组织化植物蛋白(教学课件)
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植物蛋白质组学植物蛋白质组学(Plant Proteomics)是蛋白质组学领域的一个分支,旨在研究植物蛋白质的组成、结构、功能、相互作用及调控机制等,其研究方法与蛋白质组学类似,涉及的核心技术包括蛋白质的分离、纯化、鉴定、功能注释、相互作用研究和表达调控研究等。
植物蛋白质组学的研究,不仅能为植物生长发育和逆境适应的规律提供物质基础,也能为农作物抗逆性和品质改良提供理论根据和解决途径。
通过对不同生长条件下、不同植物品种以及正常与逆境个体间的蛋白质组比较分析,我们可以找到某些"特异性的蛋白质分子",它们可成为遗传改良和生物技术策略的分子靶点,或者为生态环境变化对植物生长的影响提供分子标志。
百泰派克生物科技BTP植物蛋白质组学服务内容。
1.蛋白质鉴定与功能注释。
利用高分辨质谱(Thermo Fisher的Q Exactive质谱、Orbitrap质谱)技术我结合生物信息学数据库和软件,对检测到的蛋白质进行鉴定,同时为其提供详细的功能注释。
2.蛋白质组定量分析。
提供标记(iTRAQ、TMT、SILAC )与非标记方法(Label Free),对蛋白质进行定量分析。
3.蛋白质相互作用研究。
采用免疫沉淀(IP)、免疫共沉淀(Co-IP)或亲和纯化质谱(AP-MS)等方法,研究您感兴趣的蛋白质与其他蛋白质之间的相互作用,后续基于液质联用技术(LC-MS/MS)对IP、Co-IP样品及GST融合蛋白Pull-down等纯化样本中的蛋白/蛋白混合物进行质谱鉴定。
4.蛋白质翻译后修饰(PTM)分析。
提供磷酸化/糖基化/泛素化/乙酰化/甲基化/二硫键/亚硝基化等翻译后修饰鉴定,包括修饰位点以及修饰定量。
5.蛋白质表达差异分析。
通过比较不同处理条件下的植物蛋白质组数据,进行蛋白质表达差异统计分析(韦恩图、火山图)和聚类分析(层次聚类分析、K-means聚类分析)。
植物蛋白质组学技术的应用。
1.基因研究。