人食管鳞状细胞癌细胞株hsam145基因簇表达生物学信息的分析
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miR-145-5p对口腔鳞癌细胞增殖的调控作用及其机制赵微;李润滋;张雨;张雨馨;沈千会;李嘉琪;罗菲;李敏惠;杨平【期刊名称】《成都医学院学报》【年(卷),期】2024(19)2【摘要】目的探究miR-145-5p对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞增殖的调控作用及其机制。
方法利用GEO数据库构建OSCC的miRNA差异表达谱;通过生物信息学技术预测miR-145-5p靶基因并对其进行GO、KEGG及PPI分析;以人OSCC细胞株(HSC-3)为实验对象,将实验分为CN组(未做处理)、NC组(转染mimic NC)和miR-145-5p组(转染miR-145-5p mimic),通过CCK-8法检测不同剂量(50、100、200 nmol/L)miR-145-5p对HSC-3细胞增殖的影响;JC-1和Annexin V-FITC/PI染色结合流式细胞术检测miR-145-5p对HSC-3细胞的凋亡诱导情况;RT-qPCR检测miR-145-5p调控神经母细胞瘤鼠肉瘤同系物(NRAS)、C-JUN氨基端激酶(C-JUN)、信号转导和转录激活因子1(STAT1)的表达情况。
结果 miRNA差异表达谱显示,miR-145-5p在OSCC中表达下调(P<0.05);GO和KEGG分析显示,miR-145-5p靶基因主要调控MAPK信号通路;PPI蛋白互作显示,NRAS是miR-145-5p的关键靶基因之一;CCK-8结果显示,50、100、200 nmol/L的miR-145-5p转染HSC-3细胞后,细胞活力较CN组降低(P<0.05);JC-1染色结果显示,miR-145-5p组HSC-3细胞线粒体膜电位低于CN组(P<0.05);Annexin V-FITC/PI染色结果显示,miR-145-5p组HSC-3细胞凋亡率较CN组明显增加(P<0.05);RT-qPCR结果显示,与CN组比较,miR-145-5p组NRAS 表达降低(P<0.05),而MAPK信号通路关键转录因子C-JUN和STAT1表达升高(P<0.05)。
食管鳞癌组织中hMLH1 mRNA的表达变化及意义叶骉飞;李惠武;庞作良;李卉;田勍;郭文佳;王洪江【期刊名称】《山东医药》【年(卷),期】2010(50)18【摘要】目的观察食管鳞癌组织中错配修复基因hMLH1 mRNA的表达变化,并探讨其临床意义.方法采用RT-PCR法检测60例食管鳞癌组织与癌旁组织中的hMLH1 mRNA.结果食管鳞癌组织中hMLH1 mRNA相对表达量(0.761 7±0.035 7)明显低于癌旁正常组织(1.025 2±0.047 4),P<0.05;hMLH1 mRNA的相对表达量与食管鳞癌分化程度、肿瘤浸润深度和淋巴结转移无关(P均>0.05),与病理分期有关(P<0.05).结论 hMLH1 mRNA表达缺失参与了食管鳞癌的发生或发展.【总页数】2页(P54-55)【作者】叶骉飞;李惠武;庞作良;李卉;田勍;郭文佳;王洪江【作者单位】新疆医科大学附属肿瘤医院,乌鲁木齐,830011;新疆医科大学基础医学院科研中心;新疆医科大学附属肿瘤医院,乌鲁木齐,830011;新疆医科大学基础医学院科研中心;新疆医科大学附属肿瘤医院,乌鲁木齐,830011;新疆医科大学基础医学院科研中心;新疆医科大学附属肿瘤医院,乌鲁木齐,830011【正文语种】中文【中图分类】R737【相关文献】1.食管鳞癌组织中自噬相关基因9B mRNA及蛋白的表达变化 [J], 王玲玲;李蒙妍;贾永旭;常志伟;秦艳茹2.食管鳞癌组织中Wnt2、Dvl mRNA和蛋白表达变化及意义 [J], 王勇涛;汪洋;尚自强;王洪江3.弥漫性大 B 细胞淋巴瘤组织中 MGMT、hMLH1蛋白表达变化及其临床意义 [J], 陈军;廖小莉;覃思繁;林思彤4.Ⅲ期鼻咽癌组织中hMLH1与p53的表达变化及意义 [J], 徐澍;胡赟;张维元5.EphA2、hMLH1、hMSH2 mRNA在新疆维吾尔及汉族食管鳞癌中的表达及意义 [J], 叶骉飞;李惠武;庞作良;李卉;田勍;陈艳;郭文佳;李秀梅;王洪江因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
食管鳞癌组织中HGF、c-met表达变化及意义赵杨;李嘉;徐树雷;申兴斌【摘要】目的观察食管鳞癌组织中肝细胞生长因子(HGF)及其受体c-met的表达变化,并探讨其临床意义.方法采用RT-PCR技术和免疫组化法检测50例食管鳞癌患者手术切除肿瘤组织(观察组)和其中20例患者远离病灶的正常食管黏膜组织(对照组)中的HGF、c-met mRNA和蛋白.结果观察组HGF、c-met mRNA和蛋白表达量明显高于对照组(P均<0.05).观察组HHGF、c-met mRNA和蛋白表达与食管鳞癌淋巴结转移、TNM分期有关(P均<0.05),HGF、c-met mRNA和蛋白表达呈正相关(r=0.89、0.68,P均<0.01).结论食管鳞癌组织中HGF、c-met mRNA 和蛋白表达上调,二者可能参与了食管鳞癌的发生、发展过程.【期刊名称】《山东医药》【年(卷),期】2016(056)006【总页数】3页(P52-54)【关键词】食管鳞癌;肝细胞生长因子;肝细胞生长因子受体;c-met蛋白【作者】赵杨;李嘉;徐树雷;申兴斌【作者单位】承德医学院附属医院,河北承德067000;承德医学院附属医院,河北承德067000;承德医学院肛肠医院;承德医学院附属医院,河北承德067000【正文语种】中文【中图分类】R735.1肝细胞生长因子(HGF)可以促进多种细胞的分裂、生长、运动以及血管生成[1]。
c-met是由原癌基因编码的蛋白产物,是HGF的受体,具有酪氨酸激酶活性[2]。
在一些恶性肿瘤细胞中存在HGF与c-met共同表达,构成不受调控的异常自分泌环,持续激活信号通路,促进肿瘤恶性演进。
2014年5~11月,我们检测了食管癌组织中HGF、c-met的表达变化,并分析其与食管癌临床病理参数的关系,探讨HGF、c-met在食管癌发生、发展中的作用。
1.1 临床资料收集承德医学院附属医院收治的50例食管鳞癌患者的手术切除肿瘤组织标本为观察组。
SMO蛋白及mRNA在食管鳞状细胞癌组织中的表达及意义李俊平;陈奎生【期刊名称】《肿瘤基础与临床》【年(卷),期】2011(024)001【摘要】目的探讨SMO蛋白及mRNA在食管鳞状细胞癌组织中的表达及意义.方法分别应用免疫组织化学及原位杂交方法检测68例食管鳞状细胞癌组织、35例癌旁不典型增生组织及68例正常食管黏膜组织中SMO蛋白及mRNA的表达,并分析其与食管鳞状细胞癌各临床病理特征的关系.结果 SMO蛋白的阳性表达率在正常食管黏膜组织、癌旁不典型增生组织及食管鳞状细胞癌组织中依次增高,分别为0%,28.6%和69.1%,总体差异有统计学意义(P<0.05);SMO mRNA的阳性表达率在正常食管黏膜组织、癌旁不典型增生组织及食管鳞状细胞癌组织中亦依次增高,分别为0%、14.3%和63.9%,总体差异有统计学意义(P<0.05);SMO蛋白及mRNA的阳性表达率均与食管鳞状细胞癌组织学分级、浸润深度、淋巴结转移及TNM分期有关(P<0.05).结论 SMO蛋白及mRNA阳性表达率升高可能与食管鳞状细胞癌的发生、发展及浸润转移有关.【总页数】3页(P1-3)【作者】李俊平;陈奎生【作者单位】郑州大学第一附属医院病理科,河南省肿瘤病理重点实验室,河南,郑州,450052;郑州大学第一附属医院病理科,河南省肿瘤病理重点实验室,河南,郑州,450052【正文语种】中文【中图分类】R735.1【相关文献】1.Smo蛋白及Gli-1蛋白在人子宫内膜癌组织中的表达及临床意义 [J], 张铮铮;刘筱;徐浩;经莉;杜文升;陆晓媛2.Smo蛋白及Glil蛋白在结直肠癌组织中的表达及其意义 [J], 朱达坚;陈小伍;剧永乐;康凯夫;陈坚平;陆光生;戎祯祥3.Sonic hedgehog信号通路Smo蛋白及其下游转录因子Glil蛋白在胃癌组织中的表达及其意义 [J], 戎祯祥;方驰华;朱达坚;刘胜军4.Smo蛋白及Gli-1蛋白在人子宫内膜癌组织中的表达及临床意义 [J], 张铮铮;刘筱;徐浩;经莉;杜文升;陆晓媛5.Smo和Gli1蛋白在食管鳞状细胞癌组织中的表达及临床意义 [J], 孙波;张蕾;李颖霞;符仲标;卲惠杰;温洪涛因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
·论著·食管鳞状细胞癌中犕犌犘基因的表达和启动子区甲基化状态及其临床意义薛 丽 叶 明 王 刚 【摘要】 目的 研究基质Gla蛋白(MGP)在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的表达和启动子区甲基化状态,探讨MGP对ESCC细胞侵袭的影响。
方法 收集2014年5月至2019年5月于中国人民解放军空军第九八六医院就诊的253例ESCC患者的ESCC组织标本和癌旁非癌组织标本,分别设为ESCC组和癌旁非癌组。
采用实时荧光定量PCR(Real timeqPCR)法检测犕犌犘mRNA的相对表达量,采用蛋白质印迹法检测MGP的蛋白表达水平,采用免疫组织化学染色法评估MGP蛋白在组织中的定位和分布,采用甲基化酶消化法、DNA亚硫酸氢盐修饰法及Real timeqPCR法分析犕犌犘基因启动子区的甲基化状态。
构建重组MGP过表达质粒和DNA甲基化转移酶1的沉默质粒(siDNMT1)。
将人ESCC细胞系KYSE30分为对照组、si DNMT1组、阴性对照(si NC)组、MGP过表达组和空载体(EV)组,采用Transwell小室法检测各组细胞的侵袭能力。
结果 与癌旁非癌组织相比,ESCC组织中犕犌犘mRNA和蛋白表达水平均显著升高,差异均有统计学意义(犘均<0.05)。
免疫组织化学染色结果表明,ESCC组织中犕犌犘的阳性率高于癌旁非癌组织。
与癌旁非癌组相比,ESCC组中犕犌犘基因启动子区CpG岛甲基化水平降低,两组差异有统计学意义(犘<0.05)。
与对照组相比,MGP过表达组KYSE30细胞的侵袭能力较强;与si NC组相比,si DNMT1组KYSE30细胞的侵袭能力较强,组间比较差异均有统计学意义(犘均<0.05)。
结论 ESCC组织中MGP表达上调或犕犌犘基因启动子区甲基化下调可以介导ESCC细胞的侵袭。
【关键词】 基质Gla蛋白;食管鳞状细胞癌;基因甲基化;侵袭DOI:10.3969/j.issn.1673 534X.2021.06.009 基金项目:陕西省重点研发计划项目(2019SF 168) 作者单位:720054 陕西西安,中国人民解放军空军第九八六医院检验病理科(薛丽);610303 陕西宝鸡,中国人民解放军联勤保障部队第九八七医院检验科(叶明、王刚) 通信作者:王刚,Email:wggang_515@163.com犕犌犘犵犲狀犲犲狓狆狉犲狊狊犻狅狀犪狀犱狆狉狅犿狅狋犲狉犿犲狋犺狔犾犪狋犻狅狀狊狋犪狋狌狊犻狀犲狊狅狆犺犪犵犲犪犾狊狇狌犪犿狅狌狊犮犲犾犾犮犪狉犮犻狀狅犿犪犪狀犱犻狋狊犮犾犻狀犻犮犪犾狊犻犵狀犻犳犻犮犪狀犮犲 犡犝犈犔犻.犇犲狆犪狉狋犿犲狀狋狅犳犔犪犫狅狉犪狋狅狉狔犘犪狋犺狅犾狅犵狔,986狋犺犎狅狊狆犻狋犪犾狅犳犘犔犃犃犻狉犉狅狉犮犲,犡犻′犪狀720054,犆犺犻狀犪;犢犈犕犻狀犵,犠犃犖犌犌犪狀犵.犇犲狆犪狉狋犿犲狀狋狅犳犔犪犫狅狉犪狋狅狉狔犕犲犱犻犮犻狀犲,987狋犺犎狅狊狆犻狋犪犾狅犳犘犔犃,犅犪狅犼犻610303,犆犺犻狀犪【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 ToinvestigatetheexpressionandpromotermethylationofmatrixGlaprotein(MGP)inesophagealsquamouscellcarcinoma(ESCC),andtoinvestigatetheeffectofMGPoninvasionofESCCcells.犕犲狋犺狅犱狊 FromMay2014toMay2019,twohundredandfifty threepatientswithESCCwereenrolledinthe986thHospitalofPLAAirForceforESCCandparacancernon cancertissuesamples,whichweredividedintotheESCCgroupandtheparacancernon cancergrouprespectively.Therelativeexpressionof犕犌犘mRNAwasdetectedbyreal timequantitativePCR(Real timeqPCR).WesternblottingwasusedtodetecttheexpressionofMGPprotein,andimmunohistochemistrywasusedtoevaluatethelocationanddistributionofMGPproteinintissues.·334·国际消化病杂志2021年12月第41卷第6期 IntJDigDis,December25,2021,Vol.41,No.6Copyright©博看网 . All Rights Reserved.Methylationstatusofthepromoterregionof犕犌犘genewasanalyzedbyutilizingthemethylasedigestionandDNAbisulfitemodificationmethodandReal timeqPCRmethod.RecombinantMGPoverexpressionplasmidandmethyltransferaseDNMT1silencingplasmid(si DNMT1)wereconstructed.ThehumanESCCcelllineKYSE30wasassignedtothecontrolgroup,thesi DNMT1group,thesi NCgroup,theMGPoverexpressiongroup,andtheemptyvector(EV)group.Thetranswellcellmethodwasusedtodetecttheinvasionabilityofeachgroupofcells.犚犲狊狌犾狋狊 Comparedwithnon canceroustissuesadjacenttocancer,thelevelsof犕犌犘mRNAandproteininESCCtissuesaresignificantlyhigher,withstatisticallysignificantdifferences(犘<0.05).TheresultsofimmunohistochemicalstainingshowthatthepositiverateofMGPinESCCtissuesishigherthanthatinnon canceroustissuesadjacenttocancer.Comparedwiththeadjacentnon cancerousgroup,themethylationlevelofCpGislandinthe犕犌犘genepromoterregionintheESCCgroupisreduced,withastatisticallysignificantdifference(犘<0.05).Comparedwiththecontrolgroup,theinvasionabilityofKYSE30cellsintheMGPoverexpressiongroupisstronger;comparedwiththesi NCgroup,theinvasionabilityofKYSE30cellsinthesi DNMT1groupisstronger,withstatisticallysignificantdifferences(犘<0.05).犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀 Up regulationofMGPexpressionordown regulationof犕犌犘genepromoterregionmethylationinESCCtissuescanmediateESCCcellinvasion.【犓犲狔狑狅狉犱狊】 MatrixGlaprotein;Esophagealsquamouscellcarcinoma;Genemethylation;Invasion 食管鳞状细胞癌(ESCC)是食管癌的主要亚型,在中国的发病率较高[1]。
中英文缩略词对照表英文缩写英文全名中文译名APOE Apolipoprotein e载脂蛋白ECLIC3chloride intracellularchannel protein3细胞内氯离子通道3COL11A1collagen typeXIAlpha-1XI型胶原a1 CXCL13C-X-C motif ligand13趋化因子CXC配体13 CXCR2CXC chemokine receptor2CXC趋化因子受体2CRISP3Cysteine Rich SecretoryProtein3富含半胱氨酸的蛋白3EYA2eyes absent homolog2眼缺失基因2ESCC Esophageal squamous cellcarcinoma食管鳞状细胞癌ENDOU Endouclease特异性核酸内切酶FLG Filaggrin丝聚蛋白HOXD10homeobox D10同源异型盒D10基因INHBA Inhibin beta A抑制素A KRT13Keratin13细胞角蛋白13 LHX2LIM Homebox2LIM同源框基因2MMPMatrix metalloproteinases基质金属蛋白酶MAGEA melanorflaantigenassociatedgene黑色素瘤抗原基因SPRRs small proline-richproteins富含脯氨酸的小蛋白SYNPO2L synaptopodin2-likeprotein突触足2样蛋白TGM1transglutaminase1转谷氨酰胺酶1 XCL1Lymphotactin淋巴细胞趋化因子目录摘要 (1)2 ABSTRACT………………………………………………………………………………前言 (4)5研究内容与方法………………………………………………………………………………1.数据集的获取 (5)52.方法……………………………………………………………………………………………103.统计学方法………………………………………………………………………………104.技术路线图.............................................................................................结果 (11)20讨论…………………………………………………………………………………………致谢 (27)28参考文献……………………………………………………………………………………综述 (32)38攻读硕士学位期间发表的学位论文………………………………………………………39导师评阅表………………………………………………………………………………食管鳞癌预后标志物的筛选及其生物信息学分析研究生:高艳导师:张莉教授/主任医师摘要目的:对食管鳞癌(Esophageal Squamous Cell Carcinoma ESCC)患者的组织基因芯片数据进行生物信息学分析,筛选与食管鳞癌发生、发展可能相关的靶基因并进行分析,进一步筛选与预后相关的基因。
基于生物信息学分析筛选舌鳞状细胞癌核心基因及其预后价值【摘要】本研究利用生物信息学分析方法筛选出舌鳞状细胞癌核心基因,并对其进行基因功能和通路分析。
结果显示这些核心基因在舌鳞状细胞癌的预后中具有重要价值,临床验证结果也证实了这一发现。
本研究为舌鳞状细胞癌的预后评估提供了新的分子标志物,有望帮助指导个体化治疗策略。
未来研究可进一步深入探讨这些核心基因的生物学功能及相关通路,以拓展临床应用领域。
这项研究为基于生物信息学分析筛选舌鳞状细胞癌核心基因及其预后价值提供了重要参考,对临床实践具有积极的启示作用。
【关键词】生物信息学分析、舌鳞状细胞癌、核心基因、预后价值、临床验证、研究总结、未来研究方向、临床实践1. 引言1.1 研究背景舌鳞状细胞癌是口腔颌面部最常见的恶性肿瘤之一,具有高度侵袭性和转移性,严重影响患者的生存质量。
目前,针对舌鳞状细胞癌的治疗主要以手术切除结合放疗和化疗为主,但仍存在许多患者耐药或复发的情况,预后不容乐观。
寻找舌鳞状细胞癌预后的生物标志物和核心基因,对于指导临床治疗和提高患者预后具有重要的意义。
随着生物信息学技术的发展,基因组学、转录组学和蛋白质组学等高通量数据的快速产生和分析,为筛选出舌鳞状细胞癌的核心基因提供了新的途径。
通过生物信息学分析方法,可以有效地识别出在舌鳞状细胞癌发生发展中起关键作用的基因,并深入探究这些基因的功能和通路,为进一步研究其在舌鳞状细胞癌中的生物学意义和临床预后价值奠定基础。
本研究旨在利用生物信息学方法筛选出舌鳞状细胞癌的核心基因,并探讨其在该疾病中的作用及预后价值,为舌鳞状细胞癌的治疗和预后评估提供新的思路和方法。
1.2 研究目的本研究的目的是通过生物信息学分析筛选出舌鳞状细胞癌的核心基因,探讨这些基因在肿瘤发生发展过程中的重要作用和机制,以及它们在患者预后中的潜在价值。
通过深入研究这些核心基因的功能和通路,我们希望能够为舌鳞状细胞癌的生物学特征提供更深入的理解,为患者的个体化治疗提供更有效的指导。
microRNA-145对食管鳞状细胞癌细胞增殖的影响孙嘉伟;刘凤霞;刘文亚;薛敏杰;王潇【期刊名称】《新疆医科大学学报》【年(卷),期】2013(036)006【摘要】目的探讨microRNA-145(miR-145)对食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞增殖的影响.方法用脂质体法将miR-145转染入ESCC细胞,实验分为正常对照组、随机序列组和miR-145组.在荧光显微镜下观察细胞生长及基本形态,采用实时定量PCR(qRT-PCR)检测各组细胞miR-145的表达,采用噻唑蓝(MTT)增殖试验检测细胞增殖情况,用伤口愈合实验检测细胞迁移.结果 72 h后,MTT增值实验显示,miR-145组[表达值为(0.56+0.04)]的癌细胞增殖速度较正常对照组[表达值为(0.98+0.09)]和随机序列组[表达值为(0.95+0.11)]明显下降,差异有统计学意义(P <0.05).结论 miR-145对ESCC细胞的增殖可能有抑制作用.【总页数】4页(P756-758,762)【作者】孙嘉伟;刘凤霞;刘文亚;薛敏杰;王潇【作者单位】基础医学院人体解剖教研室,乌鲁木齐,830011;基础医学院人体解剖教研室,乌鲁木齐,830011;第一附属医院影像中心,乌鲁木齐,830054;基础医学院人体解剖教研室,乌鲁木齐,830011;基础医学院人体解剖教研室,乌鲁木齐,830011【正文语种】中文【中图分类】R735.1【相关文献】1.MicroRNA-145对骨肉瘤细胞增殖及凋亡的影响 [J], 范磊;邵增务;吴强;魏玉龙;于晓巍2.咖啡酸对食管鳞状细胞癌KYSE150细胞增殖、迁移、侵袭及裸鼠移植瘤生长的影响 [J], 孙晓萌;齐义军;高社干3.上调环状RNA_8199表达对食管鳞状细胞癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响[J], 王伟;燕迪迪;丁爽;倪凯园;姜国忠4.RBMX在食管鳞状细胞癌中的相关性研究——RBMX对食管鳞状细胞癌细胞增殖和凋亡的影响 [J], 刘芳;李贵才;丁宗梅;秦凯;陆松华5.S1P/S1PR1通路调节补体B因子的表达对食管鳞状细胞癌细胞增殖和迁移的影响 [J], 徐凤敏;陈昱伶;任玲;蒙春梅;李倩倩;胡为民因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。