分子生物学实验室的建设与管理浅析——以南京农业大学应用基因组实验室为例
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分子生物学综合大实验实验报告分子生物学综合大实验实验报告外源基因SOC1的扩增和重组载体的构建与筛选班级姓名学号实验目的通过PCR技术克隆外援基因SOC1的目的片段。
通过质粒提取,酶切和连接技术,把SOC1基因重组进TA克隆载体并完成筛选。
实验用品材料:植物叶片,TA克隆载体试剂:DNA提取液(1L)TE缓冲液;琼脂糖;核酸染料;;DNAmarker;6×上样缓冲液(0.25%溴酚蓝、0.25%二甲苯青FF、30%甘油)、DNA聚合酶、dNTP、上下游引物器材:研钵,恒温水浴,离心机,离心管,PCR仪、生化培养箱、电泳仪、电泳槽、凝胶成像系统,去离子水、超净工作台,低温台式离心机,分光光度计,水浴锅,高压灭菌锅,酒精灯等。
实验原理通过配制DNA提取液,利用研磨法获得DNA模板,然后采用PCR技术扩增基SOC1基因获得目的片段,然后通过酶切和连接方法把SOC1基因连接到TA载体上。
大肠杆菌感受态细胞中加入质粒,则质粒DNA与Ca2+形成的复合物粘附于细胞表面,经过42℃短暂的热激处理后,DNA与Ca2+形成的复合物进入大肠杆菌细胞,在不含抗生素的培养基中短暂培养,使转入大肠杆菌质粒上的抗生素抗性基因表达,在含相应抗生素的选择培养基上可将转化菌(含质粒)与未转化细菌分开,转化细菌经过不断分裂增殖形成菌落,而未转化的细菌则不能。
并通过氨苄抗性筛选获得重组子实验方法步骤1、植物基因组DNA的小量提取(1)剪取新鲜幼嫩的植物叶片1~2片于1.5 mL离心管中.(2)先加入少量的DNA提取液100 μL,用研磨棒充分研磨尽量避免提取液溅出。
(3)再加入600 μL的DNA提取液,使DNA提取液的总体积为700μL,上下颠倒混合均匀。
(4)放入高速离心机4℃条件下12 000 rpm离心15 min。
(5)取上层水相,移入标有相应序号的新的离心管中,加入600 μL的异丙醇(与加入DNA 提取液的总体积相同),上下颠倒混匀。
《分子生物学试验》课程教学大纲课程编号: 05030适用专业:生物工程与生物技术试验学时数:36学时试验学分:1教材:主要参考书:《分子生物学试验指导》徐庆华等成栋学院立项教材 2024一、课程说明《分子生物学试验》以介绍分子生物学中的试验方法、试验手段和培育学生试验操作技能为其主要内容。
须要以分子生物学基本理论为基础,其教学目的是为了提高学生在分子生物学技术方面的动手实力,培育学生分析问题和解决问题的实力。
通过试验,要求学生能在原有的相关理论学问基础上较全面和深化理解分子生物学基本原理,驾驭基本的分子生物学试验方法和技巧,初步具备肯定的试验设计实力,以求为以后的学习和科研工作打下良好和扎实的基础。
本试验课在方法上力求经典,试验内容涉及了质粒DNA的提取及限制性内切酶酶切质粒分析;大肠杆菌感受态细胞的制备及质粒DNA转化大肠杆菌;应用多聚酶链式反应(PCR)体外基因扩增及产物鉴定;SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳测定蛋白质分子量等分子生物学的基本理论。
二、学时安排三、教学内容及教学基本要求试验一碱裂解法小量提取质粒DNA及琼脂糖凝胶电泳检测一、试验特点试验类型:综合试验类别:专业基础安排学时:6 每组人数:2二、试验目的1、驾驭碱裂解法小量提取质粒DNA和试剂盒提取质粒DNA的原理和方法。
2、驾驭琼脂糖凝胶的制备及外源DNA的检测原理。
3、了解质粒DNA的粗略定量方法。
三、试验内容提要1、将单菌落接种于3m1含相应抗生素的LB培育基中,37℃摇菌过夜;2、12,000rpm离心30sec,收集菌体;3、加200u1溶液I(含RNaseA 100ug/ml ),振荡悬浮菌体;4、加200ul新配制的溶液II,颠倒混匀;5、溶液澄清后马上加入预冷的200u1溶液III混匀后冰上放置5~10 min;6、4℃、12,000rpm离心15min,取上清,加0.7倍异丙醇混匀,室温静置5min;7、12,000rpm离心10min,70%乙醇洗涤沉淀,抽干后溶于适量水或TE,-20℃保存备用。
一、实训背景分子生物学是研究生物大分子如蛋白质、核酸的结构与功能的一门学科。
随着生命科学技术的不断发展,分子生物学在医学、农业、环境保护等领域发挥着越来越重要的作用。
为了更好地理解和掌握分子生物学的基本理论和技术,我们开展了为期两周的分子生物学实训课程。
本次实训旨在通过实际操作,加深对分子生物学理论知识的理解,提高实验技能,培养科研素养。
二、实训目的1. 熟悉分子生物学实验室的基本操作规程和安全规范。
2. 掌握DNA提取、PCR扩增、酶切、电泳等分子生物学实验技术。
3. 理解基因克隆、基因表达、蛋白质分析等分子生物学实验原理。
4. 提高团队协作和沟通能力,培养科研素养。
三、实训内容1. 实验室基本操作与安全规范(1)熟悉实验室布局,了解各种仪器的使用方法。
(2)学习实验室安全操作规程,掌握实验室废弃物处理方法。
(3)进行实验前的准备工作,如配制试剂、消毒、无菌操作等。
2. DNA提取(1)了解DNA提取的原理和常用方法。
(2)学习酚-氯仿法提取DNA。
(3)对提取的DNA进行质量检测,如A260/A280比值、琼脂糖凝胶电泳等。
3. PCR扩增(1)了解PCR扩增的原理和步骤。
(2)设计PCR引物,进行PCR反应。
(3)对PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳检测。
4. 酶切(1)了解酶切原理和酶切反应条件。
(2)学习限制性内切酶的用法。
(3)进行酶切反应,对酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳检测。
5. 电泳(1)了解电泳原理和电泳技术。
(2)学习琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳等电泳技术。
(3)对DNA、蛋白质等生物大分子进行电泳分离和检测。
6. 基因克隆、基因表达、蛋白质分析(1)了解基因克隆、基因表达、蛋白质分析的基本原理。
(2)学习相关实验技术,如载体构建、重组表达、蛋白纯化等。
(3)对克隆的基因、表达的蛋白进行检测和分析。
四、实训过程1. 实验前准备(1)查阅相关文献,了解实验原理和操作步骤。
(2)配制实验试剂,确保实验用品齐全。
分子生物学实验室有相应的要求:我提供一份关于建立实验室大标准:临床基因扩增检验实验室基本设置标准根据《临床基因扩增检验实验室管理暂行办法》,制定本标准。
一、临床基因扩增检验实验室区域设置原则(一) 临床基因扩增检验实验室原则上分为四个分隔开的工作区域:1、试剂贮存和准备区2、标本制备区3、扩增反应混合物配制和扩增区4、扩增产物分析区如使用全自动分析仪,区域可适当合并。
(二)各工作区域必须有明确的标记,避免不同工作区域内的设备、物品混用。
(三)进入各工作区域必须严格按照单一方向进行,即试剂贮存和准备区→标本制备区→扩增反应混合物配制和扩增区→扩增产物分析区。
(四)不同的工作区域使用不同的工作服(例如不同的颜色)。
工作人员离开各工作区域时,不得将工作服带出。
二、工作区域仪器设备配置标准(一)试剂贮存和准备区1、2~8℃和-15℃冰箱2、混匀器3、微量加样器(覆盖l~1000ul)4、移动紫外灯(近工作台面)5、消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤心)6、专用工作服和工作鞋7、专用办公用品(二)标本制备区1、2~8℃冰箱、-20℃或-80℃冰箱2、高速台式冷冻离心机3、混匀器4、水浴箱或加热模块5、微量加样器(覆盖1~1000ul)6、可移动紫外灯(近工作台面)7、超净工作台8、消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤心)9、专用工作服和工作鞋10、专用办公用品如需处理大分子DNA,应备有超声波水浴仪。
(三)扩增反应混合物配制和扩增区1、核酸扩增仪2、微量加样器(覆盖1~1000ul)3、可移动紫外灯(近工作台面)4、消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤心)5、专用工作服和工作鞋6、专用办公用品(四)扩增产物分析区视检测方法不同而定。
实验室简介分子生物学实验室实验室简介分子生物学实验室分子生物学实验室是一个专门进行生物分子研究的科学实验室。
在这个实验室中,研究人员利用最先进的技术和设备,深入探究生物体内分子的结构、功能和相互作用方式。
通过分子生物学的研究,我们可以更好地理解生命的发展与演变,为医学研究、疾病诊断和治疗提供重要的理论和实践基础。
一、实验室设施与仪器分子生物学实验室拥有一系列先进的设施和仪器,以支持研究人员进行实验和数据分析工作。
重点设备包括:高速离心机、蛋白质电泳仪、核酸分离仪、PCR仪器、逆转录仪、荧光显微镜、光谱仪、DNA 测序仪等等。
这些设备的运用使得我们能够进行DNA、RNA、蛋白质等生物分子的提取、分离、纯化和检测。
二、研究领域分子生物学实验室主要关注以下几个研究领域:1. 基因表达调控机制研究:我们致力于揭示基因转录调控、核糖体翻译和信号转导等分子机制。
通过分析基因表达的控制过程,我们可以深入了解基因在细胞生命周期中的重要作用,为疾病的诊断和治疗提供理论依据。
2. RNA干扰技术研究:我们利用siRNA和miRNA等RNA干扰技术,研究RNA干涉对基因表达和细胞功能的调控作用。
这项研究有助于我们理解RNA干扰在生物体内的生理和病理过程中的重要作用。
3. 蛋白质结构与功能研究:我们探索蛋白质结构的三维构象、相互作用和功能调控机制。
通过了解蛋白质的结构与功能,我们可以开发新的药物靶点,并提供药物研发和治疗疾病的理论指导。
4. 分子遗传学研究:我们利用分子遗传学的方法研究基因突变、对细胞遗传物质的稳定性和遗传信息传递等方面的问题。
这有助于我们对遗传性疾病发生机制的理解,并为疾病的预防和治疗提供依据。
三、研究成果分子生物学实验室在多个研究领域取得了一系列重要的科研成果。
我们的研究成果发表于国际著名的科学期刊,并得到同行专家的广泛关注和认可。
研究人员还积极参与学术会议和学术交流活动,与国内外同行学者进行合作研究,不断拓展研究领域和提高研究水平。
分子生物学实验室常见实验
1.基因克隆:通过PCR扩增目标基因或外源基因,将其克隆到载体中,如质粒、病毒等,使其能够在宿主细胞中表达。
2. PCR:聚合酶链式反应,是一种可在体外扩增DNA序列的技术,适用于从少量DNA样品中扩增特定区域的DNA片段。
3. 蛋白质表达与纯化:通过基因克隆,将目标蛋白质表达于宿主细胞中,并通过蛋白质纯化技术将其纯化出来。
4. DNA测序:通过测序仪对DNA序列进行测定,可以用于基因组测序、基因突变分析等。
5. RNA干扰:通过RNA干扰技术,将RNA分子导入到细胞中,靶向特定的基因,从而抑制基因表达。
6. 细胞培养:将细胞放入培养皿中,提供合适的营养物,使其在体外生长并繁殖,可用于体外实验研究。
以上是分子生物学实验室常见实验,这些实验技术广泛应用于生命科学领域的基础研究和应用研究,为疾病诊断和治疗等方面提供了重要的科学支持。
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