(整理)生化第十四章
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第十三章脂类代谢β-氧化:碳氧化降解生成乙酰CoA,同时生成NADH 和FADH2,因此可产生大量的ATP。
该途径因脱氢和裂解均发生在β位碳原子而得名。
每一轮脂肪酸β氧化都由四步反应组成:氧化,水化,再氧化和硫解。
肉毒碱穿梭系统(carnitine shuttle system):脂酰CoA通过形成脂酰肉毒碱从细胞质转运到线粒体的一个穿梭循环途径。
酮体(acetone body):在肝脏中由乙酰CoA合成的燃料分子(β羟基丁酸,乙酰乙酸和丙酮)。
在饥饿期间酮体是包括脑在内的许多组织的燃料,酮体过多会导致中毒。
柠檬酸转运系统(citrate transport system):将乙酰CoA从线粒体转运到细胞质的穿梭循环途径。
在转运乙酰CoA的同时,细胞质中NADH氧化成NAD﹢,NADP+还原为NADPH。
每循环一次消耗两分子ATP.第十四章蛋白质代谢生物固氮作用(biological nitrogen fixatio):大气中的氮被原还为氨的过程。
生物固氮只发生在少数的细菌和藻类中。
尿素循环(urea cycle):是一个由4步酶促反应组成的,可以将来自氨和天冬氨酸的氮转化为尿素的循环。
循环是发生在脊椎动物的肝脏中的一个代谢循环。
脱氨(deamination):在酶的催化下从生物分子(氨基酸或核苷酸)中除去氨基的过程。
氧化脱氨(oxidative deamination):α-氨基酸在酶的催化下脱氨生成相应的α-酮酸的过程。
氧化脱氨实际上包括氧化和脱氨两个步骤。
(脱氨和水解)转氨(transamination):一个α-氨基酸的α-氨基借助转氨酶的催化作用转移到一个α-酮酸的过程。
乒乓反应(ping-pong reaction):在该反应中,酶结合一个底物并释放一个产物,留下一个取代酶,然后该取代酶再结合第二个底物和释放出第二个产物,最后酶恢复到它的起始状态。
生糖氨基酸(glucongenic amino acid):降解可生成能作为糖异生前体的分子,例如丙酮酸或柠檬酸循环中间代谢物的氨基酸。
第十四章蛋白质生物合成一、填空题1.蛋白质的生物合成是以____作为模版,_____作为运输氨基酸的工具,____作为合成的场所。
2.细胞内多肽链合成的方向是从端到端,而阅读mRNA的方向是从_____到___端。
3.核糖体上能够结合tRNA的部位有部位、部位和部位。
4.ORF是指,已知发现最小的PRF只编码个氨基酸。
5.蛋白质的生物合成通常以作为起始密码子,有时也以作为起始密码子,是以和以及作为终止密码子.6.SD序列是指原核细胞mRNA的5′端富含碱基的序列,它可以和16SrRNA的3′端的序列互补配对,而帮助起始密码子的识别.7.含硒半胱氨酸的密码子是。
8.原核生物蛋白质合成的起始因子(IF)有种,延伸因子(EF)有种,终止释放因子(RF)有种;而真核生物细胞质蛋白质合成的延伸因子通常有种,真菌有种,终止释放因子有种。
9.密码子的第二个核苷酸如果是嘧啶核苷酸,那么该密码子所决定氨基酸通常是。
10.原核生物蛋白质合成中第一个被掺入的氨基酸是。
11.真核生物细胞质蛋白质合成对起始密码子的识别主要是通过机制进行。
12.无细胞翻译系统翻译出来的多肽链通常比在完整的细胞中翻译的产物要长,这是因为。
13.蛋白质的半寿期通常与端的氨基酸性质有关。
14.tmRNA是指。
15.同工受体tRNA是指。
16.疯牛病的致病因子是一种.17.已发现体内大多数蛋白质正确的构象的形成需要的帮助,某些蛋白质的折叠还需要的催化酶是和。
18.SRP是指,它是一种由和组成的超分子体系,它的功能是。
19.蛋白质定位于溶酶体的信号是。
20.分子伴侣通常具有酶的活性。
21.某些蛋白质基因的编码链上并无终止密码子,但可以通过Pre—mRNA的和两种后加工方式引入终止密码子。
22.蛋白质内含子通常具有_____酶的活性。
23.已有充分的证据表明大肠杆菌的转肽酶由其核糖体的____承担。
24.决定蛋白质进入过氧化物酶体的信号肽是____。
第一章、蛋白质的结构与功能1、主要元素:C、H、O、N、S(P7)2、定氮法:样品中含蛋白质克数=样品的含氮克数×6.253、肽键:肽键是由一个氨基酸α-羟基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩全面行成的化学键,是蛋白质分子中的主要共价键,性质比较稳定。
(P11)4、肽:肽是氨基酸通过肽键相连的化合物,蛋白质不完全水解的产物也是肽。
10个以下氨基酸组成成寡肽,10个以上氨基酸组成称多肽。
(P11)5、多肽和蛋白质分子中的氨基酸均称为氨基酸残基。
具有特殊的生理功能的肽称为活性肽。
(P11)6、蛋白质一级结构:指多肽链中氨基酸(残基)从N端到C端的排列顺序,即氨基酸序列。
主要化学键为肽键。
(P12)7、蛋白质二级结构:指多肽链中相邻氨基酸残基的局部肽链空间结构,是其主链原子的局部空间排布。
主要化学键为氢键。
(P13)8、蛋白质三级结构:指整条多肽链中所有氨基酸残基,包括主链和侧链在内所形成的空间结构。
主要化学键为疏水键。
(P15)9、结构域:分子量大的蛋白质分子由于多肽链上相邻的超二级结构紧密联系,形成多个相对独特并承担不同生物学功能的超三级结构。
(P16)10、蛋白质四级结构:指各具独立三级结构多肽链以各种特定形式接触排布后,结集在此蛋白质最高层次空间结构。
在此空间结构中,各具独立三级结构的多肽链称亚基。
主要化学键为疏水键,氢键,离子键。
(P16)第三章、酶1、同工酶:指催化的化学反应相同,但酶蛋白的分子结构、理化性质及免疫化学特性不同的一组酶。
亚基:骨骼肌形和心肌形。
组成的五种同工酶:LDH1(H4)、LDH2(H3M)、LDH3(H2M4)、LDH4(HM3)、LDH5(M5)。
(P40)2、酶促反应的特点:催化性、特异性、不稳定性、调节性。
(P41)第五章、糖代谢1、糖酵解反应的特点:在无氧条件下发生的不完全的氧化分解反应,整个过程均在胞质中完成,无需氧的参与,终产物是乳酸;反应中适放能量较少,一分子葡萄糖可净生成二分子ATP。
第一章: 蛋白质的结构与功能1.蛋白质元素组成,利用何种元素可推算出其在样品中含量?2.组成蛋白质的氨基酸基本分类,根据是什么?3.蛋白质的一级结构与空间结构(二、三、四级,基元)概念,稳定力量。
4.α-螺旋和β-折叠的结构特征。
5.多肽链中氨基酸测定,主要分析方法。
6.蛋白质分子量测定基本方法有几种?7.蛋白质变性及理化性质改变的特征8.何谓蛋白质的等电点(pI)?在酸性或碱性环境中,某一pI的蛋白质带电荷会一样吗?会带何种电荷?9.蛋白质亲水胶体特征及稳定因素。
10.蛋白质分离纯化基本依据?常用方法。
第二章: 核酸的结构与功能1.单核苷酸组成成分及其各成分之间的连接方式:ATP、NAD、ANDP、FAD、cAMP 的组成和中文读法2.DNA分子一级、二级、三级结构概念(注意原核与真核生物的相似与区别)3.参与Pr生物合成的三种RNA(tRNA、rRNA、mRNA)细胞含量、分子大小、稳定性、构成或构型。
4.核酸的理化性质包含哪几个方面?5.核酸变性、复性、杂交概念(注意在某一种情况下构型的变化)6.DNA、RNA分离纯化的基本原则7.核酸含量的测定方法有几种?方法的建立以何种核酸成分为基础的?第三章: 酶1.作为生物催化剂的特点2.何谓酶的专一性?分几类?3.酶分类的根据?分几类?命名分类?4.全酶构成?各成分在酶促反应中作用?5.金属离子在酶分子中作用?6.B族Vit辅酶形式是什么?一般有何作用?7.酶的活性中心及必需基团?8.酶促反应影响因素有哪些?9.最适pH,最适T,Km意义。
10.酶高效率的机制?11.何谓酶的抑制作用?抑制剂分类?12.竞争性抑制剂与非竞争抑制剂对酶的抑制作用方式各是怎样?对Km,Vmax影响如何?13.从对酶作用考虑,有机磷中毒与重金属中毒机理及急救机理?14.寡聚酶,同工酶,诱导酶。
15.酶的活性单位定义。
第四章: 糖代谢1.糖的化学本质是什么?糖类在体内有何生理功能?2.什么是糖酵解?有何生理意义?3.何谓有氧氧化?有氧氧化主要分为几个阶段?有何生理意义?4.何谓三羧酸循环?有何生理作用?5.什么是磷酸戊糖途径?有何生理意义?6.什么是糖异生?其生理意义是什么?7.试述丙酮酸是如何异生成糖的?8.糖原是如何合成和分解的?9.试比较肝糖原与肌糖原的合成有何异同点?10.食物中的淀粉是怎样被消化吸收的?又怎样转变成肝糖原?11.比较糖代谢各途径在细胞内进行的部位、关键酶、产物、ATP生成与消耗。
第十四章蛋白质生物合成一、填空题1.蛋白质的生物合成是以____作为模版,_____作为运输氨基酸的工具,____作为合成的场所。
2.细胞内多肽链合成的方向是从端到端,而阅读mRNA的方向是从_____到___端。
3.核糖体上能够结合tRNA的部位有部位、部位和部位。
4.ORF是指,已知发现最小的PRF只编码个氨基酸。
5.蛋白质的生物合成通常以作为起始密码子,有时也以作为起始密码子,是以和以及作为终止密码子。
6.SD序列是指原核细胞mRNA的5′端富含碱基的序列,它可以和16SrRNA的3′端的序列互补配对,而帮助起始密码子的识别。
7.含硒半胱氨酸的密码子是。
8.原核生物蛋白质合成的起始因子(IF)有种,延伸因子(EF)有种,终止释放因子(RF)有种;而真核生物细胞质蛋白质合成的延伸因子通常有种,真菌有种,终止释放因子有种。
9.密码子的第二个核苷酸如果是嘧啶核苷酸,那么该密码子所决定氨基酸通常是。
10.原核生物蛋白质合成中第一个被掺入的氨基酸是。
11.真核生物细胞质蛋白质合成对起始密码子的识别主要是通过机制进行。
12.无细胞翻译系统翻译出来的多肽链通常比在完整的细胞中翻译的产物要长,这是因为。
13.蛋白质的半寿期通常与端的氨基酸性质有关。
14.tmRNA是指。
15.同工受体tRNA是指。
16.疯牛病的致病因子是一种。
17.已发现体内大多数蛋白质正确的构象的形成需要的帮助,某些蛋白质的折叠还需要的催化酶是和。
18.SRP是指,它是一种由和组成的超分子体系,它的功能是。
19.蛋白质定位于溶酶体的信号是。
20.分子伴侣通常具有酶的活性。
21.某些蛋白质基因的编码链上并无终止密码子,但可以通过Pre-mRNA的和两种后加工方式引入终止密码子。
22.蛋白质内含子通常具有_____酶的活性。
23.已有充分的证据表明大肠杆菌的转肽酶由其核糖体的____承担。
24.决定蛋白质进入过氧化物酶体的信号肽是____。
25.T4噬菌体基因60在翻译的过程中经历____过程。
26.某一tRNA的反密码子是GGC,它可识别的密码子为____和____。
27.mRNA上编码区内密码子的突变可造成致死作用,但是生物体可以通过tRNA反密码子的图摆弄而得以成活。
这种tRNA的突变又称为____,而这种tRNA称为_____。
28.以(UAG)n作为模版在无细胞翻译系统中进行翻译克得到____种多肽。
29.环状RNA不能有效的作为真核翻译系统的模版是因为i____。
30.常见的无细胞翻译系统有____、____、____和____等。
二、是非题1.氨酰-tRNA合成酶可通过其催化的逆反应对误载的氨基酸进行校对。
2.在蛋白质生物合成中,所有的氨酰-tRNA都是首先进入核糖体的A部位。
3.由于遗传密码的通用性,所以真核细胞的mRNA可在原核翻译系统中得到正常的翻译。
4.核糖体蛋白不仅仅参与蛋白质的生物合成。
5.在翻译起始阶段,由完整的核糖体与mRNA可在元和翻译系统中得到正常的翻译。
6.所有的氨酰-tRNA的合成都需要相应的氨酰-tRNA合成酶的催化。
7.EF-Tu的GTPase活性越高,翻译的速度就越快,但是翻译的忠实性就越低。
8.fMet-tRNA f Met与Met-tRNA m Met 的合成由同一种氨酰-tRNA合成酶催化。
9.对于同一种氨酰-tRNA合成酶来说,在它的催化下,被识别的氨基酸随即的与其相应的tRNA的3′端CCA的3′-OH或5′-OH形成酯键。
10.tRNA的个性即是其特有的三叶草结构。
11.含硒半胱氨酸-tRNA是由游离的含硒半罐氨酸与tRNA Sec合成而来的。
12.含硒半胱氨酸的掺入需要一种新的延伸因子。
13.泛素是一种热激蛋白(HSP)。
14.氨酰-tRNA进入A部位之前,与EF-Tu结合的GTP必须水解。
15.从DNA分子的三联体密码可以毫不怀疑地推断出某一多肽的氨基酸序列,但是从氨基酸序列并不能准确的推导出相应基因的核苷酸序列。
16.已知发现许多蛋白质的三维结构不是由其一级结构决定的,而是由分子伴侣决定的。
17.多肽链的折叠发生在蛋白质合成结束以后才开始18.在线粒体内的翻译系统中,第一个被掺入的氨基酸也都是甲酰甲硫氨酸。
19.蛋白质翻译一般以AUG作为起始密码子,有时也以GUG为起始密码子,但是以GUG为起始密码子,第一个被掺入的氨基酸为Val。
20.大肠杆菌丙氨酰-tRNA的合成并不需要tRNA ala具有完整的三叶草结构。
21.与核糖体蛋白相比,rRNA仅仅作为核糖体的结构骨架,在蛋白质合成中没有什么直接作用。
22.甲硫氨酸能够刺激蛋白质的生物合成。
23.绝大多数含硒蛋白是氧化还原酶。
24.人工合成多肽的方向也是从N端到C端。
25.在大肠杆菌里表达人组蛋白,可直接从人基因组中获取目的基因。
26.细胞内的tRNA只参与蛋白质的合成。
三、选择题(下列各题均有五个备选答案,是从其中选出一个)1.预测一下哪一种氨酰-tRNA合成酶不需要有校对的功能()(A)干氨酰-tRNA合成酶(B)丙氨酰-tRNA合成酶(C)精氨酰-tRNA合成酶(D)谷氨酰-tRNA合成酶(E)色氨酰-tRNA合成酶2.预测一下哪一种蛋白质的半寿期最长。
()(A)醛缩酶(B)葡萄糖激酶(C)HMGCoA还原酶(D)丙酮酸激酶(E)柠檬酸合成酶3.某一种tRNA的反密码子为5′IUC3′,它识别的密码子序列是()(A)AAG (B)CAG (C)GAG (D)GAA (E)AGG4.根据摆动学说,当一个tRNA分子上的反密码子的第一个碱基为次黄嘌呤,它可以和mRNA密码子的第三位的几种碱基配对?()(A)1 (B)2 (C)3 (D)4 (E)55.如果遗传密码是四联体密码而不是三联体,而且tRNA反密码子前两个核苷酸处于摆动的位置,那么蛋白质正常合成大概需要多少种tRNA?()(A)约256种不同的tRNA (B)150~250中不同的tRNA (C)3小于20种(D)与三联体密码差不多的数目(E)取决于氨酰-tRNA合成酶的种类6.以下蛋白质除了哪一种以外不属于G蛋白家族?()(A)IF-1 (B)IF-2 (C)EF-G (D)IF-Tu (E)EF27.以下哪一种抑制剂只能抑制真核生物细胞的蛋白质合成?(A)氯霉素(B)红霉素(C)放线菌酮(D)嘌呤霉素(E)四环素8.既能抑制原核又能抑制真核细胞及其细胞器蛋白质合成的抑制剂是()(A)氯霉素(B)红霉素(C)放线菌酮(D)嘌呤霉素(E)蓖麻霉素9.白喉毒素能够抑制真核生物细胞质的蛋白质合成,是因为它抑制了蛋白质合成的那一个阶段?()(A)氨基酸的活化(B)起始(C)酰胺-tRNA的进位(D)转肽(E)移位反应10.一个N端氨基酸为为丙氨酸的20肽,其开放的阅读框架至少应该由多少个核苷酸残基组成?()(A)60 (B)63 (C)66 (D)57 (E)6911.真核细胞的蛋白质可经历泛酰化修饰,被修饰的氨基酸残基是()(A)Gly (B)Ala (C)Lys (D)Arg (E)Gln12.使用(GUA)n作为模版在无细胞翻译系统中进行翻译,可得到几种多肽?()(A)1种(B)2种(C)3种(D)4种(E)不确定13.在蛋白质分子中下面所列举的氨基酸哪一种最不容易突变?()(A)Arg (B)Gly (C)Val (D)Asp (E)Met14.大肠杆菌素Col E3能够抑制原核细胞的蛋白质合成,其抑制的机理是()(A)作为一种核酸内切酶切掉16S rRNA的3′端的一段核苷酸序列。
(B)作为一种核酸内切酶切掉16S rRNA的5′端的一段核苷酸序列。
(C)作为一种核酸内切酶切掉23S rRNA的3′端的一段核苷酸序列。
(D)作为一种核酸内切酶切掉23S rRNA的5′端的一段核苷酸序列。
(E)作为转位酶的抑制剂。
15.以下哪一种蛋白质因子在GTP的存在下,至少可以局部的保护Met-tRNA m Met防止核酸酶对它的降解?()(A)EF-Ts (B)EF-Tu (C)EF-G (D)IF-2 (E)RF-316.下列哪一种氨基酸发生的取代突变最容易出现表现型的改变?()(A)Arg→Lys (B)Asp→Glu (C)Ser→Thr (D)Val→Ile (E)Trp→Pro 17.新合成的分泌蛋白和细胞膜蛋白需要经历哪一种形式的翻译后加工?()(A)stop-transfer序列的去除(B)在高尔基复合体上对N联结的寡糖链进行修饰(C)在离开高尔基体之前添加磷酸萜醇(D)粗面体内质网中分泌结合蛋白(Bip)(E)激活水解KDEL序列的肽酶18.一个突变细胞系的甘露醇-6-磷酸的受体基因缺失,预测该细胞系将发生()(A)在高尔基体内不能发生O-联结的寡糖链的填加。
(B)溶酶体酶将不能正确的定向。
(C)受体介导的内吞事件将增加。
(D)细胞液中的甘露醇-6-磷酸的浓度将提高。
(E)从内质网上产生的小泡将不能和高尔基体顺面融合。
19.美国洛克菲勒大学的Blobel因提出什么学说而获得1999年的诺贝尔医学生理学奖?()(A)信号肽学说(B)氧化磷酸化学说(C)第二信使学说(D)癌基因学说(E)分子伴侣学说四、问答题1.什么是无细胞翻译系统?经常被使用的无细胞翻译系统有哪些?一个无细胞翻译系统中需要哪些成分才能满足翻译条件?2.大肠杆菌某一多肽基因的编码的序列是:5′ACAATGTATGGTAGTTCA TTATCCCGGGCGCAAATAACAAACCCGCGTTTC3′(1)的无意义链的序列以及它编码的mRNA的序列?(2)能编码多少个氨基酸?(3)因上对紫外线高敏感位点?(4)用PCR扩增该基因,需要合成两段(dNMP)6作为引物,请写出(dNMP)6核苷酸序列?3.一段人工合成的多聚核苷酸的碱基序列是……AUAUAUAUAUAU……,将此多聚核苷酸作为模版在大肠杆菌无细胞翻译系统中进行翻译,你与其会产生什么样的多肽?如果将该模版放在从动物细胞线粒体制备出的无细胞翻译系统中进行翻译,得到的产物是……-Met-Tyr-Met-Tyr-Met-Tyr-……,那么,线粒体与大肠杆菌的密码子有什么差别?4.为什么m7GTP能够抑制真核细胞的蛋白质合成,但不抑制原核细胞的蛋白质合成?相反人工合成的SD序列能够一直原核细胞的蛋白质合成,但不能抑制真核细胞的蛋白质合成?5.嘌呤霉素和红霉素都能够抑制原核细胞的蛋白质合成,从而抑制细菌的生长,但嘌呤霉素抑制的效果明显低于同剂量的红霉素,试解释这种现象。
6.尽管蛋白质的水解在热力学上是有利的,但是由泛素介导的蛋白质选择性降解却需要消耗A TP。
试解释ATP对于这种形式的讲解为什么是必须的。