TF-1细胞凋亡相关基因的研究

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TFF1在肺癌中的表达及作用研究

TFF1在肺癌中的表达及作用研究刘开泰;陆妙珍;褚宇东【摘要】目的研究三叶因子1(TFF1)在肺癌组织及肺癌细胞株中的表达、甲基化状态及其功能.方法选取98例非小细胞肺癌患者手术切除的肺癌组织,采用RT-PCR、MSP检测TFF1在肺癌组织中的表达与甲基化状态,分析其与患者临床特点的相关性,以及检测肺癌细胞株H23、H1299、L78、H446、H157及95D中TFF1的表达和甲基化状态以及5-aza-2'-deoxycy-tidine(DAC)处理后细胞株中TFF1表达的变化.TFF1转染H23细胞株,MTT法及克隆形成实验检测其增殖能力和克隆能力的变化,细胞凋亡实验及Western blot检测凋亡相关蛋白Caspase3表达水平.结果 TFF1在肺癌组织中的甲基化率为56.1％(55/98).TFF1甲基化与肺癌患者的TNM分期和淋巴结转移显著相关(P＜0.001).TFF1在H23和H157中无表达,在H1299、H446及95D中表达较低,在L78中表达较高.DAC处理后,细胞株TFF1表达的变化分别为表达恢复(H23、H157),表达增强(H1299,H446,95D)和无明显改变(L78).恢复表达TFF1后,H23细胞株的增殖及克隆形成能力明显减弱(P＜0.05),细胞凋亡率和凋亡相关蛋白Caspase3活性片段的表达明显增加.结论 TFF1在肺癌组织中的甲基化状态与肺癌的TNM分期和转移密切相关.TFF1在肺癌细胞中的表达受DNA甲基化的调控.肺癌细胞株H23中恢复表达TFF1可以抑制其增殖和克隆能力,促进其凋亡.【期刊名称】《浙江医学》【年(卷),期】2015(037)004【总页数】5页(P283-286,294)【关键词】TFF1;肺癌;DNA甲基化;表观遗传学【作者】刘开泰;陆妙珍;褚宇东【作者单位】315040 宁波市医疗中心李惠利医院放疗科;315040 宁波市医疗中心李惠利医院放疗科;315040 宁波市医疗中心李惠利医院肾内科【正文语种】中文1.1 人组织标本及细胞系 98例肺癌及癌旁组织来自宁波李惠利医院胸外科手术切除的肺癌患者，其中Ⅰ～Ⅱ期38例，Ⅲ～Ⅳ期60例。

北医免疫课程PDCD5-研究思路

12
Construction of pcDITFAR19
fi ori Bgl II
CMV Intro
Nhe I EcoRI
LacZ
pGEM-TTFAR19
EcoR I
TFAR19
pcDI-IL-6
Sal I
IL-6 cDNA
EcoRI
EcoR I
ori
NeoR
XhoI BGH poly A
EcoR I
MS2
PDCD5 ORF PCR Product (410bp)
Xho I
pMTY-4
EcoR I Thrombin Linker Stu I
Xho I Pst I Klenow Xho I T4 Ligase pL Stu I Xho I
MS2
pMTY-TFAR19
EcoR I Thrombin Linker
TAA AAA AAT AAA CTT GTT ATG CAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 540
PDCD5编码蛋白结构比较简单,全长125个氨基酸，不含二硫键， pI 5.65 ; 无信号肽，无跨膜序列，与已知人类蛋白无同源性;S118可以被CK2磷酸化
8
PDCD5基因结构图
EcoRI
NeoR
NeoR 13
PDCD5过表达促进 HeLa和 MGC-803 细胞撤除血清诱导的凋亡
14
PDCD5对各种细胞具有促凋亡效应,但单独不能诱导凋亡
细胞种类
TF-1 HL60，MGC-803，HEK293，HeLa Jurkat
诱导凋亡因素
GM-CSF withdrawal Serum withdrawal Serum withdrawal, VP16, FAS Ab

程序性细胞死亡分子5(PDCD5)研究进展

·综述·程序性细胞死亡分子５（ＰＤＣＤ５）研究进展杨丰赫１　叶菁菁２　郑　铭１，△（１北京大学医学部基础医学院生理学与病理生理学系，北京１００１９１；２北京大学人民医院中心实验室和临床分子生物学研究所，北京１０００４４）摘要　程序性细胞死亡分子５（ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄｃｅｌｌｄｅａｔｈ５，ＰＤＣＤ５）在人体各种组织中广泛存在，可以通过多种凋亡通路促进细胞凋亡，其在大部分肿瘤中低表达，对肿瘤化疗具有增敏效应。

近年发现，除了在细胞凋亡过程中发挥作用外，ＰＤＣＤ５在多种疾病的病理进程中发挥重要作用，如：肿瘤、自身免疫性疾病、炎症性疾病、脑缺血再灌注损伤及动脉粥样硬化等。

ＰＤＣＤ５蛋白结构简单，无二硫键，其重组蛋白药物开发较便利，具较高的药物基因组学应用价值。

本文主要介绍近２０年来ＰＤＣＤ５的研究进展及其在肿瘤、免疫系统疾病、心血管系统疾病中可能的应用、存在的不足、以及在其他方面的应用前景。

关键词　ＰＤＣＤ５；凋亡；肿瘤；心血管系统疾病中图分类号　Ｒ３６３ＰｒｏｇｒｅｓｓｉｎＰＤＣＤ５ＲｅｓｅａｒｃｈａｎｄＩｔｓＰａｔｈｏｐｈｙｓｉｏｌｏｇｉｃａｌＲｅｌｅｖａｎｃｅ　ＹＡＮＧＦｅｎｇＨｅ１，ＹＥＪｉｎｇＪｉｎｇ２，ＺＨＥＮＧＭｉｎｇ１，△（１ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＰｈｙｓｉｏｌｏｇｙａｎｄＰａｔｈｏｐｈｙｓｉｏｌｏｇｙ，ＳｃｈｏｏｌｏｆＢａｓｉｃＭｅｄｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＨｅａｌｔｈＳｃｉｅｎｃｅＣｅｎｔｅｒ，ＰｅｋｉｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｂｅｉｊｉｎｇ１００１９１Ｃｈｉｎａ；２ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＣｅｎｔｒａｌＬａｂｏｒａｔｏｒｙ＆ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＣｌｉｎｉｃａｌＭｏｌｅｃｕｌａｒＢｉｏｌｏｇｙ，ＰｅｋｉｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＰｅｏｐｌｅ＇ｓＨｏｓｐｉｔａｌ，Ｂｅｉｊｉｎｇ１０００４４Ｃｈｉｎａ）Ａｂｓｔｒａｃｔ　ＰｒｏｇｒａｍｍｅｄＣｅｌｌＤｅａｔｈ５（ＰＤＣＤ５）ｉｓｕｂｉｑｕｉｔｏｕｓｌｙｅｘｐｒｅｓｓｅｄｉｎｖａｒｉｏｕｓｈｕｍａｎｔｉｓｓｕｅｓ，ｐｒｏｍｏｔｉｎｇｃｅｌｌａｐｏｐｔｏｓｉｓｔｈｒｏｕｇｈｍｕｌｔｉｐｌｅａｐｏｐｔｏｔｉｃｐａｔｈｗａｙｓ；ＰＤＣＤ５ｈａｓｌｏｗｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｌｅｖｅｌｉｎｍｏｓｔｋｉｎｄｓｏｆｔｕｍｏｒｓ，ａｎｄｉｔｃａｎｉｎｃｒｅａｓｅｔｈｅｓｅｎｓｉｔｉｚａｔｉｏｎｏｆｔｕｍｏｒｓｉｎｒｅｓｐｏｎｓｅｔｏｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ．Ｉｎｃｒｅａｓｉｎｇｅｖｉｄｅｎｃｅｓｈｏｗｅｄｔｈａｔ，ｉｎａｄｄｉｔｉｏｎｔｏｐａｒｔｉｃｉｐａｔｉｎｇｉｎｃｅｌｌａｐｏｐｔｏｓｉｓ，ＰＤＣＤ５ｐｌａｙｓｉｍｐｏｒｔａｎｔｒｏｌｅｓｉｎａｖａｒｉｅｔｙｏｆｄｉｓｅａｓｅｓ，ｓｕｃｈａｓｃａｎｃｅｒｓ，ｉｍｍｕｎｅｓｙｓｔｅｍｄｉｓｅａｓｅｓ，ｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙｄｉｓｅａｓｅｓ，ｉｓｃｈｅｍｉａｒｅｐｅｒｆｕｓｉｏｎｉｎｊｕｒｉｅｓ，ａｎｄａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ．ＴｈｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆＰＤＣＤ５ｐｒｏｔｅｉｎｉｓｑｕｉｔｅｓｉｍｐｌｅｗｉｔｈｏｕｔｄｉｓｕｌｆｉｄｅｂｏｎｄ，ｔｈｅｒｅｆｏｒｅ，ｉｔｉｓｖｅｒｙｃｏｎｖｅｎｉｅｎｔｔｏｄｅｖｅｌｏｐａｎｄｐｒｏｄｕｃｅｔｈｅｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔｐｒｏｔｅｉｎｆｏｒｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｐｕｒｐｏｓｅｉｎｔｈｅｆｕｔｕｒｅ．ＴｈｉｓｒｅｖｉｅｗｍａｉｎｌｙｆｏｃｕｓｅｓｏｎｔｈｅｒｅｓｅａｒｃｈａｄｖａｎｃｅｏｆＰＤＣＤ５ｉｎｔｈｅｒｅｃｅｎｔｔｗｏｄｅｃａｄｅｓ，ｔｈｅｐｏｔｅｎｔｉａｌａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎａｎｄｄｅｆｅｃｔｓｏｆＰＤＣＤ５ａｓｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓｔｒａｔｅｇｉｅｓｆｏｒｃａｎｃｅｒｓ，ｉｍｍｕｎｅｓｙｓｔｅｍｄｉｓｅａｓｅｓａｎｄｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒｄｉｓｅａｓｅｓ，ａｓｗｅｌｌａｓｐｅｒｓｐｅｃｔｉｖｅｓｏｆｔｈｅｖａｌｕｅｏｆＰＤＣＤ５ｉｎｏｔｈｅｒｄｉｒｅｃｔｉｏｎｓ．Ｋｅｙｗｏｒｄｓ　ＰＤＣＤ５；ａｐｏｐｔｏｓｉｓ；ｔｕｍｏｒ；ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒｄｉｓｅａｓｅｓ１９９９年，北京大学人类疾病基因研究中心利用ｃＤＮＡ差示分析法（ｒｅｐｒｅｓｅｎｔａｔｉｖｅｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓａｎａｌｙｓｉｓ），从诱导凋亡的ＴＦ１细胞用中成功克隆了在凋亡时表达上调的人类新基因，命名为ＴＦＡＲ１９（ＴＦ１ｃｅｌｌａｐｏｐｔｏｓｉｓｒｅｌａｔｅｄｇｅｎｅ１９）（Ｌｉｕ等．１９９９）。

足细胞凋亡与膜性肾病的研究进展

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２２４３
中存在足细胞凋亡，而导致足细胞凋亡的主要原因则为糖尿病肾病氧化应激的产物ＲＯＳ。目前认为ＲＯＳ的来源主要有两条途径．一为ＮＡＤＰＨ氧化酶途径，二为线粒体途径。Ｓｕｓｚｔａｋ等［１０］研究表明．在体外培养的条件性永生足细胞中加入高糖（３０ｍｍｏｌ／Ｌ）可刺激细胞膜ＮＡＤＰＨ氧化酶和线粒体两条途径产生大量ＲＯＳ．ＲＯＳ又通过ｐ３８ＭＡＰＫ信号
２．Ｉ．２
ＴＧＦ．Ｂ１介导的足细胞凋亡ＴＧＦ．
Ｂｌ（转化生长因子Ｂ１）是一种多功能的细胞因子．在损伤的肾小球内。呈典型上调。越来越多的研究表明ＴＧＦ．１３１介导了肾小球足细胞的凋亡。在肾小球硬化过程中发挥着重要作用。目前认为ＴＧＦ．Ｂｌ主要通过以下两条信号转导通路介导足细胞的凋亡。
２．１．１
ＴＧＦ．Ｂ１／ｐ３８ＭＡＰＫ信号通路
ＴＧＦ．１３１除激活Ｓｍａｄ通路外．还激活丝裂原活化的蛋白激酶（ＭＡＰＫＳ），如ｐ３８ＭＡＰＫ通路。ｐ３８ＭＡＰＫ为ＴＧＦ．１３ｌ系统下游的一个通路。ＴＧＦ．１３１通过与其Ｉ型和Ⅱ型丝／苏氨酸激酶受体的不同成分相互作用，将信号转入细胞内，刺激激活ＭＫＫＫ（ＭＡＰＫ激酶激酶），转而激活ＭＫＫ（ＭＡＰＫ激酶）主要为ＭＫＫ３和ＭＫＫ６．然后通过双位点磷酸化激活ｐ３８ＭＡＰＫ．活化的ｐ３８ＭＡＰＫ信号诱导促凋亡因子Ｂａｘ（Ｂｃｌ．２家族成员）蛋白合成，Ｂａｘ与含ＢＨ３结构域的另外的Ｂｃｌ．２家族成员作用。导致前者的寡聚并插入线粒体膜，引起线粒体膜通透性的改变．跨膜电位丢失，释放细胞色素Ｃ和其他蛋白［８］。释放的细胞色素Ｃ与Ａｐａｆ－Ｉ（凋亡促进因子）结合引起Ａｐａｆ－１寡聚。从而募集并激活Ｃａｓｐａｓｅ．９．由Ｃａｓｐａｓｅ．９激活Ｃａｓｐａｓｅ－３，使细胞进入凋亡［引．此即凋亡的线粒体通路。这一过程在Ｓｃｈｉｆｆｅｒ等㈧的研．究中被证实：在足细胞内，ＴＧＦ一１３１刺激

细胞凋亡的检测(来自北京大学人类疾病基因研究中心

摘自北京大学人类疾病基因研究中心/news/apoptosis.htm细胞凋亡的检测北京大学人类疾病基因研究中心陈英玉细胞凋亡与坏死是两种完全不同的细胞凋亡形式，根据死亡细胞在形态学、生物化学和分子生物学上的差别，可以将二者区别开来。

细胞凋亡的检测方法有很多，下面介绍几种常用的测定方法。

一、细胞凋亡的形态学检测根据凋亡细胞固有的形态特征，人们已经设计了许多不同的细胞凋亡形态学检测方法。

1 光学显微镜和倒置显微镜（1）未染色细胞：凋亡细胞的体积变小、变形，细胞膜完整但出现发泡现象，细胞凋亡晚期可见凋亡小体。

贴壁细胞出现皱缩、变圆、脱落。

（2）染色细胞：常用姬姆萨染色、瑞氏染色等。

凋亡细胞的染色质浓缩、边缘化，核膜裂解、染色质分割成块状和凋亡小体等典型的凋亡形态。

2 荧光显微镜和共聚焦激光扫描显微镜一般以细胞核染色质的形态学改变为指标来评判细胞凋亡的进展情况。

常用的DNA特异性染料有：HO 33342 (Hoechst 33342)，HO 33258 (Hoechst 33258), DAPI。

三种染料与 DNA的结合是非嵌入式的，主要结合在DN A的A-T碱基区。

紫外光激发时发射明亮的蓝色荧光。

Hoechst是与DNA特异结合的活性染料，储存液用蒸馏水配成1mg/ml的浓度，使用时用PBS稀释成终浓度为2~5mg/ml。

DAPI为半通透性，用于常规固定细胞的染色。

储存液用蒸馏水配成1mg/ml的浓度，使用终浓度一般为0.5 ~1mg/ml。

结果评判：细胞凋亡过程中细胞核染色质的形态学改变分为三期：Ⅰ期的细胞核呈波纹状（rippled）或呈折缝样（creased），部分染色质出现浓缩状态；Ⅱa期细胞核的染色质高度凝聚、边缘化；Ⅱb期的细胞核裂解为碎块，产生凋亡小体(图1)。

3 透射电子显微镜观察结果评判：凋亡细胞体积变小，细胞质浓缩。

凋亡Ⅰ期（pro-apoptosis nuclei）的细胞核内染色质高度盘绕，出现许多称为气穴现象（cavitations）的空泡结构(图2)；Ⅱa期细胞核的染色质高度凝聚、边缘化；细胞凋亡的晚期，细胞核裂解为碎块，产生凋亡小体。

atf2转录因子 -回复

atf2转录因子-回复转录因子（Transcription Factors，简称TFs）是一类能够调控基因转录的蛋白质分子，它们通过结合到基因的启动子区域上，与RNA聚合酶和其他转录激活或抑制因子相互作用，从而影响基因的表达。

在细胞发育和生理过程中，TFs起到了至关重要的作用，能够调控基因的启动和停止、确定基因表达的细胞、组织和器官特异性，以及参与激素信号传导等。

本篇文章将深入探讨ATF2转录因子及其在细胞信号转导中的功能。

ATF2 （Activating Transcription Factor 2）是一个重要的转录因子家族成员，其编码基因位于人类染色体2q32-q34区域。

ATF2是一个受丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路调节的双重转录因子，能够通过调控基因的转录起到生物学功能。

该转录因子由两个功能域组成：N末端的ATF 家族保守结构域（bZIP结构域）和C末端的加上杆。

ATF2参与了多种信号通路的调控，例如T细胞受体（TCR）信号通路、线粒体途径和糖代谢途径等。

在TCR活化过程中，ATF2被丝裂原活化激酶家族蛋白激活，进而促使其定位到TCR信号通路的启动子区域，通过结合到响应元件上，与其他转录因子相互作用，从而调控下游基因的转录。

这一过程在免疫细胞的激活和应激反应中起到了重要的作用。

此外，ATF2还与肿瘤的发生和发展密切相关。

研究发现，ATF2能够调控细胞周期和凋亡相关基因的表达，进而影响细胞的增殖和生存。

ATF2的过度表达可能导致细胞增殖水平的提高，从而推动癌症的发展。

另一方面，ATF2的功能丧失可能导致凋亡信号通路的紊乱，从而促进肿瘤细胞的增殖和转移。

因此，ATF2有望成为治疗癌症的重要靶点。

除了在细胞信号转导中的功能，ATF2还参与了细胞的应激反应。

在环境胁迫、氧化应激等情况下，ATF2能够被激活，进而调控一系列应激反应基因的转录。

这些基因的表达可以使细胞适应环境的变化，并促进细胞的存活。

TFF与消化系统肿瘤关系的研究进展

TFF与消化系统肿瘤关系的研究进展冯丽英;马丽;秦玉彩【摘要】Trefoil factor (TFF) peptides are a family of small molecular regulatory protein which is mainly expressed in gastrointestinal mucus membrane,including TFF1 (PS2), TFF2 (SP)and TFF3(ITF). Its main function is to keep the integrity of mucous membranes and promote the repair of epithelial damage. Recent studies have found that trefoil factor family has connection with the occurrence and development of digestive tumors. At the same time it has a certain impact on cell proliferation and apoptosis. Therefore further study on mechanism of trefoil factor family in gastrointestal tumor will provide new approaches for the diagnosis and treatment of gastrointestal cancer.%TFF是一族主要表达于胃肠道黏膜的小分子多肽,包括乳腺癌相关肽、解痉多肽和肠三叶因子,其主要功能是维持黏膜的完整性和促进损伤黏膜的修复.近年研究发现TFF与消化系统肿瘤的发生、发展有关,同时对细胞的增殖和凋亡有一定的影响,因此,进一步研究TFF在消化系肿瘤中的作用机制,将为消化系肿瘤的诊断与治疗开辟新的途径.【期刊名称】《临床误诊误治》【年(卷),期】2011(024)009【总页数】4页(P82-85)【关键词】三叶因子;肽类;消化系统肿瘤;细胞增殖;细胞凋亡【作者】冯丽英;马丽;秦玉彩【作者单位】0000石家庄,河北医科大学第二医院消化科;0000石家庄,河北医科大学第二医院消化科;0000石家庄,河北医科大学第二医院消化科【正文语种】中文【中图分类】R735TFF(trefoil factor family，TFF)是新近发现的一类小分子多肽，又称三叶肽。

细胞凋亡及检测方法

细胞凋亡细胞凋亡是指由基因所决定的细胞自动结束生命的过程，由于细胞凋亡受到严格的由遗传机制决定的程序性调控，所以也常常称为细胞编程性死亡(programmed cell death,PCD)。

具体指细胞遇到内、外环境因子刺激时，受基因调控启动的自杀保护措施，包括一些分子机制的诱导激活和基因编程，通过这种方式去除体内非必需的细胞或即将发生特化的细胞。

例如，蛙的个体发育过程中，四肢的形成过程中尾巴消失等现象，都涉及细胞的自动死亡。

在形态学上把细胞凋亡分为三个阶段：第一个阶段是凋亡的开始，此阶段只是进行数分钟，细胞中所表现的特征是：微绒毛消失，细胞间接触消失，但是质膜保持完整性，线粒体大体完整，核糖体逐渐与内质网脱离，内质网囊腔膨胀，并与质膜发生融合，染色质固缩等等;第二阶段是形成凋亡小体，核染色质发生断裂，形成许多的片段，与一些细胞器聚集在一起，然后被细胞质膜包围，形成凋亡小体；第三阶段是凋亡小体被吞噬细胞所吞噬，而其残留物质被消化后重新使用。

细胞凋亡是一个主动性自杀过程，所以它是一个耗能的过程，需要ATP提供能量。

【细胞凋亡是指为维持内环境稳定，由基因控制的细胞自主的有序的死亡。

细胞凋亡与细胞坏死不同，细胞凋亡不是一件被动的过程，而是主动过程，它涉及一系列基因的激活、表达以及调控等的作用；它并不是病理条件下，自体损伤的一种现象，而是为更好地适应生存环境而主动争取的一种死亡过程。

细胞发生凋亡时，就像树叶或花的自然凋落一样，对于这种生物学观察，借用希腊“Apoptosis”来表示，意思是像树叶或花的自然凋落，可译为细胞凋亡。

人体内的细胞注定是要死亡的，有些死亡是生理性的，有些死亡则是病理性的，有关细胞死亡过程的研究，近年来已成为生物学、医学研究的一个热点，到目前为此，人们已经知道细胞的死亡起码有两种方式，即细胞坏死与细胞凋亡(apoptosis)。

细胞坏死是早已被认识到的一种细胞死亡方式，而细胞凋亡则是近年逐渐被认识的一种细胞死亡方式。

细胞凋亡相关功能基因列表

Entrez Gene ID Current Symbol 25ABL1134ADORA1135ADORA2A142PARP1143PARP4148ADRA1A186AGTR2196AHR199AIF1207AKT1208AKT2239ALOX12317APAF1318NUDT2328APEX1329BIRC2330BIRC3331BIRC4332BIRC5333APLP1351APP355FAS356FASLG387RHOA388RHOB472ATM572BAD573BAG1578BAK1580BARD1581BAX596BCL2597BCL2A1598BCL2L1599BCL2L2602BCL3604BCL6608TNFRSF17627BDNF637BID638BIK652BMP4662BNIP1663BNIP2664BNIP3666BOK672BRCA1673BRAF695BTK727C5729C6730C7731C8A732C8B733C8G735C9823CAPN1 827CAPN6 834CASP1835CASP2 836CASP3 837CASP4 838CASP5 839CASP6 840CASP7 841CASP8 842CASP9 843CASP10 857CAV1 858CAV2 867CBL914CD2922CD5L 929CD14 939CD27 940CD28 943TNFRSF8 944TNFSF8 949SCARB1 952CD38 958CD40 959CD40LG 970CD70 984CDC2L1 993CDC25A 1026CDKN1A 1029CDKN2A 1032CDKN2D 1082CGB 1147CHUK 1149CIDEA 1191CLU 1201CLN3 1268CNR1 1269CNR2 1270CNTF 1432MAPK14 1434CSE1L 1499CTNNB1 1509CTSD 1537CYC11603DAD1 1611DAP1612DAPK1 1613DAPK3 1616DAXX 1630DCC1647GADD45A 1649DDIT3 1676DFFA 1677DFFB 1773DNASE1 1776DNASE1L3 1777DNASE2 1793DOCK1 1848DUSP6 1849DUSP7 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NM_024011Description1v-abl Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 12adenosine A1 receptor3adenosine A2a receptor4poly (ADP-ribose) polymerase family, member 15poly (ADP-ribose) polymerase family, member 46adrenergic, alpha-1A-, receptor7angiotensin II receptor, type 28aryl hydrocarbon receptor9allograft inflammatory factor 110v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 111v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 212arachidonate 12-lipoxygenase13apoptotic peptidase activating factor 114nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 215APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 116baculoviral IAP repeat-containing 217baculoviral IAP repeat-containing 318baculoviral IAP repeat-containing 419baculoviral IAP repeat-containing 5 (survivin)20amyloid beta (A4) precursor-like protein 121amyloid beta (A4) precursor protein (peptidase nexin-II, Alzheimer disease) 22Fas (TNF receptor superfamily, member 6)23Fas ligand (TNF superfamily, member 6)24ras homolog gene family, member A25ras homolog gene family, member B26ataxia telangiectasia mutated (includes complementation groups A, C and D) 27BCL2-antagonist of cell death28BCL2-associated athanogene29BCL2-antagonist/killer 130BRCA1 associated RING domain 131BCL2-associated X protein32B-cell CLL/lymphoma 233BCL2-related protein A134BCL2-like 135BCL2-like 236B-cell CLL/lymphoma 337B-cell CLL/lymphoma 6 (zinc finger protein 51)38tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1739brain-derived neurotrophic factor40BH3 interacting domain death agonist41BCL2-interacting killer (apoptosis-inducing)42bone morphogenetic protein 443BCL2/adenovirus E1B 19kDa interacting protein 144BCL2/adenovirus E1B 19kDa interacting protein 245BCL2/adenovirus E1B 19kDa interacting protein 346BCL2-related ovarian killer47breast cancer 1, early onset48v-raf murine sarcoma viral oncogene homolog B149Bruton agammaglobulinemia tyrosine kinase50complement component 551complement component 652complement component 753complement component 8, alpha polypeptide54complement component 8, beta polypeptide55complement component 8, gamma polypeptide56complement component 957calpain 1, (mu/I) large subunit58calpain 659caspase 1, apoptosis-related cysteine peptidase (interleukin 1, beta, convertase)60caspase 2, apoptosis-related cysteine peptidase (neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 2)61caspase 3, apoptosis-related cysteine peptidase62caspase 4, apoptosis-related cysteine peptidase63caspase 5, apoptosis-related cysteine peptidase64caspase 6, apoptosis-related cysteine peptidase65caspase 7, apoptosis-related cysteine peptidase66caspase 8, apoptosis-related cysteine peptidase67caspase 9, apoptosis-related cysteine peptidase68caspase 10, apoptosis-related cysteine peptidase69caveolin 1, caveolae protein, 22kDa70caveolin 271Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence72CD2 molecule73CD5 molecule-like74CD14 molecule75CD27 molecule76CD28 molecule77tumor necrosis factor receptor superfamily, member 878tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 879scavenger receptor class B, member 180CD38 molecule81CD40 molecule, TNF receptor superfamily member 582CD40 ligand (TNF superfamily, member 5, hyper-IgM syndrome)83CD70 molecule84cell division cycle 2-like 1 (PITSLRE proteins)85cell division cycle 25 homolog A (S. pombe)86cyclin-dependent kinase inhibitor 1A (p21, Cip1)87cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma, p16, inhibits CDK4)88cyclin-dependent kinase inhibitor 2D (p19, inhibits CDK4)89chorionic gonadotropin, beta polypeptide90conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase91cell death-inducing DFFA-like effector a92clusterin93ceroid-lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease) 94cannabinoid receptor 1 (brain)95cannabinoid receptor 2 (macrophage)96ciliary neurotrophic factor97mitogen-activated protein kinase 1498CSE1 chromosome segregation 1-like (yeast)99catenin (cadherin-associated protein), beta 1, 88kDa100cathepsin D101cytochrome c-1102defender against cell death 1103death-associated protein104death-associated protein kinase 1105death-associated protein kinase 3106death-associated protein 6107deleted in colorectal carcinoma108growth arrest and DNA-damage-inducible, alpha109DNA-damage-inducible transcript 3110DNA fragmentation factor, 45kDa, alpha polypeptide111DNA fragmentation factor, 40kDa, beta polypeptide (caspase-activated DNase) 112deoxyribonuclease I113deoxyribonuclease I-like 3114deoxyribonuclease II, lysosomal115dedicator of cytokinesis 1116dual specificity phosphatase 6117dual specificity phosphatase 7118E2F transcription factor 1119E2F transcription factor 3120E2F transcription factor 5, p130-binding121eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 2122epithelial membrane protein 1123epithelial membrane protein 2124epithelial membrane protein 3125E1A binding protein p300126excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 2 (xeroderma pigmentosum D)127excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3 (xeroderma pigmentosum group B complementing)128endoplasmic reticulum to nucleus signalling 1129coagulation factor II (thrombin)130coagulation factor II (thrombin) receptor131Fanconi anemia, complementation group A132PTK2B protein tyrosine kinase 2 beta133c-fos induced growth factor (vascular endothelial growth factor D)134forkhead box O1135forkhead box O3136FOS-like antigen 2137GRB2-associated binding protein 1138growth arrest-specific 2139glial cell derived neurotrophic factor140GPI anchored molecule like protein141glutathione peroxidase 1142glutathione peroxidase 4 (phospholipid hydroperoxidase)143growth factor receptor-bound protein 2144glycogen synthase kinase 3 beta145gelsolin (amyloidosis, Finnish type)146glutathione reductase147glutathione S-transferase M1148glutathione S-transferase pi149glutathione S-transferase theta 2150granzyme H (cathepsin G-like 2, protein h-CCPX)151granzyme A (granzyme 1, cytotoxic T-lymphocyte-associated serine esterase 3)152granzyme B (granzyme 2, cytotoxic T-lymphocyte-associated serine esterase 1) 153granzyme M (lymphocyte met-ase 1)154huntingtin (Huntington disease)155histone deacetylase 1156heat shock 70kDa protein 5 (glucose-regulated protein, 78kDa)157heat shock 10kDa protein 1 (chaperonin 10)158islet amyloid polypeptide159interferon, alpha 2160interferon, beta 1, fibroblast161insulin-like growth factor 1 receptor162insulin-like growth factor 2 (somatomedin A)163insulin-like growth factor 2 receptor164insulin-like growth factor binding protein, acid labile subunit165insulin-like growth factor binding protein 2, 36kDa166insulin-like growth factor binding protein 4167insulin-like growth factor binding protein 5168insulin-like growth factor binding protein 6169inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase beta170interleukin 1, alpha171interleukin 1, beta172interleukin 2173interleukin 2 receptor, alpha174interleukin 3 (colony-stimulating factor, multiple)175interleukin 3 receptor, alpha (low affinity)176interleukin 10177interleukin 10 receptor, beta178tumor necrosis factor receptor superfamily, member 9179interleukin 17A180forkhead box K2181interferon regulatory factor 1182jun oncogene183jun B proto-oncogene184jun D proto-oncogene185lactalbumin, alpha-186lectin, galactoside-binding, soluble, 1 (galectin 1)187LIM and senescent cell antigen-like domains 1188lymphotoxin alpha (TNF superfamily, member 1)189lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3)190lymphotoxin beta receptor (TNFR superfamily, member 3)191CD180 molecule192lysozyme (renal amyloidosis)193microtubule-associated protein tau194myeloid cell leukemia sequence 1 (BCL2-related)195Mdm2, transformed 3T3 cell double minute 2, p53 binding protein (mouse)196Mdm4, transformed 3T3 cell double minute 4, p53 binding protein (mouse)197mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1198mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3199mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5200mitogen-activated protein kinase kinase kinase 10201matrix metallopeptidase 9 (gelatinase B, 92kDa gelatinase, 92kDa type IV collagenase)202myeloperoxidase203myxovirus (influenza virus) resistance 1, interferon-inducible protein p78 (mouse) 204v-myb myeloblastosis viral oncogene homolog (avian)205v-myb myeloblastosis viral oncogene homolog (avian)-like 2206v-myc myelocytomatosis viral oncogene homolog (avian)207growth arrest and DNA-damage-inducible, beta208NLR family, apoptosis inhibitory protein209nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 (p105)210nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2 (p49/p100) 211nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, alpha 212nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, beta213nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, epsilon214nerve growth factor, beta polypeptide215nerve growth factor receptor (TNFR superfamily, member 16)216non-metastatic cells 3, protein expressed in217nitric oxide synthase 1 (neuronal)218nitric oxide synthase 2A (inducible, hepatocytes)219nucleophosmin (nucleolar phosphoprotein B23, numatrin)220neurotrophin 3221neurotrophic tyrosine kinase, receptor, type 1222tumor necrosis factor receptor superfamily, member 11b (osteoprotegerin)223purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1224serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 2225p21/Cdc42/Rac1-activated kinase 1 (STE20 homolog, yeast)226p21 (CDKN1A)-activated kinase 2227PRKC, apoptosis, WT1, regulator228paired box gene 3 (Waardenburg syndrome 1)229paired box gene 7230programmed cell death 1231programmed cell death 2232phosphodiesterase 1B, calmodulin-dependent233phosphoinositide-3-kinase, class 2, gamma polypeptide234phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1235promyelocytic leukemia236P450 (cytochrome) oxidoreductase237protein phosphatase 2 (formerly 2A), regulatory subunit A, beta isoform238perforin 1 (pore forming protein)239protein kinase, AMP-activated, alpha 1 catalytic subunit240protein kinase C, alpha241protein kinase C, epsilon242protein kinase C, zeta243mitogen-activated protein kinase 1244mitogen-activated protein kinase 4245mitogen-activated protein kinase 7246mitogen-activated protein kinase 8247mitogen-activated protein kinase 10248mitogen-activated protein kinase kinase 1249mitogen-activated protein kinase kinase 5250mitogen-activated protein kinase kinase 6251eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 2252presenilin 1 (Alzheimer disease 3)253presenilin 2 (Alzheimer disease 4)254phosphatase and tensin homolog (mutated in multiple advanced cancers 1) 255prostaglandin E receptor 3 (subtype EP3)256parathyroid hormone257prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (prostaglandin G/H synthase and cyclooxygenase)258PTK2 protein tyrosine kinase 2259protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6260protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13 (APO-1/CD95 (Fas)-associated phosphatase)261RAD21 homolog (S. pombe)262RAD23 homolog B (S. cerevisiae)263v-raf-1 murine leukemia viral oncogene homolog 1 264retinoblastoma 1 (including osteosarcoma)265AT rich interactive domain 4A (RBP1-like)266jumonji, AT rich interactive domain 1A267retinoblastoma binding protein 4268retinoblastoma binding protein 5269retinoblastoma binding protein 6270retinoblastoma-like 1 (p107)271retinoblastoma-like 2 (p130)272v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A, nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 3, p65 (avian)273v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog B, nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 3 (avian)274D4, zinc and double PHD fingers family 2275S100 calcium binding protein B276mitogen-activated protein kinase 12277chemokine (C-C motif) ligand 2278mitogen-activated protein kinase kinase 4279secreted frizzled-related protein 1280secreted frizzled-related protein 2281secreted frizzled-related protein 5282serum/glucocorticoid regulated kinase283seven in absentia homolog 1 (Drosophila)284signal-induced proliferation-associated gene 1285synuclein, alpha (non A4 component of amyloid precursor)286superoxide dismutase 1, soluble (amyotrophic lateral sclerosis 1 (adult)) 287SON DNA binding protein288secreted phosphoprotein 1 (osteopontin, bone sialoprotein I, early T-lymphocyte activation 1)289somatostatin receptor 3290signal transducer and activator of transcription 1, 91kDa 291serine/threonine kinase 3 (STE20 homolog, yeast)292ADAM metallopeptidase domain 17 (tumor necrosis factor, alpha, converting enzyme)293mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7294teratocarcinoma-derived growth factor 1295testis enhanced gene transcript (BAX inhibitor 1)296transcription factor Dp-1297transcription factor Dp-2 (E2F dimerization partner 2) 298transforming growth factor, beta 1299TIA1 cytotoxic granule-associated RNA binding protein。

细胞因子对胰岛细胞凋亡及凋亡相关基因表达的影响

ＨｉｇＬＵＭｎ，ＵＤｍｎＳｎ，Ｎａｐｎ，Ｎｎ，ＨＮＫｑｎＹＮＷｅＥＱｎ，ＩｉｇＹｅｉ，ＵＪｇＷＡＧＢｏｉｇＷＡＧＪｇＣＥｅｉ，Ｉｉｉｉ
ＤｐｒｅｔｆｎｏｒｏｏｙＧｎｒｌｏｐｔｏＴａｊｅａｔｎｏＥｄｃｉｌ，ｅｅａＨｓｉｆｉｉｄａＵｉｒｔＴｎｉ００２ＣｉｍｎｇｌａｎｎＭｅｉｌｎｖｓｙｉｊｃｅｉ，ａｎ３０５，ｈｎａＡｓｒｃｂｔｔｊｃｉＴｖｓｇｔｅｅｔｏｕｒｅｒｓｃｒ（Ｎ）ｆｎｔｒｒｎ（Ｎ）ｎｔｅｐｐｏｉａＯｂｔｅ：ｏｉｅｔａｅｆｃｆｔｍｏｃｉｆｔＴＦｏａｄｉｅｅｏＩｏｏｔｓｅｖｎｉｓｎｏｓａｏ．ｎｆＦｈａｓ
基因表达的影响。方法：应用ＴＮＬ法检测高浓度ＴＦｔＩＮ／ＵＥＮｏ和Ｆ￣培养后大鼠胰岛细胞和小鼠１Ｃ３３一细胞凋亡百分Ｔ率．用半定量Ｒ－ＣｓＲ－Ｃ检测培养后ｂｌ２ｂｘｃｍｃｐ３和ｆｓＮ应ＴＰＲ（ＱＴＰＲ）ｃ、ａ、— ｙ、５一ａＡ的表达。结果：鼠胰岛细胞经ｍＲ大
ａｄｅｐｅｓｎｏｏｔｓ —ｅａｄｇｎｓｎｉｅｅｓＭｅｈｄ：ｐｐｏｃｃｌｆｒｒｔｓｔｅｌｎＣ３ｃｌｎｘｒｓｏｆｐｐｏｉｒｌｅｅｅｌｃｉ．ｔｏｓＡｏｔｔｅｓｏｉｙｒｌｌａｄ１Ｔ一ｅｉａｓｔｉｓｔｌｉｌｐｍａａｉｅｃ３ｌ

缺血预处理抗心肌细胞凋亡的相关基因调控机制的研究

ｈｌｕｔｕｔｅｕｙｔｅｍｌｃａｔｇｔｎｔａｎｙａｉｉｈｍａｒｐｒｓｎｉｕ．ｅｆｌｏｆｒｒｔｄｈｏｅｕｒａｅｉｒｔｇｍｏｒａｓｅｉ－ｅｆｉｎｒｐｈｓｌｒｅｉｃｄｌｃｅｕｏｊｙＫｅｏｄ：ｙｃｒｉｓｈｍａｒｐｒｓｎｉｕｙｅｐｐｏｉ；ＩｈｍｃｐｃｎｉｏｉｇｅｅｙｗｒｓＭｏａｄｌｉｅｉｅｅｆｉｎｒ；Ｃｌａｏｔｓｓｅｉｒｏｄｔｎｎ；Ｇｎａｃ－ｕｏｊｓｃｅｉ
ｒｌｔｄｗｔｒｍｉｇｏｘｒｓｉｎｃａｇｓｏｎｐｐｏｉｒａｅｅｅ，ｕｈａａｍｉｅｅ，ｃａｌｅａｅｉｐｉｎｆｅｐｅｓｈｎｅｆｈｏｍａｙａｏｔｓｓｅｄｇｎｓｓｃｓｆｆｌｇｎＢｌｍｉｙ－ｔｓａｙｆ
发生改变有相关，ｆ家族基因、ｃ家族基因、— 基因、－ｎ基因、因子Ｋ如ａｓＢｌｃｃｊｕ核Ｂ等。而缺血预（ｏ－ａｍｔｓｈｍｃｐｅｏｄｉｎ，ｎｎｔｕａｉｉｅｉｒｎｔｎｇｒｃｃｃｉｏｉ
ｐｏｅｎｒｔｉ
已知Ｂｌｃ２家族有大约１成员，。５个按其功能可分为抗凋亡的Ｂ１ｃ２亚族（．包括Ｂｌ、ｃｘ、ｃｗ、ｌ、ｒ３等）ｃ２ＢｌＬＢｌＭｃ１Ｎ－一 — 。。１
肌ＩＣ和ＮＰ）ＰＩＣ在抗心肌Ｉ伤过程Ｒ损
中对细胞凋亡和上述所论及的调控抗

人红系分化相关基因高表达提高TF-1细胞系存活能力

ｏｆＴＦ一１ｃｅｌｌｌｉｎｅ．Ｍｅｔｈｏｄｓ：ＡＴＦ－１ｃｅｌｌｌｉｎｅｓｔａｂｌｙｏｖｅｒｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇＥＤＡＧｗａｓｇｅｎｅｒａｔｅｄａｆｔｅｒｈｉｇｈ－ｅｉｃｆｉｅｎｃｙ
Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ，Ｅ— ｍａｉｌ：ｈａｐｐｙｌｉｃｈｙ＠ｙａｈｏｏ．ｃｏｎ．ｒｃｎ
［Ａｂｓｔｒａｃｔ］０ｂｊｅｃｔｉｖｅ：Ｔｏｉｄｅｎｔｉｆｙｔｈｅｅｆｆｅｃｔｏｆｅｒｙｔｈｒｏｉｄｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ－ａｓｓｏｃｉａｔｅｄｇｅｎｅ（ＥＤＡＧ）ｏｎｔｈｅｓｕｒｖｉｖ系分化相关基因高表达提高ＴＦ一１细胞系存活能力
郑巍薇。，张美江，尹荣华。，董小明，詹轶群，杨晓明，李长燕
１．军事医学科学院放射与辐射医学研究所，北京１００８５０；２．天津大学化工学院，天津３０００７２；３．北京工业大学生命科学与生物工程学院，北京１０００２２［摘要］目的：检测人红系分化相关基因（ＥＤＡＧ）对ＴＦ一１细胞株存活能力的影响。方法：采用电转染法将过表达ＥＤＡＧ的质粒高效转染ＴＦ一１细胞株，通过Ｇ４１８筛选得到过表达ＥＤＡＧ的ＴＦ一１细胞稳定株，用ＭＴＳ法检测过表达ＥＤＡＧ的细胞稳定株在撤除细胞因子后的增殖情况，用流式细胞术检测细胞凋亡。结果：用表达ＧＦＰ的质粒电转染ＴＦ一１细胞株，通过综合评价转染效率和细胞状态，确定最佳转染条件为１３５０Ｖ电压电击３０ｍｓ，电击次数为１次；对得到的细胞稳定株进行检测，其内源ＥＤＡＧ的ｍＲＮＡ和蛋白水平均上调；将细胞稳定株在撤除细胞因子状态下培养，过表达ＥＤＡＧ后细胞存活能力增强、凋亡减少。结论：用电转染方式高效转染ＴＦ一１细胞，通过筛选得到过表达ＥＤＡＧ的稳定细胞株，并证实撤除细胞因子后过表达ＥＤＡＧ能提高ＴＦ一１细胞系的存活及抗凋亡能力。［关键词］人红系分化相关基因；ＴＦ一１细胞；存活；凋亡［中图分类号］Ｑ２５；Ｒ４５７［文献标识码】Ａ［文章编号］１０Ｏ９ — ０００２（２０ｌ３）０４－０４６２－０５

细胞周期和细胞凋亡类基因

细胞周期和细胞凋亡类基因G0 G1 转变(G0 to G1 transition) 1: mdm4G1/S 特异转录，有丝分裂细胞周期(G1/S-specific transcription in mitotic cell cycl e) 1: gfi1G1/S 转变, 有丝分裂细胞周期(G1/S transition of mitotic cell cycle) 19: bca t1 ccnd1 ccne1 cdc34 cdc7 cdca5 cdk4 cdkn3 cul1 c ul2 cul3 cul4a cul5 gspt1 lats2 pml ppp6c rcc1 sk p2G1/S 转变检控点(G1/S transition checkpoint) 4: dlg1 hus1 nbn p uraG1 期(G1 phase) 2: cdc42 rb1G1 期, 有丝分裂细胞周期(G1 phase of mitotic cell cycle) 10: anapc2 cd c23 cdk6 cdkn1c dnaja2 e2f1 map3k11 taf1 taf1l tbr g4G1 特异转录，有丝分裂细胞周期(G1-specific transcription in mitotic cell cycle) 1: gfi1bG2/M转变, 有丝分裂细胞周期(G2/M transition of mitotic cell cycle) 10: ana pc10 anapc4 anapc5 birc5 ccnb1 cdk2 dnm2 khdrbs1 l ats1 tpd52l1G2/M转变DNA 损伤检控点(G2/M transition DNA damage check-point) 1: brsk 1G2 期, 有丝分裂细胞周期(G2 phase of mitotic cell cycle) 4: cenpf ches 1 gtse1 kpna2M期(M phase) 2: ilf3 rb1M期, 有丝分裂细胞周期(M phase of mitotic cell cycle) 4: cdc25b dlg7 mphosph6 mphosph9M期特异微管过程(M phase specific microtubule process) 1: kpna2S-M检控点(S-M checkpoint) 1: appbp1S 期, 有丝分裂细胞周期(S phase of mitotic cell cycle) 1: cdk2ap1S 期特异转录，有丝分裂细胞周期(S-phase-specific transcription in mitotic cell c ycle) 1: abl1胞裂蛋白环组装(septin ring assembly) 1: nubp1胞质分裂(cytokinesis) 16: arhgef11 aurkc cecr2 dctn3 dia ph2 espl1 myh10 prc1 rasa1 rock2 sept2 sept3 sept4 sept5 sept6 sept7不对称细胞分裂(asymmetric cell division) 1: pard3凋亡程序(apoptotic program) 10: bad bik casp2 casp7 cas p8 casp9 mcl1 pdia2 psen2 vdac1凋亡核改变(apoptotic nuclear changes) 2: dedd2 ndufa13凋亡染色体浓缩(apoptotic chromosome condensation) 1: acin1凋亡线粒体改变(apoptotic mitochondrial changes) 4: bak1 bax bc l2l1 bid动粒组装(kinetochore assembly) 2: cenpe cenpf纺锤体组织和生物发生(spindle organization and biogenesis) 7: aurka b ub1b cks2 kntc2 spag5 ube2c zwint分裂间期, 有丝分裂细胞周期(interphase of mitotic cell cycle) 1: katna1减数分裂(meiosis) 30: boll c8orf1 ccna1 ccnb3 cspg6 dmc 1 dmwd dusp13 exo1 h2afx mre11a msh4 msh5 nek2 ra d50 rad51 rad54l rec8l1 smc1l1 smc1l2 spo11 stag2 stag3 sycp1 sycp2 top3a tsga2 utp14c xrcc2 zw10减数分裂纺锤体组织和生物发生(meiotic spindle organization and biogenesis) 1: tubg1减数分裂前期I (meiotic prophase I) 1: sycp2减数分裂前期II (meiotic prophase II) 1: msh5减数分裂染色体凝集(meiotic chromosome segregation) 1: sgol1减数分裂重组(meiotic recombination) 19: atm chek1 dmc1 klhdc 3 lig3 mlh3 mre11a msh4 msh5 rad21 rad50 rad51 ra d51l1 rad51l3 rad52 rad54b rec8l1 spo11 sycp1姐妹染色单体凝集(sister chromatid segregation) 1: lats1姐妹染色单体连接(sister chromatid cohesion) 3: cspg6 pols rec8l1跨越开始控制点, 有丝分裂细胞周期(traversing start control point of mitotic cell cycle) 6: cdc2 cdc25c cdc6 cdc7 cdk10 cdk2联会复合体形成(synaptonemal complex formation) 4: sc65 stag3 s ycp1 sycp2内S DNA 损伤检控点(intra-S DNA damage checkpoint) 1: nek11确立有丝分裂纺锤体定位(establishment of mitotic spindle localiz-ation) 1: espl1确立有丝分裂纺锤体取向(establishment of mitotic spindle orient-ation) 1 : pafah1b1染色体凝集(chromosome segregation) 13: espl1 psen1 psen2 p ttg1 rad21 riok3 sgol2 smc1l1 smc1l2 srpk1 stag1 s tag2 stag3染色体浓缩(chromosome condensation) 1: hils1染色体组织和生物发生(chromosome organization and biogenesis) 8: pttg1 pttg3 rad50 smc1l1 smc1l2 smc2l1 smc5l1 smchd1染色体组织和生物发生(见于真核生物) (chromosome organization and biogenesis (sensu E ukaryota)) 82: abtb2 ard1a atrx cbx4 cenpa chd1 chd2 chd3 chd4 cspg6 egf h1f0 h1fx h2afb1 h2afb3 h2 afv h2afx h2afy h2afy2 h2afz h2bfm h2bfs h3f3a h3f 3b hist1h1b hist1h1c hist1h1d hist1h1e hist1h2ab his t1h2ac hist1h2ae hist1h2ag hist1h2ak hist1h2aps4 hist 1h2ba hist1h2bb hist1h2bc hist1h2bd hist1h2bh hist1h2 bj hist1h2bk hist1h2bl hist1h2bm hist1h2bn hist1h2bo hist1h3f hist1h4g hist2h2aa hist2h2ac hist2h2bc his t2h2be hist2h3c hist3h2bb hist3h3 hmga1 hmga2 loc340 096 loc340549 loc347376 loc388177 loc391405 loc391769 loc391770 loc442461 loc653604 prm1 prm2 psen1 psen 2 rad21 rad21l1 rec8l1 rp11-196g18.6 rp5-998n21.6 sm c4l1 tnfrsf7 tnp1 tnp2 top3a top3b twist1 znf238细胞成熟(cell maturation) 1: il21细胞凋亡(apoptosis) 262: acin1 ad7c-ntp adora2a adra1a a gtr2 ahr akt1 api5 aplp1 app apr-2 arhgef6 atg12 atg5 aven axin1 axud1 bag1 bag2 bag3 bag4 bag5 ba x bbc3 bcap29 bcap31 bcl2l11 bcl2l12 bfar birc1 bi rc4 birc5 birc6 birc7 bmf bnip1 bnip2 bnip3l bnipl bre c12orf22 casp14 casp3 casp6 casp8ap2 cd14 cd4 0 cd5l cdc2l1 cdc2l2 cdkn2a cgb7 ciapin1 cias1 cidea cideb cidec clu crop cse1l ctnnal1 ctnnbl1 cycs dad1 dap dap3 dapk1 dapk2 dapk3 daxx dcc ddx41 dffa dffb dhcr24 diablo dido1 dnase1 dnase1l3 dnase 2 dock1 dpf2 e2f1 eaf2 ebag9 edar egln3 eif2ak2 e lmo1 elmo2 elmo3 ep300 ern1 ern2 espl1 f2 f2r faf 1 faim faim2 fas faslg fastk fis1 fksg2 flj21901 foxo3a fxr1 gadd45a gadd45b gadd45g gas2 glrx2 gml gpr65 gzma gzmb gzmh hd hipk2 hipk3 htra2 iapp ier3 ihpk3 il17 il19 il1a il1b il24 il2ra ing4 it gb2 itgb3bp kcnip3 kiaa0971 kiaa1967 lgals12 lgals7 litaf ltbr ly86 maea mageh1 magi3 map3k5 mdm4 mo ap1 mrps30 mtp18 nalp2 nckap1 ndufa13 nfkb1 nfkbia ngfr ngfrap1 nme3 nme6 ntn1 p2rx1 pak1 pawr pax3 pdcd1 pdcd10 pdcd11 pdcd2 pdcd4 pdcd6 pdcd6ip pdc d7 pdcd8 pdcl3 pde1b phlda1 phlpp pml ppard ppm1f ppp1r13b ppp1r13l ppp1r15a ptk2b ptpn6 ptrh2 pura purb rad21 raf1 rffl ripk1 ripk3 rnf130 rnf34 ro ck1 rybp scarb1 sema6a sgk sgpl1 sh3glb1 siah1 sia h2 sirt1 siva slc25a6 smndc1 spata4 spin2 sqstm1 s tk17a stk17b stk3 stk4 sulf1 taip-2 taok2 tbrg4 te gt tesk2 tia1 tiaf1 tial1 tnf tnfaip3 tnfrsf10a tn frsf10c tnfrsf10d tnfrsf11b tnfrsf12a tnfrsf14 tnfrsf19 tnfrsf1a tnfrsf1b tnfrsf21 tnfrsf25 tnfrsf6b tnfr sf7 tnfsf10 tnfsf12 tnfsf7 tnfsf9 tp53 tp53bp2 tp53 inp1 tp73 tp73l tradd triad3 trib3 trim35 txnl1 ub e4b unc5a unc5b unc5c unc5d yars zbtb16 zdhhc16 zn f346细胞分裂(cell division) 138: als2cr19 anapc1 anapc10 ana pc11 anapc2 anapc4 anapc5 anapc7 aspm bcar1 brrn1 bub1 bub1b ccdc16 ccdc5 ccna1 ccna2 ccnb1 ccnb2 cc nb3 ccnc ccnd1 ccnd2 ccnd3 ccne1 ccne2 ccnf ccng1 ccng2 ccnk ccnt1 ccnt2 ccrk cdc14a cdc16 cdc2 cd c20 cdc23 cdc25a cdc25b cdc25c cdc2l2 cdc2l6 cdc40 cdc42 cdc6 cdc7 cdca1 cdca5 cdca8 cdk2 cdk3 cdk4 cdk5 cdk6 cdk7 cdk8 cenpe cenpf cenpj cetn1 cetn 2 cetn3 chfr cit cks1b cks2 clasp1 clasp2 cnap1 c ntrob cspg6 dclre1a flj37927 ftsj3 fzr1 hcap-g ince np katna1 katnb1 kif11 kif23 kntc1 lats1 lats2 lig 1 lig3 lig4 mad1l1 mad2l1 mad2l2 mapre1 mapre2 map re3 nedd9 nek1 nek2 nek3 nek4 nek9 nudc pafah1b1 papd5 pard6a pard6b pard6g pols ppp1ca ppp1cb ppp1c c pttg1 rad21 rcc1 rcc2 sept1 sept10 sept11 sgol1 sgol2 sirt2 smc1l1 smc2l1 smc4l1 spag5 spata5l1 sssca1 stag1 stag2 sycp1 sycp2 tacc1 terf1 txnl4a u be2c wee1 zc3hc1 znf367 zw10细胞溶解(cytolysis) 15: c5 c6 c7 c8a c8b c8g c9 gzma gzmb gzmh gzmm lyz mmd mmd2 prf1细胞生长(cell growth) 31: ar csrp2 ddx5 dgkd emp1 emp3 erbb2ip esr1 fgf20 fgfr1 fgfr2 fgfr3 fhl1 frap1 klf6 lefty1 lefty2 loc440836 ltbp4 mtpn ndrg4 nop5/ nop58 notch2 p8 slc3a2 tgfb1 tgfb2 tgfb3 tnn vat1 xrn2细胞死亡(cell death) 22: aplp1 aptx bnip3 clu clul1 db c1 eif4g2 emp1 emp2 emp3 faf1 fosl2 il17 ins nup6 2 parp4 psmc5 ptger3 setx tgfb1 tgfb2 zak细胞增殖(cell proliferation) 253: ache adra1b adra1d akr 1c3 appl ar areg arhgef1 bcar1 bcat1 bhlhb3 bin1 blzf1 bst2 btc bub1 bub1b bub3 c2orf29 cbfa2t2 cbf a2t3 cckbr cd160 cd5 cd74 cdc14a cdc16 cdc25a cdc25c cdc27 cdc2l1 cdk3 cdk4 cdk5 cdk5r1 cdk5rap1 cdk 5rap3 cdk6 cdk7 cdk9 cenpf chgn chrm1 chrm3 chrm4 chrm5 cklf cks2 clk1 col4a3 creg1 crip1 cse1l cs f1 csf1r csrp2 ctf1 ctnnbip1 cul5 cxcl1 cyr61 dab2 dctn2 dip13b dkc1 dlg7 dtymk e2f1 e4f1 edd1 ednr a egfr eln emp1 emp2 enpep ephb4 eps15 eps8 erbb2 erbb4 erf erg evi5 fes fgf1 fgf2 fgf3 fgf4 fgf5 fgf6 fgf7 fgf8 fgf9 figf frat2 fscn1 fth1 fzd3 gab1 gas6 gcg gfer gfi1b gkn1 gpc4 grn grpr hdgf hdgfrp3 ifi16 ifrd2 igf2 igfbp4 igsf8 il15ra il1a il1b il2ra il5ra il6r il8rb il9r ilk-2 insig1 in sl4 irf2 isg20 khdrbs1 kif2c kitlg klf10 krt16 lgi 1 lmo1 lrp1 lrpap1 ly86 map3k11 mapre1 mapre2 mas1 matk mdk mdm4 met mia mif mki67 mnat1 mpl ms4a2 mt3 mtcp1 mxd1 myc myt2 nab2 ndp npy nr6a1 nrd1 osm osmr pa2g4 pcna pdap1 pdgfa pdgfb pdgfra pem t pes1 pgf pim1 pim2 plk1 ppard ppbp prdm4 prdx1 prg4 prkd1 prl prmt5 prok1 prok2 psphl ptch pten ptn pura purb pyy raf1 rapgef3 rbbp7 reg1b reg3a retnlb rfp rps27 runx3 s100a6 s100b serpinf1 sfn shfm3p1 sipa1 skp2 slc29a2 sphk2 spock1 stil syk tacstd2 tal1 tcf19 tcf8 tfdp1 tgfa tgfb1 tgfb2 tgfb3 tgfbi thpo tnfrsf17 tnfsf13b tnfsf7 tnfsf8 tnf sf9 tp53 tpd52l2 tpx2 traip tspan1 tspan2 tspan3 t spy1 tusc2 txlna txn txndc ube2v2 usp8 vegf vegfb vegfc vti1b wit1 zak zfp36l2 zmynd11 znf259细胞周期(cell cycle) 354: ahr als2cr19 anapc1 anapc10 a napc11 anapc2 anapc4 anapc5 anapc7 ankrd15 apc appb p1 appl aspm atm atr aurka aurkb aurkc axin1 bax bcl10 bin1 bin3 brca1 brms1 bub1 bub1b c10orf46 c13orf10 c6orf88 ccdc16 ccdc5 ccna1 ccna2 ccnb1 ccn b2 ccnb3 ccnc ccnd1 ccnd2 ccnd3 ccne1 ccne2 ccnf ccng1 ccng2 ccnh ccnk ccnt1 ccnt2 ccrk cdc14a cdc1 6 cdc2 cdc20 cdc23 cdc25a cdc25c cdc2l1 cdc2l2 cdc 42 cdc45l cdc5l cdc6 cdc7 cdc73 cdca5 cdk2 cdk2ap1 cdk3 cdk4 cdk5 cdk6 cdk7 cdk8 cdkn1a cdkn1b cdkn 1c cdkn2a cdkn2b cdkn2c cdkn2d cdkn3 cdt1 cenpe ce tn1 cetn2 cgref1 cgrrf1 chaf1a chaf1b chek1 chek2 chfr cit cks1b cks2 clasp1 clasp2 clspn cnap1 cntr ob cspg6 ctcf ctcfl 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rhob rif1 rint1 rp11-29 1l22.2 s100a6 sash1 sass6 sept1 sept10 sept11 sept2 sept3 sept4 sept5 sept6 sept7 sept8 sgol1 sgol2 sh3bp4 siah1 siah2 sirt2 smarcb1 smc1l1 smc1l2 smc2 l1 smc4l1 smpd3 snf1lk spag5 spin2 sssca1 stag1 st ag2 stag3 stim1 strn3 sufu sycp1 sycp2 tacc1 tada2l taf1 taf1l terf1 terf2 tfdp1 tfdp2 tlk1 tlk2 tp53 tp53bp2 tp73 tsc1 tsc2 tusc2 tusc4 txnl4a txnl4b uba52 ube1c ube2c uhrf1 uhrf2 usp16 vash1 vhl w ee1 wt1 wwox xrn1 zak zc3hc1 zmynd11 zw10 zwint z wintas细胞周期检控点(cell cycle checkpoint) 11: atr brca1 ccne2 ccn g2 cdkn2a fancg rad1 rb1 smc1l1 tp53 zak 细胞周期停滞(cell cycle arrest) 68: aif1 apbb1 apbb2 bard1 btg4 c10orf7 cdkn1a cdkn1b cdkn1c cdkn2a cdkn2b c dkn2c cdkn2d cdkn3 cgref1 cgrrf1 cul1 cul2 cul3 cu l4a cul5 ddit3 dhcr24 dst eif4g2 ern1 gadd45a gas1 gas2 gas2l1 gas2l2 gas2l3 gas7 hbp1 ifnw1 il8 in g4 inha inhba jmy khdrbs1 macf1 map2k6 mapk12 mfn2 mllt7 mphosph1 myc nbn notch2 pa2g4 pcaf pcbp4 p lagl1 pml ppm1g ppp1r15a ppp2r3b rassf1 sart1 sesn1 sesn2 sesn3 tbrg4 tp53 uhmk1 vash1 zak雄性减数分裂(male meiosis) 3: hspa2 pim2 taf1l雄性减数分裂I (male meiosis I) 1: ccna1一维细胞生长(unidimensional cell growth) 1: bin3引导细胞凋亡(induction of apoptosis) 92: alox15b apoe bad b ak1 bax bcl10 bcl2l11 bcl2l13 bclaf1 bik bnip3 bni p3l bok casp10 casp3 casp4 casp6 cd2 cias1 cideb cidec col4a3 dapk2 dapk3 dcc dedd diablo dpf1 ei24 ercc2 ercc3 ern1 ern2 fas faslg foxo3a hd hrk i fna2 ifnb1 ikbkg inha inhba jmy lalba lck lta mal map3k10 mapk1 mx1 nalp1 nme3 notch2 nudt2 p8 pdc d5 plagl1 plg pml ppp1r13b ppp2ca ppp2r1a ppp2r1b prkce pten pycard s100b sipa1 smndc1 stk17a stk17b tia1 tial1 tlr2 tnfrsf10a tnfrsf19 tnfrsf7 tnfrsf9 tnfsf10 tnfsf12 tnfsf14 tnfsf8 tp53bp2 tp73l tpd52 l1 tradd traf3 traip unc13b utp11l znf443引导细胞凋亡经死亡域受体(induction of apoptosis via death dom-ain recept ors) 10: bid cradd daxx dedd dedd2 diablo fadd il 18 tnfrsf10a tnfrsf10b引导细胞凋亡由胞外信号(induction of apoptosis by extracellular signals) 19: adora1 bax btk casp8ap2 cd38 cflar dap dap3dapk1 dpf2 fastk map3k5 ndufa13 pdcd6 prkca ripk3 siva timp3 tnfrsf25引导细胞凋亡由激素(induction of apoptosis by hormones) 3: pth sst r3 tp53引导细胞凋亡由细胞内信号(induction of apoptosis by intracellular signals) 9: cdkn1a cul1 cul2 cul3 cul4a cul5 hipk2 lgals1 2 sart1引导细胞凋亡由氧化压力(induction of apoptosis by oxidative stress) 2: prodh rnf7有丝分裂(mitosis) 98: akap8 anapc1 anapc11 anapc2 anapc7 aspm aurka brrn1 bub1 bub1b bub3 ccdc16 ccdc5 cc na1 ccna2 ccnb1 ccnb2 ccnf ccng1 ccng2 ccnk cdc2 cdc20 cdc25a cdc25b cdc2l1 cdc2l2 cdc6 cdca5 cdk2 cdk3 cenpf cetn1 cetn2 cetn3 chfr cit clasp1 clasp 2 cnap1 coro1a dclre1a dctn1 dctn2 dctn3 eml4 fgf4 flj37927 fzr1 hcap-g hgf incenp katna1 katnb1 kif22 kif23 kif2c kntc1 lats1 lats2 mad2l1 mad2l2 map re1 mapre2 mapre3 mis12 nedd9 nek1 nek3 nek4 nek9 nolc1 nudc pafah1b1 papd5 pbk plk1 pols ppp5c pt tg1 rad21 rcc2 sgol1 sirt2 smc2l1 spag5 sssca1 sta g1 stag2 sugt1 tardbp tpx2 ttn txnl4a txnl4b ube2c wee1 zc3hc1有丝分裂G2 检控点(mitotic G2 checkpoint) 2: ccna2 nbn有丝分裂纺锤体检控点(mitotic spindle checkpoint) 5: bub1 bub3 cenpf mad2l2 ttk有丝分裂纺锤体延伸(mitotic spindle elongation) 2: kif23 prc1有丝分裂纺锤体组织和生物发生(mitotic spindle organization and biogenesis) 10: cspg6 dync1h1 kif11 ran rcc1 smc1l1 stmn1 ttk tu bg1 unc84b有丝分裂纺锤体组装(mitotic spindle assembly) 1: rae1有丝分裂后期(mitotic anaphase) 5: anapc10 anapc4 anapc5 mad1 l1 numa1有丝分裂检控点(mitotic checkpoint) 7: brca2 bub1b chfr kntc1 mad1l1 mad2l1 zw10有丝分裂姐妹染色单体凝集(mitotic sister chromatid segregation) 5: espl1 kif25 kifc1 kntc2 zw10有丝分裂姐妹染色单体凝集蛋白(mitotic sister chromatid cohesion) 1: smc1l1有丝分裂末期(mitotic telophase) 1: mad1l1有丝分裂染色体浓缩(mitotic chromosome condensation) 11: brrn1 cdca5 cnap1 hcap-g pam pcoln3 pols prm1 prm2 smc2l1 sm c4l1有丝分裂染色体运动向纺锤体柱(mitotic chromosome movement towards spindle pole ) 2: cenpe dlg7有丝分裂细胞周期(mitotic cell cycle) 2: brrn1 cep250有丝分裂中期(mitotic metaphase) 2: cenpe mad1l1有丝分裂中期/后期转变(mitotic metaphase/anaphase transition) 1: cdc27有丝分裂中期板汇集(mitotic metaphase plate congression) 3: cdc23 c dca5 cenpe有丝分裂中心体分离(mitotic centrosome separation) 1: cetn1有丝分裂重组(mitotic recombination) 3: rad51 rad52 rad54b增殖(reproduction) 1: mmp23b中心体复制(centrosome duplication) 1: sass6中心体周期(centrosome cycle) 3: cetn3 npm1 tube1中性粒细胞凋亡(neutrophil apoptosis) 1: il6周期蛋白分解代谢(cyclin catabolism) 3: anapc2 cyb561d2 ube2c转化细胞凋亡(transformed cell apoptosis) 2: prf1 rhob。

细胞凋亡机制与方法研究进展

棱，动自身遗传机制，一系列精确的反应程序，启按形成级联放大的信息传导和基因表达，最终导致生
理性死亡 … 。
１１肿瘤坏死因子（Ｎ）体家族．ＴＦ受ＴＦ家族至少有１Ｎ２个成员，已证实其中的死亡受体ＦｓＴＦ１等在与相应的配体结合后能诱导ａ、ＮＲ细胞凋亡。这些受体的共同特点是他们的胞内区都有转导细胞死亡信号所必须的一段高度同源的氨基酸序列，称作死亡区，是能引发配体介导反应它的一个独立功能域。目前已克隆出能与ＦｓＴ — ａ或ＮＦＩ死亡区相互作用的蛋白：ａ亡区结合蛋白ＲＦｓ死（ＡＤ、ＮＲ死亡区结合蛋白（ＲＤ）ＦＤ）ＴＦ１ＴＡＤ和受体结合蛋白（Ｉ）这些蛋白也含有与Ｆｓ或ＴＦ１ＲＰ，ａＮＲ同源的死亡区，中任何一种过度表达均可导致其细胞凋亡样形态变化，终使细胞凋亡。位于最ＦＤＡＤ信号下游并能与ＦＤＡＤ的ＤＥＤＤ区结合的蛋白亦被克隆，称作ＦＩＥＰＲＩ被归类于白细胞ＬＣ／ＯＴ，
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第８卷
第２期
解
剖科学进
展
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２０２。
２００２正
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细胞凋亡机制与方法学研究进展

线粒体基因转录调控机制的研究

线粒体基因转录调控机制的研究线粒体是细胞内一个重要的细胞器，更像是一个小型的能量工厂。

它除了担任生成细胞能量的任务外，还负责一些重要的生物学过程，比如细胞凋亡、钙离子平衡、细胞分裂、老化等等。

线粒体内的遗传信息主要源于线粒体基因组，该基因组仅由约16 kb的DNA序列组成。

这个相对较小的基因组需要高度的线粒体生物合成和细胞内的物质循环，以保证细胞的正常功能。

为此，线粒体细胞呼吸链中合成ATP的过程需要从细胞核转录和翻译许多的琐碎细胞器内蛋白质基因。

这其中就需要对于线粒体基因的转录进行调控。

在线粒体中，细胞呼吸链的基因编码仅占核基因组和线粒体基因组总编码基因的少部分，但其编码的蛋白质各起重要的作用。

与此同时，在线粒体内部对基因表达水平的调控也是非常必要的，包括转录、RNA加工、翻译等过程。

线粒体基因转录调控的机制研究方面，已有多项进展和创新。

其中包括哺乳动物线粒体转录起始机制的研究，哺乳动物线粒体基因转录启动和中断动态相关的研究。

同时，还有线粒体RNA降解的研究以及肌肉细胞特异的线粒体基因转录调控的研究等等。

1. 转录起始机制线粒体的转录起始机制是线粒体基因转录调控的一个重要环节。

动物线粒体的转录起始机制概括如下：所有编码基因集中存在H折叠区（H区）下游区域，编码规则不能自行启动转录，而是依赖于友好H-DNA结合的人类线粒体炎症质（TFAM）和转录调解因子B2比C1：C2缺陷（TFB2M）的作用。

在哺乳动物体内，TFAM是细胞周期和节律性的线粒体基因表达调控的关键。

它同时也是线粒体DNA复制的必要成分。

然而，TFAM并不能独立地引导RNA聚合酶的选择，相反它需要TFB2M作为协同因子。

研究发现，TFAM和TFB2M配合的线粒体编码基因，必须在H折叠区与TFAM和TFB2M中的rRNA聚合酶一起被捆绑，才能启动转录。

同时，实验研究表明，在线粒体基因组中，许多不同的元件组成了复杂的调控网络，使得细胞可以对线粒体内某些特定基因的表达程度进行精细调控。

凋亡相关基因PDCD5研究进展

凋亡相关基因PDCD5研究进展PDCD5（原名TFAR19）由我国学者[1]利用cDNA-RNA（cDNA representation difference analysis）方法从白血病细胞株TF-1中克隆得到，并证实参与细胞凋亡调控过程。

研究表明其在多种肿瘤组织中表达下调，与肿瘤的发生发展、耐药机制的形成具有明显相关性，具有临床检验价值并对肿瘤的早期发现、早期诊断、早期治疗有很大的应用价值。

1 PDCD5基因定位与结构PDCD5定位于染色体19q12-q-13.1，能产生两个不同转录本。

cDNA （NM_004708）全长为559bp，包括6个外显子和5个内含子，AATAAA加尾信号和polyA尾，含有高活性非TATA盒启动子[2]，其中25-399bp有一个编码125个氨基酸的读码框，在25bp处有一个ATG起始密码[3]。

另一转录本（GenBank Access No. DQ208400）无外显子3和5，转录出一个截短的40氨基酸残基的蛋白质，其编码蛋白质促凋亡活性明显降低[4]。

研究表明，PDCD5的mRNA在50多种人类组织中均有表达，在成年的心脏、睾丸、肾脏、肾上腺、造血系统及胎盘中高表达，而在胚胎组织中的表达水平远低于成年组织[3]。

在PDCD5结构功能关系研究中，亚细胞定位于细胞核，PDCD5由3个紧凑的α螺旋核心、N端两个游离的α螺旋和C端无结构域，C端无结构域及N 端α1螺旋与PDCD5核转位有关，并且无核转位结构的PDCD5蛋白突变体其凋亡效应受到明显影响，其中C端起主要作用[5]，PDCD5核转位现象与促进细胞凋亡密切相关，核转位现象的发生早于磷脂酰丝氨酸外翻和核酸片段化，可能为细胞凋亡发生的早期事件[6]。

PDCD5进行翻译后可在S118位点磷酸化，并且磷酸化后的PDCD5参与其促凋亡活性，用非磷酸化的氨基酸突变后，PDCD5促凋亡效应减弱[7]。

2 PDCD5蛋白生物学功能利用生物信息学方法[8] 查找与PDCD5同源类似物，其结构为全螺旋蛋白质类-类RuvA C端结构域折叠，从结构上提示PDCD5有可能参与蛋白质降解、基因表达、膜磷脂转运等过程；根据同源物线虫微阵列拓扑图分析，提示PDCD5从功能上可能参与抗凋亡及泛素化途径。

细胞凋亡相关基因

细胞凋亡相关基因细胞凋亡是一种重要的细胞死亡方式，常常在胚胎发育、组织再生、免疫反应、恶性肿瘤等生理和病理过程中发挥着重要的作用。

细胞凋亡的早期和晚期事件涉及到复杂的信号转导网络和大量的基因，其中细胞凋亡相关基因是至关重要的活性基因。

它们参与细胞凋亡的调节、诱导和执行，是指导细胞凋亡发生和进行的“指挥员”。

这篇文档将详细介绍细胞凋亡相关基因的分类、生理功能和调控机制。

一、细胞凋亡相关基因的分类细胞凋亡相关基因包括：调节基因、信号转导基因、执行基因和抑制基因等几类。

它们的分类方式如下：1、调节基因：主要负责调节细胞凋亡的发生和过程，如Bcl-2家族基因、p53等。

2、信号转导基因：是指在体内信号转导途径中作为新响应器、信号发生器等的基因，如Caspase家族基因、PARP基因、Fas/CD95基因等。

3、执行基因：是维持正常细胞减数分裂、细胞分化和细胞死亡等基本细胞功能的实施者，如Caspase家族基因、caspase激活剂Smac等。

4、抑制基因：是调节细胞凋亡的重要因素，如XIAP、Bcl-2等。

二、细胞凋亡相关基因的生理功能1、调节细胞凋亡的荷尔蒙调节细胞凋亡的主要信号分子是荷尔蒙，它们能够结合其特定的受体在细胞内导致一系列的生化反应，最终分裂或死亡。

荷尔蒙激活p53、Bcl-2和其他一些调节细胞凋亡的基因，从而加速或抑制细胞凋亡的发生。

2、参与发育与生长的基因许多参与生发周期和器官发育的基因都参与了细胞凋亡的调节与执行。

如Bcl-2家族的基因在囊泡期的卵胞凋亡中起重要作用。

同时，一些胚胎发育过程中的基因如Caspase-3、Caspase-7等也可以诱导胚胎凋亡。

3、参与细胞免疫的基因细胞凋亡在免疫系统中发挥着重要的作用，通过清除老化、擦伤和受感染的细胞来防止病变。

一些与免疫相关的基因如Fas/CD95、TNF-α等都能够诱导细胞凋亡。

4、参与肿瘤发生和治疗的基因许多肿瘤细胞通过不同的途径逃避细胞凋亡的调节和执行，从而导致肿瘤的形成和发展。

细胞凋亡调控相关的基因及酶

细胞凋亡调控相关的基因及酶细胞凋亡是一种正常细胞程序性死亡的过程，它在维持生物体内部环境稳定、细胞发育、组织形成和免疫系统调节等方面起着重要作用。

细胞凋亡的调控涉及许多基因和酶，下面将介绍其中几个主要的调控因子。

1. Bcl-2家族基因：Bcl-2家族是细胞凋亡调控中最重要的家族之一。

它包括抑制凋亡的成员（如Bcl-2、Bcl-xL）和促进凋亡的成员（如Bax、Bak）。

这些基因通过调节线粒体膜通透性来控制细胞凋亡的发生。

Bcl-2和Bcl-xL通过抑制线粒体膜通透性转运蛋白Bax和Bak的活性，阻止线粒体释放细胞凋亡执行者酶，从而抑制细胞凋亡的发生。

2. c-Myc基因：c-Myc是一种转录因子，对细胞增殖和凋亡起着重要作用。

c-Myc在细胞生长、代谢以及凋亡调控中发挥着双重作用。

在细胞生长和代谢方面，c-Myc可以促进细胞周期进程和蛋白质合成，从而促进细胞增殖。

然而，在细胞凋亡调控中，c-Myc也能够诱导细胞凋亡的发生，通过抑制Bcl-2的表达或者直接调节凋亡相关基因的表达来实现。

3. p53基因：p53是一种重要的肿瘤抑制基因，也是细胞凋亡调控的关键因子。

在DNA损伤、细胞应激和肿瘤发生等情况下，p53被激活并调控多个靶基因的表达。

p53通过直接调控凋亡相关基因表达，如促凋亡基因PUMA和Bax的表达，或者通过调节凋亡相关信号通路的活性来诱导细胞凋亡。

4. Caspase家族酶：Caspase是一类半胱氨酸特异性蛋白酶，是细胞凋亡执行者酶。

Caspase家族包括半胱氨酸蛋白酶（如caspase-3、caspase-7）和半胱氨酸酶（如caspase-8、caspase-9）。

这些酶在细胞凋亡中起着关键作用，通过激活下游的凋亡效应蛋白，如DNA酶和核蛋白，从而引发细胞凋亡的级联反应。

5. IAP（抑制凋亡蛋白）家族：IAP家族是一类通过抑制Caspase的活性来抑制细胞凋亡的蛋白质。

IAP家族包括多个成员，如cIAP1、cIAP2和XIAP。

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生物化学与生物物理进展PROGRESS INBIOCHCMISTRYAND BIOPHYSICS1999年第1期 No.11999TF-1细胞凋亡相关基因的研究刘红涛　王玉刚　张颖妹　宋泉声　敬保迁　袁　勇　马大龙摘要　利用近年来发展起来的代表差异分析（cDNA representational differences analysis, cDNA-RDA）技术研究了在人红白血病细胞株TF-1细胞撤除细胞因子后进入凋亡时诱导表达的基因.发现了6个新基因片段.其中有三个经与GenBank nr和dbEST查询均没有发现同源性，已经向GenBank进行登记，登记号分别为U83208，U83279，U83397.此外还发现一批已知基因的表达与凋亡相关，其中包括Hou和人硫氧还原蛋白等, 提示它们在凋亡中可能起作用.这项工作为进一步研究凋亡相关基因打下了良好基础.通过RDA的研究结果，有可能发现人白血病细胞凋亡的特异标记蛋白或发挥作用的重要蛋白，以期为白血病治疗提供理论基础.关键词　TF-1细胞株，代表差异分析，凋亡学科分类号　R392.1Studies on the Apoptosis-Related Genes of TF-1 Cell Line by cDNA-RDA Technique. LIU Hong-Tao, WANG Yu-Gang, ZHANG Ying-Mei, SONG Quan-Sheng, JING Bao-Qian, YUAN Yong, MA Da-Long (Department of Immunology, Beijing Medical University, Beijing 100083, China).Abstract　The genes effecting in the process of the apoptosis of TF-1 cell line when it is deprived of the cytokine in the culture medium were studied by RDA (representational difference analysis) method. The TF-1 cell depriving of cytokines for 8 hours was selected as the Tester and normal-cultured TF-1 cell as the Driver. Seven gene fragments were found uniquely expressed or highly expressed in the process of apoptosis of TF-1 cell line which include some known genes such as Hou and thioredoxin that formerly suggested to play a role in apoptosis.There are three fragments are complete novel after searching the nr and EST catalogues of GenBank and were banked into GenBank. The accession numbers for them are U83208, U83279, U83397 respectively. From the novel gene fragments, the complete cDNA sequence of them can be fished and the bioactivity and function of them in apoptosis of TF-1 cell and other hematological tumors can be further studied. On the other hand, the function of some known genes which were not suggested formerly in the course of apoptosis can be studied.Key words　TF-1 cell line, representational difference analysis(RDA), apoptosis 细胞凋亡（apoptosis）是当前国际生物学研究的热点之一.目前已发现多种基因参与细胞凋亡，例如TNF/FAS家族，BCL2家族，ICE/CED-3家族，多种癌基因，抗癌基因，热休克蛋白等［1］.但由于细胞凋亡为多阶段，多系统，多基因参与的复杂过程，目前对其参与的全部基因尚远未了解清楚.通过进一步克隆化新的凋亡诱导基因，特别是具有启动作用的凋亡早期表达基因，将有助于阐明凋亡机理，为一些凋亡相关疾病特别是肿瘤的治疗提供新的思路. 细胞凋亡也是造血细胞自然死亡的一种主要形式，一些血液病问题也与细胞凋亡密切相关，特别在一些血液肿瘤的发生、发展中起重要作用.在CML、B-CLL、ALL、AML等肿瘤细胞中均有高水平BCL-2的表达，细胞凋亡过程的受阻是血液肿瘤形成的重要原因［2］.目前已证明抗肿瘤化疗药物，肿瘤细胞诱导分化剂（如维甲酸及其合成的衍生物HPR），某些激素（如糖皮质激素及PGE2等），某些细胞因子及某些化学药物（如砷类化合物（As2O3）［3］）也是通过诱导血液肿瘤的细胞凋亡，发挥治疗作用.因此深入研究血液肿瘤细胞凋亡的发生机制，及其基因调控并进行基因分离和克隆，可望人为地调控细胞凋亡，提高治疗效果，预防疾病发生. 本项研究以细胞因子依赖性的人红白血病细胞株TF-1细胞作为研究对象，通过撤除细胞因子诱导其凋亡，利用代表差异分析技术(cDNA-representational difference analysis,cDNA-RDA)［4］进行凋亡早期特异表达基因的克隆化，并进行功能研究.RDA 是1993年［5］发展起来的一种新方法，最初用于基因组表达差异的研究，因其简便有效性被大家推广用于cDNA的差异表达研究.1　材料和方法1.1　细胞系和细胞培养 TF-1细胞由中国药品生物制品检定所丁锡申教授惠赠，由本室长期传代培养.培养基中加入80～100 U/ml的人重组GM-CSF.细胞去细胞因子时用Hank "s液洗三遍后悬于不含GM-CSF的培养基中.1.2　DNA片段化分析为了解TF-1细胞去细胞因子后凋亡情况，分别于去细胞因子后0、8、12、24、48、80 h收集2×106 TF-1细胞，提取片段化DNA［6］.1.3　细胞总RNA及mRNA的提取细胞总RNA的提取利用GIBCO-BRL公司的TRI Z0L TM试剂.各取1×107去细胞因子8 h后的TF-1细胞及相同数目不去细胞因子的TF-1细胞，离心收集后，加入1 mlTRI ZOL TM试剂提取总RNA.以上两种细胞mRNA的提取使用Pharmacia公司的QuickPrep "Micro mRNA Purification kit.1.4　双链cDNA的合成采用GIBCO-BRL的Superscript TM Choice System for cDNA Synthesis试剂盒，利用1.3所提的不去细胞因子和去细胞因子细胞mRNA为模板，进行单链及双链cDNA的合成.1.5　RDA寡核苷酸以下是应用于RDA的寡核苷酸［4,5,7］.RBgl24, 5′-AGCACTCTCCAGCCTCTCACCGCA-3′，RBgl12, 5′-GATCTGCGGTGA-3′，JBgl24, 5′-ACCGACGTCGACTATCCATGAACA-3′，JBgl12, 5′-GATCTGTTCATG-3′，NBgl24, 5′-AGGCAAC-TGTGCTATCCGAGGGAA-3′，NBgl12, 5′-GATCTTTCCCTCG-3′ 划线的地方是每对引物配对互补的区域，以上引物由上海生工生物工程有限公司合成.1.6　RDA差示杂交操作参照文献［4,5,7］.去细胞因子和不去细胞因子组cDNA 2 μg用DpnⅡ切后连上RBgl12和RBgl24，然后以RBgl24为引物对两者进行PCR扩增，扩增产物用DpnⅡ切后，利用Glassmilk回收200～1 600 bp的片段，并定量取2 μg去细胞因子组的回收产物再连入JBgl12和JBgl24后,再取0.4 ng纯化的连接产物(被测组），与40 μg加因子的回收产物(本底组)（1∶100）进行长时间杂交，杂交后的产物以JBgl24为引物进行PCR扩增，PCR产物纯化后用绿豆核酸酶处理.终止反应后取20 μl处理后的产物为模板，以JBgl24为引物，进行18轮PCR反应.此次PCR产物纯化后用DpnⅡ切,酶切后片段为DP1（以上为第一轮杂交）.取2 μg酶切后的DP1再按以上操作连上新的Adaptor NBgl12和NBgl24（第一轮后）或JBgl12和JBgl24（第二轮后），重复RDA过程，连入新adaptor 的DNA为被测组,作PCR时分别以NBgl24或JBgl24为引物，杂交时本底组的量分别为0.1 ng(1∶400),0.01 ng(1∶4000)，分别得到DP2和DP3.取一定量的DP3与经BamHⅠ酶切并用CIP处理的载体pGEM3zf进行连接并筛选阳性克隆.1.7　测序反应测序使用Pharmacia Biotech公司的ALF TM DNA Sequencer，测序反应按Standard Annealing of Primer to Double-Stranded Template, 以荧光标记的反向引物为测序引物，使用的酶为T7 DNA聚合酶.1.8　与GenBank已有序列的比较及新序列的登记注册将测序所得到的序列以E-mail的形式或通过进行序列比较，并通过所提供的BankIt功能将在nr和dbEST中完全没有同源性的序列到GenBank进行登记［8～10］.1.9　mRNA斑点杂交和RNA印迹基本操作按文献［11］，去细胞因子和未去细胞因子组总RNA用分光光度计Beckman 640定量后，对应狭线孔中各加入20 μg总RNA，利用GIBCO-BRL公司抽滤点膜装置HXBRI-SLOT TM MANIFLD将总RNA点于DUPONT公司的Gene Screen Plus " Hybridization Transfer Membrane上.RNA印迹时［12］，总RNA经在含有甲醛的凝胶上进行的RNA电泳后，通过毛吸法转到尼龙膜上.探针的标记和杂交操作参照DUPONT公司Random Primer Fluorescein Labeling kit with Antifluorescein-HRP(DuPont NEN "NEL803)试剂盒说明书，一般X片压膜过夜后显影，定影.2　结果2.1　TF-1细胞去细胞因子后进入凋亡分别于去细胞因子0、8、12、24、48、80 h时提取TF-1细胞的DNA，并进行电泳.电泳显示（图1）去细胞因子12 h时DNA的片段化就已经非常明显，说明TF-1细胞去细胞因子后进入凋亡.一般来说，基因水平的改变TF-1细胞应该早于形态学上的改变.为此我们选取去细胞因子8 h后TF-1细胞进行RDA.图1　TF-1细胞去细胞因子后DNA片段化电泳结果1:λDNA/HindⅢ标准; 2～7: TF-1细胞去因子0、8、12、24、48、80 h.2.2　RDA 进行RDA操作时，以未去细胞因子的TF-1细胞为本底组，而以去细胞因子8 h后的TF-1细胞为被测组.进行三轮RDA，每轮中本底组:被测组分别为100∶1，400∶1，4000∶1.图2显示了杂交前不去及去细胞因子TF-1细胞cDNA，以及三轮RDA每一轮的产物，从电泳上可以看出，随着RDA进行，带型发生了改变，大部分消失而局部增强.第三轮后，可以看到明显的不同条带，此类差异带可能代表差异表达的基因.图2　利用RDA筛选在TF-1细胞去细胞因子8 h后特异表达片段的电泳结果1:λDNA/HindⅢ标准; 2: 正常培养（不去细胞因子）的TF-1细胞cDNA经DpnⅡ酶切后，PCR扩增; 3: 去细胞因子8 h时TF-1细胞cDNA经DpnⅡ酶切后，PCR扩增; 4:第一轮RDA后即DP1; 5: 第二轮RDA后即DP2; 6:第三轮RDA后即DP3.2.3　测序，检索和杂交结果三轮RDA后的产物与pGEM3zf相连后，电泳分析选择大于pGEM3zf载体的克隆进行保存并选择20个克隆用LiCl和PEG8000的方法提取质粒［12］后进行测序.测定的序列以E-mail或WWW的方式到GenBank进行检索.检索结果(表1)表明其中有7个克隆只有部分序列有同源性，可能为新的未知基因.其余13个为已知基因，将以上7个未知序列再到dbest数据库进行检索，发现其中4个有相同序列，3个没有同源序列，将这3个基因片段以EST的形式向GenBank进行登记，并获得承认.GenBank的登记号码分别是U83208，U83279，U83397.对以上克隆中的12个进行了斑点杂交以检测它们在TF-1细胞中的表达情况，杂交结果显示其中7个在凋亡的TF-1细胞中高表达（图3显示了部分结果），而在正常TF-1细胞中低表达或不表达.并用RNA印迹的方法对2个新基因转录产物(被命名为TFAR19和TFAR15(2))的长度进行了估算.结果显示（图4）TFAR15(2)长度约为1.0 kb,而TFAR19长度约为700 bp.利用Pharmacia公司的Pharmacia LKB Imagemaster DTS扫描仪扫描分析.结果显示以上两个克隆在去细胞因子组及不去细胞因子组间表达有差异(表2).表1 利用RDA技术发现在TF-1细胞去细胞因子所致凋亡中表达的基因克隆号测序长度同源性已知序列（全长）杂交结果130998%HSU32849人Hou基因(1426)H 325096%HSU54645人腺苷激酶2B(adk2b)基因(2105)H 425798%HSU21138人核糖体蛋白L9mRNA N.D51)39668%(40/68)CEF07A11 Caenorhabditis elegans cosmid F07A11(35,692)H620398%HSLDHAR人乳酸脱氢酶A(LDH-A,EC1.1.1.27)(1661)NH 724797%HUMCD24B人CD24 mRNA(2116)ND 811198%人硫氧还原蛋白mRNA(501)H 923697%人胸腺嘧啶核苷合成酶基因(18597)NH 1022098%人卫星DNA ⅢNH 11 同4ND 1328898%HSU17899人氯离子通道调节蛋白mRNA(1355)ND 141)16658%(68/117)DDP8A7 Dictyostelium discoideum P8A7 gene(2568)NH 15290　同4ND 1729096%同10NH191)29059%(71/119)HUMSFRS人剪切因子7（富含精氨酸/丝氨酸）(SFRS7)(8213)H2020099%HSU56637人帽蛋白alpha亚基同种异形体ND 231)27089%(44/49)X58779/HSHTLIP人肝三甘油酯脂酶5′非编码区ND 8(2)1)263　无同源ND 15(2)1)31274%(35/47)HUMMDR1人P糖蛋白(MDR1)mRNA(4646)H 19(2)1)25059%(71/119)同19号H 1)表示可能为新基因；ND表示没有检测；H或NH表示在去细胞因子TF-1细胞中高表达或不高表达.图3　RDA得到克隆在正常培养和去细胞因子TF-1细胞中表达的狭缝杂交结果1:β-actin;2～5: 克隆1, 5, 14, 19.图4　二个未知新基因的RNA印迹结果1: 人GAPDH; 2: TFAR15(2); 3: TFAR19.A：去细胞因子；B：加细胞因子.表2　RNA印迹扫描分析结果　去细胞因子组加细胞因子组GAPDH 1.27 1.27TFAR190.3240.132TFAR15(2)0.6960.236注：表中数值为去除背景(background)后条带的平均分光光度值(A).3　讨论 TF-1细胞株［13］是从患红白血病的病人分离建立的人前髓细胞株.TF-1细胞的生长增殖依赖于IL-3、GM-CSF、IL-13、EPO、SCF等细胞因子的单独或联合作用［13］.一旦在培养基中去除细胞因子，TF-1细胞就会进入凋亡.一般去细胞因子8 h后，几乎70％的细胞进入凋亡［14］.我们的DNA片段化电泳结果也证实了这一点.去细胞因子后培养基中加入蛋白质合成抑制剂环己酰胺后，细胞的凋亡受到抑制［15］，这说明TF-1细胞去细胞因子后的凋亡时有大分子蛋白质的合成.尽管以前的工作证明，TF-1细胞凋亡时BCL-2的mRNA和蛋白质水平均下降，而且是通过抑制PKC激酶的活性达到的［14］.但对TF-1细胞凋亡早期基因水平的变化还没有一个全面的了解. 为了更好地研究TF-1细胞去细胞因子凋亡机制并以期发现在凋亡中起作用的新基因，我们用RDA方法进行了TF-1细胞去细胞因子凋亡中基因差异表达的研究.本研究以细胞因子刺激生长的正常TF-1细胞为本底，以去除细胞因子的进入凋亡的TF-1细胞为被检查者，试图发现在凋亡早期过程中发挥作用的一系列基因.并进一步为其他血液肿瘤细胞的诱导凋亡和临床治疗提供一定的理论基础. 总的来说，凋亡涉及到从胞外至胞内一系列的信号传导过程和效应器蛋白水解酶的活化和调节两个步骤［16］.从本研究中所得到的在TF-1细胞凋亡中差异表达的基因编码的蛋白质，主要是一些核内调控因子，这与我们选择去细胞因子的时相在早期有关.一些克隆（如Thioredoxin［17］, Hou［18］等）经过检索发现以前的工作提示它们的高表达在凋亡中起作用,为我们今后进一步地研究以上已知基因在凋亡中的作用打下良好基础.更为重要的是，我们发现了数个新基因片段.而利用未知基因的片段可以从文库中筛选全长cDNA或用RACE的方法克隆出全长cDNA序列，有可能发现信号传导途径上的新蛋白或凋亡的标记蛋白.使我们对血液肿瘤细胞的凋亡的认识有进一步的提高，具有重要的理论意义和潜在的应用价值.最近，我们已克隆出TFAR15和TFAR19的全长cDNA序列在GenBank登记并被接受，登记号分别为AF022385和AF014955.作者单位：北京医科大学卫生部医学免疫学重点实验室, 北京 100083参考文献　[1]　Thompson C B. 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