蛋白质一级结构决定高级结构
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科学故事:一级结构决定高级结构蛋白质的高级结构由其一级结构决定的学说最初由Christian B. Anfinsen于1954年提出。
在1950年之前,Anfinsen一直从事蛋白质结构方面的研究。
在进入美国国立卫生研究所(NIH)以后,继续从事这方面的研究。
当时他最想知道的是:一个蛋白质是如何折叠成它独特的三维构象的?需不需要其他酶的帮助?蛋白质为什么要采取特定的构象?Christian B.Anfinsen然而,要想了解蛋白质的折叠过程,首先需要建立一种方法能够测量或评估蛋白质的构象,其次还需要找到一种手段用以检测折叠过程。
Anfinsen以牛胰核糖核酸酶(ribonuclease)为研究对象轻而易举地解决了第一个问题(实际上选用此酶的部分原因是当时的芝加哥肉类加工公司能够为他的实验室随时提供足够的原材料),因为核糖核酸酶催化RNA的水解,其酶活性完全取决于其特定的三维构象,于是酶活性成为测量这种蛋白质采取何种构象的一种方法。
但要观测折叠过程既可以从一个新合成的尚没有折叠的蛋白质开始,也可以在体外将一个已折叠好的蛋白质去折叠(unfold),然后再观察它的再折叠(refold)过程。
Anfinsen选择了后一种途径。
事实上,这种酶特别适合用后一种途径进行研究,首先因为二硫键是决定其分子形状的主要因素。
另外,此酶是一种单纯蛋白质,只有124个氨基酸残基组成,含有4个二硫键,而且其活性很容易通过测定水解RNA释放出来的核苷酸量来测定。
Anfinsen和两个博士后Michael Sela、Fred White在研究中发现,使用高浓度的巯基试剂——β- 巯基乙醇(β- mercaptoethanol)可将二硫键还原成自由的巯基,如果再加入尿素,进一步破坏已被还原的核糖核酸酶分子内部的次级键,则该酶将去折叠转变成无任何活性的无规卷曲。
对还原的核糖核酸酶的物理性质进行分析的结果清楚地表明了它的确采取的是无规卷曲的形状。
一、蛋白质的一级结构蛋白质的一级结构(primary structure)就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序(sequence),也是蛋白质最基本的结构。
它是由基因上遗传密码的排列顺序所决定的。
各种氨基酸按遗传密码的顺序,通过肽键连接起来,成为多肽链,故肽键是蛋白质结构中的主键。
迄今已有约一千种左右蛋白质的一级结构被研究确定,如胰岛素,胰核糖核酸酶、胰蛋白酶等。
蛋白质的一级结构决定了蛋白质的二级、三级等高级结构,成百亿的天然蛋白质各有其特殊的生物学活性,决定每一种蛋白质的生物学活性的结构特点,首先在于其肽链的氨基酸序列,由于组成蛋白质的20种氨基酸各具特殊的侧链,侧链基团的理化性质和空间排布各不相同,当它们按照不同的序列关系组合时,就可形成多种多样的空间结构和不同生物学活性的蛋白质分子。
二、蛋白质的空间结构蛋白质分子的多肽链并非呈线形伸展,而是折叠和盘曲构成特有的比较稳定的空间结构。
蛋白质的生物学活性和理化性质主要决定于空间结构的完整,因此仅仅测定蛋白质分子的氨基酸组成和它们的排列顺序并不能完全了解蛋白质分子的生物学活性和理化性质。
例如球状蛋白质(多见于血浆中的白蛋白、球蛋白、血红蛋白和酶等)和纤维状蛋白质(角蛋白、胶原蛋白、肌凝蛋白、纤维蛋白等),前者溶于水,后者不溶于水,显而易见,此种性质不能仅用蛋白质的一级结构的氨基酸排列顺序来解释。
蛋白质的空间结构就是指蛋白质的二级、三级和四级结构。
(一)蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构(secondary structure)是指多肽链中主链原子的局部空间排布即构象,不涉及侧链部分的构象。
1.肽键平面(或称酰胺平面,amide plane)。
Pauling等人对一些简单的肽及氨基酸的酰胺等进行了X线衍射分析,得出图1-2所示结构,从一个肽键的周围来看,得知:(1)中的C-N键长0.132nm,比相邻的N-C单键(0.147nm)短,而较一般C=N双键(0.128nm)长,可见,肽键中-C-N-键的性质介于单、双键之间,具有部分双键的性质,因而不能旋转,这就将固定在一个平面之内。
生化测试一 氨基酸一、填空题1.氨基酸的结构通式为 。
2.氨基酸在等电点时,主要以 兼性/两性 离子形式存在,在pH>pI 的溶液中,大部分以 阴离子形式存在,在pH<pI 的溶液中,大部分以 阳 离子形式存在。
3.生理条件下(pH7.0左右),蛋白质分子中的 Arg 侧链和 Lys 侧链几乎完全带正电荷,但His 侧链带部分正电荷。
4.测定蛋白质紫外吸收的波长,一般在 280nm ,主要由于蛋白质中存在着 Phe 、Trp 、Tyr 氨基酸残基侧链基团。
5.皮肤遇茚三酮试剂变成 蓝紫 色,是因为皮肤中含有 蛋白质(氨基酸)所致。
6.Lys 的pk 1(α—COOH )=2.18,pk 2(α—3H N +)=8.95,pk 3(ε—3H N +)=10.53,其pI 为 9.74。
在pH=5.0的溶液中电泳,Lys 向 负 极移动。
7.Henderson —Hasselbalch 方程为pH=pKa+lg[质子受体]/ [质子受体]。
8.实验室常用的甲醛滴定是利用氨基酸的氨基与中性甲醛反应,然后用碱(NaOH )来滴定 上放出的 NH 3+/氨基。
9.一个带负电荷的氨基酸可牢固地结合到阴离子交换树脂上,因此需要一种比原来缓冲液pH 值 小 和离子强度 高 的缓冲液,才能将此氨基酸洗脱下来。
10.用 N-溴代琥珀酰亚胺 试剂可区分丙氨酸和色氨酸。
二、选择题1.区分极性氨基酸和非极性氨基酸是根据 (C )A. 所含的羧基和氨基的极性B. 所含氨基和羧基的数目C. 所含的R 基团为极性或非极性D. 脂肪族氨基酸为极性氨基2.下列哪一种氨基酸不属于人体必需氨基酸 (D )A. 亮氨酸B. 异亮氨酸C. 苯丙氨酸D. 酪氨酸3.下列哪一组氨基酸为酸性氨基酸: (D )A. 精氨酸,赖氨酸B. 谷氨酸,谷氨酰胺C. 组氨酸,精氨酸D. 谷氨酸,天冬氨酸4.含硫的必需氨基酸是 (B )A. 半胱氨酸B. 蛋氨酸C. 苏氨酸D. 亮氨酸5.芳香族必需氨基酸包括 (D )A. 蛋氨酸B. 酪氨酸C. 亮氨酸D. 苯丙氨酸6.含四个氮原子的氨基酸是 (B )A. 赖氨酸B. 精氨酸C. 酪氨酸D. 色氨酸7.蛋白质中不存在的氨基酸是下列中的哪一种?(D )A. 赖氨酸B. 羟赖氨酸C. 酪氨酸D.鸟氨酸8.在蛋白质中不是L-氨基酸的是(B )A. 苏氨酸B. 甘氨酸C. 半胱氨酸D. 谷氨酰胺9.谷氨酸的PK 值为2.19, 4.25, 9.76; 赖氨酸的PK 值为2.18, 8.95, 10.53; 则它们的PI 值分别为(B )A. 2.19和10.53B. 3.22和9.74C. 6.96和5.56D. 5.93和6.3610.从赖氨酸中分离出谷氨酸的可能性最小的方法是(D )A. 纸层析B. 阳离子交换层析C. 电泳D. 葡萄糖凝胶过滤11.用于确定多肽中N-末端氨基酸的是(C )A. Sanger 试剂B. Edman 试剂C. 两者均可D. 两者均不可12.有一蛋白质水解物,在PH6时,用阳离子交换柱层析,第一个被洗脱的氨基酸是(C )A. Val (PI5.96)B. Lys (PI9.74)C. Asp (PI2.77)D. Arg (PI10.76)13.下列那种氨基酸属于非编码氨基酸?(D)A. 脯氨酸B. 精氨酸C. 酪氨酸D. 羟赖氨酸14.可使二硫键氧化断裂的试剂是(C)A. 尿素B. 巯基乙醇C. 过甲酸D. SDS15.没有旋光性的氨基酸是(C)A. AlaB. ProC. GlyD. Glu16. Sanger试剂是(B)A.苯异硫氰酸酯B. 2,4—二硝基氟苯C. 丹磺酰氯D.β-巯基乙醇17.酶分子可逆共价修饰进行的磷酸化作用主要发生在哪一个氨基酸上(B)A. AlaB. SerC. GluD. Lys18.当含有Ala,Asp,Leu,Arg的混合物在pH3.9条件下进行电泳时,哪一种氨基酸移向正极(+)(B)A. AlaB. AspC. LeuD. Arg19.下列哪种氨基酸溶液不使平面偏振光发生偏转(B)A. ProB. GlyC. LeuD. Lys20.对哺乳动物来说,下列哪种氨基酸是非必需氨基酸(C)A. PheB. LysC. TyrD. Met21.一个谷氨酸溶液,用5ml的1M的NaOH来滴定,溶液中的PH从1.0上升到7.0,下列数据中哪一个接近于该溶液中所含谷氨酸的毫摩尔数为(B)A. 1.5B. 3.0C. 6.0D. 1222.下列AA中含氮量最高的是(A)A. ArgB.HisC.GlnD. Lys23.下列在280nm具有最大光吸收的基团是(A)A.色氨酸的吲哚环B.酪氨酸的酚环C.苯丙氨酸的苯环D.半胱氨酸的硫原子24.在生理pH值条件下,具有缓冲作用的氨基酸残基是(C)A. TyrB. TrpC. HisD. Lys25.下列关于离子交换树脂的叙述哪一个是不正确的?(D)A.是人工合成的不溶于水的高分子聚合物B.阴离子交换树脂可交换的离子是阴离子C.有阳离子交换树脂和阴离子交换树脂两类D.阳离子交换树脂可交换的离子是阴离子26.下列哪种氨基酸可使肽链之间形成共价交联结构(D)A.MetB. SerC. GluD. Cys27.下列氨基酸中哪个含有吲哚环?(C)A.MetB. TyrC. TrpD. His三、名词解释1. α-氨基酸:是含有氨基的羧酸,氨基连接在α-碳上。
蛋白质的高级结构1 . 氨基酸等电点:氨基酸分子净电荷为零时溶液的 PH 值称为等电点。
2. 肽键:氨基酸之间脱水后形成的共价键。
肽键的结构与性质:具有部分双键性质的肽键不能自由旋转,参与肽键形成的6个原子共处于一个平面--肽平面(Cα1,C,O,N,H,Cα2)与Cα相连的两个单键可以置于旋转,由此产生两个旋转角(Cα-N小写,Cα-C大写,拉式作图)多为反式,X-Pro除外N带部分正电荷,O带部分负电荷3.蛋白质的一级结构:是指蛋白质肽链中氨基酸的序列,它们之间以肽键相连,有的还有二硫键。
蛋白质的一级结构是最基本的结构,决定了蛋白质的高级结构。
4. 构型:指不对称碳上相连的各原子/取代基的空间排布(D/L型)--构型改变涉及共价键5. 构象:在相同构型的化合物中,与碳原子相连的各原子/取代基在单键旋转时形成的空间排布蛋白质的构象:肽键具有部分双键性质,不能自由旋转;氨基酸残基侧链还有空间位阻和静电效应6. a-螺旋: a-螺旋是蛋白质中最常见、含量最丰富的二级结构。
由多肽主链盘绕形成。
每圈螺旋包括 3.6 个氨基酸残基,螺距 0.54nm,每个 aa 沿轴上升 0.1 5nm。
a-螺旋中氨基酸残基的侧链伸向外侧。
相邻螺圈之间形成链内氢键,氢键的趋向几乎与螺旋轴平行。
•肽链中的肽平面绕Cα相继旋转一定角度形成α-螺旋,并盘绕前进•3.6个aa螺旋上升一圈;间距0.54nm•右手螺旋,每个氨基酸残基的N-H都与前面第四个残基C=O形成氢键(13个原子)•侧链:o遇到Pro就会被中断而拐弯(亚氨基酸,不能充当氢键供体,刚性的环)o Gly上只有两个H,两个单键旋转自由度很大,螺旋稳定性大大降低o带相同电荷的氨基酸残基连续出现时,稳定性降低o N端为酸性,C端为碱性可以中和N端为正,C端为负的偶极矩的影响;还可以是N与磷酸基团结合,C端与金属离子结合(不重要)7. B-折叠:在相邻肽链主链上的-NH 和 C=O 之间形成有规则的氢键的多肽链构象。
蛋白质的一级结构的主要作用力1.一级结构(primary structure):氨基酸残基在蛋白质肽链中的排列顺序称为蛋白质的一级结构,每种蛋白质都有唯一而确切的氨基酸序列。
2.二级结构(secondary structure):蛋白质分子中肽链并非直链状,而是按一定的规律卷曲(如α-螺旋结构)或折叠(如β-折叠结构)形成特定的空间结构,这是蛋白质的二级结构。
蛋白质的二级结构主要依靠肽链中氨基酸残基亚氨基(—NH—)上的氢原子和羰基上的氧原子之间形成的氢键而实现的。
3.三级结构(tertiary structure):在二级结构的基础上,肽链还按照一定的空间结构进一步形成更复杂的三级结构。
肌红蛋白,血红蛋白等正是通过这种结构使其表面的空穴恰好容纳一个血红素分子。
4.四级结构(quaternary structure):具有三级结构的多肽链按一定空间排列方式结合在一起形成的聚集体结构称为蛋白质的四级结构。
如血红蛋白由4个具有三级结构的多肽链构成,其中两个是α-链,另两个是β-链,其四级结构近似椭球形状。
维持作用力:用约20种氨基酸作原料,在细胞质中的核糖体上,将氨基酸分子互相连接成肽链。
一个氨基酸分子的氨基和另一个氨基酸分子的羧基,脱去一分子水而连接起来,这种结合方式叫做脱水缩合。
通过缩合反应,在羧基和氨基之间形成的连接两个氨基酸分子的那个键叫做肽键。
由肽键连接形成的化合物称为肽。
扩展资料:蛋白质是组成人体一切细胞、组织的重要成分。
机体所有重要的组成部分都需要有蛋白质的参与。
一般说,蛋白质约占人体全部质量的18%,最重要的还是其与生命现象有关。
蛋白质(protein)是生命的物质基础,是有机大分子,是构成细胞的基本有机物,是生命活动的主要承担者。
没有蛋白质就没有生命。
氨基酸是蛋白质的基本组成单位。
它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。
机体中的每一个细胞和所有重要组成部分都有蛋白质参与。