nano measurer1.2_imagetool3.0和imagej粒径面积图像分析软件使用方法分布计算的测量方法

1、打开imagej软件
2、File——open，打开图片
3、设置阈值。

Image——adjust——threshold——若分析内容为空洞，则点击一次apply；若
分析内容为凸起，则点击两次apply。

使要分析的部位变为深色。

4、进行标尺设定。

Analyse——setscale，软件会自动判断图中标尺中像素个数，在known
distance中设定自己图片标尺的长度，并且将unit of length中的单位设定为自己标尺的单位。

如图，known distance设为5，unit of length设为μm。

5、分析并输出结果。

Analyze——analyze particles,在show中选取outlines，并点选display
result和exclude on edges，或可根据自己的需要选择不同选项。

最后点击ok，即可得到
结果，可把结果复制到excel中分析。

6、设置输出选项。

在analyze—analyze measurements
中设置输出选项，得到自己想要的结果。

比如周长、面
积、灰度值等。

imagej用户使用手册第三部分摘要：一、ImageJ软件简介二、ImageJ 3D可视化技巧1.三维重建2.体积测量3.表面可视化4.透明度调整三、ImageJ实用技巧——常见问题汇总1.图像处理与分析2.插件安装与使用3.系统优化与调整四、结论与展望正文：imageJ用户使用手册第三部分一、ImageJ软件简介ImageJ是一款广泛应用于生物医学图像分析的开放源软件。

它具有强大的图像处理和分析功能，可以满足科研人员在实验研究中的需求。

本部分将为您介绍ImageJ的基本操作和实用技巧，帮助您更好地应用这款软件。

二、ImageJ 3D可视化技巧1.三维重建在ImageJ中，可以使用三维重建功能对扫描获得的立体图像进行可视化。

通过调整视角和光照，可以获得更为直观的三维效果。

此外，还可以对重建结果进行定量分析，为科研工作提供有力支持。

2.体积测量借助ImageJ的体积测量功能，用户可以对三维图像中的物体进行精确测量。

例如，在细胞成像研究中，可以测量细胞的大小、形状以及细胞内结构的体积变化等。

3.表面可视化表面可视化是另一种三维可视化技术，可以直观地展示物体表面的形态特征。

在ImageJ中，通过对图像进行表面重建，可以实现物体表面的可视化。

4.透明度调整在三维可视化过程中，可以通过调整图像的透明度来实现不同组织或结构之间的区分。

这对于观察透明或半透明的样品（如细胞和细胞器）非常有用。

三、ImageJ实用技巧——常见问题汇总1.图像处理与分析在ImageJ中，可以利用各种图像处理工具对图像进行预处理，如平滑、锐化、滤波等。

此外，还可以使用测量工具、ROI（感兴趣区域）工具等进行图像分析。

2.插件安装与使用ImageJ具有丰富的插件资源，用户可以根据需要安装和使用这些插件。

安装完成后，插件会自动集成到ImageJ软件中，方便用户进行相关操作。

3.系统优化与调整为了获得更好的图像处理和分析效果，可以对ImageJ系统进行优化和调整。

ImageJ实用技巧——面积测量综述面积测量，是ImageJ中最常用的功能之一，之前的教程中没有对这一功能进行过多的说明。

而越来越多的同学在使用ImageJ测量面积时，出现了各式各样的问题。

这一篇稳重会对怎样利用ImageJ进行面积测量作更的全面叙述，包括手动、半自动和自动框选等类型，旨在让大家对面积测量有更深入的理解，掌握更多面积检测的方法，同时根据所举出的例子，找到适合自己的测量方法。

面积测量的Workflow很简单，只需要两步：1、选出感兴趣的区域（ROI）——即图像分割2、Measure面积测量的本质其实就是图像的分割，图像分割的好坏直接决定了结果的好坏。

区域的框选又可以分为三种类型：1、自动框选（Threshold、Analyze Particles、Color Threshold）2、半自动框选（魔法棒工具、Trainable Weka Segmentation）3、手动框选（矩形、圆形、Free hand工具等）下面会对这三种类型逐一说明并举例：第一步：告诉ImageJ你要测面积这一参数（Analyze -> Set Measurements）在Set Measurements界面勾选Area。

情景一：自动框选（Threshold、Analyze Particles、Color Threshold）1、整体面积（Image -> Adjust -> Threshold）图像转为8-bit后，通过调整阈值，框选出细胞，然后Measure 得到整体的面积。

要求所选区域的灰度值，与周围区域有明显的差别。

2、单个细胞面积（Analyze -> Analyze Particles）图像转为8-bit后，通过调整阈值，框选出细胞。

如果细胞之间有重叠，还需要进行细胞分割。

然后Analyze Particles，得到单个细胞的面积。

可参考这篇文章：Treasure琛：ImageJ实用技巧——单个细胞平均荧光强度自动检测(定量分析篇)3、RGB彩色图像面积（Image -> Adjust -> Color Threshold）对于RGB图像，通过颜色、饱和度、亮度等参数的调节，可以选取到颜色统一的区域。

imagej diameterj使用方法ImageJ和DiameterJ是用于图像处理和分析的软件工具。

ImageJ由美国国立卫生研究院开发，可用于在各种研究领域中，包括生物学、医学和材料科学等快速、准确地进行图像分析。

DiameterJ是ImageJ 的一个插件，可用于测量图像中的物体的直径。

ImageJ的使用方法：第一步，下载和安装ImageJ软件。

ImageJ支持Windows、Linux和Mac平台，可以从其官方网站下载。

第二步，导入需要分析的图像。

可以通过点击“File”菜单，从计算机上导入图像，或通过拖放图像文件到ImageJ窗口中打开它。

第三步，选择想测量的区域。

在ImageJ工具栏中选择适合的选择工具，例如矩形选择工具或椭圆选择工具，从图像中选择想测量的区域。

第四步，测量区域的大小。

在ImageJ的“Analyze”菜单中，选择“Measure”选项，ImageJ将计算区域的大小并将其显示在一个结果表格中。

DiameterJ的使用方法：第一步，下载和安装ImageJ软件。

DiameterJ是ImageJ的一个插件，需要先安装ImageJ才能使用DiameterJ。

第二步，打开图像。

使用ImageJ打开需要测量的图像。

第三步，选择测量对象。

在ImageJ的工具栏中选择DiameterJ工具栏，选择适合的测量对象。

第四步，设置测量参数。

可以设置测量线的颜色、粗细等参数。

第五步，测量直径。

将测量线从一个端点延伸到另一个端点，点击DiameterJ工具栏中的“Measure”按钮，测量直径的结果将显示在结果表格中。

总之，ImageJ和DiameterJ是功能强大的图像处理和分析工具，可用于许多学科领域中的研究。

对于使用这些软件的人来说，了解这些工具的使用方法非常重要，可以大大提高他们的工作效率和准确性。

如何用ImageJ和Origin，轻松测量纳米粒粒径及做粒径分布
图
介绍
制剂的电镜图，是我们在论文或者实验中经常见到的图。

所以，我们今天的教程是如何使用ImageJ对电镜图中的纳米粒进行粒径的整体测量，以及如何使用Origin对其进行作图。

软件
ImageJ
Origin 2019b
图文教程
此教程分为两个部分，首先使用ImageJ进行粒径的测量，然后使用Origin 进行作图。

ImageJ粒径测量1. 使用ImageJ打开图片
2. 使用直线工具，标记标尺
3. 设定标尺：菜单栏-Analyze-Set scale
4. 只需要写上右下角的标尺的单位，点击OK，就会发现图片上方变化了
5. 然后点击ROI manger
6. 然后我们在粒子的直径上画一个横线，点击add it。

可以点击显示
全部和标记，这样标记了的就可以显示出来，避免二次标记，这里我选择20个用来演示。

7. 点击测量
8. 所有的长度就显示出来了
Origin作图1. 打开origin，复制进来所有所测量的粒径数据
2. 选中数据，点击作图(选择分布图)
3. 我们来看一下形成的基础图
4. 对其美化一下
5. 最后，我们可以将两幅图组合在一起。

信息技术利用ImageJ图像处理软件进行小麦籽粒 计数的方法研究文/张世刚(山东省泰安市第一中学）摘要：作物的籽粒数目是作物的重要产量要素之一。

小麦育种、栽培过程中，单株、单穗和群体籽粒数的计 量是基础数据。

在实际工作中，小麦籽粒计数的样品众多，工作量巨大，一般采用人工方式，耗时长，错误率 高。

本研究的目的是利用开放式图像处理软件ImageJ,快速测定小麦籽粒数目。

本研究利用不同来源的小麦单 穗、单株和群体籽粒，通过规模化成像、下载安装软件、标准化参数设置和批量数据输出，进行籽粒计量。

结果表明，本方法能准确地计量不同来源的籽粒数目，卡方结果表明，与人工计量相比，差异极小，能够替代人 工计量。

此外，本系统所利用IimgeJ软件具备较多功能，在进行籽粒计数的基础上，还可以提供籽粒大小等数 据；通过改变参数，还可以将本方法应用于玉米、水稻、花生等作物的籽粒计数。

本文研究的方法简化了小麦 籽粒的测定方式，减少了人为的误差，在实际工作中具有一定应用价值。

关键词：ImageJ软件；图形处理；籽粒计数；小麦Study on Grain-counting Method in Wheat Using ImageJ Image Processing SoftwareZHANG Shigang(The First Middle School of Taian City )Abstract：Grain number of crops is one of the important yield factors. In the process of wheat breeding and cultivation, the grain number measurement of single plant, single panicle and population are the basic data. In practical work, the wheat grain-counting samples are numerous and the workload is huge. Manual way to count grain is time-consuming with higher error rate. The purpose of this study was to rapidly determine the number of wheat grains using an open image processing software, Image^J. In this study wheat grain 什〇171different sources，including single spike, single plant and population were measured by scale imaging, software downloading and installation, standardized parameter setting and batch data out puting. The results showed that this method could accurately measure the grain numbers from different sources, and the chi-square test results showed that compared with manual measurement, the new method had minimal differences, and could replace manual measurement. In addition, the ImageJ software has many additional functions. On the basis of grain-counting, it can also provide the data of grain size etc. By changing parameters,the method can be applied to the grain-counting of corn, rice, peanut and other crops. This method can simplify the determination of wheat grain and reduce the artificial error with certain application value in crop practise.Key words ：ImageJ software; graphic processing; grain counting; wheat第258期NO.258 十二月December 2017 Agriculture Network Information |农业网络信息19I信息技术Technology作物籽粒数目是作物产量的基本要素，也是作物 农艺性状的基本数据。

tem统计粒径计算方法
TEM（透射电子显微镜）是一种非常重要的材料表征技术，可以用于观察材料的微观结构和成分。

在TEM中，粒径计算是一项常见的任务，用于确定样品中颗粒或晶体的大小。

粒径计算方法通常基于图像处理和分析。

以下是一些常用的TEM粒径计算方法：
1. 直接测量法：通过在TEM图像中测量颗粒的直径来计算粒径。

这可以使用像素尺度和已知放大倍数将像素大小转换为实际长度。

然后，可以使用直线或圆形拟合等方法来确定颗粒的直径。

2. 全息法：全息法是一种利用TEM图像的干涉模式来计算粒径的方法。

这种方法需要对干涉模式进行数字处理，以获得粒子的尺寸信息。

3. 统计方法：统计方法基于对TEM图像中颗粒数目和分布的统计分析。

这些方法可以根据颗粒的形状和密度等参数来推断粒径分布。

4. 傅里叶变换方法：傅里叶变换方法利用TEM图像中的频率信息来计算粒径。

这种方法基于颗粒的散射模式，通过将图像转换到频域，并进行傅里叶变换来获取粒径信息。

需要注意的是，不同的粒径计算方法适用于不同类型和形状的颗粒。

选择合适的方法需要综合考虑样品的特点和实验条件。

此外，还有一些商业化的软件和开源软件可用于TEM粒径计算，如ImageJ、Gwyddion等。

这些软件提供了各种功能和工具，可以帮助科研人员进行粒径计算和分析。

作图软件：Image J介绍：该软件可以计算选定区域内分析对象的一系列几何特征，分析指标包括：长度，角度，周长，面积，长轴，短轴，圆度等。

参考：解螺旋-套路课01-第三章-第3节两种应用：免疫组化定量分析，计数免疫组化定量分析3种方法：手动、自动1、自动2【1】手动定量1.打开图片File –open –找到图片2.选择完所有阳性结果后，再同一进行计算Analyze –tools –ROI manger（感兴趣区域）然后标签栏选择第3个标签（以任意形状选取感兴趣区域）【2】自动定量11. 打开图片File –open –找到图片2. 彩图转换为8bit灰度图Image –type –8-bit3. 设定阈值Image –adjust –threshold系统会自动设定一个阈值，并将阈值之上的面积进行统计，此时打开免疫组化原始图片，手动调节阈值大小，当我们设定的阈值能够比价好的反应免疫组化的生物学意义时，就使用此时的阈值统计4. 统计Analyze –measure得到4个参数：area(阳性区域总面积)，mean(平均光密度)，min(最小光密度)，max(最大光密度)，后续作图用。

【3】自动定量21. 打开图片File –open –找到图片2. 彩图转换为RGBImage –type –RGB stack在得到的图片中，通过拖动下方的进度条，选取对比度最显著的那张3. 设定阈值Image –adjust –threshold系统会自动设定一个阈值，并将阈值之上的面积进行统计，此时打开免疫组化原始图片，手动调节阈值大小，当我们设定的阈值能够比价好的反应免疫组化的生物学意义时，就使用此时的阈值统计4. 统计Analyze –measure得到4个参数：area(阳性区域总面积)，mean(平均光密度)，min(最小光密度)，max(最大光密度)，后续作图用。

计数例如：克隆形成实验定量分析两种方法：手动计数、自动计数【1】手动计数1. 打开图片File –open –找到图片2. 点击工具栏第7个按钮“多点计数工具”在每个克隆上进行点击，每点一下，图上就会多一个软件加上的点3. 所有的点都选上之后，点击analyze –measure软件会生成一个结果图拉到最下面，就可以看到一共有多少点【2】自动计数1. 打开图片File –open –找到图片2. 彩图转换为8bit灰度图Image –type –8-bit3. 设定本张图中最大克隆和最小克隆设置最大克隆：点击工具栏第3个按钮，然后圈出本图中最大的克隆，再analyze –measure，看这个克隆的面积，例如area = 276设置最小克隆：点击工具栏第3个按钮，然后圈出本图中最小的克隆，再analyze –measure，看这个克隆的面积，例如area = 544. 设定阈值Image –adjust –threshold系统会自动设定一个阈值，并将阈值之上的面积全部用红色标记如果不合适，可手动调节因为阴影的存在，软件把这些阴影也识别为阳性结果，我们需要通过对克隆大小的限定，从而将阴影排除在阳性结果之外5. 通过对克隆大小的限定，从而将阴影排除Analyze –analyze particles在size（pixel^2）处填入克隆的大小范围，结合第3步的结果设置：30---300，点击“OK”这样，阴影就被排除了6. 拉到最低，便可以看到克隆的数量。

第五课 为他人开一朵花 2.能为别人开花的心是 ，能为别人付出的人是不寻常的人。

这类人必定有 ，有高尚的品格，有 心灵。

3.要做到心中有 ，眼里有世界。

二.导学指导: 1. 阅读教材第48页的短文，四人一组，讨论： （1）张路带水是留给自己喝的吗？杨帆各方面发生变化的原因是什么？张路具有什么样的品质？ （2）说说自己的有哪些为他人着想的想法和行为，这是你品格中闪亮的一角，不要遗漏哟。

2.找一名同学有感情的阅读“感悟角”的短文---《放心,我不会丢下你》，然后自由谈感受. 3.自由默读教材第50页的故事《眼里有世界》，回答： 卢老师为什么会敬佩那位同学？你能举一两个为另人着想，反过来也方便了自己的例子吗？ 三．课堂训练： 1．2008年中新浙江网电 8月8日晚8时8分，一场盛况空前的开幕式拉开了2008北京奥运会的帷幕。

奥运志愿者们以真诚的微笑，周到的服务，细致的关怀，展现了那种时时处处为他人着想的境界和他们人性美的一面“我参与.我奉献.我快乐.我成长”奥运志愿者们奥运志愿者奥运志愿者东方卫报昨天本报提出“别把车骑进菜场买菜”的倡议，本报记者昨天下午再次探访了南苑农贸市场，发现以往菜场里的不文明现象已经有了很大的改观，大部分市民文明买菜既方便了自己，又给了别人方便。

方便了自己，给别人方便市民文明买菜“你自己看不见，为什么还要提着灯走路呢？”盲人说：“我提着灯，为别人照亮道路，同时别人也容易看到我，避免了碰撞。

这样既帮助了别人，也保护了自己。

”同学们，你们听了这则故事，有什么感想呢？ （1）你从老盲人的话中懂得了什么道理？ （2）在这个故事中你是怎样领会“心中有他人”的？ 四．要点归纳及反思: 第2课时 别人的感受你知道吗？ 学习目标：用心理换位的方式体会别人的感受 学习重点：体会别人的感受 学习难点：学会宽容他人 使用说明：课前各位同学自学课本52—55页的内容并完成导学案，在有问题的地方用双色笔做好标注，准备小组讨论，做完后交给小组长，小组长负责检查评价后交学科班长，课前一天交给任课教师批阅评价。

ImageJ图象处理软件在测量玉米子粒大小中的应用白光红;张义荣;刘弋菊;邢鸿雁;严建兵;彭惠茹;章建新;李建生【期刊名称】《玉米科学》【年(卷),期】2009(17)1【摘要】介绍了基于ImageJ软件处理数字图像辅助测量子粒大小的新方法。

分别用图像处理和游标卡尺两种方法测量了70份玉米材料的子粒大小,图像处理法测量的相对误差均小于2%。

对粒长、粒宽和粒厚成组数据进行t测验,两种测量方法间差异不显著。

相关性分析表明,两种测量方法间呈极显著的线性相关。

与游标卡尺法相比,ImageJ软件处理图像法更方便快速,可用于玉米等作物种子大小的实际测量工作。

【总页数】5页(P147-151)【关键词】玉米;图像处理法;测量;子粒【作者】白光红;张义荣;刘弋菊;邢鸿雁;严建兵;彭惠茹;章建新;李建生【作者单位】新疆农业大学农学院,乌鲁木齐830052;中国农业大学／国家玉米改良中心／农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室,北京100094【正文语种】中文【中图分类】S513【相关文献】1.基于ImageJ软件的香樟千粒重的测量及其应用 [J], 钟永达;周燕玲;李彦强;刘立盘;刘淑娟;杨爱红;刘腾云;余发新2.Photoshop软件在园艺试验测量中的应用——一种测量葡萄花蕾大小的新方法[J], 齐永顺;王同坤;张京政;程瑞月;张会龙3.ImageJ软件在数字图像处理课程教学中的应用 [J], 郑林涛;董永生4.ImageJ软件在泥石流固体颗粒分析中的应用 [J], 赵岩;郑娇玉;郭鹏;熊木齐;崔志杰;孟兴民5.Photoshop软件在园艺试验测量中的应用——一种测量葡萄花蕾大小的新方法[J], 齐永顺; 王同坤; 张京政; 程瑞月; 张会龙因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

4hneimagej测定方法ImageJ是一款广泛使用的开源图像处理和分析软件，也是科学研究中常用的图像分析工具。

它具有强大的功能和灵活的扩展性，可以进行各种图像处理、分析和测定。

下面将介绍一种使用ImageJ进行测定的方法。

首先，打开ImageJ软件，并加载需要测定的图像。

可以通过"File"->"Open"来打开图像文件，或者通过"File"->"Acquire"来获取摄像头或扫描仪中的图像。

加载图像后，可以对其进行裁剪、旋转、调整亮度和对比度等预处理操作，以便更好地进行测定。

接下来，选择合适的测定工具。

ImageJ提供了丰富的测定工具和插件，例如可以使用"Line"或"Freehand"工具来测量线段的长度，使用"Particle Analyzer"插件来测量颗粒的数量和大小等。

根据具体测定的对象和需求，选择合适的工具进行测定。

使用选择的工具，点击图像上的起点，然后拖动鼠标至终点，完成测量。

例如，在测量线段长度时，可以使用"Line"工具，点击起点，然后拖动至终点，松开鼠标即可测量到线段的长度。

在测量颗粒的数量和大小时，可以使用"Particle Analyzer"插件，选择合适的阈值进行图像分割，然后进行颗粒的计数和测量。

完成测量后，可以对结果进行分析和记录。

ImageJ提供了许多分析和计算的功能，例如可以进行统计分析、绘制直方图和生成报告等。

可以通过"Analyze"菜单来访问这些功能，根据需要选择相应的分析方法和参数。

完成分析后，可以将结果导出为文本文件或图像文件，以便进一步使用和分享。

在使用ImageJ进行测定时，还需注意一些常见的问题和注意事项。

首先，选择合适的分辨率和图像显示参数，以保证测定的准确性和可重复性。

使用imagej diameterj的技巧使用ImageJ和DiameterJ的技巧简介ImageJ是一款免费的图像处理和分析软件，它提供了丰富的功能和工具，用于处理和测量图像。

其中一个非常有用的插件是DiameterJ，它可以实现图像中物体的直径测量。

本文将介绍如何使用ImageJ和DiameterJ进行直径测量，并分享一些技巧和注意事项。

一、安装和准备1. 下载并安装ImageJ软件，可以从官方网站（）上获取最新版本。

2. 安装完成后，打开ImageJ，然后点击"Plugins" -> "Manage Plugins"，在插件列表中搜索"DiameterJ"并安装。

3. 准备要测量的图像，可以从本地文件夹导入，或通过ImageJ的"File"菜单中的"Open"选项打开。

二、测量直径1. 打开要测量的图像，确保图像属于8位灰度图像或32位浮点图像。

如果不是，请使用ImageJ的"Image"菜单中的"Type"选项将其转换为适当的格式。

2. 选择测量工具。

在ImageJ的工具栏中，可以看到不同的测量工具，包括线段、圆形和椭圆等。

根据图像中物体的形状选择适当的测量工具。

3. 在图像上点击并拖动，绘制一个与物体直径或周长相切的线段、圆形或椭圆。

4. 单击"Analyze"菜单，选择"DiameterJ"，然后选择"Measure"选项。

DiameterJ将自动测量出物体的直径并显示在结果窗口中。

三、技巧和注意事项1. 精确选择：在绘制测量工具时，要尽量准确地选择与物体相关的区域。

避免选择与其他物体重叠或干扰的区域。

2. 多次测量：如果测量对象有多个直径或周长，可以使用多次测量来获取更准确的平均值。

粒径统计之从电镜图到数据图——简单而实用的小软件ImageJ（一）前言：友情提示：大家直接在百度中搜索ImageJ就可以找到这块软件，软件本身也不大，下起来很方便，祝大家使用愉快！ImageJ的功能很多（这是为什么我们选取ImageJ来分享的一个原因），统计粒径的方式也有多种，今天跟大家分享一种最常规的方式——手动统计粒径。

后续我们会对其他的方式也进行一些基本的介绍，敬请期待。

第一步：利用ImageJ打开图片文件。

ImageJ是一个基于java的公共的图像处理软件，它能够处理TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多种格式的图片（只要将SEM，TEM图片变成这些格式就可以用ImageJ进行处理了）。

操作：点击ImageJ菜单栏中File--Open,找到想要打开的TIF或者JPG文件，将其打开，得到下图右所示界面。

备注：TEM图片有的时候是DM3的格式，需要先通过Gatan DigitalMicrograph（有机会后面也会跟大家进行分享）将其转变为TIF或者JPG格式。

第二步：设置标尺。

标尺对于一个图片的重要性用不着我废话，这里，我只讲操作。

a. 在工具栏中找到画线工具，然后采用它画一条直线，与标尺长度重合；（备注：如果标尺太小，可以通过缩放工具将图片放大之后，再用画线工具画直线）b. 在ImageJ的菜单栏中找到Analyze-->Set scale,在弹出来的窗口中，Known Distance一栏中填入标尺的已知长度，Unit of Length 中更改标尺的单位。

然后，点击OK完成标尺的设置。

设置标尺实际上就是要得到像素长度和已知标尺长度的比例尺，这样画一条线就可以通过这个比例直接得到这条线的真实长度。

第三步：量取粒径。

设置好标尺以后，就可以通过划线来方便地量取纳米颗粒的粒径尺寸了。

a. 采用画线工具，划出某一颗粒的直径（如果颗粒太小，可以采用缩放工具进行缩放），然后点击菜单中Analyze-->measure,在弹出的result窗口中，length即为测得的纳米颗粒粒径数据。

灰度分析和细胞计数神器：ImageJ（附软件下载）作者：解螺旋·叶子如需转载请注明来源：解螺旋·医生科研助手导语Image J是NIH推出的分子生物分析软件，使用方便，简单易学。

与PS比起来，Image J有个强大的优势，就是分析处理的结果比较受到普遍承认，不会被怀疑作假（小保方晴子哭晕在厕所）。

Image J用于生物医学领域最多的就是条带灰度值分析（DNA电泳或者Western Blot条带分析）和细胞计数。

来具体看看怎么操作。

条带灰度值分析打开Image J软件，在File里打开图片，并且转化为8-bit灰度图(Image→Type→8bit)。

方框工具选择并画出条带，然后选择Analyze→Gels→Select First Lane。

最后按Analyze→Gels→plot Lanes，就会出现山峰样图。

但这样是不够的，要把每个山峰分开。

这就用到了直线功能，把下面都封口后点击"魔棒"。

分别点击每个峰下方的区域，在"Results" 里就会出现面积，表示相应条带的灰度值。

如果要测多个条带的灰度，就用在Select First Lane后，点Select Next Lane来复选。

这里注意，每个框的形状大小必须是一样的。

分析图像中的颗粒数(细胞计数)打开Image J软件，在File里打开图片，并且转化为8-bit灰度图(Image→Type→8bit)。

这种黑底的图数起来非常困难，需要反相下变成白底图。

框定区域后，选择Edit→Invert。

比之前清楚多了吧，再设置下阈值（Image→Adjust→Threshold）。

经过调整后对比非常明显。

最后，进入Analyze→Analyze Particles, 键入微粒大小的下限和上限，并且选择显示轮廓（Show outlines）和显示结果(Display Results)。

点击ok，被计数的微粒将显示轮廓和编号。

Nano Measurer 1.2；ImageTool (IT) 3.0 ；imageJ，统计粒径、孔径、孔面积，孔的总面积，角度等三款图像分析软件使用方法一、Nano Measurer 1.2 粒径分布计算1.文件/打开图像文件2.对照拍照时的标尺画出一根同样长度的线(图中红线)/设置/标尺3.对话框中输入实际长度100，单位um/确定4.用鼠标在所需测量的孔上划距离，得到有序号的标记5.点击报告/查看报告/跳出统计报告和柱状图6.点击图中下方“统计报告到出…，得到下方数据，ok！！！！******************Nano Measurer 1.2.5***************************************************************************==================Basic report==================Total 35Max./um 29.50Min./um 1.69Mean/um 15.14No. Particle size/um1 22.022 21.043 12.674 13.715 24.126 23.837 17.058 29.509 13.0510 24.5311 13.5912 22.7513 20.2514 11.9015 18.0116 22.5617 14.3518 16.3619 1.8820 16.0721 18.2122 12.5123 24.2824 17.3625 21.2526 13.0927 18.8428 1.6929 4.2130 3.3731 2.6632 5.0633 16.03二、ImageTool (IT) 3.0 统计粒径、孔径、孔面积，孔的总面积，角度等ImageTool (IT) 3.0版是一个免费的科学用途的图像处理与分析软件，可以显示、编辑、分析、处理、压缩、打印灰度图形或彩色图形。

ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数，也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。

step 1.首先打开软件后，开启图档ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数，也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。

step 1.首先打开软件后，开启图档step 2.请先做校正，选择Analyze底下的Calibrate选项，再选择校正的模式，使用Uncalibrate OD，再按ok按下ok之后会出现校正的图形Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项)，再按下Analyze/Gels/select first Lane快速键(Ctr+1)，此时框架中会出现一个号码1，之后可以移动框架到第二个lane再选择Analyze/Gels/select second Lane快速键(Ctr+2)，当然可以一直加下去，最后按Analyze/Gels/plot Lanes快速键(Ctr +3)。

Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度，此时可以看到有几个比较高的区段，就是我们想定量的band，使用直线工具(工具列第五个选项)先将图形中高点为有band的区域和没有band的区域分开再，使用魔术棒工具(工具列第八个选项)点选要分析的区域。

Step 5.当我们点选分析时，在result的对话视窗会出现分析的数据，依序点选就会出现每个band的值。

注：当我们选择分析的条带也可以是横向选取，就可以只比较相同大小的DNA 的含量，同样也可以应用在western blot或其它类似实验条带的分析上。

使用ImageJ 分析图像中的颗粒数[] 原创教程，转载请保留此行1，到本站资料下载-实用小工具栏目下载 ImageJ 并安装。

2，打开ImageJ并打开要分析的图片。

请看演示图片。

3，把图像二值话或者设定阈值。

选择Image - Adjust - Threshold...根据提示设定你需要的阈值。

nano measurer粒径提取代码以下是Nano Measurer粒径提取代码的示例：●import numpy as np●import cv2●def extract_diameters(image):●提取图像中的粒径。

●Args:image:图像。

●Returns:粒径列表。

●灰度化图像。

●gray_image=cv2.cvtColor(image,cv2.COLOR_BGR2GRAY)●二值化图像。

●threshold=cv2.threshold(gray_image,0,255,cv2.THRESH_BINARY|cv2.THRESH_OTSU)[1]●轮廓提取。

●contours,hierarchy=cv2.findContours(threshold,cv2.RETR_EXTERNAL,cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)●计算粒径。

diameters=[]●for contour in contours:●diameter=cv2.arcLength(contour,True)●diameters.append(diameter)●return diameters●加载图像。

image=cv2.imread("image.jpg")●提取粒径。

diameters=extract_diameters(image)●打印粒径。

print(diameters)该代码首先将图像转换为灰度图像，然后进行二值化。

二值化后，图像中的粒子将被转换为白色，背景将被转换为黑色。

然后，使用cv2.findContours()函数提取图像中的所有轮廓。

最后，使用cv2.arcLength()函数计算每个轮廓的周长，并将其转换为粒径。

1.打开粒径分布软件NanoMeasurer软件，点击文件
2.打开要量取的TEM图
3.点击右键可以放大缩小图片，按住左键拖动鼠标量取标尺
4.点击设置，点击标尺，设置标尺的实际长度
5.按住左键拖动鼠标量取粒径大小
6.量取一定数量后，点击报告，点击查看报告，点击“统计报告导出txt文件”
7.复制导出的数据到Origin软件中，选中第二列数据
8.Statistics-Descriptive Statistics-Frequency Counts-Open Dialog
9.在Relative Frequency 打对勾
10.选中第五列比点击柱状图
11.对柱状体进行参数设置：坐标轴参数修改为28字号加粗、坐标标注修改为36字号加粗，边框3倍宽度，线2倍宽度。