.十二个X染色体STR基因座荧光标记复合扩增体系的法医学应用 [J], 任峥;曾祥培;陈文静;吴晓洁;童大跃;李建金;孙宏钰4.19个常染色体STR和27个Y染色体STR复合扩增体系的法医学应用 [J], 贾菲; 赵斌; 沈红缨; 刘锋5.19个X-STR荧光复合扩增体系的法医学应用评估 [J], 林添春;杨幸怡;熊晨;李奥成;孙宏钰;刘超因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
4个Y-STR基因座的多态性及其法医学应用的研究郑秀芬;程俊峰;叶健;朱少建【期刊名称】《遗传学报:英文版》【年(卷),期】2002(29)2【摘要】通过荧光标记引物结合ABI 377型全自动DNA测序仪检测自动分型方法对中国壮族及汉族人群中各 10 0例无关男性个体的A10、C4、A7 1、A7 2等4个Y染色体特异的基因座的等位基因及单倍型的分布进行了调查。
结果发现A10、C4、A7 1、A7 2基因座分别有 7、6、6、6个等位基因 ,基因多样性 (GD)分别为 0 7776 0 6 2 9(壮汉 )、0 773 0 732、0 5 978 0 72 72、0 6 6 6 4 0 6 4 5 8。
在 2 0 0个观察样本中共发现 114种单倍型 (haplotype) ,单倍型多样性(haplotypediversity,HD)分别为 0 9786 0 9772 (壮汉 )。
通过测序确认基因座核心重复序列及等位基因核心序列重复数。
建立了这 4个基因座的复合扩增体系 ,分型准确清晰。
还对这 4个基因座的男性特异性、遗传稳定性、灵敏度等法医学有关指标进行了考察并且在实际案例中进行了应用 ,结果证明 ,这 4个Y STRs基因座非常适应于法医检验。
【总页数】6页(P95-100)【关键词】Y-STR;A10;A7.1;A7.2;C4;基因多态性;法医学;应用;汉族人;壮族【作者】郑秀芬;程俊峰;叶健;朱少建【作者单位】公安部物证鉴定中心;广西刑事科学技术研究所【正文语种】中文【中图分类】Q987;D919.1【相关文献】1.福建畲族人群26个Y-STR基因座遗传多态性及其法医学应用 [J], 边英男;特来提·赛依提;朱如心;赵琪;张素华2.广州汉族人群12个Y-STR基因座多态性及法医学应用研究 [J], 刘超;陈玲;陈晓辉;刘长晖;王慧君3.昆明地区汉族人群9个Y-STRs基因座遗传多态性及法医学应用研究 [J], 刘德华;景强;许冰莹;聂胜洁;胡利平;曾发明4.山西汉族人群Y-STR基因座DYS498遗传多态性与法医学应用 [J], 张慧丰;梁景青5.蚌埠地区汉族41个Y-STR基因座遗传多态性及法医学应用 [J], 何传锦;张荣芳;邹磊;郑冰洁;宋丹璐;黄景峰;兰江维因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
4个Mini Y-STR基因座在中国北方汉族群体中的遗
传多态性的开题报告
1. 研究背景和目的
Mini Y-STR基因座是短多态性重复序列(short tandem repeat,STR)的一种,长度为小于10bp的重复序列单元,该基因座广泛应用于
父系亲缘关系鉴定和人群遗传学研究中。
本研究旨在探究中国北方汉族
群体中4个Mini Y-STR基因座(DYS441,DYS442,DYS443和DYS444)的遗传多态性,为未来更深入的人类遗传学研究提供数据支持。
2. 研究内容和方法
本研究将以50名中国北方汉族男性为研究对象,采用聚合酶链反应(PCR)技术扩增4个Mini Y-STR基因座,利用电泳技术测定扩增产物
的长度,从而确定各个基因座的多态性。
通过计算等位基因频率、杂合
度和遗传距离等指标,分析样本间的遗传多态性。
3. 预期结果和意义
预计本研究将发现中国北方汉族群体中4个Mini Y-STR基因座存在
较高的遗传多态性,即存在多种等位基因,且各个基因座的杂合度均较高。
这一结果将为未来更深入的人类遗传学研究提供数据支持,同时也
可作为父系亲缘鉴定的依据。
4. 研究局限性和不足
本研究的样本规模相对较小,仅选取了50名中国北方汉族男性,因此所得结果可能不代表整体的汉族男性群体的遗传特征。
此外,由于所
选取的Mini Y-STR基因座数量较少,因此对于中国北方汉族男性群体的
遗传多样性也只能有限的探究。
A study of genetic polymorphisms of 4 Y chromosome specific STR loci in Wuhan Han
population
作者: 杨荣芝 钱水 黄代新 陈慧 余纯应 杨庆恩
作者机构: 华中科技大学同济医学院法医学系,武汉,430030
出版物刊名: 刑事技术
页码: 27-30页
主题词: Y-STR基因 性调查 遗传多态性 GD 汉族 检出 分型 法利 个人识别 亲子鉴定
摘要:目的调查汉族人群DYS19、GATA-A10、GATA-A7.2和DYS458 Y染色体STR基因座的遗传多态性.方法利用PCR和PAGE技术对160例无关男性血样进行4个Y-STR基因座分型.结果 4个Y-STR基因座群体调查分别发现5、5、6和 9个等位基因,基因座GD值分别为0.6365、0.6996、0.6377和0.8239.共检出107种单倍型、单倍型GD值为0.9867.结论 4个Y-STR基因座均具有较高的遗传多态性,在法医学个人识别和亲子鉴定有实用价值.。
山东地区汉族人群4个STR基因座遗传多态性分析刘娟;焦传珍【摘要】目的研究山东地区汉族人群4个STR位点(D10S1248、D14S1434、D22S1045、SE33)的遗传多态性.方法运用PCR扩增、8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染技术对152个无关汉族人群个体进行多态性研究.结果 4个位点分别检测出72、80、72、136个等位基因片段,共有53个基因型.其频率分布在0.0526~0.1579之间,经检测其多态性分布符合Hardy-weinberg平衡定律.4个STR位点多态信息量(Polymorphism informationcontent,PIC)分别为0.8493、0.8785、0.8173、0.9157.期望杂合度(Hetemzygosity,HET)分别为0.8643、0.8892、0.8374、0.9211.结论山东地区汉族该4个sTR基因座位点的多态性数据显示其基因分布特征具有特异性.【期刊名称】《德州学院学报》【年(卷),期】2011(027)002【总页数】5页(P63-67)【关键词】短串联重复序列;基因座;遗传多态性【作者】刘娟;焦传珍【作者单位】德州学院生物系,山东德州,253023;德州学院生物系,山东德州,253023【正文语种】中文【中图分类】Q75短串联重复序列 (ShortTandem Repeat, STR),是广泛分布于真核生物基因组中的高度重复序列,由2 6bp核心序列组成,其核心序列重复次数的变化构成其基因座的遗传多态性[1].由于微卫星DNA具有在基因组中分布均匀,多态性含量丰富,呈共显性遗传,稳定性好,可比性强等特点,不仅可以作为基因组作图的遗传和物理标记,还可用于亲子鉴定和群体相关性研究[2].为目前在动植物上的遗传连锁分析、基因定位以及饱和遗传标记图构建等领域一个极为重要的研究手段.本试验将选用四对微卫星引物(D10S1248、D14S1434、D22S1045、SE33)对用碱性裂解法从山东地方人群血样中提取的人体基因组DNA进行PCR扩增并用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行遗传多态性研究,分析山东地区汉族人群4个STR基因座遗传多态性,以期为群体遗传学、遗传性疾病连锁分析、法医学亲子鉴定和个体识别等研究领域提供科学依据.1.1 试验样本山东地方人群无关汉族个体血液样本152份, EDTA抗凝,-80℃保存.1.2 试验方法碱裂解法从血液中提取基因组DNA,PCR扩增后进行2.0 琼脂糖凝胶电泳和8%非变性的聚丙烯酰胺凝胶电泳.根据文献[3-7]提供的微卫星引物序列,筛选了4对微卫星引物,微卫星引物由上海生物工程技术服务有限公司合成,PAGE纯化(见表1). 1.3 数据处理记录统计各无关个体四个STR位点的基因型,计算基因频率,并对基因型分布作χ2检验.利用Powerstat软件分别计算STR位点各基因座的实际杂合度(H)、预期杂合度(He)、多态性信息总量(PIC)[3-7].对152个无关汉族人群个体提取DNA,1.0琼脂糖凝胶电泳,所获得的DNA条带明亮、清晰(见图1)可进行分子生物学的后续研究.对提取的基因组进行PCR扩增,2.0 琼脂糖凝胶电泳(见图2)和8%非变性的聚丙烯酰胺凝胶电泳.结果表明,试验所获得的DNA片段与预期一致.记录统计的四个 STR位点 D10S1248、D14S1434、D22S1045、SE33在山东地区汉族人群的等位基因及频率,以及应用参数见表2、表3、表4.本试验研究了D10S1248、D14S1434、D22S1045和SE33四个STR基因座,获得了四个STR基因座的等位基因及基因型在山东地区汉族人群中的频率分布(见表2,3).经Χ2检验基因型观测值与期望值差异无显著性,符合 Hardy-Weinberg遗传平衡定律.在山东地区汉族人群中D10S1248基因座,观察到9个等位基因,13种基因型,常见等位基因大小是232 bp,其频率为0.2105;D14S1434基因座观察到10个等位基因,14种基因型,常见等位基因较多,大小分别为206 bp、218 bp、222 bp、226 bp、250 bp,其频率均为0.1316;D22S1045基因座,观察到9个等位基因,11种基因型,常见等位基因大小是171 bp,其频率为0.2353;SE33基因座,观察到17个等位基因,15种基因型,常见等位基因大小是290 bp、345 bp,其频率均为0.1316.4个 STR基因座的PIC值在 0.8173~ 0.9157之间,HET值在0.8374~0.9211之间,显示其杂合度较高.从以上数据分析中可以看出4个STR位具有高度多态性,都属于人类高识别能力遗传标记,是一组高鉴别能力的位点.本研究结果与国内其他学者报道的基因频率相似,获得了山东地区汉族人群的等位基因频率分布资料,为山东地区法医学鉴定等研究提供了科学依据.【相关文献】[1]polymorpouls MH,Xiao,H,Rath DS,et al.Tetranucletide repeat polymorphism at the human cfes/fps proto -oncogene(FES)[J].Nucleic Acids Res,1991,19: 4018[2]T.A.布朗.基因组[M].袁建刚,周严,强伯勤,译.北京:科学出版社,2002:153-155.[3]朱波峰,吕桂平,沈春梅,等.山东地区汉族人群9个STR基因座遗传多态性分析[J].中国医学科学院学报, 2002,24(6):620-625.[4]龙友国,邱祥智,龙思方,等.中国17个汉族人群3个STR基因座的遗传关系研究[J].右江民族医学院学报, 2007,29(3):336-338.[5]庄文越,庄文卓,李正祎,等.吉林地区汉族群体两个STR基因座的遗传多态性调查[J].苏州大学学报(医学版),2007,27(1):89-91.[6]刘长晖,刘超,杨电,等.广州地区人群15个STR基因座遗传多态性[J].中国法医学杂志,2007,22(5):327 -329.[7]金鑫,姜成涛,涂政,等.海南黎族群体14个STR基因座遗传多态性[J].中国法医学杂志,2007,22(6):403 -404.。
荧光标记复合扩增检测4个STR基因座多态性李英碧;吴谨;侯一平;张霁;廖淼;张林;陈国弟【期刊名称】《中国法医学杂志》【年(卷),期】2005(020)004【摘要】目的建立荧光标记复合扩增D1S2142,D13S1492,D14S306,D15S659基因座检测分型方法,并对成都汉族群体4个基因座的遗传多态性进行调查.方法用6-FAM标记D1S2142和D15S659引物,HEX、TMR分别标记D14S306和D13S1492引物,PCR复合扩增,310基因分析仪电泳自动收集电泳结果数据,GeneScan Analysis Software3.7NT软件计算扩增产物片段相对大小,Genotyper(R)3.7NT软件进行样本基因型分型,建立了荧光标记复合扩增检测4个STR基因座基因型的方法,对145名成都汉族无关个体样本进行分型.结果荧光标记复合扩增D1S2142,D13S1492,D14S306,D15S659基因座,每个STR基因座都获得了清晰的基因型分型结果.145份样本,4个STR基因座分别检出10,14,7,12个等位基因和22,54,21,39种基因型,其基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡.4个基因座在成都汉族群体的杂合度分别依次为0.7793,0.8345,0.7793和0.8345;多态信息含量分别依次为:0.7656,0.8730,0.7470和0.8312.累计非父排除率为0.9783,累计个人识别机率为0.9999 917.结论荧光标记复合扩增D1S2142,D13S1492,D14S306,D15S659基因座,可实现对每个基因座准确分型;成都汉族群体该4个基因座的遗传学数据,可为群体遗传学和法医学研究与应用提供基础资料.【总页数】4页(P218-221)【作者】李英碧;吴谨;侯一平;张霁;廖淼;张林;陈国弟【作者单位】四川大学华西基础医学与法医学院,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院,四川,成都,610041;四川大学华西基础医学与法医学院,四川,成都,610041【正文语种】中文【中图分类】D919【相关文献】1.24个Y-STR基因座荧光标记复合扩增体系的建立 [J], 刘宏;李越;刘长晖;刘超;葛斌文;陈林丽2.6个miniSTR基因座荧光标记复合扩增的遗传多态性 [J], 石美森;百茹峰;于晓军;吕俊耀;陈树添3.STR基因座荧光标记复合扩增检测及其法医学应用 [J], 李英碧;吴谨;侯一平;张霁;廖淼;张林;陈国弟4.荧光标记复合扩增对中国汉族群体8个STR基因座的多态性 [J], 郭红玲;姜成涛5.DYS19、DYS391、DYS439基因座多态性及其荧光标记复合扩增检测的研究[J], 朱传红;杨庆恩;王海生;申成斌;刘成昌因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201911050200.7(22)申请日 2019.10.31(71)申请人 安徽省公安厅物证鉴定中心地址 230061 安徽省合肥市庐阳区安庆路270号安徽省公安厅申请人 安徽安科生物工程(集团)股份有限公司 无锡中德美联生物技术有限公司(72)发明人 陈林 郑卫红 王留柳 张科 耿学磊 史明浩 张雷 梅兴林 郑卫国 (74)专利代理机构 苏州国诚专利代理有限公司32293代理人 王丽(51)Int.Cl.C12Q 1/6888(2018.01)C12N 15/11(2006.01)(54)发明名称人类Y染色体35个STR基因座的荧光标记复合扩增试剂盒及其应用(57)摘要本发明公开了人类Y染色体35个STR基因座的荧光标记复合扩增试剂盒及其应用,所述试剂盒包括扩增35个Y -STR基因座的特异性引物,其中包括28个低突变Y -STR基因座,7个快速突变Y -STR基因座。
本发明所述试剂盒包括28个低突变率和7个快速突变、多态性较高的Y -STR基因座,兼顾了男性家系排查和同一父系不同男性个体之间的区分;本发明所述试剂盒中引物具有特异性强,灵敏度高,分型结果准确的优点,完全能够满足实际案件检验、DNA数据库建设以及亲子鉴定的需要;本发明所述试剂盒具有很强的检材适应性。
权利要求书2页 说明书9页序列表10页 附图5页CN 110628920 A 2019.12.31C N 110628920A1.人类Y染色体35个STR基因座的荧光标记复合扩增试剂盒,其特征在于,35个STR基因座包括28个低突变Y-STR基因座DYS392、DYS389I、DYS447、DYS389II、DYS438、DYS527a、DYS527b、DYS596、DYS391、DYS456、DYS19、DYS448、DYS385a、DYS385b、DYS549、DYS437、DYS481、DYS533、DYS390、DYS458、DYS460、DYS393、Y_GATA_H4、DYS439、DYS635、DYS444、DYS643、DYS557,以及7个快速突变Y-STR基因座DYS627、DYS576、DYS570、DYF387S1a、DYF387S1b、DYS449、DYS518;所述试剂盒共包括31对特异性引物,用于扩增所述35个STR基因座,所述特异性引物的序列为:DYS392、SEQ ID NO:1~2;DYS389I和DYS389II、SEQ ID NO:3~4;DYS447、SEQ ID NO:5~6;DYS438、SEQ ID NO:7~8;DYS527a和DYS527b、SEQ ID NO:9~10;DYS596、SEQ ID NO:11~12;DYS391、SEQ ID NO:13~14;DYS456、SEQ ID NO:15~16;DYS19、SEQ ID NO:17~18;DYS448、SEQ ID NO:19~20;DYS385a和DYS385b、SEQ ID NO:21~22;DYS549、SEQ ID NO:23~24;DYS437、SEQ ID NO:25~26;DYS481、SEQ ID NO:27~28;DYS533、SEQ ID NO:29~30;DYS390、SEQ ID NO:31~32;DYS627、SEQ ID NO:33~34;DYS458、SEQ ID NO:35~36;DYS460、SEQ ID NO:37~38;DYS393、SEQ ID NO:39~40;Y_GATA_H4、SEQ ID NO:41~42;DYS439、SEQ ID NO:43~44;DYS635、SEQ ID NO:45~46;DYS444、SEQ ID NO:47~48;DYS643、SEQ ID NO:49~50;DYS557、SEQ ID NO:51~52;DYS576、SEQ ID NO:53~54;DYS570、SEQ ID NO:55~56;DYF387S1a和DYF387S1b、SEQ ID NO:57~58;DYS449、SEQ ID NO:59~60;DYS518、SEQ ID NO:61~62;所述特异性扩增引物分为五组:DYS392、DYS389I、DYS447、DYS389II、DYS438、DYS527a、DYS527b和DYS596为第一组,DYS391、DYS456、DYS19、DYS448、DYS385a、DYS385b和DYS549为第二组,DYS437、DYS481、DYS533、DYS390、DYS627、DYS458和DYS460为第三组,DYS393、Y_ GATA_H4、DYS439、DYS635、DYS444、DYS643和DYS557为第四组,DYS576、DYS570、DYF387S1a、DYF387S1b、DYS449和DYS518为第五组;每对引物中至少一条采用荧光染料标记其5’端。
3个miniSTR基因座四色荧光复合分型体系的构建及应用刘宁;左敏;李淑瑾;丛斌;白雪;谷建立;侯志平【期刊名称】《中国法医学杂志》【年(卷),期】2009(024)003【摘要】目的建立D3S3053、D6S474、D20S482(扩增片段<150bp)3个miniSTR基因座四色荧光复合分型体系,用于高度降解DNA样本的基因分型.方法采用6-FAM、HEX、TAMRA荧光染料标记D20S482、D3S3053、D6S474基因座上游引物,构建并优化复合扩增体系,在ABI 310遗传分析仪卜对扩增产物进行电泳分析,Genemapper 3.2软件分析产物片段大小并进行分型.采用上述体系对120份河北汉族健康无关个体血样进行检测,并计算群体遗传学参数.比较该体系与ID试剂盒用于高度降解检材的成功率及灵敏度.结果 D3S3053、D6s474、D20S482 3个miniSTR基因座荧光标记复合扩增分型体系稳定可靠,灵敏度达50pg,用于高度降解检材分析的成功率明显高于ID试剂盒.3个基因座在河北汉族人群中的累积个人识别能力为0.998,累积非父排除率为0.84.结论该系统可用于分析高度降解DNA样本的基因分型,进行法医学个人识别和亲权鉴定.【总页数】4页(P154-157)【作者】刘宁;左敏;李淑瑾;丛斌;白雪;谷建立;侯志平【作者单位】河北医科大学法医学系,河北省法医学重点实验室,河北,石家庄,050017;河北医科大学法医学系,河北省法医学重点实验室,河北,石家庄,050017;河北医科大学法医学系,河北省法医学重点实验室,河北,石家庄,050017;河北医科大学法医学系,河北省法医学重点实验室,河北,石家庄,050017;河北医科大学法医学系,河北省法医学重点实验室,河北,石家庄,050017;河北医科大学法医学系,河北省法医学重点实验室,河北,石家庄,050017;河北医科大学法医学系,河北省法医学重点实验室,河北,石家庄,050017【正文语种】中文【中图分类】D9【相关文献】1.3个miniSTR基因座荧光标记复合扩增体系的建立及应用 [J], 杜冰;江继平;杜宏;张林2.23个STR基因座荧光复合扩增体系的法医学应用评估 [J], 唐建新;李双琳;刘宏;翁玮霞;刘超;杜蔚安;黄杰3.4个Y-miniSTR基因座荧光标记复合扩增体系的建立 [J], 王惠;白小刚;夏昱;李庆庆;何望;梁伟波4.河北汉族人群D9S1122/D10S1435/D12ATA63 miniSTR基因座四色荧光标记分型体系的构建及遗传多态性研究 [J], 侯志平;丛斌;李淑瑾;白雪;谷建立;刘宁5.十二个X染色体STR基因座荧光标记复合扩增体系的法医学应用 [J], 任峥;曾祥培;陈文静;吴晓洁;童大跃;李建金;孙宏钰因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。