PCR技术的原理和方法
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PCR技术的原理步骤以及应用1. PCR技术的原理PCR(聚合酶链反应)是一种体外扩增DNA的方法,它可以在短时间内通过不断复制DNA分子,从而大量产生目标DNA序列。
PCR技术的原理主要包括以下部分:1.1 原料PCR反应中所需的原料包括DNA模板、引物、dNTPs(脱氧核苷酸三磷酸盐)和DNA聚合酶。
1.2 PCR的步骤PCR技术一般分为三个步骤:变性、退火和延伸。
1.2.1 变性(Denaturation):PCR反应的第一步是将DNA模板的双链分离,使之变性成两个单链。
此过程需要将PCR反应体系升温至95°C,使DNA双链断裂成两条并带电的线性DNA。
1.2.2 退火(Annealing):在退火步骤中,温度降低至50-60°C,引物与目标DNA序列的单链片段结合形成两个引物-模板复合物。
引物是根据所欲扩增的目标序列设计的短DNA片段。
1.2.3 延伸(Extension):在延伸步骤中,将温度升高至72°C,此时DNA聚合酶能够将dNTPs加入到引物的3’端,从而合成新的DNA链,完成了一轮PCR反应。
这个新合成的DNA附着到模板DNA上,形成两个完整的DNA双链。
重复以上三个步骤可以进行PCR反应的循环扩增,有助于复制大量DNA。
1.3 PCR技术的应用PCR技术具有广泛的应用领域,包括:•基因检测和诊断:PCR技术可以用于检测和诊断疾病相关的基因突变、染色体异常等。
例如,通过PCR技术可以进行遗传性疾病的早期筛查。
•犯罪学和法医学:PCR技术在犯罪学和法医学中的应用较为常见。
通过PCR技术可以在犯罪现场收集到的微量DNA样本中进行基因分型,从而帮助解决刑事案件。
•遗传学研究:PCR技术也在遗传学研究中广泛应用。
例如,可以通过PCR技术进行基因表达研究、基因突变分析以及基因组水平上的DNA重排等。
•分子生物学研究:PCR技术是分子生物学研究中的一项关键工具。
PCR技术试验方法及原理PCR(聚合酶链式反应)是一种常用的分子生物学技术,可在短时间内扩增出特定DNA序列,具有高度敏感性和特异性。
本文将介绍PCR技术的试验方法及其原理。
一、试验方法PCR试验一般包括以下几个步骤:1. 样品收集与DNA提取:首先,从目标生物体中获取样本,可以是血液、组织、体细胞等。
然后,采用适当的DNA提取方法提取DNA,并将其纯化以保证PCR反应的准确性。
2. PCR反应体系制备:准备PCR反应液,其中包括DNA模板、引物(前向引物和反向引物)、酶和缓冲液等。
引物是通过DNA序列设计的短寡核苷酸片段,用于定位PCR扩增的起始点。
3. PCR反应:将PCR反应液置于热循环仪中,按照一定的温度和时间程序进行PCR扩增。
常见的PCR程序包括初始变性,循环变性,退火和延伸等步骤。
通过反复的温度循环,DNA序列将得到指数级的扩增。
4. PCR产物检测:扩增后的PCR产物可以通过多种方法进行检测,如凝胶电泳、实时荧光PCR等。
其中,凝胶电泳是一种常见的方法,通过将PCR产物与DNA分子量标准在凝胶上进行电泳分离,可观察到特定大小的DNA条带。
二、PCR原理PCR技术的核心原理是DNA的不断复制和扩增。
PCR反应在一系列的温度循环下进行,每个温度阶段发挥不同的作用,实现DNA的复制和扩增。
1. 变性(Denaturation):在高温(通常为94-98°C)下,PCR反应体系中的DNA双链被分离成两股单链,使其变性。
这一步骤使得DNA链解开,为后续的扩增提供模板。
2. 循环变性(Annealing):将反应温度降低至适宜引物结合的温度(通常为50-60°C),引物与DNA模板序列互补,结合在目标序列的两侧,并起到引导DNA复制的作用。
3. 延伸(Extension):在较低的温度(通常为72°C)下,加入DNA聚合酶(如Taq聚合酶)。
该酶能以引物为起始点,在DNA模板上合成新的DNA链,复制并扩增目标序列。
PCR技术的原理与方法PCR(聚合酶链式反应)是一种重要的分子生物学技术,用于在体外扩增DNA序列。
它由美国生物化学家科里斯·莫利什(Kary Mullis)在1983年发明,并于1993年获得诺贝尔化学奖。
PCR技术能够快速、高效地扩增DNA,因此广泛应用于基因工程、疾病诊断、法医学和生物学研究等领域。
PCR的原理基于DNA的体外扩增,需要以下几个关键的成分和步骤:1.DNA模板:PCR需要一段待扩增的DNA模板,可以是从细菌、植物、动物或人类的细胞中提取的DNA。
2.引物:PCR需要两个短的DNA引物,用于标记待扩增的DNA序列的起始和终止点。
引物是通过序列特异性的DNA合成的,与待扩增的DNA序列在起始和终止点上有互补配对。
3. DNA聚合酶:PCR需要一种DNA聚合酶,可以是常用的热稳定的DNA聚合酶Taq聚合酶。
聚合酶能够将新的DNA链合成到已有的DNA链上。
PCR的方法步骤如下:1.反应体系准备:将PCR反应所需的试剂和溶液组装在一起。
包括DNA模板,两个引物,聚合酶,缓冲液和反应液添加剂(如dNTPs和镁离子)等。
2. Denaturation(变性):将反应体系加热到92-98摄氏度,使DNA双链解开为两条单链。
这个步骤可以通过热循环反应器中的高温来实现。
3. Annealing(退火):将反应体系降温至50-65摄氏度,使引物与待扩增的DNA序列的起始和终止点互补配对。
这个温度较低可使引物在模板上定向结合。
4. Extension(延伸):将反应体系升温至72摄氏度,使聚合酶在引物的引导下合成新的DNA链。
这个步骤需要在确保聚合酶活性的情况下进行,不同的DNA聚合酶需要不同的温度和时间。
5.重复反应循环:以上三个步骤组成了一次PCR循环,在一个PCR反应中,可以执行数百到数千个循环,每个循环将DNA扩增一倍。
这样重复循环可以扩增出大量的DNA。
通过PCR,可以在几小时内从极少量的DNA模板中扩增出足够的DNA。
PCR技术的原理及方法PCR(Polymerase Chain Reaction)技术是一种用于扩增DNA序列的重要方法,它的原理基于DNA的聚合酶链式反应。
第二步是退火,即降低温度使引物(primer)与DNA模板序列互补结合。
引物是一段较短的单链DNA分子,长度通常为18-25个核苷酸。
引物的选择至关重要,因为它们决定了扩增片段的起始和终止位置。
第三步是DNA的延伸,即在适温下,用DNA聚合酶引导两条引物分别在DNA模板序列的两个方向上进行扩增。
这个过程是由DNA聚合酶催化下的核苷酸加入,以形成新的DNA链。
上述三个步骤被称为一个PCR循环,一个PCR反应通常包含多个循环,每个循环可以产生几千万到几十亿个DNA复制子序列。
随着PCR循环的进行,目标DNA序列将指数级增加。
PCR方法通常包括以下几个步骤:1.DNA提取:从样品中提取目标DNA,例如从血液、组织或培养物中提取DNA。
2.引物的设计:根据目标DNA序列的信息设计特异性的引物。
引物应该与目标DNA序列互补,并且具有适当的退火温度。
3.PCR反应混合物的准备:制备PCR反应的混合物,包括引物、DNA模板、核酸酶抑制剂、核苷酸混合物和DNA聚合酶等。
4.PCR程序:PCR反应需要经历多个循环,每个循环包含变性、退火和延伸。
PCR程序需要根据目标DNA序列的长度和引物的特性进行优化。
5.分析扩增产物:扩增反应结束后,可以通过凝胶电泳、定量PCR或其他方法来检测和分析PCR产物。
凝胶电泳可以根据扩增片段的大小进行分离和检测。
PCR技术的应用非常广泛,包括基因检测、疾病诊断、遗传学研究、人类起源研究、病原体鉴定等。
PCR技术的高灵敏度、高特异性和简单易行的特点使其成为现代分子生物学和医学领域中不可或缺的工具之一、此外,PCR技术还催生了许多相关技术的发展,如实时PCR、逆转录PCR、多重PCR等,进一步拓展了其应用范围。
pcr技术原理及步骤PCR技术原理及步骤。
PCR(Polymerase Chain Reaction)技术是一种分子生物学技术,它能够在短时间内从少量DNA样本中扩增出足够多的DNA片段,是分子生物学实验中常用的技术之一。
本文将介绍PCR技术的原理及步骤。
一、PCR技术原理。
PCR技术是通过DNA聚合酶(DNA polymerase)在一系列温度循环中,不断地复制DNA片段,从而实现DNA的扩增。
其基本原理如下:1. 双链DNA解旋,首先将DNA样本加热至94-98°C,使双链DNA解旋成两条单链DNA。
2. 引物结合,将温度降低至50-65°C,引物(primers)与单链DNA互相结合,为DNA聚合酶提供复制的起点。
3. DNA聚合,将温度升高至72°C,DNA聚合酶开始复制DNA片段,合成新的DNA链。
通过这样的温度循环,可以在短时间内扩增出大量的目标DNA片段。
二、PCR技术步骤。
1. 样本处理,首先需要从样本中提取DNA,通常使用酚/氯仿法或商用DNA提取试剂盒进行DNA提取。
2. 引物设计,根据目标DNA序列设计引物,引物的选择对PCR扩增的效果至关重要。
3. PCR反应体系配置,配置PCR反应体系,包括DNA模板、引物、DNA聚合酶、缓冲液、dNTPs等成分。
4. PCR扩增,将反应体系置于PCR仪中,进行一系列温度循环,完成DNA的扩增。
5. PCR产物分析,通过琼脂糖凝胶电泳或其他方法对PCR产物进行分析,验证扩增效果。
三、PCR技术应用。
PCR技术在分子生物学研究、医学诊断、法医学和生物工程等领域有着广泛的应用。
例如,可以用于基因克隆、基因突变分析、病原微生物检测等。
总之,PCR技术作为一种快速、高效的DNA扩增技术,已经成为现代生物学和医学研究中不可或缺的工具之一。
掌握PCR技术的原理及步骤,对于开展相关实验和研究具有重要的意义。
以上就是关于PCR技术原理及步骤的介绍,希望对您有所帮助。
PCR的原理和应用领域1. PCR的原理PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链式反应)是一种在体外扩增DNA片段的技术。
它是由美国生物学家凯瑟琳·梅利斯(Kary B. Mullis)在1983年发明的,因其在分子生物学领域的重要应用而获得了1993年的诺贝尔化学奖。
PCR的原理主要包括三个步骤:变性、退火和延伸。
1.1 变性(Denaturation)将待扩增的DNA样品加热至94-98℃,使双链DNA解开成两条单链DNA。
这一步是为了使DNA分子的双链结构完全解链,以便后续的退火步骤。
1.2 退火(Annealing)将待扩增的DNA样品降温至50-65℃,加入引物(寻找特定靶序列的DNA寡核苷酸链),使引物与单链DNA序列互补配对结合。
这一步是为了使引物与待扩增的DNA序列特异性地结合,以启动PCR反应。
1.3 延伸(Extension)将待扩增的DNA样品在72℃下加入DNA聚合酶(如Taq聚合酶),使DNA引物双链结构被DNA聚合酶复制成两条新的DNA双链。
这一步是为了合成新的DNA链,使扩增物数量呈指数倍增。
经过多个循环的变性、退火和延伸步骤,可以在短时间内扩增出大量特定目标序列的DNA片段。
2. PCR的应用领域PCR技术具有高效、灵敏、特异性强等优点,因此在许多领域得到了广泛应用。
2.1 分子生物学研究PCR技术在分子生物学研究中扮演着重要角色,广泛应用于:•基因克隆和表达研究:PCR可以扩增特定基因片段,用于克隆和构建重组DNA。
可以通过PCR检测基因在不同组织和细胞类型中的表达水平,研究基因的功能和调控机制。
•突变检测和基因诊断:PCR可以检测基因突变,用于遗传病的诊断和预测。
例如,PCR可以用于检测致病基因的特定突变,如BRCA1和BRCA2基因突变与乳腺癌的关联。
•DNA指纹和个体识别:PCR可以扩增DNA中的特定序列,用于DNA指纹分析和个体识别。
PCR技术的原理与方法PCR(聚合酶链式反应)是一种体外的DNA复制方法,它通过模拟细胞内的DNA复制过程,在离体条件下扩增DNA片段。
PCR技术的原理主要包括反应组分、温度循环和反应酶的作用三个方面。
1.反应组分PCR反应液的主要组成部分包括DNA模板、引物、dNTPs(四个脱氧核苷酸单元)、聚合酶和缓冲液。
DNA模板是PCR反应的起始物,可以是任何含有待扩增片段的DNA。
引物是DNA片段的两侧序列,它们是PCR反应酶(如Taq聚合酶)的起始点,引物序列应与目标DNA片段的两端互补。
2.温度循环PCR反应需要在不同的温度下进行循环,包括变性、退火和延伸步骤。
温度周期的设定是PCR反应中最关键的一步,它根据DNA的退火温度来决定。
-变性:将PCR反应液加热至94-98℃,使DNA双链解离成两条单链的DNA模板。
在变性步骤中,双链结构会解开,导致DNA模板的两条链分离。
-退火:将反应液温度降低至50-60℃,使引物与DNA模板的特定序列互补结合。
退火温度应低于目标DNA的退火温度,以保证引物的特异性结合。
-延伸:将反应液温度升至72℃,使聚合酶在这一温度下所具有的酶活性可以引导dNTPs与引物结合,从而在DNA模板上合成新的DNA链。
此步骤通常需要较长的时间,以确保完全延伸。
3.反应酶的作用PCR反应中使用的酶主要包括DNA聚合酶、外切酶和反转录酶。
其中DNA聚合酶是PCR反应的关键酶,最常用的DNA聚合酶是Taq聚合酶,因为它具有耐热性,能够在高温下保持酶活性。
- DNA聚合酶:在延伸步骤中,DNA聚合酶通过与引物结合以及dNTPs的加入,完成新DNA链的合成。
Taq聚合酶在延伸过程中能够保持酶活性,因此它是PCR反应中常用的酶。
-外切酶:在PCR反应中,外切酶用于切断PCR产物,以免产生错误的扩增产物。
-反转录酶:PCR反应也可用于合成DNA的互补RNA(cDNA),此时需要使用反转录酶将RNA转录为cDNA。
PCR技术的原理及应用1. PCR技术概述PCR(Polymerase Chain Reaction)技术是一种基因工程技术,用于在体外扩增DNA片段。
它是由美国生物化学家Kary B. Mullis于1983年发明的,已经成为现代分子生物学和生物医学研究中最基础和最重要的技术之一。
PCR技术的原理是通过逐渐增加DNA双链的方法,在体外扩增某一特定DNA片段,使之达到可以测定和分析的水平。
PCR技术的基本原理包括DNA的变性、引物的结合和DNA合成。
2. PCR技术的步骤PCR技术通常包括以下三个主要步骤:2.1 变性(Denaturation)PCR反应开始时,DNA样本被加热至高温(通常是94-98℃),使DNA双链变性,即将两个DNA链分离成两条单链。
2.2 引物结合(Annealing)PCR反应温度下降时,引物与目标DNA片段中的互补序列结合。
引物是短的DNA片段,以逆向互补的方式与目标DNA序列的两端配对。
引物的选择是PCR反应成功的关键,需要根据目标序列的特性进行设计。
2.3 DNA合成(Extension)在PCR反应过程中,酶(通常是热稳定的DNA聚合酶)通过引物作为起始点,沿着DNA模板合成新的DNA链。
该过程通常在高温下进行,使酶能够稳定在DNA链上进行复制。
每个PCR循环会产生两条新的DNA链,其中一条是目标序列的补充链。
3. PCR技术的应用PCR技术广泛应用于各个领域,包括基因检测、遗传学研究、医学诊断和法医学等。
3.1 基因检测PCR技术可以用于检测和鉴定各种基因突变、插入、缺失等基因变异。
通过PCR技术可以扩增出需要检测的基因片段,并可以通过其他技术(如DNA测序)对扩增产物进行分析和验证。
3.2 遗传学研究PCR技术在遗传学研究中起着重要的作用,可以用于DNA指纹鉴定、基因组重组、基因表达调控研究、基因治疗等方面。
例如,PCR技术被广泛应用于DNA 指纹鉴定,通过对DNA样本进行PCR扩增和电泳分析,可以确定个体之间的遗传关系。
PCR原理过程和应用方法有哪些步骤引言聚合酶链反应(PCR)是一种在分子生物学中广泛应用的技术,它能够扩增特定DNA片段并产生大量复制品。
PCR的原理简单而灵活,被广泛用于基因分型、遗传性疾病的检测、DNA克隆、基因工程等领域。
本文将介绍PCR的原理过程以及常见的PCR 应用方法和步骤。
PCR原理过程PCR的原理基于DNA的双链复制过程,在一个热循环中通过不同温度的变化开展。
一般包括三个关键步骤:变性、退火和延伸。
1.变性(Denaturation):将待扩增的DNA双链在高温(通常为94-98℃)下解链成两条单链DNA。
这一步的目的是使DNA的两条链完全分离,为后续的扩增提供模板。
2.退火(Annealing):将温度降低至较低的退火温度(通常为50-65℃),使两个引物(primer)与目标DNA序列的两端互补结合。
引物是由设计的片段特异性DNA 序列,它们会定向性地结合到待扩增的目标序列上。
3.延伸(Extension):将温度升高至适宜的延伸温度(通常为68-72℃),此时DNA聚合酶开始复制DNA。
酶会在引物结合的位置上逐渐合成新的DNA链,延伸到相邻的引物区域。
通过以上三个步骤的循环,PCR可以快速扩增特定DNA序列,使其得到数量级增加。
PCR应用方法和步骤PCR在科学研究和临床诊断中有着广泛的应用。
以下将介绍几种常见的PCR方法和相应的步骤。
1.基因型鉴定•提取DNA样本:从样品(如血液、唾液、组织等)中提取目标DNA。
•Primer设计:根据待鉴定的基因序列设计特异性引物。
•PCR扩增:按照前文介绍的PCR原理过程进行扩增。
•凝胶电泳:将扩增产物通过凝胶电泳分离,根据不同大小和迁移速率确定基因型。
2.突变检测•提取DNA样本:从患者样本中提取DNA。
•引物设计:设计引物以特异性扩增突变位点。
•扩增反应:按照前文介绍的PCR原理过程进行扩增。
•测序分析:通过测序技术对PCR产物进行分析,检测突变。
pcr技术的原理和应用有哪些方面1. 引言PCR(聚合酶链反应)是一种在生物技术领域广泛应用的技术方法。
通过PCR,可以扩增并复制DNA片段,从而使得微量的DNA样本得到增加,为进一步的分析和研究提供了便利。
本文将介绍PCR技术的原理和应用的方面。
2. PCR技术的原理PCR技术利用了DNA的复制原理,通过反复进行加热、变性、退火和延伸等步骤,从而使DNA片段得到扩增。
具体而言,PCR的步骤包括:2.1 变性首先,将待扩增的DNA样本加热至高温,使DNA双链分离成两条单链。
这个过程称为变性。
2.2 引物结合然后,降低温度使DNA片段中的引物与DNA单链结合。
引物是两条DNA单链的起始序列,用于指导DNA复制的起始点。
引物的选择与待扩增的DNA片段有关。
2.3 DNA合成接下来,将DNA聚合酶(Taq DNA Polymerase)引入体系,该酶能够在较高温度下工作。
DNA聚合酶在引物的引导下,以单链DNA为模板,分别在两条单链的3’端合成新的DNA链。
这个过程称为延伸。
重复以上的变性、引物结合和DNA合成步骤,PCR技术可以使DNA片段多次复制,达到扩增的目的。
3. PCR技术的应用PCR技术在医学、生命科学、法医学等领域有着广泛的应用。
以下是几个PCR技术的应用方面的举例:3.1 分子诊断PCR技术可以用于检测疾病的分子诊断。
通过扩增病原体的DNA片段,可以在患者的样本中检测到病原体的存在,从而实现早期疾病的诊断和治疗。
3.2 遗传病筛查PCR技术可以用于遗传病的筛查。
通过扩增特定的基因片段,可以检测患者是否携带遗传病相关的基因突变,从而进行遗传咨询、家族规划等方面的工作。
3.3 基因工程PCR技术在基因工程中有着重要的应用。
它可以用于构建表达载体、定点突变、基因克隆等操作。
通过PCR技术,可以方便、快速地获取目标基因片段,并进行进一步的工程操作。
3.4 进化研究PCR技术可以用于进化研究。
通过扩增物种的特定基因片段,可以对其进行系统发育分析,了解物种的亲缘关系和进化历程。
PCR技术的原理和方法
1.PCR定义
PCR(Polymerase Chain Reaction)即聚合酶链式反应,是指在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以特定引物为延伸起点,通过变性、退火、延伸等步骤,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA的过程。
是一项DNA体外合成放大技术,能快速特异地在体外扩增任何目的DNA。
可用于基因分离克隆,序列分析,基因表达调控,基因多态性研究等许多方面。
2.PCR技术的基本原理
即在高温(95℃)下,待扩增的靶DNA双链受热变性成为两条单链DNA模板;而后在低温(37~55℃)情况下,两条人工合成的寡核苷酸引物与互补的单链DNA模板结合,形成部分双链;在Taq酶的最适温度(72℃)下,以引物3’端为合成的起点,以单核苷酸为原料,沿模板以5’→3’方向延伸,合成DNA新链。
这样,每一双链的DNA模板,经过一次解链、退火、延伸三个步骤的热循环后就成了两条双链DNA分子。
如此反复进行,每一次循环所产生的DNA均能成为下一次循环的模板,每一次循环都使两条人工合成的引物间的DNA特异区拷贝数扩增一倍,PCR产物得以2n的批数形式迅速扩增,经过25~30个循环后,理论上可使基因扩增109倍以上,实际上一般可达106~107倍。
PCR基本原理示意图
假设扩增效率为“X”,循环数为“n”,则二者与扩增倍数“y”的关系式可表示为:y=(1+X)n。
扩增30个循环即n=30时,若X=100%,则y=230=1073741824(>109);而若X=80%时,则y=1.830=45517159.6(>107)。
由此可见,其扩增的倍数是巨大的,将扩增产物进行电泳,经溴化乙锭染色,在紫外灶照射下(254nm)一般都可见到DNA的特异扩增区带。
3.PCR反应基本步骤
3.1 变性(denaturation):通过加热使模板DNA的双链之间的氢键断裂,双链分开而成单链的过程(94℃,30s)。
3.2 退火(annealling):当温度降低时,引物与模板DNA中互补区域结合成杂交分子(55℃,30s)。
如下图所示
3.3 延伸(extension):在DNA 聚合酶、dNTPs 、 Mg2+存在下,DNA 聚合酶催化引物按5’→3’方向延伸,合成出与模板DNA 链互补的DNA 子链(70~72℃,30~60s )。
以上述三个步骤为一个循环,每一循环的产物均可作为下一个循环的模板,经过n 次循环后,目的DNA 以2n 的形式增加。
4. PCR 扩增的基本方法
4.1 PCR 反应体系
4.2 PCR 反应的成分和作用
总体积:一般为25μl ~100 μl
(1)无Mg 2+buffer :由纯水、kcl 、Tris 组成。
Tris 用于调节反应体系pH 值,使Taq 酶在偏碱性环境中反挥活性。
kcl 可降低退火温度,但不能超过50 mmol/L ,否则会抑制DNA 聚合酶活性。
(2)Mg 2+:终浓度为1.5~2.0 mmol/L ,其对应dNTP 为200 μmol/L ,注意Mg 2+与dNTPs 之间的浓度关系,由于dNTP 与Taq 酶竟争Mg 2+,当dNTP 浓度达到1 mmol/L 时会抑制Taq 酶的活性。
Mg 2+能影响反应的特异性和产率。
(3)BSA :一般用乙酰化的BSA ,起着减少PCR 管对Taq 酶的吸附作用,对Taq 酶有保护作用。
(4)底物(dNTPs ):dNTPs 具有较强酸性,其储存液用NaOH 调pH 值至7.0~7.5,一般存储浓度为 10 mmol/L ,各成份以等当量配制,反应终浓度为20~200μmol/L 。
高浓度可加速反应,但同时增加错误掺入和实验成本;低浓度可提高精确性,而反应速度会降低。
(5)Taq 酶:能耐95℃高温而不失活,其最适pH 值为8.3~8.5,最适温度为75~80℃,一般用72℃。
能催化以DNA 单链为模板,以碱基互补原则为基础,按5’→3’方向逐个将dNTP 分子连接到引物的3’端,合成一条与模板DNA 互补的新的DNA 子链。
无3’→5’的外切酶活性,没有校正功能。
某种dNTP 或Mg2+浓度过高,会增加其错配率。
用量一般为0.5~5`——GGA TCTAGCGTA TGCTTGAAA ——3`
3`——CCTAGA TCGCATACGAACTTT ——5`
模板DNA
3’ — GAACTTT — 5’
引物1
5’—GGA TCTA — 3’ 引物2
PCR 引物与模板结合示意图
5个单位/100μl
(6)模板:PCR对模板DNA的纯度不要求很高,但应尽量不含有对PCR反应有抑制作用的杂质存在,如蛋白酶、核酸酶、TqaDNA聚合酶抑制剂、能与DNA结合的蛋白质。
模板DNA的量不能太高,否则扩增可能不会成功,在此情况下可适当稀释模板。
(7)引物:引物浓度一般为0.1~0.5μmol/L,浓度过高会引起错配和非特异扩增,浓度过低则得不到产物或产量过低。
引物长度一般15~30个碱基,引物过长或过短都会降低特异性。
其3’末端一定要与模板DNA配对,末位碱基最好选用A、C、G(因T错配也能引发链的延伸)。
引物G+C约占45~55%,碱基应尽量随机分布,避免嘧啶或嘌呤堆积,两引物之间不应有互补链存在,不能与非目的扩增区有同源性。
5.PCR反应条件的选择(影响因素)
5.1 温度参数
5.1.1 变性:模板变性完全与否是PCR成功的关键,一般先于94℃(或95℃)变性3~10 min,接着94℃变性30~60 s。
5.1.2 退火:退火温度一般低于引物本身变性温度5℃。
引物长度在15~25 bp可通过公Tm=(G+C)×4℃+(A+T)×2℃计算退火温度,一般退火温度在40~60℃之间,时间为30~45s。
如果(G+C)低于50%,退火温度应低于55℃。
较高的退火温度可提高反应的特异性。
5.1.3 延伸:延伸温度应在Taq酶的最适温度范围之内,一般在70~75℃。
延伸时间要根据DNA聚合酶的延伸速度和目的扩增片段的长度确定,通常对于1 kb以内的片段1 min 是够用的。
5.2 循环数
PCR的循环数主要由模板DNA的量决定,一般20~30次循环数较合适,过多的循环数会增加非特异扩增产物,具体要多少循环数可通过预试验确定。
5.3 PCR产物积累规律
反应初期产物以2n呈指数形式增加,至一定的循环数后,引物、模板、DNA聚合酶形成一种平衡,产物进入一个缓慢增长时期(“停滞效应”),即“平台期”。
到达平台期所需PCR 循环数与模板量、PCR扩增效率、聚合酶种类、非特异产物竟争有关。
6 PCR常见问题
6.1没有扩增产物
A循环温度:变性温度、退火温度
B 引物设计
C DNA聚合酶活性
D 抑制性成份(蛋白酶、核酸酶、其它抑制聚合酶活性的成份)
E DNA样品
6.2 非特异产物及电泳呈涂布状
A Mg2+浓度
B 调整引物、模板、聚合酶的用量
C 适当减少循环数
D 适当提高退火温度,缩短退火或延伸时间
6.3 引物二聚体的形成
A检查引物的序列
B 提高退火温度
C 调整引物与模板浓度
D 增加引物长度
6.4 假阳性结果的预防
A实验器材应一次性使用(吸咀、PCR管)
B 注意操作环境,戴一次性手套
C 严格PCR操作规程
D 多次取样的试剂应分装
E 设置阴性对照和阳性对照。